TCONS_00072642 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00072642
Unique Name	TCONS_00072642
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1448

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_80:326213..342203-

transcript sequence

>TCONS_00072642 ID=TCONS_00072642|Name=TCONS_00072642|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1448bp
gaaaaatatatataaaaatgtgACAAGCACAGAAAGTTCATTTTGAAGTT
CCCAAACATGGCTATGCAAAAATGCCACATCATCAAAGATCCCCACAATA
AACAAATCACCTCTATTTGTTACAATCCATTAAAACATGAAATAGCTGCT
GGATTAGAAGATGGGACAATTAAAACTTGGGATTGTGTTGGCGAAAATAT
CGGCAAACTTACAAAAACATGCCATGAACATGATGGATGGGTCAATTGCT
TACTATATTGGCCAGATGCAAAGCTTTTGTTATCAGCTGCAAATGATGGG
AAGTTGATAGCATGGGGATCCAGTATGTTGCCTATGTCCGTCTCAAAGAT
AGGAACTCCAATTTATTGTATGGCCTGGAACATCCGGAGAAGTCAAATTA
TTCTTGGTGTGAACAGTGCTTTAAAAGTATACACACTGAAGGACCCTTct
aTAATCCGTCTCTATCCCTACCAAGCTGACTTCACGTTGGATATATGGTC
TGACAATGATGGTGGCCCGACTTACGAAGCCTATGGTGAGATCAAATTCA
atattggatttttcgatttcaacCAAAACGTCGTGATGTGGCATTTGTGG
AAACCCAATTATTTGAACGTCCTAAATGGTGCAACGCATACTATTACCAA
TACTCATATTTTCCAGGAAACCAACGAGTTTGCTCATGCAGGAAATTTAA
CAGCTCTAGGCACTGTTTGGGAGTGGGATGACTTTGGAGATGATAATAAT
GGATCGCCACACGGTGACGTGTTCCAAATGAAAGACGTACTGGATGAAAG
TGTCAAACGACGTTATGATGGATACGGTGCAGCGCATATTGACATTACAC
TTAAAATCACCAGACTTTGAATATCAAAGTGACGTTTCTGGATAATCGTT
AACGACAGTGAAATGAAAACCTTTTCTTTTCATCCATTATTATTAAAAAC
ACTAAAgggattgtaaaaaaaaaacactgtcTAGTGTTAGTTGTAGGCGG
ACTTTACTGACTTTACTACTTAATGTTTTCCTTTCCTATTTGGTATTCCA
TATTCTATTCTGCATTCTTCCTAAAAAAGAAGTGTTTCTACGATGGGTCT
CTTTTTTTGTCGCTTTATTGTTgttatatcaaagaaattcattaaaataa
atctattgtcaatttcatgaacaGATTTTATGActtaaagtaattaagaa
aattatttaaaaaaatattcgaacgttcgattatgggagtgttttatgtA
AATctatttatataatttttgttttgttttttcatctAGGTGTTtgataa
aacatatattcaataggttttcgttggttattggatttattaaccatcgg
tgatgtatattcaactcggcttcgcctcgttgaatactttaatcggatta
atttttacgagattaaatttttgccattttcgcgaaattaaaactcgc

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_80:326213..342203-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00072642 ID=TCONS_00072642|Name=TCONS_00072642|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15991bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_80:326213..342203- (Clytia hemisphaerica)
GAAAAATATATATAAAAATGTGACAAGCACAGAAAGTTCATTTTGAAGTT
CCCAAACATGGCTATGCAAAAATGCCACATCATCAAAGATCCCCACAATA
AACAAATCACCTCTATTTGTTACAATCCATTAAAACATGAAATAGCTGCT
GGATTAGAAGGTTTGTTGAAAAGCATGGAGAATTAGGCAAAAAGTTTGTT
