TCONS_00068810 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00068810
Unique NameTCONS_00068810
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length674

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00068810 ID=TCONS_00068810|Name=TCONS_00068810|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=674bp
AAAATTCGGATGGAACAGAACAGTAGACAGAGCAAACTTGTATACAGCAG
AGGAAAATAAAGATGGATATTTTGCCAGCAGAGATTTGGATTCACTTTAT
TCTTACAAATCTAAGTATTATTGATATTTGCAAGCTTCAGACTGTTTCAA
AACAATCTTTTAGCCTGGTGAAGTCGTACATGAAATCAatgaaatgttta
tattttgatGAGGAAATTGCTTTGATGTTGAACGAAGAAgGTGACAGACA
CTGGTGTTTTGGCAATCGCCAAATTTTCTTGCAACCTTAAACACCTCATT
ATCAGCTCTAACTATGGAATAACCAGCAAAGGTTTATCTGCACTACTCAA
ACAATGTACCAATTTGGAAACACTTGATATTGGGAGAACCTATTTATCAA
ATACCTCATTCGATGATATGTTGAGGGAAGGTTAtgccaaaaatttaaaa
gaaattcgACTATACAAATGTCCAAATATTTCAGAAGGAATAATGGAACG
TCTGGCAGCCAAAGGCATTATGATCAACTCATGTTTTTGAAGAATCAAAA
TGTTTGACCTTACTCCTTGCCTAATCAGTTTTTTCAATAATGTCAGCTAC
TTGACCATACAAAATCTTTCCTCGCAGCTCCATTTCAAAAAAAGGCTTCG
AACTAACCACATTGGGCAGTGACC
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_49:755140..766374+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00068810 ID=TCONS_00068810|Name=TCONS_00068810|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11235bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_49:755140..766374+ (Clytia hemisphaerica)
AAAATTCGGATGGAACAGAACAGTAGACAGAGCAAACTTGTATACAGCAG
AGGAAAATAAAGATGGATATTTTGCCAGCAGAGATTTGGATTCACTTTAT
TCTTACAAATCTAAGTATTATTGATATTTGCAAGCTTCAGACTGTTTCAA
AACAATCTTTTAGCCTGGTGAAGTCGTACATGAAATCAatgaaatgttta
tattttgatGAGGAAATTGCTTTGATGTTGAACGAAGAAggtttgaaatc
aatttttgcTTCTCTGAAATTTATTGAACAGATCTCACTTTCATTATGCT
GGAAATCTGCAACAGAAACTAATTTACTATTGTTAACAAGCAATTGCTCA
agaattcatttttttgaagCTGGCCATTCATCAAACATTACAGACAATGT
TTTGTTAAATCTCGCTGAAAATTGCCCCAAACTGGAGTTCTTAAACATTG
GTTCCTGCTATAATGCAagtggataaatatttttttattaaataagGTAG
AGTTCAGAATACAAACTACAAACCAAATTCTCTCTTACTGCCAGTAAGTT
TAAACCTGTCAACCCATTCTGGAAAAAAAGCTATAcaccagacccccgcg
ctcgataggatcgatcatcggaacggctcgatgacggatcgatatgtgat
cgatggattacttatcgatccggataggagatcgatgNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNGGTCGCTTCATTATTTCTTATTCGGCATTTCAAAAAAGGGT
CCGAAAATCAGaaggttttcttcttcaatttccgaAGAACATGTTCCAAA
TCTTCGAAACCATATTTTTCCGATAGCTTGATCGATCAGTGAACGGGATC
TGAAAACAGAATGGAAAAAGACATCGTCAGTAAAGTATGAGAGGCGATTA
AACAAATTATCCAATTCACCCCGggtatccgattcaccccgtcctacggt
agaggtgtcgataggtaatcgataggtgtcgataggtaatcgatagcgag
aaagatcgattaatattagagctcgatttttagaaagggtcgatagggtc
gataagatcgataaaagatcgatgatagatcgatgatagatcgatgatag
atcgataactaatcataagcttaaaaaaatcttgagtatcNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNtccgtcatcgagccgttccgatgatcgatcctatcg
agcgcgggggtctggtatACATACGTTGGATTACATCCGGTGGTGTAGAC
TTTCAATTTCAAGGGCTTGAGTAGGccacgtcatatcttccttcgttttg
agcgtaaaactcgtactcttcgggctatgagcactgctcttgttttgaat
attgaaattctccagataaatcgcatgcacactgaggttttaatgaaaca
atagagagtttcgaaacctaagccaatcagctgtgttttaaacattcttt
