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transcript sequence >TCONS_00072172 ID=TCONS_00072172|Name=TCONS_00072172|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2777bp CAAAAAGTAATTATATCGCCAAAAGGAAATATCTGTTGCTTATAATGACT TTGCTTTGATTGATACTTGCCTTTTTCTGCGCAAACTCGTCATTAAGTTA TTTTTTGATAATCTGTAATACAACATCAAGACTTTAACCATTCAACCTTA ACCAAGCCACGAGAGAGTACTTACTTATCGAGTCAACTTacaaatttgat gatttttctaaCATTCTTTAAGCAGCATGTTCAAGgcaAACTATAAGAGA GGGTCTTCGATTCTCAGAAATGAGTCAACATTCAATGATTACTGAACAAG CAATCAACCCTTACCTTTCATCGCGTGGAACTTCAAATCATATGATTCAG TCTATGGCCCTTGGTAACCATCTGACTGACAATAATAATTCAAGCAATAA TAATTACTTCAGTGAAATACAAATGGATGACGGGAAATGGACCCGACATC AAACACAGATCTTAATTGACACCTGGAAAGAGCATAAAGATATCTTATTA AGTACTGGATCAAGCTCAGCTGAACATTTTCGTGTCTGGAAACTCATTGC GACTGAAGTTAACAAATTCGCACCACCCAAGAGTCTCCAGCAATGCAAGA AGAAGTTCCGTAATATACGATACATTTGTAAAATGGCCATGAATAATAAC AAACAAGAGGGCGGTAAGAAACATTATCCAATGTTTTATTCAGATTTCCT TGAAATCATTTCCGAGAGTGAGCGCATCAAAGAAGGTGTCAAAATAGAAT CACCCAATGTCGAGGTTTTGAACGATTCAAGCAAAGATGGCGACCTGTAC GGGACTGGATATCAGAATCCGTCACCACAAGACAGCCAATACGACGAACG ATCGTCATCCGAATTAAACACACGTCGCGAAGACGAACTAGACGAGCGAC GTACTCAGCAATCGGGTAACGTTAATAACAGTGAAGGTTCTGGAAGCTTT AACGGAAGTCCTCAATCCAGAGAGTGTGAGAACGAGTATCAAACAACGAC GTCACCAAATCATCAACCGACCGTATCCGAAACGAACGTCACAAACGAGC GAAGGGAAACCGCCACTGAAAGCCATCATCATTCCTTACAAAACGGGGAT CTCGAGAACGGCCATAGTAGAATCAACGAACGCTTATCAAATTATTACTC ACACCACGATTCTATGTATCCGCCCATTTATTCGACCAGCTCTNCGCACC ACCCAAGAGTCTCCAGCAATGCAAGAAGAAGTTTCGTAATATACGATACA TTTGTAAAATGGCCATGAATAATAACAAACAAGAGGGCGGTAAGAAACAT TATCCAATGTTTTATTCAGATTTCCTTGAAATCATTTCCGAGAGTGAGCG CATCAAAGAAGGTGTCAAAATAGAATCACCCAATGTCGAGGTTTTGAACG ATTCAAGCAAAGATGGCGACCTGTACGGGACTGGATATCAGAATCCGTCA CCACAAGACAGCCAATACGACGAACGATCGTCATCCGAATTAAACACACG TCGCGAAGACGAACTAGACGAGCGACGTACTCAGCAATCGGGCAACGTTA ATAACAGTGAAGGTTCTGGAAGCTTTAACGGAAGTCCTCAATCCAGAGAG TGTGAGAACGAGTATCAAACAACGACGTCACCAAATCATCAACCGACCGT ATCCGAAACGAACGTCACAAACGAGCGAAGGGAAGCCGTCACTGAGAGCC ATCATCATTCCTTACAAAACGGGGATCTCGAGAACGGCCATAGTAGAATC AACGAACGCTTATCAAATTATTACTCACACCACGATTCTATGTATCCGCC CATTTATTCGACCAGCTCTGAACATTACATGCGTaagcataaaaatattg acGTCAGTATAATGGGGCGTGGGTACCCCAGTGCAAAGCGTGTTAAACGC GCCATGGATATTTACTCATCACCTGCCCCTGCGCCCTACAAATACGCAAG CCGACACCATCATAGAGGATATCCGCCCACGATGGCCACAATCGCCAGTA ATTCTTACCCATATCACATTAACAACCACTATTCGACAACACCGCCGCTT ATTCGACCCGTATCTACACCAAAAGATACATCCCCGTCTCCCCGTAATAC TGTTTCTAGTACCAATAACGTAGCACCGAGTCTGTCCAATGATTCGTCTT ATATGAAAGCAGAGCATACGCATATTAATGACGCACCGCCTGCGCTGAAA TCGTCTCCTGGGTACAAGAATAGAGAGATGCACGCACCTAAAGACTTAAC ATTAAGTGAAACTTTGAACTTTTACAATCAACGATTCTTAGATATGCAAG AGAGACAAACTGAATTATTTAGTGAAATGATTTGTCGGCATGAACAATTT CTTTCCAGACTTTTAGAACAACAACGAACGGCTGCTGAAGATGCTCAAAA AAGAGACAAAGAATTCATGTTAAAATTGATAGAAATGTTCGTTAAGCAAT AGTTTCAAACGTTCTCAactttttagtttttacaattttttcttctgatt ttcaatttcttctgatagaatttttctttcgtttttttttttcttttaaa