CACTTTTAGTGTGCACTCTTCTTCTAACCTTTTAGAAACTAAAAGGAAAT
TCCTCTACAATCATGAAAGTCAGAATATTTGGGCATTTCTGGGTATTTTA
GCATTATGCAGAATTAAAAGTTCAATGAGAATGACATTTTCAGACTTGCT
ACTTTATCTAATCGAATATTTCGGTTTTAGAGGGGTATAATTGCTTCCCT
AGGCTATATTCTCAGTCTAGTGGGACCATTCACAAGCTTTTGGAGCCTCA
GATATCCTAAGCTCACAGTCTTAAAAGTTTCACGTAAGACTCGGAGTTAA
AACTCTACTTTCTAACTGAATAGGGTGGATTATTCGATTTGATCCATATT
TTTGTCGCACCCATTATATTTTATAATACAATGTTTTTAGATGGGACAAT
TAAAACTTGGGATTGTGTTGGCGAAAATATCGGCAAACTTACAAAAACAT
GCCATGAACATGATGGATGGGTCAATTGCTTACTATATTGGTATTTTTTG
TCTTCATTTCTTTATAAGGATTATGGCTGAAAGAAATATTATCTCATGGG
TCCGTCAATGAATCCTCATCTTCTTCTCAATCAAGGAAAATATGAATACC
ATACAATTCCAATACTTTATTTTACTCTTCATGAAATTACACTTTTTATA
AAGTAGATACATTGAAATTAGCAATTAAACTTCCTGACCTTTTAAAGGTT
ATCAAGGGGACAAAATACAAAAATTATGTGTTCTTTATAAGTCTCATAAA
GTAATCTTTTCCTTCACTCAGGCCAGATGCAAAGCTTTTGTTATCAGCTG
CAAATGATGGGAAGTTGATAGCATGGGGATCCAGTATGTTGCCTATGTCC
GTCTCAAAGGTGACAAATTTGTTTAAAACTTTTCTATGTTATAAAAACAA
AGTTTTCGAGAAATAAAGATTTTTTAGCTGAAGAGACAAGAGTTCCAAAG
AGTCTATTGTTAGTTTTATATTTTCCATTTTTGAGTTTTATCTATATAAA
AAGGCTGGCTTGAGAATGTCTGTTTGTAATTGTCTTTCTTTCTGCTGTCC
GAAATCTTTTTTAGAGCCTTTCAAAAATTATACGCCTAGTGGATTCCACT
CCTTCGTGCAAGCTCTTTTTTCATATTTTAACAGTAAGCTTTTGAATCAT
CATAATAATTAAATGATCTCAATTCAAATCCTTCATTTTAGATAGGAACT
CCAATTTATTGTATGGCCTGGAACATCCGGAGAAGTCAAATTATTCTTGG
TGTGAACAGTGCTTTAAAAGTATACACACTGAAGGACCCTTGTAAGTTTC
CTCTTTAATTTTTATGGTTGGTTTGGATTTAGGGGTACCAGGTTATAAAA
TTGGTATCAACATTTTCATAAACGAATAATTTTCAAAAGCTCTACCATTT
ATCGCGTCGATTTCAGTTCATCAAGGATAATTTGACAATGACCTAACACT
CGGCTTAATGGTTAACCTAAATACTTTTGGATATTATATGGGTGGTGGTT
CATTTTTCTGTTTTTCAGAAATTGAAAAACCCTCTAAATTAAAAAAAAAT
TACACAATTTTATCAATATGATCCATGCTGTGAGGTTATTTTATGAGTTA
TAATTGCGTTGATTCGCTGAATAAGAGAGTGTTTTATATGGATTTCGGAC
TTGGATATACCAGTAGAATATTAAAAAAGCACCAAAAACGTCTTGTTTAA
AACCTCTGAAAGCTTTAAACTTTAAATGCAAATAACAGTTAAAACTGACT
AAAAGATTTGATACGTTTTATAATGAACGAAAAACTTCAAGTGGATTGTC
GCGAGTTCAAGATTAAGAATGATAAAAATTAACAGAAGCATTTTTTGTTT
TTGTTAAAAATTTAAAAATTCAAACGATTAAGAATGATTTTATCATATGA
AACGAAATAAAAACATTTTGAAAATAAAACCATACGATAGTGATGCATAA
AACCCCAAACATATAGCAATGACTGGTCAGGTGGTATTTATTACTTATTG
AAAGCGTGACAAGATTGTGTTATGAATATTATTCAATATATATAATATTA
TGTACAATGCTGGACAACATAATAGTCACATTATACTGTTCAAAATTCAT
CCTCGGCCAAACAAAATTTTAAACACAATTTAAACAAGTGCATGATATCT
AAATCTCCAAAAAAAAAACGCGTTGGTGCAATGCAACATGCTCCGTCCAA
CCAAGCTTTAAAGGCTCAGATTATTTCTTAATAATAACAATGATAATAAT
GATAACATATGTTTTAAATGGAATGCTCCGAAAAATTCCAAAAGCTTTTA
