TCONS_00068361 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00068361
Unique NameTCONS_00068361
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length5930

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00068361 ID=TCONS_00068361|Name=TCONS_00068361|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5930bp
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Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00068361-protein

>TCONS_00068361-protein ID=TCONS_00068361-protein|Name=TCONS_00068361-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=1097bp
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KKIKLEEPDEMVYSPMEDENSMTPTNSPPPSRSITPKEEEQEIPLQT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_483:2977..35242-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00068361 ID=TCONS_00068361|Name=TCONS_00068361|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=32266bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_483:2977..35242- (Clytia hemisphaerica)
ATACTTAGTACCAATAATAAACAATATAAACAATGGAGATGACGGGTATT GCAAGCAGGTGACAACAAAGAAGTCATGATGATATCAGAGTTGAAGAACC TTAAGCCAATCAAAGAGGTAATTTTTCTTCTTTGTTCTGGCTATTCTTGG ATACAATTTTGAAAAATCGATTACTGAATAAGTAAGCTTACAATAACTTT TTAAGACCATTTAACCCTGAAAATCACAAAAAAGGAACATCAAAAGCCAA AATTTACTGGTTAATAAAATGAAACGTATAAAACCAATTTGTTTGGGAAC ACTGTTTGATTTCTTTTTTTTATTGCTTCAAATTGCAATGTAGTTTTCAG CTGGTTCATTTAGAAATCGGAAAACAGCTAGCAGTAAAAAAAGCTTGATT TATAGGGGTATTCTAAAACGACCCTGAACCTCTTTTCTCCATTGTATCCT CAATCCACCTGATTGATAGACATGGTAGATAAGATTTGGAAAACATTGGT GCTGTCACCAGTTTACCAAGGCCAAATAATGTTTGAAACAAGGGATAGTT CAGTATCTTTATTATGGTTTATTGTGTCGTAACGTGTTATAAAGGGCCAG TACAGGTTATTTAAGTATTATCATCTGTTTATTTAATATTAAAACATAAT AAACAACAACATGAAATTTGTTTGTCCTAACCAATCAATGGCTTTAAAAA TAGCTTTTACTTCTTTAAATCTAGTTCCAATTCATTAAAAGCGATATGAT AATCAAAATGTAATATGAATTTTTTTCTTTGTCAGTCTCTTTTGCATCAG TGATGACGTCACACTTACAGTACAGTCTGTTACTAAGGTAGCTGCGCGAT CATCGTTATAAAAACGTCATTACCAATATTCTCATAATCTGTTTGCTTGA AACTCAACAAAGCAAAACGTTTTTTATATAAGAAAAGCTGCCTTTCTAAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_483:2977..35242-

>TCONS_00068361 ID=TCONS_00068361|Name=TCONS_00068361|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=36234bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_483:2977..35242- (Clytia hemisphaerica)
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TCAGTCGACTTTCAATCGCAACGTTCTTTCGATTATTTTGATCGCCGACC
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CGCCTCTTGGTGCCCAGAAGATGGAACAGAACAATAACACCATGTTGACC
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TGGTAGTTCTGACTTTCGAGCAAATTATCCCTGGTACCCAACGTCTGGTC
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GAACCTCCTTCCTCGTCATCAACTGCAGCTTTCATGGCGCCCAAACTCCC