attttctgctCCAGGTTTTTGAGCAGATTTGTAAATATATTTATCTAAAT GCGATCTTTAAATTGGGTAATTCTTAATTTTTACAGTTGACTTGCCTGGT TTTTGATACATTCTTAAAACTGTCAGATCGTTGTGTACGACAGGGGTTTT ATTCAAATCTCCCTTGTCAACAAAAATTCTTTAAGAATTCATCTTTGAAC CCTTAAATGAGGCCGTTGGAAAATTAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_71:426415..475091- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00072172 ID=TCONS_00072172|Name=TCONS_00072172|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=48677bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_71:426415..475091- (Clytia hemisphaerica) CAAAAAGTAATTATATCGCCAAAAGGAAATATCTGTTGCTTATAATGACT
TTGCTTTGATTGATACTTGCCTTTTTCTGCGCAAACTCGTCATTAAGTTA
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CCTCTTTTGTTGTATTTGTTTTAAGTACGTAAAGTAAGGGCCTAAAACGT
CCTTTAGCGTTCATTTAACATTCTAAGAACGCCCACGTGCTTAAGTTTGA
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TGACAAGTAATATGTCTAAACTCATATAAGTGCCCTCTCTGAGGTCTGCA
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TGCGTTTCTCCAGTATTTTTTTGGTTTCTCTGTTCCTTCTATGACGTCAA
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ATCTTTTCCCTTTGTTTTTTTATTGTTTTCTTACTGTTAAAACAAAAAAC
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TTCTTTGTCATTATTCTCTCATTAAAATCAATCTTAATGGGTGCTCAAAG
AGGCTGTGTGCTGATGGTAGGACAGAAAATTAAGGCTAAGTTTGGGCTAT
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TAAAATTCGTTTTCCAAATAAAGTAGAACGTTTTTTATTGGGCCCAATAT
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CTGCATACTAACTAATGAACAATTATTATTATTAAGCTTTGTGACATGTG
ACGACATCACAGTCTGGTCAGCGGCAACTTAAGTCCAACATCTTCATCAA
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TTATGGTTATAGTAACTAATAACACGCATTTTTTATAAGAAACGTTTTAT
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AAGAACAATACTGATTTTGACAGATTTGGACACATAAACCCAAATTTTTA
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AGAACACCCAAGCTTGAGCCCAATCAACTGTTTCTTTAAAAAAAAAGTGT
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AGTCGTCCAAACAGTCTGGGCCGTCACGTTTTATAAGAGCATCAAAAAAA
CTCAAGCTTTCAGATGTTCTTAACTTTTTCAGTTTTTAAGGCTAAAAGTT
TTCTGTAAATGTTCTTAATTCCACCATTTTGTGAATAATTTTGTGCAATT
TCTTTAAGAAATTAGGTCTTTTAGAGTCCACAAAGCCTTAAAATGTTTTT
CTTGTTCTTAACATTTTGACCATCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTG
TTCTTATAAAAAAAGCGTGTATGGCTCCGTCCTTTCGGCGTTTTAAATGA
TGAATTTATTGTCGAACTCTGGTTTCCGTGCGAGCAGATGTGACACGTTT
GACGGGTGTGTTTCTTTTTTTTTCAGCTGAGAGGAAAGTTTCTAATTACT
GCAGGGTCCTGAAATCGCCATTTTAAAGAAAAAAAAATTAGTCAGATAAA
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TTTTTCATCGGCTTGGAATAAAGTTCCTGATGGCACGGTCCTGAAATCGC
TAATTTAAAGAGACAAAAAAATCTACCAAAAATATTTTTTTCATATTTAT
GAATTTTGAAAAAATATTATTTGAAATAGATTTTGGACATGAAAAAGGCA
AAAGTCAAAAGATGGGCTTTGTAAGCTTGATATTTAGATTTTAATACCTA
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GCGCTGAGTAAGTGCATCCATTAATTAACGAAAATATCAGGAAACGTGCT
TCTAAATATATCATAAAAAACTAATCAATAAACCCTTGTTTCAGCATTCA
