TCONS_00068948 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00068948
Unique Name	TCONS_00068948
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	229

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_490:7264..24222-

transcript sequence

>TCONS_00068948 ID=TCONS_00068948|Name=TCONS_00068948|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=229bp
CTGATTCTTGACTCAAATCTCCAAGTCTTTCACCCCATCGATGTTTTTAC
GCAATGCCTTGGAAGGCTAGACAGAAAACTAATTTCAAATGACATAACAG
ATTTGTGGGAGGAGATAACAGAAAATGTTCTCAAAGACAAAGATTCTGAg
CTGGCAACCTGGTTCAACCCAGACACCTTCTTCAATGAAGAGAAAAATAA
CAAGAAGCGAAAGGTGCAGTGTATAGCAA

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_490:7264..24222-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00068948 ID=TCONS_00068948|Name=TCONS_00068948|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16959bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_490:7264..24222- (Clytia hemisphaerica)
CTGATTCTTGACTCAAATCTCCAAGTCTTTCACCCCATCGATGTTTTTAC
GCAATGCCTTGGAAGGCTAGACAGAAAACTAATTTCAAATGACATAACAG
ATTTGTGGGAGGAGATAACAGAAAATGTTCTCAAAGACAAAGATTCTGAG
GTGATTTTACATTTTAATGCCAGTTAATCTACTCCTGAGTTTGTTTGCTT
AAATTACGATACGTAAGTTCATAAAAAACCAGACGATTCATTCCAATACG
CCTTAGCGTCGCGGTCACCTTATGGAGGACTGGTAATGAATTTACAAGGT
GATAGGTGTATTCTTATTCAACATTCAAAGGTCAAAACATTGCAAACTTG
AACAAAAGCTCTCCCAAGATACCCGTTTAGTATAAACTCATCTGTTCTAG
GACCCAAACAACCAGAATAATGTTCCAATGAATACAAATTTGATCCATAT
TGTTTCATCTCCTTTATCACTATGTAGCATCCACCAGAGCAGTGGATATA
AAATAGCACGTGACCATAGCCAGAGGTATTATCGAACTTACGATATGCAA
CGGAATAGCTGTTTGAATTTCGCTTCAACTTATAGCTTAAGCTATGATAT
GTGTTACCTTTGTACCAAAGGCGTTGAGAAAAGCGGACTCCACCATTAAA
AAATCGATTAGGAAGCTGAACAGCTTCGATTGGTTGTGTATCAGATATAG
TACCAAACATTAAAGTGTTATTGTCAATGTTCGTTCGGCTTGGATAACGC
TTTTTAATGATATCTGAAGCCAGCTCCCTTGTAGATTCTTGAGAAATGGA
CTTGCGCATGGCATCGATGTTTTTTAAATAGCCAATATTTTTTATCATTT
GAGGAACAATGCCTCTAGAACCATGATATTGCCTTAAAAGGGTTGCAATG
AAGCCTTCGAAGACGAAGTTCGAAATCAAGACTAACAGGCAGCCATGTTT
TCTCCTCTGGTCAGCGATGTGGATTAGAGCATGATTGGTAAATGTTTCAG
ATTCGTCTCCATGAAGCATTTGATCATTGCGGTGATATTCAATCAACATC
TTTTCGGCAAGCTTGATGTCCTCCTCACGAGCGCTGTCTTGGCTTAGGAG
TTGAAGGCTGGTAACGAGTAACCCCAAATGACAGAAAGAGTCGTCTGGAA
TACGATCTTTAAGAGTCGGTAACAAAACGTGCAAAAGAAGAAGCTGGAGA
