TCONS_00070847 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00070847
Unique NameTCONS_00070847
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length3552

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00070847 ID=TCONS_00070847|Name=TCONS_00070847|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3552bp
ATGTGCCAACATTAAACTGTTAATATTATTGTTTACTGTTTTCTTTAATT
CAAAATCATTCATGcgcaaagttttctttttttaactttagagaTTTTTC
TCCATTCGTAATTTTCCACTTATCTTGGACtagaattcttttttattttg
gggTTGTTTGCTGACCGAAGAAATCCAAGATGAAATTGACATTGGTCTGT
GTGGCTTTATTCGTCGTTTTCTACGGCGCCGAAGCTCTTAAACTAAGAAA
AAAGAGAAACATTCCATTGAATGCTTACTACTTACCCAAAGACAAAAACT
TGGAACGAGAACTTGAGATCGAGAAGagaagtgcaaacccatgtggAATG
GGATGTGCTGCCGCATGTGCACCAGCCTGCCAGCCAAGCTGCTGCGCtgc
accacctccaccaccaccaccaccacctaTGCCAGCCTTTGGCTGCGCAC
CAATCTGTAGTCATTGGTCATCCATGATCGCTGCACAACCTGCTGCACCT
ATGCCTTGTCCATCACAATGTCAAGCTATGCCAGGGTGTTGTAACGCTCC
ACCTCGACCACCCCCTATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCAC
CCATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCCATGCCATGTGCT
GCACCTCCATGTGCCCCACCACCTATGCCATGTGCTGCTCCACCATGTGC
ACCACCACCTATGCCTTGCGCTGCTCCACCATGTGCCCCACCACCAATGC
CTATGCCTATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCTATGCCA
TGTGCTGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCTTGCGCTGCTCCACC
ATGTGCCCCACCACCAATGCCTATGCCTATGCCATGTGCTGCACCTCCAT
GTGCCCCACCACCCATGCCATGTGCCGCCCCACCATGTGCCCCACCACCT
ATGCCAGCTTGTCAGCCCTCTTGTGCTCCTGCTTGTTGCATGCCACCACC
TCCACCCCCTATGCCTATGTGCCAACCCTCATGTGCACCAGCATGTTGCA
TGCCCCCTCCTCCACCACCACCAATGCCTATGTGTCAACCATCTTGTGCA
CCAGCTTGTTGTAGACCTGCTCTCCCACCACCTGCTCGAGCTCCCCCACC
ATGCCCTGCTGGATGTCCAAGAGCTTGCTACCCCGCCTGCCGACCAAGCT
GTTGCGCACCACCTCCTCCACCCATGCCATGTGCAGCCCCACCATGCATG
CCTCCACCCATGCCATGTGCAGCCCCACCATGCATGCCTCCACCAATGCC
AATGGCTATGCCATGTGCAGCCCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCTT
GTGCCGCCCCACCATGCGCACCTCCACCTATGCCTTGTGCTGCCCCACCA
TGCGCACCACCACCTATGCCTTGTGCTGCCCCACCATGCGCACCACCACC
TATGCCATGTGCTGCCCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCTTGTGCCG
CCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCATGCGCTGCTCCACCATGTGCA
CCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCTCCATGTGCACCACCACCTATGCC
ATGTGCTGCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCATGTGCCGCCCCAC
CATGTGCTCCACCAGCCCCAGCCCCTTGCGCTGCACCACCATGCCAACAC
GTCAACCTTCCACCAACAGTCATCAACCTTCCagctccaccacctccacc
aatGCCATGTGGTCCAACTTGTGCTCCAACTTGCGCACCTGCTTGCTCTA
AAGCTTGTTGTAGCAAAAAATAAACACACATGTTAGAGAACTAGACCTTT
AATGTCAAAGCAATGAAACATCTGTGAAAACAAACAGTGCACAAATAAGT
GGTTTGCTCCGAGAAGAATCGGCACTACGTGTTTCTGAGTAAGATcaaaa
gaaatattcgaatattaTGTAAATAACACAAGAGAAGtggtttatttttt
taacaaattattATATGTGTTTTCGACCTTCATTAACTGATAAGtatata
