|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00072966 ID=TCONS_00072966|Name=TCONS_00072966|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1906bp
AAAGAAACAGATAACAATGTATAACAGCATTAAGAAATCATGGTTCATCC
CACCAGAATACAAACATAAAGATATCCCACCTTTGTTATTGGGTAATTTT
TCTGTATCAAGCACTTCAAGCTACTCCAACGAGCATGCGCAAGGGTTCTT
CCACACTGGCAAATATTATTTGATCCTACAAGAAGACAAGGAAGAAAATA
TTGTTCACGTGATCAAATTCGATATAGAAGAATTCCAATGGGTACACAGT
CGAATAATTATCAGCTTACCAAAAACTGAACTCGAATGTCACcgagaaaa
tgttttcaattcaACCAGTGGTGTATTGGTTCATATCATACAAACATACC
CAACAAACGAACGTCATGAAACTGTAATGGATCTTTATACTTACAACATT
GTTGATCTTTTTGACGAGCTTAATGGTAAAGATGTAAAAATTCCTGAATC
AACTGAACCAGAATCACCACCAGAAACACCAACATTTTATAATCCTGAGG
ATTTTTCAGAACCCCAAAATTCACCAGATCTATCTTTTATGGCTAGTATC
TTTGAAGATTCGTACGATCAAGATTCGAACGATGAATCTAGTAGACCTAC
ATCGTTTTTTGAATTGCCCTCAGAAtcacaaaatcaaaatctaaacATGG
AACATGGTTCATCAGAGTCACTTAAAGCTGATTTAAATAGAGATTTGCAT
CATCTAGATTCAAAGATTGACGACGAAGCATCCACTCCAGATCTGTCTTT
GGCATATGATCAATTATTCAACTCTATAACTTGTAAATATGCAAAATTTC
TTGGCCACGAGAATGCCACTTTACTTATAAGCAGTTATTTTACTCCGTAT
TATGAGAGTAACCAGGATGAGAGATACAACTATCTGGATTTTATCAAGAT
ACAAAAAGATCAACTTTGTCACGAGAAAAGATTGGTCTTAGATTTCGATA
CGGTTGGTGGATCAGTAATTGCGAGAAGGGAATATACtaaagacaaaata
tttttctttaaaaggtcttATATTGAAGACAGTGAATATATAATGAACTT
AAAGATCCTCGAATGTGATTATTCTGGTAATTTTTTATATTCGTATAATC
TGGAATACATTGAATCGTGGATGTTTAATGTTGTTGATCTTAAATATTCA
AATTACATATTTCTTTATAATGGTTATGGCGAATTGGAGGACCTTGAATT
ACGAGTTTTAAAACTGGAGAATGGGGTTGTTTTGTCaataaatgaaacaa
aaaacttCATTCCCTGTGTGAAAGTACCAGTAGAATATAGAGGAAGGGAC
TTCAGAGTGCGTGCCCCTATCAAGAAGTTCGATCGCCTTGTTATGCCACT
TTACTGTGCCACAAAGGATGTATTTCACCCTGAATTTTACATGGCAATTG
ATTTATCTACTATAGAAGTTGTTCACCAAATTATTTCTCCTGAAAATTCA
CATCCTTGCTATTCTGTAAATTGGAACAATGAAGAAATTGGGATGACTTT
TCGTAAAGATAATCTTCAAAATGCTACGAGACTTGGACCGTTATGTTTTA
AAATGGCTTGCAATAATATTGAAAGGAAAGAAGAAAtgaaatctttgaaa
tattTGGCAAGATTTGCTGTTTTAACATCGTTCAATTATCATCAATTAAT
GGAAGCGAATTTGCCATCGACATTGTTTGActatttgggaattgaaaagt
gaaaattgTAAGATTACAGGAAGgataatttattcaaaaatttgacaaat
tgaaagttttgacaTCGTTCAATTATTACTAATTGATGGAAGCGAATTTG
CCATCGACATTGTTTGACTATTTGGGATAAGATTACAGGAAGGataattt
attaaaatattaacaaattgaaagttttgacaTCGTTCAATTATCACTAA
TTGATG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_86:1389072..1405665+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00072966 ID=TCONS_00072966|Name=TCONS_00072966|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16594bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_86:1389072..1405665+ (Clytia hemisphaerica)
AAAGAAACAGATAACAATGTATAACAGCATTAAGAAATCATGGTTCATCC
CACCAGAATACAAACATAAAGATATCCCACCTTTGTTATTGGGTAATTTT
TCTGTATCAAGCACTTCAAGCTACTCCAACGAGCATGCGCAAGGGTTCTT
