TCONS_00069241 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00069241
Unique Name	TCONS_00069241
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	10727

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_496:351945..407284-

transcript sequence

>TCONS_00069241 ID=TCONS_00069241|Name=TCONS_00069241|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10727bp
AACCGAAAGCATTACCAACAGTGAATGTCAAATTGCCCAAGGATGGAATT
GTGAATATCAAAGAAGGTGAACCATTTGAACTCAACTTTGAAGTATCTGA
TGACTCTAAAGCCATCTTCTACAAAGGTGATAATAGAATCGATGATATGG
GTCGAGCTGTTGTCACCAGAATGGGTAGAACCTTTAGATTCTACATTCCC
GAAGTCAAGGAATCAGATTCTGGTCAATACATCATGGAAGTCCAAGGAGA
ATCTGGAATAACCAACAAATCATTCAAAATCAAAGTACAAGgaaaaccaa
agaaatcacCCATCCCGACCATCGACGTCGACCTTCCTGACGAACCAATC
AAAAAGAGGGAAGGTGACAAATTTGAAGTCCGTTTCAAAATCAGTGGCCA
ACCACACCCTGaagtcttcttttttaaagatgaaaAACCCATTGAAGAAA
AATCGAAGAAAGTTCTCATCAAGCGGGAAGGCGAATATTATAATTTCACC
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aaataaaaatggtacCGTTGAAAAAGAATTCGAAATCGAAGTCGAAGGCA
AATCGAAAAAAGCTCCAGTAGCAGCACCAAAACCACAACTTCAAAGTTTG
GTGAGCGCTTCAACTAATCCCAACAAACCAGCATTCAAGATCAAGTTACA
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GACGATGACGATCGCAACTTTTtacaagaagaagaagaagatggaaCTTG
CGCTCTTGTTATTCGTGAAGTATCCACTAACGACCGTGGTACTTACAAGT
GTATGGCTAAAAATCGTTTCGGTAAAGCCATGACCACTGCTGAGCTCTTC
GTTGAAGATCATGGATTTGAGTCTGACGATTCAGAATCTGAGCTTGGTGG
ACGATCGTTGCCAAGAACTGATGATGACGATCTTACAGATGATGACCTCT
TGGATGAAGAAGACGAACTCGATCACGCTCAAATCATATTACCCATGCGT
GACCGTCACGCTACCATCGGCTCCTCCGCTAAATTTTCATGCCGTGCACA
ATCCATTAAACCCCACATACCTGTAGAATGGTACCACGATGATAAACCAG
TCGACCTTGGTTGTGGACGTATAAAAGCTGCCGTCGCCGAAGAAGGAGAA
CTGTTCACGTTGAACTTGAGGAATGTACAAATGTCAGATGCTGGCAAATA
TAAGATCGTCTTCAAATTACCCAACGAGACGTTGACATCGAGTGCTAACC
TTAATGTTGATGAGGGTCGCAAAACAGAATTTGGTGTTTCAAGCCGATCT
TCAGATACGAAGAAAGAGCCAAAAGCAACACCACCAAAACCCGCCCCCAA
AACACAAAGGAAACCAGGCCAAGAAGAACCGACTTTTGTTTTGGAACCAA
AAGATAAAACAGTCGTTGAAGGTAATCAGCTGAAATTAACAGCCAGCGTT
AACGGTAAACCAACACCCTTAGTTGAATGGTATAAAGAAAACTCATTACT
TAAATCTTCCTCTACCATTGATATTCAAGCAACGAGGAACCTACATAACA
TGGTAATAAGAAAGGCTACCACGAAAGATGCTGGCGTTTACAGATGTACT
GCTCGTAACGAAGCTGGACAATGTACTGTCGAAGTCAACATCAAAATCGA
TACTAAATCCAACAAACCTAAATTATCGCCAAACCACCCAGCATTTACGA
GAGAATTAGAGGATTTTTACGAAGCTGAAGAAGGAAACGATGTCGAAATG
AAAGTCGAATTTACCGGCAAACCGAAACCACGAATCCATTGGGAGAAAAA
TGGAAAGAATATTGTCTCGATTAAACGTGTCAAAATACACGAGGAAGATG
GAGCAAGTCAATTGTTGATCAAGGCATTGAGAGACACTGACTTTGGTGAT
TATTCGTGCACCATTTCCAATTTCCATGGCAACACGAAATCCACTTCATG
TCTTCGATTATgCTCTGATGGTACACCCGACATTCACATAAACACGCCCT
CTCCACCACCACCCCCTATTTCTTCCACAACCAATCAAGAATGTTCTAAt
ttggacGAATACGATGCTACTGATGATGAAGTGGCGGTTATTACAGACAG
AAGGAACGACCAAAATACAAGCAATGATATAGGAATGAAACTATTGCAAA
TCAAGGAATTACATCCTGGACTTAATAGGGAAGTGACCAGGCATAAATTC
CCTGGCGCATGCGGTATTGATGTCGTTGTAATGCCTGCAACTCCGCGAGA
TTCACCAGTCAGTGGTGCTCAACcagtaatcaaaacaaaacctgaAGACT
TAGACTTAAACATTGGCGAAAAAGCTTTATTTGAATTACAATTAGCTGAT
GATACAGATTTAGCCAAAGTCAATGTGTCTTGGTCGAAAAATGGACAAAT
TTTATTCGGTTCTGGTAGAACGAGAATATGGAATAAAGACTATAGTTTCT
TTCTGGAAATTTCCAAAGTTGACGTAGATGATGAGAGTCTGTATGAAGTT
CGTGTTCGAAACGATTACGGAGAAGTCATGTGCGACGTTCAACTATTGGT
TAATGATGAAGAAGAATTATCTGAAgaagaagaatctgaagttgaagaag
aagaagtaaAACTAAAGATCACCAAACCCAAATTCACCAAGAAATTACAG
AAACAATATCAATTAATTGAAGGTGAAAAACTATTACTTGAAGTCACTAC
ACAAGGTGGACCTTGTGACATCGCTTGGTATTACGAGGGTAAGAAATTAC
TACCCAGCGACTTCATGCAGTTAGTAACAGAGGTTGATAGCCATCAACTT
GTTATCCCAGAAACAGTTTTGGATGATGAGGGAGTCTATTCGTGTACAGT
ATCTAACGAACTCGGTAAAGATGAAACTGAAGCTGACGTCTTTGTAGATG
AAATTGATGATGCAGCAGACGGTGCTGGATCAAAACCGGCGGACGTTCCT
CCTGAAATTGTGAGGAGTTTGCATGATAAGGAAGCTTTTGAGGAGGACGA
GATACGTTTTGATGTTGAAGTCATTGGATGTTCTCAAGTCCAATGGTTCT
TAAACGACCGAGAAGTAAAAGCCAATGATCAATTCCAACTCATGTCCAAA
GATGACCGTTATTCATTCATCATCACCAGTGTGGAGATTGAGCATGATGG
ACAAGTGAAAATGGTTGCTACATCCAAAGCTGGCAAAGTGGAAGCTACGT
GTGAGCTTTTAGTTGAAGGTAACGATGaatctgaaaaagaagaagaagaa