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CAGTTAAGGACCGTTACGGTAATTTTTTTGACCGGAGGAACGATTTTACA
CGGAAATACGGCACAGATGATTTCACACAAAGAGGATCGTTATCTGAATA
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CAATCGCAACGTTCTTTCGATTATTTTGATCGCCGACCTGACGGTGGTTT
TCACAGCCCACATCCAGGTCACCACGGTGTTTACAATAATTTCAACAATC
ATAAGAACCCGGCAGACGAACTACAATACACGTCATTAAACGACGTCAAA
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GGTTCCACCCAACGAGGCAAAAGAGTATCCAAATAGTCTTATAAACAGCC
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TATCAAGACAATCCATATAGCAATAGCCTGAATTTACCAACAGTTGCTAA
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CCCAGAAGATGGAACAGAACAATAACACCATGTTGACCAACAACAATGAT
GTCGAATTTGATGTCCCTTCGCAAATTAAGAAAATCAAAAAACTGAACCT
CCTTCCTCGTCATCAACTGCAGCTTTCATGGCGCCCAAACTCCCGCCTCC
TCCACCGCCTACCACACTCAATCTCTCCTCCATAGTCACGCAACCGAAAC
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GAATCCCACCCCACTAGTGGAAGTGACAGTATAATAACATCAACTCATCC
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TCAACTGCAGCTTTCATGGCGCCCAAACTCCCGCCTCCTCCACCGCCTAC
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CACCCCACTAGTGGAAGTGACAGTATAATAACATCAACTCATCCTGTTTC
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GTAATTTTTTTGACCGGAGGAACGATTTTACACGGAAATACGGCACAGAT
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GAATAATATGGAGTTCCGTAACCAATGCCAACGACTATCAACGGGCGATC
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GATTATTTTGATCGCCGACCTGACGGTGGTTTTCACAGCCCACATCCAGG
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GTGTCTCTACCAATAATAACAATTCGTGTAGTTATCAAGACAATCCATAT
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CGAGAATTCCGTAATATCACCTGTCCCGACCAGCACACTTTCGCCGGTAC
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GGAAGATGAGAATTCTATGACGCCCACAAATTCACCGCCTCCGTCACGCT
CTATCACGCCAAAGGAGGAAGAGCAAGAAATTCCTCTTCAAACTTGAAGC
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GCGAAGAATTTGCCCGCTCAGCCAAAGAGATGGCGGACGAACGCATGAAA
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CGCCCAAATGTCGGTGGTGTCGCCTCTTGGTGCCCAGAAGATGGAACAGA
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TCGCAAATTAAGAAAATCAAAAAACTGAACCTCCTTCCTCGTCATCAACT
GCAGCTTTCATGGCGCCCAAACTCCCGCCTCCTCCACCGCCTACCACACT
CAATCTCTCCTCCATAGTCACGCAACCGAAACCACCACACTCGACAGCAT
CGTCTACAAGTTCTCCTTCATCGAGTTCCACCGTAGAGACTATCACACTA
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GAAACCTTTGACAGGTGAAGAAAAGGATCGTAGACCCATGAACGGCTTCA
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AAAGATAATAGCTTTACTTTTAACACCAACGAAACGAAAATGTTCACCCA
GGCTACAAAAATAGTGGAAATGGTAGTTCTGACTTTCGAGCAAATTATCC
CTGGTACCCAACGTCTGGTCGCCAAGTGTCCTTCAGATCATCCTTTCTAT
GTCAAACACAAGGGTTGGGTAGCCTCAAGTCCTACTGAAGCAATGGCTCG
GTACGGTACTTCCTTCCGCGCTCTAGCAGTTGCTGACACTGTCATCCCGT
