XLOC_012711 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_012711
Unique NameXLOC_012711
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000178_pilon:293698..301752+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_012711 ID=XLOC_012711|Name=XLOC_012711|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8055bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000178_pilon:293698..301752+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGAACTAATAAAGACATTATAGTAGCATTAGACTTACCATTTGTGTTTTG TGATACTTGCCATAACCAGCGATCTGGTAGTGGTTATAACTCAGGAAAGT ATTATGCAGCGGCTGCAGCAGTAGCCATTCAAGATATCAATAATAACAAA CATTTGCTAAGTAGAAACCAACTTCGATATGTTTGGAATACCAATCATAC AGATACGCACTGTGTTGAGAAAGAAGCAATCAAAATAATGATGGGTCAAC TTAACATGAATGTTTCTGGATTCATCGGATTTAACTGTTTTTGTCGTACA GTTAGTAAAATGGCAGGAGCTGTGAATTTACCACTTTTTTCTATGGTAAG TGTGTGTGTAAGCTCTGACACGATTATTTTCagcattcagttttcaatga atcagaaatcaaaataaGGTATGAAGTGCTTCTTCTTTACTTCATCTTTA GTCAACCAATTTCTATACATTGGTTATAGAATGCCCTCTTCATTCATGAC ATTTCAAAAAAGGGGACAAGTTCTGTGTTTTTTAAGATACATTTCTGTTT GGCAGCTCTGAAGTTATGTTTGACTTTTATTATATTaaggtttttcaaag tttttatatataatcctattttggtatctaaaaaaatcatgaaagaTGAT GCATTCAATGTTTATATAAGTTAAATGATAACATAAATTCAAAAGGACAC AATTTATCAAATATTCCGGATCAAGTAGGCTATTGCATTTTATTATGATT TTCCAGCTGATTCTGTCCAACATGCAGGTCAGTTACAGTAAGTTGGTCTA CTGTAATGTTGACATTCCTCCTCtaatttctttgcttagcaattagagag aaaaaatcttttgtctatcagtgattttgaccttccaattattcctatct ctaaagaagggtgtcgtaattagaagagggatgtcaacattagacaaACG 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TTGAGAAAGAATTTGTacacatatttttcatgaaactcAATTTTTCCAAT TCAAATGATTACTCTGACCAAATTAAACAAAGAACCAGCGACTTTGATTA GAAATATGGAACCAACTTATAAAGTAGACTTCCCTTAGGCAAATCTGTAC ACAGAAAATTGAATCTAAACAAAACCTTTTATGCACCTACAAAACCCATT AAAATGACATCatcataattttaaattaaCAAGAAAAGTGGTGTTTCTGC AAACTTGTCCtagtttaaaattcaatttaaaagtAGAAGAATCTTTACAT TTCTGGTTTTCAACCAGATATAAAAATAGCATACTCTAGTGTTCCACCTT AAACTTTCCTTGAAATACCCAGGGCTGGAATTATTTGAAGCTTTATGGGT ACCTACCTAGATGATCCTGCCTAGCAACccattttttcgtcaaaaactac CCAGACATATCTAACATTCACGAGCCCCACGCGATAAATCGTCACATATT ACTGACACTGACATTCCCTCGAAtttcaggtcggcattcggcagTGCCGA CCTAAAAGCCGACCAAAGAGTGCGTATGGTCGGCAGTTCATTGCCGACCA TATTCATTGATTCTCTCGGCAGCCGACCATAAGTTATCTTTTAGGTCAGC AAAGCCGACCTTAACAGCAACTGTAactgtaaaatgaaagtctCTATAAG AACCATATCgcactcaaataaaaaaacaaacattgccgtagcctttaaac