TCONS_00071994 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00071994
Unique Name	TCONS_00071994
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	10151

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_66:105992..122041-

transcript sequence

>TCONS_00071994 ID=TCONS_00071994|Name=TCONS_00071994|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10151bp
TTTTgttgttcgattaagttcgacaaagttcgattagtttggtaattgaa
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GTACGGAAATTCTAAAAACCACAAAATTGTATCCACTGGGACTGATGTGC
AAAGGACGCCAGACTGATTGATTACATCCATTTTTGGCATTGTCTGGAGG
AAATAAGTTTTCTTATTCGACATCGCACATTTTGAATCTGGTTCTTTTAA
TATATTAGTCCAGTTGGTTGGCTGAGTTCAGTGTTGTACTTTCACTGTTA
GTGAGccctttataattttttatgttttcaatcaaaactGATCAAAATGA
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ATAACTCATGAAAGCCGCAATTCATATTTACAAACATTGAAAGCTCCACA
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agcaggaaaaattattttttctggctggccgcattccggaaacactacat
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aaatattttgcacttAGCAAAATAAAAGCAAATATTTGAAATAGTCCTAA
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GATTTCTAAAAACTAAATTCAAACTTTATTGGGGCATACCTGGTATAACA
TGTTGGTATGACATCAGTTTGTTAAAAATGATAGAAATAATAACCTATAC
AGGTCCATGATATTCTTCATCACACAACTGTATATCCTTCTGTTCAAAGT
TCCAGATGAAAAATCAGCTTTTGATATTTGCTTCTCTTTTGCCAATTGTT
TATTGCTTGCAATGTGAAGAACTATTGCCTGGACAGTACTTCTGTGAAGA
GCCTACCATTGACCCTGATACACAGGCTGAAGCAGGATGTCAGCCAAATA
AGACAGTGAAAGTTCCATGTCATATTGCTCAAGGCATCCAATGTGATGGA
GACATAATTAAAGGAAATGAGACTGGATTTTATCGTGAAGTACCTTGCCG
TTATGTAAATGGGAAATCGTTTGCGACAGCATTATTGCTGTCCATATTTC
TAGGTGTGTTCGGGATTGATCGTTTCTATCTTGGTTATCCTGCTATTGGA
TTGttcaaattttgcacactgggatttttcatgatatttcaaTTTATTGA
TGTTGTTTTGATTGCAACTCAGATTCTTAAACCAGCTGATGGCTCTGATT
ATTACATGGACTATTTTGGACATCGTTTGATCCCAATTAAGTATGATAAT
AATACATATTGGCTACCCCCTTGAGTCTCAAGCTATGTTTGGAAAGCAAC
TGATCTGAAGAGCCAAGAGGAATAACACCATCAAACTCTGAAAAAAGGCT
GGAATGAGTGTTTTTGTCAAGgcagaattttttcaattcttatAAACATT
TTAGGGGACAATAAATTTCTTCCAGTCATAGGCTGTCACATACCAGCTTC
AAGCGTTCAGTGGTGACCATTCCTCTATTTAGAAAATGTTAGGTAACTTT
GGAAGAAATCCTTAAGAGTTCATTCATAATCATTTTAATGCAGACAACTA
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GAATTCCCTGGCTAATGGGAAAGCTTTGTTTGTtaaagcatttttcaaaa
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CTCTGTAAGCTTGCAATGTATGATATGTATGTAATGaagtattttaaaaa
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GGTCATGTGTCTCTGATGTCCAGTCAATCTCATTGGAAATTATGACATTG