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CAACACCCGTATGGCTATGTTTCCTCAAAGCTAAATCTCTATTGACGCGT
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TGGAACCGATGGATCAGGAGTCGAATGGGGCCTTAAAAGTCCATCCAAGT
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GAAGTTCCCGGTACGGATACACAGAAACCCGGAAAACTACTTCGATGCCC
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AATGTCGGTGGTGTCGCCTCTTGGTGCCCAGAAGATGGAACAGAACAATA
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ATTAAGAAAATCAAAAAACTGAACCTCCTTCCTCGTCATCAACTGCAGCT
TTCATGGCGCCCAAACTCCCGCCTCCTCCACCGCCTACCACACTCAATCT
CTCCTCCATAGTCACGCAACCGAAACCACCACACTCGACAGCATCGTCTA
CAAGTTCTCCTTCATCGAGTTCCACCGTAGAGACTATCACACTAACGTTT
TCCTCAAAAGCCAGTGAACAAGATTCCAACTCAAGCACCGCCAAACTTGT
CAACGAATATAAAAACCTGATGACTAAAGACAAAACGAATAGAGACCCTG
AATTCAACAAATCCTTATCCGACTCAGAGTCTTCCCCCTCAGTGTCGGTT
GAAACGAACGCCCTGGGCGGTGGCGGAATACGTAAGAAACGAAGGAAACC
TTTGACAGGTGAAGAAAAGGATCGTAGACCCATGAACGGCTTCATGCTGT
TTGCAAAATCAATGAGAGTCGAATTAACTAAAGAATTCCCTGGAAAAGAT
AATAGCTTTACTTTTAACACCAACGAAACGAAAATGTTCACCCAGGCTAC
AAAAATAGTGGAAATGGTAGTTCTGACTTTCGAGCAAATTATCCCTGGTA
CCCAACGTCTGGTCGCCAAGTGTCCTTCAGATCATCCTTTCTATGTCAAA
CACAAGGGTTGGGTAGCCTCAAGTCCTACTGAAGCAATGGCTCGGTACGG
TACTTCCTTCCGCGCTCTAGCAGTTGCTGACACTGTCATCCCGTCACCAT
CGAGCAACAACAAATTGATAGCGACGCCGAGTAACACACTATCGCCGCTG
GTGAAATCCTCAGTCGCTGAAGTGCTGCCATGTGAAATTTGAGCAGGATG
ATCTTAACTTTCGAACATCAGAAGAAGTAGCCGATTACTGTACAACACCT
GGTGGCAGGAAGCGTGACAACATGAATTTCTACACTAGTGGTATGAAAAT
TGTTTGCATCAAGATGGAACAAAGCATGAATTCCGCAAGGTTTTTGTTGA
CACCGACAGTGCACCGTCAATCAGTGGGAAGTGAATCCCACCCCACTAGT
GGAAGTGACAGTATAATAACATCAACTCATCCTGTTTCGCCTTACAATAT
TCACAACATTCAAACACCTTCATATTGGCAACCTCAGATTTGGCCAACAC
CCGTATGGCTATGTTTCCTCAAAGCTAAATCTCTATTGACGCGTCGAACA
TCAAGGTCAAAGTCCATTCCACCGGCATTGGTTATCAACCCGAATCCATC
CTCAATGGAAATCGACTCCAAAGGTAAAGACGTTGGTGTAAAGAAAGACC
AAGCAAGCAAGCTCCGTCAACTGGCTGAATTCGCGACGTCGCCACGTAGC
CTGTACAACCACAGTCCATTAACGTCATTGACGCCAAGTCTTCTTGGAAC
CGATGGATCAGGAGTCGAATGGGGCCTTAAAAGTCCATCCAAGTTTTCTT
TCTCCGATAAATCGTCTCGTCAATGGAATCGATCCTTCAATCGCGAAGTT
CCCGGTACGGATACACAGAAACCCGGAAAACTACTTCGATGCCCGCAAGA
AGGATGTGGAAAAGTATTTCGCTCCTCACCTGGCTACAGATATCATCTCA
AGTCGCACGATATCGATCCGCGACCGCACGTTTGTCATGTCTGCCATAAA
AAGTTTAAAAGTGCAAACGGACTAAAGTATCATTTACGAAAAGCACACCA
CATTGAACCAGTTGCTTCCAAACAGAACAATAACAACAATAATGGGAATG
CAAATTCACCAAAAGATAGAGAGTCACTCTCCTCCGAAGAGGATCATTTG
TTTAACATGAACGAGTACAACTCTAGAGGCTACGTCAACGGTGGTGGAGG
GAGTTTTTCATCCGACAGAACGTCAAGCATCGCTCCATCACCTTTAACTA
AATCACTGTCTTCGCCTTTGATTAAAAACATTCCATTGAGTCCTTTATTG
AAAAGTCCGTTAGATTTTACTCAATATTTATCCACTAGTTCGAGTGGTTC
CGGATCACAGAGCCCATATCCAGTTAAGGACCGTTACGGTAATTTTTTTG
ACCGGAGGAACGATTTTACACGGAAATACGGCACAGATGATTTCACACAA
AGAGGATCGTTATCTGAATACACTCAACAATGTCATCAGAATAATATGGA