GGCAGCTGAAGAATTGTTTTTACAAAGGTCCACCCTTCATTTCAATCCAG
AGTACATTCTTAAATGTTGTTTGTTTGACAAAGGTATTATGATTCAAAGT
TTTGTCAATTTTAAAGTAATCTTCAAGTATGCTCCATCTTCGCCATCGTA
TACTGTCATTATGTCTTTTCCTAGAATATCTTTGGCTTGAAATAGATCAT
TGGTGGGACTCCCTATTGTATCATCGACAGTATTTCCGTCGGTTTCCATA
ACACGGCCATTGACGGTTATATGACCCACTTGGTCAAAATCTTGTAGCTC
AGAAAATTCTACAAAACCATCTACAATATAGGTGGTTTCATCTTGAATGC
TAAGGTATTCTTTTTTATTAACTTTCCAAAGGGTGATTTTGTTGTTTGTA
TCCTCTTCTCCAACTTTTACATGGATATGTCCATACGCCTCGTAATTTTG
ATTGTTATCTTCTGCCCAAAATTCCAGCTTAAATGACAGCTTGAAACGTG
AGTACTGGATAGTAGCTGAAAAGTAAAGGTAATAATTTCGGTGAAAAAGG
GTGTTTAAAAGAAACTTGAGCCTTATAAACAGATTTTTGGACCTTAGATT
GTTTAAAAAATAATTCGATGCTTCAACTTTTTCAGGGGGGGGGGGGGNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGGTTATTTTAACGTTT
TTCAAGATTTAAAGTTCCGGCGAGAAAGTCGATTTTGGGCTATCTCTTTA
ATTTAATCGAATATCTCAATTTGGGAGGGGTTAGCAGACTTCCAGGCTAT
ATTCTGAGCCTTTTGGAGTAGTTTTGAAATTTTGGATCCTCAGATCCTGA
GGTCGTAAGTCTTAAGTCTAGCGTTAAAACTCAGAGTTAAGACTCTAACC
TCCGAACCTATTTTAGAGAGCACTTACAAATTTATTGTGGTTTCAAAACT
TCCCGGTGAATTTCCCTTTTTTCTCAAATATTATGACCTTGATTGGGCTG
TTCCATAAAATATCCATACCGGGGGGGGGGGTTGGAAAAACCTTTTCAAG
TGAAAACAAATTTCTTGGAAAAGTGTAGATACCCCCTGGAAAATGGCAAA
ATTTGCTAAGGAAATTTCTTTTCACGTCTTAAAGTGAGGGTGGAAGAACC
ATAATCAGTTTTCCTGGAAATTCAAGAATAACTTTTTACCCCCTGGAAAA
ATGAAAAAACACTGCTTTAAACTCCCTGGAAATTCTTTTCGGATTACCCC
CTGGAAATGTTCGTCCACCCCCCTGTATGGTCTTAAAATGGAATGGACCA
TTGTAGGACATCCTGATGTTTAGTGATGTGGTGGTATACCCAAAAAACTA
AAAAAATACAAAAAAGGTAGTATCCAGACTAAAATTTGAGAATTCTCTTT
AGTAAATTGGTACTAAAATTAGTAATTTTCATAATTTTATGAATTTGTTT
TCAGAACTTTTTGTGATTTATTCAGAATTTAAAAAAAATTTCCCAAGTTC
AATTATTTTCGCATCCAGTCAAATGTCATTAACGTTTGCCCAATTCATAA
AACATGAATATGCTGTTGCAAATATCAGCACTCTTGAGAAAAAAGATCCC
GAGAAGACAAAATGTGTCCTGAAAATACCAAAATTGGACGGTCTCTGTGT
CAAAATGCCCCTAAAAATTTTAGCAAATAGGTACTAAAATACCACTTCTC
TAAAATGGGGTGGTTGTATGCAAGAAATTCTTGAAAATCCTTTTAGTACT
CATATATTTCCGAGATTTTAGTACCCATATATGTCCAGGATTTTAGTGCC
GACCCCCCTGAGTAATTGTATATTAAAATAATAATAGTAATTATTTTATA
TCCTTAATATACCTTCCTTATGTTCATTCAAAGGTATCCTCCCTGTTGAA
ATTCCACTTGCATCTCCTTGGGTTTCAACAACGCCATTATGACAAAAACA
TTTGTTGTCATTTGTGTAAAATGCTTCTTTTGTTTTTCTTTGACATCTCA
AAACACATTCAGTGATTGATCGTGGTCCTTTGATTTCTTCTGAATCGATC
AAATTTGAGTTTCCAAAGGATTTTAAAATGTAGGGTGTATAATCTTCACA
GCTTAATACTAAATTAGCGCACCATAAAATGTACAAATAACTCAACATCA
ACATATTTTCAAAGATTGTACTTTGCCAAAAATTATGAATTGGTAATTTG
ATCGTAATTTTCTTTTTCATACATTTGAAAAGTTCTCCTGACTTTAATAT
GGGCATAATTTCAAGTCAAACTCAGTTTTTAACAGTTTTAGAAATTTTTA
