TCONS_00072352 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00072352
Unique NameTCONS_00072352
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2855

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00072352 ID=TCONS_00072352|Name=TCONS_00072352|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2855bp
GTTTTTTTGGGGGAGATTTGCAGAGATAAAACTTTTTGAGCTGATCTTGT
TAGTGCTATggctatttcaaaagaaaaagagaacaCTTTAAATTCTGTAA
GAAGATTTCACTGGatgtaaaattcatttcatttttttttttgaaacttt
tcaaaatcagtCGCAACGTGGAGTCATTATTCTGTCCCGCACGttgctgg
attttttaacctttccaaGGTTCAGTTCAATACGGATGAAGCCAGAAAAC
AAGAATCTTATTACAAAGAGACACCACATGGACAGCGAATGTTGAAAGAA
TCGATCATTAACTCTCATCGATATAAACCTACAACACCACCCTAACAACA
TCGACTGATTACTTCACATCAAAAGATCGCTCAGCGTTCGAGGAAAAACA
AGCTGTGTATTTTGCGCAACACCACAGCACTGACCGTGTTGATCATATAA
AAACTGTAAACAAACTACATCATTCGCTGGCAACATCCGATCATAGAAGG
TCATCTCAAGATGCGTACTTTAAAACAACTCCTAGTTTTGATCGTTCTTG
TTTTGCACAAATCACAAAATGTCTTGGCGAGCTCCAACACAACCTTCAAC
AACCAGACGACGGTTGTCGGCAACAACGCGACCTTACCTAGCAACAACAC
TGACTCCATCTTATCAAACGAGACGGAGTACCTGATGGATGTGGTGTATT
GGGAACAGAAACCGTTTCTTTTTTACAACGAGGAAAAACAAGAGATGGAC
GGTATCATCCCTCAAATGTTTTCACAAGCAGACGAATTTTGCATCACCCA
GAAAAACCGTAAAATTAACCACTACAAACGTCGCATGCCAAGTCGCAAAG
CCTTCTTCGATCTCGCCCGCGCAGTAAACACGTCATATGGAGAGGGCGAT
CTTGAAGGAATTCGCGCTGACCGCTCGTTTTGGGTTTCAGTGCTGGCGTA
CGCCGATCGCAACGAAGATAAGTTTAAGAAGAACCGAAAATTGAGGGCTT
TCCAACTGATGACATCGAACGAGATTGCGGTCATTGTCCGTCGTGAGATG
ATCTCCCTACCAAACAAAATCATCCGAGGTATATTGAGTTGTGAACAAAT
TTTCTTCCTCGCTATCTTGATGGCTGTTTTGTTCGGCCTTGTTTTGTGGA
TGATCGAACGATACCAAAACGAGGATTTCCCAGAATCCTTCATTCGTGGT
ATCGGCAGCGGTTTGTATTGGTCTATCGTTTCCATGACGACGGTAGGGTA
CGGAGATATCACCCCAAAAAATCCAATCGGGCGATTTATCGCGTGTATTT
GGTTATTCGTGGGCGTAATGGTGGGATGTATCGTGGTGGCCACTATGACG
GACGTCGTGACGGGCGTAGGTGATTTGAATGTGTATGGACAAAAGGTGGC
TGTACTGGAGCATTCTTATGAAGCAAAGACCGCAGAGAAAGACTACCGCG
CCAATATTGTGCCCGTTGAATCTTACGACGAAGTGTTAAGATTGCTGAGG
GAGAATAAAGTATTCGCAGGAATGATGAACGTTGACGTAGCTGCGTGGTA
CCAAGATGAAATCAATGACGACACAAATCCAACACCGTTACGTATCGTAC
AGAAACTACCCGCTAAATTGTATGTCAATTGTTATCTACCGACCGATCTC
GCTCGTGAAATGAaagaagttttcaaatgtatgTATTACTCCAAAGATGA
AGTTTACACGTATTCTATCGAAGCGTTTAAGCGACATTGTCATACAGAAA
CTCTCTATATCGGATCGATGAGTGAACTCATCATGAATAACCTCTACATA
CAGGTCTTGTTAGGAGCAGTTTGTGGCTTGATGTTGGTGGGTATCATTTA
TGATCTAGTCAAATATTGGCAGGGAGGAATGAAGGATGATAAGAAGAAGA
AATTGATCAACAACAACCATGATGAGAAAATACAACTCAACGGGTTCAAT
TCTTACTAAAAAATTCAGACTTATTGCAAACAACCTTTTAAAGGTGTTTG
GCGAGAGAGGTTAAAGAAAGTGCCGTCAGACAAGAGACAATCTTTATTGG
ACGAACGGTAGAAACCAATTCAACTCATAAAGtcgaagaaaaatatgaaa
aactaaACTTGAAGTCGTTAGTTTCCATTGAACGATCGATTAATTTGAAA
ATACCACAAACCTTCATTTTCAAACAGATAGCTTTAAATAGTGGAGATTC
GACAGTGTGTACAATGCAGAACATTATAAGGACCGGTATACACtagaaat
attttaatataCTTTTACACTAGGTTTAagttaatttttaaaactttttg
atagTTTGCCTATATTAACATGATATTCTAGATAACTTAGCTCGATTAAG
GGAACTCTTTCAATAAAAATAGGTGTTTGCTGTCCGGTAAAAGACAGATA
CAGCTCTCGCCCAAGAACTACCTGTAAATAATTAATTGGCTCTGTAGCTT
GTGATGATTTCAAGCACCGATTGTTTGCGAGCTTATTTAGGTGCTTCATA
TACAGTGTAATTATTTTCAAgacttatttttataaaaaatctttcttttt