aactttgccgacctaaaatatagctcagatcggcattgccgacctaaaaa caagcttaggtcggcaaaattttgccggcctTCGGCCGGATTTGGACGGC ACTTACGTGCcgacttacttttacttgaatttcGAGGGCACATTATATGG AAAAGATTCTCGTAGTATGGTAAATTATAGAATTAGAACTCTCAATCAAT 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AACGGATAGTTTCTTGTATTATTACGACTCGTTGGAACACATTTTCGAAC CGTTTTTAAATGAATGTCAACGGAAAGCGAGAAGTAAGCTCCTTCTTTAA CATCTCTTTCAACCAACATTTTATATGTATCCTCTCAGAAAAGTCGTGAA AACCTTCTTACTTTTGAAGTAACCAAATGCGGTTGAGTTTCATGAAAGAT GTCACGGATCGTACGGGTTGGCACCAGCCTACTATAAGAGATTTATTATC GAATGAAGTATTTGCTATTGGCTAAAAGGTGTCTTTTAGGTTTTTCCCTG GCCTCATTTCGCCAATTCATTGAtgtatttcttaaaaaatactgaatttt taCAGTTTTCGTTGTTGACAAATCATATTCTGACCATTACATTTTGATGT TGGTCCTCTTTTATGTACACGAGACCTTCCTCAATATGTAAAAATGGTTA ATCTGAAATTTAAGGTTAGCTTAACAGAAAATTTCTTAGttttctcagac actaatttCGGGATTTTCCCCTTTTGATTTGACAACGGCGATATGAGAAG GGTGCGTGAAGGATTAGCTGTGGTTTTTGCCCCCCTATACCATTCTGTTC TAAATCCATTGACAGCTTATAGCTGGAGTTACCGTTACTTTCGGTTGTGG TTTTTAGCCCTAACTATCAGCTGCGGCTTTTGGATTTTGGATGTATAACT GTCAACTGCGTCTATTAGTCTTACCTTAGCCTAAAGCAAATGCACGACTA TTGATTCTATCACCTATGATATAATCTGAAAGGAATTTTCGTTTTAATGG CATCGTAAGCCTTTAACGACTGAGTGACGTCACTAAGACTTAGATAATCG GCATCTTCAAAAAAGTCATGTTTATAATCCATCCCAGTCCACGTATTGTT GCGGTTTCAGCTAATGACCTTTTTATCATCTAATTAACGAAATCAACTGA ACGAAACTAGTTAATCTATTTTTCTTCGAACTGGGTCTTTGAGGAAAAAT TGTGTGACATGATAATAATGACGACACTATGATCTTTTTCCCTTGTCCTT AAAGTCTTGAGGGTTTAAATTGTAACTCGCAGATATACTTAGATTTATCG CTTGAATCAGAGAAATCCTTAAAAATGATGTACttgggggtggggggggg tgggtagaaattctttttttacggTGGGAGAGGGCTAAGAATTCGGGAAC ACTATGAATCATACATAAAGCCTTATTATAGCGTTGTTTCGGAAAGCAAT CTCAGGTTTTTCACATACAGTAAACTCtcacttattcgaacttctattat tcgaatttttctataattcgaacttattcccaGTCCCGGTCAAAGAGAAA CCTTCTCATAATAtactttccataattcgaatctctctgtaattcgaaca aataagattccccgatcgtgttcgaattagcgagagtcgaccgtatttca ttttttcatttacaGCCGTGTTATTGATGTTGGAAAGTCCTTTTTTGAGT TGGGAGTTCCCAGAGGAATTTATGGTGTGTATAAAGCCCTATGTAGTATT TCGAAACACCATCTATGACATGGTTTTCTTACTaatttccttttcatttt tcagttgtGTTATTGATGTTGGACAAAGGGAAACTTCAACAATTTATGAT GATGGCCAGCAAGAAGAATATGACGAACGGTGATTACGTATTTATCGCCG TTCATCCGTTCGCCACTAGCGAGACGTTTTTACGGAACACTCATAGTTTA TACGATTACGTTTGGATCTTGCCGTGGATGGGTTACCATGGTGACGGGAA CGGTGATAATTCATTCTTCTTCGGTACTAAAGAAGAAATGGTGAAAGCAT ATCAAGGACTCTTCCTATTAATGCCTCAGGTATACATCTCTGATTTTAAA CAACcgccaatcttttttttaaataccgcCCATCTCTTaaaaaaaaCGCC