CCACACTGGCAAATATTATTTGATCCTACAAGAAGACAAGGAAGAAAATA
TTGTTCACGTGATCAAATTCGATATAGAAGAATTCCAATGGGTACACAGT
CGAATAATTATCAGCTTACCAAAAACTGAACTCGAATGTCACcgagaaaa
tgttttcaattcaACCAGTGGTGTATTGGTTCATATCATACAAACATACC
CAACAAACGAACGTCATGAAACTGTAATGGATCTTTATACTTACAACATT
GTTGATCTTTTTGACGAGCTTAATGGTAAAGATGTAAAAATTCCTGAATC
AACTGAACCAGAATCACCACCAGAAACACCAACATTTTATAATCCTGAGG
ATTTTTCAGAACCCCAAAATTCACCAGATCTATCTTTTATGGCTAGTATC
TTTGAAGATTCGTACGATCAAGATTCGAACGATGAATCTAGTAGACCTAC
ATCGTTTTTTGAATTGCCCTCAGAAtcacaaaatcaaaatctaaacATGG
AACATGGTTCATCAGAGTCACTTAAAGCTGATTTAAATAGAGATTTGCAT
CATCTAGATTCAAAGATTGACGACGAAGCATCCACTCCAGATCTGTCTTT
GGCATATGATCAATTATTCAACTCTATAACTTGTAAATATGCAAAATTTC
TTGGCCACGAGAATGCCACTTTACTTATAAGCAGTTATTTTACTCCGTAT
TATGAGAGTAACCAGGATGAGAGATACAACTATCTGGATTTTATCAAGAT
ACAAAAAGATCAACTTTGTCACGAGAAAAGATTGGTCTTAGATTTCGATA
CGGTTGGTGGATCAGTAATTGCGAGAAGGGAATATACtaaagacaaaata
tttttctttaaaaggtcttATATTGAAGACAGTGAATATATAATGAACTT
AAAGATCCTCGAATGTGATTATTCTGGTAATTTTTTATATTCGTATAATC
TGGAATACATTGAATCGTGGATGTTTAATGTTGTTGATCTTAAATATTCA
AATTACATATTTCTTTATAATGGTTATGGCGAATTGGAGGACCTTGAATT
ACGAGTTTTAAAACTGGAGAATGGGGTTGTTTTGTCaataaatgaaacaa
aaaacttCATTCCCTGTGTGAAAGTACCAGTAGAATATAGAGATAGGGAC
TTGAGAGTGCGTGCCCCTATCAAGAAGTTCGATCGTCTTGTTATGCCATT
TTACTGTACCACAAGGGATGTATTTCACCCTGAATTTTACATGGCAATTG
ATTTATCTACTACAGAAGTTGTTCACCAAATTATTTCTCCTGAAAATTCA
CATCCTTGCTATTCTGTAAATTGGAACAATGAAGAAATTGGGATGACTTT
TCGTAAAGATAATCTTCAAAATGCTACGAGACTTGGACCGTTATGTTTTA
AAATGGCTTGCAAtgatattgaaaagaaagaaaaaattaaatctttgAAA
TATTTGTCAAGATTTGCTGTTTTGACATCGTTTACTTATAATGAATTATT
TAAAGCAAATCTTCCATCTTCATTATTTAATTATTTGGGGATTGAAAACT
AGTTGTTTACTGAATACATTTTCCAccaatatttgaaaaacattggaaaa
atggaggaaaacaaaaaggaaattcatcaaaatcacCTAATATGAAGCGN
AAAAACTAGTTACTTACTGAATACATTTTCCAccaatatttgaaaaacat
tgGAAATAATATGAAGCGAACATTATTAATATTGATAGTTTTGTATCCTT
CCCTTTACGAAATTTTATAAGATtctatcaaacttttttatacTATATTA
TATATTTATAATTAGGATAACTATTTTACagaatttataattttttattt
tatcaaactCAATGAATGAATTCCCAGATTATCTTACAAAAATCAGTGAT
TGTAAGTTTCGGTTGTTCCCCGGGTGGTGTACTACCCTTGCTGACCGatg
ggggtgctccgctgaggttcgaaaaatggaccctacgtgggactcgtttt
ttttttaattttgccgaaatttgcgaaaaagtgacTCTAAATAGGACTGA
AATTCagaaatgttctcaaatttttcactttttccccaaattttccaaaa
aaggcacccttacgAGGGGCAGATTTTTCTGATTGACCCATTTTGCCCTT
GTACCCCCCCCTCCCGGGTTGTTCCTAGATGTTTTAGTACGTTTTAGCAA
TAAACTGTCATTTTCCTATTTAACAGGCCCCAGGTTTTGTGACATGTTGT
ATCTCGCTGTGATATAATAATGGTCTAATTTTATTGCTTTCGACTAGCAG
TTATTGTAAAAAATGGAGGCTTAAATGATAACTTCTTTCTACAGACGAAT
CAAACTGGATATGCCACCATTATCATTGCGCAATCAGTATTTTGGCTTTG
AATCTGAAGGACACTACAATTTTCTGCAATTCCATCATTTTTCTTTATGC
TCGTGATAAAATTGCGTGTACTTTCTTGTGAATTATAACATTTAATGTCC
TTCTTTTACaggtacaaaaaaatattaaaaccaaaaacattaaaagaatT
