TCONS_00069000 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00069000
Unique Name	TCONS_00069000
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	8415

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_491:343950..387545-

transcript sequence

>TCONS_00069000 ID=TCONS_00069000|Name=TCONS_00069000|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8415bp
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CACTATATGAAAGATGAGTTCGTTTATGCAAAGTTCAGCCTTCATCCATG
GTTTATCTCGATTGAACGGAAAATGGGAGTTAGTTCAAATCATCGGTGAA
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ACCACCGACTGTCAAAAAACCGGAAGATTGGTCTCCAGTCTTCATGGACT
TCCTCGCTCAGGCTTTGATCAAGGATTTCGAGTATCGCCCTAAAGTTGAT
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GaATCGAAAACTACTTATGGCTCTGATTCACATTAACTTGAAAATCACTG
AGAAAATTGACAAGACTTCTGGCACGCTGGAAGCTAAGAAACGAAATGCA
CAGAAGAATGCGAAAGTTATGGAAGTTGATGATCTGGCAAAGTTACCGAG
ACTGAATGAGgaaatcatgCTTGAATATATAACTGAAAGATACAATGCAG
ATCAAATTTACACATACGTTGGTGAAATCCTGATTGCTTGCAACCCGTTC
ACTGAGATGGATATCTATGGTCCCGGTGCATCAATGTTGTATCAAAACTC
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ACCACGCTATGCAACACAAACAGATTGATCAGTGTTGCGTGATCAGTGGA
GAGAGCGGTTCAGGCAAAACAATAACTGCTAATCTCCTTCTTAAACAATA
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TCAACACGTTAATGGAGGCTTTCGGCAACGCCCAAACAACCATCAATCAG
AACTCATCCCGATTTGGAAAATTCCTTGAACTTCATTTCACATCATCGGG
AGGTTTCGTTGGTGCTCAGGTCTCTGAATACCTTTTAGAGAAGTCACGTG
TTGTATCTCAGCCAACCAACGAACGgaattttcatatcatgtaTTATTTG
ATCGCTGGATTGGACTTTCATAATAAGTTGAAAGACTTTGAGTTGACTAC
CAGTGACAGCCATAGGTATCTTAACACCGACGAATGGTTATTATCTGAGA
TTGCATGCACATCAGAAATGCAAGTTAAGTTTACCGAAGTACAAGCTTGT
CTAGAAAATATCGGATTCACTAAAAAAGAGATACAAAGCTTCTATTGTGT
TTTGGCAGCGATTATTCATTTGGGAGATATCGAATTCAGTGTCGATTCAC
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TACAATCGCTTGTTCACATGGATTGTCAAAAGAATCAATTCTTTGCTTCG
TGCTGAAGACAAAACACAgaCAACTCACTCGCGTATTAGCATCTTAGACA
TGTTTGGATTTGAGAATTTCGAAGCGAATTCATTCGAACAACTTTGTATC
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GTGGGAATTTGAAGAATATGCTACGGAAGGGATCAAAGCAGTTCCATTTG
AATTCAATAATAATAAACCTATACTTGATCTCAGTTTGCAGAAACCAGTT
GGTATTTTAGCATTACTTGACGAAGAAAGTCGTTTCCCAATGGCTACTGA
CATGACTTTAGTCGAGAAATATCACGACAATATCGAATCGCCGTATTTGA
AGACATCAAGAGACACCAGTTCATCCTTCCTCATCAAGCATTACGCCGGT
GATGTGAAGTACGACTCAACAGGTTTCCTTGAGAAGAACCGAGACACGTT
GTCTGTGGATGTGGTGGAAACTATCCAGGCTAGTTCGGACGAAACCATTG
CTCAATTGATCGAAGAATCTGCCGCATCCTTGCTTGGCCTTGAGAAACAT
ACTGACAGGAAGAAATCACTAGTAGCAACTACCAACCGTTTCCATCAAAC
CGTGTCAACACATTTCAGGTTATCCTTGAGGAATTTGATGTCGAAAGTCA
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AAACCCAATGTAATTATACCAAGCATGGTGCTGAACCAACTTCGATGCAC
TGGTGTTCTTGAAACCATTAATATTCGACAAAAGGGTTATTCAGAACGGT
TACCATTTGAACAATTTGTGGAGCtTTATCGATTTATAAGCTACCAATAC
GTAGACGTCGTACCTCGAGATAAGGAAACTTGTCTTCAATTGTTGAGAGC
TTCCAACATTGACCCTGAAGAGACGTGGGGAGTTGGTAGAACAAAGATCT
TCTTGCGTTACTGGCATGTACAAAAGTTGCGGACTCTCAAATCTCACTAT