TTGTTAATAGGATTAGAGGCACCCTCTTGGGAAATAAACAGATGGATTTA
ATGAAAATGTAGTCTTTTAGAGACCCGTACATTATTTATCATATTTCCTT
GATTTCATACAGGTATGAAATTCAAAGAGAATAATTATATATAACAGGGT
TACTCCGTTTTTTCAACGAGGTCTGGAATTATATTAAAGTCTGGAAATGT
CCGGAGGAAAGTCTGAAATTACTTTGGGCGTACAAACTTTCGCAACGCAA
GCAGAAACTTTCGCGAGGACGAAAAATCGCGAAATTCACGACATTTACTT
TCGCGAATTTAATGGAAAAATATTTTTCGCGAGCATAAACTTTCGCGAAT
CAAGACGTAAAATTGAGAATTTTCACATGAAAAAATGACTTAGAGGGACA
AATATTTCTTGGATTGGTTTGAGACATTTGTAGGCTAAAAAGTGTCATAA
AAGTTACATTTTATTCAAATTTTGAAGTTTTTCTATTTTGTCAAGAAATT
TTCGTGAGCATAAACTTTCGCGAATGGCCCTTCCTAGAATTTTTAAAGAC
ATTTACTTTCGCGAAAAGGGTCAAAATTCGCGAAAATCACGAAAGTTTCT
GCTTGCGAAAGTTTGTACGCCTAAAGTAGGTTCTTTGCGAGAAAAATTCG
GGAAAAGTTCCGAATGTGAGGAAGCGTTTTTGTCTTCTAGGAAAACAAAT
GAATCGTCTTTAATTTCAAAATGCCAAAAATTTCTACTCTCTTTCCTCGC
AAACTAGTAGCCTGTGAGTGGCAACTCTGTTTAATCGACTGCTCGAGAGT
GGTTTTTAAATTTCGTTTTTAAATTGAAATAAATTTTTGACTTGCTTAGT
TCTATGAATACATTACTTTCCTTAAATTTTGTCTGAATATGAGAGCCTTT
AATATTCTTGTAACGTAGCCTAACGTCCCTATTCCTCAAAGCGTAATTAT
TTTTTAGGGGTCTACGCTTTGCTTTTTGATTATGTGTTATGTATTCACCA
AAACCACGACAACAATTGCAGATCAAAGCCAAAAGAAATGTATAAAGGCT
TGAGGCACATTTATAAAGCCCGAAGGGCTAGATGTTGTGCTTTAAAACCA
TCACAAGCAAATTAAGTGACTACTCTCAAGAAATATTGATATAAGTTGCT
TTTGATTTCAAAAATCTCCTAAACTTCTGATTGGTCAAGCGCTGAAATTC
TATTGTAATGTCACGTGACCTAGGTAGGATCTCATAAATAGATAGATATG
ACACATTTTTCAGCCAAAGCACGACATTTAGCCCTTCGGGCTTTATAAAT
CGGTGGCCTCTTGATGTATTCATCACTTTTGTATTGTTTATGACGTCATT
CTCCTATCATGGATCGTTCATGGATCATTTTATCCATTGTTTATCCATGT
TTATTATGCTTAGAACTTAGTCCATGTAAATTGATTACATATTTTTTTTA
ATAATGTGTTGAACGTGAGTTTCTAAACATCGACCAGAAATGGCGACCAC
GACCACCGACCACGACCGGCGACCAGATAAATTTGGGTTATCGAGTTTAT
CTGCTCTCTCCGCCGTAGAGAACGTTTAAATCAAGTACTCAGAATACTAA
AAAGTGACCTTTGAAGTAACCAGTCATTTTCTTGACAAAGTGACACCATT
TCGAAATATAATTGATAAGGTTGCAATAGAATGACACCTGTAAATGTAAA
TAAATCATAGACATTAAAGCATTTTTCTTACATAAGCTTTTGTCAGTGCA
GAGGATTTACTTTTTATATGAATAGAGTAGTCATGGAAGTGATGACTTTG
GTTTGTATAGATGATGAGTGATTGAAACTCATTTGAGCTAGAATCTGAGA
AAGTCTGTCCGTTGTTTTTCCGTTTTACGTCTTTGAAAGGAATCTTGCAC
ACTTAATCCTCGGGTGAGTTTCTCTTTTTTTCGGAAAATAAATTTTTTTA
GCCTGGGGACGAGTTTGAGCGTCGAAACAAGGACAGACTAAAAATACAAG
CTTACTTTTTGATTTTATGAGCCTTTAAGTGATACAAAAGATACTGAAAT
CGAATCGAACAAGTTTGGTCAGACCGTTCGACAATGATTGAAACTCTTAC
CACTATTCGGGATATTTTGTTCAACGCGTTTAGTCACAATCCCATTTTGA
TCCCCCTTTTTTTCGCTGAAACCATCATGACAAAAAAAAAACCTTATCGT
TCGTGTAAAATCCATCTTTTGACTTGTTTTTTTTTGACATCTCATAACAC
ATTCAATGATGGACCGTGGTCCTGTAATTTCTTCTGCATCGATCAAGGTT
GACTTTTTGACAATTTCTAGGTCGTGGAAATTGCAATTAACAAATTGGAA
