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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00072174 ID=TCONS_00072174|Name=TCONS_00072174|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2659bp GCTGAATCTAGGGATGATTTGATTGTGGTTTGGTTTCTTTTAGTTTGGAT TGGTTTTCTATGATAGATCTTTGACAGTGTTCTGCACCCGATGCCGATGA CACAAAACAACTCATTGgcaAACTATAAGAGAGGGTCTTCGATTCTCAGA AATGAGTCAACATTCAATGATTACTGAACAAGCAATCAACCCTTACCTTT CATCGCGTGGAACTTCAAATCATATGATTCAGTCTATGGCCCTTGGTAAC CATCTGACTGACAATAATAATTCAAGCAATAATAATTACTTCAGTGAAAT ACAAATGGATGACGGGAAATGGACCCGACATCAAACACAGATCTTAATTG ACACCTGGAAAGAGCATAAAGATATCTTATTAAGTACTGGATCAAGCTCA GCTGAACATTTTCGTGTCTGGAAACTCATTGCGACTGAAGTTAACAAATT CGCACCACCCAAGAGTCTCCAGCAATGCAAGAAGAAGTTCCGTAATATAC GATACATTTGTAAAATGGCCATGAATAATAACAAACAAGAGGGCGGTAAG AAACATTATCCAATGTTTTATTCAGATTTCCTTGAAATCATTTCCGAGAG TGAGCGCATCAAAGAAGGTGTCAAAATAGAATCACCCAATGTCGAGGTTT TGAACGATTCAAGCAAAGATGGCGACCTGTACGGGACTGGATATCAGAAT CCGTCACCACAAGACAGCCAATACGACGAACGATCGTCATCCGAATTAAA CACACGTCGCGAAGACGAACTAGACGAGCGACGTACTCAGCAATCGGGTA ACGTTAATAACAGTGAAGGTTCTGGAAGCTTTAACGGAAGTCCTCAATCC AGAGAGTGTGAGAACGAGTATCAAACAACGACGTCACCAAATCATCAACC GACCGTATCCGAAACGAACGTCACAAACGAGCGAAGGGAAACCGCCACTG AAAGCCATCATCATTCCTTACAAAACGGGGATCTCGAGAACGGCCATAGT AGAATCAACGAACGCTTATCAAATTATTACTCACACCACGATTCTATGTA TCCGCCCATTTATTCGACCAGCTCTNCGCACCACCCAAGAGTCTCCAGCA ATGCAAGAAGAAGTTTCGTAATATACGATACATTTGTAAAATGGCCATGA ATAATAACAAACAAGAGGGCGGTAAGAAACATTATCCAATGTTTTATTCA GATTTCCTTGAAATCATTTCCGAGAGTGAGCGCATCAAAGAAGGTGTCAA AATAGAATCACCCAATGTCGAGGTTTTGAACGATTCAAGCAAAGATGGCG ACCTGTACGGGACTGGATATCAGAATCCGTCACCACAAGACAGCCAATAC GACGAACGATCGTCATCCGAATTAAACACACGTCGCGAAGACGAACTAGA CGAGCGACGTACTCAGCAATCGGGCAACGTTAATAACAGTGAAGGTTCTG GAAGCTTTAACGGAAGTCCTCAATCCAGAGAGTGTGAGAACGAGTATCAA ACAACGACGTCACCAAATCATCAACCGACCGTATCCGAAACGAACGTCAC AAACGAGCGAAGGGAAGCCGTCACTGAGAGCCATCATCATTCCTTACAAA ACGGGGATCTCGAGAACGGCCATAGTAGAATCAACGAACGCTTATCAAAT TATTACTCACACCACGATTCTATGTATCCGCCCATTTATTCGACCAGCTC TGAACATTACATGCGTaagcataaaaatattgacGTCAGTATAATGGGGC GTGGGTACCCCAGTGCAAAGCGTGTTAAACGCGCCATGGATATTTACTCA TCACCTGCCCCTGCGCCCTACAAATACGCAAGCCGACACCATCATAGAGG ATATCCGCCCACGATGGCCACAATCGCCAGTAATTCTTACCCATATCACA TTAACAACCACTATTCGACAACACCGCCGCTTATTCGACCCGTATCTACA CCAAAAGATACATCCCCGTCTCCCCGTAATACTGTTTCTAGTACCAATAA CGTAGCACCGAGTCTGTCCAATGATTCGTCTTATATGAAAGCAGAGCATA CGCATATTAATGACGCACCGCCTGCGCTGAAATCGTCTCCTGGGTACAAG AATAGAGAGATGCACGCACCTAAAGACTTAACATTAAGTGAAACTTTGAA CTTTTACAATCAACGATTCTTAGATATGCAAGAGAGACAAACTGAATTAT TTAGTGAAATGATTTGTCGGCATGAACAATTTCTTTCCAGACTTTTAGAA