AATGATTCCGTTGAGCTCGTTCAAAGAGctgTTCGTGCATGGACGTCTCG
TTGCAGTATCcgtaaatttttgaattttcgtcACGATGCCGCCAAAATCA
TTCAATCGAATTGGATAAGATTTAAGAGAAAACGcgattttgaaaagttg
aaacaaGCCATGACTGATGAAGTTAGTAACCAAAGAGACTTGAATCAGAA
TACTGGAGAAGCAGaggTGCGTCCATTTTATCGAAACTACCAGAGAAGTG
AAATTGGTTATACTGAAGATGATTCAAAGGCTAAACGAAGCTCTTCCTTT
GCTAATGATGTACTAAATCAAAGTACAAACGGTGGAGCAGCTGTACAACA
AAATGATTTGGATGGAATTGATCCCGATGGACGTGCCGCGTTGGAAGAAA
CACGCGCAATCATTCTTTTACTACAGATCGAGTTGACTTGTCGAGAAGCA
TACGATATCTTGGATCGGACTTCTTACCCTGTAATTCATTCAATTCGCAA
TAGCAACCAAGGAGGAGAAAGCACACCGAAACTCAAGCCACAAAAATTGA
ACTATCGTGAGAAACAAATGGCAATGGTTGATGGGTACAGCAATCCTTTG
CAACAAAAATTCAGACATGCGCATGTTCACACTGAGAGCCAGCCAACAAT
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AACGCCCTACTCGTGAGACCGCCCAATATGCATCACCTCCAGCGACTGTC
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AATcaagaaaaaagagaaagcGCCTAATACTCAGAATAAGGCGGAGAAGA
AAAAGAGTTCACCGCCCTCATCAGTGAACAAAAAAGTTGATAATTATCCT
TCGAAGACAAGACGTAATTCGGTACCTGTTAAGCCGGTATCCATAGCAAC
GACAAACCGCTCCAAACCACCTGTCGAAGAACGCAAACAACCACCTTCCA
TTAACAAAAGAGTCAAACCACAACAACCACCAGCCAAAATAAATACTATC
AACAAATCAAAACCTGTTCTAGTTGAAAAGCAGACTCCACGCACCAAGCA
ACCCTCTAACAACAGTGTGAACAGGGTAAAACCGGTAGCCGATAAAGAGA
ATGGAGGACCTGTCTTGAAACCAGCAAATATTAATAGGAAGCCTCCACCT
AAATCTCAGGATGAGAACATACCAAGAACAGGAAGCAGCCAACGAGTTAA
ACCAGTACAACAACCGACCCGAAAACAGAATCCACCgACTTTCGGTTCCG
AGAATCGCGTCATGAAAGAAAGGGCATCTTACGAGGACAGAATCCGTCGT
AACACACGAAAACCTGATGAAAGTTTATCACGCGTTAATCCGTCCGTAAG
CCGAAACTCGTCGTTCGCTATTCCGACATCAGCACCAAAGGACCGACAAC
GTTTACCGACAAACGCCGAGAGTGTTCACCGACGCTTCAAGCAACCCTTA
CCAAGTACTAATAACCATAAACCATATAATTATCTGAGCAATAACCGACG
CGATCAGAGTCATTTATTAAACCACGCCCCCATAGACGGTTTCAATAATA
ACCCAATCAACCACATGGCATACGAGGGAGACCAAAGGAAACGGGCGTCA
CCCGTCGCTAAGAGGGTGCCAAAACAAAACCCACCCGCGAACGCCCACGT
ACCGACTGAATATTCACGCAGTAATAATCCGATTCATAATTTCCAAACTC
CGAATAATGGAAAGAAAGTGCTTCACGGTTTCCATTATGGATTACAAAAA
GAAAGCGAATTATCTTCGATGAGATTAAATCGAACGGGAAGGCTCCAACA
GCTCGTTCATTGAGAGTATAAATTGTTTTTGGAAATTGGAAGAAAATATA
ATGACTTTTTAAATGACGTCGGCTTACGCCAAGGAAAGAACTCGACTCGT
ACAAATGAACGAATTCATAGATAGGATAGGATCTCATAAATAGATATTTC
TCAAGATCTATGataaaatcgaaaatttcaaaatggtgcTACTGTTTGGC
ATTTCATAATAATTAGATAAACGACCAAGATAAATTATAATGTAGTACAT
TAACTTAATATTAACTCATACAAGtattttaaataataaaatttacgttt
aaattatttaataatgaaaaaagataatcGATAAAAAGAGCGCTTAAATC
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AGGTGGGTATCttcaattctattgtttttagtTTGTAGTCTATTCAGTAT
GGTCACTCAGGGCATTGGGATTTCCCTATCTGAAATCATTTACTTGATCT
TAACCCTAGCGTGTAGAGGGAAATGGTGGCAACGGTGCTCCAAGCTGGCA
AATATAAACGTCAAAATCTAATTTCGAATCCTGTCTTTtagttcactttt
ttatgattctgatagcggtCACGAAAGTCCATTGCTGtgatcagtaaaat
caaaaagtggctCTGACTACGAGATTGGTCAAAACCATGCCCATTTAACT
TCAAATGGGCTATGAATAAGACAATGGTGTCATTGACGATCAATTACCTA
TCTTTAATTGGTTATGATTATCTTTATTGTGGATGTATGAAAATCAATAG
TGGCTTTCCATTCATTCCATTTATCATTGTGCTGAATAAGATGGTCTTTT
gataaatcgaaaaaaaatcttgttTGAAGATTTAAACAGTAAACAAACCA
AGAATTACAGAAAAAGTTAATGTTGATTTGCAGCTCTATGTGTATGTTTG