AATGTTGAAGAAAAATACAAAATTGATCATGAACAACATTGCTAACGAGA
GATGCTAACGCCTTAGAGATTACGTTCGAATCCTTTGAGTCTTCTGATAT
ACTCTTTCATCTGAGAAAGCTGATCAATTTTGTCCATTTTCTATATGAGA
TATTTCGTGAAAATAAAAAGGTTTTGACCATTTTGGTGTTCCATGGAACC
TGTCATTTTCAGACATTTTGAATAAGAACCCAACAAAGTTTTCATTGATT
AGAACAGTGACACATTTTTAGTTGTCTAAGATTTTTTCATCAATATTTCA
TGGTTTGAGTTATATGTATCTCTGTCCAGGAGATGAATATTTAATTGCGC
CTACAACTCCTAGCCTGTTTTTCATGGTCCAATTTTAAGCAAATCAAGGT
TCAAATTAGTAAAAACAGAGTACTAAATCTAAAATATCTCAGTTTTCAAG
TTGATGAACATAAAAAACACGTAGTGAACGACGTTTCGACGGTTGTCTTT
AAGTTTTCAAGTATATATAGTTGTTTTCAAGTCTTCTTGACTACAAAATA
TCAAGCGTACAAAGCTAAACCCCCATTTATATTGCACTCCGCCTATATAT
AGTGAAGATATGTAATATCTGTCATTTTAGAAAAATAAAAGTATTGATAT
ATAAATAACTCAAACTGATAAAAACGAAAAAAGTGAAGAATATTTTTGTT
AATTATGTATATTTACGATTTTTTTGGTATTTTTAATTTTTTAATTTATA
AATCATTCCGAAACAGAGGGAAATTTAGCAAAAAGTCAAAGGGAATTTAA
ATAATGGTATGTGAAAGAAAAACCTTATCCAAAACTTCCAAATGAAGAGT
ATATAAAAAAACAAAAAGAAAAGCAAAAAAAAACATGCATACACACAACA
CAAACCCGAAGTCCCAGACTTGTGACTGGCATAGTGACTTTCCACGTGTT
TAAAGGGCCCACACTCAGTCGACTTCAGAAAACATAACAGAACCGGCCAG
CAGCTTCCAAACAAATAACAAACACTACAACCAAATACAGTACAAAAGGG
TAAAAAGACACACTGTAACAACTTACCACATACACTACAGATGAAACAAA
CATTTGTAGCAAACATCTCACACAAAAATAGAAAAAATCACACAAAAACT
GAAAAAAAAACAGAAAAGACTATATGTACATTTATCTAAATTTATACATA
CTTGTATATGCTATCTATACATTCCCTTAAATTTATACATACTTGCATAT
ATTATATATACATTCCCTTGAATTTATACATACTTACATATATTACACTT
TTTTTTATATAAGAACCGGTATATTTTTGCTGAGGCTCGGCTGTTCTTAT
TTTTTTGGCACTTTGAGCCCTGAATTGTTCTTATTTTGTTCTTATTTTTT
CTAAGGTAAAAAACAAGTTTTGGCTATTTACTTTACTTTTTAGAAGATTT
TAGAAACCAGTGATTCTTTTTGCTATAGATCTCTAACTTCAGCCTCTCCA
CTGTTATTAAATTGTTCTTATTTTTTGGCATTTTTGAGTGTATATATACC
GGGTGCACCACAAAAAAGTTTCTCTCTTTAAAACTAATTTTCTCGAAATC
TAAAAATTTTTAAAAAACCGTTCCTATTTCATTGGAAAGAAGAAAGNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTATTTCATT
GGAAAGAAGAAAGGTAAACTTAAATTTTGATGGGTCATTTATTAAATTCG
ATTCATTAGATCAAAAGTTATGCTCAATTAAATAAAAAAGTTCCTTTCTG
AAAGTGCTCAAACGCGTTAAAAATTGACCTATCAAATTAAACAGAAGCAT
AATTACATCATTGTCTTTGTTTAAGTCATTAAAAATAATAATTAGCTGTC
TAAATGAGCTTTTATTATATAAAGGAAGGTTGAATTTCAATAAAAGGCAG
AAAATCTGGGTAAAATTAATAAAAATACGTCAAATATGGGTTTCCAGATA
AATCCAGCCTTACATAGACTTTATCCAGTCTAAAACCAAAAATCGGAGGA
AAGTGTCGGTAAAAGTGAATTAAAGTGATTTTGATGTAGATTTTAAACCC
TTTCGGCCTTTCAGTTTCGAAATTTACGTGTTTAATTACTTAAAAATGCT
TTTAATCATGTAAAGGCTATTGCGATTGACAGTTTTAATATAAAAATTTG
ATAGGTCGATTTTCAACGTTTTCGAGCACTTTCTGAAAGTAACTTTTTTA
TTCAATTGAGGATAACTTTTGATCTAATGATCCGAATTTAATAAATGACC
