TCONS_00068689 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00068689
Unique Name	TCONS_00068689
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4813

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_487:32638..40623+

transcript sequence

>TCONS_00068689 ID=TCONS_00068689|Name=TCONS_00068689|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4813bp
ATCGatcgaaaaagtttttcacgaaatttgagcaattttatgttcatttt
gatttgatcgaGACTTCATTTTCTCTAATGAtgaatattttggaaaattc
aagTTCTCATCTATTTTGAGCACAAGGTTTTTCTCAGGAGGAGGAGGAGC
TCAAAGGCTAATGTTTTAGTTTGTGtgaacaaattttatttgagttgtga
ttttcttttttggaatttcttAAAGAGAATTTGTAATCATTTTTGTTCTT
GTACAAAATGAGTTGTGTTTGTTCCTTGTTTTGCCGCACCAATAAAGTGT
CGGTGACATCGAGCAGTAGCGAAGCTGAAGAAGAATATTTCAACGAAACC
GAcaacgaagatgaaaaacatGCCGGCAAtcccaaaacaacaaaatacag
cGAAAAACTAAAAGAAATGATCGCACCCATGTCAACTAAATTCAACCTAC
ACAAAGAATATAAAAAACTTGAATACCTGTGTGCTTTCTTTGCTTGCGCG
TCACACCGTACGAACGTTATCTTACGTTCGCTAGGTGCGTTATCATGGCT
TGCTAGCGTCGTTATTCATTTTGCCTTCGACGTTAACGAGGCCATAAAAG
TCTACGGCTACACCTTCTTAGCAGCGCAGTTCTTCTGGTTGTTGAACTTC
GTGGTTGGCACCCTAGCTATGCGTTATCGTGTGTTACCATGGTTACTCGA
AGGAATGAAAGAATTAAGACACGATGAATGTTATGAAAAAACAATCACAA
ATGTGCTCAGAATGGTTAAGaaaattccGTATTGGGTTCTCGCGTTCGGA
TTTGTCGGCTCTGGTGCCCAACACCTTTTCTTATATATCGATGATGCGTT
TAACGGTTCCTACAATTCATGGATGGAATCTAAAATCGTGGCCTCAATAC
TCTTGATCGTACGTTTCGTAACAGCCGCTCATATTTACAGCGCTTACCTG
TTGTTTTGGATGGGTCCAACTGCGGTAATGATGGCGTGTGGTTACGCTAT
GTCCGAGTTCTTAGATCAATTCGATGCAAAGATTCGAGACACAAACCGAA
TAACATCATTCAAAGAAGCCATCTCGTTGTATTCAAAACGCGCCAAATTC
GTCAAAACCTCTTCCTCCAAGTGTTTAGTTATCTTATCCATGCAATTACT
ATCTGTCGTCATTTGTTTTGGTTTAAACACATACGTCTTCTTATTCTCGC
CTGTTAGAAGATATTTGCATGTTTGGCACTCCATTGTCCCACTACTCATC
ATGGTTTACCCACTATGCACTGCGGCATGGGTTACTAAACAGTACACTTG
GTTTATTATAGTTGTTGTACGAGCTTGGGTGCATCGTGACGATTTAGATT
CATCATCCAGTGATGAAGATTCAGGAATTGATGAAATGAAAACGAGTCAA
GATAAAAAGACATTCGCAGGGAAAAGTCCTTTCTTCTCTAAAAAGAAACT
AGACGAGTCTATTAGTTCTTCAGTTGCTGGCATCTTCAAAAGCGGCCGCC
CAAAGTCTGCGCATTTCGATTCGCAACGGAAACTGTCTGGATTCAGGCGA
TCATCAAGTGTACAAATTAAGGACCGTAATAAAAGGAAATCAACGCAAAA
TCTCATGCCTTGGCAGAAAGCAGTAGCTGAGAAACAACTTTCTGATCCGG