catgAAAACGAAGATTCCAAAGTCACTGAAGCAAAGGAATCAGAAGATAG
CAAAGAAGCACCAACTTTTAAAGAGGTCATCCAAAGTCAACAAGTGGTTC
AAGGCTCAAATTGTCGTTTTGATGCTCGCCTTGAAACTCACAGTACCCAA
ACCAAAATCCAATGGCTATGCGGGGAAGAAtcagtgacgtcatcaagatt
CAGTCACATGACTGTGGTTTCAGAAGATGACTTACAGTCTTTGGTAATCG
ATGACGTCAAATTGCTGGATACATCTCAATATACTTGCGTTGTCTCGAAC
GACTTTGGTCGATGCGAATGTTCAGCTGAATTACTGGTACTTCCTGCTGG
ATTGGATGGAGACAATTCAAACAGTCAATCAGGCTCAAGAAAGTTTTCGC
TCATTCCATTAACAACATACACAGTATCTGAAGATTACTATCCGAAAAGT
GAAGATTGCATATCTCTCAACAAAGATGAAACGGTGCAAGTGTTGGATAA
AAGCAAAGCGGATATTTGGTTGGTTCAAAAGTTAGATGGAAGTGAACAGA
TTGGATTTGTTGAACCCAAAGCCTTGAAAGAGGTTGAGACTGGAACAGTT
GAAAGAAAAGGTTCTGGTGATGCCAGCAAAGGAGGATTGGAACCCATAtt
ggatgaaaatattttgagtaTGATTCAAGAAGAGCAGAAGAATCttgttg
aagaagaaaaagttgaGCCAGAAGAAGAGaaacagcAATACATAGCTATC
GGCAACTATGAAGCAAAATCAGAAGAAGAAGTCAGCCTTACCGAAGGAAT
GATCGTCCTGCTGGTTGATGGTTCACTGAACCAAGAGTATTGGTTCGTAC
GTATTCTATTGGATGATGGGAAGCCTGGGTCCGAGGGCCTGGTACCGAAC
ACGTTCTTGCAACTGCTTGACGAACACCAGAAGGAAGAGGCTCAAGAGAA
ACAtaaaagtttagaacatttaGAgaaaatagTAAAAGAGGTGTTGACGA
CGGAACAGACGTATATTGACCAATTGAAAGAAGTTACTGAGGTCCACATG
GTCGAAGCAGATAAACATGATTCACCAATGAGAAATAAACAAGACATGGT
CTTTGCAAATCTTAAAGATATCCAACAATTTCATGCAACGAAATTCATGG
CAGCTTTGGAGAACGCTCACCAAAGTGGAAGTGACATTGCACAAGTCTTC
CTCGAAAACAGCGATGAATTGGAGAAGATGTATGTGTATTATTGCAACAG
TCGTCCGACAGCAGATGAAGTGCTCGATAAACAAGATATAATTGAATACT
GGGATGAATTCCAACAAAGTACAGACAGTCCTCATACATTACGTGCATAC
CTCATCACCCCTGTGCAGCGTATCACTCGATATCAATTATTGCTGAAAGA
AATACTCAAATACACAACGCGTGCCAATAAAGATTCAACCTGTGTCGAGG
ATGCGCTATCGAAGATTAGTTACATCATTCGACATGCAAATGATACAATG
CACATCAAACGTATTGTTGGCTACGAGtgtGATTTACCATTAGATCAAGG
TGGAAAACTATTGAAAATGGATACAGTCTTGACTTGGGATGGAATCAAGG
CTAAAGGAAAAGGCAAAGAGAGGCATTTATTCTTATTGGAGAAAGTTTTG
ATTGGTACTAAAAAGACTGAAGGCAAAAACAAAGATGACTTCTCATACAA
TGTCAAATTTCTTATGGAGATATCAGATCTTGGTCAGACAGAATTTATTG
AGAACTTCCCAACACGATGGGTATTATGGTCTGGAAAATCTGCAGCGTCA
GCAAGTATTCAGTACACTGTTGAGGCTAAATCTGAATTGGATAAAGATTG
TTGGGTGCGAGATATTCGTGAGATGTTAGCACGACAGCTAGCTGATCTCA
AAAACACACAAGGTAAAAGTTATGAGAAACCACCACAAAATGTATCACCA
GATACTGAAAGAATCAATTCACCTGAACAAATGTTTCCTGCCATAACGGA
AAAAATTGCCGGTAACGAGAGTGGAGTGTCAAAGATTGTGGATGATCTGA
CGGAGATTGAAGAGCAATACATTGCAGCGGAATATCCATTGCAACCTTTA
TCTCAAGAACGAAAGGGGCAGCTGATCACTGGTGAATTGTACCGTCTCAA
CGCTAATGCCAAAACCAAAGAAAACTTGTCTCATTTATTCAAAGCAGGAG
ATTTGGTCTCGCTTATTCGTGCAGGAACTACACTTTACCTCGTTGAACCA
GCTGGCTGTGAAGACCCATTCAAACGTACTTGGGTCCCAGGCTCTTTTTT
GGTTCCTTTATCAGAAAGTGTAGCTGAACTTGATGAAGAACAGGAGGAAG
acccACCTGTATTTATCAAAGATTTGACTTCGCAAACTGCTAAAGTGGGT
GAAAACATCACATTAGAATGTCAAGTTGTAAACAGTCTGATTGTCGAATG
GTTTTATGATGACATGCAAATCACTGTAGCCGAAGGAACTGAAATTGTCT
TCGATAGAGAGACTGGTATTACTAGTCTATCCATTGAGAATATTTGTCCT
GAAGACGCGGGAGATTATACTGTCCGCGCGATCAATGACGCGGGCGTTTC
ATCAAAATCAGCCCGTTTGAATGTGGAAGATATAGCTGAAGTGGATcttg
atgattctggtgaatataaATTTGTAGTTTCCAATGAATTTGGTGAATCG
GAATCTGTGGCAACTTTAATTGTCAATGGTGCAGAAGATGATCTTCAATC
TCCTGCTCCACCTGGTCAACCTTACTCAACTAAAATCACCGATCATTCAG
TTATTTTATCATGGCCAGTGAGTCCATCCGCTGACGTCACACATTACGTC
ATTGAATACCGTAACGTCGAGTATGGTCCTGACGCATGGAAATTAGCTTT
GGACAAGGTTGAGACAAATTCTTGTACCGTGAATGATTTAGCTAACGAGG
ACGAGTTTGTGTTCAGAGTGTTTGCTTATAACAAGACGTTGGCTAGTGAA
CCAAGTCAATCATCTGAAAAGATTCTAATAGAAGcACCACGCAAAAAGAA
GTCAAAGAAACGTGGTGAAGACACTAAATCACCGGACCCACAAGGCCGGT
TATCTCCATTTCAAAAGCGACGTCAATTCAAACAAAACGCAGGGTCCAGC
TCGGATGAAGATGATGACGATGATAGCGGGTCAAGAGGGCGTTTATCTCC
ACGTCAGGGTGGCCCTCTATTTACAGCAAATCGTAAGGGCGGACGTTCAA
GATCTAAGAGTCCAATGAGAGCCAAACAACAAATGATGGCGCAATCTCCA
GATGGTAAAGGAGCTCCATACTTCACACGAGAACTTGAAAACTCCTTCGT
CGTTGAAGGTGGGGCCGCCAAATTTATTTGCCGATGCCATGGAAATCCAG
ATCCAGAAGTCGTATggtacaaagaaaaagaaaaaatcgtcGAATCGAAA
CAATTCTCTATCTTATTTGACGCTGACGAAAATTGCGTGTTAATTATTAC
TCAGAGTAATCACGACACGGCAGGCTCTTACATGTGCGTTGCGTCGAATT
CGTACGGAACAACAAAGAGTACCGCTATGTTGTACGTTGAAGGACTGCAA
ACGGAGTACGATACAGAAACGGAAGACGAAATTTCGGACCCCGAACCACA
ACCGGAACGGGAACAAATCAACGTACGGAAAGATGCTGTTGAGAACCATT
