TCONS_00070880 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00070880
Unique NameTCONS_00070880
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length4551

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00070880 ID=TCONS_00070880|Name=TCONS_00070880|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4551bp
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AACCATACAAAGGAACATTGAAAATGATATGTGTAGCATTGATGAAAGGT
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TTTCAAATCAGCTTTGTTAAGAACAACTCTCATGTTATCGGTGGAGCAAG
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GCAATGGTCACGCTAATTCGGTCAGTCGTTTGTTTTGGAGAAAGTGAAGA
GGATCTTTGGATGAGTGCACCTTCAGTTGTTGTTCCTGCTACAGCAGTTG
TTGGTCCTTTACCGTCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCT
GGAGTAGTCTCAGATGAAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGG
TCCTTTACCATCAGTACTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTGCTCCTGGAG
TTGTCTCTGATGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCT
TTACCGTCAGTGCTGACAAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGT
CTCAGATGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTGGATGGTCCTTTAC
CTTCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTAGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCA
GATGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCCACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTC
AGTACTGACAAGTGGTCCTTGAGTAATTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATG
GAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTG
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GCAGTGGATGGTCGTTTACCTTCAGTACTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGT
TTCTCCGGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGTTGTTCCTGCTACAGCAG
TGGATGGTCGTTTACCGTCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCT
CCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGTTGTTCCTGCTACAGCAGTTGA
TGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTACTG
GAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTG
CTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGC
TTCAGTTGTTCCTGCTACAGCAGTGGATGGTCCTTTACCATCAGTGCTGA
CAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTACTGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACA
GCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGT
TTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGTTGTTCCTGCTACAGCAG
TGGATGGTCCTTTACCATCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCT
ACTGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTC
AGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATG
GAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTA
CTGGCAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTAGAGTAGTTTCAGATGGAGC
TTCAGTTGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGA
CAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTTTCAGATGGAGCTTCA
GTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTACTGGCAAG
TGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTAGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGTTG
TTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGACAAGTGGT
CCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTTTCAGATGGAGCTTCAGTTGTTCC
TGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGACAAGTGGTCCTT
GAGTGGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCT
ACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCGTCAGTGCTGACAAATGGTCCTTGAGT
TGTTTTTCCTGGAGTAGTTCCAGATGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAG
CAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTT
TCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCCTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGT
TGATGGTCCTTTACCGTCAGTGCTGACAAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTC
CTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCCTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGAT
GGTCCTTTACCGTCAGTGCTGACAAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGG
AGTAGTCTCAGATGGAGCCTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTC
CTTTACCGTCAGTGCTGACAAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTA
GTCTCAGATGGAGCCTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTT
ACCGTCAGTGCTGACAAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTTT
CAGATGGAGCTTCAGTTGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCT
TCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCCGGAGTAGTCTCAGA
TGGAGCCTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCGTCAG
TGCTGACAAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGA
GCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTGGATGGTCGTTTACCTTCAGTGCT
GACAAGTGGTCCTTGAGTTTTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTT
CAGTTGTTCCTGCTACAGCAGTGGATGGTCCTTTACCATCAGTACTGACA
AGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCGGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGT
AGTTCCTGCTACAGCAGTGGATGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGACAAGTG
GTCGTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTTAGTAGTT
CCTGCTTCATCAGTGGATGGTCCTTTACTATCAGTGCTGACAAGTTCGAT
TGTTTTGGTTGAAGGAAGAGTTGTTTCCTGCGTTGTTGTTTTTTCACCAC
AACAAGTAGTTGTTGTCTGAGAACGTGTTGGTCCAAAGGGTGTTGTGTTT
GGCTTCTCTGAAAAATTACTTTCTCCAACATCAAGAGTAGTTTGTTCATC
GGATCGACGAGTTGTAATTTCATTTGAACCTTCAGTGATGACAATCGGTG
TAAAGGTAGTTGTTGACAAGGACGGCGTACTTGTCATTTTTGTTGTGTCA
TCAATCGAAATAGAAGTTGTTTCTTGGACATCCGTTGAAATAACAGGTTT
AGGAACTGTTGTGGTTTCTTTAGAGCTTGGAGTAGTTTCTCCTGAGCTTG
GAGTGGTTTCTTCTGAGCTTGGAGTGGTTTCTTCTGAGCTTGGAGTGGTT
TCTTCAGAGCTTGAAGTGGTTTCTTCAGAGCTTGGAGTGGTTTCTTCAGA
GCTTGGAGTGGTTTCTTCAGAGCTTGGAGTGGTTTTTTCAGAGCTAGGTG
TGGTTTCTTCAGAGCTTGGAGTAGTTTCTTCAGAGCTCGGAGTGGTGTCT
TTACCATCTGTAACAACTAAAGGTGCATCAGTTGAGACAACTGGTTTAAA
TGTTGTTAATCTATATGAAGCAGTTGTTTTGTCTTCAGAGCTTGGAGTAG
TTTCTCCAGACCTTGGTGTGCTTTCTTGACCATCTGTAGAAACTAAAGGA
GCATCCGTTGAGACAACTGGTTTTGATGTAGTTAATCCACTAACAGCTGT
TGTTTTATCTTCAGAGCTAGAAGTTGTTACTTCAGAGCTTGGACTGATTT
CTACTGGACTTGGAGTAGTTTCTTCTGAGCTTGGAGTGGTTTCTTCAGAG
CTTGGAGTAGTTTCTTGACCATCTGTAGAAAGTAAAGGAGCATCTGTTGA
GACAACTGGTTTCAATGTTGTTGATCCACTTGCAGCAGTTGTTTTGTCTT
CAGAGCTTGGAGTTGTTTCTTCAGAGGTTAGAGTAGTTTCTCCTGAACTT
GGTGTTGTTTCTTGACCATCTGTAGAAACTAAAGGAACATCTGTTGAGAC
AACTGGTTTTGATGTTGTTAATCCACTAACAGCTGTTGTTTTGTCTTCAG
AACTTGGAGTTGTTTCTTCTGAGCTTGGAGTGGTTTCTTCTGAGCTTGGA
GTGGTTTCTTCAGAGCTTGGAGTGGTTTCTTCAGAGCTTGGAGTGGTTTC
TTCAGAGCTTGGAGTGGTTTCTTCAGAGCTTGGAGTGGTTTCTTCAGAGC
T
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_58:1246259..1252759+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00070880 ID=TCONS_00070880|Name=TCONS_00070880|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6501bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_58:1246259..1252759+ (Clytia hemisphaerica)
CTTATTTTCATATAAGATTGCATTTTCCAAATACTTCCTTGTAGTTCCAC AACCATACAAAGGAACATTGAAAATGATATGTGTAGCATTGATGAAAGGT TGGCATTGAGCACTTTGATCAATAACATGCAGAGAACTCATAGAGAAACC TTTCAAATCAGCTTTGTTAAGAACAACTCTCATGTTATCGGTGGAGCAAG TGATCGACATTGGACAGTCTTCGACGAAATTCAGCACATCTGCTGTTGGT GCAATGGTCACGCTAATTCGGTCAGTCGTTTGTTTTGGAGAAAGTGAAGA GGATCTTTGGATGAGTGCACCTTCAGTTGTTGGTCCTTTACCTTCAGTAC TGACAAATGGTCCTTGAGTTAGTTCTCCTGGTGCTTCAGTAGTTCCTGCT ACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTACTGACAAGTGGTCCTTGAGT TGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGTAGTTCCCGCTACAG CAGTTGTTGTTCTTTTACCTTCAGTACTGACAAATGGTCCTTGAGTTGTT TCTCCGGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTGGATGGTCGTTTACC ATCAGTACTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAG ATGGAGCTTCAGTTGTTCCTGCTACAGCAGTGGATGGTCGTTTACCATCA GTACTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGG AGCTTCAGTTGTTCCTGCTACAGCAGTGGATGGTCGTTTACCTTCAGTAC TGGCAAGTGCTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGATCT TCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGAC AAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAG TTGTTCCTGCTACAGCAGTGGATGGTCGTTTACCTTCAGTACTGGCAAGT GGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCATATGGAGCTTCAGTAGT TCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTGCTAACAAATGGTC CTTGAGTTAGTTCTCCTGGTGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTGGAT GGTCGTTTACCATCAGTACTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGG AGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTC CTTTCCCTTCAGTGCTGACAAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTA GTCTCAGATGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTT CCCTTCAGTGCTGACAAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCT CAGATGGATCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTGGATGGTCGTTTACCG TCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGA TGGATCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCGTCAG TGCTGACAAATGGTCCTTGAGTAGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGA TCTTCAGTAGTTCCTGCTATAGCAGTGGATGGTCGTTTACCGTCAGTGCT GACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCGGGAGTTATTTCTCCTGGAGCTT CAGTAGTTCCTGCTACAACAGTTGATGGTCCTTTACCATCAGTACTGACA AGTGGTCCTTGAGTTGTTGCTCCTGGAGTAGTCTCTGATGGAGCTTCAGT AGATCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTCCCTTCAGTGCTGACAAATG GTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGTAGTT CCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCATCAGTACTGACAAGTGGTCC TTGAGTTGTTGCTCCTGGAGTAGTCTCTGATGGAGCTTCAGTAGATCCTG CTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCGTCAGTGCTGACAAATGGTCCTTGA GTTGTTTTTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGATCTTCAGTAGTTCCTGCTAC AGCAGTTGATGATCCTTTACCGTCAGTGCTAACAAATGGTCCTTGAGTTG TTTTTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCA GTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTC TCCGGGAGTTATTTCTCCTGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTG TTGGTCCTTTACCGTCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCT GGAGTAGTCTCAGATGAAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGG TCCTTTACCATCAGTACTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTGCTCCTGGAG TTGTCTCTGATGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCT TTACCGTCAGTGCTGACAAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGT CTCAGATGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTGGATGGTCCTTTAC CTTCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTAGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCA GATGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCCACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTC AGTACTGACAAGTGGTCCTTGAGTAATTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATG GAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTG CTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGC TTCAGTTGTTCCTGCTACAGCAGTTGTTGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGA CAAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACA GCAGTGGATGGTCGTTTACCTTCAGTACTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGT TTCTCCGGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGTTGTTCCTGCTACAGCAG TGGATGGTCGTTTACCGTCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCT CCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGTTGTTCCTGCTACAGCAGTTGA TGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTACTG GAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTG CTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGC TTCAGTTGTTCCTGCTACAGCAGTGGATGGTCCTTTACCATCAGTGCTGA CAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTACTGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACA GCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGT TTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGTTGTTCCTGCTACAGCAG TGGATGGTCCTTTACCATCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCT ACTGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTC AGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATG GAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTA CTGGCAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTAGAGTAGTTTCAGATGGAGC TTCAGTTGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGA CAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTTTCAGATGGAGCTTCA GTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTACTGGCAAG TGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTAGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGTTG TTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGACAAGTGGT CCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTTTCAGATGGAGCTTCAGTTGTTCC TGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGACAAGTGGTCCTT GAGTGGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCT ACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCGTCAGTGCTGACAAATGGTCCTTGAGT TGTTTTTCCTGGAGTAGTTCCAGATGGAGCTTCAGTAGTTCCTGCTACAG CAGTTGATGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTT TCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCCTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGT TGATGGTCCTTTACCGTCAGTGCTGACAAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTC CTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCCTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGAT GGTCCTTTACCGTCAGTGCTGACAAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGG AGTAGTCTCAGATGGAGCCTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTC CTTTACCGTCAGTGCTGACAAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTA GTCTCAGATGGAGCCTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTT ACCGTCAGTGCTGACAAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTTT CAGATGGAGCTTCAGTTGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCT TCAGTGCTGACAAGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCCGGAGTAGTCTCAGA TGGAGCCTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTTGATGGTCCTTTACCGTCAG TGCTGACAAATGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGA GCTTCAGTAGTTCCTGCTACAGCAGTGGATGGTCGTTTACCTTCAGTGCT GACAAGTGGTCCTTGAGTTTTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTT CAGTTGTTCCTGCTACAGCAGTGGATGGTCCTTTACCATCAGTACTGACA AGTGGTCCTTGAGTTGTTTCTCCGGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTCAGT AGTTCCTGCTACAGCAGTGGATGGTCCTTTACCTTCAGTGCTGACAAGTG GTCGTTGAGTTGTTTCTCCTGGAGTAGTCTCAGATGGAGCTTTAGTAGTT CCTGCTTCATCAGTGGATGGTCCTTTACTATCAGTGCTGACAAGTTCGAT TGTTTTGGTTGAAGGAAGAGTTGTTTCCTGCGTTGTTGTTTTTTCACCAC AACAAGTAGTTGTTGTCTGAGAACGTGTTGGTCCAAAGGGTGTTGTGTTT GGCTTCTCTGAAAAATTACTTTCTCCAACATCAAGAGTAGTTTGTTCATC GGATCGACGAGTTGTAATTTCATTTGAACCTTCAGTGATGACAATCGGTG TAAAGGTAGTTGTTGACAAGGACGGCGTACTTGTCATTTTTGTTGTGTCA TCAATCGAAATAGAAGTTGTTTCTTGGACATCCGTTGAAATAACAGGTTT AGGAACTGTTGTGGTTTCTTTAGAGCTTGGAGTAGTTTCTCCTGAGCTTG GAGTGGTTTCTTCTGAGCTTGGAGTGGTTTCTTCTGAGCTTGGAGTGGTT TCTTCAGAGCTTGAAGTGGTTTCTTCAGAGCTTGGAGTGGTTTCTTCAGA GCTTGGAGTGGTTTCTTCAGAGCTTGGAGTGGTTTTTTCAGAGCTAGGTG TGGTTTCTTCAGAGCTTGGAGTAGTTTCTTCAGAGCTCGGAGTGGTGTCT TTACCATCTGTAACAACTAAAGGTGCATCAGTTGAGACAACTGGTTTAAA TGTTGTTAATCTATATGAAGCAGTTGTTTTGTCTTCAGAGCTTGGAGTAG TTTCTCCAGACCTTGGTGTGCTTTCTTGACCATCTGTAGAAACTAAAGGA GCATCCGTTGAGACAACTGGTTTTGATGTAGTTAATCCACTAACAGCTGT TGTTTTATCTTCAGAGCTAGAAGTTGTTACTTCAGAGCTTGGACTGATTT CTACTGGACTTGGAGTAGTTTCTTCTGAGCTTGGAGTGGTTTCTTCAGAG CTTGGAGTAGTTTCTTGACCATCTGTAGAAAGTAAAGGAGCATCTGTTGA GACAACTGGTTTCAATGTTGTTGATCCACTTGCAGCAGTTGTTTTGTCTT CAGAGCTTGGAGTTGTTTCTTCAGAGGTTAGAGTAGTTTCTCCTGAACTT GGTGTTGTTTCTTGACCATCTGTAGAAACTAAAGGAACATCTGTTGAGAC AACTGGTTTTGATGTTGTTAATCCACTAACAGCTGTTGTTTTGTCTTCAG AACTTGGAGTTGTTTCTTCTGAGCTTGGAGTGGTTTCTTCTGAGCTTGGA GTGGTTTCTTCAGAGCTTGGAGTGGTTTCTTCAGAGCTTGGAGTGGTTTC TTCAGAGCTTGGAGTGGTTTCTTCAGAGCTTGGAGTGGTTTCTTCAGAGC T
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044079XLOC_044079Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070880-exon-scaffold_58-1491911889:1246259..1246590TCONS_00070880-exon-scaffold_58-1491911889:1246259..1246590Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070880-exon-scaffold_58-1510915933:1246259..1246590TCONS_00070880-exon-scaffold_58-1510915933:1246259..1246590Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070880-exon-scaffold_58-1575043694:1246259..1246590TCONS_00070880-exon-scaffold_58-1575043694:1246259..1246590Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070880-exon-scaffold_58-1491911889:1248541..1252759TCONS_00070880-exon-scaffold_58-1491911889:1248541..1252759Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070880-exon-scaffold_58-1510915933:1248541..1252759TCONS_00070880-exon-scaffold_58-1510915933:1248541..1252759Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070880-exon-scaffold_58-1575043694:1248541..1252759TCONS_00070880-exon-scaffold_58-1575043694:1248541..1252759Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_58supercontigscaffold_58:1246259..1252759 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.163962 0 0.160467 0 0.249186 0.272435 2.4805 2.91162 0.585208 1.39793 0.611311 0.393495 4.58854 6.12433 4.32135 3.00556 1.67277 1.35858 14.5132 12.5994 2.69617 2.11339 1.08128 1.63177 1.95485 2.75626 0.216665 0.309664 9.08643 9.22519
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00070880 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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