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AACGGGCGTGGCACAAGTCAAAGTGATAAAAGAAGACGAGCTACTTAAGA
CAGCTTGTGAACAGTTCTTGGGAAAGAACCCTGAAGAGATCGAGGGAATC
CTCTTGCAAACTCTGGAAGGTCATCTTCGTGCCATTTTGGGTACTCTTAC
AGTAGAAGAAATCTACAAAGATCGTGACACTTTTGCTGGTTTAGTCAGAG
AAGTTGCTTCGCCAGATGTTGGCCGTATGGGTATCGAAATTCTTTCGTTC
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GACGCAAACAGCTGTGGTCAGACGTGAAGCTGATATTGGTGTCGCAGAAG
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GATTCACGTTTCAAAGCTGACACACAAATTGCCAACTCTTCAAGAGCATA
CCAAATGGAGAAAGCCGCTTTCGACCAAGAGGTCAACACCAAAACAGCCG
AAGCTGAATTAGCATACGAGCTCCAAGCTGCTAAAGAGAAGAAGGGTATT
CGTAACGAGGAAATTGAAATCGAGGTTATCGAAAGACGAAAAATGATTGA
AGTACAAGAGAAGGATATTGAACATCGTGAAAAAGAATTGCAAGCCACCG
TTCGTCTCCCAGCCGAAGCTGACGCGCACAAAGTACAAGTTCTCGCTGAG
GCTGCTAAGACAAAGAAAGTCTTGGCTGCTCAAGCTGACGCCGAGAAAAT
CAGAATGATTGGTGCTGCAGAAGCCGCAGCAATCGAGGCCATTGGTAAAG
CAGAAGCTGAACGAATGAGACAAAAAGCTGCTGCCTACAAACAATACGGA
GACGCTGCCTTGATGTCCCTTATCTTGGAAGCCATGCCTAAGATCGCAGC
TGAGGTTGCGGCTCCATTAGAAAAGACGCAAGAGATTGTGATCATTAGTG
ACGACAAGAACGGTAGCAATGTCTCTTCAGAAGTCACCAAATTGTTGGGC
TCTTTACCTCCGCAAATCCAAGCACTCACTGGTGTCGATCTTTCTAAGgc
tATCGGACAAATCCCTGGGGCAAAAGTTGCATCATAATTCATGATGAAAT
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ATAGTCTGAACTCTTTGCCCAGTTGCATGTTATATAGTAACCGAATCAAG
TCACGAATGTGCTATCTTGTGTACAAAAAAAAGACTTGATTAACCACCGA
ACTCTAAACTGAAGTCTACCGTATCTTAAGACTATTGCCACCTAGTCTTC
TCGTAGTAGAGCTGTTGATTCtagtttttattttagatttcgGTGCTTCT
TCCAATTGACTTCACATGCACCTATAAGCACACTCAAAGGACGACTAATA
AACATAATATTTGTCCATTGGCAATGTATCTATAATAAATGGACTGGTTG
TAAACTTCTGGTTATGAAGACTTGTCTTAAAAGGACTAGGTCTAAAACTC
TTCTTCATGTGTATTTTAGGGataattattttatttgttttcgaATTTGA
ttagtttatttgtttttttcttcggTTAGATTTTGTTTCGTCCATAGCTT
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cttttcaaattccCGATGACCAGTGAAACTCAGGGGATTGATtcgatttt
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ATTTACAAAATCATCCCTTTCGGCGCCAAGGGAAATCAGCTATATATTTT
GTTCCAAAATTCGGGAGACATTATTTCTTGATTTCTGTCTTAACCCTGTC
TTTAAAGAAGTAGCATTCTTACATAATTTTATTTAATCATTTATATACAA
CCGGCCCCTGAAAGCAATTTTTGTTTTAGGCCCTAGGCTTTTTTTTCCTT
AGGGGGAAATTGTATTTATTTGTCCCATTTTCCGTAATTGAAGGCACGTA
CTATGAAATCGAGGCTTGGTAATTTTTTACTTGTAAGTCCTTCAAACTAA
T

transcript from alignment at scaffold_66:105992..122041-

Legend: exon