ACATACTGAAAGAAGAATTAGGAAGGGGTAAATTTGGTGTCGTCACAAAA
TGCCAATGTAAAACGTCTGGTACCGATTTCGCTGCAAAATTCATTAAATG
TCGGCCGACAGAACGAAAAAACGTTTTAATGGAAATTGATATCATGAACT
CGCTTAACCATAAACGATTGATAAACTTAGTAGCAGCGTTTGAATCATCG
AGACAAATTGTGCTTGTATTAGAGTTGGTAACTGGAGGTGaactttttga
gaaattaaCTGAAGAGGAATATATTTCGGAGAAAGATGTGACTTTTTATA
TGAAACAAGTTTTACAGGGTGTTCAACATATGCATGAACGAGAAATTCTT
CATTTGGATTTAAAGcctGAGAACATCATGTTAGTCAATCCACACAGTAC
ACAAATCAAACTTATTGATTTTGGTCTGGCGCGTCGTTACAAGAAAGGAG
ACTCACTAAAAGTGTTGTTTGGTACACCAGAATTTATGGGACCTGAAGTC
ATCAATTATGACCAAGTTACCACGGCAACTGACATGTGGTCTATTGGTGT
TATCACATACGTGTTGTTATCTGGTCTTTCTCCTTTCGCTGGTGACAATG
ACTCTGAAACGTTGACCAATGTTACGTCAGGTGAATGGGATTTTGACGAT
CCAGTATTTGAAGATATCAGTGATGAAGCCAAAGACTTCATTATGGATTT
ACTGGTCATGAGACCAAGTGATCGTGCCACTGTCAAAGATTGTCTTGATC
ATCCCTGGTTCATGttcaaaaaattcaagaaaaagatcAGAACTGATCGG
TTAAAGGCTTTCACTGCTCGCCGAAAATGGAAGAAAACAATCACAGCAGT
CCGTAGTACAAATTTCTTAACACGCCTTCTTACGGGCATCAAGACATCAC
AAAACGCCACAACGCCCATTTCAGCGCCAACCACGCCACAATCAGAATTA
AAGAGAGAGGACAGTGCTCCCACCAGTCCGGTCTCAACCAGTTCATCAGG
ACCAGCCTGGAAAAGGGTTGAAGATTTGGAGGAATTTGATGCTCCTGAGT
TTGACAAGAAGCTTGTAGACTTGAAAATTCGACGTGGAGAAGTGGCTCAT
TTTCAGGCTACATTCCATGGAGTGGAAGATGAAAGAGACACACCTGAGGT
TGCATGGAAACGGGAAGGGCGTATCTTGAACGAATCTAAACACAACCATA
TGACAGTGATTGGTAATGGAATGCATTTAAAGATCTTGAACTCTCAACTC
GATGATACTGGTCGATATACAGTTCGTTTGGAGAATCAGCATGGCGCTGT
TGAATGTTCAGCTCATCTTATCGTCAGAGACGCCCCCTCACCACCTGCCG
CCCCTGTTATCACTCAAGTCCTTTCTACAAGTGCCCTTGTTCAATGGCGG
GCGCCTTCCGATGGGAACGCCCCTATAATGTCATACCGTTTACAATATCG
TAAACTAGGCGATCAGGAGTGGTCAGTCTTCTCAGACAGTATTCAACAAA
CAATCACAGTTGTGGAAGATCTTGAGCCTGATAGTTCGTACAGGTTTCGA
GTGAGTGCAACCAATGAAATTGGATCCAGTGAAATGGGTGAACAAACTGA
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ATGCACCGGGTGCCCGAAGGTTATCCCGATCACTCTCGATTACAGTACCA
CCTTCACGACTTCGGTCACGTACACTTGGATATGAGatcaaattaaaaga
aacaAACCCTGAAAACAATTACAATTTCAAGGAAGAAATCGGAAGGGGTA
AATTTGCGGTGGTCAAGAAAGTTGGCAGTAAGCACAGTGGAGAGACGTAC
GCCGCCAAAATGGTCAAATATGATGAAGATACGGtcgaaatcacaaaaaa
agaaTTCGATATTTGGAAAGATTTAGATCACGCAAACTTGGTGCTACTAC
ACGAATCATTTTTTGTGCGAAAATATCTGATTTTCATTTGTGATTTGGTC
AATGGTCAAGATGTATTGTTGTTTTTGGCAAATTTACCGTCACCGACAGA
GGATGACGTTGCTGGATGTATGAAACAACTCTTAGATGCTCTTGACTACC
TGCATCAAATGAATATTTGTCATTTAGATATTAAGCCGTCGAACATGGTG
ATGTTAGGGTCCATGTTGAAATTGATTGATTATGGCTCGGCAAGAAGGGT
GACGTCAAAAGGTGGCGAAGTTGGTGAAATGgtcggaacaatagaattca
tgTCACCTGAAATGATTAGTTTTGATGCGGTCAGCAGTAGTACAGATATG
TGGAGTGTTGGTGTTCTAGTATATTCACTATTGAGTGGATTATCACCTTT
CACCAGCGATGATGAAGATGAAACAATGTCTTTAATCACCGCTGTTGATT
ATCAATTCGATCCGCAAGTTTTTGACGCCATCAGCGAAGAGGcgaaaaaa
tttattaaaaaccTTATAGTGCGTATTCCTGAGAAAAGACCTTCTGCCAT
CGTCTGCCTTGAAGACCCATGGTTATCTGACGCATTAGAGAAAACTCGAT
TATCATCGGGGTTGATTCCGGACAGTTTATTGGAATTATCCGATTATTTG
GCGGAGCAAGAAGAAATGGAAAGTGTGCGCGCGTCTTTGGTTATGCGCAC
GTTTTTACAATCTCCATACGAATCGCCCGATGAGAGTGAATCAGAGGAAG
AGGAAGCATAGTATTCAGGTAGTCATCAACAACTTGTTGTTTGTCTTTGG
TATGACTGATGACGTCACTTCGACTACGTTGATCGACATCAGAACATGAC
AAAAATGGTATCTCTTCCTACAAAGCGAAAGTAGCTTACTGAGTGCCTGT
TCCTAACCAAATGTTCTGAAAGCAAAATGTCGAAAGTGATCTTACCAACA
AAGCAAGTGTGGGATGAAAGATAACAAAGGTTGCTCTTAGCTCTCTGTCC
TACCATGCTTACCTCAAGATTAGAGCCCAGTTCCTAACTAGTCGTTGCGA
ATGGAGAAGAAATCATCGCAAGGTTATCGAAGGGACGAAACAAATTCCAT
AAGCAAAGATGAAAGAGTAAactggaaatgaaaatgaaaattttagttaa
ttttatttttgtaaataaacaaaTTATGTTGAATTTCCTTATTGGATTTA
TTCAAATCATCTCAGAGGTGAACTTGGGTCCTCGTTTTATTGTAAAGAGT
TTTAAAAATCATATCGAACTAGTTTGCTGAAAAATGTCATTCTTTACCAG
CAAAtacaaaaagttttaatttctgTTTAATGATTATTTaatgttcaaat
ttttttctaaataattattttcccACTGAACACAGTagcattttttgcaa
aaaaaatatattcacaGCATaaattttttactattttatcgTACCGCAAA
AAAACATGTTAGTAATAGTATATTTTTGTATCGTTTTATAACCTTTAGTA
CGTATGTCCAGTATTTAAGAGCTTTTATTTTAGCCGCAAACCTTAAGagt
atataaatatttttttctcttaaacCATGTATTAAGATATTTTAATTTGA
TTACAATTTTTGTATGATAGAACCAAAATTattgattttagaatttttat
caatttttttattgaaagtaatttttttctttcacaatattttataaatg
gaATCCAGAAGAATTTTTCTATAACAG