ataaaatattgaaaagggGCATGTGTTGTTATGTATTAGAGACAAGAAAC
TGTTCACCACCACTGGCAATAAAAGCGACATTACCAAACATTGTTTATAT
TAGCTATATTTATATGGGAATGCAAGTCTTGTCTTGAAATAATAACAATG
Cctatttttcaatactttttaaacattttataatttgattttttgtatcg
GAATCAAAATTTGTCATTATCAAAGTCATTTCATGTTCAATTAAATTCTT
GATAGTTCCAATATGTTCATCTAAATCTCCCTTTAATTTATTGTCAAAGA
TGTTCTGGGAGTTTTCGTAAATATAACTAGTATCATGTGTTTTCGAGGGG
GGTGAATTGGCTTGCTCTTTACAATTACAGTCACTGCATCCTCTTTTAAG
TTCTTTTTGCTCGCTAGAACAATTATCATTTTGGGGTTGCATATTATCAA
AGCCATCAATAAGTGTATCTATTGTAGTGTTATCCATAGAATCATGCCTT
GTGTTCTTATGACCTCCCAAGTCTCTTTCTTCTGTCTTCCGTCTGTTATT
CTGAGCAGCTATTTCATCAATATGACTTTggttattttcaaaatcttcaa
gCTTGGTGATCAAAGCTTCAAATTGATCTCCGGTTTCTTTCACAAAAGCA
GGCTGATTCATAAGAAACATATATATCGcactaaaacaaacaaaataaac
aaatatttgATACAGCTACCATTTATTTAATGTGAAgtataaataattga
aaaacagATACATGGCAGAGGAAGGGGAAGAAACAAAGTGGAGTAAAACA
GTAACATCATCAAGTCTTTTTCAAGAGCTTTATAGTTTGTATAGTTATTA
ACTTACCTGACTTTCCCTCTGAAATGAGaaagtttttcgaaaaatatgcc
aGATGATTTGAAACCTTCGTTGAATGCAGTCTGGAGAATGTAATCTTGGC
CCTGGGAAATTCCTTCACGAAATCCATCCTTATAtaataaaataacattt
tttcaaaagaattacTGTAATGTTGTGTTATTAAAGCACATTTTATTTGT
GAAATATGAAAACTCTATGCAAACTTCATCAGACATCTTTGATAGATTTG
ATAGAATGCTCCACCATCAGCCAAAAAACACTAATCTTATAAAGAAGTGT
GCATCATATATAAACAAGAAGCTGAAGCAGCATGAAGGCCTAGACATACA
ATTGATTATTTATCATTGGTACTGATTTTTACAAGACattgtttcttcca
aaatgaacttgaatcaACAAAGTGCTTAGACtgagagaaaatcaaaaatt
cttaaaaaagtatttacctttgtatgtttatgtttcaaagaattgaaatc
attttctaaattttcactttcatctAGCCAATCCATGTCCtccatttttt
ataatttttcaaataatttgctACTAGGCATAAACTGATTCTAAGAATTT
AAATGGTAAGGTAAATTGTTAATAACAAATAGAATTAATGATCCTCATAA
AG
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00070847-protein

>TCONS_00070847-protein ID=TCONS_00070847-protein|Name=TCONS_00070847-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=547bp
MKLTLVCVALFVVFYGAEALKLRKKRNIPLNAYYLPKDKNLERELEIEKR
SANPCGMGCAAACAPACQPSCCAAPPPPPPPPPMPAFGCAPICSHWSSMI
AAQPAAPMPCPSQCQAMPGCCNAPPRPPPMPCAAPPCAPPPMPCAAPPCA
PPPMPCAAPPCAPPPMPCAAPPCAPPPMPCAAPPCAPPPMPMPMPCAAPP
CAPPPMPCAAPPCAPPPMPCAAPPCAPPPMPMPMPCAAPPCAPPPMPCAA
PPCAPPPMPACQPSCAPACCMPPPPPPMPMCQPSCAPACCMPPPPPPPMP
MCQPSCAPACCRPALPPPARAPPPCPAGCPRACYPACRPSCCAPPPPPMP
CAAPPCMPPPMPCAAPPCMPPPMPMAMPCAAPPCAPPPMPCAAPPCAPPP
MPCAAPPCAPPPMPCAAPPCAPPPMPCAAPPCAPPPMPCAAPPCAPPPMP
CAAPPCAPPPMPCAAPPCAPPPMPCAAPPCAPPPMPCAAPPCAPPAPAPC
AAPPCQHVNLPPTVINLPAPPPPPMPCGPTCAPTCAPACSKACCSKK
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_58:847054..851511+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00070847 ID=TCONS_00070847|Name=TCONS_00070847|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4458bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_58:847054..851511+ (Clytia hemisphaerica)