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>TCONS_00071994 ID=TCONS_00071994|Name=TCONS_00071994|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16050bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_66:105992..122041- (Clytia hemisphaerica)
TTTTGTTGTTCGATTAAGTTCGACAAAGTTCGATTAGTTTGGTAATTGAA
CTGTTCGATTAATTACACGTCTGGGATATAGGAGTTTTACAGTAAAAGCT
TAGATTGCCATGCCAAGGGTTTAAATAAGGAGTTGAGCAAAATTTCCCTA
GCACTTATAAAAATTGACTAGATTTCCCTTCCAAGTGCTTTTTTTATCAG
AAAATTCCTGTCACCAACCCCCTAGCTAGCAGCTAGGCTAGGTATATCCC
ATCCATACTGTATGGAATTTTTTCTCGCTAGATTGATTGTACTCAAGTAT
ATACTCTCTTGGACAAGAGATGATGGCAGAAGTCAAATACTAAAGGCTGT
TAAAAATGATATGGTTACCTAACAAACCACACTACATTCTAAAAACGTGC
TGGCCATTTTACATACCATTGTTTGATTGTGTTGATTACACTTTTTTTCA
AAAATGTCGGCCATGAAAAGACACAAAAGCTGAGAGCCGAAGTTAGCAGT
GCTAAATGGTCAGGTGTACTTTTGAGCCCGTCGTCAAGTTTCGGCATTTT
TATCTTAATGAGTGAAGCCACGTACAACTGCTTCGCAAGCATTTTTAGTA
GGTCCTACTCAAACCAGCAGTCACACTAAAATTGAATTCTAGTGCTATAG
TGTGGTTGCTGCGCTAGGAATAGCGCGATAAGTCAACTTCGGCAAAGCAA
AGGGGAGGAAATCAACAGACAGGACTGTTTTGCTTTGGTATGGAAAAGCC
TTACTAACTTTACTATGTAACTTAGAGACTTAACATTTACAAATGTAAGA
ACAGTGTATGTTATATAACTTAATGTTGCTACAAGATATTTTTTTATTTA
GCTTCTCAAACTTCCATGCTGTAAGAGAGTCCTTGTAAATTTGGAACCAC
TATTGCTGCTTGCCAACCAAAAGAACTTTTTGTATCTAATTATGGTGACC
ATGGTAAATGATGAAAGCCATAATCGTAGTTACAAAGTGTGATGGAGTTC
TAAATGTAGATTAGAGGAATAATCAATGCTTACAAGTTGATTTTATATAT
GTTATAAAATTTTATAATTGCACCCTGCTTTTGTTCTGTCGTGTTCTGTG
TTGTTTCAATTGCATAAAGTTAAAGGGATAATCAGATGGTTACCAAGATT
GATATACTTCACTATTGAACCTATAGGGAATAACAGACTTCATTTTTCCT
TACTCAAAACTTTAATAGTTTTTCTTAAACTCTAATTCAAATTTTTCTTG
GTTTTTATAAAAGATCTCAAAAAGCAGTGTTCGCCATGTTTTTTTAAGGC
GGTCATCGAAAAATTGTTCTATTCGCGTCACTCGCCCACATCAAATTTTC
CGCTGATTTTCCAGTGCGGATGGAGATGCGGAAAAAAACCTGGGAAAAGC
AATTTGTTCTTTTAAAGTATAGCTTTTTTCTCAATTGCTCTGACGTGACG
ACCATCGAAAAATTGTTTTGCTCGCGTTACCACCCGCCCCTGAGTTACTG
GCGTGATTAAAAAAAACCCGGGAATGTTTTTGACCGCCCGTCCGCCCGCT
TGCATTTTTAACACCCGTTGCGAACGCGAACAGAGCATTTTTTCGATGAC
CGCCTAAGGACCTCACGCGCTTTTTAGTTTGTTATTGTAATCCAAGTTGG
CTCAACCTATCTATAAATTTCAGCTGATAAAAAGGGTGTCGGAATTAGAG
GAGGGGTGTCGACATTAGACCAAGTTACGGTAGCTGTGATGATTCCTATT
TTGAGTCAAGAATGCTCAATATACCGGGTGCACCAAAAAAAAGTATACAA
CTTTGTCGAGATATTGTGAGCTTCAGGATTTTATTTTTTTGTTCATTCTT
TTTTTATTGTATAGAGGATGGTCTAACTTAAATTTTGAGCTATCATACAT
TAATTTGAAAAAGTAGTTCGCAAGTTATTTCCAAAAAACTGACTTTTTTT
CCATGTCGAAATTTCAAAAAATCATTAAAAACAGCGAGCAAACTTTTCTC
TTGACACTTACCTCTTTACACATAAAAATACCAAAAAGATGTGTTCATCA
AAACTTACGGAATTTAATAGTATGGTAAAACAAGCTATTCCCTACGTGGG
ATAATATTTTTTAAAGGCTAAAAATTTTGTTTGGAAATCTCCAAGAGAGG
TTTTGATGCTATATGTGTGTGCTATGTGAGAAAACCATTTCTAGACTAGT