ACGATGATTGACGACAAGAAATCATGGTTCATTCCACCTGACTTCAAAGC
CAAGGATATACAACCACTATTCATCGGATTTGAGCCATTTGATAAAGATG
AGATGGGATTTTACCACACTGGTGAATACTTTTTAGCTAAGGAAGATCCA
AAAAAAACCGATACCGTGCGTATTCATATTATCGAATTctataaaagtta
ttctaaattTCTTCAACGCGTTGTGACCGTTAAACTTCGTTCCTGCGTTG
GATATTATAATTACGAGCAGCTTTGTTTTTATCCAGATGttggttttctt
cttcataCAATCGAACGTTATTCTAGCGACAGGGAATATTTTACTATCGA
CCTTTATGGTTATCACATTATTAATTGGTTTGAAAAGAACCGGAACAACA
TTGAATTGTGTATGGATCTTAAACCCTCTCCTGATTTAAGTCTGACGTGT
GCCAGTGAATTTAGATTTCTAAGTTATCACAACCATAATATCATTGGAAA
CAATATAAAACTTATCATTTCAGCATTTTCTCAACGAACAGTTGATGAAG
CTAACGGCCCTTCACTCGTATCATATCGATGtttatgtttggattttttA
AACATCGAGCTACATCaaataaagcaagaaaaaagaCTGGTAATAGAATT
AGACAGACCGttggaaaattcttttgtttttcgatATTTTACCAAGCATA
AGATCTATTTTGAAAGGATCGATAACAAACACAATACCATTAAGTCAACA
ATCTTAGAATATGATTACTCGGGTAAATTTTTATATTCATATTCCATTGA
TTATTCCGATTCATTTGTAAAGCATTTCGAATGTATTAGAAATTCAAact
taatatttttatatttttaccccAGAAAAACTAAACCTGAGGATCTTGAA
ATACGAGTTATGAAATTGGAAAGAGGTAAAGCTGAGATTGTTAAAGaagt
taaaaatattatatttccgAAAGAGGACGGAGTTATGTACAAATCAGTCG
CATTAAATGATCCAATTAAAAGATTCAATCATACTGTATTACCAGCTTTA
TTAAGGGACGATGTCCACGGGGTATATATGACTCTGGATTTAACAAACAT
GAAAATTACACGTAAGTCTCAAAGACAAATTATGACTGAAGATGACGATA
TTCAGGCTGTTTCCTTGAATTGGAACAACAAAGAAATTGCAATGATTTCT
TTAAACGATGAGGAATTCGTATTTCAAATTGCACGCAATGATACTGTTGA
AGGGAACGGTAGtgtaaaatctttgaaacatTTGGCAAGATTTGCTGTTT
TGACATCGTTCAATTATCATCAATTAATGGAAGCGAATTTGCCATCAACA
TTGTTTGACTATTTGGgcatagaaaaatgaaaatcgtAAGATTACACGAA
ggataatttattgaaaaatttgacaaattgaaagttttgacaTGGTTCAA
TTATCATCAATTAATGGAAGCAAATTTGCCATCGATATTGTTTGActatt
tgggaattgaaaaatgaaaattgtaagTTTACAAGAAggataatttattg
aaaaatttgacaaaNCAAATCTTTGAAACATTTGGCAAGATTTGCTGTTT
TGACATCGTTGAATTATCATCAATTAATGGAAGCGAATTTGCCATCAACA
TTGTTTGActatttgggaattgaaaaatgaaaattgtaagTTTACAAGAA
ggataatttattgaaaatttgacaaattgaaagttttgacaTCGTTCAAT
TATCATCAATTAATGGAAGCGAATTTGCCATCGATATTGTTTGActattt
gggaattgaaaatgaaaattgtaagTTTACAAGAAggataatttattgaa
aattttaacaaattgaaagttttgacaTCGCTCAATTATCATCAATTGAT
GGAAGCGGATTTACCATCGATATTGTTTGActatttgggaattgaaaatg
aaaattgtaagTTTACAAGAAggataatttattgaaaattttaacaaatt
gaaagttttgacaTCGCTCAATTATCATCAATTGATGGAAGCGGATTTAC
CATCGATATTGTTTGActatttgggaattgaaaatgaaaattgtaagTTT
ACAAGAAggataatttattgaaaattttaacaaattgaaagttttgacaT
CGCTCAATTATCATCAATTGATGGAAGCGGATTTACCATCGATATTGTTT
GActatttgggaattgaaaatgaaaattgtaagTTTACAAGAAggataat
ttattgaaaattttaacaaattgaaagttttgacaTCGCTCAATTATCAT
CAATTGATGGAAGCGGATTTACCATCGATATTGTTTGActatttgggaat
tgaaaatgaaaattgtaagTTTACAAGAAggataatttattgaaaatttt
aacaaattgaaagttttgacaTCGCTCAATTATCATCAATTGATGGAAGC
GGATTTACCATCGATATTGTTTGActatttgggaattgaaaatgaaaatt
gtaagTTTACAAGAAggataatttattgaaaattttaacaaattgaaagt
