|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00073701 ID=TCONS_00073701|Name=TCONS_00073701|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2579bp
gagagagagagaaagagagttTGTTGTGATTTTGTTTCTTGCTGTTTGTT
GCTGTGTTATAGATTGAGCATTTGGACGTGTCGAATACACACCACTCTTA
AGCAAACCGTCAACAGTTTGCACAAACAACTCAACAAGGACTTTGTCTTC
AATTTTCAACTCAAACTAAAAAAACTAATTTCAGAATATCCTGAATTAGT
TCGAATCAAACATTCAATAACTTCAGACGATTCAAAAAACCTCGTTTCAC
AGGATTTACATATCAACCAACAAGATGACTTCAGTAGATGCATATGATGA
AGAATACGATTCTGCCCGTTTATCAGGCACCAATGCTGTCGTCGAATTCT
ACAATTCATACGCTGAAGAATATGAACGAATCTTGGATGAGCAAGTCTTT
TTCTGGATCGGTGAATACAGTGCTGGTGTCTTATGGAAAGTGATGACAGA
TAAGAAAACAGATGAAGAGAAAGCCAATCTAGCTGTCCTTGATGTTGCTT
GTGGTACTGGTAAAACTGGTGAATTCTTAAAAGAAGTTGGATTCTCCATT
GTCGATGGTTGCGACCCAGCTTTGAAAATGGTGGAAATtgccaaacaaaa
gaaaatcttccgTGATATCCATATCGGTCAAATGGGACCAAATCCAGAAG
ACGGTTTCAAGACCATTCCTGATGGTACATATGACGGACTTTTGTGTGTC
GGTTGCTTAACACGTGGTGCAGCTGCCGTTAAAGACGCATTGCCAGAATT
TGTTCGCGTGCTCAAAAAAGGCGGCTACGGGGTTTACGTTATCTCACAGT
CCCTTAACAAAATTGATGCCTTAAAGGACCATTTAAAATACTTCGAAAGT
CAACAATTAGATATTATCacaattgaaaagaaattttatcgtATTTATAA
TGAGGTTACCACATATTGTCATGTTtacattgtgcaaaaaatgtaaattt
attttctgGTATTCCAAATATGTTCTCTTCAATTTGTAATTTATATCACC
TATTTTCTGAAATCTTTCTTAAGTCAGTTTATCATTAAGATTTACTGATA
ATCTTCTAAACTATGTCAGCCCTAATGCATATTGAAgtaaaaaagattaa
aagagcctaaatttagatttttaccAGATGTAAATTCTAGCTCAGGTCGT
GAGCAGATGTACATTTAATTCTTTTGTCTCTATGATGACATTTGATAAAA
ATGGCTTATCTGTAAGACGCACTAGGTaaataaaattgtaatatttCTAC
TAAATTTCGGTAGAGAATAAAAAAGGCGTTTTATTTTAGCATGAAGATTC
AGAATTGAAAAACTGACTAAGATAGatttcattttcacaaaaaacatATT
ATACATTATACATTGTAGCAAAATGTTATATATTACATTTGATAATTTGT
TATAGTGTTATTGTATAATTTTTAACATACTACTGATTTTGTCGTTTATA
GCATAACTGTTTTTGTGTTTTAGCTAAATGTTATATCGTTATACATATTA
TAATTTAACTTATAACTTGTtgtaaaactaatttttttcaatatttgaat
AGAGTCGCACTTtgaaaagtaaaagtaaaacttTGTATCATTTATTTTAT
CACTCGTATATAAGTAGACATAGAACTTGCCTCCCCCTCCATCATACACG
tttagtttataagaacatccaaaatttttaaagccttcaagtgttcctaa
ctttttgagttttaggcctaaaaatgttcttaacatgttcgtattttcac
cacttttagagcatttttgttttagagtcttcaaagccttaaaatgttct
taacttgttcttaacattttggccatcgaatccttatgttcctataaaaa