tatttaaaatctctatNNaataagcaattcccggtgggggtcactagtgg
ccgcctatagcagtgcctatagacgccgcctatagcagtgcctatagacc
aagagtaaggcctaaaagcctggatctgtctattgtgtagactaggtCTT
GAGTCAGTCTACgccaaaaaatatctggtttATATATTACCATCTTTCCA
GAGTGTTATTAGACCTTTTCTTATCGCATTGTCATGTCAAATAGTTAGAA
AAAGTAATTGAACTTTACAGGGAAATCTTTAGTTCGATATAGAGCTTTTC
TAAGTTTAAGGTTTGCTTACATATTGCTATTTGTTTGATTAATGTTTGGT
TCCGCTTATAAGTGCGTCAGCTGTAGCTTAATACAAAACGCTGTTCAAGA
AGCTCAATAATAATTTATCAGCAATAACTGTAAATTGTACACATCAAACG
TCAATAAACTAATCAAACTAACTAACCAAAGGTTTGATTGAGTTTGATTA
GCTCAACAAATGGAACATTTTCAtcagtttttttccaaaacaatTTGTCG
CAggcaaagattttcaaatttttcattttcaaagtagaAGTGATGTAAAC
CTTACAGCGCCGCATTTTTTTCATTgagatgaaaatttcaatttttacct
ATATTTGAGAGAAACGTAGAAATACCAATAACTGGCaacccccttaggaa
attcataGGGTTCTATCAAAATCCGAGAcccccctaaatgtaggggggTT
AGAAATAATGTGTTCACACTACATTATATTTGGGAGAATGTACTTATACC
CTgaatcaaattttagaaataatgCGTTTGGAAAAATTACTTTAAGGGAG
GGATATGAAATCAGACTATTTAAAGGGAGGGATAAGTAGTAAGGGTTTTC
AAAGGAAGTGACTGGCAGTGATAGTGTTTTTGATGATGTTAGTTTATACC
ATGAAGtgtgctattttttcaaaaaagatttcctaTCAGTAAATTCTCTA
AAAAGAATGTTATACAGCTCAAAAGTAATTGGAATTTATTAGTAAAAATA
TTGGTACAGggggggggtccatgtacaaaacagcggcatgtatcagtact
ttgtagcaaatttcgattttaaacacccacccacccctataGTACACAAT
GTACAAAATAatatccagcaaactcccaaaaacaccccaacaccccctat
attttacaatatactatccagcactatccagcaaactcccaaatacaccc
tgacatcccctgtataatacaatatactatcaagcaaattgccaaatata
ccccaacaccccccttacatagtacaatatactatccagaaaactaccaa
atatacccctacaccccttcataaaataaaaattttaagccaaaaaactt
gaaactttggggcaagttttttattcttcccataaaaaaattttcaaaag
attttctcgaaaattgtcaaaaacattgagaattttaaaagattttcgac
aaaaatctaaaataaatcacaattttatttgattttggctttttagtaca
caaatactaagcagaaaatccgaaatttgaccctgacaccccctgtatag
tACAGGTATACTTAACAgcaaatcagaaatttgaccCCCATGTATAGTAC
ACAAGTACTAAACagctaattttttttgaaaacacccacccaccccatga
TACATGCCGCTTTTCTGTACATGGACCCCCCTGATTggtattatatattt
tttctaaatacgGTTGTGGGATTCTTAAGGTGAAGTATAAAAGAGAGGGC
TAGATTTATAGGGTGGGTAGAGACCTCTTTTCAAACTTTGTTAGTTTGAT
TTGATCATGCCGGTTCCATAAATGACTATTTCTTCCTTGGTCCATATTCT
TCAGAAGAGATACTACAAGGAATGAGAAAAGAAGGGTATACCTGGCATCT
GGTTTAAAAGTTAGAACGATATAAAGGATGTCCTAGGAAACATCTTGCAT
ACGATTTAGATGAATATCTTATAGTATCTCAATGTTATCATTTCAGGTGA
CAGACACTGGTGTTTTGGCAATCGCCAAATTTTCTTGCAACCTTAAACAC
CTCATTATCAGCTCTAACTATGGAATAACCAGCAAAGGTTTATCTGCACT
ACTCAAACAATGTACCAATTTGGAAACACTTGATATTGGGAGAACCTATT
TATCAAATACCTCATTCGATGATATGTTGAGGGAAGGTTAtgccaaaaat
ttaaaagaaattcgACTATACAAATGTCCAAATGTAAGTTCATGTTGAAC
GTTGATAATTGAATTTTTATATGTGCAATCCATGTTAGTAAAATTTTAGC
TGGGTCAAAGTATTTGCTATAGCTTGGTAGCCTTGCATTTGTAGAATCTC
GATCCTTGACAGTTCAGTGATTCATGCCACCTTCAGGTAGGGCCCAATAA
GGCTTAATACTGTAATGGTATTGATTTTTGTTAGGATTGAATTttgcggt
tgagctcatccgtgaaattttgagcttttgcaGAGACTTAATTCCGCAGA
TGACTCTATTGTCAGTTGTTGTGagaaattatttattatttgctattttt
gctattttactGCCCAACTATGCATGTTGGTTGTGAAATACGCATTACTA
GTGCTTCGTTGATGGCGGTAAACATGTTAAAAGTGGTCTTTTGGAATTCA
ATGCAAAAAGATTTCCTAGATAAAacctttcaaatttccaattGATTACA
ACCAAAGCTgcgaaaaaagcaaaatttaaTCGCAGCAAAAATTAGTCCCA
CTAATgaaaatttagtgaaaatttagtTTACAGCATACCTAAGTATATTA