ATGTGCCAACATTAAACTGTTAATATTATTGTTTACTGTTTTCTTTAATT CAAAATCATTCATGcgcaaagttttctttttttaactttagagaTTTTTC TCCATTCGTAATTTTCCACTTATCTTGGACtagaattcttttttattttg gggTTGTTTGCTGACCGAAGAAATCCAAGGTATATTGTCACTTCTTCTGT TTTTCTTGCACTTTAAATAAATGATTGTTAGGCCGTTTATCTATCaagca aatattttttcaaaatttctttaatctCGTGTATGTATGATAACCTCTTT ATGACAAAGAAAGCTTATCTTCAAAAGAGTTATACAATAAAAGATTGAAG GCAAATGATATTATAAAtgatgagaaaaatatttcataccTTTCCTCCTA CTGTAAGCTTGTCCCTTTTTCTTTAGATGAAATTGACATTGGTCTGTGTG GCTTTATTCGTCGTTTTCTACGGCGCCGAAGCTCTTAAACTAAGAAAAAA GAGTAAGTTGTTAGTTTAAATGGTGCAACGAGATTTAACCTTGTATAGTG ATAAAGAAAATCTGAACGTTTCAACTTATTGTTCGATTTTtaatgaatac acgttttttttaagaaactagttttaccaagcagcctcaatgtttcttaa gaaatcggccttttgagccttaaatgtttcttacatgtttctaaACTTTG TCAAGCTTAAAGGACACTTTCTCAAGTATTTCTAACtgttatgtaagtat ttttctggaactttgattggaaggtttcttaaaaaaaaacgaattaaaaa atgttatcttctcattctcagcctcagtatgtttcttagttttcaggcat tctgagcctcatgtttcttaaaagtgagtttcttaaaaaaaacgtgtaat tttaAACAGGAAAGCATGAGCGCTAATAGTAAAATTTTATGAAAGGAAGC CATGGTTAAAGATTATGACAAcgatttatttcttttgttatttcaaGGAA ACATTCCATTGAATGCTTACTACTTACCCAAAGACAAAAACTTGGAACGA GAACTTGGTAAGTGTACATCtatcaacatttttcattttgatttgacttt cttgtttactttttatttttatctgaaCCTGAAAGAGAGAGAGAATACAA AAAAGCAATACTTCATTGTTTATTATTAATTCTGAATATCATCATAAATA ACatgttttcttattttaaaGAGATCGAGAAGagaagtgcaaacccatgt ggAATGGGATGTGCTGCCGCATGTGCACCAGCCTGCCAGCCAAGCTGCTG CGCtgcaccacctccaccaccaccaccaccacctaTGCCAGCCTTTGGCT GCGCACCAATCTGTAGTCATTGGTCATCCATGATCGCTGCACAACCTGCT GCACCTATGCCTTGTCCATCACAATGTCAAGCTATGCCAGGGTGTTGTAA CGCTCCACCTCGACCACCCCCTATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCC CACCACCCATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCCATGCCA TGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCTATGCCATGTGCTGCTCCACC ATGTGCACCACCACCTATGCCTTGCGCTGCTCCACCATGTGCCCCACCAC CAATGCCTATGCCTATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCT ATGCCATGTGCTGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCTTGCGCTGC TCCACCATGTGCCCCACCACCAATGCCTATGCCTATGCCATGTGCTGCAC CTCCATGTGCCCCACCACCCATGCCATGTGCCGCCCCACCATGTGCCCCA CCACCTATGCCAGCTTGTCAGCCCTCTTGTGCTCCTGCTTGTTGCATGCC ACCACCTCCACCCCCTATGCCTATGTGCCAACCCTCATGTGCACCAGCAT GTTGCATGCCCCCTCCTCCACCACCACCAATGCCTATGTGTCAACCATCT TGTGCACCAGCTTGTTGTAGACCTGCTCTCCCACCACCTGCTCGAGCTCC CCCACCATGCCCTGCTGGATGTCCAAGAGCTTGCTACCCCGCCTGCCGAC CAAGCTGTTGCGCACCACCTCCTCCACCCATGCCATGTGCAGCCCCACCA TGCATGCCTCCACCCATGCCATGTGCAGCCCCACCATGCATGCCTCCACC AATGCCAATGGCTATGCCATGTGCAGCCCCACCATGTGCACCACCACCTA TGCCTTGTGCCGCCCCACCATGCGCACCTCCACCTATGCCTTGTGCTGCC CCACCATGCGCACCACCACCTATGCCTTGTGCTGCCCCACCATGCGCACC ACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCTT GTGCCGCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCATGCGCTGCTCCACCA TGTGCACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCTCCATGTGCACCACCACC TATGCCATGTGCTGCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCATGTGCCG CCCCACCATGTGCTCCACCAGCCCCAGCCCCTTGCGCTGCACCACCATGC CAACACGTCAACCTTCCACCAACAGTCATCAACCTTCCagctccaccacc tccaccaatGCCATGTGGTCCAACTTGTGCTCCAACTTGCGCACCTGCTT GCTCTAAAGCTTGTTGTAGCAAAAAATAAACACACATGTTAGAGAACTAG ACCTTTAATGTCAAAGCAATGAAACATCTGTGAAAACAAACAGTGCACAA ATAAGTGGTTTGCTCCGAGAAGAATCGGCACTACGTGTTTCTGAGTAAGA TcaaaagaaatattcgaatattaTGTAAATAACACAAGAGAAGtggttta tttttttaacaaattattATATGTGTTTTCGACCTTCATTAACTGATAAG tatataataaaatattgaaaagggGCATGTGTTGTTATGTATTAGAGACA AGAAACTGTTCACCACCACTGGCAATAAAAGCGACATTACCAAACATTGT TTATATTAGCTATATTTATATGGGAATGCAAGTCTTGTCTTGAAATAATA ACAATGCctatttttcaatactttttaaacattttataatttgatttttt gtatcgGAATCAAAATTTGTCATTATCAAAGTCATTTCATGTTCAATTAA ATTCTTGATAGTTCCAATATGTTCATCTAAATCTCCCTTTAATTTATTGT CAAAGATGTTCTGGGAGTTTTCGTAAATATAACTAGTATCATGTGTTTTC GAGGGGGGTGAATTGGCTTGCTCTTTACAATTACAGTCACTGCATCCTCT TTTAAGTTCTTTTTGCTCGCTAGAACAATTATCATTTTGGGGTTGCATAT TATCAAAGCCATCAATAAGTGTATCTATTGTAGTGTTATCCATAGAATCA TGCCTTGTGTTCTTATGACCTCCCAAGTCTCTTTCTTCTGTCTTCCGTCT GTTATTCTGAGCAGCTATTTCATCAATATGACTTTggttattttcaaaat cttcaagCTTGGTGATCAAAGCTTCAAATTGATCTCCGGTTTCTTTCACA AAAGCAGGCTGATTCATAAGAAACATATATATCGcactaaaacaaacaaa ataaacaaatatttgATACAGCTACCATTTATTTAATGTGAAgtataaat aattgaaaaacagATACATGGCAGAGGAAGGGGAAGAAACAAAGTGGAGT AAAACAGTAACATCATCAAGTCTTTTTCAAGAGCTTTATAGTTTGTATAG TTATTAACTTACCTGACTTTCCCTCTGAAATGAGaaagtttttcgaaaaa tatgccaGATGATTTGAAACCTTCGTTGAATGCAGTCTGGAGAATGTAAT CTTGGCCCTGGGAAATTCCTTCACGAAATCCATCCTTATAtaataaaata acattttttcaaaagaattacTGTAATGTTGTGTTATTAAAGCACATTTT ATTTGTGAAATATGAAAACTCTATGCAAACTTCATCAGACATCTTTGATA GATTTGATAGAATGCTCCACCATCAGCCAAAAAACACTAATCTTATAAAG AAGTGTGCATCATATATAAACAAGAAGCTGAAGCAGCATGAAGGCCTAGA CATACAATTGATTATTTATCATTGGTACTGATTTTTACAAGACattgttt cttccaaaatgaacttgaatcaACAAAGTGCTTAGACtgagagaaaatca aaaattcttaaaaaagtatttacctttgtatgtttatgtttcaaagaatt gaaatcattttctaaattttcactttcatctAGCCAATCCATGTCCtcca ttttttataatttttcaaataatttgctACTAGGCATAAACTGATTCTAA GAATTTAAATGGTAAGGTAAATTGTTAATAACAAATAGAATTAATGATCC TCATAAAG

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_58:847054..851511+

>TCONS_00070847 ID=TCONS_00070847|Name=TCONS_00070847|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=4932bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_58:847054..851511+ (Clytia hemisphaerica)
ATGAAATTGACATTGGTCTGTGTGGCTTTATTCGTCGTTTTCTACGGCGC
CGAAGCTCTTAAACTAAGAAAAAAGAGAAACATTCCATTGAATGCTTACT
ACTTACCCAAAGACAAAAACTTGGAACGAGAACTTGAGATCGAGAAGaga
agtgcaaacccatgtggAATGGGATGTGCTGCCGCATGTGCACCAGCCTG
CCAGCCAAGCTGCTGCGCtgcaccacctccaccaccaccaccaccaccta
TGCCAGCCTTTGGCTGCGCACCAATCTGTAGTCATTGGTCATCCATGATC
GCTGCACAACCTGCTGCACCTATGCCTTGTCCATCACAATGTCAAGCTAT