gtaaaacGCTTACTTATAATATGCTTATGTAACAAGTAATTAGAGAAATA
TTAATTGTTAAAGTAAAAACTCCTTAATTATTTATCTCTCATCTTTAAAG
GACACTGTTGAGAGTCTATATGGTATCCCCATGTTGAATTTACGGCTAAT
CTGGTTTTGCAGTTATATTTTCAAGTCACGCTCCCTAGaaccaattttaa
taaaagCGAGAAAcagccaaaaattaaaaatctctGTGAAGCAGTggtat
ttaaatttttcattaacttTCCCCACTAGTCTATCTGAACCCCTTTTGAG
AATCG
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_77:108495..126396+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00072352 ID=TCONS_00072352|Name=TCONS_00072352|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17902bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_77:108495..126396+ (Clytia hemisphaerica)
GTTTTTTTGGGGGAGATTTGCAGAGATAAAACTTTTTGAGCTGATCTTGT TAGTGCTATggctatttcaaaagaaaaagagaacaCTTTAAATTCTGTAA GAAGATTTCACTGGatgtaaaattcatttcatttttttttttgaaacttt tcaaaatcagtCGCAACGTGGAGTCATTATTCTGTCCCGCACGttgctgg attttttaacctttccaaGGTTCAGTTCAATACGGATGAAGCCAGAAAAC AAGAATCTTATTACAAAGGTTAGTAAGCCTTCGAATACTGTTTTTCAGTC TCAATTCATCAATATTCTTTATTAACTTAAATGCAAGTAGACCATGATAT TCAAAGGTCGTCAACTCTCTCTCTCTAGTCCGAACATCTGTAATTCAAAC TAAAAGATTGATCTTCTCGGCTGGAAAGTAGTGTAAAATGCTCTCTacaa ttcgaatatttctctaCTTCGAAAGAAGGCTTTAATCCCtggagatcgaa ttagagaggacAAACTGCATTCTTATGGGACGGGAAAGGGACTTCTCTCA TATTCAATCTCGTTTCTCAACTTTTTGCATCATTTTTCGATAGATTAGTA ATCTTCGAACTTATTTTACTAAAGCATccattaaaaaaagttaattcgCA ATAACAACGTGCGAAATTCTTGTTAAAATTAACGTTTGTCGCCATCACAT GAAAACAGTATGATTAAAACCTTCACAAATTTAGCGCAAAGAAATTTGAT GGGGATAAATTACCTTTTTAGTGGATGACAAAAACTGTTCATACAATGGA TCGCCCATCAAACGACTTTTTGATGCGGCCGACAGGAACGAGAGAAAGAA TGATGAGGCGTTGAGTTCAGTAGTTATCTCCATAATGTCTTTAGCGGAGA CGCATGTTTTGAGTGGTTGTTCAGTGGTTTGTTCagaacttggagaggga atgatGGAGATTTGGACTGCTCCTTCTTCGCCTCCTATTCCTCCTTCAAC TTCAACAGGAGATGGAGGGTTCAATTCTTGTTGAAGTTCGTTCAATTTGT CATTCTTCATCTGTTCTGTTAGTTGTCTGAAAGTTGAAGCACTTTTTTTA CAATAACCAGTATAGTTTGAAACTCGACTGTTCTTTCATGTTTTCAGACA ACACTCACTTTCTTCCCTTAGAAGCTAAAAAGAGGTTGAAGAGCACCACC ATAAGTCAGACAGTAAATTAGAATTTCAAACAGGGTTTCTAAGGTTTTAT TGGGTGAGGAGcttcggtgaaattcatactgtTTTAAGACCTAAGGGTTT GTTGGTGATTTCCGCGTGATGTGTTTGTCACAAGATTCTTTAgtaattac actttttttatacacgtttttttctttattagaacacctaaaatttggct gagcctggatgtgcttatttctttagcagttttcagcctaaaatgttctt aattgcgttcttaatttttcacactactctaaatcgacaataacATGCAA AATAaggagcacttaaaattggtaaaatttggacaatatttgactctcga ttttagaaaatccatccctaagttccgttaaaactgcttgaaaataggaa aaagatgtagtttcttgtcattttttttccaaactgaggctgggcatgtt cttacgatgttcttaatttttcgacgaatttcagcctcaatgttcttata aattcggttctaataaaaaataaaacgtgtaaTCGAACAAACTACACAAT AACATACtgtaaggcttcgatggcaaaaatgttaagaacaagttaagaac attctaaggcattgcagactcgaaaacacccgatttcttagaaaaatggg taaaaatggtcacaagatggtgaaaataagaacatgttaagaacattttt aggcttaaaactgaagaagttaagaacatccgaaggcttcaaaaattttg gatgttcttttaaaaaaatcgcGTAAATGGTTTTCAAAAGCCTGGGATCA AGTTAAAACCTAAAAAGAGATTATAAATTAATCATGAGGTgcaaatgaca atttttttgaaaacgagtTTAATAATCCTTGACAAGTAAACTTACTAAAG CcgtcaaagttttgaaattgaatttaatGCATTGGATTGGATTAAAATAC ACTTTAGTTATTTTGAAGGGAATGAAGGACGCtgacttcaaaaaaaaaaa