TACTTTGATTTTGCaaacaatttttcttgttttttttttatgacgtagCG
TCAAAATAAACAATGTGAAATTGAGGCTCAAGTAAGCCTAAAACTAAATC
AAGGACAATGATTTAAATTTTTACCTCTAAAATATTGAATCTTTAAACTC
AATAAAACTATAATTGAATATGTCTAACAATTTATCACAATGGATACTTC
TTCTTGGGTTGCTTGTGTCGCTTTCCTTGGCTAGCCACCACCACTACCAC
CACCATAAACGACACCATCACCACCATCACGCCCATCATAGATCAAACGT
CACCAAGGGCGCTCAACGCCCTTCATCATATCCTGATGACGAACATAGCT
TAAGAAATATACAAATGCAAGATTTGATCGAGGATGATGAtgaatttttt
aacaaactgaagaaagaaaaagcGATGGTGATACCCACAGTTCTCAGTGA
TGCAGGTCCAAAAGCAGCAAATATGGCGGATCTGGAAATCGAACATTTAG
CTGAACAAATTCCTGAATTCAAAGATAAGACTGTcgcaaaatatttcaag
aagtCTTACCGAGAAGGTGACATTGAATCAACTGAAGATTTTAAAGCCAT
CATCAGTGGTAACCTCTCACCGCAAGATCTCGAAGAATTACGTAAGAAGT
TAAAATGGCAGGTAACGAAAGACGAACATGGGAAACCCATGGTCAAGATA
CCATTTTTAGTGAGAAATCTTGGTAAACAAGCAATCGAATCGATCAATCA
AGCAATCGAGGATTTGAAACGTTTTACATGTATTCGATTGACTCCTCGAG
AAAAAGAAGATAAGGATTATGTACAGTTCCTACCCAGCAAGAAAGGATGC
ACATCACATTTCGGTCGTCAAACTGGTGCTCAACGAATAGGACTAGGTGC
AGGATGTGAATACAAGGGGACTGTGCTCCATGAAGTCATGCATACCTTGG
GTTTCCTACATGAATGCACAAGACCAGACAgaaATAGATACATCAGAGTG
AATTTCGACAAAGTGGAAGAAGGGAGGAAACGAAATTTCAAGACATATGA
TCATAAAATTATCACTGATTACGATGGACAGTACGATCCATTCTCCATAA
TGCATTGCAACCATCATGCATTTAACGAAGATCGAGAAGACGAAACCATA
GAATCACTTCTACCAAATATTCCCAACAAAATATTAGGACAACGCTTAGG
CTTGACGGCTTTGGATGTTATGAAGATCAATCAAGCATACTGTAGAACAA
CACCTGAAGTGATCGTGCAACCATCCTTACAACTCCAACAACCGCCATCG
ATCGTCCTTGACATCCCACAACGTGATGAAATGGCTTCAACAACCACGAC
GACAACCACCACACCACCGACTACAACATCAACCTCGACAACAACAACCA
CACTGACCACGACCACCCCGACAACGACTACTTCAACGTCAACGTCTACA
ACAccaacaacaacgacaacaacaacaacaccatTTTTCATTCCACCCAT
ACTCCTACCTTTACTCTTTCCAACGACAACCACGACAACttccacaacaa
caacattaGTCCCAGGACAAGAAATCGAAGACGATCCGATAGACCCCAAC
AGCGACGACCCAGTAACCACAACGACAACTGCAGAACCGCTATCAGAATT
AGACCAAGCTACCACTACTACAACAGAGACCCCACGAATCGTTATACAAT
TTCCTCTTTTAACATCTTGCATTCCAAATCCACTTTGCGTGACTCCACCT
TGCAACGCACAGCCATGTCTTCAACAACCCTCGCCACCACAACCTCAAGT
TGTACAACCTTCACAACCGTCTGACGAGAGCTGTGATAAACCACCTTGCG
AAACCAAAGACAGTGAATGCAATTCTCCTTATCCATGTTGGCCGCAAAAT
TTTGAATGGTCGAATGTTGGTTTTCCGCAATCATGTGATTGTCACAATGA
CAATCTCTCTTCATCCGCACCTCCACCTGGGCCACCAATATCTATTATTC
CAGACAACGCacctgaaaatgacaaaaagtgtcaattgtGCAGATGTACA
CCAATGAAGTCAACCCAAACACCAAGGGTTTGGTCAAATAATCATTTTTG
TCAcccttcaaaaaagaaagatcCCAAGTTTCAACTTCTAAGAAGTGGAT
TTGTGCCAGGAAAACGTTGTTTACTAATCGACGAGTCCAAAGAGTGGGAT
AACTTACacctttgttttgataaagCAGCTCCTTACGATTTGATGTGGTC
AACTGTTGACCAATtaaaagaaaatggaaaatcaAGATGTTTGAAGATGG
AGGAACCACAGGATTGGGTCTGGAATAAAAAATATCTTTGTGATAAGAAT
agtatataaaattttaaatttaaaccGTTTTAGTTtagtaaaaaaagaag
aaaaatcactCATCTAATTTTCGGTTGACACTACTTACTGTATTATTCTA
TTATAGAGAAGATCA

transcript from alignment at scaffold_491:343950..387545-

Legend: exon

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>TCONS_00069000 ID=TCONS_00069000|Name=TCONS_00069000|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=43596bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_491:343950..387545- (Clytia hemisphaerica)
