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transcript sequence >TCONS_00072324 ID=TCONS_00072324|Name=TCONS_00072324|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3874bp GCGTTGCTATGGTTTCATGTTCAAAATGGGCTGTTATCGTGATTAAAACA ATATTATTGTCTTCATGAATACAATCGcatattattgtttttaaaacaaa gcagaagaaaagagagaaatgaaatatttttcaaagaatatggattttcg ttgctcaatattgttttgatttttggactTATTGCATTTATTTGAATGGT ATGAAATTTGAAGACACAAtcgattttcattgtaacagctTCCTGTTCGT TGATTGGATAGAAAATGCTGGGAATAACAAGGATCCTAATGCTTATTAta CTTTCAAATTTGGTGGTTATCGTCACATCAACAAAAAGAACAACGGTTGA ACGACAATGGTCAAATGCATCACATGACTTGTTCCCAGCCTATCAGAAAT CACCAATTaccaagaaaaacattttgttcaaatgTAAGAAATCAAAAAGG ACTGGAGCAGACATCACTTGTcgtcaaataaaccaatcactGAAGCATAA ACAATCACGTGTGTTTAATGTTGAGAAGCAACAAGTGATTCAAAATCTGG ACGACTTTTTCAATCAGTTTACATCTAACATACGCACCATTCGTTATTCT TTACAGCAAGTATTGGATTTTGATTTGCTTGAACAGTATCAATTACAGTT AAAAGCTCTTAAAACGAGCGTTACAACTGTGACCACGCTCTTATTGGGGC ACAAAGCCCacaaattaaatgaaaaacgaCCGACTTATCCTCCGACTGTC ACCTTGAATCCAATATTGAAACACAAAATGGACCAGAAACAAGCGCAACA ATTATGGCTTGATCAAAGTCTTCGAGAAGAGCAAAAGCTAGGAAAAGTCT CAAATCAATTATTAGAACCCATTCATGCACCGTTAAATGATATAATCACT AAAGTGAAactaaaatcattgaaaattcCGAAATCGATACGGGCACCTCT ATTGAAACCTTTAGTGACAAATATCAtgcccaaaccaaacgcactgAAAT TATCATTATCGCGACCAACAGAAGCTAGGTCGGATCAACTAATTGAACAA TCTATATCACCGCAATTGGCAAGCGTCAAAACACCGATATCCACTATTTT TAACATTGTACCTACATCGAGTTCAAAGACAAAGCTACCTACCCTGTCTT TGCAAGATAATGAACCAGTATTGAAGCTGAAATCTCCAAAATTACCATCA CTGCCTTTCCCAACAAGTGTCAAGCCTCAAATGAGCAGACAATCACCGAA TCTTCAAACTTCTACAGACGATTACAAACAAATGTTCCCTTTGAAAAGGG TTCCTACAACTTCATCGACACTTTTGACTGAACAAAATAACCAGAAAGAT GCAGATGAAATTATTGGAACAATAGACTCAATGCTAAAACCAATATCATC AACAATAATCTTCAAACCAACAACTACAACCGTCATCAACAAAATCAATt atcaaaatgaaatcaaactaGTCAAACCTACTCTACATCAACTGTTGTTG GACGCTAAGAAAAACTTATTGAATTTCGATATTTTGAATGCAAAGAATGC TGAAAAACTCCAAACTGGCGCAGTTACACCACCTTTAAATGCTGATAATG GAGAATCGATGATAAATCAAGAACCAATAGAAATGATTAAAGGGGTAACC AATGAAGATGTATTTCCAAATGTGCAACCGGGTATAACTTGGAGAATAGG GATGAATTTAATGAGGAATTTTGATGATCAACTACGAAACCCGGCATCAA AGATCTTTCAATTGCTGAAAACACACATTGAACGAGAGATGATGAAACTT TATAATAGCAAtgaatcatttttgaaatgtcaaatcaaaaaattcctaCC AACCAAATTAAGGATTACCCACGCGTCATAAATCAATTCCCACCGGAACC ATGGGCGGCTCGTTGGACAACGTTTTAATTTCCATAACGGTTTTTTATCC AAATGATGAATCATAAATCATCCTACTCATCTTACTCTTCATCCAATAGT TAATTTCACAGCACTTATAACAATGGTTTTCGGTAGagtaacaaatattt ttcatctTGGATGATGCTTCTTCATAACAGCATTGTATACTTTTCAAAGA ACTCTCTACTGATTGGTACAAGAATGTCATCATTCATCATtggactcttc cagaaaatgttcgtacatggggggttGAGGATATATAGTGGCCGGggata gtgaaaaatctacaaaatttaccttgtccggggggagggggtaagTTTAC TCTGTTTTTGATtatccagggggtcaactaatgcttgtccgggggataag acctgctgtccgggggttaaaagtcacaatgtccgtgggacaaatttcca aaaagtgttatatcctccacccccatattcaaattatttctggaaaagcc cattcctCCTCCATTACTTTTCTAAGACTTTCCACCCATAGCGTTGGCGA TATTTATTCAAACTGTGATACGGTAATTAGGGATGCAGCACATGAAAGgt cgactatcattcctctccgatgcgAAATTAGCCCGCTATTAAGAGCTTCA GCGGGGGTGACCGCCAATCCACCATCGGAGGACGAACGTCAAGGGTACGA TTTTCTGGCTCTATAAGGTGCACTATAATGTTTTATAAAGTTTCTTGTGC AAAATTTTGGAAGGTCTGACTACCTTTGCTTCCCCCGGAAAAGAGAGTCA GAGTTACATAGTTATATTTCTTCCCTGAGAAGTATTTTAATTGTTCAAAA AAAGCAATAGAATGATTTCTTGTATTATTTTGATCATGCTTTATGAAAAA AAGCTATATACCAGAATCATGCTTCAATAAGTCACATTTCACCATGCATC AAATCGAATTCCATCAATAATTTCCTTTCAGTTTACATAATTGATACTTT GGTTATACAAAACAACCGATCAAATTTCGTCGTAATCATCTTTTAACCAA TCACGTCTTACCAAACATCACTCATTAATAGTAATCATCATCGTAATCAT