CAACAACGAACGGCTGCTGAAGATGCTCAAAAAAGAGACAAAGAATTCAT GTTAAAATTGATAGAAATGTTCGTTAAGCAATAGTTTCAAACGTTCTCAa ctttttagtttttacaattttttcttctgattttcaatttcttctgatag aatttttctttcgtttttttttttcttttaaaattttctgctCCAGGTTT TTGAGCAGATTTGTAAATATATTTATCTAAATGCGATCTTTAAATTGGGT AATTCTTAATTTTTACAGTTGACTTGCCTGGTTTTTGATACATTCTTAAA ACTGTCAGATCGTTGTGTACGACAGGGGTTTTATTCAAATCTCCCTTGTC AACAAAAATTCTTTAAGAATTCATCTTTGAACCCTTAAATGAGGCCGTTG GAAAATTAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_71:426415..487821- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00072174 ID=TCONS_00072174|Name=TCONS_00072174|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=61407bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_71:426415..487821- (Clytia hemisphaerica) GCTGAATCTAGGGATGATTTGATTGTGGTTTGGTTTCTTTTAGTTTGGAT
TGGTTTTCTATGATAGATCTTTGACAGTGTTCTGCACCCGATGCCGATGA
CACAAAACAACTCATTGGTAATTTATTGTCTTTTGTCGAGTTTGTATCAA
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ATTAATATCTTTCAATCTGAAATAATACCTGAACCTGCGCACGTACTTTT
TTCGAAAACAAATTATTTTAATGTCACGGTGTCTCTTTTGATAATTTTCC
AGCGTGCTGACCCAGGCCCCTAACAACCGGGACAATTTCAGTCAAGAGAA
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AGCTAAATTATAAAGCGTTTTGTTGTTTGTTGAAAAGATATTCACGAGTA
GAATATTATCGAAAAGGAAACATTTAAAATGAGTCGTAAAATCAAGAAGA
TAAAAACCAACTTCTTGAATGACTGAGCTTATGATTACCATTTTTACACC
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AAAAATCCAGTGGGAATGGTTTAAGAGTGTAGTCTTTTCCATTGATTTTC
AAGTGGGTATGAAATTAAATCAATTTTCCAGTGGGTCTAAAATTGTAGGG
TACTTTTTCCACCGAGGACGAAATTTTAAGCTGGCAGAAATTTTAATATT
TCTAAATGAAGTTTCAACTTCAAGACCACGTCATCCCAACCACTCAAAAA
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TTTGAGTCAGCTTATGTCAAAATGAGATATCAAAAAGTAATTATATCGCC
AAAAGGAAATATCTGTTGCTTATAATGACTTTGCTTTGATTGATACTTGC
CTTTTTCTGCGCAAACTCGTCATTAAGTTATTTTTTGATAATCTGTAATA
CAACATCAAGACTTTAACCATTCAACCTTAACCAAGCCACGAGAGAGTAC
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AGCAGCATGTTCAAGGTATTGTTACTTTTATATCATTTTCTTTTGTTTTT
CATTTTATTGTTTTAGTTTTTGTTTGTTTTACGATTGACCAAGCCTTATC
TGTTTAATCATTTGAATTTGATGAATTTATTGATTTGGGTTTTTGTTTTT
AGTCAATTTTTTTGGTAAGGCAAATTCTACAATTTAAGTCAAATTTTTAT
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TAGGTTGCTGATATTATTTTTCAGGACTTCTTTTTGTCAAAGAATAATTA
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TTTTTTACGTGAGCAAAGAATGTACAAAAATCTAAATAATTTTAGAATAA
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CGTGTAAGAAGTATTTAGAAACCTCTTTATCTTACTGCATCGAAACTTAG
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GCCAATTTCAGTAGCGATGTCATTTCCAACCACTAGAATTGCTCCGCTTT
TTCAGCAATAATACCGAACCCTGACTTGTGAATATAACCTTATGATTTTA