GCCAGGGTGTTGTAACGCTCCACCTCGACCACCCCCTATGCCATGTGCTG
CACCTCCATGTGCCCCACCACCCATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCC
CCACCACCCATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCTATGCC
ATGTGCTGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCTTGCGCTGCTCCAC
CATGTGCCCCACCACCAATGCCTATGCCTATGCCATGTGCTGCACCTCCA
TGTGCCCCACCACCTATGCCATGTGCTGCTCCACCATGTGCACCACCACC
TATGCCTTGCGCTGCTCCACCATGTGCCCCACCACCAATGCCTATGCCTA
TGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCCATGCCATGTGCCGCC
CCACCATGTGCCCCACCACCTATGCCAGCTTGTCAGCCCTCTTGTGCTCC
TGCTTGTTGCATGCCACCACCTCCACCCCCTATGCCTATGTGCCAACCCT
CATGTGCACCAGCATGTTGCATGCCCCCTCCTCCACCACCACCAATGCCT
ATGTGTCAACCATCTTGTGCACCAGCTTGTTGTAGACCTGCTCTCCCACC
ACCTGCTCGAGCTCCCCCACCATGCCCTGCTGGATGTCCAAGAGCTTGCT
ACCCCGCCTGCCGACCAAGCTGTTGCGCACCACCTCCTCCACCCATGCCA
TGTGCAGCCCCACCATGCATGCCTCCACCCATGCCATGTGCAGCCCCACC
ATGCATGCCTCCACCAATGCCAATGGCTATGCCATGTGCAGCCCCACCAT
GTGCACCACCACCTATGCCTTGTGCCGCCCCACCATGCGCACCTCCACCT
ATGCCTTGTGCTGCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCTTGTGCTGC
CCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCACCATGTGCAC
CACCACCTATGCCTTGTGCCGCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCA
TGCGCTGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCTCC
ATGTGCACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCACCATGCGCACCACCAC
CTATGCCATGTGCCGCCCCACCATGTGCTCCACCAGCCCCAGCCCCTTGC
GCTGCACCACCATGCCAACACGTCAACCTTCCACCAACAGTCATCAACCT
TCCagctccaccacctccaccaatGCCATGTGGTCCAACTTGTGCTCCAA
CTTGCGCACCTGCTTGCTCTAAAGCTTGTTGTAGCAAAAAATAAATGAAA
TTGACATTGGTCTGTGTGGCTTTATTCGTCGTTTTCTACGGCGCCGAAGC
TCTTAAACTAAGAAAAAAGAGAAACATTCCATTGAATGCTTACTACTTAC
CCAAAGACAAAAACTTGGAACGAGAACTTGAGATCGAGAAGagaagtgca
aacccatgtggAATGGGATGTGCTGCCGCATGTGCACCAGCCTGCCAGCC
AAGCTGCTGCGCtgcaccacctccaccaccaccaccaccacctaTGCCAG
CCTTTGGCTGCGCACCAATCTGTAGTCATTGGTCATCCATGATCGCTGCA
CAACCTGCTGCACCTATGCCTTGTCCATCACAATGTCAAGCTATGCCAGG
GTGTTGTAACGCTCCACCTCGACCACCCCCTATGCCATGTGCTGCACCTC
CATGTGCCCCACCACCCATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCA
CCCATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCTATGCCATGTGC
TGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCTTGCGCTGCTCCACCATGTG
CCCCACCACCAATGCCTATGCCTATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCC
CCACCACCTATGCCATGTGCTGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCC
TTGCGCTGCTCCACCATGTGCCCCACCACCAATGCCTATGCCTATGCCAT
GTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCCATGCCATGTGCCGCCCCACCA
TGTGCCCCACCACCTATGCCAGCTTGTCAGCCCTCTTGTGCTCCTGCTTG
TTGCATGCCACCACCTCCACCCCCTATGCCTATGTGCCAACCCTCATGTG
CACCAGCATGTTGCATGCCCCCTCCTCCACCACCACCAATGCCTATGTGT