GAAATATCGTTGGCTCGACTACCTCAATAAACAGTGTGCCTCGATTTGCT
TCAACCGTTGCTGCGGCAACTGCTATAAACAAATTTAAGAATGTAAAAAA
CAGACCGAGATTCAATTTCGAgaaatttttatcttatttagagAGCATGC
GTAGTGTGGTTGGGTTCTCCATCTCAGGGATTATGGTCACGTGGGACTTG
GTCTCCACCACactgtttttattgttttccaTCATAGCTGTTTTCATGCA
GGAATCAATCTTTGGCGATCAAAAAAGTACGTTGACTTCTTGATCTGACT
ACAACATAAGACCCTGTCCACACGTTGCATGGTGTGAATCCTTTTGAAGA
CAATGGAATCATTCAAATTGGCGTGTTTGGGATTGAttttatttatctta
tttttatttataaaaccgATATCGTGTGCTAAATGTAAATCCAGCCCAAT
TTTTTGGAACAGCGCGATTAAGAGTTATTAATTGCATCCAAACACTACCT
CTTTGAGCTTTGGCCCACTGGGCCTTTTTCCTTAATCTAGTGCTGTAAAA
TAAGTCGACATTTCAAAATTGGACTAAGTATTGATCCTGTTTTTGTGGAA
TTTGCTACTGTGTGCTACTACCattggataccccttaaaatcacataccc
cttaaaacctacaaagttgcACTTTGGGCTCTCTTAGccaccaaacttaa
tttaataGTATAATTCACTTTTCTACTACCTGTTATAAATTTgctttcat
aaaatacctaatttcgAGAATTCAATTATCGCGAAGTATcgtaaaattcg
aagttatttgaaaattcaagtttTTCGAACCTAGAGATTGCACAATTGAG
TTTATAGTCATAAAACCGATACTTTTTAGGTACCTATttatggtaggtat
gaaaaaaatcattttcttcttcatgatTAGACTCAACCGAAATCGTAAGG
CCCTGAAAGTTCTATTTCAAGGCTCATTATAGTAGTGGCCAATAAAATCT
ggaaatcgactttctcaaaacctggtcattctgtataccaaaatgtcaca
aattcgatggagatttagaaaaacattagtaccatacgtcaaaaatgaag
ttaataaaagttttgaccctTCAAGGtcgttttttgaagaaaaaaacaag
tgCAATTGTATTATGGgtatgaaatcctgaaaaatacaaatacacgtttt
ttttttataagaacaaactatataagaacataaggcttcgagcccaaaaa
tttaagaacattctaagaacatactaaggctttggagacttaaaaacatg
caatttcttaagaaattacatcaaaatgctcaaaaaatgctgaaaataag
aaaattttaagaacatttttaggcttcaaattcaaaaaactaagaacatc
cgaaggcttcgaaaattttcgatgttcttataaaaaaaaacgtgtattgt
ttTTGGAATGGATTTCcagcaagtatttgatcaattgaatcacggTTTAG
CACCTGGATTGCAATTTCACAGTCTCAGTATGTTGTGAGTAAGGGGTcaa
tgtttgtaggttttaagatGTAATAGTGAAGATTTTAAggcatattttga
ttttaacgtacagttttgaaaGTATTTAGGTACCAATGATCCAATTGTAA
CGGtagtaactttgcagtgaatcactgtataaaattttagaccaaacgga
ctattttataaaaagttattcgagaaaaaccattttgtcaaaaggacatt
ttttcatgaaaaactgaaaactggttTCTACGAAACATCACTACTAGGGA
AGAAAACCATTGACagcgtactttcaacacaaaaagtttcagcctcaaat
TCCACCTAAATTTTCAGATAGAGGGTACCTCTATTACTTGTAGGTTTAAG
GGGTACCCACTGGTATAGTTTCGAGAGATAAATACAAAGTCTAAACTTAT
CTAGCATATTTATATGGCAGGGCATAACCCTATGAATGTGAAAAAACATG