tttgacaTCGCTCAATTATCATCAATTGATGGAAGCGGATTTACCATCGA
TATTGTTTGActatttgggaattgaaaatgaaaattgtaagTTTACAAGA
AggataatttattgaaaattttaacaaattgaaagttttgacaTCGCTCA
ATTATCATCAATTGATGGAAGCGGATTTACCATCGATATTGTTTGActat
ttgggaattgaaaatgaaaattgtaagTTTACAAGAAggataatttattg
aaaattttaacaaattgaaagttttgacaTCGCTCAATTATCATCAATTG
ATGGAAGCGGATTTACCATCGATATTGTTTGActatttgggaattgaaaa
tgaaaattgtaagTTTACAAGAAggataatttattgaaaattttaacaaa
ttgaaagttttgacaTCGCTCAATTATCATCAATTGATGGAAGCGGATTT
ACCATCGATATTGTTTGActatttgggaattgaaaatgaaaattgtaagT
TTACAAGAAggataatttattgaaaattttaacaaattgaaagttttgac
aTCGCTCAATTATCATCAATTGATGGAAGCGGATTTACCATCGATATTGT
TTGActatttgggaattgaaaatgaaaattgtaagTTTACAAGAAggata
atttattgaaaattttaacaaattgaaagttttgacaTCGCTCAATTATC
ATCAATTGATGGAAGCGGATTTACCATCGATATTGTTTGActatttggga
attgaaaatgaaaattgtaagTTTACAAGAAggataatttattgaaaatt
ttaacaaattgaaagttttgacaTCGCTCAATTATCATCAATTGATGGAA
GCGGATTTACCATCGATATTGTTTGActatttgggaattgaaaatgaaaa
ttgtaagTTTACAAGAAggataatttattgaaaattttaacaaattgaaa
gttttgacaTCGCTCAATTATCATCAATTGATGGAAGCGGATTTGCCATC
GATATTGTTTGACtatttggaaattgaaaaatgaaaattgtaagTTTACA
AGAAggataatttattgaaaaatttaacaaattgaaagttttgacaTCGC
TCAATTATCATCAATTGATGGAAGCGGATTTACCATCGATATTGTTTGAc
tatttgggaattgaaaaatgaaaattgtaagTTTAGACGGTATGAACTTT
TTCAGGAAAACCTCATAGTCCCTGTTGAGGTGGCTTATTTTCGTTCCAGG
GGGAGATATGGTCGGATTCCATAGTGGTATACAAAATTCCGTCAGTAATA
ATTTAATTCaaattaggaaatttttcatcttttaaattcattaaaaatac
AGAATTTTATTCAAGCTGTTTCCTTGAATTGGAACAACGAAGAAATTGCA
ATAATGATTTCTTTAAACGATGAGGAATATCTATTTGGCTTGGGAATGAA
AAGTGAAAATCGTAAGATTACATGAaggttaatttgaaaaatttaacaaa
atgaaagtttttacATCATTAAATTATCATCAATTGATGGAAGCGAAttt
gctaagggtccgagggacGAAAGTCAgacagctaggacacgcagataGAA
AAACGTGATAGCGAATCCTTATGTTGGTTTTTATAAAaccttcgtcataa
cttttcgaattaaaaaatctttttgagtgTGAATACGTAAATTTTCACTT
TTCCACCTTACGTACAAATTTTGCCtattttttttcgctttttcaCCGAT
GTATTATTTTGACTGTGACACTGAACATTGAATTCAATATCACTTTCCTC
TATTTTTAAGGTAAAAAGAAACAGATAACAATGTATAACAGCATTAAGAA
ATCATGGTTCATTCCACGTGAATACGAAAATAGAGATATTCCACCTTTGT
TATTGGGTAATTTTTCTGTATCAAGCACTTCAAGCTACTCCAACGAGCAT
GCGCAAGGGTTCTTCCACACTGGTAAATATTATTTGATCCTacaagaaga
aaaggaagaaaatatcGTTCACGTGATCAAATTCGATATAGAAGAATTCC
AATGGGTACACAGTCGAATAATTATCAGCTTACCAAAAACTGAACTAGAT
GGTCACcgagaaaatgttttcaattcaACCAGTGGTGTATTGGTTCATAT
CATACAAACATACCCAACAAACGAACGTCATGAAACTGTAATGGATCTTT
ATAATTACAACATTGTTGATCTTTTTGACGAGCTTAATggcaaagattta
aaaattccTGAATCAACTGAACCAGAATCACCACCAAGAACACCAACATT
TTATAATCCTGAGGATTTTTCAGAACCCCAAAATTCACCAGATCTATCTT
TTATGGCTAGTATCTTTGAAGATTCGTACAATCAAGATTCGAACGATGAA
TCTAGTAGACCTACATCGTTTTTTGAATTGCCCTCAGAATCACAAAGTCA
AAATCTAAACAGGGAACATGGTTCACCAGAGTCACTTAAAGCTGATTTAA