AAAGTTCATCTATTGACTGAATAACACATAATAGCATTGGTATTATATTT
TCTAGATTTCAGAAGGAATAATGGAACGTCTGGCAGCCAAAGGCATTATG
ATCAACTCATGTTTTTGAAGAATCAAAATGTTTGACCTTACTCCTTGTAA
GTAGTTTTGTTCTCCTAATGGGCATACACAATAATGTTTAAAACCtaaga
ttttaattaaaaaatatgagATTTGTATTTAAATTGTGCAATTAGCATCA
ATCACCAGTTTATTTTTGTGGGTGTGTTTGAGTATGGGGCTGGGTGTAGT
ACACTTCTTGCTTGGACTTTTGTACTCTTGATCAATTAATGTTATCAATT
AATACTAATTTGAGTCATCTTCATTTTAGGCCTAATCAGTTTTTTCAATA
ATGTCAGCTACTTGACCATACAAAATCTTTCCTCGCAGCTCCATTTCAAA
AAAAGGCTTCGAACTAACCACATTGGGCAGTGACC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042904XLOC_042904Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1491911889:755140..755379TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1491911889:755140..755379Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1510915933:755140..755379TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1510915933:755140..755379Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1575043694:755140..755379TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1575043694:755140..755379Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1491911889:765086..765322TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1491911889:765086..765322Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1510915933:765086..765322TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1510915933:765086..765322Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1575043694:765086..765322TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1575043694:765086..765322Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1491911889:765945..766035TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1491911889:765945..766035Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1510915933:765945..766035TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1510915933:765945..766035Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1575043694:765945..766035TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1575043694:765945..766035Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1491911889:766269..766374TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1491911889:766269..766374Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1510915933:766269..766374TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1510915933:766269..766374Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1575043694:766269..766374TCONS_00068810-exon-scaffold_49-1575043694:766269..766374Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_49supercontigscaffold_49:755140..766374 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.85148	0	0.644973	0	0.870179	1.18819	1.20165e-06	0	0.646057	0.674922	0.646089	0.645035	0.553685	0.69708	0.0780391	0.712255	0.449448	0.524613	0	0.163254	0.960244	0.744057	0.480527	1.08911	0.587033	1.3237	0	0.487355	0.0868635	0.432873
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00068810 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top