transcript from alignment at scaffold_496:351945..407284-

Legend: exon

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>TCONS_00069241 ID=TCONS_00069241|Name=TCONS_00069241|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=55340bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_496:351945..407284- (Clytia hemisphaerica)
AACCGAAAGCATTACCAACAGTGAATGTCAAATTGCCCAAGGATGGAATT
GTGAATATCAAAGAAGGTGAACCATTTGAACTCAACTTTGAAGTATCTGA
TGACTCTAAAGCCATCTTCTACAAAGGTGATAATAGAATCGATGATATGG
GTCGAGCTGTTGTCACCAGAATGGGTAGAACCTTTAGATTCTACATTCCC
GAAGTCAAGGAATCAGATTCTGGTCAATACATCATGGAAGTCCAAGGAGA
ATCTGGAATAACCAACAAATCATTCAAAATCAAAGTACAAGGTATGCTCC
TCATTGATGCGACGTTAAAAACCAAGAATTTGTCTTCATTATTTAATTCA
TGCCACGTGTTTTCACAATCAAAACTTCGCTCTTAGATACGCACAAAATA
AAAAAATAATCTTTTATTATAGCAGGCTTTACCATGCAAAATGAACCAAT
CGAAAAGCTGTGATAGTGATAATATAATAGCGAAAATAACTGATAAACTA
CTGAAATTTGACTAATACATATGCAGCTAATACACATACAATAATAGATA
CACCACATACACATGATACACTATTATCCTCCTCTACATACATTTTGCTA
GTTGCACGTTCGTCACTCTAAAATCTTCGATCATAAACACACCTAGGATT
GGGTTCGAGCTGACCAAGGCCGTCTGTCAGACGCAAAAACATCCAAAATT
TAGACCAACAGAAAGTCATTGCTTCAAGTGTTCGAATTCATTGCATTGAC
GCATTCCCAGCTAAAGGTCATTTCACGGTCGAAAGGAATCATGGGTAATC
AGGACCACTACGCTCTGATAACGACTTTCTGTTGGTCTAAATTTTGGATG
TTTTTGCGTCTGGCAGACGGGAAGCCATTATCCTTATCGCTAGCCTTATC
AGTTTATATTACTCATGATTTATTTCGACTGTTAAATGACCTATAAAGCC
TGAGACTTTTGGCTCTTGTGAACTGGAACGAATACGCTTTAATTTCACTC
TTAAGGTTCATACTGTTGGTGTATTCAATTCTCAGGGGTTCAGTTTTTTC
CATGTAATTCTAGGAAGAGGAATAGATAGATGTATCAAAAGTTGCATTTA
AAACAAAGGTATTTGTCTCAATTGTAGGAAAACCAAAGAAATCACCCATC
CCGACCATCGACGTCGACCTTCCTGACGAACCAATCAAAAAGAGGGAAGG
TGACAAATTTGAAGTCCGTTTCAAAATCAGTGGCCAACCACACCCTGAAG
TCTTCTTTTTTAAAGATGAAAAACCCATTGAAGAAAAATCGAAGAAAGTT
CTCATCAAGCGGGAAGGCGAATATTATAATTTCACCATACCGAGACTGGA
ATCTTCAGATTCTGGATTGTATGTTGTAGAATGTGAAAATAAAAATGGTA
CCGTTGAAAAAGAATTCGAAATCGAAGTCGAAGGTATTCATCAACTTCTA
TATCATTTCGTTAAATTAAAGAAGTTTTGGTTTTCTGGACATGGCCTGCT
TTGATTTGTCAGATGAAAGAGGGTTTAAACTAAAAAAAAGTCCATGGTCA
TAATAATTACGGGCTGATATTTGTGTGGCATATCAACTAAAAGTTGCTAC
AGGCGTTACTCGAGAGATAAATCCAATATAAACTATCATTGTAAAAATGA
GCCCTTCACGCTAATGGTGAATCAATGGTAAGAATTGATATGATGAAAGT
TAAACTCGATATTAATTCTTGATTTCAGGCAAATCGAAAAAAGCTCCAGT
AGCAGCACCAAAACCACAACTTCAAAGTTTGGTGAGCGCTTCAACTAATC
CCAACAAACCAGCATTCAAGATCAAGTTACAAGACATTGAAGTTGTTTCC
TTCAGTGCTGTCAGATTCGAAGTCGTCGTTAAAGGTGAATTTTTGATTTT
CAAAATGGTAGAAAGAGTTGTTAGCGACTCCATAAATAAAATAGGCGTTC
ATACGGCATGCATTTTGATTTTTGGGGACATGTCACATGTCATACATCGG
GGTTTTTCCAAGCGGAGAAGAACTAGCTCTGTTGTTTGTTGTTTTTTTTA
CTTTGTCCGCATTAGAACAATTGGAACAGTGTTTTTTACTATGTTACATA
GTATTCGATTTTTCAGTGTTTCAGAAGCATATGGAATTTTTAAATTAAAA
ATATATCTATCTTCTTCTTAACACAGGTGACCCTGAACCAGAGATCACGT
GGTATAAGAACAATGAAATTATCGACGATGACGATCGCAACTTTTTACAA
GAAGAAGAAGAAGATGGAACTTGCGCTCTTGTTATTCGTGAAGTATCCAC
TAACGACCGTGGTACTTACAAGTGTATGGCTAAAAATCGTTTCGGTAAAG
CCATGACCACTGCTGAGCTCTTCGTTGAAGGTATATATAAGTGTTATTTA
CACAGCGTTGTTTCAACGTTCATCTAACGTTCTGTGGACCTTGTATAAAC
GTTAGATTAACGTTGAAGCAACGTTTGCCAGGCTGTCTAGTATTATATTG
TAATATAGTCTGAATCGCAGACCTCTACTAAACCGCTGGTAGTTTATAAG
GAGCACGAATCCGTTAGAGGATACCAGCAGCCTAATTGTAATGTTTTTCT
CCCTTCCTTCTGCAAAGTCAAAGACTTATTTACACATCTATCGATGCATT
ACCTCCGTCTCTTCGCAGTTACGTTTGGTATAGACTTAGTTACGAAGAAG
AGTTTTTGTCACGAAAGACGTCACCATGTTACTTATTATTCTGAACATTA