TAAATGACCTCTGATTTGGAGACGCGATACACTGTCACCGTCTTACTATT
TCTAATGATGACGTAATGCGATTATTAAAAGTTACATTAATGAAAGTCGT
TCCGGAAATGAAAATTAGACATTTGTGGATAATATTNAATGCGATTATTA
AAAGTGACATTAATGAAAGTCGTTCCGGAAATGAAAATTAGACATTTGTG
GATAATTTTTATAATTACGGGGGACTCGCTGCTGCTGAAGACTTCTTAAC
CGCCAGTGCCTGACTATTTTTCATTACTTTTCTTTGTTACTTTGTTTTGT
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TTATCTCTGGCTTGATCAAAATCCAAAAATCGTTTGAGTATTGTACTAGC
TTGACTCTGGGAATCTGGCGATTTTTTAATCACGATGATTAATTAATTTG
CTTTGGTTAAACCTTTTAAACCGCAATAAAGAGGCCGGCTGTTTCTGGTC
GTACAAAATATTGTTATTTCTTCTTATTTCCAAGACGCGTGGTATTAATT
CTTTAAGGACTTTATCAATTTCAGTTCGATAATGTGTCTATACCGCATCC
TGGTTGGTTATACGTAATGTTTTTCTCAAATCTCTGTTAATTTTCAATTT
CATAAATTTTAGTTTTTTTTAAGCACTGTATTCCACTGTATCAGGCTAAA
TAAAAATTCTGATCTACATAGCCCAAAAATTGCATCTTTGTGTCTTTAAA
TCAATCTACCAAAGCTGAGTTACTGAACAGTAATCCAGGACTAGCCCTCA
AACCACGAGGACACAATGTCAGAAACGCCGACTTTTACTTTAACACCTGT
CTCAAATTGATTGAGCATATTTTGCTTACAAAAAAACGTCATCAAAATCA
AGTTGATTACATTGTTTTTCCTTGTGGCACAATGAAAAAATCGAGTTTTC
GAATCAAAACTTTTGTTACCGTTAACGATTTCCTTTTCCTGTGGATAAGA
TTTTTAATCTTTACGGATAAAGACTTTGCGGCTGCAGGCTAATTCCGGGA
CAAACTAAAAACATCCTCCAAAGTACAAATCAACGTCTGAGGCATCTTCC
GATTACTAGTAATCGAAAAAGGCGCGACCTTTTGACTTGGTTTTTAATTA
CCCTTCTAAAACTGATTTTTTTAATGAACTCTCTCGTATCTCATTCATTT
GGGTACACCGTCACCGCTTTGAGAGGCGGTGGTTGTTTTGGTTTGGTGGT
TTGTGAGGCGGATAAGCGATCAGGGTGTTTTTGTTGGCACAGACAAACTC
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AGGAAATCTTGAGATGACGTGATTTCATATGTATTTTTCAAAAATCAAAA
TGTGGTAACTAAAAGTTTCATGCACTTGCGTACAATCATCAAATGCGATT
TCATATATTTTATATATTTTATTTGATAATTTCTTCTTTAAGAATGTTTT
CAATTTTACAGTGTGGATAATCTTAAAATTGAATTCTCGCATGGCGGTTT
TAAGGTACAGTTTTATATAGTTTGAGGTTTTTTGTTGCTACACCTGAAGG
AAATTTCTTCATTGATAGTTAGATTATCTTTATTACTGGACTTTGAAAAT
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TGGGAAAATTCTCATGGGAAATCAGGAGGGATCTTGTAACTATTGCGAAG
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TTTTTAAACTTTCACCTAATCACTGATAAAATGCTTTTGAGGTCTCGACA
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TAACGCGAGGTAGATTGGGTTCGAATATAAAGGGCGAATGAAAATATCTT
CCAATCTAGTAAATAGACTTTTTTCGCAAATTGAGAACCTAAAAATTTTG
CGTGGATAAAGTTCGCCAATCAGCCTCTTTTTCACCTTTCACCATTTAAT
CAACTGAAGGTAACAGGATAATTGGGAGGGAGTCGTCCTAGATTCTAAAC
TAGAATGTCCCCCGCTTTGATGCAGTTTTTCTTAAAGCAGGCGGCAATAG
CTTCGTTTCGTTTCAAGATTTGAATAAAATAAACTCGAAAAGGAAGGCTA
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ATAGAGGTTTCTAAACTCCGCCTAAACCTAGGATGAAACCTAACCTCAAT
TTACATAAACTGAAATATCGTTTGATATTGAAAAAAAAAACATAATAAAG
TTAAGATACCTGGGGTGTCAACGAGTCACTCAAACACTAGGCAGGCAACG
AAAAAAGCTTCTTCGATTGACAAATAAGAATTTTTTTCCAATACAGATTA