GGTCAATAAACTTAAAATAAATTGTagatatttttttagaaataattatt
taacataatttaaagtttgatatgaaagaattttttcatCCCTATCCTCG
AAACAAAACTTCTACTCGTAAGTTCAATGTCGCAAGTTTTGTTCTGTTTG
ACgaagaattttattatttttgttaacTGGATATTGTCAAGAGCCAGATC
AAAGCTTTACAAGTGTTTGCGGCTTCTTAGtgaaaaataacttttctgCT
GCTTCATATAATAAGCTCTCCTCCATTCCGTCATACAGTCAGTCTAATTG
ACATCAATGTTCCTTGTTTACATACAATGACGTATGACTAAAAAAACACA
TTGACCTTCTTAGCTTCAACAAAACTTAACCACGAGTTGCCGATTTCATT
TAGGTTTCATGATTACCAAAAATTACACCGTGGAACACAGAACCACAATT
CATGATATCCACGAGGTAATGTTTTTAAGGAAACACCTCGGTTTTTTCCA
GTAGTGGCAAACTTTGAACGGAAAAGAACGGGGAGTTTCcgtagaagaaa
aaaatattgcgtCATGAATATCACAAATACAACTTGCTTCTCTAATGAAT
GGAATGATGATGCCAATACATAAATTCGCTGGTTGGTGAACTCACATGTC
AATGCAACATAATAATGTAGACAGGCTAGCCACAAGTTCAGCATCCAATG
TCCATTCTATGGTTTTATTCGGTTCAACAAATGAATCACCATCAAACTTG
GTAAAGGTCTAACTtattctttgatgtaccattgtctcattttaatgatt
ttaaatCCAAAAGCTGTGAAGACTTCTTCTTCCGTAGATCTTGAATACCT
TCCAATTGGAGATTCCTTCTCGTTCAACCAGAGCCCTCTTCCATCCAGAT
ATCACTTTCCATTCAACTTGGTAAAGGTTCCATGCTTGTTTTGATATCAT
GATCTCTCTGTAAAACTTCATTATTGTTCAATAGCCTTTTCCTCCTTTTG
TAAAACTTATACACGATATAAACTCCAACACCAAGAATGAACAAGATGAC
AATTCCAACGATTACAAAAGCGATCTTGGTTTCACTTCGCGTTGCATCTC
CTGTTAATGATGGATCTTCAGATTCTGATGAGCTACTCATTTTCTTTCAA
TACTTGATGATCT

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_487:32638..40623+

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00068689 ID=TCONS_00068689|Name=TCONS_00068689|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7986bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_487:32638..40623+ (Clytia hemisphaerica)
ATCGatcgaaaaagtttttcacgaaatttgagcaattttatgttcatttt
gatttgatcgaGACTTCATTTTCTCTAATGAtgaatattttggaaaattc
aagTTCTCATCTATTTTGAGCACAAGGTTTTTCTCAGGAGGAGGAGGAGC
TCAAAGGCTAATGTTTTAGTTTGTGtgaacaaattttatttgagttgtga
ttttcttttttggaatttcttAAAGAGAATTTGTAATCATTTTTGTTCTT
GTACAAAATGAGTTGTGTTTGTTCCTTGTTTTGCCGCACCAATGTAAGTA
TTTAGCGTCCGAAAGTAGAGTGTCTGTGAAAGAGGCCAAATGAAATTTCG
ATTATAGTGACTTTTCGCCTTTGAGGTTGTTTCTATCTTCTTCATATCCA
CTAGCTTCATGTGACCGAGAgaaattgtttgattttttcaagTTGTTGTA
AAAGTTGTTGTTTTTACGTTGATATGGTTAAATAAAAGCTAAATAAAATG
TCTCAAGAATGATCTATTTTCCTTCCACAATCAAAGCTTAATCTATAACG