CAACCATCTTGTGCACCAGCTTGTTGTAGACCTGCTCTCCCACCACCTGC
TCGAGCTCCCCCACCATGCCCTGCTGGATGTCCAAGAGCTTGCTACCCCG
CCTGCCGACCAAGCTGTTGCGCACCACCTCCTCCACCCATGCCATGTGCA
GCCCCACCATGCATGCCTCCACCCATGCCATGTGCAGCCCCACCATGCAT
GCCTCCACCAATGCCAATGGCTATGCCATGTGCAGCCCCACCATGTGCAC
CACCACCTATGCCTTGTGCCGCCCCACCATGCGCACCTCCACCTATGCCT
TGTGCTGCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCTTGTGCTGCCCCACC
ATGCGCACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCACCATGTGCACCACCAC
CTATGCCTTGTGCCGCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCATGCGCT
GCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCTCCATGTGC
ACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGC
CATGTGCCGCCCCACCATGTGCTCCACCAGCCCCAGCCCCTTGCGCTGCA
CCACCATGCCAACACGTCAACCTTCCACCAACAGTCATCAACCTTCCagc
tccaccacctccaccaatGCCATGTGGTCCAACTTGTGCTCCAACTTGCG
CACCTGCTTGCTCTAAAGCTTGTTGTAGCAAAAAATAAATGAAATTGACA
TTGGTCTGTGTGGCTTTATTCGTCGTTTTCTACGGCGCCGAAGCTCTTAA
ACTAAGAAAAAAGAGAAACATTCCATTGAATGCTTACTACTTACCCAAAG
ACAAAAACTTGGAACGAGAACTTGAGATCGAGAAGagaagtgcaaaccca
tgtggAATGGGATGTGCTGCCGCATGTGCACCAGCCTGCCAGCCAAGCTG
CTGCGCtgcaccacctccaccaccaccaccaccacctaTGCCAGCCTTTG
GCTGCGCACCAATCTGTAGTCATTGGTCATCCATGATCGCTGCACAACCT
GCTGCACCTATGCCTTGTCCATCACAATGTCAAGCTATGCCAGGGTGTTG
TAACGCTCCACCTCGACCACCCCCTATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTG
CCCCACCACCCATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCCATG
CCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCTATGCCATGTGCTGCTCC
ACCATGTGCACCACCACCTATGCCTTGCGCTGCTCCACCATGTGCCCCAC
CACCAATGCCTATGCCTATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCA
CCTATGCCATGTGCTGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCTTGCGC
TGCTCCACCATGTGCCCCACCACCAATGCCTATGCCTATGCCATGTGCTG
CACCTCCATGTGCCCCACCACCCATGCCATGTGCCGCCCCACCATGTGCC
CCACCACCTATGCCAGCTTGTCAGCCCTCTTGTGCTCCTGCTTGTTGCAT
GCCACCACCTCCACCCCCTATGCCTATGTGCCAACCCTCATGTGCACCAG
CATGTTGCATGCCCCCTCCTCCACCACCACCAATGCCTATGTGTCAACCA
TCTTGTGCACCAGCTTGTTGTAGACCTGCTCTCCCACCACCTGCTCGAGC
TCCCCCACCATGCCCTGCTGGATGTCCAAGAGCTTGCTACCCCGCCTGCC
GACCAAGCTGTTGCGCACCACCTCCTCCACCCATGCCATGTGCAGCCCCA
CCATGCATGCCTCCACCCATGCCATGTGCAGCCCCACCATGCATGCCTCC
ACCAATGCCAATGGCTATGCCATGTGCAGCCCCACCATGTGCACCACCAC
CTATGCCTTGTGCCGCCCCACCATGCGCACCTCCACCTATGCCTTGTGCT
GCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCTTGTGCTGCCCCACCATGCGC
ACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCACCATGTGCACCACCACCTATGC
CTTGTGCCGCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCATGCGCTGCTCCA
CCATGTGCACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCTCCATGTGCACCACC
ACCTATGCCATGTGCTGCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCATGTG
CCGCCCCACCATGTGCTCCACCAGCCCCAGCCCCTTGCGCTGCACCACCA