TCGCCGGCCTTTGCCAATTTTACTACCTTGCTGTTCAAAGAGGTGATTTT
CTTAGAGAAATCGTGAGGGTAGTGAATTTGTTTTAGGATACCGTTAATTT
CATCCAAGTCATCTTGATCGAGGAGTCCGTTCGGTGGGAAAAGAAATTTT
GAAAGTTTTCGTTTTAATTCCCCCTCTAGGATCAAGTGCATATAATCAAA
AGGGACTTTATACGGTATTTCAGTGATATCTAGCACTACAGACTTTCCCT
TCCAACCAAAAAATGCATTTCCCTTCTCCTCAGCCCGCTCAGCAAACGAC
ATGCTTTCTTCCATTGTTCTCAAAGGGAAAGGATTTTCTTGGAAACGATA
AAACCGAACTAGATGATTTCCTTCTTTGGTGCATCCAGGATGATAGCAGA
CCGGGCATCCAAACTTTCCATTAAACTGTTTTAAGCTCAATGATGCAGCT
CTTGCAGGTAAATCTGCTAAACTTGCTTGAATTTCAAGAAAAAAAAATTT
GTCTTCATCAAGTATGCTTACAGCAAAACCAATGTCACGTAGTTGTTTTA
CCTCCCGAACAAATTGAAGCTGAAACAGGTCAAAATTTGGCTTCTGTTCG
CCATACCAAATGCCACAAAATAAAATGTTTCGCACACTAAAACGCTTGTG
TATAGGTAACCCGACAACGAATGCAGTGATAAGCCAAACATTCAAAGATT
CTGATTTGATTGTAGGAGCTCCATAAATATGCCAGACCATCGTAATACGA
TTGTGGTCATCGTGACTCTTGTAAACCTCTCCATCCCAAATGTTCTCATA
AAGGCCTTCTGTTCTGTTTTGCATGAACGTAATGATGTCATCATAATACC
CTGAAAACAAAAAAAAAAACAATAAAATAAATTTGACTAACCACGATTTT
GGGTTCTGCTTCAATAAAATAAGACCGAAAAACCTTTAAAACATTGGCTA
AAACTTTCCTTGAATAACTTAAAATTTCCACCATCTAAAATTATTCAAAC
ATTGCTAAATAAAGCTTGCTGGTAAAATTTCAAATAAACCAGACAAGAGG
TTCTACAATAATTGGCTACTTTGTGTAAAATACTGAGTCAATACACATAT
CACAAGTAGTGAGAATTTCAAACCAAAATTCAACAAGTCAAAACAGGGGA
TCCATCTAAGGGTAAGCACATAAAGAGTTATTTTTCTGGAAGAGTTGTTC
CTGAGGCTAATTTCTTTGCACAAAGTGCCTACCTTGAATGATTTTAATCA
GCTGTGTTTTGATGTCGAATATTGTGAAGTGAAGAATATTAACAGTATCC
TCGTGCGATGGACAATTCACATAAGAGCATTTGTTTTGCTGTATCGGACA
ATGACAATTGCTGCATAGATTGTAATCTGTCGAATTATGTTTATACTCAA
GAAGTTTTCTTATTCAATCGATAAGACGATGTTGGACAACCGTTTCCAAA
TGGTAACACATGGTGAAATATCTAAATACGATGTTTAATTACTTTAATTT
TCGTTGATAGCTTTTCAGCAGAACTTAGATGATCCCTGAGTATTTGACAG
TTACTAGGTGAACTTAAATTATGAACTGGAAATATGATATACTTGACACG
TTAGCAATTGGGACTGATAAAATAAACAAATAGTCATCAAAAATTTACGA
AAACGGCTACTTCTAGCATTATCATATGCCGGCAATTTTTTTTCTCAAAA
TGAGACAGGGCCATGTTTTGGGCAATGCTAATACGCCTCTTTTTGAAAAA
AAAACAGAGAAAATTTAGGACAAAATCTTGATAAAAACAGTTTTTCTGGC
ATATTTCCAGCATTTCTGGCCGGAAAAAAACCTTTTTTTAATAGGGCTCC
GTACATTTTAGATATGTATATCCTGAAGTCTAAAGTGTGTCCTGACAAAA
GCAAATTAAGAATATATTTTAAAAACGTTAAACTATGGTTAAACTGGTTT
TTATACAAAAAAGTGATACGCCACGGTTATGAAGATCATAATACATGAAC
AAATCAAAATGAGATGATAAGTGAAAAATCCTATGAGTAAGATCTCACTT
CTGACAAAAGGTCATTCATTGCTTTATCTGCTATTCCATGCTTGACACCC
CAAATTTTTAGAAGAAGTGCAAATGACTTTCGATTGATTCGGCAGTTTGG