GTTGTTGAAATTAAGGGATCAAAATAATACGTGATTCTTAGGATTAATAT
TGTTGACCTGCAAACGAAGACTCCCTTTAAAAcgagttcttataaaacat
aCTTTAAATCAAGTCAGTTATATTAAAACCCAAGGAAAGGTAAGTATGGC
TCTTCCATTAGAATCTTTGTCTTTTGAAAAGCTTTCTCTGCAATTGGCTA
CACCAGATTCCTTCATTTCCATCGtaaaactcaaatcaaaagCCTCCTTG
TAAGGATCGGGTTTAAACTTTCGTTCATACATTTTGGAAACTTCAGTTCT
CCATTCTATCCCCTTTCAACAGTTTATATAGCAACATAAACATCAACTAC
TTTCCTTCTTCTTATCTTCAGAAAGTGTCGGTGACATCGAGCAGTAGCGA
AGCTGAAGAAGAATATTTCAACGAAACCGAcaacgaagatgaaaaacatG
CCGGCAAtcccaaaacaacaaaatacagcGAAAAACTAAAAGAAATGATC
GCACCCATGTCAACTAAATTCAACCTACACAAAGAATATAAAAAACTTGA
ATACCTGTGTGCTTTCTTTGCTTGCGCGTCACACCGTACGAACGTTATCT
TACGTTCGCTAGGTGCGTTATCATGGCTTGCTAGCGTCGTTATTCATTTT
GCCTTCGACGTTAACGAGGCCATAAAAGTCTACGGCTACACCTTCTTAGC
AGCGCAGTTCTTCTGGTTGTTGAACTTCGTGGTTGGCACCCTAGCTATGC
GTTATCGTGTGTTACCATGGTTACTCGAAGGAATGAAAGAATTAAGACAC
GATGAATGTTATGAAAAAACAATCACAAATGTGCTCAGAATGGTTAAGGT
ATTACGGTTCTTTACCTAATTCGTTTGCGCGTTTTACCCTCTTAAAACTA
TAATCCTGTGAACCTTGGAAATACATAGCCGAAATCATCCACTGTATTTT
TGCCTGTGCTGTCTGTCCATGCTCATACTCGAGATAATGAAAACTCaaat
agttgtaataaaattgttgatgaaaatttgatatctgGAAGCAACCCAAT
ATTTAGTTAAGGTCGATGACCATGTACTTTTTCAATTCTTATTTTTAATA
ACGTTCGGCGTAACCTTTAGACATTTTAGGTGAAAGACATTcatgtattt
tgtttttcttagaaaattccGTATTGGGTTCTCGCGTTCGGATTTGTCGG
CTCTGGTGCCCAACACCTTTTCTTATATATCGATGATGCGTTTAACGGTT
CCTACAATTCATGGATGGAATCTAAAATCGTGGCCTCAATACTCTTGATC
GTACGTTTCGTAACAGCCGCTCATATTTACAGCGCTTACCTGTTGTTTTG
GATGGGTCCAACTGCGGTAATGATGGCGTGTGGTTACGCTATGTCCGAGT
TCTTAGGTAAGGTGACTTCCGTTCAAATCTGGATTAAGGGCTAGAATGGG
CATCTAGTACTTTTGATTAGAAGAGATTGTCAGTCGTTTCGGAAAAAAGA
TGGAACTGTAGAGCAAAGGCAATCAGAACTTACCTATTCTACATAAAATT
GGGAAACTTTTGATTTGTAATATGTCCagtactaccttaagggaacttat
tttggcgggaactaattttgacgagcggTAAAAATCCTGGAAATTTTGCc
gattgatgaatttttttaattttgccgggAACTAATTTcggcgaattttg
tctaaatttgccgaattcgccaaaattagttcccgtcaaaataagttctc
ttAAGGTAGTAAGCTCGTTGAGTCAGCTCCTGGACTACAATGGCTTCaat
taccagtggataccccttaaaacctacaacaaaaaaggtaccccctatat
cctgataaagaaaacagtaagggctgaaactttttctggtgAGTCTAGGC
TATCTATGAGCTTCTTCCCCGGGTATGGTTTTTTGTAGAAGCTGCTAAGA
AAATCTTTATTGCTTtgtgaaaaaatgcaattttagctatttacccctta
