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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00073646 ID=TCONS_00073646|Name=TCONS_00073646|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=727bp CAAGCAGCCGTTCTTGTCCTCCGATTAGAAACGTGATTCCAGCTCAGCAA GGTCATCCAAAGCAGATTCACTTTATCAAGCACTTCAAGTTTTTCTAAAG GAAACAAGTAACTAATCCAATCGATCATCATGAATGTTTTATGGGCTATC ATTTGGTTCCTTGTTCTCATTTTCATCGGATGGCCAATTTCTGGATTCTG TGCATCTTGGTACGTCTGTTGTCTCCCATTCGAAGTCTGTATTGAACCTA TCAAACAATTGAATGAGATGTTATTTAAAGGTGTGAAATTATGTTATGAG GTTGCTGTTCATATGAAGGAAGGGAAATCTGGATGGTAAATTCTTCATTG TCTCGGTTATACATTTCTATATGTGTAACCAAAAACttgattttaacttt tttttgacttatgGTTTCTTGATTGCCATTCACATAACCTTCGGCATCAA TATTCTTTTGGTGGATACTTGGAACTGAGTGCAATCATTAACATTGACAT GTGATCCAGTTTATCTTATTAACCAAACTCTCCAATATGGTATATATAGA TTTTATGATTATTTTACATCTATTTATATATAatcttttgtttacatttt tttgacattttctttgttaaaCTGTACAATTGACTTAAACTAGGTATCTT ATAATAGTAAGAAACATTTTATGTTAATCCAAATAAATTCTTATATCCTT ACCGTCTTTGAAATGTTTTAGACGAAA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_97:136629..144668+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00073646 ID=TCONS_00073646|Name=TCONS_00073646|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8040bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_97:136629..144668+ (Clytia hemisphaerica) CAAGCAGCCGTTCTTGTCCTCCGATTAGGTGTAACGAATTTTAATTTCCA
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TGTATTGAACCTATCAAACAATTGAATGAGATGTTATTTAAAGGTGTGAA
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TTAACATTGACATGTGATCCAGTTTATCTTATTAACCAAACTCTCCAATA
TGGTATATATAGATTTTATGATTATTTTACATCTATTTATATATAatctt
ttgtttacatttttttgacattttctttgttaaaCTGTACAATTGACTTA
AACTAGGTATCTTATAATAGTAAGAAACATTTTATGTTAATCCAAATAAA
TTCTTATATCCTTACCGTCTTTGAAATGTTTTAGACGAAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1491911889:136629..136656 | TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1491911889:136629..136656 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1510915933:136629..136656 | TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1510915933:136629..136656 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1575043694:136629..136656 | TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1575043694:136629..136656 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1491911889:137052..137123 | TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1491911889:137052..137123 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1510915933:137052..137123 | TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1510915933:137052..137123 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1575043694:137052..137123 | TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1575043694:137052..137123 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1491911889:144042..144668 | TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1491911889:144042..144668 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1575043694:144042..144668 | TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1575043694:144042..144668 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_97 | supercontig | scaffold_97:136629..144668 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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