TGCTCAAAGAACTTTGGTCTGCATTGAGTTTGCTGGTGTTGGAAATGTTC
ATGACGTGCAAATAAGATGGAGAAACTGTTGGCAAAATATAAGATAAGAG
AAAAAGGAATAAAAAAACAATGAAGTTGTGTTTTTGTCATTTTTGTCTTA
TTTTATAGCGTGATTGCTGTTTTTAATGATTTTTTGAAATTTCGACATGG
AAAAAAGTCAGTTTTTTGGAAATAACTTTCGAACTACTTTTTCAAACTTA
ATGTATGATAGCTCAAAATTTAAGTTAGAGCATCCTCTATATAATAAAAA
AAGAATGAACAAAAAATTTAAATCCTGAAGCTCACAATATCTCGACAAAG
TTGTTTACATTTTTTTTGGTGCACCCGGTACATCATCGATTATCTTTGAG
AAAATTCTACAAGACCCCCTTAATGTCACCTTCGACAAGTCCGACAGACT
TCTCAGGAACTTAAAAAAAACAGTGGGACCTCTCTCGGACCTTTCACATT
TGAAAGAGCTCAGAATTTGAAATTTTAAAGTGGAATATTATATGTTGGAA
CAGACTTGTCAGTTGGCAAATCTACTTTGGAAGTCACGTTTTCTCATGTA
TAAGAGCATGTACCCTTAAAATCTCAGACCATCTGATTATCCCTTTAAGA
CTCCCATTTCAGCACTAAGATTCCTACTCCACTTTTCTACCAGAAAAAGA
CAAGAACTCCGGGTATATAGGCAGTTTGGTAAGTAGCACAAGATTTCCAG
CTAAATGCTAAAACCACCATTTTTGCTTAATTTGGGGGGGAGGTGAGACA
GTGTAGAACCTGTCTTTGTATTTAAATCTTATTGCTATTTGATAAGTCAG
AGCAGTGAGTCCTTTTTCATCACTAAAAAACAAATTAGCCTATTCATTTG
CTGGGCTCAACTGGACTCACTTGCTGAAGAAAAAGGTTTTATATTTCATA
AATTTTATTCTGAAAGTGAGTGTGCGTGACAAAGAGAAGTGTCTTTGATT
GGCAGATTTCATCAACAGTTTTTTTTAGTGGGAATTTCAAGCAAAATTGG
GGGAACTGTTGAGTAATAGAACTGGTGGAACTGGGTGGAAGAGTAGCTGA
TCTTAAAAATTTTTGAATTATGATAAAAATCATTATGAAATTGTTGGGAG
CTATTTTCCTTAGCACCCCCTGGAAAATGCTAGGGCCTGGACCCCTCTAT
ATATCCTTATACCTTTAGAAGAAAACTCTTTCCAATCTCATGCCAGCTAT
TCTGGAAAAAATAGTGGAAAATCCCAGAAGAGTTACAAGAATGTTAGTGC
CAGAATGGGAATTTTATGCAAAACAACAGTTTGCTTTAATGGTGAATGGG
CCATTCCAGAATTTGTCTGTAACAGGGGGGCGGACGACACAGGATTTCAG
AGGGCAAAATTTTTCACCAAAATTTGAAATTTCCAAGGTGAGAGAAGAAA
ATGTATGAATTAAAAAAGGCAAAAAAGAGTGGAATTTCCGATGCATTTTG
CAAAGGTACATAGATTTTTATCGGAATTTCCGACCACCACTGGAAAAGAA
AAATTGTTTCCAAGGCTAGAAAAAATTAAAAAATGCACTTCGTCCTGACA
GGGGATAACAAAAATTTTCTTTGGGCCAGGTTTTTATAAGGCAAAAGTCC
AAAGAATTTTGGCCTGGACATCAATGCTCAGGTCAAGAGATCGTTTTGCA
ATTTTGGCCTGAACAAATCAAGCCATACTTGGTCTAATGTCCCTCATCTT
TTTAGAGCTGATGAAGTGAAAATATCAGACAGAAAGGTCAAAACTATTTT
TCTTTGCTCAGAGAGAAAAAATCATTTTCCAATCAGTGATTCCAAGTATC
ATATATTATTCTTATCTTTAGAGACAAGGTACTTCAGGAGGTTTAAATAC
TGTATAAAAAAAGTAGCAACATTTACCACCTGGTTGTGCAACTTCATCGA
TGTTTACAGTAACTTAGTCTAATGTTAGCATCGCCATCTAATTTTGTCTG
TTAAACTTGGCAGACTGTCCGGTGTTTTTGTCTGGTGCCAAAATGTATCA
TAGATCATGCCAGAAACAACTGTCATTTGATAGGCCAGTTTTACATTACA
GTACGGAAATTCTAAAAACCACAAAATTGTATCCACTGGGACTGATGTGC
AAAGGACGCCAGACTGATTGATTACATCCATTTTTGGCATTGTCTGGAGG
AAATAAGTTTTCTTATTCGACATCGCACATTTTGAATCTGGTTCTTTTAA
TATATTAGTCCAGTTGGTTGGCTGAGTTCAGTGTTGTACTTTCACTGTTA