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TGAAAAAAAGTTTTTTCCTTTGATTATCTTACAATGTTTTGCAAAAGAAC
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TAAAGTCTTTTATTCTCAAAATAAAGTTTGGGGAGGGGCCCCCTAGCCAG
AGCCACACTTTACCCCTACGGTGTACTGCTAAATAGAACGCTCTAAAAAA
AATTGCTACAGTTTCAAATAAGAGAAGTAAAAAAAAAATGGAAGTGTTGG
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TGACCCATTTTCACGGTATGAGCGAATAAGAAATCTTCATTTTAGATATC
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GTAACTAATAAAATGTCAGAGAGCTTTAAAAAAGAGCGAAAAGGGCTAAT
TTTCATACTTTGGATTTGAATATTTGGTCACTAAAGATCATGGAAAAGGG
TTCCTTACTTCAATGCAACTTTTATGGTATGTAAAACTTGGTCTTTACTT
TATATTACTTTTAACACCCCTGTCTCACAGCCCCGGTGAAAGATTGAAAT
TTTTGGATTGAAATCGCAATTGGGATAAAAATTCTATTGTTCCAAGGTTA
AAAAATCCAGTGAGGGTGGGGCCCCAGCGAGTCTGTGACACAGTGTCTTT
TACCACAGATACATAATATTTTCACATACTATTAGATGGACATTTCTTCC
AAAATATTTCGTGATATTTATCAGACTGTTTTGTTTTTCAAACTGTACAC
ACGAAATATGGTGATTCTCTCACTCATATATGTACACACTTCGTTTAGGT
TTATGTCCCATCTAGGCCAGCTGGTAAAATTTACGAAGCTAATTGCTAGT
CTCATTTTAATTCTTGATCGAACCAACTTGGAAGACTCCTATGTGAAAGA
GATAACTAACTAAGTAATAAGTCTAAGAATAAAATTAGACAACTTGAATA
TATCGTGAGATCGGGTAACTTGCATCAGTGGAGGCAAACATGCATAGCCC
TCAAATGAATGACCTGTCTAGTCATTAAATCAAAACAAAAATGGTAGAGT
AGATATGTGAGCGGAGCTGCGTAGTTCCTTGTTTTTAAATTTTCCTGCTT
TGATTGGTCAGTCATTTGATGGCTATGCAAGTTTCCCTTCACTGATGAAG
TTACCCGATTTCACGGTATATGATATATGATTAGCTGTTTTGAGAGATTA
GAATTATCACCCTAAGAATGCATCTGATGACGTGGCTGACAGACTTAAGG
AATTTTTAAATACAAATTCAATCCAGCCCAGGAAATGAAGAGGTGACAAG
AAAACTTTTTTTCCATTTTGTAACTTTTCCTCCAGTCTAGTCTATCGAAG
AATAGAACACCTTACTGCTCACCATTACGCAATTTTTAAATACTTTTTGA
TCCTTGTTTCCCTCCACTCATAGCTATTAAAATTTAATTTTCATCTTCGG
TTTTACATTGTTATAATATTTTTCCTGGCTTCTTTCTTCATGGGCGATTA
AAAACTTAAATATGACGGATTTTAATTGCTCGTGATGTTTCACCATTTTA
ATTTTAAACTCAGCTGACCCATATAAACCGGAAGAACTTTTTAATCTGAT
CAGCACTAGTCTTGTCTTGACTTCAACACTATTTTCATGGCAATTTTATT
TGCTTAATATTGCTTAAGCTTACTTTGGCATTCACGCGAAAAAAGAAATG
AAGAATTTATTTCTATTTTTCGAAGCTCTTGAGTTGTTTTCAATAATTAC
CATAGAAATATAACGTCTTATTAATCAAGCAATGTCTACATTAAATTTAT
AGCATGCAACAGGAACATATACTTCAATATGACGTGTATGGTACACAACA
AAAGAATAAGAATAAATTTCGTAACGTCTAGATACACTTTTTCTTTTTCA
TAAGAATAATTTTATAAATTGCCAAAAAATAAGAACAATCTAAGAACAAT
GTTGAGCGTGAAATTACTCAATTTCAAGCAATTTAGAGGTAAAAGTAGTT
AAAATTGGATAAAAATCCTAAAATACCTCAACTGAATCCAATAAATAAGA
ACAGAATAAAAACAATACGAGACTAAAAGTGCCAAAAAATAAGAACAGAG
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AACTGAAATAACTAAATCGGAAGACACTTGGCTCTTTAGGAAACTTCACA
TATGGACTTTAGAAAATCCCGAATAATAGAGCACTCATCATGCTTGACGC
CAAATTAATTACTATTACCAATTTCAACTTAATTGTATTGGATCCGGTCT
TTCTTTAGGCTGTTGCTTGTTCACCGTCATTAATCAGCCAATTTTTGATA
ATTTCACTTTGGCTTATTTACATTTTTTTGTATTTGTAGTGGTTGTTTTC