atcattctaaaattGCTCTGAAAACGAACGGTGTTAAGTTGAAAGCAAAC ACTGGTCTTGGGgtatttttcaagatttcactTGTTTATTGTTTTGCAAA GGTTATTCATAGGAAGGTGTTATACCAAATATTAGACTTGCTTGGAGCAA TTTAAAAGAGATCATTTTCTAAACGAAAGTGAAGAATGAAGTTGGTCGAG ACACAAAAACTGGAATCTCTCAATCTGGAGGAGTGATGTACTACTAGTAA AATAGTGGGGGGCCCATAGTGGTGTactagaaaaaacaaaatttgtcaGT TGAGAATAAAATTTTTCTAAGGCTGTGGAGAATTTAAGGACAGGAAGTGT TTCATAAAAGGATATAGGAAGTTACTGTAAATGGGGTTTTATGTTTAGAG CGATATTTAGATAATGACACAGCTAGGTTATTAAGGGCTCCTGGAAGACA TGTAGTTTAGTTTAACAAAAAGTCTTAGAAATCCGTTTTGAAAAATGAGA ATCTTTGCTTTAATTCACTAAAGACCATTCTTATACTTTTTAGTCCGTTC TAAGTTTTTACcaaaaagagacttaaaacatccaggagaataatttttca caagGGACTTACTGTAGTTGTTCGTCGATAGTTTTCGTTTCCAAGCAACA TCCAACCAGATGAGGGATCATCTCATTCATCCTCGTTAAGGCATTGTTta cattgaaaatatattttggaaaaagtgGTGCTTCGACGATAGCTTCTTCT GTGTTTGGGGTTGGGTCTTTCTTTGTGTTCTTTCCCTTTCCACCACCACC TCCGCCATCTTTCTTGGATTGTTTGGCGGACGAGCGAGCAGTAGCTAACT TCTGAGCGGGCGGGCGATCATCATTGAAATGTTGTACTTGGcaaatttcc taaaatcaaaattgcATTGGTCAAGTTCATTCGACTATGTTTTGCTATTG ACTTATTATTAAATTTCctaatcaaatatttttaaagcaaaatatcaaga atttcaCTTTGGTTGTTAATTTAATTTCTAAAAGGTGTTTGCAGATTTTA CTTTgtatttctttcaatttctttcaaaaccAGAATGTTTTTTCTTGGAA TTTTGACTATTTTGGATAGGTAGTTTTGAAATGTCTTCTGAGTTGATTGG TTAAATGTGACGTGTCGGctacaaaatattaaaatgacgtcattcttTTA GTCATTGAGAGCTTTTGGGCTTAATTTATGTCGTCTTTCTCTAAAAAAGT ACACTTCCAAATGAATCAGGTTGGTTTAGCCCTGTCTTAAAAGATGTCAA GGGAGTTTTTGNACGAGCGAGCAGTAGCTAACTTCTGAGCGGGCGGGCGA TCATCATTGAAATGTTGTACTTGGCAAATTTCCTaagatataaaaaatca aaattgcatTGGTCAAGTTCATTCGACTATGTTTTGCTATTGACTTATTA TTAAATTTCctaatcaaatatttttaaagcaaaatatcaagaatttcaCT TTGGTTGTTAATTTAATTTCTAAAAGGTGTTTGCAGATTTTACTTTgtat ttctttcaatttctttcaaaaccAGAATGTTTTTTCTTGGAATTTTGACT ATTTTGGATAGGTAGTTTTGAAATGTCTTCTGAGTTGATTGGTTAAATGT GACGTGTCGGctacaaaatattaaaatgacgtcattcttTTAGTCATTGA GAGCTTTTGGGCTTAATTTATGTCGTCTTTCTCTAAAAAAGTACACTTCC AAATGAATCAGGTTGGTTTAGCCCTGTCTTAAAAGATGTCAAGGGAGTTT TTGATTTGCCCCTTGCGATAttctttaaacattttcaaaagaaacattta agaTTTTAGATTTCATACTTATTTGGGTATTAAATAAAATCTTACTCATT TATTCCATTACTTTAGAGGTTTTCTGATGGACTCTCTTTTGGTGACATCA ATAAATCTTTACAAATATATCTTATCATCCAAAAGGGTTTCAGTACTTTC AAATATTTAGCGGTACAGAAACTCCGCCTTCCGattccaaaaagaaaaga gGAGAATTATCCTGCTGAGGTCAGTCAATGTTATCTCCATAAAATGGTCC AGTACTAAAATATATTATGGCTACACGATAAAAGAAATAGAGATAGAATT AGggttgttttttcttcaaaccgGAGTTGCACAAGAAGCCTAAAAAAGGA CATTTTATAGATATGGTTTTTGACAATGGAAATTCGACAAATTCTGTTCT TGATATTCCCcatatatttttattcttcAACTTTCAACGAAACCATGACA AGGTCACTCTCTCTCAAACGTTGATCAACTATTACTACAAAAATTGAAGG TAATcttttaagcgttttttttCAAGGGCCTTATTTTTGATCTACTTCTA AACCCTACTTTTTAATGATAAAAAGCCTGTTTAGTATACTTTACAAGTTT ATTCGGGGTTAATCTAAAGCCGGTATAACGCTAAAATATTGAACTGGGCA TAATTTTGGGCCTCTTTTGGGCCTGTGTGAAACAAGGTGACAAATACCAA TTTAATACTTTGAGCTTAACTACACTCTTCTTTACAGGAAAAATCAATAC GAACCAATCTCTCAGCCTCTAGAATANGAAGGTAAtcttttaagcttttt tttgaAGGCCCTTATTTTTGATCTACTTCTACACCCTACCCTACTTTTTA ATGATAAAAAGCCTTTTTAGTATACTTTACAAGTTTATTCGGGGTTAATG CCGGTATAACGCTAAAATATTGAGCTGGGCATAATTTTGGGCCTCTTTTG GGCCTGTGTGAAAAGGGCCAACAAGGTGACACAAATACCAATTTAATACT