ATACAGTTCTTCGTCATCTGAATCGTAATCGTCTTCCATGTTTCCGAATA
GATCGTCATCTTCTTCTTCTTCAGTCGAGATATTGGATTCATAACCACTA
AATACTGTATCGTTAAGATCAGATTCGGAACCAAATTCGAAATTGTTATA
ATCACTACCAAATTCACAATCAATCTCTGGAATAAAAATGATGGAGTTCT
TTATAAAAGTTGAAAACAAGAGTGAACTCATTGCAAATTAATTAAATTAA
AAATTATTTAGAAAATGATTTACAAAAAACACTTTTGTACTTGTTTTTTT
GGATTTTACTTCATCAATGTGGTCGTAAACTTCATCTTCAAAAATCATAC
ATTCTTTGACTTCTAATTCAATAATTCCTGGCAAGGTATCCGTGTATCTA
CTGACGCCAATAGTACGATTTCATGGCTCAATGGTCTAGTGGTATGATTC
TCGCTTTAGGTGCGAGAGGTACCGAGTTCAATTCTCAGTTGAGCCCTGCT
TTGGCAAACTCAATCGATGAAAATTCATTTCCAAATGAATTCAACATGGA
TAAGATTGCTCATTTAGAATTGCTCAAAACCGGCACGTTGTTCCGTATAC
ACGATCCGCTCCTCGCCTCAAAACTATGCCTTGGCATATTGGCGTNCTGA
AGCGAAGGCAGTTCAGAAGTCTGACTGAATTTTTTTCTTAAATTCAGTAA
AATTTCTGGAATTTAAAGCCATTTTTTATGCAAAATTTGAACTGGTTTTT
ATCTTATTTGTTGCTGGTTTGTTTTGTTATCATTTGGTTCACATTTCATG
TAATTTGCTTGATTTTTGGCGAAGTTATGTCCAGTCAGCTTTTATTTTAC
ACTCAGTTTGTAAACTAGATAGATATTAGTTTCAATTTCTTAATTTTCAA
CTGATAAATATGACAGGGATAGGTGCCTTGATTGTCTCTCAGACTAGGTA
ATAATTTGCTAAAAGTTTATTATGTATGTAAGATTGAAATTGAATTGCCC
TCATTTGATATGATTGTAAACTGAAACGCAAACTGACTGAGAGAGGTCGT
TCAATATCAATTATTTATCAAATTGGATCTGTATAAGGCAAATTAATTCC
TTTACCTCACATAAGTCAAGTGAATCATTGTGAAAGGGTATATGGTTTTC
TTTATGTTTAGAATGATAAAGATAGAAATTAACAATGCCAAAGGAGGGTT
TAAGTGAGAAGGACTGGAAGCAACGCTTGCAAAACTTTGCAGATGGAACT
TTCCATTTTTCAACTGGCCGACACACAAGTAACAAAAGACGACAAGAGGA
GTACTTTGGTGTTAAAAATTGCCCGGCGCATAACAGATCTCAGAAAATTG
GTGTCGATGGAAAACCAATCATTTGCAAGTGCGGCTACCATAAAAAGAAA
AAACAAAATATTCCAGTACTGATACCAAAGCTAAACAAACCAAGCCAGAA
TGTACCAAAAGTATCAACAAGTACACCAATATCACCAAGCAGTGTTAATT
CAAACTTTTGTCGTCAAGGATATTTTCACACGCTGGAATGCAAACAAAGA
TATCGATGAGACTTTGATGATATTTTTTTCCCATTGGCAATTTTCAAATT
GAATTTATTGCTGATTTCTTCTTTGTTATATATAGGATGGTACTGTGTAT
TTTTGTTATGAGTTCATAGTAAGATGTTCTCAATTCTAGTCATAAGGAGT
GTCAAACTGGAGTTCTGGTTCACAGGTAATTTGAAGGTTTCATCACTCAG
AATATGTATTATTGCAGTAAGTAGTTATTTTACAGTAACGCTCTATTCTC
ATTTTAAACGTCCTCAGCCATCAACGCACAAGACAAGTATTCCACGCTAT
ATTCCAAGGAATATTCAATCCCTGTCACCAAAAAACAATCCAAACGAGAA
AAACTTGCAGGTATATAAATTTCATTTTAGTAGTATATACAGTAGATTAA
AAGATATTTCAGAATTACGTTTAAGATTATTCTTTCTAGAGTGCTATTTT
TGTTTAAAGTTTGTTCCTTAACCTTTTACCCCTGTTACTTTTTTAGCTTT
CTACACCTTCACTGTACAAACGCTCTTCAGCACCATCGGCTATTCCTGTT