CATCTCAATAgacaaatcttttaaaaaaagaacagTTAGATTATTCCaat gaaaaacttaaaatattcGAATATATGATTTCCTCGAATTACAACTTTTT CCCAGTTTTATCTATGAGCGGACCTCTCTCCTAGAGAAAAATTACACCTG GTACCTAATGCAGACCTAGCTTTTAATGCTTATTGTCATATATTATATAT GAGCGAACCTCTCTACGAGCAAAAtaacattgggcttttccagaaatagt ccgtgcccTGccctgttgaggatatcggataccCAGGGAGTTCAcgattt ttgctcaaaagtggatatccctggatatccagggggttaaatatctacaa gggagcggatatccagggggtgaggtgtcttttcaagtaaaaaaatacga tatccaggggtaagcatctttataagagaggatatccagggggttgagca tatttttaagagtgaatAACAAAgaaggatatccaggggttcgatacttc gaaaaatcaatatcctcaacagtgggggaaattttttttctggaaaagcc catcgGGTACCCAAGGACAAACCTAGGTGTCCATGACATTGATCAATTTT ACTTTTcctaatttgattttaaaagtgaTAGAAAGGGGTACAAACAGTAT GCTTGTATAATATTATAAACCACTGCAGTCTCTCTGGtttcactaaaatc aaatcacATTTTCGTTGTAGATCCCATCAGTAGAAGGAGATCAGCACAAG AAATTCAAGGATTTTCAAGACCGCGTCCGTAAAGGCATGTCTAGACCTCC ATTCAACAGTGAAGTTTACAATGGTGAACTTAAAGATGTTGTCAAATCAA AGAAACAAGCCAAGGTAagggtttgtttttcttttcgctGCGTTGCGTTC ACTCAAtactaccgagtttatgtatgtgtgtttttcagcgacggagacgg taaggttctaatttgactagatcatgaccaaccgAGGACAAGTGCAAACA CATAAACTCGATACTGTCTGTTACTGGTCTGTTTGTTCTTCATTGTGTAT TGACACTATTGACACTCATAAAGTTAAtataaaaattcgaaatttttacG ACCAACATAAGCTTGTCACCGATCGCAATCATGGAATTATTTCCCTATTT GTTGAACGAATTTTGTGTTCAAAAAGTgtcatcaaaatatattttgtttc tTCACTTCCTCTTTCAGCCACCACCGGAAGCTCACCAACTGTATGATGCA GTCATGTTGTACGCTCACGGATTGAACAAAACGTTATCCAAAGGATACAG CGTAACCAATGGATCTGATATTATCCAAAATATCCTTAACACCCGTCACG AGAGT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000178_pilon:293698..301752+

>XLOC_012711 ID=XLOC_012711|Name=XLOC_012711|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2442bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000178_pilon:293698..301752+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGAACTAATAAAGACATTATAGTAGCATTAGACTTACCATTTGTGTTTTG
TGATACTTGCCATAACCAGCGATCTGGTAGTGGTTATAACTCAGGAAAGT
ATTATGCAGCGGCTGCAGCAGTAGCCATTCAAGATATCAATAATAACAAA
CATTTGCTAAGTAGAAACCAACTTCGATATGTTTGGAATACCAATCATAC
AGATACGCACTGTGTTGAGAAAGAAGCAATCAAAATAATGATGGGTCAAC
TTAACATGAATGTTTCTGGATTCATCGGATTTAACTGTTTTTGTCGTACA
GTTAGTAAAATGGCAGGAGCTGTGAATTTACCACTTTTTTCTATGCGAAC
TAATAAAGACATTATAGTAGCATTAGACTTACCATTTGTGTTTTGTGATA
CTTGCCATAACCAGCGATCTGGTAGTGGTTATAACTCAGGAAAGTATTAT
GCAGCGGCTGCAGCAGTAGCCATTCAAGATATCAATAATAACAAACATTT
GCTAAGTAGAAACCAACTTCGATATGTTTGGAATACCAATCATACAGATA