GTGAGCCCTTTATAATTTTTTATGTTTTCAATCAAAACTGATCAAAATGA
CATTCGTCAATTGCCGGTGGAAATGATGCCAAGTCTATGCTGAATTGTTA
TTTGTTTAAACTGAGGTCTACGCCAAAAAAAGTTCTGGTTGTGGACCAGC
ACAAATTGCAGGAGGGTTATGGGTCCAGAGGGCAAAGTCTCTGTAAGCCC
TGGGATATTTTGATCTTCTCACACGCTAAAAATTTGCTATATTTTTTAGT
TTTATGATTTAAAAGGCTAGAAAATAGCTTTTATTGCTGGCACTTCTGAG
GGGGGTGCGCTCAAACCTGGCGTAATGAAATCAGGTGTTAATGTGGTAGT
GCTCTCTCGTCTTGAAAAGCTTTGACTTGCGCTAATACCTTTTTTTATAT
TCAAATTTGTTGTGCAGTAGAGGTCATGATCTCCCATCTCTTTATTCTCA
AGGAGAGCAAGTTGGGGTAAAGTTAAATAAAAGTGGTGCCAAGATTTATT
ATAACTCATGAAAGCCGCAATTCATATTTACAAACATTGAAAGCTCCACA
ACTTGTCATAAATTGCAATTGCAGTTGACAGTAAAATTCTTTGATCTTTG
ACTCTTTTCTATTGTTTTTGGCAATTTTTTTATCAAACTTATAATGAGCT
CGAAAGATCGCTAAGTACTAACATGATTTCAGGCCACTTCTCAGGTACCC
TCAACACAGCATGGTGCCCTAATGATTGAGGTCCCCTTAAAAATTTGTCA
GATACCTCAAATTGCCTGAAAATCTGCTTTAGGTTGGTAAGGGTAATGCT
TTAGGCCCTGATTAACCAAGAATCTTTTCATATTGCCACTTTTTGTACAG
CCCAGTGTTCCTATCAGATTAGCAAGATAGCTACCCCAAACAGTGTTTTG
TTTTATTTTTGTCCTCTCTAGACTGTTAATTTAAAAGATCTTATTAAAAA
TCTGGAATGAAATACCATATTTTGACTAGACATACCTAACACTATGAATT
GATATTGGTATGATATGGCTGGCAAGAAAATTTTCAACGATCGCCACTAT
TTCTTGCCCCATTAATTAAAAACCTATGCTACTAAGTACCAAAGGGCCAA
TTTTTAATGAAATTTCAAACTCTTTTTAAGCAAAAACCAGTTAGAGGATC
AGCAAGCTCTCTAAAATCTTTACAGAAGACTTTTAAAGCAAATAATAGCT
GATTTCTATACTGAACAGGAGTTATAATTGTGGCAAAAGTGTTGATTTTC
TACTCAGTTGGGAAAATTTGTTTATAAGTCGACACAATTTTTATGAAATT
TGGTACCAATCAGGCTTACTATGTGTAGGATTCATTTCGATATCAGGCAA
AAATTAAAAAATGTAGTGTAGTGCTTCCTGAAACCTGGCCGGGTAAAAAA
TAAATTTTCTCTGACCTGGCCGCAGACTATTATAGATTCATCTTTAAGAA
AATGGAGTCCTTTGGTTAGATATTCCCGCTTGTAAACCAAGTTTAGTTTG
TTAGTAGTTGATACATTAGTATTCAGAGGTTACTTCATACCTGTTTGTAC
ATAAAAGTTATCTTTAAATTCTATGTCAATGATTTTAAGTTATCAAAAAT
AGCAGGAAAAATTATTTTTTCTGGCTGGCCGCATTCCGGAAACACTACAT
TTTTATTTTTTAATTTATTTTCGCCTTATTTAGAAATATTAGAAATATCT
GCAAGTGCATTTTTCCTGAATACACTGCACTGGGAAGGGAAATATTTTCC
TCCAAAAAGCACTTTCATCTGCTTGGATATTGGCTTCTATGACAAATTCA
AAATATTTTGCACTTAGCAAAATAAAAGCAAATATTTGAAATAGTCCTAA
AGGTATAAAAATCCACCAAAATTCATCTGTATTTAATCATTATTATAATT
GATTTCTAAAAACTAAATTCAAACTTTATTGGGGCATACCTGGTATAACA
TGTTGGTATGACATCAGTTTGTTAAAAATGATAGAAATAATAACCTATAC
AGGTCCATGATATTCTTCATCACACAACTGTATATCCTTCTGTTCAAAGT
TCCAGATGAAAAATCAGCTTTTGATATTTGCTTCTCTTTTGCCAATTGTT
TATTGCTTGCAATGTGAAGAACTATTGCCTGGACAGTACTTCTGTGAAGA
GCCTACCATTGACCCTGATACACAGGCTGAAGCAGGATGTCAGCCAAATA
AGACAGTGAAAGTTCCATGTCATATTGCTCAAGGCATCCAATGTGATGGA
GACATAATTAAAGGAAATGAGACTGGATTTTATCGTGAAGTACCTTGCCG