CATCGTCGTCATCGTAATGATGATGTCGGCGATGGTGTCGTCTTGGGAAA TAATAATTATTGACATGGTGATGATGACGGTGATGAGGATGGAAATCATC ATCCTCGTATCCAGACTTCCATCGCAAATAATCAGCAAAGTCAGCTGGGA TTTGTAACCCAGCTGCTCCATTTCCTAAGTTCAAACCTGGTACAACTGGG CTTCCTGCAGGTGCAACGTTATTGACTGCCTCTGTTCCTTGTCCTCCTTG TCCTCCCAAAGCTGTGTTTGCTTGTGCAGGGTTATTCATGAATTGGTTTG GTAATGGATACATATTCGGGTTTAATGCACCTCCGTTGTTGTTATTGTAA TTCGAATCATCGGGCGATCCTCGAGACGCCATTCCACCCGCCATTCCATT TCCAAAATACTGAGCAGGCTCATTGCCATATCTCACCACAGCTGGATTCA CATTCGCTGGAGATAAGATTCTACCAAGATTTCCATGCGCACCAACAGCT CCAGCATATCCTAAATCTCCCAAAGTGCTGACGCGACTTGCTTCTGGTAT GGTAGCTGGTATATGACCAGGTTTGGCAACAACATTCAATCCAGCAGGTT TTGCGTTGATTTTGACTCCTTCAGCATCTGCAGTGACTTGTATTTCAGGT CCTCGATCCTCCATATGGAAATGCGTTGGTTGTCCTGATTGAACAACTTC TTTCTCTTGGCAATGTACCAAATGGTTGCTTAGATTTAAAATTACAAACA TCCATAATATTTTTTGCCttgtttttaaaacaaatcCCATATCTCTCTTC TTTTCTtataatattcttatttttgaatCATTAGTAAACAAATTTAGGTG AGAATTagttactttttaattttc Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_76:117680..182236- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00072324 ID=TCONS_00072324|Name=TCONS_00072324|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=64557bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_76:117680..182236- (Clytia hemisphaerica) GCGTTGCTATGGTTTCATGTTCAAAATGGGCTGTTATCGTGATTAAAACA
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CTCTACCCTACCTTTAAGACAATAGAGCTTACGACTTTAATTAAGGAACA
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TCTGTATTGTAGTCAACAAAAGATTCTCCTAACTACATTTTAATTAAGGA
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GTCAAATGCTGCTAGTCTACTTCACTGGACTCAGCGTCATAAAAAATTAT
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CTTAATTCGACTCCCTGAGGTAATAAAAAAAGACATATAGAGCTTTGAAA
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GCTAAGAATGTTACCGGTACACCATTTAACCGGAACTAAAATACTGAAAC
GCGCGCGCAAAATTATGAGATGTTTTCCCAACTTTCCCTCACGAGTGAAG
CTATGAATGCCATCCTCGGAAGCTTTAGGCTTCCTGCGGTGGCAATAATT
TGTGGATGAAAAGAAACATACATATGACGCGCCGCGTGTTGCCAAAAATG
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TCCGATGATTAGATACGATGAAAAAAAAGGAGTTAATTCTCCATTTATTT
CTTATTACCTCAGCAGAGCAGAGGGGGCACTATTTAGTCATGTTTGAATC
AGATTTTGCATACTTAACAATCGACCATTTCAAATTTGGTTCAATTTCCT
CATTTTTTTGTGGGGGCGTATGGTATTTTTTCTTCGGAATTTCGGAAATC
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TTGCTCCTGTGATCCTGACTGGAAACCAAATACCTCTTGCAAAGCCAGTA
AACTTTTTAGTGCAAATAAAAACATTGAAAAATGGTGCAGCAACACTTGT
CCGACTGGTTATTGCCCAAAAGCATTTTGTCATTGCGATTAATTGACTTT
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GAATTTTTGTATTGTAATTGAGTTTTTTTTAATATTCTTATATTTTGTGA
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TAAAACCTCACCTTTCATCACCCAGAAATAGAGGTTAAGGATTTATTTTT
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GTCTTGCTATTGTTACATTATGCTGATATAAGCAAACAAATTTTTTTCTT
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GGGTCAAAAAAGTTGTGTGTACAATTTGAACACAAAAATTTGTTTTAATG
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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TCONS_00072324-exon-scaffold_76-1491911889:135533..135606 | TCONS_00072324-exon-scaffold_76-1491911889:135533..135606 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_76 | supercontig | scaffold_76:117680..182236 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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