CGCACTGTGTTGAGAAAGAAGCAATCAAAATAATGATGGGTCAACTTAAC
ATGAATGTTTCTGGATTCATCGGATTTAACTGTTTTTGTCGTACAGTTAG
TAAAATGGCAGGAGCTGTGAATTTACCACTTTTTTCTATGAGTTGCCAAG
AGATGGACCTCTCCAAGAAGACAGAATATCCAACCTTTGCACGAACCACC
ACATTGAATCGTGACGTCATCTACATGATTATTACTATGCTTAAAAAGTT
CAAGTGGAAAAAATTTGCTGTCATGTATGAGAGAGTTGCCAAGAGATGGA
CCTCTCCAAGAAGACAGAATATCCAACCTTTGCACGAACCACCACATTGA
ATCGTGACGTCATCTACATGATTATTACTATGCTTAAAAAGTTCAAGTGG
AAAAAATTTGCTGTCATGTATGAGAGGTCGCACATTTGGGACGCGGTATA
CACAGCACTGAAGAAGGAGAGCGAAAACATGGCAGATTTACAAATGACAT
TAATTAAAAGTTATGAGAAAACGGATAGTTTCTTGTATTATTACGACTCG
TTGGAACACATTTTCGAACCGTTTTTAAATGAATGTCAACGGAAAGCGAG
AAGTCGCACATTTGGGACGCGGTATACACAGCACTGAAGAAGGAGAGCGA
AAACATGGCAGATTTACAAATGACATTAATTAAAAGTTATGAGAAAACGG
ATAGTTTCTTGTATTATTACGACTCGTTGGAACACATTTTCGAACCGTTT
TTAAATGAATGTCAACGGAAAGCGAGAAttgtGTTATTGATGTTGGACAA
AGGGAAACTTCAACAATTTATGATGATGGCCAGCAAGAAGAATATGACGA
ACGGTGATTACGTATTTATCGCCGTTCATCCGTTCGCCACTAGCGAGACG
TTTTTACGGAACACTCATAGTTTATACGATTACGTTTGGATCTTGCCGTG
GATGGGTTACCATGGTGACGGGAACGGTGATAATTCATTCTTCTTCGGTA
CTAAAGAAGAAATGGTGAAAGCATATCAAGGACTCTTCCTATTAATGCCT
CAGttgtGTTATTGATGTTGGACAAAGGGAAACTTCAACAATTTATGATG
ATGGCCAGCAAGAAGAATATGACGAACGGTGATTACGTATTTATCGCCGT
TCATCCGTTCGCCACTAGCGAGACGTTTTTACGGAACACTCATAGTTTAT
ACGATTACGTTTGGATCTTGCCGTGGATGGGTTACCATGGTGACGGGAAC
GGTGATAATTCATTCTTCTTCGGTACTAAAGAAGAAATGGTGAAAGCATA
TCAAGGACTCTTCCTATTAATGCCTCAGATCCCATCAGTAGAAGGAGATC
AGCACAAGAAATTCAAGGATTTTCAAGACCGCGTCCGTAAAGGCATGTCT
AGACCTCCATTCAACAGTGAAGTTTACAATGGTGAACTTAAAGATGTTGT
CAAATCAAAGAAACAAGCCAAGATCCCATCAGTAGAAGGAGATCAGCACA
AGAAATTCAAGGATTTTCAAGACCGCGTCCGTAAAGGCATGTCTAGACCT
CCATTCAACAGTGAAGTTTACAATGGTGAACTTAAAGATGTTGTCAAATC
AAAGAAACAAGCCAAGCCACCACCGGAAGCTCACCAACTGTATGATGCAG
TCATGTTGTACGCTCACGGATTGAACAAAACGTTATCCAAAGGATACAGC
GTAACCAATGGATCTGATATTATCCAAAATATCCTTAACACCCGTCACGA
GAGTCCACCACCGGAAGCTCACCAACTGTATGATGCAGTCATGTTGTACG
CTCACGGATTGAACAAAACGTTATCCAAAGGATACAGCGTAACCAATGGA
TCTGATATTATCCAAAATATCCTTAACACCCGTCACGAGAGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_012711XLOC_012711-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000178_pilongenomesc0000178_pilon:293698..301752 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1153-1290:7918
Aaloc1009-1152:7421
Aaloc736-1008:6357
Aaloc559-732:4659
Aaloc415-555:4138
Aaloc325-414:256
Aaloc67-321:1