TTACGAAAACCTCAAACTCCACGTAACTTAAGTGACAGAAAGCACGGTAA
GGACTTCAAAATTTTTATTGTCGCATAGTTACAATTTTTTAATGTATATA
TTTTTCTAGCGTATATACATGACATTTTTTATGAACAGGGACATATTTCT
TCTGCTTTTTCATGGAAGAAAAGTGAAGCTGTAAAAAATGGATCTTTCGT
CAAAAATATTTTTACAAGATTTTGAACTGTCAAACTGTCAAACTATTAAA
CTATGGATATTCATGATTGAACCTATTTTGAATTTTTTGGATTTGGTTTT
AACTGGTACTTGAAAAAATATTCTGTCCAATTTTACTTCTTAACACTTAT
ATCTTAAAACTCTAACATTTATTCTTAACATACAACGTTCAAAGATTACA
ATAACAATCATGGCTGTTTGAGATCATTCAAGTTCATCAATTACTTAAAA
TTTATTTTGATCTTAACAAAATTTTGCACTGCTAAAAAATGGCCTCTCAG
CGAAAAGACTTAGTAATTTTTAGAGAAAATGAAAGTAATCACGTGACTTT
TAGAATGTTATATTTGCACATTTCCATAGAATATATTTTTTAATGTATAT
ATTTTTCTAGCGTACATGACATTTTTTTATGAACAGGGACATACTTCTTG
AAACTGTAAAAAATGGATCTTTCGTCGAAAAGATTTTTACAAGATTTTGA
ACTGTCAAAAAATGGCCTCTCAGCAAAAAGACTTAGTGATTTTTAGAGAA
AATGAAAGTGAAAGTGACCACGTGACTTGTATATATTATATTTTGCAGCT
TTTCATAGATTATTCTTATATATGTATATATTTTTCTTGTGTACATGATA
TTTTCTATGATCCACCCCTGACTAGGTTCGAACCCTAGCTTGGGTAATGC
TTAATGCAAAATCTAATAATACTTCACATGTAATTGCTGTGTTTATTTTC
TTTAAGAAATATTTCACCCTGACTAGGCAGGATTTAGGTTTTGCTACCGA
CTTTTGCTTTTCACTTACTTTCCCCTTCTCCCCTTTTCTTTCCCCCCTTT
TCCCCCTCGCTTCGGGACGGTCTTGCCCCTTTTTTAGCTCAGGGGTTAGA
GCACTGGTCTTGTAAACCAGGGGTCGAGAGTTCAAATCTCTCCGGTGATC
GTATAGTGGTTAGTACATTGCGTTGTGGCTGCATTAACCCAGGTTCGAAT
CCTGGTCACGGCACGTTATTGTACCTCATTCATCTAACAAATGATGGAAC
CGGACGGATCCAAAATATAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNGATTTTACGTCATTTACAACCAATGAGCGATTGGTTCCGTGATGTA
ATGTCAGAAGACATTGCAGTGGTACATATCATGATCTGGTTTTTTTCCCC
AATTTTCAAGCCTAAAAAACGCTTTCCGCAGATTCGATTCCTGGATTTAA
ACACGAGTATCCAAAGTTATCCTGATTTGTTTTTCAGCGGATACATAATT
GGCCTTTCGTATCCAAATGTATTACTACGATTGACCGGTCGCACCNCGCT
TTCCGCAGATTCGATTCCTGGATTTTAACACGAGTATCCAAAGTTATCCT
GAATTGTTTTTCAGCGGATACATAATTGGCCTTTCGTATCCAAATGTATT
ACTACGATTGACCGGTCGCACCCAAAACTAGGAAACTATGTTGACCAGAA
ACCGGATACGAACTGGTCAATTAGGTTCGAATGCGGTGTTAACCGATATG
CCGGTAACTAAGTTGACAGACAGGGAAACTTCAGGATACTAAGCGTATCC
ATTAAAGATACGTGCCCGTATTCGCAAAGAATTCTTCCCGTGGTGCTAAT
AACGCGAATGTCGTGGGTTCGACCCCCACACTGGCCATGTATTGTATTTA
AAGTTTGTATGGAGTATTCAATCATCTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAGACATTATCA
AACCTTGAAAGTATGGAAAATAGCAAAGTGTTAACCCTAACCCTTACCCT
ACCCTTACCGGACGGATCCAAAATATATTAGTTGGGTTTGACGGCAGCGG
TATTCAGCAAGTGAATCAATCAACTTGTTAAAATACGTGCCCTCATTTGA