AATTTCACTACTAAAATACCATCGCTAAAAGTTTCCATTGGTATTACATT
CACTATATGAAAGATGAGTTCGTTTATGCAAAGTTCAGCCTTCATCCATG
GTTTATCTCGATTGAACGGAAAATGGGAGTTAGTTCAAATCATCGGTGAA
GGGACTTATGGAGAGGTAAATATAACTAACTTAACTCCTCGTTTTCTAAA
GTACTTTTTGTACAGNCTTATGGAGAGGTAAATATAACTAACTTAACTCC
TCGTTTTCTAAAGTACTTGTTGTACAGGTGACGCTCTCTAATTCGATCTT
CAAAGGGAAGAGGATTTTCATCGAATAGTAGCGCGTCGTTTATAAGAGTT
TCTTGCTGACGGGGACTTTCAATATTTATCGAATAATAGATATTTTAAAG
GCCTAATTTTGGGCCGCACATATGGTCGTTTTGAAATAGAGTGCCCCTCG
TGTAATGCTTTACAAAAAATTTTCTTTTTTTTTCCTTTAAGGTTCACAAA
GCTGTGAATAAGAAGCAAGAATATGCTGCAGTCAAAGTAGTCGAAAACCA
TCCATCGAAATTGGATGAACTTCAGAATGAAATGGAAATTCTTAAACGAT
TTTCACATCATCCGAATGTTGTTAGTTATTACGGAACGTATTTATTCACT
GATGCTCAAATGCAACCCACCCAAATATGGCTTGTCATGGAGGTAGGTAC
CTATTTAGTTAATCTCGTAACATACTTTAGGGGTACAAACTTTCGTGAGC
AGAAACAAGCCTTTTTCGCAAAAGTAAATGCATTTGAAAATTCTTAACAA
GGTGATTCGCGAAAATTTATGCTTGCGAAAAATTCCTGTTGAAAATCTAT
ATAGCTTCCAAATCAAAATCAAAATTAGTAATTGTTGCATTTTTATGCCT
TAAAGGCGTCCTTGAATTCATAGAATACCAGTTTTAATCAAATTCATGGA
GTATTTACGTCACTTTTCATTTGAATCATCCAATTCCCGAAGGTTTATGC
TCGTGAAAAATATTTTTTCCTCGAATTCGCGAAAGTAAATTTCGCGAAAG
TTTGTACGCCTGAAGTATCATCCATTCTGCATACAACACGCTATGTTCTA
AAGTATGTGGCCAATGTGATGATCTGACTTGGTTGTTCAGCCAAAATAAT
GAAAACTGAGTTCCTTTTGCTTTAAAGCAAAAACGGAAGCGACTGGGTTC
TAATGCTTNTGAGTTCCTTTTGTTTTAAAGCAAAAACGGAAGCGACTGGG
TTCTAATGCTTATGTATATGATTGACGTTTGATTTTTGTGCGGTTGTTTT
GCGTCAGCCAATCACCGCGCTCAAAAGCTCATTTAATACTCATCCCAAAT
CTGGATGAAAATATTAAAGCGGTCCGCCAACCTGAGCAGATTCCCTAGCG
GCGCCTGATATTTAGAGTTTAGCCATTGCAGATTTATAAAGCCCGAAGGG
CTAGATTTCGTGCTTTAAGCCATCGCAGGCAAAAAAATTGAATGTCGAAA
AAAATATTGCGAAGCTTCTAATTGGTCAAGCGCTGTAATTCTATTATAAT
GTCACGTAACCTAGGTAGGATTTTTCCTATCTAACCACGGCACACTTGTC
AGCGAAAGCACGGCATCTAGCCCTTCGGGCTTTATAAATCTTTGCGTGCC
ATGCGCGGAGTATCAGAATCTGCTAGGGGAATGGACCGAATCCGATCAGA
TTTCCCTTTGGGAGAAAGAAATAGATTTTTTGTCATTAATTCATTGACTT
TGAAAATCAAGGACTATTTTCCATTATTGTTGTCTTTGTATTGCCTTCTT
TCAGTATTGCGAAGGTCGTTCAGTCAGTGAATTGGCGAAACATGTTATCC
GAAACAACAATCGTTTAGATGAAGGAATCATCAAGTATATACTACATCAA
ACTTTACAAGTAAGTGACTTCACTACTGCAGTGTAAAGCTCTCGCTTCTA
TTATTCGAATAATTGTTTCCAGTCCCCACCAAGGAGAAACCCCCTTAAAA
TACTTTCTATAATTCGAATCTCTGTAATTCGAGCCTTAGCAGCCTGGTTG
CTTATAAAGAAAAAAAACCCTCCCCCGTTATAAGGCACCTGAGAGTACAA
ATCTTTGGAAGGATCGGCAAATCAATCGCAAAACTTGATTGTTTTTAAAC
TCATTTCACTAGATATGAAACTTTTTAATTTCTCATTTCAGGGGATACAC
TATTTACACAAGAATAAAGTGATGCATCGTGACATCAAAGGACCGAACAT
TCTAATGACAATCACCGGAGAAGTCAAAATTATTGATTATGGTAAGCTTG
CCCCCCCCCCGATCTTATTTTTTATGGGGTTATTTCAACAGATATCTTAT
ATTAAACACTAGATAGAGATACTCTGTATTTCCCAAGCAACGACAGGTGA
AGCAAAATAATGCGCCATCTTTGCTGAAAGTTGGTCTAGTAGGAATCGAT
TTGTAGAGACCGATTATTATTCTATCCTAATTACAGGTACTCTATAGATG
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CGTTTTCAAATATTTTTTACGGGAGTTCAGTTGATAGTTTAACAATTATA
GATAGAAATAGTTTCCTCGTATGTTTTGGATGAAGGGCGTCAAAAACAGC
TCCCTTTTTGTAGTGAGAATTATTGTAATTCGTTACTAGATTTATCATTA
ATATTATTCTTTGTTCTTAGGCGTATCATCTGAACTGCATAACACGATGG
AACGACGTAATACATCGGTCGGTTCACCATTCTGGATGGCACCAGAGGTG