CGATTAAAAACCTCATGTTTCAATTTGTTTTTATCCATAGATCATGGATT
TGAGTCTGACGATTCAGAATCTGAGCTTGGTGGACGATCGTTGCCAAGGT
AAGAAAGCAATAAGCAGATAAAAAGACAAAGAAAATAGGAGAATGCCGTA
GAATGCATGCTTTTGATTGTTTCTTACATTTAAAAACTGTTTGACAGGAT
TCTTGATCCTCACACTTCGAGAGAGTCTCCTGTATGAACAGAAACTCTTC
TATAAAACGCTTCAGTAGAATCCCCATCAAAGGGAAATCCTTCGGGTCTT
TCGAGCTGTAGAGGTCCGACTTGTGAAAATCAAGGTTGATGTCAATTCTT
TCTTTTCAGAACTGATGATGACGATCTTACAGATGATGACCTCTTGGATG
AAGAAGACGAACTCGATCACGCTCAAATCATATTACCCATGCGTGACCGT
CACGCTACCATCGGCTCCTCCGCTAAATTTTCATGCCGTGCACAATCCAT
TAAACCCCACATACCTGTAGAATGGTACCACGATGATAAACCAGTCGACC
TTGGTTGTGGACGTATAAAAGCTGCCGTCGCCGAAGAAGGAGAACTGTTC
ACGTTGAACTTGAGGAATGTACAAATGTCAGATGCTGGCAAATATAAGAT
CGTCTTCAAATTACCCAACGAGACGTTGACATCGAGTGCTAACCTTAATG
TTGATGGTATGTTTCTAGACAATTAAGTGCATGCTGTGTTTGTTCGTTTG
TTTTGTTTGTTTTGTGTTTATTTTTTGTTAGTATCGCGTTGTGCTCAATT
TGCATTGTTGACCAACTGACAACCTCGTTCCCAGCGTCTAATCAACTTTT
CTACGTTTACTATGGACGCCGGAATATACCCTCTGGCGTATATCAGTAAA
TTATTAAGGGCTACACGGGACGAGGTTAAGCGAGTTACTCTAAATATTAT
TATTACCTTAAGACGCAGCTCAATCAAGAAAAGTGCACAGAACACTGCAC
AATTTTTTTTATTTTTTTTCACCTTTTAACGCATTACTAATAATGACATA
CCTAACATTAACTGCACTCAACGTCTTTGTGTGTATGCCCATATTTAGAG
TCGCATGATTTATTGTATTTTTCTAAGTTGGCTTGAAATGAAAGCTCATT
CAACCGTTGAAAATATTTTTTGAAAATGTTCTTCTTTTTCAATTTGACAG
AGGGTCGCAAAACAGAATTTGGTGTTTCAAGCCGATCTTCAGATACGAAG
AAAGAGCCAAAAGCAACACCACCAAAACCCGCCCCCAAAACACAAAGGAA
ACCAGGCCAAGAAGAACCGACTTTTGTTTTGGAACCAAAAGATAAAACAG
TCGTTGAAGGTTGGTAAAGACTTTTTGTCCAGTTAATTTTTATTGGCGCC
TTATTTTCAGAGGCGCGTGGGTGTTTTATAATGAAAGATATTTCAGGCAA
AACTTCGGTAAACATTTAACTGCGCTCTGGCAATATATAGGCAATGATGT
ATTATTATGACCTATCCCTAACATCTACCGACAAATGGAGGCTTCGTGGT
TATGTAAGCTTATCTCTGTTGCACATGTCACGCGAAAAAGCAGAAAAAAG
CATTTTATCGCAGTTTCGAATCAAGATTCTATTTGCTAAGAAACGAAATT
TTCGATAAATGTCACTGACCTCTTTTATGTAAAATCAAGATAAATTGCTC
CTAAACTGGATAAGTCAGATTAATCCCTTTTTGAAAATTAGTATAATTCT
TTTTTAATGCTCAGTTCAGACGGTTTTGAAACTGCTTAAACATAGTTTGA
ATGTTACATTGGCGTGAATAATTTTGTATACTAATTTCTTTAAAACTGTT
AGAGTTTCACGGATTCAATCTATGCTTATCAAATTCGGTAACATTGACTC
CATAATCTATGGTCCATTTTCTTTAATTGTACACGCTCTTTTATGCTACA
ATGTGTAAACCATGTCTTTGTGATCGGGCTTATTCCGCTGTGATTGGTTT
CCATAGGATTGCAAGATAATTGTTCACTGTTAAAGCAAATGGACTTGACT
TGAAAAAAAACGACCTTAGACCGTTGCAGAACAGTTTTGTTGTTACTTAA
TAGTAATGGATTCTCAAATATCTTTCCTTTGTTTAATTTCACAGGTAATC
AGCTGAAATTAACAGCCAGCGTTAACGGTAAACCAACACCCTTAGTTGAA
TGGTATAAAGAAAACTCATTACTTAAATCTTCCTCTACCATTGATATTCA
AGCAACGAGGAACCTACATAACATGGTAATAAGAAAGGCTACCACGAAAG
ATGCTGGCGTTTACAGATGTACTGCTCGTAACGAAGCTGGACAATGTACT
GTCGAAGTCAACATCAAAATCGATACTAAATCCAACAAACCTAAATTATC
GCCAAACCACCCAGCATTTACGAGAGAATTAGAGGATTTTTACGAAGCTG
AAGAAGGAAACGATGTCGAAATGAAAGTCGAATTTACCGGCAAACCGAAA
CCACGAATCCATTGGGAGAAAAATGGAAAGAATATTGTCTCGATTAAACG
TGTCAAAATACACGAGGAAGATGGAGCAAGTCAATTGTTGATCAAGGCAT
TGAGAGACACTGACTTTGGTGATTATTCGTGCACCATTTCCAATTTCCAT
GGCAACACGAAATCCACTTCATGTCTTCGATTATGTAAGTTAACTAAAGG
ACAATTTTACAAAAAAACTGTTGGGAATAGAGAGATTATCAAGGCACTAA
CTTTATCAAATTTAGTTTAAATACTTTGGTACTAAGATAGTACTATAACA
CCAATGACCCTTCAGTTTTATTTGCACTAATGATAGCTTATAAAAGTAAA
ATCTTAAAGCCCCAAGAAGTGGGTGAAACTTATGAATTTGAAACGCCAAA
ACGGTCAATAACTCATTGTTTATTGCACAAGAAACATCTTATTGTTAAAA
TTCAACTTCTTCAATGCCACTCAAGAAAGTAGAACTCGTATTCATTTTTA
TAAATTTCCGATACTTTCTTTGTTTTCAGGCTCTGATGGTACACCCGACA
TTCACATAAACACGCCCTCTCCACCACCACCCCCTATTTCTTCCACAACC
AATCAAGAATGTTCTAAGTAAGTACCCTAGATTATTCTTCTTTATGATTT