AGAGGCTTGGTGACTTTTTACTCATCTACTCAAAATACTCTTCTCTAATT
ACTCATTAAGTAAATAGTATTTGACAATAAACGCAGGCGATAAACGCCTA
TATTTGTGCTTAAACTTGTTTGCAGAATCAAATCTCTTGTGGTTACAGTT
TTCTGATAAAAAAAAGAAAAGGCTTTTCTATTTTAACGCCGTTTCCAATT
CGTCTTTATTTGGGGCTAAAGGGTATAAGTATCTTGTCTAACCTCTTAAA
AGTGAAAAAATTAAAAAAAATTTAAAGTCTTTTAAATCTTTGACCCTAGC
TGGGATTTGAACCGTTGACTCCTCTATATCCACACTTGTTTTAATTACCA
TATGAAACTAGTGGCTAGTTTGAAACGCAGGTTACAGCTCTATGGTGTAC
GGTGGCCGAGAAGGGCCACACAAAATAAAAAACCTCAATACAAAATAAAA
AATTCCAATACAACACAAGATAGAAAGTCCCAATATATACAAAATAAAAA
ATTCCGATACAAAACAAAAAAAATGTCAATACAAAATAAAAACTTCCGAT
ACGAAATAAAAAAACAACACAAAATGAAAAACGGCATTTTTGAATACCGG
GACTCGTGAACCACCAAAAAAGGTCCCAAAATCTTAGAAATTGGAACCCC
CTAAGGTTTGGACCCCGACTTTCAAAAATTTCAAAAATTAGTACCAGGGT
CCCTAAATTCTTGAAAACCTAAAGTGGGACCTAAAATCTTGCAGGGACTC
CAGGGAAGCCTGAAGTAATGGGAGCCAAAAAGATCAACCTAACCAACTAA
AACCTTAAACATCACGGTGTAGCAGGGCAGGACCGCTAGGGATGTTTGTA
ACACGTGATTATTGTGATATGGAGTGAAGTGTTCAAACTGAAATGAATAC
AAAGAAAATAATTTAGAAAAATTGACAATTTGACTAAATAAATGAAAACT
AGGAATGATGATGCTAATTAGTGAAAATGTCTAATTAGTGAAAAAATTAC
TAATTAATGAAAATGGCTAATTAGTGAAAAATGACTAATAATCAAACAAA
AAAGGTACGAAACGTGAACAAGGTAGAACCACAGCTGTGACCGCCAAGAA
GCCTGACACAGCTGTGACCGCCAAGAAGCCTGAGCACGAACGTGCGAATG
AGAATGCGGGCGAAACGAGTGCACAGCTGAGAAGACCATGAAACCAGGGC
ACGAACGTGCAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTCAAGTTAAACATTTCATTTAA
ACCATCCACCAGATCAACTTCATCCACTTGATGGATAACTACTAACTCAC
GAACTGCACGATTCGTCTCGCGGAACACAATACATGATAAGTATCCAGGC
TCACAACATAAGACTTTGGCCATTTTTGGGTCCCACTTTTTGTATGTATT
GAATTATTTATTTTGTATTGGACTTTTTTTATTTTGTGTTGAACTTTTTT
TATTTTGTGTTGAACTTTTTTTATTTTGTATTGAACTTTTTTTATTTTGT
ATTGAACTTTTTTTATTTTGTGTTGAACTTTTTTTATTTTGTATTGAACT
TTTTTTATTTTGTATTGAACTTTTTTTATTTTGTGTTGAACTTTTTTTAT
TTTGTATTGAACTTTTTTTATTTTGTATTTGAATTTTTTATTTTGTATTT
GAATTTTTTATTTTTCATTTGAACTTTTTATTTTGTATTGGAATTTTTTA
TTTTGTATTGGAATTTTTTGTTTTGTATTTGAATTTGTTATTTTGTATTG
GAATTTTTTATTTTGTGTGGCCCTTCTCGACCACCGTAATGGTGGCCCAT
AAGTGCCAAGTAATTTTTTATTGAAAAACTCAAAAAAAAAAATTTCCATA
AATGAAAATGGGCCAAAACAACTTAGTGCTTAGACCCCAAACATTTTTAC
AAATGTGTAGGAGAGTATAAAATGATATCCTTTACTCCAGTGTTCTATGG
TACCATAAATGAGAGTTTTTTTGTCCGAAACGGTGCTTTTCCTTTCTATT
TTTTTTGCAGACAAAATTATTTATCAAACAATAGGCAATATGGAGAGCCT
TTGTTTTGATTTGTAAATAAAGAGTCGATTTTTTTCTTAATATGCAGCAT