aaaacgtgtaaaggtTTTAGTGTACTAAAGATTATTGAACCCGAAGTTCG
ATCTTATAATGGTAAAATGTTTCAACTTGGGTGgttaaaaaatacaattt
ttgatCTAAAACATCACAAGGCtagaccaatttgattactagttgtttta
cgggcccgaccgaccctgaaatatcgaaaatcgaaataaaaataaaattg
attttggtagtacatttttattttattgctttacagactgctAGACCCCC
TATCTTAgctagcttggcccgtaaaacaacaaattaaattggtctcatCT
AAGCCATTTTTAACCTGctataaattttgaagattttgattttttgtgag
aactgaattttacaaaatttccaataaatggacgaaaatttATCAAAGCT
AATCAAATTCACTCAAGCTAGAAAGTTTGTACCTTGTCGAAACCTAAAAT
GATATTTCTTGTTTTTGCACGCTAAAGCACTCTGCTTTTTCATGGCTAAA
TAAGGATTTCACTTCACTGTAATTCGAACtgtccattttttttaaacaaa
aacgcTGTTTATCTAACATGACTGTGATTGTATTTTGTATGGCAATACTT
CGATTAGGGACTTGACACAAAAGAAAACACCCAAAGGCCACAAGAGGTGA
CTCGTATTATCATGAATTTTCTATCTTAGGAAACACTAGTCGATACTCTT
AAATTTCAAGAGACCCCCTTTCCCAGATC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_97:157623..165368- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00073701 ID=TCONS_00073701|Name=TCONS_00073701|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7746bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_97:157623..165368- (Clytia hemisphaerica)
GAGAGAGAGAGAAAGAGAGTTTGTTGTGATTTTGTTTCTTGCTGTTTGTT
GCTGTGTTATAGATTGAGGTATGAATCTTTTTTAAAGTTCACCGAGTCGC
TAGTACAAACTAAATATATTTGGCCCCTATATTGACATTGTTGAGTATTT
CGTCGTTTTTCAGATATTGAAGTTCGGATGAGAAAGGACGATTTCAGTAT
TTCCACTTTTATTTCAATGGCTATTTTGATTTGGGAGGGAGGTGTTTAGT
GCTTTCCAGGCTATATTCTCAGCATTACTAGAACATTTTTGAGATTTCGG
ATCCTCAGATCCTAAGGTCAATTTGGTTACCAAATTAGCATTTTATCACC
GCGAAGTACACTGAGTGTCCCCGAGTGGGAGTGTCCAAATCGAAGAAGTT
GAAATAATTATTCTAAAAGAGTCTCTTTTTCTCGGTGATCCTTACCTACA
TAATCATGTTCACTTTTTTACACGTTTTTTTTTTTAATAAGAATACACTT
TATAAGAATGTCCATGATGAAAATGGCCAAAAGATTAAGAATAATGCTAA
GAATATCACCATCATGGAATTTTGCTACTCAAGATAAGAATGCCATTTTT
AGAGCATTTTCAATTATAAATCGTCAATTACCCCCAAGTAAGGGTCGCTC
CTTTCACAAAAATGCCATTTTATGCTTGAGACGTATGAACTAAAATGTTA
AATTTAGTCTGAATTAAGGTCCTAACTTAAGAATGCTGTAAGAATATTTT
AGGATGATTTTGCCAAAAACTTAAGAATATCCATGATGAAATGGATTTAC
ACCATTTTTTATAAAAAAAAGCGTGTAGTCTCTTTAATGATAAGTTGGGG
AGTCAAATAGACGTTCTTTTGCCAGTTTTCGGAAAGGTTTTTCGCTTTCA
GGTTCTGTTTTACAGGGGAAAAGAATTTGGATGATTTCCCGTATGTTTTA
