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transcript sequence >TCONS_00072965 ID=TCONS_00072965|Name=TCONS_00072965|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1912bp
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CACTAATTGATG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_86:1389069..1405665+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00072965 ID=TCONS_00072965|Name=TCONS_00072965|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16597bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_86:1389069..1405665+ (Clytia hemisphaerica)
GTAAAAGAAACAGATAACAATGTATAACAGCATTAAGAAATCATGGTTCA
TCCCACCAGAATACAAACATAAAGATATCCCACCTTTGTTATTGGGTAAT
TTTTCTGTATCAAGCACTTCAAGCTACTCCAACGAGCATGCGCAAGGGTT
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GTATTGGTTCATATCATACAAACATACCCAACAAACGAACGTCATGAAAC
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CTTAAAGCTGATTTAAATAGAGATTTGCATCATCAAGATTCAAAGATTGA
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ACTCTATAACTTGTAAATATGCAAAATTTCTTGGCCACGAGAATGCCACT
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GAGATACAACTATCTGGATTTTATCAAGATACAAAAAGATCAACTTTGTC
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GCGAGAAGGGAATATACtaaagacaaaatatttttctttaaaaggtcttA
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ATTCTGGTAATTTTTTATATTCGTATAATCTGGAATACATTGAATNTAGT
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TTTATATTCGTATGATTTAGAATACATTGAATCGTGGATGTTTAATGTTG
TTGATCTTAAACATTCAAATTACATATTTCTTTATAATGGTTATGGCGAA
TTGGAGGACCTTGAATTAAGAGTTTTAAAACTGGAGAATGGGGTTCTTTT
GTCaataaatgaaacaaaaaacttCATTCCCTGCGTGAAAGTACCAGTAG
AATATAGAGATAGGGACTTGAGAGTGCGTGCCCCTATCAAGAAGTTCGAT
CGCCTTGTTATGCCATTTTACTGTACCACAAGGGATGTATTTCACCCTGA
ATTTTACATGGCAATTGATTTATCTACTACAGAAGTTGTTCACCAAATTA
TTTCTCCTGAAAATTCACATCCTTGCTATTCTGTAAATTGGAACAATGAA
GAAATTGGGATGACTTTTCGTAAAGATAATCTTCAAAATGCTACGAGACT
TGGACCGTTATGTTTTAAAATGGCTTGCAatgatattgaaaagaaaaaaa
aaataaatctttgaaATATTTGTCAAGATTTGCTGTTTTGACATCGTTTA
CTTATAATGAATTATTTAAAGCAAATCTTCCGTCTTCATTATTTAATTAT
TTGGGTATTGAAAACTAGTTGCTTACTGAATACATTTTCCAccaatattt
gaaaaacattgGAAAAATGGAGGAAAAGCAAAAAggaaattcatcaaaat
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tcaaacaacTCAATGAATGAATTGCCAGATTATCTTACAAAAATCAGTGA
GCGTAAGTTTCGGTTGTACCCGGGGTGGTGTattacccttgtcgaccgac
gggggttgctccgctgaggttcgaaaaatggaccctacgtgggactcgct
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ACAAACACAATACCATTAACTCAGCAATTTTAGAATATGATTACTCGGGT
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ATACTGTATTACCAGCTTTATTAAGGGACGATGTCCACGGGGTATATATG
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TATGACTGAAGATGACGATATTCAAGATTTTTCCTTGAATTGGAACAACG
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TTGTTTGACTATTTGGGATAAGATTACAGGAAGGataatttattaaaata
ttaacaaattgaaagttttgacaTCGTTCAATTATCACTAATTGATG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1491911889:1389069..1389724 | TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1491911889:1389069..1389724 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1510915933:1389069..1389724 | TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1510915933:1389069..1389724 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1575043694:1389069..1389724 | TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1575043694:1389069..1389724 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1491911889:1396789..1397764 | TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1491911889:1396789..1397764 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1510915933:1396789..1397764 | TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1510915933:1396789..1397764 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1575043694:1396789..1397764 | TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1575043694:1396789..1397764 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1491911889:1405386..1405665 | TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1491911889:1405386..1405665 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1510915933:1405386..1405665 | TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1510915933:1405386..1405665 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1575043694:1405386..1405665 | TCONS_00072965-exon-scaffold_86-1575043694:1405386..1405665 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_86 | supercontig | scaffold_86:1389069..1405665 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
