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transcript sequence >TCONS_00072974 ID=TCONS_00072974|Name=TCONS_00072974|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1538bp AAGCCAAGGATATACAACCACTATTCATCGGATTTGAGCCATTTGATAAA GATGAGATGGGATTTTACCACACTGGTGAATACTTTTTAGCTAAGGAAGA TCCAAAAAAAACCGATACCGTGCGTATTCATATTATCGAATTctataaaa gttattctaaattTCTTCAACGCGTTGTGACCGTTAAACTTCGTTCCTGC GTTGGATATTATAATTACGAGCAGCTTTGTTTTTATCCAGATGttggttt tcttcttcataCAATCGAACGTTATTCTAGCGACAGGGAATATTTTACTA TCGACCTTTATGGTTATCACATTATTAATTGGTTTGAAAAGAACCGGAAC AACATTGAATTGTGTATGGATCTTAAACCCTCTCCTGATTTAAGTCTGAC GTGTGCCAGTGAATTTAGATTTCTAAGTTATCACAACCATAATATCATTG GAAACAATATAAAACTTATCATTTCAGCATTTTCTCAACGAACAGTTGAT GAAGCTAACGGCCCTTCACTCGTATCATATCGATGtttatgtttggattt tttAAACATCGAGCTACATCaaataaagcaagaaaaaagaCTGGTAATAG AATTAGACAGACCGttggaaaattcttttgtttttcgatATTTTACCAAG CATAAGATCTATTTTGAAAGGATCGATAACAAACACAATACCATTAAGTC AACAATCTTAGAATATGATTACTCGGGTAAATTTTTATATTCATATTCCA TTGATTATTCCGATTCATTTGTAAAGCATTTCGAATGTATTAGAAATTCA AacttaatatttttatatttttaccccAGAAAAACTAAACCTGAGGATCT TGAAATACGAGTTATGAAATTGGAAAGAGGTAAAGCTGAGATTGTTAAAG aagttaaaaatattatatttccgAAAGAGGACGGAGTTATGTACAAATCA GTCGCATTAAATGATCCAATTAAAAGATTCAATCATACTGTATTACCAGC TTTATTAAGGGACGATGTCCACGGGGTATATATGACTCTGGATTTAACAA ACATGAAAATTACACGTAAGTCTCAAAGACAAATTATGACTGAAGATGAC GATATTCAGGCTGTTTCCTTGAATTGGAACAACAAAGAAATTGCAATGAT TTCTTTAAACGATGAGGAATTCGTATTTCAAATTGCACGCAATGATACTG TTGAAGGGAACGGCAGTGTCAAATCTTTGAAACAACTGGCAAGATTTGCT GTTTTGACATCGTTCAATTATCATCAATTAATGGAAGCGAATTTGCCATC GACATTGTTTGActatttgggaattgaaaagtgaaaattgTAAGATTACA GGAAGgataatttattcaaaaatttgacaaattgaaagttttgacaTCGT TCAATTATTACTAATTGATGGAAGCGAATTTGCCATCGACATTGTTTGAC TATTTGGGATAAGATTACAGGAAGGataatttattaaaatattaacaaat tgaaagttttgacaTCGTTCAATTATCACTAATTGATG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_86:1391818..1405665+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00072974 ID=TCONS_00072974|Name=TCONS_00072974|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13848bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_86:1391818..1405665+ (Clytia hemisphaerica) AAGCCAAGGATATACAACCACTATTCATCGGATTTGAGCCATTTGATAAA
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attaacaaattgaaagttttgacaTCGTTCAATTATCACTAATTGATG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00072974-exon-scaffold_86-1491911889:1391818..1393029 | TCONS_00072974-exon-scaffold_86-1491911889:1391818..1393029 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00072974-exon-scaffold_86-1510915933:1391818..1393029 | TCONS_00072974-exon-scaffold_86-1510915933:1391818..1393029 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00072974-exon-scaffold_86-1575043694:1391818..1393029 | TCONS_00072974-exon-scaffold_86-1575043694:1391818..1393029 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00072974-exon-scaffold_86-1491911889:1405340..1405665 | TCONS_00072974-exon-scaffold_86-1491911889:1405340..1405665 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00072974-exon-scaffold_86-1510915933:1405340..1405665 | TCONS_00072974-exon-scaffold_86-1510915933:1405340..1405665 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00072974-exon-scaffold_86-1575043694:1405340..1405665 | TCONS_00072974-exon-scaffold_86-1575043694:1405340..1405665 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_86 | supercontig | scaffold_86:1391818..1405665 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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