CATCCAAATTTAAGTTTATCATTCTTCTTTCCAATGAAATAGGAATGGTT
CTTTTAAAATTTTTAGATTTCGAGAAAATTAGTTTTAAAGAGAGGAACTT
TTTTGTGGCGCACCTGGTAGCTTGATCGAACTGAGTGAAAAGCGGGGAGG
GTGCATCATAGCGTTCCTAGGGACAGTTGTCACTGTCCCCGAAATTAAAG
AAATGGTACATAGTGGAATGACACATTTACAAATATGTAATCAGTTGAGA
CAAAGATATCCTTTGCAGACAGGACTCAGTGAAAGAAGCGTCCGAAGATT
TTACCGATTGAACGATATCAAAAGGATAACTTACCAAGAACTAGACGAAA
TTGTTGGAGACTGTATCGAGCGTTATGGTCATGGTTACGGCAGGTCACTC
ATGCAAGGGAGTGTAAGATTATTATTAGGTACTGGTAGAGTTGTACCTCA
AAGGTGAGTCTCACGATTCTTTACGACGACTTGCTTCTGTAGAATTTGAA
TTGAGAATAAGGAACAAGGGACCTACAAGAATAAACCAACCCCATACCAT
ACTATTCTCCTTACTTTGGCTACAAAGCGCGTACTGTATAACCCGTACCC
GGACCGGACCCTGGACCCCGAGAAAACCCGGACCCCTCGTAATTTTTCGA
GAAAATCCGGACCCCATCCAAATTTACGAGAAAACCCGGACCCTACCCAA
ATTTACGAGAAAACCCAGACCCCACCCGTGCAATGCTCTTAGGGCTCAAT
TAAAATTCCAGGGTTGGCCAGGAAATATTATAATTGGCATTTACTATTTT
CCAGTGTTTCTCAATATTGGAGCAAGATTATTGTTCTAGAAAGTTCATAA
AGGCCTAATAGTTCNTAACTCCTATGAACGAAAAATGAATGTGTATACTA
TACTTCATATCCAACACGAATTGAGAACCTAGAATTTTGTCGTGGATTAA
AGTTCGCAATTCAGCCTTTTTTTATGTAGTTTCTTCCATTTTCCTAGGGG
TTTTGGCAGAACTTCGTTGGATTCAAACTTAATCACGAGGCTCGACTCGA
TTCATGTATTTGTTCAAGAATTGTCTAAACATTTTAAAAATTTATGGGTG
AAAGAAGGCGACAACAGTTGAACTGAATAATTTATGAATTTACTGATAGC
TCGCATTCTATTCGAGGCCATTTCTGTTAGATTCCTATGACCATATGAAT
GTTTATTTTCAAAAAAATTGGGTTCAACATTAGAGATCTAGATTTTTAGA
GAAAAACTGTACTAATTTTTTAAAAATGATTCCATTATGTTTTGACCTCT
AAGGAAATTGCATAATAACTCTCACAAAAATGTTGAAAATAAGAACATTT
CAAGAACATTTCTTGGCTTTATAAAACTCAAAAAATTAAGAACATCCGAA
AGATTCAAAGATTTTGGATGTTGTTATAGAAAAACGTGTAACCATTAAGG
CCTTTAGAGTGTAATCTTTAAGGGCGTTAAGGGTTCCTTTAGCACTATAG
TTGAAGCATTAGAAAATATTTTAAAGACAATAGACCTTTTCATAAAATTA
CGTCACGAAAATCACTTGCCTCGTTTTGAAATTATTGCTATGGTGATAAC
TCCCAGCGGATTTTATTAAAACTACTCTCTATTTATAAAAAAATCACTTT
AAATGTCTCAAGGGACATAATCACCAAGGTAATGGTTTTAATACGAGGCA
AGTGATGTTCGTGTCGTAATTTATGAAAAGGTCTATTAAGAGATTTAAGA
CAATTTACTCCAGTTGCAAACTCCGAATATAGAAAGTAGAAAGATTAATC
GAATCGAAAAAAAATTGTATCAGTTTCTAGTGAGAGTTCACTATGATTGT
ATTTTTTTTACCATTTTCAGCCTCGTGGACCTCCACTTCTTTTGTCGAAC
TTCCCCTCATTCTCAACTTCTTTTGTCGAACTCCCCCTCATTCTCAACAA
CGTCATTATGACAAAAACATTTGTTGTCATTTGTGTAAAATCCTGCTTTA
GTTTTTCTTTGGCATCTCATAACACATTCAATGATTGATCGTGGTCCTTT
AATTTCTTCTGAATCGATCAAGTTTGAGTTTCCAAAGTTTTCAACTTCAT
AAGACTTACTACTACAAACTGCAAGGATAATTTCCCAAGAAAAGATGGCC
ACATTGAGTAGAAGATACATCTTGAATTCCAAAATTTAACGATAGGCGTC
GGTTGATTTCAATAGTTCTAATTTTTATTCTCCAGCTTTCTTCCTTTGAA
TGCTAATTCGATGAATACCTTTCACATTTCTTTTCGTATTTTCTATTGTT