TTGAGCTTAACTACACTCTTCTTTACAGGAACAACCAATAAGAACAAATC TCTCAGCCTAGAATATCTCCAAAACTATgcatataaaaagaaaataagaa taatttgaggctcaacaaaaatttactggctCTCTCAAAGAAAAACAGTA GCTTGAGTTGCAATTTCTGGAAAGCGTCTTCCGTTTTTGAATGGGAAATT AAGCAAGAGGTACATCTGAGAACAATAAAAGAGTCAATATCGTACAAAAC ATATCAGGGGGATttgtttcgaaaatttttgtttgtatGACGTCATTGTC AAGCAGAAGAGATAAATCATAGGTAATTGAATGTGAAACAGACTTGTCAA ATTTATTCATTTGTTCGTGATGTACCGACGCTTTAGAACAGAGAaaacat acagactacggcgtTCAAAATACGTCCATAGTATGTACACTAAAAAACCT TCCCCCAGAAAAATGCTCTAAAGTTCTTGAACGAATACGTGATTGCAGCG CGACTCAATGAATCCCAAAATTCTAACGTCGTCTAGAAAAacaaacttaa atttttgacTTACATtcaaagaaagttttaagttACCAAGAAAGACCTTA GGAAAATACTCACGTGCTAAAAAGTCTAAACAAAAAGTGGGTTTATCATT TCAAAACATGCGACACTTTCTAATCCAATCACTAGATGATCAACTTTTAG AGATTTTTAACAATTAGACGCTAAGTGTATTTTCTAATCTAACATCTATA TAAAAACATGCAAACCAGAGACTATGTTTAGGTTAAATTGACATTTTGGA CAAACCTTTTACTCTCTTACTGACTTGAGCAAGACCTGAGCTAAAGAAGG GATTCACGAGTTTTATGAGAAGAAGGGAACATATTTGAATTTAAGGtaat ttcctttaaattttcattagctacactttttttataaaaaccagtaaatt tttgatgaggctcggctgttcttatttttttggtactttaagcctcaaat ttttcttatccttttcttatttatagggtgaaaTTGAGTTATTTAGACGT TATACCAAATTTTTACTCTTCCCctaaattacttgaaatttagtaactcc aggctcagcattgttcttaaattgttctaataaaaaaagtgtatgcaAAG TATTTTGGGCCCTGGAACCAATTAATTTTCTGGAACCTTCTAAAGTTTAA TATTCAATACTTTTTAATTCATACTTTCCTTCGTATTAACTTCTTAATAT CTACTCTAAATATTTGATAAATGTCTGAAAATCACCTGATTCTTACAACC CCTGAAGtttaaagtttcttgcttagagttttaaatggattttagcaTTG GAGTTGGAAAGGAGGGTCAAGTCACAAAAACATTAGGATTGGTCTATGCA ATTTTCAACAGAGAAATGATACCCTATTCCAAGCTTTTCCTTTTAATCAA AGTATATTGTGAGCGGATTTTCGAAGACATCTAGTCTTCAGACAAAGTCA TTTTATGAACGTAAAGTTGGCTTAAGATAGACTTTTGGGGAAACTTAGTA AGGAATAATTATGAACACACCAACCATAATTAAGAACTCATCCCTGTTTG CCAAAAAAAGTTCTACTCAGTATGATTCCAAATGGGGTGAAAGTTTTGTG TACaaattctttataagaacaaactacacgATCGAGAACATAAAGTATgg gaaatattaagaacaaattgagaacattaaggctttgtggactctaaaac acacaATTCCTTAGGAAATCACGCAAAAATACTCACAGAATAACGaaaga agaacattttaagatcaTTTCTAGGcgtaaaagtcaaaaaataaagaaca ttcgaaggcttcaaaagttttggctgctcttatagaaaaacaagGTGTAC ATCATCCATATCTTGGAAAGAAATGAAAGCAAAGTTTAAGAAAGAGAAGG GAAGAAGAAACCTCTGCAGTGAATTCTGAATTTAAACTCTGATTATTACA AACAAAACTGCGGCCGAGATTGAATACTTCGGGAGGATATTTTAATAATT GAGAGCTCCCTTTAAAATATCAAGGAAACAATGTAGGGGATAGAATTTAA TATATACTTCATATCTATTATAATAAGTTTCTCtattgaaaaatgaacaa aGAGCAAAAGTGATTGCACGACGGAGGAAAAAGTCCCAAAATTTGCCTTA TTTTCGTGGAGTTACTAAAAGGTTTTAAATAAGCATAGTTTAGAGAAGTA TCTTTAATCGAAAACACAGCTCTCTCCAACTTCTCCTACTAGAATGTTTA TAGAGAGGTTTAGTAGTGTAATACGTGTGTGTTtcgattttctttgatgt aTGTTGAACTAAAAACTGAAGTTTATTGTTGAAAAATTGACCTTGTGAGA GGAATCGATTCAATTTGAGTTTTTTGGGAGTTACCAATGTCACTTGAATA TCTACCTGGCAGGAAACTAAAGTCGAAAGAAATCGACTTCCGACCAGGAA gatattcaattgacattggtacacattttttataagaacaaactatataa gaacataaggcttcgattgccaaaatgtTCAGAACAAGTTAAGtacattt taaagtttttttttcttacacctattttcttaagaaaatgaacaaaaata ctctcaaaatggtgaaaataagaacatgttgagaacatttttaggcttaa aacttaaaaagttaacatctgaaggcttcaaaaaatttttatgttcttat aaaaacgtgtaccaatgtcaattgaatatcTTCAAGGTCAGAAGTcggct tctttttgactttggtCAATAAGAAAACTCATCGATGGAAAACTACTCAT