AAAATGAGTCATCAATCACGCACAACCAGCCGATTTTGTTTATGTAACGG
TCACTAATGGATACGCAATGGGATACATACAAATTTTTTTATAAGAACAA
AATAGATAAGAACATAAGGCTTCCATGGCCAAAATATTAAGAACAAGTAG
GCTTTGCCGACTCTAAAACAATCCATTCTTACGAAAATTCTCACAAAATG
GTGAAAATAAGAACATTTTTAGGCTTAAAGCTCGGAAAGTTAAGAACATC
CGACGGCAAAAAATTTGGATGTTCTTATAAAAAAAATATAGTAAAAACAA
AACGGGGGAAGGGTAAATCTCATAACCGTGACCGTGGGATGGAACGGGAT
GTTCTGGAGTTTTTATAAGATACTCCACTAATTAGTCATCTAAAGTAATA
GAGATGAAGCGTTCTTAAGAGAGCTACAAAATTGTTTTATTACTGGTTAA
CGACCAACCAAATCAGAAAAGAGCTTGTAAAAACTCCAGCTTGTCCCAAT
GGAATAAACAACTGATGTATACCGTTCGCTAGAAGTTATTCAAAAGAATT
AAATAATTTAAAATACGTCATTTTAATACAACTTATTAGCTACACGAAAT
CTCATGAGTTTTAAGTACGTAATAAACGTTTTTCTAAGTGCCCTATCACT
TATTGTCAACGTCTGATAATAGGCTCATTAAGAAAGAATGTGAGTGAGAT
TAGAAGTAGATTTTAAGTCTATGGCGGAGAGCGCTGGTTTCCTTATAAGG
AACATAGATAATAGCTATCACTCTCCGTCATTGAGTTTAATTATCCTCTA
CACCCGCGTTGTGATTTGGTAGTTTAAATTGGTAATTAGTAATGTTTCAA
AAGGATGTCAAAAGTAAACATACAATAGTTATAATTAAAGGCTTTTATCC
AGGCTTGTACTTTGTACAATGTTTATGTCATTTTAAATGAAAAAAAAATA
TCAAAAAGATCATTTCTATTTTTTTCAGTTTTTGAAGGTATTTCGAAGTG
ACTGCTCTCTGGACGTGGTAAGATAATGTTTTTGTTTATATACTCATTTT
TTAGTTTATGCGAGAACACAAATTACTTCAAGTTATTGAAATTTCGAGAT
ATGGAGTAAGGTTTATAAAAGTAAAGCATTATTAAGTAAAGGGACCATGA
AAACTTGTTTGAGGTTTGAGTTACAGACTTCACTTTTTTATACAAATTTA
TCTGGCTCAATAGATCTCAATAATTCTCAAGTCTTCAAAATTTGTGCAGC
ATTTCCGATGACAGATTGAATCTAGCACTTTCTTTGTATTCGTGTTAAAT
ATTTTTTTCAATCCAGTTTTTGTATAAAAACCACGCTGGCCGCGCAACTT
ATGTAGGAACATAGTCCGATAAGAAACCCCCGGTCTAGAAGCCTTTAGTT
TCTTTCTATTGTTGAGAACTCGAACTTGCGTTGAGAAATTATCTTGTTTT
GCTCACTTTTTGATCATGTGATTAACTTTTGAACCAATTCCAAGAGGAAT
ATTTGGTAACGTGATCAAAAACTGAGCAAATCGATTTTTATAATCGTTAG
TAACAAAGGAAAAAGTTAACAAAAAGTTATAACAATAGGCTTTCAGACCA
GGGTTTTTTATACGGACTATGGTAGAAAATAAGTGCTCCTACATAGAAGA
TTCAACTCTACCTTCGGCTGTTATATATTTTATTGGTTACATGACCCGTG
TGGTTTTCACACAAACACTACCGTGAAGCGGGGTAACTTACATCAGCGGA
GGTAAACTTGCATAGCCATCAAATGACTGACCAATCAAAGTAGCAAAATT
TCAAACAAATGAACTACGCAGCTCTGCTCGCAGCTCTAATCTACCATTTT
TTGTTTTGATTTCACTTTGTATTTTAATGACCAGACAGGTCTTTCATTTG
ACTGCTATGCATGCTTGCCTCCACTGATGCAAGTTACCCGGTCAGTATTC