CTTTCTTAGCATTGTTCATTCGGTTTTAATCAATTCACTTGAAATAAACC
GCTGTAAATAACCATATAGAACGGTATTCAACGGTATTATTTTTTTTTAT
GTTTTTTTTTTATACAATGATTTGAACTTTATAAGATTTTCAAATATTCT
GCTCTGAAAAAAAAATTTGAAACTCTTAATTTCATAAGTAAGATTATTAA
AAAGCGAATTATCAAGTTTGCTAAAAAAGATAAAAAAGTAGCATATTACT
AAGGATAATTGTAATAAATATGGATTGAAAAAGATTAAACACGGGCCTTG
TCAAAGTTATAATCGTTTGTAGGAAGGAATGATGTCAAAATTTTTTGGTC
TATGAGTACTTAATGATACGTCAATCCTTCCTGGTAGACTGTAACCCCGT
CTCTTTACGCTCTAAAGATTGATAGTAGTATAAGTTTGTGATATTCACGT
TTTTTTATAAGAACAAACTAAGTAAGATCATAAGGCTTCGATGGCCAAAA
TATTAAGAACAAGTTAAGAACATTTTAAGAACATTTTTAGGCTTAAAACC
CAAAAAGTTAAGAACATCCAAAGGCTTCAATAATTTTGGATGTTATAAAT
CTATAGATTAATAAATATATAATATAACTTGATATAATAATATAATAAAT
ATATGTATTCACATGATATCATTTAAGAAAGCCCTCACCAGACGAGTTTA
CAATAAGCTGTCCCATTGATTGATCAAACCTTGAACAGCTACACATAATG
TGTTACATTATATATTCCAAGAAAAATCGTGGCTTTGTCCTGGGGGCTTG
GGTTTCAAGATAACGGGTTTGTCTGAGCTAAAGTTGCAAAATAGACCCAT
AACGAGACTGAATTTTAATAAGAATATTAGAATATTAAGAATATTGAAAA
TATTTCAGGCTGATTTTCTCCTAAAAATTAAGAATATTCCTGAATAATTG
AAAAAACACCATTCTTATAAAAAAACGTGTAATTCATAATTTCAACCAAA
TTTATTAAGTTTCGATTGAAAACCCTTAGGGAGTAGGTTTTTGAATTTAG
CTTATGCTTGTTTTTTTGATCCCCTTCGAAAGACTTTCGAGGGTTTTGAA
AAAGAAACCATTCTAGTTCGCACATACCCGGGGGTTTTCTTTAGAAAATT
ATGGTTTCTTTTTTTTAAAGCTCTAAAGAATGCTGTAAGAATATTTTAGG
ATAATTTTCCCAAAAAAGTTAAGAATATCCATGATGAAATGGATTTATAA
AAAGAAAAGCGTGTACGCGTTCTCAGATTTCCGGGTTAATTTCTCTCTAT
GTAACTAATTTTTTCCTATTGAATATCTGCTTTATTGACTCATTTGTAGG
ATTACAATACTATTTGTTTTTTTTTCTTTTATAAGCATAACATTTATAAG
CATACGCAGGCTCAGTTTTTGGCACTTAAACAATGGCTCTATTGTTTGAG
AGTAATAAAATGCTAAACGTAATGCAAGCCTGATATAGGGACAGACACTT
TNAAGTCTCTCTAACAATTTTTTTCCTATTGAATATCTGCTTTATTGACT
CATTTGTAGGATTACAATACTATTTGTTTTTTTCTTTTATAAGCATAACA
TTTATAAGCATATGCAGGCTCAGTTTTGGGCACTTAAACAATGACTCTAT
TGTTTGAGAGTAATAAAATGCTAAACGTAATGCAAGCCTGATATAGGGAC
AGACACTTTCTTATAACAAAACATGTATTTGTACAATTCACATGTCTCTG
ATTGAGTTATTTTCGTATTTTTAATCTTATATATAATGAATTTGTATATA
TTGTATATCAAATGCCGCAGACTAACCTGTATTAATATGAATAATAATTA
TGATAATAAGAACAATAATCAATCGAAATATTGAAGAAAAAATTCTTCGA
TATCCCCTTGGTTCGCTTCAACCACAACACGACTAAATGAAAATTAGTTT
TTGTACGGTCACGATGTTTATTTGGTCCGTATTTGTAGTATTTTTCGGTA
AAATCCAAGTTATTTTTTGTAACACCTCATACGAAGTCAAAAATTTTAAC
ACCTTGGCTTTGGAAGAATCGGAAGAAATCAAAGGACCACGATCAATCAC
TGAATGTGTTATGAGATGTCAAAGAAAAACTAAAGAAGGGTTTTACACAA
ATGACAATAAATGTTTTTGTCATAATGGCGTTGTTGAAAATCAAGGAGAT
GCAAGTGGAGTTTCAACAAAAGAAAACAAGCTTAATAACGAGGATAAATG
TGAGTAAATTTTTCTTTATATTTTTACACCCCCAAGTGACAGACCTGCTT
GGACCCAAGCCCCACTGGAGAATGGTCCCTGGTTGGAAAATGGAACAGAA