CTCAAAAAAATAATCCAGATTTTAATCATCTTCGTTCGATTCGGTATATT
GTTGTGCTGTGTATTAAATCGTCTTATCTTGGGGTAACATTATAGACAGC
TTTTGTTCCAGAATCCTTATTTTTCTAAGTAGTGCGGTTTTGACTGTCGT
GTTCGATTTAGAAATTATTAGGACGAGCAATTATGACGTCATCAATTTTA
AACTTCCTTCTTCCTCTTCCTTTACTCGCTTTCCTTTGATTGCGCAATAG
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TAGATACTAAATAGATACATCACCTGAACCAAAAAGAATTCCAAATTTTT
TGATTTTTACCGAGATTAGGGCTTTGAAAGGTGAAATACTCTTCTTCGTA
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TACTTTTTATTTTGTCCTTTGATTCCAGGTAAAGGAGCTCCATACTTCAC
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TTTGCCGATGCCATGGAAATCCAGATCCAGAAGTCGTATGGTACAAAGAA
AAAGAAAAAATCGTCGAATCGAAACAATTCTCTATCTTATTTGACGCTGA
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GGAAAGATGCTGTTGAGAACCATTACATACTGAAAGAAGAATTAGGAAGG
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GTGGAAACCACTCCCAAGGAAATTATTCTGACTACGATGGCATGGTTTCC
ACATTGTAGCAAACAAAAGTACACACTTAAAAGCGGATAGGTTTTAATCA
TTCAACTGTTTCTCCTAAAGTTAAACTTTCCAGTGAATATATATGGCTAT
GCTATTGTGTATTTTTGCCTATGATGTAAAGAAAAGATTATCCCTACCTT
CGGGAAGATATTTGCACTGTGACTTCTCCCGACAAATTCGATCTAAGAAG
ATTTGAAATATTCTTATTTTTTCACTCCACACTTGAAGTCTTTCTACCAT
TGTTTTACTTCCCACGACTCACACCTTAACCCAGATTAGATTGAATGAAT
CTTTGATTTAGATCTGGGAAATTTCATTCAGGCCATTAGCTCAACTTTTT
ATTCCATCTTTATCTTTACAGGGGTAAATTTGGTGTCGTCACAAAATGCC
AATGTAAAACGTCTGGTACCGATTTCGCTGCAAAATTCATTAAATGTCGG
CCGACAGAACGAAAAAACGTTTTAATGGAAATTGATATCATGAACTCGCT
TAACCATAAACGATTGATAAACTTAGTAGCAGCGTTTGAATCATCGAGAC
AAATTGTGCTTGTATTAGAGTTGGTAACTGGAGGTGAACTTTTTGAGAAA
TTAACTGAAGAGGAATATATTTCGGAGAAAGATGTGACTTTTTATATGAA
ACAAGTTTTACAGGGTGTTCAACATATGCATGAACGAGAAATTCTTCATT
TGGATTTAAAGGTAATTTCTTTAAAGGGACAAGCAAATAGTTTCATGATA
GATAATTTAGATTTTTGAAATTTTTTCCTTTTATACATGACGTTGTATTT
CCAAAAGCTAGTATATCAAATTTGGAAAACTTAGATCAGCAAATTGGGAA
GTGGAACTCTTGAACCAAATATCATAATAGCCAAATATCAAAAAACTATT
TAATTTTCCATTAAATTTCTAACAAAACTCCAATACATATACGTGTAAAC
CACTGTACGCATTAGAATAAGCGTGCACTGTCTATCACTTGTTAAACCAG
AAGACCAAGAAATTTTCCCTCGTTAGCTGTTTTCAATATTCAACTATGGC
TTAAGGTTCAAGACTAAATATTGAACGCCATAAAGTAACAATACAACAAT
GCTATATCCATCATGTATATAAAATTTCATTTTTTAGCCTGAGAACATCA
TGTTAGTCGATATAAAATTTTATTTTTTAGCCTGAGAACATCATGTTAGT
CGATATAAAATTTTATTTTTTAGCCTGAGAACATCATGTTAGTCAATCCA
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CATTAAGATTACAATTTTCCAATGTTTAAAACTGCCAGGTTACCTTGTTT
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ATAAAATGAAAGGTTAATATATAGGCAAATTTTTAAACTGCTGGAAAACT
TACACGCTAGTAAAGTTTTTCTTGTAGAAAGTAATTCGCCTACTAATTTT
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ACCTTATCGGCCTTTTTAACGCGCCCAAAAATAACGCCAATAAGGGCTGG
TATAAAAAGCGCCAATAAGGTAGTAGAAAAAGGAGGTAAATGACCAAAAT
GCCGACAATAGGGGTGTACTCAGAAGAGAAGTGAGAGAAGTTTCCCTCAC
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TCTACTTTTACTATTACAGTGATCGTGCCACTGTCAAAGATTGTCTTGAT
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TCAAGAAAAAGATCAGAACTGATCGGTTAAAGGCTTTCACTGCTCGCCGA
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GCCCTGGCCTCCGTTGTCATTATCCTTCGTCACACTTTGCAAACACAACT
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TCAGAATCTTCAAACAGAATTTAATAATTATCCTCATTTGTTCGACTGTG
ACAGACACTTTTGTAAACCATATATATCGGCTTTTTTCCGACAGGTGGAA
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