GAAAACTGGGAAAAAAGAGAAAGTGCTGTATTTCGTGCAAATTTTAGGCA
CAATTTAAGCACCTTTGCTTTGCCTGTAAAAGTTTTAAGGAACCCTTCTA
GCATACAGTATACTAAACCGGATATAATGGTATAATAACGTTAAACTGCC
AAACCATAGATCACTGTACATTTTCGAAAACTAGAAATTTAACAGATTGT
TTGTTCTTTGATGTTAATTTTTTTTGCCTTTTCGCAATTAATACCTGAAT
TCAGCATATCAAATTTCTGTAAAACGCTGATTTGGTGGATTCGAAAAAGT
GAAAGGTTCGGGTTAATGGTATTTAGATTTCTAAAAAGACATCAAAAAGC
TTAATCTATTTCTAGCGAGGTCTACAAATCATAGACTACCAACTATTTTC
TATGTGACTTTCTAAAGAAATGTCAAGCATTCTGATAAAGAAGTGAATAA
ATATTGTTTAAAGGATTATTTACATTACACCCCCTACCTACCTTCCTTAT
GAATAACGGTTTGATAATTTATAATTAAATTGACTTTTTAACAATATAGG
AAGATAAACGTAGTCTGCAAATTTGAAAAAGCAGATAGCAGATAGGTATC
AAATTCCAAAACTTACACATTTCTTATAAGAACATCCAAAATTTTTGAAG
CCTTCGGATGTTCTTAACTTTTTGAGTTCTAAGCCTAAAAATGTTCTTAA
GATGTTCTTATTTTTACAATTTTGGGAATATTTTTGTCCGTTTTCCTAAG
AAATAGGGTGTTTTGAGTTCAGCCTTAAAATGTTCTTCACTTGTTTTTAA
CATTTTGCCCAGCGAAGCCAATTAGCCATAACTATATGTTCTTATATAGG
CGTATTTAAATTTTGTTTTTGTTTGACTTGATTCTATCAGCTCAAATTAA
AGATTCTATTCTAAGTGCATCACACCTTTAGTAAATTAACTTTGGTGGGG
ATTAAATTTTTGGCAAAGATCGCCAAATTAAATTCATGCCAAAATAATTC
ACTTATAGTATCCTTTGTATTTGCTACATATGTGTTCTTTTGTTTTAGTT
TTTTTGAGCTAAATTTGTGGTTATTCAAAGGGNGGGTTTTTACATGAATT
TTTCTTCTTTTTATACCCAATGGCAACTTTTGACAAATGGGCTTAAAAAA
TTAGTCCTAACATCCCCCCCCCCTACGNGAATTTAATTTGGTGAACTGGG
CCAAAATCATCCAAATTTAACTTTTCCTGCCATCCGCCAAATTTAGATTA
TTGCTTTCTTCCCCCAAATGTTCTCTATTTTAAGGCAAATAAATTCTTGC
CAAAACTAATTTTTCAAGCCGGCAGCTTGAAAATTCCCTCATTAAATTCC
CTCCAAATTTTTACTTTTGTTAAGATTACTTCAACAACTGTATTGTTAGA
TTTACTATAATAATTTATTGAAACTTTCTAGCAGCAATTTCTTATTGTAC
AAGCAAGAAAAATTCATTGATTGATATTACATAGTTAAACATGATATGAT
TAAGTGACTGTCGCAAAAACTCGAACCCTATAACTTGAATGTTTCCTTAA
CTCGAACGGTTTTTTTATCCCTTCAGAACAAATTTAGGCTGTTTTCACCT
ATATCCCTAATGTTAGTTTAAAAAAATGATAACTTTCTGAAAACCTATAA
GATTTTAGGAATGACAAAAGAATTATTTCACATATTTGTTTTTGAAAAAT
ATTTTTCAGGCTGATTTCAATCTCATTTTATCTTTTCTAACATTTAATTA
ACTTAAAATCAATTTCAGCAATTTTGAAACTGACACGAATCAAAAGTACG
TTGCTTTTTAACGATTTTGTACATTCGCAGGTCACGTGTTAAACTGTTAA
GCTCTTTTACTTTTTTCAAACTTTTAAGTTACTCTTTAAGCTATTCATTC
AGGCGACCTTCCAGCGCAGCGGGTTTATTATCATTGCACAGCCTCTCTGT
TTTAATTATACAGTATTTCATCTATTCTGACGTGTAAACTCAACCTTGGC
