TCONS_00073703 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00073703
Unique NameTCONS_00073703
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2644

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00073703 ID=TCONS_00073703|Name=TCONS_00073703|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2644bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_97:157623..171664-

Legend: exon
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>TCONS_00073703 ID=TCONS_00073703|Name=TCONS_00073703|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14042bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_97:157623..171664- (Clytia hemisphaerica)
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045762XLOC_045762Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00073703-exon-scaffold_97-1491911889:163402..163440TCONS_00073703-exon-scaffold_97-1491911889:163402..163440Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00073703-exon-scaffold_97-1491911889:157623..160133TCONS_00073703-exon-scaffold_97-1491911889:157623..160133Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_97supercontigscaffold_97:157623..171664 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
22.2627 20.3245 2.93665 5.01931 59.1474 46.0908 13.1258 17.1461 6.09341 5.98976 6.28014 7.5778 34.3387 41.5241 23.8277 12.2011 10.9864 16.7011 27.8006 19.7387 32.6836 34.3241 15.0048 29.3133 195.063 154.014 102.93 124.267 19.3917 25.2126
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00073703 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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