TACCAGTTCTCGAAGTATAAAAAACGGTATGAATTCTTGAGGCAAGCACA TAGCGTAGCAGAACATAGGAGTTATGTTGCCAGGTGCAAAGTCCAAccaa atattttgtttataattATACACAGCACGCACTGAGAATGTAATATCTCT GTCCTGCTGAAAGCAACCTTCAAGCACTTGACCTACTCCTGTGAATCAAG CTGTGTGTATTTTTAACGGAGGCAACACAAAACTGTTTTTAATGTCGAGC ctaatgaaattttgaagagctTGCTGTCAATAATGCTGCTCCAATACTTA TTGTTTACGCACACTACTAAGATTGACTTGACGTTCAAATCCGCGAAATT CCctaaatttaatccccgcgaaaatttatcgcAATAATGAGTAATGCATT CTACAAAAATTAGGTCATTAATTCTCTGCAAGTTATGACTTTTTGTACTC CAATTCGCAACACGCTTCTACATTTTCTATCATTTCTTGCTACAAATGAA CTATTCAATCTTTTTAATGAGGAAGGAGGCAATGtcaccacagatctgta aagcccgaagggctagatccgcggcctttatcgaaaagtgaagcaagttt tggtgtaggatttcctaccaaagaaatcacgtgacaacaagcaatttcac tggtttgagagatgcaaaatagcgtttgccgcctactttttttgatctcg cgctccgaaaacaattaaaatgctagattctattcatcggcaagaaattt aaaaagtcaaatttttgcttcactttttttgctggagaaagcttaaagtt gcctatctagccctttgggctttacagatataTGTGACTGTCACTTTCTT ATAGATCATGTGTTGGCAAtctcaaaacaacaacaaagggaaatatttca aaaaatcaatcttCTATCTTAACGaattaatacacgtttttttataagaa catccgaagtttCTGAaaccttcagatgttcttaaacttttgaattttaa gcctaaaagtgttcttaacatgctcttattttcacctttttgtgagtatt ttgtccaattttctaagaaatcgggtgttttagagcccacaaaaccttaa attgatttaaatattttggtcatcgaagccttatgttcttgtataatttg tttttataaaaagcgtgtagtgtAAAAAGCCGtagaaaatattcgaatta tCTCAATTTTACACCCTGAGACGTAACAGAGGAGTTTTCTTGTCTATGAA CTATGCCGAGGGCGGAAAAAACGGAAGGGCAGAAGGGTGGGAGGAAGCTA AAATCACGCGTTTAAAGGAGATTTGCATCATCAACTTAATTTTGTAAGAC AATAAGATCATTTTTGTTTACCTCAGATTAGTGTTAAGCGTTTTGACCTA AAAGGCAGCTACtacatattttccaaaaatgattgaaaacgtCTACTTAA TCAGCAAATCTGTCTGATACTGACTCAGACTTACGTCTTACTGTAATTGC GGCTAACTATCCAAAAGATAACTCGACattcaaatgaaaacatttccgCT GAAAATGCAAATTACCAATATTTTGAGATAAGTTCGCCCATTATAAAAAG TGTCTAACAATCACTCCAAACGTTTGTGCCAGCTTGGTTTTAACTTATTC CAAAGTGGCTGTACTGTAATTTTTGCAGTTTCAGAGCTTTGATTGATGAG GGAACTTTTGGATAGTTAGCCGTAAGTCAGTTTTATAGGTTTTTTGAATA AAACTATTCCATTAAGTTTTTCAGGAGGCATATAAAATCGCAAGGATGGT GAGTTTAAGTAGCTTGGGTTTAAAGTGAGACACCTTATAatatttcgtca cctagaggcattttcgtcactttcccccgaccaaaatttcaaattcgtca cttttccccgacgacatttacaatttagtcactttcacccaactaaattc tccaaatgaaatggtttccttcactagttCGAAAAAAGATCTTCTAATTC Gatgtttaaagcactaatttcagttaataaaggtgtaaaaatttagattt taattttggttggggtttaaaaaatcgggtaaaagttttggtcggggata aaaaaatcgggtaaaagtttTGGTCGGGTGATAAAATATCGGGGAAAAAA TTCATCGGGGGGAAAATTTCGTCACCCCCTCAAAATTTTCGTCACTTTCC CCCGACATCTTTTTCCCCGATAAGGTAATTTCCAAAAAGTGTGGAAAACC TAATCCGAGAAAGTTGGGGTAAAGTGACCGCAAAATCTTGAGGAAGTGAC TGAATTATTAGCGAAGTGATCAAATTTTTCCCCAACTAATATTTACTCCG ACTTTTTCCCCTTAAAAGGTAATAGAAGGACAAAAGATTATTATGAAAAT CATGCTTAAGAAATCATAGCAAAATTTAGAAGTGCCAATATCAATGGAAC AATTAACAAATTTAGCATTTTAGCATTTAATCAAGATTTTTTCGTCTTGG GGGTTGAAGCGATAATCGATGATCTAACTCAATctcattataaaaacatt ttctcctGTTTGAATTTTCTTCTACTTCAAATCATTAATACAAGGATAGG AAACAAACAATATTTCGCCAAAACTTCGTTTTACAGGTATGTAGACTTTT TTCCAGACCTATCTATACAActtgtaaaaaacaaaatagttTTTCATGGG AACATTTTCTCTAAGAACACTAGAGgtttttgaagttttcaaaGACATCT TGGAATTCAAAAGAAGTTTAAAGCATTTTGAATGTGATTATAAGGTACTA AAACGAGAAAGTTTAATTTCATCTTAGCGCTACAGGATTTGTATCAATTC AGGTTGGTTATAATTAGCAGTTGAAAAAGTTTGGCTAATACTGAAAAAGA