TTTTAACCTGTTTATACATGAATTACTGTATTATCATAGATAAAGTATTT
CTTTTGTTGTCTTATACTTATGTTGCAATGGTCTGTCAAAAAATTACGAA
AGACAAAAGTTTTTGCATAATAATTCCTTGGCATATAGGGTTTTACAAGA
TCTTATTTAATTGGTCAACTCAAACTATCAATACAATAGGTTTTATCAAG
TAAACGTTATTTCTGCCAATCGTATGCTAGATTTTTAAAGAAAGTCTCCT
CAATCTAACGCCGGTTTGCATAGAGATGACTAAACAAAATTATTTGTACA
AAACCTTTAATCTTGTGTTTTTTTATTTCTTCTAGCATTTGGACGTGTCG
AATACACACCACTCTTAAGCAAACCGTCAACAGTTTGCACAAACAACTCA
ACAAGGACTTTGTCTTCAATTTTCAACTCAAACTAAAAAAACTAATTTCA
GAATATCCTGAATTAGTTCGAATCAAACATTCAATAACTTCAGACGATTC
AAAAAACCTCGTTTCACAGGATTTACATATCAACCAACAAGATGACTTCA
GTAGATGCATATGATGAAGAATACGATTCTGCCCGTTTATCAGGCACCAA
TGCTGTCGTCGAATTCTACAATTCATACGCTGAAGAATATGAACGAATCT
TGGATGAGCAAGTCTTTTTCTGGATCGGTGAATACAGTGCTGGTGTCTTA
TGGAAAGTGATGACAGATAAGAAAACAGATGAAGAGAAAGCCAATCTAGC
TGTCCTTGATGTTGCTTGTGGTACTGGTAAAACTGGTGAATTCTTAAAAG
AAGTTGGATTCTCCATTGTCGATGGTTGCGACCCAGCTTTGAAAATGGTG
GAAATTGCCAAACAAAAGAAAATCTTCCGTGATATCCATATCGGTCAAAT
GGGACCAAATCCAGAAGACGGTTTCAAGACCATTCCTGATGGTACATATG
ACGGACTTTTGTGTGTCGGTTGCTTAACACGTGGTGCAGCTGCCGTTAAA
GACGCATTGCCAGAATTTGTTCGCGTGCTCAAAAAAGGCGGCTACGGGGT
TTACGTTATCTCACAGTCCCTTAACAAAATTGATGCCTTAAAGGACCATT
TAAAATACTTCGAAAGTCAACAATTAGATATTATCACAATTGAAAAGAAA
TTTTATCGTATTTATAATGAGGTTACCACATATTGTCATGTTTACATTGT
GCAAAAAATGTAAATTTATTTTCTGGTATTCCAAATATGTTCTCTTCAAT
TTGTAATTTATATCACCTATTTTCTGAAATCTTTCTTAAGTCAGTTTATC
ATTAAGATTTACTGATAATCTTCTAAACTATGTCAGCCCTAATGCATATT
GAAGTAAAAAAGATTAAAAGAGCCTAAATTTAGATTTTTACCAGATGTAA
ATTCTAGCTCAGGTCGTGAGCAGATGTACATTTAATTCTTTTGTCTCTAT
GATGACATTTGATAAAAATGGCTTATCTGTAAGACGCACTAGGTAAATAA
AATTGTAATATTTCTACTAAATTTCGGTAGAGAATAAAAAAGGCGTTTTA
TTTTAGCATGAAGATTCAGAATTGAAAAACTGACTAAGATAGATTTCATT
TTCACAAAAAACATATTATACATTATACATTGTAGCAAAATGTTATATAT
TACATTTGATAATTTGTTATAGTGTTATTGTATAATTTTTAACATACTAC
TGATTTTGTCGTTTATAGCATAACTGTTTTTGTGTTTTAGCTAAATGTTA
TATCGTTATACATATTATAATTTAACTTATAACTTGTTGTAAAACTAATT
TTTTTCAATATTTGAATAGAGTCGCACTTTGAAAAGTAAAAGTAAAACTT
TGTATCATTTATTTTATCACTCGTATATAAGTAGACATAGAACTTGCCTC
CCCCTCCATCATACACGTTTAGTTTATAAGAACATCCAAAATTTTTAAAG
CCTTCAAGTGTTCCTAACTTTTTGAGTTTTAGGCCTAAAAATGTTCTTAA