ATAGCATGTGAACAACAGTTAGATTACAACTATAACATCAAATGTGACGT
TTGGAGTATGGGTATCACAGCTATCGAATTGGCAGATGGTGACCCTCCTT
ACGCTGATGAACACCCTATGAAAGCCTTATTCAAAATACCAAGGTATAAT
GAACATCTCTATCAATGTACAAAGTCTCAGCGACAATCCCCAAATTTATA
TCTGAGACACTTCACATGGTCTCCCTTTCCCCCACTGTCAGCGTTGAGTT
CTCGGCCATTTCTGGACTCAACACTGATAGTGTTGTCCGGGGGACGGATT
TTTATCTTGTTAAAAATGTTTAGAATTCTTCTGTCTCAAGATGTTTTTTG
GGGGATTGGAAGTACAAAAAGAGGCTATACAGTTCTCCAAACTGAATAGA
ATTCTTCAGCATTTGAAGAAACTTGCCTATTTTGGTGTTTAAAGTCAATT
TCTGTATGAGACTAAAATCTTTGACCACTGTGTCTGTAAAGGCCGGTCTC
CACTTGCGCGCGCTTCAATCGCACTTTTTTTGAACAAAGCTTCCACGCTA
TTGGTCAAAAGAAAAATGAAGCAACTCCATTGGCGCGATCTGACGTAACG
GTTGAAAAAGTTGAAATGTGTTAAACTTTTTTTTCGAGCGCGCGCTACAT
TTTTATGACGTAATCTTTTTTCCAAGCAAAAAGGATTGAAGCCAAAAGGT
GCGATCGCAGCGCGCGCAAGTGGAGACCGGCCTTAACACGAACCTCTGCA
ACATGAACCTCTGCAACACGAATTATCATTAACTCGAACAGGCTTTCTGG
CCTCGTCAGTTAACGAACCATTATCAGCTCAACCTTAGTAACTAATTTGC
ATTCCTCATAACTGGAAGGTTAACCGTATAAAAGGAACAGAAAAAGTGGA
GTAAGATAATAGATAATGGGCTTTTCCCCCTGTACCCCCTATGTTGAGGA
GGTGTGACGTCCAGGGTGGTCTGGAAAATAAAAAATCCAGGGTGGTCTTG
TTTTTTAAATGAGAAAATCCAGGGTGGTCAGTATAACGAGGTCGAATATC
CAGGGTGGTCCAAAAGAATGGGAGAAAATAATCCAAGGGGGTTCTGAAAA
ATTGGAAAAAAAGACCTCCTCAACATACGGAGTACAAATTTTTTCTGAAA
TAGCCCAATGTACGAGAATCTCTATGAATATTATTTTGCTCAAGAGGTTT
CTATGAATTGGTACATAGAATAATCTTTTGTTTACCTTCTTCTGTTCACC
AGGAATCCACCACCGACTGTCAAAAAACCGGAAGATTGGTCTCCAGTCTT
CATGGACTTCCTCGCTCAGTATGAAATATTTCACAGCATATTCTCTAAAA
TTCTTACATCTAGGGTCAAATATATGGTTTCGCTAAGCCTTATACAAGTA
AAGGGTTATTGAAACTCTCTTAATGGGGTTTGCTAGATAAAGGGGGTCTC
ACAAAAATCAAATTGTACTGTGTTAGATTCACAGATCTGTAAAGCCCGAA
GGCTAGATTTGCGGCTTTTATCGAAAAGTGAAGCCTAGGTTTGGAAGGAT
TTCCTACCAAAGTCACGTGACTAAAAAATGTTGACCTCTGTAAAGGTTAC
TTTTGCCCCGTCCTTAATACATAAAATTGGAAACGTTTTCTAAGTAGTTT
GAGATCAGTGGGCATAATGATATTGTGCCATCTTTTCTTCTAGGGCTTTG
ATCAAGGATTTCGAGTATCGCCCTAAAGTTGATGAAATGCTTCAACATGA
ATTTCTCGAGGATTGCAAATCAACAAACGAGGCGGTTAGTATTGTAATAT
TTTTATCTTTTGTCATTCTCGCTTATTTTGCAAGATATTTTGCATTTCTA
TTCATCTCCTTTTATTATTGACAAAATACCTTGAAAACGGCCCTGGCCGA
AATTTTTAGCTATAATGGTACCCTTGTTTCGATCCTCCGTCCAATTTTAT
TATTGACGAAAAGTGCTCTTTTCTATCGAGGCTTTTCCCTCCTTGTTTAT
TTTAAAAAGTTACCCAAACTGTTAATCTAACATGCTAGACGACTAATTCG
GACTTCTAGAAAAGGAGTACGTTTTTACATCACGCTCATTTTTGAGACTT
GAAACCGTCAGTAGGGACCTAGGGCTAGAGGCGAAACTTTAACCCTTCTC
AGCCAAGAGAAAGTGAAGCCTATTATCAAAAAGGCGCATAGAGCGCGCCG
TAATCATGATGACGGATTTTATTTAGCGGTTGCTTTTTTTTGGAGGACTA
CATTTTTTTAAATCTAGCGATAGATTTTAGTTTCGATCCGGCGTTTGTGT
AAAAACCATGCGCGGGCGTTCTGGATGGGAAATAAGTGGTTTCATTTCCC
ATCCAAGAGTCTTGCCTCTAGCCCATCGGACTTGAAACTCAATGTTAGCG
ACCTATGATAGTAGTACCCAGGCGGTTCAATCGGTCATAGACTCCAATCG
TGGTCGACACGATCTCGGAATGGTCTCATAGTAGAAAATAAGCAAACAAA
TATTGAAGGAACAAACTGACATCTTTCCAGTAACAGTTTTCGCAATTAAC
ATATAACACCCATATTACTTACGACTTCAATCTACCGAATCGTTTTTGAG
GAAAATGATCAGTTACTTTTCTTTTTAAGAATCGAAAACTACTTATGGCT
CTGATTCACATTAACTTGAAAATCACTGAGAAAATTGACAAGACTTCTGG
CACGCTGGAAGCTAAGTATGTCATTTTTTTAGAAGTTGAAATTATAATGA
TAATTGTGTCCCTTAAACTTTGAGTCTTATGCTAAGAGATTTTTGATTTG
