TCONS_00069875 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00069875
Unique Name	TCONS_00069875
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1977

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_511:148348..158516+

transcript sequence

>TCONS_00069875 ID=TCONS_00069875|Name=TCONS_00069875|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1977bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_511:148348..158516+

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00069875 ID=TCONS_00069875|Name=TCONS_00069875|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10169bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_511:148348..158516+ (Clytia hemisphaerica)
CAGAAAGGTCAAATTGCTTTTTCTACCAAGGTAAAgacttttttttaagt
ttatacCTGGACTTTCTGATTGATTGTGTTTATTTGAGGCTCATTTTCGA
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ATCGCAAACCAGATTTGAGCTCCAAGACAGCTAAATGGGACAAAGGAGGC
TTTTTACATTTCGTTGAAACGAGATGTGGTGCGTTGCCATGTCGATCAAA
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ATGACATGAAATGATCCACAGAGTctggaatttcaaaattcttataGTTT
TAGAGGTTTATTTGGCACAGCCAAGTAATAGCAGCTGCtgatattcgaaa
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AATAGTGTATAATTAATTGGAACTTTTATTTATCATAAGATATTTTAACC
tcctttgaaaaattaaagaaagagACTTAAATCTAAACAATAATTTATTT
CTAGATGACGGCGTCTTTT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_043520	XLOC_043520	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_511	supercontig	scaffold_511:148348..158516 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2.16471	2.58391	0	0	0.420273	0.983264	0.0105598	6.95798	0	0.946422	0	0	0	0	0	0	0	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00069875 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00069875 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00069875 (transcript) - C. hemisphaerica