TCONS_00072107 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00072107
Unique Name	TCONS_00072107
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2634

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_71:193904..205590+

transcript sequence

>TCONS_00072107 ID=TCONS_00072107|Name=TCONS_00072107|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2634bp
CAaacattcaaaatggtagcttcaAGCACATGTTgaacaaaattctaaaa
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GTGGAGTAcccttttcaaatgtttttgaaCACTTGCTGGATACTGGTTCC
TCAATAACAAAGGTATTTTCGGTTGCTTTCCCGG

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_71:193904..205590+

Legend: exon

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>TCONS_00072107 ID=TCONS_00072107|Name=TCONS_00072107|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11687bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_71:193904..205590+ (Clytia hemisphaerica)
CAaacattcaaaatggtagcttcaAGCACATGTTgaacaaaattctaaaa
atcattTTAGACAACGAGAAAGAAGAGTTTAagagaaaaaacaacataaa
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TCTGTTTTTGCGACTTGATTGTTCTTTTGTCTCTAGAACTTTTGACATCA
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CAGATTGGATTTCCCATTGTcttttatcgattactcaaatTATTTAACTA
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GAAAATTGGTTCAAATTATTCAATGTTCTTTATGATAAGCGCCCAAGTAT
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GAGTTCCGATGTTTACGCTTCTTTTAATAAGAATCCGTAAAaatttaatt
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GTTAGTATTTTATTAAAATCTGTGGCTCAGATTGATCTGTAAAGTTTGGC
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TTTTTCGTTCAACAGAAGGGGTTTAGAGAAATTATTTCTAATAgtttctt
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GACTCAGATGTTTCAAGATGCAGAGACTGCGTGTCATTCCAGTTGTGGAG
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ATTGATTTATTTCCATTAAAAGCAGGGTCATAATGTAAGAATGTTGTATT
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ATAtgaaatacacatttttaaaagaaactcCAATTGTTGAAGATCAGGGC
TGTTGCTAAGGATTTTCTggatttcagccaaaaagttGCTTAtggatttt
gagaaaaattgttTGACTTTTTATCTCATTTAATATCCAGAATACCTCAA
ATGCCTCTTTTCCAGGTATTTTCGGTTGCTTTCCCGG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_044784	XLOC_044784	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_71	supercontig	scaffold_71:193904..205590 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.72144	5.80633	3.31294	2.60748	14.1124	7.93149	7.97417	10.1528	3.34505	3.88443	5.99726	2.64369	7.92081	4.9693	3.94456	5.04895	5.21485	4.77237	0	2.18545	8.92557	8.07198	7.68048	9.56884	8.7902	12.8397	1.70094	1.45224	7.82678	8.81801

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00072107 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00072107 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00072107 (transcript) - C. hemisphaerica