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Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00069241 vs. Swiss-Prot (Human)
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            A N YGT++ +  + L   G + E + + E E+SD    EP+ +   + +  +  V + Y ++E LG GKFG V +   K +   +A KF K     E++N+  EI IMN L+H +L+  V AFE    IV+VLE+V+GGELFE++ +E++ ++E++   YM+Q+ +GV+++H++ I+HLDLKPENIM VN   T+IKLIDFGLARR +   SLKVLFGTPEF+ PEVINY+ +  ATDMWSIGVI Y+L+SGLSPF GDND+ETL NVTS  WDFDD  F++ISD+AKDFI +LL     +R     CL HPW M K  K    KK+  DR+K + ARRKW+KT  AVR+   L+   +++G+   +++T    +PT+P +  K E     S     +       V+       P F K + DL++  G  A F     G  D    PEV W ++ + + ES+H  +    +G   L I +   DD  +YT +  N  G   C+A LIV
Sbjct: 1406 AINVYGTSEPSQESELTTVGEKPE-EPKDEVEVSDDDEKEPEVDYRTVTINTEQKVSDFYDIEERLGSGKFGQVFRLVEKKTRKVWAGKFFKAYSAKEKENIRQEISIMNCLHHPKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFERIIDEDFELTERECIKYMRQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGTRIKLIDFGLARRLENAGSLKVLFGTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNETLANVTSATWDFDDEAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLDCTQCLQHPWLM-KDTKNMEAKKLSKDRMKKYMARRKWQKTGNAVRAIGRLSSMAMISGLSGRKSST---GSPTSPLNAEKLESEEDVSQAFLEAVAEEKPHVK-------PYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPD----PEVVWFKDDQSIRESRHFQIDYDEDGNCSLIISDVCGDDDAKYTCKAVNSLGEATCTAELIV 1899