ggcattgaaatatttttcaaacagaGAGGTTCAGACAGAGAGGGAGCTAC GTTTGCGAAGTTCTTGCACGTGCTTCTGGAGAAATCTCCAACTTTGAATT AATCTTTACCGTGTCCAAACTGTCACCATTAACTCGCCTTAATTTCCGTC TCAGGCTTGCTATTAAAATGACTGTTCTATTTATCCTTTTCTGGATtcta aatcaattttcaattaatttttaatATCGCTTCACTGTCACTTCTTATCT AGGTATCTATATAAAAATATATCTCATTTATAATTCTCGAGACTGCCATA AAAAGCACAACCATGGGAGTTCGAAATTCATTCTGCTGACTTCACTCAAC CCGTCTATATACAAAAGCATCGGATATTTACTGAAAATGACAGCTTGGTT CACATTTAACCTCTTTTTGATTGGCTGTAGTTGTTGCGCAACACTATGGG CGATCCCTACAGCACAACCTGGAACGACTCCAACAACAAACGTAACTCAA GAGACAACATCTGGCAACACTTCTGCAACCACCAACCACGATAATGAGAA CACAAAAACGAAAGAGACCGTTCTAATGGATGTCGTATACTGGGAACAGA AACCTTTCATCTTCTACAATGCCAAGGGTGAAATTGATGGAATCATACCA TTGATGTTCCAACAAGCACAAGCTTACTGTATCCCTAACAACcattccat caaaatgatcaaTTACGTCAAAAGAGCCGGCAGCCGaaaacatttttaca atttagcgCGTTCTGATGTGGGATACCAAGAAGGAGAGTTGAGTGAGATC CGCCAGAATAACGCTTTTTGGATTCCAGTGGTCGCCTACTCCAACAAGAA AGTGGATGATTTCGTCAGCAAACGAAATCTCCGTGTTTTTCAACTCATGA AGTCAGACAAGATTGCTGTTATCGTTCGTCGGGAAATGATCTCTCTCCCG AATAAAATCATCCGGGGTATTTTAAGCTGTCAACAAATTTTCTTCCTAGC TATCTTGATGGCAATTTTGTTCGGTTTGGTGCTTTGGGTGATCGAACGCC AACAAAGTAAAGAACTTCCAAATTCCTTTATTAAAGGCTTAGGGACTGGA CTTTATTGGGCTATTGTCTCCATGACAACAGTAGGCTACGGAGATATCAC ACCAAAAAATCCGATCGGGCGATTTATTGCCTGTATTTGGTTATTTGTGG GCGTGATGGTTGGGTGTATAATGACCGCCACAATGACTGATATTGTCACG GGCGTAAAAGATTTGAACGTCTTGAACAAACGAGTCTCCGTTCTCGAGAA TTCATTTGAAGAGAAAACAGCAGAGAAAGACTATCGTGCGAAAGTGGTGC GCGCCGAATCATACGATCAAGTTTTAGAGATGGTTCGGAAAGGAGATGTG TTCGCAGGTATGATGAACGCGGACGTAGCGGCTTGGTACCAGGATGAAAT TAACGATAATACTGCTTTAGTACCTTTGAAAATCGTCGAAAAACTACCTG CTAACTTATACATCAATTGCTATTTACCTGCTGACTTGGCAgttcaaatg aaaaagattttcaaatgtATGTATTATGCTAAAGACGAAGTGTACACCTA TTCTATACAAGCTTTTCAACAATACTGTCACACAGACACTTTGTACATAG GTTCAATGAGTGATTTAGTTTTTCACAACATCTACATACAAATCCTTTTG GGTGCAGTGGCAGGTTTGATGTTGATTGGTATTGGATATGACGTCACCAA ATATTGGACATACTTTAAAAGCTCAGGTAGCGAGAAAGATGAGAAAGAGA CTGATCAAttgatgatgaagaaaaagaaagagaaaaatggTTTCAATGAC CGATATCCGATATTCTGATGAAGGTACACAAGAAGTCGAGACGTGATCCA CTATGTAGGATAGAGGGATGCCATGAGCTGCTTAAAAGCTTCCGAACTAA AGCTCTTTGAGCAGATTAGATTGATGACACAAGATGTTGACACTTTTAGA AACGGTATTAGAAGCAGAAGATAGCAAAAGCATTACAATACATCATTATT TCCTTTAGTAGACGCTATTCCTTAAAACCTATAACTTCAGATGTTATTTA GTGATTATAAATTGAAGCTAacaattttgctttattttctCAAGAGTGAT TGAACTACGgactttgaatttttattaatcGAGAACATTTGATGTAAATA GACCTTTATAACCAAGCAACATGTACAGGTATAATAATTAAAGGAATATC CAGATAAAATTGAAATTCGGTTTAAGAATTTCTGCCTATTTCAAAAACAA GATATTTgggttttaatttcaaatttttgctcaagaaaaaaaaaaagaaa ttctacGAAATTCAGAGATTTCACACCATTTCATCTTTACAGCTTTGGAA TGTTAGTAAGTAGAGATATTTGGCAGTTTTAATCAGGACCATAAAAAAGG TTTCTTTTAGGccgaatttcatttttttatctagTTATCCCtttcataac aaaaaaaaaatcgatcATTTGGTTAAACAATATTATGTTCAGTAGTGCTA TGGAAAaccaattcttgatatgcgtaactCATTTTCTAGCGGAATTACCC GAAGAAATCCGGAATTTGacccctctctgttactaaaaatagaaacacgg aggtcaaaatccggcttttttcgggtgcttccgtTGAAAATATGAcatca tcttgacttacgcatatcaagaataagtCAATCCGGTTAGACCATAAATC TGGTCAAAAGCCAATAAGGAATTGCAAAACCTAAATATTTCAACTTAAAG AACCAAAAAAACTAATCATGATTTCAAAGGCGGTCGATTAACCATCTGAG