CATGTTCGTATTTTCACCACTTTTAGAGCATTTTTGTTTTAGAGTCTTCA
AAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTGTTCTTAACATTTTGGCCATCGAATCC
TTATGTTCCTATAAAAAAAAACGTGTAAAGGTTTTAGTGTACTAAAGATT
ATTGAACCCGAAGTTCGATCTTATAATGGTAAAATGTTTCAACTTGGGTG
GTTAAAAAATACAATTTTTGATCTAAAACATCACAAGGCTAGACCAATTT
GATTACTAGTTGTTTTACGGGCCCGACCGACCCTGAAATATCGAAAATCG
AAATAAAAATAAAATTGATTTTGGTAGTACATTTTTATTTTATTGCTTTA
CAGACTGCTAGACCCCCTATCTTAGCTAGCTTGGCCCGTAAAACAACAAA
TTAAATTGGTCTCATCTAAGCCATTTTTAACCTGCTATAAATTTTGAAGA
TTTTGATTTTTTGTGAGAACTGAATTTTACAAAATTTCCAATAAATGGAC
GAAAATTTATCAAAGCTAATCAAATTCACTCAAGCTAGAAAGTTTGTACC
TTGTCGAAACCTAAAATGATATTTCTTGTTTTTGCACGCTAAAGCACTCT
GCTTTTTCATGGCTAAATAAGGATTTCACTTCACTGTAATTCGAACTGTC
CATTTTTTTTAAACAAAAACGCTGTTTATCTAACATGACTGTGATTGTAT
TTTGTATGGCAATACTTCGATTAGGGACTTGACACAAAAGAAAACACCCA
AAGGCCACAAGAGGTGACTCGTATTATCATGAATTTTCTATCTTAGGAAA
CACTAGTCGATACTCTTAAATTTCAAGAGACCCCCTTTCCCAGATC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00073701-exon-scaffold_97-1575043694:165301..165368 | TCONS_00073701-exon-scaffold_97-1575043694:165301..165368 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00073701-exon-scaffold_97-1575043694:157623..160133 | TCONS_00073701-exon-scaffold_97-1575043694:157623..160133 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00073701-exon-scaffold_97-1510915933:165301..165368 | TCONS_00073701-exon-scaffold_97-1510915933:165301..165368 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00073701-exon-scaffold_97-1510915933:157623..160133 | TCONS_00073701-exon-scaffold_97-1510915933:157623..160133 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00073701-exon-scaffold_97-1491911889:165301..165368 | TCONS_00073701-exon-scaffold_97-1491911889:165301..165368 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00073701-exon-scaffold_97-1491911889:157623..160133 | TCONS_00073701-exon-scaffold_97-1491911889:157623..160133 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_97 | supercontig | scaffold_97:157623..165368 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