ATAGAGATTTGCAGCATCATGattcaaaaattgatgacgaAGCATCCACT
CCAGATCTGTCTTTGACATATGATCAATTATTCAACTCGATAACTTGTAA
ATATGCAGAATTTCTTGGCCACGAGAATCCCACTTTACTTATAAGCAGTT
ATTTTACTAAGTATTATGAGAGTAACCAGGACGAGAAATACAACTATCTG
GATTTTATCAAGATACAAAAAGATCAACTTTGTCACGAGAGAAGATTGGT
TATAGATTTCGAAACCGCTGGTGGATCAGTATTTGCGAGAAGGGAATATA
CTaaggacaaaatatttttctttaaaaggtcttATATTGAAGATAGTGAA
GATATGATAAACCTAAAGATCATTGAATGTGATTATTCCGGTAATTTCTT
ATATTCGTATGATTTGGAATACATTGAATCGTGGATGTTGTTTAATGTTG
TTGATCTTAAACATTCAAATTACATATTTCTTTATAATGGCTATGGCGAA
TTAGAGGACCTTGAATTAAGAGCTTTAAAACTGGAGAATGGGGTTCGTTT
GTCaataaatgaaacaaaaaacttCATTCTCTCTGTGAAGGTACCAGTAG
AATATAGAGGAAGGGACTTCAGAGTGCGTGCCCCTATCAAGAAGTTCGAT
CGCCTTGTTATGCCACTTTACTGTGCCACAAAGGATGTATTTCACCCTGA
ATTTTACATGGCAATTGATTTATCTACTATAGAAGTTGTTCACCAAATTA
TTTCTCCTGAAAATTCACATCCTTGCTATTCTGTAAATTGGAACAATGAA
GAAATTGGGATGACTTTTCGTAAAGATAATCTTCAAAATGCTACGAGACT
TGGACCGTTATGTTTTAAAATGGCTTGCAATAATATTGAAAGGAAAGAAG
AAAtgaaatctttgaaatattTGGCAAGATTTGCTGTTTTAACATCGTTT
ACTTATAATGAATTATTTAAAGCAAATCTTCCATCTTCCTTATTTAATTA
TTTGGGGATTGAAAACTAGTTGCTTACTGAATACAAATACATTTTCCact
aatatttgaaaaacatttgaaaaatggagGAAAAACAATAAggaaattca
tcaaaatcacCTAATATGAAGCGAACATTATTAATATTGATAGTTTTGTA
TCCTTCCCGTTAAAAAATTTATATCTaggcaaaaatataaaaatgtagtg
tttcacgaaaccggccgggtgaaaaaaaaaaaattctgacccggccgcag
actatgggttcatctatatggttcatcGTAAAGAAAATCAATCTGACCGT
TCAAACTATCAAACGCTGTTTGGTTAGATATTttcgcttgtaaatcaagt
tttgttcgttagtagtcGATGCATTGGTGTTCAAGACTTCATACtgttta
taaataaaagttatctttaaagttctatttcaatgatctttatagttatc
aaaaaaagcaaaacaaaatttttcccgTTCGGCCGCATGAGAGTTTTGTT
CCTCCACCCGCATTCTGGAAACactgcatttttttattttcgctctACCA
AACTATTTTATACCCGCTATATTAagacagatattttacaaaatttataa
tttttatattaTCAAACCCAATGAATAAATTACCagattttcttacaaaa
atcagTAATCGTAAGTTTCGGTTGTTCCCCAGGGGacggggtactaccct
tgtcgactgACAGGgcgctccgctgaggttcgaaaaatggaccctacgtg
ggactcgttttttaaaaaattttgccgaaatttgcgaaaaaagtgactcT
GAATGGGACTGGAGttccaaaatttctccaaagttttaaaattttctact
ttttccccaagtTTTCCCAAaagagggactgatttttctattttggtgtt
ttagcaaccctacctgggactcttggaggttaaaaaaggtaccctaacca
gcggcgcatccccgtaacccattttgccctagtatcCCCCCCCCCAGGGT
TGTTCTTAGATGTTTATAGTACGTTTCAGCAATAAACTATCATTTTCCTA
TTTCAAGCCCCAGGGGCTTTTTGTGACATGTTGTATCTCGACGTGATATA
ATAATTGTCTAACTTTATTGCTTTCAACTTAGCagttattgtaaaaaaaa
aggacATTGTTTGActatttgggaattgaaaagtgaaaattgTAGCATTA
TACAGGGAAAAtgaaatctttgaaataatTAGTAAGATTGAATATTTTAC
CATTATACTGTTATATCTTTATAGGTATGGAACTCAATTGGTCATTGACC
AGAGTAATGAGGCGTAGTTAAACATTTTATGGTTACAATGCTTTTtttaa
tggaaatttttaaaataagggGACAATTTAAGATTCAGTGAAGCCTTTAT
CAGTTTTTACCAAagagattgaagattttttcaatATCTATTACATAGAT
CAATATAAATtctaataatttttcatttccaaaaaagttttatattttat
cTATtgtaccaaaaatattttgtttcttttgaagTTTTGTTAGATCTTTG
