TCONS_00072541 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00072541
Unique Name	TCONS_00072541
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	5042

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_8:117975..129323+

transcript sequence

>TCONS_00072541 ID=TCONS_00072541|Name=TCONS_00072541|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5042bp
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transcript from alignment at scaffold_8:117975..129323+

Legend: exon

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>TCONS_00072541 ID=TCONS_00072541|Name=TCONS_00072541|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11349bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_8:117975..129323+ (Clytia hemisphaerica)
CGAGAGGTCAATATAATCCCATACAGACAAACCTCTTCAAAGAAAAGATT
ATATACTCACAGAGATTTTAGACAATAGAAATTGTGTTATTAAAATATTT
CGTCAGTTTGAACACGATTTCAAGAATTGACGTTGGAATGACTTCTTCTT
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CTTAACTTTTACCTTGTAAAGTGAATATATTATAATTAATTTAGTCTATT
ATTGTGATTCAAAAAGACAAGAATTTTGTGATTCAGTGTTTTGACTTTC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_045016	XLOC_045016	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_8	supercontig	scaffold_8:117975..129323 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.101109	0.173498	0.12032	0.256566	0.351489	0.283388	0.105468	0.385204	0.846255	0.277561	0.607352	0.74564	0.562898	0.0575426	0.135422	0.309518	0.0570896	0.190463	0.396918	0.0666733	0	0.684006	0	0.305828	0.268015	0.485827	0.360891	0.220808	0.0864872	0.100103

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00072541 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00072541 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00072541 (transcript) - C. hemisphaerica