GTTGATCTCATACCCTTTTGAAGTTTAAGTAAAGTTTTTCTGAGGCTCGG
CCGTTCTTATTTTTGGCACTTTTACCCTCATATGGTTCTTATCCTGTTCT
TAGTTATGGGTCAATAGCATACCGCAGTGAATCTAAAAATAGACATTGAT
TTTTCTGTTTGACCGAAATTCAATCCCATCACCCTTCGCGTTAACTACGC
CTGCATGCAAATTACGCTCAACTACAAAGAAAAAGTAATGACTTTCACGA
CTTTTTAATTAAGACGAAAAGGATTGTGGGATTGATTTTCGGTCAAGTGT
TAAAAGTAATAATTATGACGTTTGCATAACGGTGTGCTATTGAGGTATTT
TAGGCGCTATACCCAATTTTTACTACTTTGATTCCTAATTTTCATCAAAT
TGAGTAATTTTAGGGCTCAGCATTGTTCTTAAATTGTTCTTATTTTTTGG
TGATTTTGAGCCTCATTGTTTTTATGAAATAATTTTTAAAAAAAAGTGCA
GAATTTCTATCCCTATAGAAATTTTTGTCTCCACGTGTTTTTAAAGTATT
TGTAGTTTATGAAAAAAATTAACAAAACACCTCATACTCATTTTCACTTT
TTGTAGGAAATATTTAATACAAGAACTATTTTTTATTTCAGCTATAATCC
GTCTCTATCCCTACCAAGCTGACTTCACGTTGGATATATGGTCTGACAAT
GATGGTGGCCCGACTTACGAAGCCTATGGTGAGATCAAATTCAATATTGG
ATTTTTCGATTTCAACCAAAACGTCGTGATGTGGCATTTGTGGAAACCCA
ATTATTTGAACGTCCTAAATGGTGCAACGCATACTATTACCAATACTCAT
ATTTTCCAGGAAACCAACGAGTTTGCTCATGCAGGAAATTTAACAGCTCT
AGGCACTGTTTGGGAGTGGGATGACTTTGGAGATGATAATAATGGATCGC
CACACGGTGACGTGTTCCAAATGAAAGACGTACTGGATGAAAGTGTCAAA
CGACGTTATGATGGATACGGTGCAGCGCATATTGACATTACACTTAAAAT
CACCAGACTTTGAATATCAAAGTGACGTTTCTGGATAATCGTTAACGACA
GTGAAATGAAAACCTTTTCTTTTCATCCATTATTATTAAAAACACTAAAG
GGATTGTAAAAAAAAAACACTGTCTAGTGTTAGTTGTAGGCGGACTTTAC
TGACTTTACTACTTAATGTTTTCCTTTCCTATTTGGTATTCCATATTCTA
TTCTGCATTCTTCCTAAAAAAGAAGTGTTTCTACGATGGGTCTCTTTTTT
TGTCGCTTTATTGTTGTTATATCAAAGAAATTCATTAAAATAAATCTATT
GTCAATTTCATGAACAGATTTTATGACTTAAAGTAATTAAGAAAATTATT
TAAAAAAATATTCGAACGTTCGATTATGGGAGTGTTTTATGTAAATCTAT
TTATATAATTTTTGTTTTGTTTTTTCATCTAGGTGTTTGATAAAACATAT
ATTCAATAGGTTTTCGTTGGTTATTGGATTTATTAACCATCGGTGATGTA
TATTCAACTCGGCTTCGCCTCGTTGAATACTTTAATCGGATTAATTTTTA
CGAGATTAAATTTTTGCCATTTTCGCGAAATTAAAACTCGC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_045087	XLOC_045087	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_80	supercontig	scaffold_80:326213..342203 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.47453	3.06977	2.07529	2.06847	0.400555	0	0.881165	0	0.582887	0.450771	0.732507	0.570793	0.32383	0	0.494284	0.104568	0.557145	0.360822	0.680823	0.477943	0.845611	0.630711	0.782307	1.57395	0.251527	0.157381	1.44625	0.72538	0.904547	0.66911

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00072642 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00072642 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00072642 (transcript) - C. hemisphaerica