AGCAATGTTTACTATCAAACACCTATCAAACATCGGACGGGTATCAGGAA
CACAAGCGTAGGAGTACCCTTGTTAGATATCTCTGCATTGAAAGTATAAA
GTAAGGCCAATTAAGTTGAGGAAATCGGTTAAAATATCTGGTTAAAATCA
CTACAAGTTTCTATAATTCCACCATTTTTCTTTAGCTCGTGATAAAATTG
CATGTACTTTCTTGTGAATTATAACATTTTGTCATTCTTTTACAgttaca
aaaaaacattaaaatcaaaaacattaaaaaaattgcGATGATTGACGACA
AGAAATCATGGTTCATTCCACCTGACTTCAAAGCCAAGGATATACAACCA
CTATTCATCGGATTTGAGCCATTTGATAAAGATGAGATGGGATTTTACCA
CACTGGTGAATACTTTTTAGCTAAGGAAGATCCAAAAAAAACCGATACCG
TGCGTATTCATATTATCGAATTctataaaagttattctaaattTCTTCAA
CGCGTTGTGACCNtaaattgaaagttttgacaTCGTTCAATTATCATCAA
TTAATGGAAGCGGATTTGCCATCGATATTGTTTGActatttgggaattga
aaaatgaaaattgtaagTTTACAAGAAggataatttattgaaaaaNTATC
CGATACTGTGCGTATTCATATTATCGAATTCTGTaaaagtttttctaaat
ttcttcaACGCATTGTGACCGTTAAACTTCGTTCCTGCGTTGGATATTAT
AATTACGAGCAGCTTTGTTTTTATCCAGATGttggttttcttcttcataC
AATCGAACGTTATTCTAGCGACAGGGAATATTTTACTATCGACCTTTATG
GTTNCATCAATTGATGGAAGCGAAtttgctaagggtccgagggacGAAAG
TCAgacagctaggacacgcagataGAAAAACGTAATAGCGAATCCTTATG
TTGGTTTTTATAAAaccttcgtcataacttttcgaattcaaaaatctttt
tgagtGTGAATACGTAAATTTTCACTTTTCCACCTTACGTACAAATTTTG
CCtattttttttcgctttttcaCCGATGTATTATTTTGACTGTGACACTG
AANGATATCATTGGAAACAATATAAAACTTATCATTTCAGCATTTTCTCA
ACGAACAGTTGATGAAGCTAACGACCCTTCACTCGTATCATATCGAAGtt
tatgtttggattttttAAACATCGAGCTACATCaaataaagcaagaaaaa
agaCTGGTAATAGAATTAGACAGACCGttggaaaattcttttgtttttcg
atATTTTACCAAGCATAAGATCTATTTTGAAAGGATCGATAACAAACACA
ATACCATTAAGTCAACAATCTTAGAATATGATTACTCGGGTAAATTTTTA
TATTCATATTCCATTGATTNCTCTTCCACACTGGTAAATATTATTTGTTC
CtacaagaagaaaatgaagaaaatatcgTTCACGTGATCAAATTCGATAT
AGAAGAATTCCAATGGTTGCACAGTCGAATTATTATCAGATTACCAGAAA
CTGAACTCGAATGTCACcgagaaaatgttttcaattcaACCAGTGGTGTA
TTGGTTCATATCATACAAACATACCCAACAAACGAACGTCATGAAACTGT
AATGGATCTTTATACTTACAACATTGTTGATCTTTTTGACGANAGAAACT
GTAATGGATCTTTATAATTACAACATTGTTGATCTTTTTGACGAGCTTAA
TGGTAAAGATGTAAAAATTCCTGAATCAACTGAACCAGAATCACCACCAA
GAAAACCGACATTTTATAATCCTGAGGATTTTTCAGAACCCCAAAATTCA
CCAGATCTATCTTTTATGACTAGTATCTTTGAAGATTCGTACGATCAAGA
TTCAAACGATGAATCTAGTAGACCTACATCGTTTTTTGAATTGCCCTCAG
AAtcacaaaatcaaaatctaaacATGGAACATGGTTCATCAGAGTCACTT
AAAGCTGATTTAAATAGAGATTTGCATCATCAAGATTCAAAGATTGACGA
CGAAGCATCCACTCCAGATCTGTCTTTGGCATATGATCAGTTATTTAACT
CTATAACTTGTAAATATGCAAAATTTCTTGGCCACGAGAATGCCACTTTA
CTTATAAGCAGTTATTTTACTCCGTATTATGAGAGTAACCAGGATGAGAG
ATACAACTATCTGGATTTTATCAAGATACAAAAAGATCAACTTTGTCACG
AGAAAAGATTGGTCTTAGATTTCGATACGGTTGGTGGATCAGTAATTGCG
AGAAGGGAATATACtaaagacaaaatatttttctttaaaaggtcttATAT
TGAAGACAGTGAAGATATAATGAACCTAAAGATCCTCGAATGTGATTATT
CTGGTAATTTTTTATATTCGTATAATCTGGAATACATTGAATNTAGTGAA
GAAATAATGAACTTAAAGATCCTTGAATGTGATTATTCTGGTAATTTTTT
ATATTCGTATGATTTAGAATACATTGAATCGTGGATGTTTAATGTTGTTG
