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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00072971 ID=TCONS_00072971|Name=TCONS_00072971|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1474bp
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CATCAATTGATGGAAGCGAAtttg Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_86:1391776..1400249+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00072971 ID=TCONS_00072971|Name=TCONS_00072971|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8474bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_86:1391776..1400249+ (Clytia hemisphaerica)
TGATTGACGACAAGAAATCATGGTTCATTCCACCTGACTTCAAAGCCAAG
GATATACAACCACTATTCATCGGATTTGAGCCATTTGATAAAGATGAGAT
GGGATTTTACCACACTGGTGAATACTTTTTAGCTAAGGAAGATCCAAAAA
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TTACAACATTGTTGATCTTTTTGACGAGCTTAATggcaaagatttaaaaa
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GCAGAATTTCTTGGCCACGAGAATCCCACTTTACTTATAAGCAGTTATTT
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TTATCAAGATACAAAAAGATCAACTTTGTCACGAGAGAAGATTGGTTATA
GATTTCGAAACCGCTGGTGGATCAGTATTTGCGAGAAGGGAATATACTaa
ggacaaaatatttttctttaaaaggtcttATATTGAAGATAGTGAAGATA
TGATAAACCTAAAGATCATTGAATGTGATTATTCCGGTAATTTCTTATAT
TCGTATGATTTGGAATACATTGAATCGTGGATGTTGTTTAATGTTGTTGA
TCTTAAACATTCAAATTACATATTTCTTTATAATGGCTATGGCGAATTAG
AGGACCTTGAATTAAGAGCTTTAAAACTGGAGAATGGGGTTCGTTTGTCa
ataaatgaaacaaaaaacttCATTCTCTCTGTGAAGGTACCAGTAGAATA
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TTGTTATGCCACTTTACTGTGCCACAAAGGATGTATTTCACCCTGAATTT
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TCCCGTTAAAAAATTTATATCTaggcaaaaatataaaaatgtagtgtttc
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TACTTTCTTGTGAATTATAACATTTTGTCATTCTTTTACAgttacaaaaa
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ATCATGGTTCATTCCACCTGACTTCAAAGCCAAGGATATACAACCACTAT
TCATCGGATTTGAGCCATTTGATAAAGATGAGATGGGATTTTACCACACT
GGTGAATACTTTTTAGCTAAGGAAGATCCAAAAAAAACCGATACCGTGCG
TATTCATATTATCGAATTctataaaagttattctaaattTCTTCAACGCG
TTGTGACCNtaaattgaaagttttgacaTCGTTCAATTATCATCAATTAA
TGGAAGCGGATTTGCCATCGATATTGTTTGActatttgggaattgaaaaa
tgaaaattgtaagTTTACAAGAAggataatttattgaaaaaNTATCCGAT
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tcaACGCATTGTGACCGTTAAACTTCGTTCCTGCGTTGGATATTATAATT
ACGAGCAGCTTTGTTTTTATCCAGATGttggttttcttcttcataCAATC
GAACGTTATTCTAGCGACAGGGAATATTTTACTATCGACCTTTATGGTTN
CATCAATTGATGGAAGCGAAtttg
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00072971-exon-scaffold_86-1491911889:1391776..1393226 | TCONS_00072971-exon-scaffold_86-1491911889:1391776..1393226 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072971-exon-scaffold_86-1510915933:1391776..1393226 | TCONS_00072971-exon-scaffold_86-1510915933:1391776..1393226 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072971-exon-scaffold_86-1575043694:1391776..1393226 | TCONS_00072971-exon-scaffold_86-1575043694:1391776..1393226 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072971-exon-scaffold_86-1491911889:1400227..1400249 | TCONS_00072971-exon-scaffold_86-1491911889:1400227..1400249 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072971-exon-scaffold_86-1510915933:1400227..1400249 | TCONS_00072971-exon-scaffold_86-1510915933:1400227..1400249 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072971-exon-scaffold_86-1575043694:1400227..1400249 | TCONS_00072971-exon-scaffold_86-1575043694:1400227..1400249 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_86 | supercontig | scaffold_86:1391776..1400249 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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