TTATGTAAATGGGAAATCGTTTGCGACAGCATTATTGCTGTCCATATTTC
TAGGTGTGTTCGGGATTGATCGTTTCTATCTTGGTTATCCTGCTATTGGA
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AATACATATTGGCTACCCCCTTGAGTCTCAAGCTATGTTTGGAAAGCAAC
TGATCTGAAGAGCCAAGAGGAATAACACCATCAAACTCTGAAAAAAGGCT
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TTAGGGGACAATAAATTTCTTCCAGTCATAGGCTGTCACATACCAGCTTC
AAGCGTTCAGTGGTGACCATTCCTCTATTTAGAAAATGTTAGGTAACTTT
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GAATTCCCTGGCTAATGGGAAAGCTTTGTTTGTTAAAGCATTTTTCAAAA
ATCAATTTATGAGCAGAGAGAAAAAAAGAAATTTTTAAGTTACATGTTTT
TTGTCATGCAATCTTTGTAATTTGTCATATCAGCATTTATTATTGCAATG
AGAAAAGACTTTGCATACTACAATTTTTTTATGAATAGGCACTTATTTCA
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TGTTTAAGCAGAAGCAAGTNTCAAGTTTTTAATCCTATTTAATGAATTTT
TGTTAGACAAGATTCTCTCTCTGTAAGCTTGCAATGTATGATATGTATGT
AATGAAGTATTTTTTAAATGTTTAAGCAGAAGCAAGTTATCAATGATTAA
CTTTTGTTTCTTCTATAGATCTAGTAAAAACTAACTATAAAAATATGGGT
AATATCTACACAGTTGGACCCAATGAGGCTTTGGTTGTTTCTGGTAAGTA
GTGCTGTATTTTTTATCGTAACTTTTTCAAAACACATTAATGTTGTTTGA
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AGAACCATTGTTGGAGGATGGGCATGGGCTTGGTCATGTGTCTCTGATGT
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CAAACAGCTGTGGTCAGACGTGAAGCTGATATTGGTGTCGCAGAAGCTAA
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TTTATGACGATGCTTTCAGCAACGGGTTTAGCGACCAGGCGGGACCTATC
ACAGTTTTCTGTGCCTGTATTTTGATTACCTTAGAAATCTCGAGAAAGCA
ATTATTTTACGCGTAATGATATTTTCGAAATTCACGTCAAACAACAAAAA
GTTCTTCAAAGATAAAAAGTCAAACATTTTTCCTGTAAAAGCTTTAATGT
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GAATACATCACCTCTCTTTTCTTTGGGGATTTCCTTTATATTAAGTCAGT
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TCTCGTCATGTTATCATCACTCATATTCTAATAAAGTTCGGACAATCCCT
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TAACCATAATTACTTTCCAATTCACAAACGTAATATTAGAACAATAAATC
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TACATCACTTGACCTCGTTTTAATGTTCATCATCTTATAATACAGGCTGC
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AAATCACTTGAACGGCTTGAATTTTTCGGAAATTGTTAAGGGTGGAACTC
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CTCGAGTATGATTTTCTACTCTTGGAATGTGGCTTTTTCTATGGTTTATT
ATTAATTGATTGATTAATTGATTTTAATCCATTTTCAGGACAAAGAAAGT
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GATTTAGAAAAAAACCTTGTATACCATAGAACGAATTAGNGGTAAGTTAT
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ACACCTATCTTTTGTCTTGATTATTCAGATGATTGGTGCTGCAGAAGCCG