GAATGCGACTAAAGAATACTTTTTACTGTAACGAAATCTCAATCAAGTCC AGATTATCAGCATTGATCCTACTGTTTGATTTGAGGGAGAAATCACTTTC CTTAATCTCTACCAAGGGGGGaactataaaaaaaaactaataaaattcCT CTTGGAAGATGGGATGAATAGAATGTAAAACCTTTTTATCAAATCGTTTA AAATACAGTTTATAAATTCAGTGATGAGAAAAACTATTCTCTTTTCTTTG GATTCGCTAATTGTGTCTCCCCATTCAGCCAgttttggaaagaaaagttg GAAAATATAATCTTCTatgataaaaaaagtataagctGTGAAAAAGATAA CAATTTTATATTGTGTTAAAGATACTGTAATTTTCCGTACAAGTTTACCA AGGTTCTTTAGAATCTATACATTTTGGGATTGATGCAAAGGACTTGCTAT GTAGAGGTAAGACCTGCGATTTCCACGTTCGTGTCTTTCTTGGAATGGAA AGTGAAAAGGGGTGCTGGTGTGAAAAACTGAGTTCTGAATTGCTTTCATT TTAGATCAGAATTACTTTTGAATACAAGAAGGTCTGTTGAAATTGGCAAT TGATCAGACCACCATCCTTTAGTGTTAAGGGCTGTTAAATTTGgcaatca atcaatcactgcCAAGTAAATTATCAAATCAATCGGAACTTTCTATCAAA AGCATGTGATTTTAATTGCGTTGCGAAAGAGGTTGCGTGACAGTGATTTA TAGAGTACTGTTTACGATTTTAATATTCTACCAAAACACTGTGTGACTGT TTAAAGAAACCAGGAAAGAACTCCTTTATTGAGGCAAAAACAATGTGAAA TTTTATCAACGCTGCATGGTCAACAGTTAAAGAATTTACGGAACAAAAGC AAATTACCTTTTGGATAGTGTATGATGATTTGACTTAAATGCCTTCCAAA GTGATTTCGAAAGTAGGTATATCGATAGTGGAATGGGATTACGATTCCAA GAGCATTTTAAGTTATAATGACaattccttcaactttttttgtttgttca CAAAAAGTTGttgcccatttcgcgcgaaagtgaaGACCGGCCTTAAGTTT CTTTGGCTCTAAAGGTCTGAAGAGAATTGATTTTACAATCCTTTACATAA ATTTGTACATTTTTATTCGAGCCAGTgggaaactttttcttttcgtttaa attttttGGAACATTATAAAAATGATTTATCCGTTTGGCAATTTAATAAA TTCTACAATATCGCAAAATTGGATCAATATTACTTCGAATTGCCGCTTCA AATTAATCTCTTAAACAAAATTAGTATGTAAAATCTGTCTGAGCTTCTGT CCATTTTGTCTGAGATCGAGAACACTGAGCAGACTGAGAATTCCAACAAA CTGCATTTTAGACAAGGTGCAAATTTTAGTTGAACTATGGGGCTGCCAAT GGAAAGTTCTGCAGGAATTCGCATAAATATACAATACCTTTAAGatgaaa ggaagttttcaaGAAATTGGATATTCGAGATGGAAAGATTTCGAACATAT TCTAATGGCATGAGATTTTACTTTCCTGAACTATTGAAGGGAGGTGTCTC TATAGAActattttagaaactttgataTAATGTAAAATAACTTGTCTTTT ATTCTCTTTATTCAGAGACACCACATGGACAGCGAATGTTGAAAGAATCG ATCATTAACTCTCATCGATATAAACCTACAACACCACCCTAACAACATCG ACTGATTACTTCACATCAAAAGATCGCTCAGCGTTCGAGGAAAAACAAGC TGTGTATTTTGCGCAACACCACAGCACTGACCGTGTTGATCATATAAAAA CTGTAAACAAACTACATCATTCGCTGGCAACATCCGATCATAGAAGGTCA TCTCAAGATGCGTACTTTAAAACAACTCCTAGTTTTGATCGTTCTTGTTT TGCACAAATCACAAAATGTCTTGGCGAGCTCCAACACAACCTTCAACAAC CAGACGACGGTTGTCGGCAACAACGCGACCTTACCTAGCAACAACACTGA CTCCATCTTATCAAACGAGACGGAGTACCTGATGGATGTGGTGTATTGGG AACAGAAACCGTTTCTTTTTTACAACGAGGAAAAACAAGAGATGGACGGT ATCATCCCTCAAATGTTTTCACAAGCAGACGAATTTTGCATCACCCAGAA AAACCGTAAAATTAACCACTACAAACGTCGCATGCCAAGTCGCAAAGCCT TCTTCGATCTCGCCCGCGCAGTAAACACGTCATATGGAGAGGGCGATCTT GAAGGAATTCGCGCTGACCGCTCGTTTTGGGTTTCAGTGCTGGCGTACGC CGATCGCAACGAAGATAAGTTTAAGAAGAACCGAAAATTGAGGGCTTTCC AACTGATGACATCGAACGAGATTGCGGTCATTGTCCGTCGTGAGATGATC TCCCTACCAAACAAAATCATCCGAGGTATATTGAGTTGTGAACAAATTTT CTTCCTCGCTATCTTGATGGCTGTTTTGTTCGGCCTTGTTTTGTGGATGA TCGAACGATACCAAAACGAGGATTTCCCAGAATCCTTCATTCGTGGTATC GGCAGCGGTTTGTATTGGTCTATCGTTTCCATGACGACGGTAGGGTACGG AGATATCACCCCAAAAAATCCAATCGGGCGATTTATCGCGTGTATTTGGT TATTCGTGGGCGTAATGGTGGGATGTATCGTGGTGGCCACTATGACGGAC GTCGTGACGGGCGTAGGTGATTTGAATGTGTATGGACAAAAGGTGGCTGT ACTGGAGCATTCTTATGAAGCAAAGACCGCAGAGAAAGACTACCGCGCCA