TGCCAACACGTCAACCTTCCACCAACAGTCATCAACCTTCCagctccacc
acctccaccaatGCCATGTGGTCCAACTTGTGCTCCAACTTGCGCACCTG
CTTGCTCTAAAGCTTGTTGTAGCAAAAAATAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044066XLOC_044066Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1491911889:847054..847232TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1491911889:847054..847232Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1510915933:847054..847232TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1510915933:847054..847232Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1575043694:847054..847232TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1575043694:847054..847232Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1491911889:847480..847555TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1491911889:847480..847555Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1510915933:847480..847555TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1510915933:847480..847555Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1575043694:847480..847555TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1575043694:847480..847555Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1491911889:848051..848110TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1491911889:848051..848110Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1510915933:848051..848110TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1510915933:848051..848110Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1575043694:848051..848110TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1575043694:848051..848110Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1491911889:848275..851511TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1491911889:848275..851511Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1510915933:848275..851511TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1510915933:848275..851511Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1575043694:848275..851511TCONS_00070847-exon-scaffold_58-1575043694:848275..851511Clytia hemisphaericaexon
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070847-proteinTCONS_00070847-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_58supercontigscaffold_58:847054..851511 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.157639 0.233584 0.0717413 0.224441 0.344867 0.263322 20.1897 23.4218 7.52309 13.4508 26.2651 11.0348 41.5403 37.8698 26.689 111.864 49.7135 53.5381 0.0553902 0.226905 42.3526 54.5839 29.4915 29.5343 29.3425 30.9 5.80129 2.11915 0.0674345 0.312353
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00070847 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top