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CTATATTTTCTGAACTTTCGTTGACCCCTGTTGGTACTTTTCTATCATGA
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TTCCAAAATTCGGGAGACATTATTTCTTGATTTCTGTCTTAACCCTGTCT
TTAAAGAAGTAGCATTCTTACATAATTTTATTTAATCATTTATATACAAC
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_044696	XLOC_044696	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
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Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00071994 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: FLOT2 (Flotillin-2 OS=Homo sapiens GN=FLOT2 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 455.292 bits (1170), Expect = 4.013e-142
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Query: 7895 MGNIYTVGPNEALVVSGGCFGQRAKRTIVGGWAWAWSCVSDVQSISLEIMTLNPKCESXXXXXXXXXXXXXXXXXXXIKEDELLKTACEQFLGKNPEEIEGILLQTLEGHLRAILGTLTVEEIYKDRDTFAGLVREVASPDVGRMGIEILSFTIKDIEDKVNYLDSLGKTQTAVVRREADIGVAEANRDAGIKEAECDREKQDSRFKADTQIANSSRAYQMEKAAFDQEVNTKTXXXXXXXXXXXXXXXXGXXXXXXXXXXXXXXXXXXVQEKDIEHREKELQATVRLPAEADAHKVQVLAEAAKTKKVLAAQADAEKIRMXXXXXXXXXXXXXXXXXXRMRQKAAAYKQYGDAALMSLILEAMPKIAAEVAAPLEKTQEIVIISDDKNGSNVSSEVTKLLGSLPPQIQALTGVDLSK 9148
            MGN +TVGPNEALVVSGGC G   K+ + GGWAWAW C+SD Q ISLEIMTL P+CE VETA+GVA+TVTGVAQVK++ E ELL  ACEQFLGKN ++I+ ++LQTLEGHLR+ILGTLTVE+IY+DRD FA LVREVA+PDVGRMGIEILSFTIKD+ DKV+YL SLGKTQTAVV+R+ADIGVAEA RDAGI+EAEC +E  D +F ADT+IA+S RA++++K+AF +EVN KTAEA+LAYELQ A+E++ IR EEIEIEV++R+K I V+ ++I   +KEL ATVR PAEA+AH++Q +AE  K K+VL AQA+AEKIR IG AEAA IEA+GKAEAERM+ KA AY++YGDAA M+L+LEA+P+IAA++AAPL K  EIV++S D   S V+SEV +LL  LP  + ALTGVDLSK
Sbjct:    1 MGNCHTVGPNEALVVSGGCCGSDYKQYVFGGWAWAWWCISDTQRISLEIMTLQPRCEDVETAEGVALTVTGVAQVKIMTEKELLAVACEQFLGKNVQDIKNVVLQTLEGHLRSILGTLTVEQIYQDRDQFAKLVREVAAPDVGRMGIEILSFTIKDVYDKVDYLSSLGKTQTAVVQRDADIGVAEAERDAGIREAECKKEMLDVKFMADTKIADSKRAFELQKSAFSEEVNIKTAEAQLAYELQGAREQQKIRQEEIEIEVVQRKKQIAVEAQEILRTDKELIATVRRPAEAEAHRIQQIAEGEKVKQVLLAQAEAEKIRKIGEAEAAVIEAMGKAEAERMKLKAEAYQKYGDAAKMALVLEALPQIAAKIAAPLTKVDEIVVLSGD--NSKVTSEVNRLLAELPASVHALTGVDLSK 416

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00071994 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00071994 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
FLOT2	4.013e-142	68.42	Flotillin-2 OS=Homo sapiens GN=FLOT2 PE=1 SV=2	[more]

You are here

TCONS_00071994 (transcript) - C. hemisphaerica