GTTCCGTAACCAATGCCAACGACTATCAACGGGCGATCTTTCAAATCCTC
GGTTACCTTCAGTCGACTTTCAATCGCAACGTTCTTTCGATTATTTTGAT
CGCCGACCTGACGGTGGTTTTCACAGCCCACATCCAGGTCACCACGGTGT
TTACAATAATTTCAACAATCATAAGAACCCGGCAGACGAACTACAATACA
CGTCATTAAACGACGTCAAACCGTCAACCTTACATGGTGGTGGACGTCTA
TTTAGCCCTTTTAAAGACTTGGTTCCACCCAACGAGGCAAAAGAGTATCC
AAATAGTCTTATAAACAGCCACCCTCATAACATGCCTTGTGTCTCTACCA
ATAATAACAATTCGTGTAGTTATCAAGACAATCCATATAGCAATAGCCTG
AATTTACCAACAGTTGCTAAGAGCCAGTGTCATTTATCACAAAACACTGA
ACAGATTGTACCGGATATTTCATCGCCCGGATGTCAACTTTCACCCCCGG
CTTACGACCGGAACAACAATAATCATATTACGAACGTTAAACGAGGTACT
TCGGAAAGTAGTATCGATTCGGATAGTGTTTTTCAGAACGAGAATTCCGT
AATATCACCTGTCCCGACCAGCACACTTTCGCCGGTACTACCATCACCTG
ATATAATCAAGAAGTTGAGAATGGATAGTATAACGGACACCAAAGAACCA
TATTTTCCTGATGATGATATCAGAGTTGAAGAACCTTAAGCCAATCAAAG
AGACTTGAAGAACCAGACGAAATGGTTTACTCACCAATGGAAGATGAGAA
TTCTATGACGCCCACAAATTCACCGCCTCCGTCACGCTCTATCACGCCAA
AGGAGGAAGAGCAAGAAATTCCTCTTCAAACTTGAAGCAATCAGTAAGCT
ACTGGGTGAAAGATGGCGAGAGTCATCGGAAGAGAAGCGCGAAGAATTTG
CCCGCTCAGCCAAAGAGATGGCGGACGAACGCATGAAAGTCAATCCTGAC
TGTTGGAAAAGGAAACATAAGAAAGACCCCAAAGATGGCGCCCAAATGTC
GGTGGTGTCGCCTCTTGGTGCCCAGAAGATGGAACAGAACAATAACACCA
TGTTGACCAACAACAATGATGTCGAATTTGATGTCCCTTCGCAAATTAAG
AAAATCAAAAAACTGAACCTCCTTCCTCGTCATCAACTGCAGCTTTCATG
GCGCCCAAACTCCCGCCTCCTCCACCGCCTACCACACTCAATCTCTCCTC
CATAGTCACGCAACCGAAACCACCACACTCGACAGCATCGTCTACAAGTT
CTCCTTCATCGAGTTCCACCGTAGAGACTATCACACTAACGTTTTCCTCA
AAAGCCAGTGAACAAGATTCCAACTCAAGCACCGCCAAACTTGTCAACGA
ATATAAAAACCTGATGACTAAAGACAAAACGAATAGAGACCCTGAATTCA
ACAAATCCTTATCCGACTCAGAGTCTTCCCCCTCAGTGTCGGTTGAAACG
AACGCCCTGGGCGGTGGCGGAATACGTAAGAAACGAAGGAAACCTTTGAC
AGGTGAAGAAAAGGATCGTAGACCCATGAACGGCTTCATGCTGTTTGCAA
AATCAATGAGAGTCGAATTAACTAAAGAATTCCCTGGAAAAGATAATAGC
TTTACTTTTAACACCAACGAAACGAAAATGTTCACCCAGGCTACAAAAAT
AGTGGAAATGGTAGTTCTGACTTTCGAGCAAATTATCCCTGGTACCCAAC
GTCTGGTCGCCAAGTGTCCTTCAGATCATCCTTTCTATGTCAAACACAAG
GGTTGGGTAGCCTCAAGTCCTACTGAAGCAATGGCTCGGTACGGTACTTC
CTTCCGCGCTCTAGCAGTTGCTGACACTGTCATCCCGTCACCATCGAGCA
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TCCTCAGTCGCTGAAGTGCTGCCATGTGAAATTTGAGCAGGATGATCTTA
ACTTTCGAACATCAGAAGAAGTAGCCGATTACTGTACAACACCTGGTGGC
AGGAAGCGTGACAACATGAATTTCTACACTAGTGGTATGAAAATTGTTTG
CATCAAGATGGAACAAAGCATGAATTCCGCAAGGTTTTTGTTGACACCGA
CAGTGCACCGTCAATCAGTGGGAAGTGAATCCCACCCCACTAGTGGAAGT
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CATTCAAACACCTTCATATTGGCAACCTCAGATTTGGCCAACACCCGTAT
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Expression

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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
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TermDefinition
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
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