TTTTTTCTGGTGGACGCCAGACATTTGATTGTTGATGTTAATGTTGACGG
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AAGTTGATGGATTCAGGTTGGTCTTGATTGATTAAAAAAAAGGAATTTCT
ATCACTTTGTTTTTCATGACGTAACTTTGAAACGAATATTCTGCTTTGCG
AGTAGACGGTTATGCAGCTCGGCTAGGTTTTTTTGGGGACGATTTTTTTG
ACCCGCGGAGGAGGGTCATGGGTTACGGGGACCGTGCCACTTGTAAGCGT
CACTTTTTACCGGCCTGAAAATATTTGACAGGTTCCGAATTCACTCATGT
CTTTAGTTTTGATAGCTGTATCTGATAGAATATTGATTTAATTTCGAGGC
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AAAAGTGAAAAAAAAATTAGAAATCAGTTTCAAGAGAAAATCATGATATG
AATATAAGCAAAGTACTGGATATCCTTGGCAACTTAAAAAAATTGAAACA
AGATCGGTTATTTGTTTGTGCAAAGACTGTCAAAAAATCAAAAGATGTTC
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TTTTGTGATAAACATATACCATGGTCTACTTGTCTTGATCTAGCTTTCAA
TTACTTTTATTTTCAATTTCAATTTTCAATCTACTTAGTCGAATACTTTT
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CTTTTCTCGTTATTTACACGGTAAGGTTTACTTAATTATTTTCATTATCA
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CTGTTGTGCATCTAGGTCTGATTCCTGATTGACTACTGTTGATATCTTTG
GAAAATGGAAGTTTTGATTTGTGGTTCACCAAGTGTTTTTTATCATTACT
TTTTAGACTAAGATTCTGCCAATCATATTAGTTTTGCCTTTACGATTTAC
TGTAGTTGTTCGTTGTTCGTTGTTTTTACTTAATATGTAATAGTCGTATG
CAATGCATAGCATAAAATGCTTGTTCCTATTCCTAACTCATCAAACTCTT
GATAAGTTTAGCATGTGTAAAAAAGTCTCAATCTGTAGTGAGACATTGTC
ACAATGGGCTCTTCCAGAAAATGTCCGTACATGGGGGGGGATAGAGGATA
TATTGTCCAGGGGTAATTTGGGTTGTCCGAAGGGTCAACCGATGCTTGTC
CGGGGGTTAAACCTGTTGTCCGGGGGGGGGGGGCAAAAAATCACTTTGTC
CGGGGGGTAAATCACTGATAATTGTTATATCCTCCACCCCTCATATTCAA
ATTTTTTCTGGAAAAGCCCAATGTCAATGCCTGTCGATTATCAAGATCAT
CTGTTCATCATGCCAAAATAGTAAAAAATATGTAGCCCAAATCAGACATC
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AGAATACCCTAAGAATATTGATTTTCCGCAAAAAGCTAAAAAAAAATCAT
AATGAATTGAAAGAACACCATTCTTATAAACAAACGTGTATTTTATGCCA
AAATATTAATTAACAAATATATTATCTTGAACTAATCTCTCCTATTCTTC
TTTTTATTTTTTCAGGCAAACTATAAGAGAGGGTCTTCGATTCTCAGAAA
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AGAGTGTGAGAACGAGTATCAAACAACGACGTCACCAAATCATCAACCGA
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CATATTAATGACGCACCGCCTGCGCTGAAATCGTCTCCTGGGTACAAGAA
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TTTTAGTTTTTACAATTTTTTCTTCTGATTTTCAATTTCTTCTGATAGAA
TTTTTCTTTCGTTTTTTTTTTTCTTTTAAAATTTTCTGCTCCAGGTTTTT
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TTCTTAATTTTTACAGTTGACTTGCCTGGTTTTTGATACATTCTTAAAAC
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CAAAAATTCTTTAAGAATTCATCTTTGAACCCTTAAATGAGGCCGTTGGA
AAATTAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_71 | supercontig | scaffold_71:426415..487821 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|