AGCACTTGGTGGTAAGAAGGTCCCTAATTGAAAATTTCCTAGGTTTTAAA
ATCATACTCTCGGCTTGATTATTCATTTTTTTAATATAATTTCACTTTTA
CCGATAGTTGATTGGCTGGGAGTGACATAGGTAGAGAAAGATAATAAAAG
TTTTTCAATTTCATTAAGTTATTGCAGTAGTGCTATCATAAATTGGACTA
CATTCTAACCTGCTTATTTTTAGGAAACGAAATGCACAGAAGAATGCGAA
AGTTATGGAAGTTGATGATCTGGCAAAGTTACCGAGACTGAATGAGGTAT
GTTTAAAGTTTTTCCAGGGAGAGATGGTCCTGACAGAAGAAAAAGTTATT
TCTTGAAAATCTGAAAATTCAAGTCAGTATTAATTATAGGCTATGGCGAG
TCCCATCAAGATGTTTCATGTCGGTGAACAACCTTTGACAGGTTGATTTA
GTCCATTCAGGGGTACCGATTCGGAATTTGAATGTTACCAAGCTTGAAAA
CCCACAGTTTTTACGTAATTTGCGTTTTTTTTTTTGCGGTTATTAAAAGG
TAGGCTGTAGGGTCATTATAATTAATTTCAATGTTAATATTTTTCAGGAA
ATCATGCTTGAATATATAACTGAAAGATACAATGCAGATCAAATTTACAC
ATACGTTGGTGAAATCCTGATTGCTTGCAACCCGTTCACTGAGATGGATA
TCTATGGTCCCGGTGCATCAATGTTGTATCAAAACTCTCGTAAAGATAAC
CTACCGCCCCATATTTATATGATCGCTTCAAACGCTTACCACGCTATGCA
ACACAAACAGATTGATCAGGTAAGTAATTTGCTTGGCTATCAGCACTCGT
CTGATTTGTTTTGTTACAAGGGATGCGAATCTTCCTCAAAAATTAGACTG
GAGTCGTTTATAATGCGTGTATAGGCGTTATTATGATAATACGATTATAG
TTACGGGATTTAGTTTGTATAAACTAAAATTGTTCCCTCCATTACTTTTT
GCTTTATTTCTGCTATGTCTGAATTAGTCGTCTAGCTCGCTAGAATACTC
AAAAATCAGTAATTTTAATAGGCGATTGATTGCCGAACTTATTTTTGCGG
CTGACACCCACTTTTTTTCAAAATTATTTTCCCAAGGGGATTTTACAGAC
TTTTCGTGGTTTTAATTACTCGGAAAATACCCAAAACCATGAAAAGTAGC
AAGCAAAAACTTGATGTCCATGATGTACATTAAACGCTGTCTTGAATCTC
GAGTTACAACAAGTTGAAAAAATCCCACAATTTTTTAATTCTTTGTAATT
TTTCCTCATAGTGTTGCGTGATCAGTGGAGAGAGCGGTTCAGGCAAAACA
ATAACTGCTAATCTCCTTCTTAAACAATACGGACAGATGGGAAAATCAAA
TCCCAAACTTGTCAAAAAGATTTTACAGGTAATATAAACGAAAAATTTAA
ATTTGTGATTATGATCTCGAATATCTTAAATAAATGGTCTGAAAAACTGG
CTTATAAACTTGTTTTCTTCACTTTTTGTTTAATATCGTTTAATGCCATG
TCTGAAAACAAGCAATAAAAACCAATCAAGATTCTTTCCCTGAGCCTTGT
TTAACCCTAATGTTGGATTGTGTTGAAAAAGTATACAACAAAAAGCTTTT
TCTAGGGGCTAGAAAATCTAGAACGCTTTTCTATGATATTTTCCTTTGCA
TTGAAACCCGAGAAAAGTGGTCGTAGGAAAAAGCTTGAAAGTCTCTAAGG
CAAATCCTGGGCGGTGTAGTGTTTCTTACGACAGGGAACTACCAACTTAA
AATCTTTTTCCTAACTCTAGATCAACACGTTAATGGAGGCTTTCGGCAAC
GCCCAAACAACCATCAATCAGAACTCATCCCGATTTGGAAAATTCCTTGA
ACTTCATTTCACATCATCGGGAGGTTTCGTTGGTGCTCAGGTCTCTGAAT
ACCTTTTAGAGAAGTCACGTGTTGTATCTCAGCCAACCAACGAACGGAAT
TTTCATATCATGTATTATTTGATCGCTGGATTGGACTTTCATAATAAGTT
GAAAGACTTTGAGTTGACTACCAGTGACAGCCATAGGTATTGAAATGCTT
TAGTAATATCATCTTTCTAGACGTGATGAACTGCGAGCTATGTCTTTGTT
TTTTAGCCATTGATAGGTGATTTCAAATATTTAGCATCGATTATTTACTA
TCACCTTGGGACCATTGTTCAAATTTGGTTTTCTTACTAAAAGTAAAAAA
AATTAAATCTTGAATAACTCGACTTTAGAAAATAGATAGGCCAAAAAATT
TAGAGGTTTTGCTCATGACCATGGAACGAATCCACGTCCCAAATATCTCA
AACCATCTCTCTCATTAACATGCTCGAGATTCAGAGGGTATAAAGTTGAA
TTTACTGAATTCTTACACTCAGAAAGTATTTCATCTTACAGTTGACTTTT
GCTAATTCGAACTCGAAAGAGTATTTATATAGGATTTCTCCCTGACGGGA
ACTGAGAATAGGTTCGAGTTATAAAAAGATTATTATTATTATTTTTAGAA
TCTTTCTGCAGTTGACTCTCGCTTATTCTACCTCAGACGAAGAATCTTTT
CTGTTCGAATTACAGAGAGATTCGAATTGTAGAAAGCATTTTAGATGGGA
ATCTCCTTGGCGGGGACTGGGAATAGGTTCGAATTATAGAAAGATTCGAT
AAAAGAAGTTCAAATAAGCAAGAGTCTACTGTATATCTACAAATGAATGA
TATCCTTTCTTTCTTTTCGTCAGGTATCTTAACACCGACGAATGGTTATT
