|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00069268 ID=TCONS_00069268|Name=TCONS_00069268|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=448bp
TGATGGTGATTGGACAGAAGTAGTAACTGGTTTGtatgtgctgacacttg
ttgatgttgacacacttgaacttGCACTGCTTGAGGTAAATACTGAGCTT
GAAGATGGTGTAGATACAGAAGAACTAACGTATGGAGTACTGCTTGTAGC
TTGGCTGGATGAGCTTGCGATCGATGTcgatggagctggtttgcttgtag
atggtgatggtgattggacagaagtagtgactggtttgtatgtgctgaca
cttgttgatgttgacacacttgaacttGGACTGCTTGAGGTGAATACAGA
GCTCGAAGATGGTGTAGATACAGAAGAACTAACGTATGGAGTACTGCTTG
TTGCTTGGCTTGATGAGCTACCAATCGATGTcgatggagctggtttgctt
gtagatggtgatggtgattggACAGAAGTAGTGACTGATTTGtatgtg Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_496:624640..627854- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00069268 ID=TCONS_00069268|Name=TCONS_00069268|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3215bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_496:624640..627854- (Clytia hemisphaerica)
TGATGGTGATTGGACAGAAGTAGTAACTGGTTTGTATGTGCTGACACTTG
TTGATGTTGACACACTTGAACTTGCACTGCTTGAGGTAAATACTGAGCTC
GATGAAGGTGTAGATACAGAAGTACTAACGTATGGAGTACTGCTTGTAGC
TTGGCTTGATGAGCTTGCAATCGATGTCGATGGAGCTGGTTTGCTTGTAG
ATGGTGATGGTGATTGGACGGAAGTAGTGACTGGTTTGTATGTGCTGACA
CTTGTTGATGTTGATACACTTGAGCTTTCACTGCTTGAGGTAAATACAGA
GCTTGAAGATGGTGTAGATACAGAAGAACTAACGTATGGAGTACTGCTTG
TAGCTTGGCTTGATGAGCTTGCGATCGATGTCGATGGAGCTGGTTTGCTT
GTAGATGGTGATGGTGATTGGACAGAAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGGCTTGATGTGCTCACAAC
TTGAGATTGAGTGCTTGCATATGTAGATTCAGTGTAAGTTGTTTGGCTTG
TGCTTGAGCTTACTTGGCTTGATGAGCTAGCAATCGTTGTCGATGGAGCT
GGTTTGCTTGTGGATGGTGATGGAGATTGGACAGAAGTAGTGACTGGTTT
GTATGTGCTGACACTTGTTGATGTTGATACACTTGAGCTTTCACTGCTGG
AGGTAAATACTGAGCTTGAAGATGGTGTAGATACAGAAGAACTAACGTAT
GGAGTACTGCTTGTAGCTTGGCTGGATGAGCTTGCGATCGATGTCGATGG
AGCTGGTTTGCTTGTAGATGGTGATGGTGATTGGACAGAAGTAGTGACTG
GTTTGTATGTGCTGACACTTGTTGATGTTGACACACTTGAACTTGGACTG
CTTGAGGTGAATACAGAGCTCGAAGATGGTGTAGATACAGAAGAACTAAC
GTATGGAGTACTGCTTGTTGCTTGGCTTGATGAGCTACCAATCGATGTCG
ATGGAGCTGGTTTGCTTGTAGATGGTGATGGTGATTGGACAGAAGTAGTG
ACTGATTTGTATGTG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00069268-exon-scaffold_496-1575043694:627770..627854 | TCONS_00069268-exon-scaffold_496-1575043694:627770..627854 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00069268-exon-scaffold_496-1575043694:624640..625002 | TCONS_00069268-exon-scaffold_496-1575043694:624640..625002 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00069268-exon-scaffold_496-1510915933:627770..627854 | TCONS_00069268-exon-scaffold_496-1510915933:627770..627854 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00069268-exon-scaffold_496-1510915933:624640..625002 | TCONS_00069268-exon-scaffold_496-1510915933:624640..625002 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00069268-exon-scaffold_496-1491911889:627770..627854 | TCONS_00069268-exon-scaffold_496-1491911889:627770..627854 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00069268-exon-scaffold_496-1491911889:624640..625002 | TCONS_00069268-exon-scaffold_496-1491911889:624640..625002 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_496 | supercontig | scaffold_496:624640..627854 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