GCGAGCATGAAAGGAAAAGTGCTGTGAGAGGAAATAGGAGGGAAATTTTA
TTTACTTCCAACCCCTTTCATGTTGCCGCCATATGCTTTGATATTTTTAA
TATTTTTGGCTCCAGAGGAAACCCCAATGTGANNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAGTCGTTAAAATGTA
ATTTAGAAAGGAGACATTATATTGTTTAATTGAACAGTTAACTGACCTTG
ATATTAAACTGTCAATATGGCTTTAACAACAGTTCTTTACTTTTCAAAAG
TTTTATTCCTTTAAAGCCAGATTGACAGCAGAATAATAATTTTAATATTA
ATTTAGTTGACTGTATTAGTAGGGTTGCCTAATTTTTTTATGTTGATTAT
ATCTAACTGGGTATTCAATGATTATTTTAGCTGGCAACCTGGTTCAACCC
AGACACCTTCTTCAATGAAGAGAAAAATAACAAGAAGCGAAAGGTGCAGT
GTATAGCAA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_042968	XLOC_042968	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00068948-exon-scaffold_490-1575043694:24073..24222	TCONS_00068948-exon-scaffold_490-1575043694:24073..24222	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00068948-exon-scaffold_490-1575043694:7264..7342	TCONS_00068948-exon-scaffold_490-1575043694:7264..7342	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00068948-exon-scaffold_490-1510915933:24073..24222	TCONS_00068948-exon-scaffold_490-1510915933:24073..24222	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00068948-exon-scaffold_490-1510915933:7264..7342	TCONS_00068948-exon-scaffold_490-1510915933:7264..7342	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00068948-exon-scaffold_490-1491911889:24073..24222	TCONS_00068948-exon-scaffold_490-1491911889:24073..24222	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00068948-exon-scaffold_490-1491911889:7264..7342	TCONS_00068948-exon-scaffold_490-1491911889:7264..7342	Clytia hemisphaerica	exon

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_490	supercontig	scaffold_490:7264..24222 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.14655	3.13983	0	0	5.78948	4.57492	1.37986	7.75086	5.42656	6.72167	7.61159	4.28876	3.569	3.70644	4.26608	2.61609	4.83421	3.30327	2.28183	1.19388	3.1131	1.51846	1.23059	2.23758	3.45698	4.11369	0	0	1.19125	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00068948 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00068948 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00068948 (transcript) - C. hemisphaerica