aaacctacaaaatggttttcttgaataactttttatagaatAGTCCTTTt
agtctcaaattttgaacactgCAAAGTAAGTAATGGTACATTTAGATCAT
TGGTaccttaaaatttttgaaacgttactaatgtttttctaaatctccat
caaatttgtgatattttggtatgcaatatgaCCAAGTTTGAGAAActcga
ttttcaaattttattggcCATTACcataaatgagctttaaaatagaattt
tgaGGGCCTTACAATTTCTTTGGGGTGCAACCAtggagaagaaaatgatt
ttttcgtatctaccataagtataggtacctaaaagtataggttttatgac
cttaaattgatttgtgtaatctctaggtccgaaaaacttgattttttgaa
gggatttttgataaagttttcaataacttcgaattttacgACATTTTGCG
ATAATTAGAATTATTGAAATGAGATATTTTATGAAAGTACCTATATTAga
gattgtaaaaaagtgaattatacaatattaGATTAAGTTTGGTGATTAAG
AGAGCCTAAAACccaactttgtaggttttaaggggtatgtggttttaagg
ggtatccactggtatatGATCAATTCAGAAATTCGAAAGAAAAAACTAGG
AAAAAGTCAGTAATTTCCTGTAAAAAACATTTGGTACAACCTTACTACTG
TTTATCTCTATTAAGTAATCAATTAACCAACTTCGTTGCCGTGTATccaa
ggctttatttacgttactgatacGCATCAgtgaataccctggtgttggct
ggtGCCAGTCTCCCCTCTCAAAGAAGGTAGACTATTCACAAAACAATTCT
CGGATATTATCTGGTTCTGTTTGTAAGCGTCAAAAAGCCGATTATAAACA
GGAAACGATGTTGGATATCAACGACAAATCTTTCAATCAATTCCATTATA
GATCAATTCGATGCAAAGATTCGAGACACAAACCGAATAACATCATTCAA
AGAAGCCATCTCGTTGTATTCAAAACGCGCCAAATTCGTCAAAACCTCTT
CCTCCAAGTGTTTAGTATGTGTCATTTCATTATTAATTATTTTCGAACAG
ATTTAGGGGAAATGAAAGATTTGATCTTGTGTCCTTTGGAAGATAATTTA
GTAGGAATTTAGTTTAGGGGATGGCTAATTTTTCATAGGGGGTTTAACTT
GAAAGAAGGctggaaaattttattttggagAGGATTGATATGGCAGCTGC
TTGACCTTTTTTTGGACATTCGAAGTAGATCAGGTAATGAAATTAGGTAA
TAGAGGGGGAATACTGTCTATCGTAAACAACTTGCTTTTTGATGTTATAG
CTGAAAAAAGTGTTCTTTACATAGTTTGTAGGTTTAAcaagatttccaaa
atttagACTACCAGTAGGGTTAAAACCACGGATCATTATTGATAAGCTAG
TGAAATTATACTGAAATTTAGCCTTAAGTTTTAAGTTCAAGtcttaagtt
tttcttttctttctacaACAGGTTATCTTATCCATGCAATTACTATCTGT
CGTCATTTGTTTTGGTTTAAACACATACGTCTTCTTATTCTCGCCTGTTA
GAAGATATTTGCATGTTTGGCACTCCATTGTCCCACTACTCATCATGGTT
TACCCACTATGCACTGCGGCATGGGTTACTAAACAGTACACTTGGTAAGT
TGTTGATTTTGTTTCTTATTTATATAAAACTTTAAACTGTGTAGAAGATT
TTAAATTTAGGTTTAAGTTCAAAAAGCTGTAAATCTAAGGAATAAGAAAA
AAGCTAAAGGAACTAGTTTGTTACTTATCACATAAGGATGAATGTTCTTG
GGTTCTTCCTGAAAACAACCTTTGTCTGAAGGAATTGACTACAGTATAAC
GATTTTTCTTCCTTTCGTTCCAGGTTTATTATAGTTGTTGTACGAGCTTG
GGTGCATCGTGACGATTTAGATTCATCATCCAGTGATGAAGATTCAGGAA
TTGATGAAATGAAAACGAGTCAAGATAAAAAGACATTCGCAGGGAAAAGT