ATCTTAAACATTCAAATTACATATTTCTTTATAATGGTTATGGCGAATTG
GAGGACCTTGAATTAAGAGTTTTAAAACTGGAGAATGGGGTTCTTTTGTC
aataaatgaaacaaaaaacttCATTCCCTGCGTGAAAGTACCAGTAGAAT
ATAGAGATAGGGACTTGAGAGTGCGTGCCCCTATCAAGAAGTTCGATCGC
CTTGTTATGCCATTTTACTGTACCACAAGGGATGTATTTCACCCTGAATT
TTACATGGCAATTGATTTATCTACTACAGAAGTTGTTCACCAAATTATTT
CTCCTGAAAATTCACATCCTTGCTATTCTGTAAATTGGAACAATGAAGAA
ATTGGGATGACTTTTCGTAAAGATAATCTTCAAAATGCTACGAGACTTGG
ACCGTTATGTTTTAAAATGGCTTGCAatgatattgaaaagaaaaaaaaaa
taaatctttgaaATATTTGTCAAGATTTGCTGTTTTGACATCGTTTACTT
ATAATGAATTATTTAAAGCAAATCTTCCGTCTTCATTATTTAATTATTTG
GGTATTGAAAACTAGTTGCTTACTGAATACATTTTCCAccaatatttgaa
aaacattgGAAAAATGGAGGAAAAGCAAAAAggaaattcatcaaaatcac
CTAATATGAAGCGAACATTATTAATATTGATAGTTTTGTATCCTTCCCTT
TATGAAATTTTATAAGATTCTATCAAACTATTTTATACCATATTACATAT
TTATAATTAGGACAACTATTTTACagaatttataattttttattttatca
aacaacTCAATGAATGAATTGCCAGATTATCTTACAAAAATCAGTGAGCG
TAAGTTTCGGTTGTACCCGGGGTGGTGTattacccttgtcgaccgacggg
ggttgctccgctgaggttcgaaaaatggaccctacgtgggactcgcttat
tcaaactttttgcctaaatttgcgaaaaagtgacTCTAAATAGGACTGAA
ATTCCAGAATgttatcaaatttttcactttttccccaaattttccaaaaa
aggcacccttacgAGGGGCAGATTTTTGTattaacccattttgccctagt
accccccccccccNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNtccccccccccccgggggttgtT
CTTAGATGTTTTAGTACGTTTCAGCAATGAACTGTCATTTTCCATTTAAC
AGGCCCCTGGTTATGTGACATGTTGTACCTCGCTGTGATATAATAATGGT
CTATTTTTATTGCTTTCGACTAGCagttattcaaaaaatggaGGCTTAAA
TGATAAACTTCTTTCTACAGATGAATCTAACTGGATATGCCACCATTGCG
CAATCAGTATTTTGGCTTTGAATCTGAAGGACACTACAATTTTCTACAAT
TCCATCATTTTTCTTTATGCTCGTGATAAAATTACATGTACTTTCATGGG
AATTATAACATTTAATGTCCTTCTTTTACaggtacaaaaaaatattaaaa
ccaaaaatattgaaaaagaatgatTGACGGCAAGAAATCATGGTTCATTC
CACCTGACTTCAAAGACAATGATATACAACCACTATTCGTCGGCAATGTA
TCATTTGATAAAGAAGAGGTGGGATTTTACCACACCGGTCAGTACTTTTT
AGCTAAGGAAGAAACATGGATAAAAAAAACCGATACCGTGCGTATTCATA
TTATCGAATTCGATAAAAGTTCTTCTAAATTTCTTCGAAGCGTTGTGACC
GTTAAACTTCGTTCCTGCGTTGGATATTATAAATGCGATCAGTTTTGTTT
TTATCCAGATGTTGGTTTTCTTCTACATACAATCGAACGTTATTCCAGCG
ACAGGTAATATTTTACTAACGACCTTTATGGTTATCACATTATTAACTGG
TTTGAAAAGAACCGGAACAACAGTGAATTGTGTATGGATCTTAAACCCTC
TCCTGATTTAAATCTGAGGTATGCCAGTGAATTTAGATTTCTAAGTTATC
ACTACTATAATATCATTGGAAACATTAAGAGACTTATCATTTCAGCCTTT
TCTCAACGAACAGTTGATGAAGCTAACGGCCCTTCACCCGTATTATATCA
AAGtttatgtttggattttttAAACATCGAGCTACATCAAATAAAGCGAG
AAAAAAGACTGGTAATTGAATTAGACAGACCGttggaaaattcttttgtt
tttatgatattttactAAGCATAAGATCTATTTTGAAAGGATTGGTAACA
AACACAATACCATTAACTCAGCAATTTTAGAATATGATTACTCGGGTAAA
TTTTTATATTCATATTCGATTGATTATCCCGATTCATTTGTAAAGCATTT
CGAATGTATTAGAAATTCGAACTTAATATTTTTATACCCCAGAAAAACTA
AACCTGAGGATCTTGAAATACGAGTTATCAAATTGGAAAGAGGTAAAGCT
GAGGTTGTTAAAGAAGTTAGAAATATTATATTTCCGAAAGAGGACGGAGT