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TCAACAGGAAAATTAAAATAAACGATAAGCCTCTCCAATTTACTACAAAA
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CAATATCGCTAATAAGTGAGTTAGCGTTTTTTATCATTGTCATTAATTTA
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ATTTACTTAAGTGAGTCAACATCCAAGTGATTAGAGTCTTATACTCCAAT
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ATCAATGTTAAAGAATTACTGGCAGGAAACGAGGATAATTATTTTGTCAA
GGAATCAAGCAGCTTGTTAATCACCTGCAATTTAGCACAGCCCTGGCGAG
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GATTGGATCTCAAAAGTCTTCTAAGCTGACTTGGTTGTATGTATATCGTT
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GATTAAATATTAGTCTACTTAAAATCCAGTTTTCAATATCTGAAATAAAT
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CCCAGACTCTTTTTTCCTCATTCATTCAATAATATTTGATACGTATTTTA
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CCGCCGCTCTTATTGTTGTAAAAGGTTAGAATTTTGATATTTTTTGTTTT
CTTTTACTGTCAATATCTTTTGCTTGAGCTAGCGTTCTTTCGAGTCATCA
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GCTTAAGACGGAATCCTTGATTATCTCTGGCTTGATCAAAATCCAAAAAT
CGTTTGAGTATTGTACTAGCTTGACTCTGGGAATCTGGCGATTTTTTAAT
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TGCATCTTTGTGTCTTTAAATCAATCTACCAAAGCTGAGTTACTGAACAG
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AATGAAAAAATCGAGTTTTCGAATCAAAACTTTTGTTACCGTTAACGATT
TCCTTTTCCTGTGGATAAGATTTTTAATCTTTACGGATAAAGACTTTGCG
GCTGCAGGCTAATTCCGGGACAAACTAAAAACATCCTCCAAAGTACAAAT
CAACGTCTGAGGCATCTTCCGATTACTAGTAATCGAAAAAGGCGCGACCT
TTTGACTTGGTTTTTAATTACCCTTCTAAAACTGATTTTTTTAATGAACT
CTCTCGTATCTCATTCATTTGGGTACACCGTCACCGCTTTGAGAGGCGGT
GGTTGTTTTGGTTTGGTGGTTTGTGAGGCGGATAAGCGATCAGGGTGTTT
TTGTTGGCACAGACAAACTCGATATAGTGTCCATATATTACGTTACATGA
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GTATTTTTCAAAAATCAAAATGTGGTAACTAAAAGTTTCATGCACTTGCG
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GAATAAAATCTGGAGGTTTGGTAACTAATAAAATGTCAGAGAGCTTTAAA
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GTAAAACTTGGTCTTTACTTTATATTACTTTTAACACCCCTGTCTCACAG
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GTTTTTAAATTTTCCTGCTTTGATTGGTCAGTCATTTGATGGCTATGCAA
GTTTCCCTTCACTGATGAAGTTACCCGATTTCACGGTATATGATATATGA
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CGTGATGTTTCACCATTTTAATTTTAAACTCAGCTGACCCATATAAACCG
GAAGAACTTTTTAATCTGATCAGCACTAGTCTTGTCTTGACTTCAACACT
ATTTTCATGGCAATTTTATTTGCTTAATATTGCTTAAGCTTACTTTGGCA
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GATACACTTTTTCTTTTTCATAAGAATAATTTTATAAATTGCCAAAAAAT
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AATCAAGTGTAAGCTATAATAACTGAAATAACTAAATCGGAAGACACTTG
GCTCTTTAGGAAACTTCACATATGGACTTTAGAAAATCCCGAATAATAGA
GCACTCATCATGCTTGACGCCAAATTAATTACTATTACCAATTTCAACTT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_71 | supercontig | scaffold_71:426415..475091 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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