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GTATTTGGGGATAAATTGGATCCAAAGTTAAATCGTTCATATAGTAACAA
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GTAATGACCCAATGAGGTGTTATTTTGAAATGTATGGAGTTGAAAAATGC
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TTCTTGGGGGGGGCGCCGAAATCGCCAAAGTTTAATCGAAAAATGGTGAA
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CTTCTTTCACCCACCATCTCTCTTCTAAATTATGCAACGGGCCCTTACAC
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ATATCTTGGATCGGACTTCTTACCCTGTGAGTATTCTTATACAAACCTCG
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CAGCTAACCAAACTTGTTGCATACCACGTCAAGCAAACCTACCTAATCAA
GCAAAGATATTCTGACTCACACTTGAAGTTTTACCTATATAAAGGATCAG
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CCTCTGGTCCCCTTAGCTGGAAAGTGGCTTAAATTACTCTCTGCAATTCT
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GACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAATTTCAACAAACTAA
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GGGTGTCCAAAATAAAATATTTTGACCAAGGAAATTATAGAATTTCAATG
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


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The following exon feature(s) are a part of this transcript:

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The following features are aligned


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Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.0906509	0.390813	0.127805	0.026156	0.196361	0.327864	0.478331	0.623732	0.369327	0.435993	0.360347	0.809467	2.9724	2.06895	1.22572	2.26486	0.71685	1.26796	1.34973	0.634813	0.785297	1.04851	0.321043	0.0375295	0.763876	0.106464	0.199848	0.12315	0.113214	0.182816

Blast

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BLAST of TCONS_00069000 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: MYO3A (Myosin-IIIa OS=Homo sapiens GN=MYO3A PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 961.829 bits (2485), Expect = 0.000e+0
Identity = 503/1101 (45.69%), Postives = 708/1101 (64.31%), Query Frame = 1

Query:  124 WELVQIIGEGTYGEVHKAVNKKQ-EYAAVKVVENHPSKLDELQNEMEILKRFSHHPNVVSYYGTYLFTDAQMQPTQIWLVMEYCEGRSVSELAKHVIRNNNRLDEGIIKYILHQTLQGIHYLHKNKVMHRDIKGPNILMTITGEVKIIDYGVSSELHNTMERRNTSVGSPFWMAPEVIACEQQLDYNYNIKCDVWSMGITAIELADGDPPYADEHPMKALFKIPRNPPPTVKKPEDWSPVFMDFLAQALIKDFEYRPKVDEMLQHEFLEDCKSTNEANRKLLMALIHIN--LKITEKIDKTSGTLEAKKRNAQKN--AKVMEVDDLAKLPRLNEEIMLEYITERYNADQIYTYVGEILIACNPFTEMDIYGPGASMLYQNSRKDNLPPHIYMIASNAYHAMQHKQIDQCCVISGESGSGKTITANLLLKQYGQMGKSNPK-LVKKILQINTLMEAFGNAQTTINQNSSRFGKFLELHFTSSGGFVGAQVSEYLLEKSRVVSQPTNERNFHIMYYLIAGLDFHNKLKDFELTTSDSHRYLNTDEW-LLSEIACTSEMQVKFTEVQACLENIGFTKKEIQSFYCVLAAIIHLGDIEFSVDSRFSHQGEKSKVTNKNILETVSALLCVNKNKLEEALTINSSVTAGEIIKRNNTVDQALDCRDATAKVLYNRLFTWIVKRINSLLRAEDKTQTTHSRIS--ILDMFGFENFEANSFEQLCINVANEQLQFYFNEYIFVWEFEEYATEGIKAVPFEFNNNKPILDLSLQKPVGILALLDEESRFPMATDMTLVEKYHDNIESPYLKTSRDTSSSFLIKHYAGDVKYDSTGFLEKNRDTLSVDVVETIQASSDETIAQLIE----------------------ESAASLLGLEKHTDRKKSLVA--TTNRFHQTVSTHFRLSLRNLMSKVIKSDPHFVRCIRPNLQNKPNVIIPSMVLNQLRCTGVLETINIRQKGYSERLPFEQFVELYRFISYQYVDVVPRDKETCLQLLRASNIDPEETWGVGRTKIFLRYWHVQKLRTLKSHYNDSVELVQRAVRAWTSRCSIRKFLNFRHDAAKIIQS----NWIRFKRKRDFEKLKQAMT 3315
