TCONS_00073646 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00073646
Unique NameTCONS_00073646
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length727

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00073646 ID=TCONS_00073646|Name=TCONS_00073646|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=727bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_97:136629..144668+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00073646 ID=TCONS_00073646|Name=TCONS_00073646|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8040bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_97:136629..144668+ (Clytia hemisphaerica)
CAAGCAGCCGTTCTTGTCCTCCGATTAGGTGTAACGAATTTTAATTTCCA GATCATTAGTATCAATTAACTCAATTAACTCTAATGAAAAATTCAATCTG TTTTATTAAAAGTTAAATTTGAAATGGTTGCAATTGAACTGTCATAGTTG AGATAACAAAAgcttatatgttcttataaaaaaagatccACTCGAAGCAC TGCGGTGGAGTTCAATCTCATGAGaccacatttaaaaaaaaacataaaaa catattATGTTACCGTTGGTGTAATAACAAAAGCTAATCTATTGTTATCT ACGACTAAGCGCCCGGGTTTTTCGTTGAGTTGAAAACATACAATATATAT AAAAGTAGGTGTGTGCTTTTTATAGTAGAGACGACTTCATAAAATAACTT TTCGTATTATTTTTTGCATTCAGAAACGTGATTCCAGCTCAGCAAGGTCA TCCAAAGCAGATTCACTTTATCAAGCACTTCAAGTTTTTCTAAAGGTATG TTTATATTTCTATTTTGATTATGGTGTCAActgtcaaattttgattttta tgttcgTTTATATTGTTATTCTTGTATACTTTTAACTCCTACATTGATAA ATCTATGAAAAAGGGGGGAAAAGTGCTACTTTTCAGGTCTTTGTGGTTTA TGAGAAAATCTTTACTTTCAAGAGGTATTTTTAGTTTCTCTTCCAAAAAT CTAAACGAAGCAAAAGATaattattttaattcttttttatctAACTATGT TTTAGCgaatttattgttttaaaaaccCTGTGTCAGTCTATATTCTATGG GATAGCAACTAATTTCGTTCAGAGTGTCCTCgaacaaccctgtctcacag ccccggtgtgGAACTTCTTCCCACAGTGTGGGAATGAAGATTGAAATTGT ATTGCTCTCAGGTTAAAAATCCAatggaatggttttggagtgcaattttt 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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045734XLOC_045734Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1491911889:136629..136656TCONS_00073646-exon-scaffold_97-1491911889:136629..136656Clytia hemisphaericaexon
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_97supercontigscaffold_97:136629..144668 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
852.973 818.691 1118.88 1173.32 2442.21 1699.62 858.391 809.913 308.678 329.864 180.38 189.572 120.004 85.7162 25.7249 30.3781 255.233 344.434 153.818 155.008 437.559 407.671 435.765 369.557 86.7751 95.3756 68.4191 47.1386 142.984 160.433
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00073646 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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