CCTTTCTTCTCTAAAAAGAAACTAGACGAGTCTATTAGTTCTTCAGTTGC
TGGCATCTTCAAAAGCGGCCGCCCAAAGTCTGCGCATTTCGATTCGCAAC
GGAAACTGTCTGGATTCAGGCGATCATCAAGTGTACAAATTAAGGACCGT
AATAAAAGGAAATCAACGCAAAATCTCATGCCTTGGCAGAAAGCAGTAGC
TGAGAAACAACTTTCTGATCCGGGAAATATCGTTGGCTCGACTACCTCAA
TAAACAGTGTGCCTCGATTTGCTTCAACCGTTGCTGCGGCAACTGCTATA
AACAAATTTAAGAATGTAAAAAACAGACCGAGATTCAATTTCGAgaaatt
tttatcttatttagagAGCATGCGTAGTGTGGTTGGGTTCTCCATCTCAG
GGATTATGGTCACGTGGGACTTGGTCTCCACCACactgtttttattgttt
tccaTCATAGCTGTTTTCATGCAGGAATCAATCTTTGGCGATCAAAAAAG
TACGTTGACTTCTTGATCTGACTACAACATAAGACCCTGTCCACACGTTG
CATGGTGTGAATCCTTTTGAAGACAATGGAATCATTCAAATTGGCGTGTT
TGGGATTGAttttatttatcttatttttatttataaaaccgATATCGTGT
GCTAAATGTAAATCCAGCCCAATTTTTTGGAACAGCGCGATTAAGAGTTA
TTAATTGCATCCAAACACTACCTCTTTGAGCTTTGGCCCACTGGGCCTTT
TTCCTTAATCTAGTGCTGTAAAATAAGTCGACATTTCAAAATTGGACTAA
GTATTGATCCTGTTTTTGTGGAATTTGCTACTGTGTGCTACTACCattgg
ataccccttaaaatcacataccccttaaaacctacaaagttgcACTTTGG
GCTCTCTTAGccaccaaacttaatttaataGTATAATTCACTTTTCTACT
ACCTGTTATAAATTTgctttcataaaatacctaatttcgAGAATTCAATT
ATCGCGAAGTATcgtaaaattcgaagttatttgaaaattcaagtttTTCG
AACCTAGAGATTGCACAATTGAGTTTATAGTCATAAAACCGATACTTTTT
AGGTACCTATttatggtaggtatgaaaaaaatcattttcttcttcatgat
TAGACTCAACCGAAATCGTAAGGCCCTGAAAGTTCTATTTCAAGGCTCAT
TATAGTAGTGGCCAATAAAATCTggaaatcgactttctcaaaacctggtc
attctgtataccaaaatgtcacaaattcgatggagatttagaaaaacatt
agtaccatacgtcaaaaatgaagttaataaaagttttgaccctTCAAGGt
cgttttttgaagaaaaaaacaagtgCAATTGTATTATGGgtatgaaatcc
tgaaaaatacaaatacacgttttttttttataagaacaaactatataaga
acataaggcttcgagcccaaaaatttaagaacattctaagaacatactaa
ggctttggagacttaaaaacatgcaatttcttaagaaattacatcaaaat
gctcaaaaaatgctgaaaataagaaaattttaagaacatttttaggcttc
aaattcaaaaaactaagaacatccgaaggcttcgaaaattttcgatgttc
ttataaaaaaaaacgtgtattgtttTTGGAATGGATTTCcagcaagtatt
tgatcaattgaatcacggTTTAGCACCTGGATTGCAATTTCACAGTCTCA
GTATGTTGTGAGTAAGGGGTcaatgtttgtaggttttaagatGTAATAGT
GAAGATTTTAAggcatattttgattttaacgtacagttttgaaaGTATTT
AGGTACCAATGATCCAATTGTAACGGtagtaactttgcagtgaatcactg
tataaaattttagaccaaacggactattttataaaaagttattcgagaaa
aaccattttgtcaaaaggacattttttcatgaaaaactgaaaactggttT