            WE+ + IG+GTYG+V K +NKK  + AAVK+++      +E++ E  ILK  S HPNVV +YG Y F   ++   ++WLV+E C G SV++L K  ++   R+ E +I YILH+ L G+ +LH NK +HRD+KG NIL+T  G VK++D+GVS++L +T  RRNTSVG+PFWMAPEVIACEQQLD  Y+ +CD WS+GITAIEL DGDPP AD HPM+ALFKIPRNPPP +++PE WS  F DF+++ L KD+E RP V E+LQH+F+   +  +   +K L   I I+  +  TEK  +    +  KK N  +   + + +VDDLA L  L+E  + E + + Y+ DQIY YVG+ILIA NPF  + +Y    S LY  S++   PPHI+ +A   Y +M     DQC VISGESG+GKT  A+LL++Q   +GK+N + L +KILQ+N L+EAFGNA T IN NSSRFGK+LE+ FTSSG  VGAQ+SEYLLEKSRV+ Q   E+NFHI YY+ AGL    KL  ++L  +   RYL  D    + +I   S  + ++  ++ C + IGFT +++ S Y +LAAI+++G+IEFS  +   HQ +KS ++N   LE  ++LLC+  ++L+EALT +  VT GE I R NTV++A D RDA AK LY RLF+WIV  INSLL+ +         +S  ILD+FGFENF+ NSFEQLCIN+ANEQ+Q+Y+N+++F WE  EY  E + A   E+ +N P+LD+ LQKP+G+L+LLDEESRFP ATD TLVEK+  N++S Y    +    SF I HYAG V Y+++GFL KNRDTL  D+V  +++S +  I QL+                        ++  L+ L K    + +  A  TTN   QTV+++FR SL +L+SK++   PHFVRCI+PN + +        VL QLR TG+LET  IR+ G+S R+ F  F++ Y  + Y+  +      +TC  +L  + +D    W +G+TK+FL+Y+HV++L  ++    D + L+Q  VRA+      +K    R ++A IIQS    + +R +RK   +    A+T
Sbjct:   21 WEITETIGKGTYGKVFKVLNKKNGQKAAVKILDPIHDIDEEIEAEYNILKALSDHPNVVRFYGIY-FKKDKVNGDKLWLVLELCSGGSVTDLVKGFLKRGERMSEPLIAYILHEALMGLQHLHNNKTIHRDVKGNNILLTTEGGVKLVDFGVSAQLTSTRHRRNTSVGTPFWMAPEVIACEQQLDTTYDARCDTWSLGITAIELGDGDPPLADLHPMRALFKIPRNPPPKLRQPELWSAEFNDFISKCLTKDYEKRPTVSELLQHKFITQIEGKDVMLQKQLTEFIGIHQCMGGTEKARRER--IHTKKGNFNRPLISNLKDVDDLATLEILDENTVSEQLEKCYSRDQIYVYVGDILIALNPFQSLGLYSTKHSKLYIGSKRTASPPHIFAMADLGYQSMITYNSDQCIVISGESGAGKTENAHLLVQQLTVLGKANNRTLQEKILQVNNLVEAFGNACTIINDNSSRFGKYLEMKFTSSGAVVGAQISEYLLEKSRVIHQAIGEKNFHIFYYIYAGLAEKKKLAHYKLPENKPPRYLQNDHLRTVQDIMNNSFYKSQYELIEQCFKVIGFTMEQLGSIYSILAAILNVGNIEFSSVAT-EHQIDKSHISNHTALENCASLLCIRADELQEALTSHCVVTRGETIIRPNTVEKATDVRDAMAKTLYGRLFSWIVNCINSLLKHDSSPSGNGDELSIGILDIFGFENFKKNSFEQLCINIANEQIQYYYNQHVFAWEQNEYLNEDVDARVIEYEDNWPLLDMFLQKPMGLLSLLDEESRFPKATDQTLVEKFEGNLKSQYFWRPKRMELSFGIHHYAGKVLYNASGFLAKNRDTLPTDIVLLLRSSDNSVIRQLVNHPLTKTGNLPHSKTKNVINYQMRTSEKLINLAKGDTGEATRHARETTNMKTQTVASYFRYSLMDLLSKMVVGQPHFVRCIKPNSERQARKYDKEKVLLQLRYTGILETARIRRLGFSHRILFANFIKRYYLLCYKSSEEPRMSPDTCATILEKAGLD---NWALGKTKVFLKYYHVEQLNLMRKEAIDKLILIQACVRAFLCSRRYQKIQEKRKESAIIIQSAARGHLVRKQRKEIVDMKNTAVT 1114

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00069000 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00069000 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
MYO3A	0.000e+0	45.69	Myosin-IIIa OS=Homo sapiens GN=MYO3A PE=1 SV=2	[more]

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TCONS_00069000 (transcript) - C. hemisphaerica