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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00072972 ID=TCONS_00072972|Name=TCONS_00072972|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1449bp
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ttattgaaaaatttaacaaattgaaagttttgacaTCGTTCAATTATCA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_86:1391779..1405928+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00072972 ID=TCONS_00072972|Name=TCONS_00072972|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14150bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_86:1391779..1405928+ (Clytia hemisphaerica)
TTGACGACAAGAAATCATGGTTCATTCCACCTGACTTCAAAGCCAAGGAT
ATACAACCACTATTCATCGGATTTGAGCCATTTGATAAAGATGAGATGGG
ATTTTACCACACTGGTGAATACTTTTTAGCTAAGGAAGATCCAAAAAAAA
CCGATACCGTGCGTATTCATATTATCGAATTctataaaagttattctaaa
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CAATCGAACGTTATTCTAGCGACAGGGAATATTTTACTATCGACCTTTAT
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GACCTACATCGTTTTTTGAATTGCCCTCAGAATCACAAAGTCAAAATCTA
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ATTGAAAACTAGTTGCTTACTGAATACAAATACATTTTCCactaatattt
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TTATAAAaccttcgtcataacttttcgaattcaaaaatctttttgagtGT
GAATACGTAAATTTTCACTTTTCCACCTTACGTACAAATTTTGCCtattt
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GATGAATCTAGTAGACCTACATCGTTTTTTGAATTGCCCTCAGAAtcaca
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TTGTAAATATGCAAAATTTCTTGGCCACGAGAATGCCACTTTACTTATAA
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AATATACtaaagacaaaatatttttctttaaaaggtcttATATTGAAGAC
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TTTTTTATATTCGTATAATCTGGAATACATTGAATNTAGTGAAGAAATAA
TGAACTTAAAGATCCTTGAATGTGATTATTCTGGTAATTTTTTATATTCG
TATGATTTAGAATACATTGAATCGTGGATGTTTAATGTTGTTGATCTTAA
ACATTCAAATTACATATTTCTTTATAATGGTTATGGCGAATTGGAGGACC
TTGAATTAAGAGTTTTAAAACTGGAGAATGGGGTTCTTTTGTCaataaat
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TGCCATTTTACTGTACCACAAGGGATGTATTTCACCCTGAATTTTACATG
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TGACTTTTCGTAAAGATAATCTTCAAAATGCTACGAGACTTGGACCGTTA
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CGGTTGTACCCGGGGTGGTGTattacccttgtcgaccgacgggggttgct
ccgctgaggttcgaaaaatggaccctacgtgggactcgcttattcaaact
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AATgttatcaaatttttcactttttccccaaattttccaaaaaaggcacc
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TATTGCTTTCGACTAGCagttattcaaaaaatggaGGCTTAAATGATAAA
CTTCTTTCTACAGATGAATCTAACTGGATATGCCACCATTGCGCAATCAG
TATTTTGGCTTTGAATCTGAAGGACACTACAATTTTCTACAATTCCATCA
TTTTTCTTTATGCTCGTGATAAAATTACATGTACTTTCATGGGAATTATA
ACATTTAATGTCCTTCTTTTACaggtacaaaaaaatattaaaaccaaaaa
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CTTCAAAGACAATGATATACAACCACTATTCGTCGGCAATGTATCATTTG
ATAAAGAAGAGGTGGGATTTTACCACACCGGTCAGTACTTTTTAGCTAAG
GAAGAAACATGGATAAAAAAAACCGATACCGTGCGTATTCATATTATCGA
ATTCGATAAAAGTTCTTCTAAATTTCTTCGAAGCGTTGTGACCGTTAAAC
TTCGTTCCTGCGTTGGATATTATAAATGCGATCAGTTTTGTTTTTATCCA
GATGTTGGTTTTCTTCTACATACAATCGAACGTTATTCCAGCGACAGGTA
ATATTTTACTAACGACCTTTATGGTTATCACATTATTAACTGGTTTGAAA
AGAACCGGAACAACAGTGAATTGTGTATGGATCTTAAACCCTCTCCTGAT
TTAAATCTGAGGTATGCCAGTGAATTTAGATTTCTAAGTTATCACTACTA
TAATATCATTGGAAACATTAAGAGACTTATCATTTCAGCCTTTTCTCAAC
GAACAGTTGATGAAGCTAACGGCCCTTCACCCGTATTATATCAAAGttta
tgtttggattttttAAACATCGAGCTACATCAAATAAAGCGAGAAAAAAG
ACTGGTAATTGAATTAGACAGACCGttggaaaattcttttgtttttatga
tattttactAAGCATAAGATCTATTTTGAAAGGATTGGTAACAAACACAA
TACCATTAACTCAGCAATTTTAGAATATGATTACTCGGGTAAATTTTTAT
ATTCATATTCGATTGATTATCCCGATTCATTTGTAAAGCATTTCGAATGT
ATTAGAAATTCGAACTTAATATTTTTATACCCCAGAAAAACTAAACCTGA
GGATCTTGAAATACGAGTTATCAAATTGGAAAGAGGTAAAGCTGAGGTTG
TTAAAGAAGTTAGAAATATTATATTTCCGAAAGAGGACGGAGTGATGTAC
AAATCAGTCGCATTAAATGATCCAATCAAAAGATTCAATCATACTGTATT
ACCAGCTTTATTAAGGGACGATGTCCACGGGGTATATATGACTCTGGATT
TAACAAACATGAAAATTACACGTAAGTCCCAAAGACAAATTATGACTGAA
GATGACGATATTCAAGATTTTTCCTTGAATTGGAACAACGAAGAAATTGC
AATGATTTCTTTAAACGATGAGGAATATCTACTACCGGGAGGTGAGTATG
CATTCGTAtttcaaatacacgttttttttttataagaacaaactatataa
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aaggctttggagacttaaaaacatgcaatttcttaagaaattacatcaaa
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNtaagaa
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GActatttgggaattgaaaaatgaaaatcgtAAGATTACATGAAggataa
tttattgaaaaatttaacaaattgaaagttttgacaTCGTTCAATTATCA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00072972-exon-scaffold_86-1491911889:1391779..1393075 | TCONS_00072972-exon-scaffold_86-1491911889:1391779..1393075 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072972-exon-scaffold_86-1510915933:1391779..1393075 | TCONS_00072972-exon-scaffold_86-1510915933:1391779..1393075 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072972-exon-scaffold_86-1575043694:1391779..1393075 | TCONS_00072972-exon-scaffold_86-1575043694:1391779..1393075 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072972-exon-scaffold_86-1491911889:1405777..1405928 | TCONS_00072972-exon-scaffold_86-1491911889:1405777..1405928 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072972-exon-scaffold_86-1510915933:1405777..1405928 | TCONS_00072972-exon-scaffold_86-1510915933:1405777..1405928 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072972-exon-scaffold_86-1575043694:1405777..1405928 | TCONS_00072972-exon-scaffold_86-1575043694:1405777..1405928 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_86 | supercontig | scaffold_86:1391779..1405928 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