CTACGAAACATCACTACTAGGGAAGAAAACCATTGACagcgtactttcaa
cacaaaaagtttcagcctcaaatTCCACCTAAATTTTCAGATAGAGGGTA
CCTCTATTACTTGTAGGTTTAAGGGGTACCCACTGGTATAGTTTCGAGAG
ATAAATACAAAGTCTAAACTTATCTAGCATATTTATATGGCAGGGCATAA
CCCTATGAATGTGAAAAAACATGGGTCAATAAACTTAAAATAAATTGTag
atatttttttagaaataattatttaacataatttaaagtttgatatgaaa
gaattttttcatCCCTATCCTCGAAACAAAACTTCTACTCGTAAGTTCAA
TGTCGCAAGTTTTGTTCTGTTTGACgaagaattttattatttttgttaac
TGGATATTGTCAAGAGCCAGATCAAAGCTTTACAAGTGTTTGCGGCTTCT
TAGtgaaaaataacttttctgCTGCTTCATATAATAAGCTCTCCTCCATT
CCGTCATACAGTCAGTCTAATTGACATCAATGTTCCTTGTTTACATACAA
TGACGTATGACTAAAAAAACACATTGACCTTCTTAGCTTCAACAAAACTT
AACCACGAGTTGCCGATTTCATTTAGGTTTCATGATTACCAAAAATTACA
CCGTGGAACACAGAACCACAATTCATGATATCCACGAGGTAATGTTTTTA
AGGAAACACCTCGGTTTTTTCCAGTAGTGGCAAACTTTGAACGGAAAAGA
ACGGGGAGTTTCcgtagaagaaaaaaatattgcgtCATGAATATCACAAA
TACAACTTGCTTCTCTAATGAATGGAATGATGATGCCAATACATAAATTC
GCTGGTTGGTGAACTCACATGTCAATGCAACATAATAATGTAGACAGGCT
AGCCACAAGTTCAGCATCCAATGTCCATTCTATGGTTTTATTCGGTTCAA
CAAATGAATCACCATCAAACTTGGTAAAGGTCTAACTtattctttgatgt
accattgtctcattttaatgattttaaatCCAAAAGCTGTGAAGACTTCT
TCTTCCGTAGATCTTGAATACCTTCCAATTGGAGATTCCTTCTCGTTCAA
CCAGAGCCCTCTTCCATCCAGATATCACTTTCCATTCAACTTGGTAAAGG
TTCCATGCTTGTTTTGATATCATGATCTCTCTGTAAAACTTCATTATTGT
TCAATAGCCTTTTCCTCCTTTTGTAAAACTTATACACGATATAAACTCCA
ACACCAAGAATGAACAAGATGACAATTCCAACGATTACAAAAGCGATCTT
GGTTTCACTTCGCGTTGCATCTCCTGTTAATGATGGATCTTCAGATTCTG
ATGAGCTACTCATTTTCTTTCAATACTTGATGATCT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_042848	XLOC_042848	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_487	supercontig	scaffold_487:32638..40623 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0.0993888	0	0.923649	0.437927	0.162046	0.484408	0.140249	0.218631	0.0871697	0.123809	1.45307	1.78064	0	0	0.106072	0.281579	2.50564	2.79953	0.648091	1.02772	0.125668	0.132303	0.71199	0.466059	0	0	0	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00068689 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00068689 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00068689 (transcript) - C. hemisphaerica