ATATTGTGCCCGTTGAATCTTACGACGAAGTGTTAAGATTGCTGAGGGAG AATAAAGTATTCGCAGGAATGATGAACGTTGACGTAGCTGCGTGGTACCA AGATGAAATCAATGACGACACAAATCCAACACCGTTACGTATCGTACAGA AACTACCCGCTAAATTGTATGTCAATTGTTATCTACCGACCGATCTCGCT CGTGAAATGAaagaagttttcaaatgtatgTATTACTCCAAAGATGAAGT TTACACGTATTCTATCGAAGCGTTTAAGCGACATTGTCATACAGAAACTC TCTATATCGGATCGATGAGTGAACTCATCATGAATAACCTCTACATACAG GTCTTGTTAGGAGCAGTTTGTGGCTTGATGTTGGTGGGTATCATTTATGA TCTAGTCAAATATTGGCAGGGAGGAATGAAGGATGATAAGAAGAAGAAAT TGATCAACAACAACCATGATGAGAAAATACAACTCAACGGGTTCAATTCT TACTAAAAAATTCAGACTTATTGCAAACAACCTTTTAAAGGTGTTTGGCG AGAGAGGTTAAAGAAAGTGCCGTCAGACAAGAGACAATCTTTATTGGACG AACGGTAGAAACCAATTCAACTCATAAAGtcgaagaaaaatatgaaaaac taaACTTGAAGTCGTTAGTTTCCATTGAACGATCGATTAATTTGAAAATA CCACAAACCTTCATTTTCAAACAGATAGCTTTAAATAGTGGAGATTCGAC AGTGTGTACAATGCAGAACATTATAAGGACCGGTATACACtagaaatatt ttaatataCTTTTACACTAGGTTTAagttaatttttaaaactttttgata gTTTGCCTATATTAACATGATATTCTAGATAACTTAGCTCGATTAAGGGA ACTCTTTCAATAAAAATAGGTGTTTGCTGTCCGGTAAAAGACAGATACAG CTCTCGCCCAAGAACTACCTGTAAATAATTAATTGGCTCTGTAGCTTGTG ATGATTTCAAGCACCGATTGTTTGCGAGCTTATTTAGGTGCTTCATATAC AGTGTAATTATTTTCAAgacttatttttataaaaaatctttctttttgta aaacGCTTACTTATAATATGCTTATGTAACAAGTAATTAGAGAAATATTA ATTGTTAAAGTAAAAACTCCTTAATTATTTATCTCTCATCTTTAAAGGAC ACTGTTGAGAGTCTATATGGTATCCCCATGTTGAATTTACGGCTAATCTG GTTTTGCAGTTATATTTTCAAGTCACGCTCCCTAGaaccaattttaataa aagCGAGAAAcagccaaaaattaaaaatctctGTGAAGCAGTggtattta aatttttcattaacttTCCCCACTAGTCTATCTGAACCCCTTTTGAGAAT CG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044928XLOC_044928Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00072352-exon-scaffold_77-1491911889:108495..108762TCONS_00072352-exon-scaffold_77-1491911889:108495..108762Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00072352-exon-scaffold_77-1510915933:108495..108762TCONS_00072352-exon-scaffold_77-1510915933:108495..108762Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00072352-exon-scaffold_77-1575043694:108495..108762TCONS_00072352-exon-scaffold_77-1575043694:108495..108762Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00072352-exon-scaffold_77-1491911889:123810..126396TCONS_00072352-exon-scaffold_77-1491911889:123810..126396Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00072352-exon-scaffold_77-1510915933:123810..126396TCONS_00072352-exon-scaffold_77-1510915933:123810..126396Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00072352-exon-scaffold_77-1575043694:123810..126396TCONS_00072352-exon-scaffold_77-1575043694:123810..126396Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_77supercontigscaffold_77:108495..126396 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0.0517915 0.123029 0.0969354 0 0 0 0 0 0 0 0.433541 0.387581 0.268171 0 0 3.27952 1.69669 0.305144 0.797826 7.48405 8.55039 1.16202 0.461614 0 0.90425 2.07598 1.1125 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00072352 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top