GATGTACAAATCAGTCGCATTAAATGATCCAATCAAAAGATTCAATCATA
CTGTATTACCAGCTTTATTAAGGGACGATGTCCACGGGGTATATATGACT
CTGGATTTAACAAACATGAAAATTACACGTAAGTCCCAAAGACAAATTAT
GACTGAAGATGACGATATTCAAGATTTTTCCTTGAATTGGAACAACGAAG
AAATTGCAATGATTTCTTTAAACGATGAGGAATATCTACTACCGGGAGGT
GAGTATGCATTCGTAtttcaaatacacgttttttttttataagaacaaac
tatataagaacataaggcttcgagcccaaaaatttaagaacattctaaga
acatactaaggctttggagacttaaaaacatgcaatttcttaagaaatta
catcaaaaNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Ntaagaaattacatcaaaatgctcaaaaaatgctgaaaataagaacattt
taagaacatttttaggcttcaaatccaaaaaactaagagcatccgaaggc
ttcgaaattttttgacgttcttataaaaaaaaaacgtgtagtacaCAATA
ACACTGTTGAAGGGAAAGGCAGTGTCAAATCTTTGAAACAACTGGCAAGA
TTTGCTGTTTTGACATCGTTCAATTATCATCAATTAATGGAAGCGAATTT
GCCATCGACATTGTTTGActatttgggaattgaaaagtgaaaattgTAAG
ATTACAGGAAGgataatttattcaaaaatttgacaaattgaaagttttga
caTCGTTCAATTATTACTAATTGATGGAAGCGAATTTGCCATCGACATTG
TTTGACTATTTGGGATAAGATTACAGGAAGGataatttattaaaatatta
acaaattgaaagttttgacaTCGTTCAATTATCACTAATTGATG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1491911889:1389072..1390344 | TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1491911889:1389072..1390344 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1510915933:1389072..1390344 | TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1510915933:1389072..1390344 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1575043694:1389072..1390344 | TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1575043694:1389072..1390344 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1491911889:1397412..1397764 | TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1491911889:1397412..1397764 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1510915933:1397412..1397764 | TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1510915933:1397412..1397764 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1575043694:1397412..1397764 | TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1575043694:1397412..1397764 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1491911889:1405386..1405665 | TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1491911889:1405386..1405665 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1510915933:1405386..1405665 | TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1510915933:1405386..1405665 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1575043694:1405386..1405665 | TCONS_00072966-exon-scaffold_86-1575043694:1405386..1405665 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_86 | supercontig | scaffold_86:1389072..1405665 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