HSP 2 Score: 218.394 bits (555), Expect = 2.389e-56
Identity = 151/493 (30.63%), Postives = 264/493 (53.55%), Query Frame = 3

Query: 8118 DLKIRRGEVAHFQATFHGVEDERDTPEVAWKREGRILNESKHNHMTVIGNGMHLKILNSQLDDTGRYTVRLENQHGAVECSAHLIVRDAPSPPAA-PVITQVLSTSALVQWRAPS-DGNAPIMSYRLQYRKLGDQEWSVFSDSIQQTITVVEDLEPDSSYRFRVSATNEIGSSEMGEQTDLVKTLAEDEGSKRESIDAPGARRLSRSLSITVPPSRLRSRTLGYEIKLKETNPENNYNFKEEIGRGKFAVVKKVGSKHSGETYAAKMVK-YDEDTVEITKKEFDIWKDLDHANLVLLHESFFVRKYLIFICDLVNGQDVLLFLANLP-SPTEDDVAGCMKQLLDALDYLHQMNICHLDIKPSNMVML---GSMLKLIDYGSARRVTSKGGEVGEMVGTIEFMSPEMISFDAVSSSTDMWXXXXXXXXXXXXXXPFTSDDEDETMSLITAVDYQFDPQVFDAISEEAKKFIKNLIVRIPEKRPSAIVCLEDPWL 9575
            D K+R GE         G +    T    W +  + + ES+H  +    NG  L IL ++ +  G YT+ +EN+ G+ +   +L V D P PPA  P  + + S+S  + W   S DG + + SY ++     ++ W   + + + T   V+DL PD  Y+FRV A N  G+SE  ++++L  T+ E     ++ ++               P    R+ T+  E K+ +      Y+ +E +G GKF  V ++  K + + +A K  K Y     E  ++E  I   L H  LV   ++F  +  ++ + ++V+G ++   + +     TE +    M+Q+ + ++Y+H+  I HLD+KP N++ +   G+ +KLID+G ARR+ +  G +  + GT EF++PE+I+++ +  +TDMWS+GV+ Y L+SGLSPF  D+++ET++ +T+  + FD + FD IS++AK FI NL+ +  + R     CL+ PWL
Sbjct: 1246 DQKVRAGESVELFGKVTGTQPITCT----WMKFRKQIQESEHMKVENSENGSKLTILAARQEHCGCYTLLVENKLGSRQAQVNLTVVDKPDPPAGTPCASDIRSSSLTLSWYGSSYDGGSAVQSYSIEIWDSANKTWKELA-TCRSTSFNVQDLLPDHEYKFRVRAINVYGTSEPSQESELT-TVGEKPEEPKDEVEVSDDDEKE-------PEVDYRTVTINTEQKVSDF-----YDIEERLGSGKFGQVFRLVEKKTRKVWAGKFFKAYSAKEKENIRQEISIMNCLHHPKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFERIIDEDFELTERECIKYMRQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGTRIKLIDFGLARRLEN-AGSLKVLFGTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNETLANVTSATWDFDDEAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLDCTQCLQHPWL 1719

HSP 3 Score: 92.8189 bits (229), Expect = 3.392e-18
Identity = 44/94 (46.81%), Postives = 57/94 (60.64%), Query Frame = 3

Query: 6666 PYFTRELENSFVVEGGAAKFICRCHGNPDPEVVWYKEKEKIVESKQFSILFDADENCVLIITQSNHDTAGSYMCVASNSYGTTKSTAMLYVEGL 6947
            PYF++ + +  VVEG AA+F C+  G PDPEVVW+K+ + I ES+ F I +D D NC LII+    D    Y C A NS G    TA L VE +
Sbjct: 1809 PYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPDPEVVWFKDDQSIRESRHFQIDYDEDGNCSLIISDVCGDDDAKYTCKAVNSLGEATCTAELIVETM 1902

HSP 4 Score: 85.1149 bits (209), Expect = 7.036e-16
Identity = 40/94 (42.55%), Postives = 61/94 (64.89%), Query Frame = 3

Query:  675 KPAFKIKLQDIEVVSFSAVRFEVVVKGDPEPEITWYKNNEIIDDDDRNFLQEEEEDGTCALVIREVSTNDRGTYKCMAKNRFGKAMTTAELFVE 956
            KP F   ++D+EVV  SA RF+  ++G P+PE+ W+K+++ I +  R+F  + +EDG C+L+I +V  +D   Y C A N  G+A  TAEL VE
Sbjct: 1808 KPYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPDPEVVWFKDDQSIRES-RHFQIDYDEDGNCSLIISDVCGDDDAKYTCKAVNSLGEATCTAELIVE 1900

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00069241 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00069241 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
MYLK	2.078e-94	42.16	Myosin light chain kinase, smooth muscle OS=Homo s...	[more]

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TCONS_00069241 (transcript) - C. hemisphaerica