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transcript sequence >TCONS_00067548 ID=TCONS_00067548|Name=TCONS_00067548|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=618bp TCCAACAGCAATGAGACTTTGGCTAGACATTGTGCTTGGTTGTCATAAGT TTATGGTCTGATGGTTGAGTGACTGGTTCCATAAATCGGTCCCCTTCCAC AATTCCAACCCAGGAGGGGACCCAGGAAACTCCAAAAAATCAACAATAAG CTTAGTTCTAAgGGTGTATTGTGGAATAACAAAAACATGTGGTGATAATG CATTGCGAATTTGGACATCATTTTTCGATCAAATCTCCCATGAGCCTTTG CGCAGCATAAGTGGTTGTTGTTGGTGAGTGTGAACCATTCTTTCTCTTCC ATTATAATAAGTgcaatataacatttttttaaacactacttcttttttta ataatttctttttaaaaccaTAGCCTCGCTTtcaaatatttcactcgttt cCATCAGCCAATCATCTTCCACGTCTCTCGAAGAACTCGTCTGGTTCGTC GTGTATTTCCTTGCATTTATACTTGTAACGTGTTTTCTTTCTCATCTTTT GTTTGGACCAAGTTTTCATCTTTTTGGACCAGTTTTTCCGTTCAACTTTG GTGCAGGTCAAACCAATGCCACATGAACATTTATTTCGCACAATACTGCC TGTTTTCAATTCCAAGAA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_471:112558..133139+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00067548 ID=TCONS_00067548|Name=TCONS_00067548|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=20582bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_471:112558..133139+ (Clytia hemisphaerica) TCCAACAGCAATGAGACTTTGGCTAGACATTGTGCTTGGTTGTCATAAGT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1491911889:112558..112612 | TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1491911889:112558..112612 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1510915933:112558..112612 | TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1510915933:112558..112612 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1575043694:112558..112612 | TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1575043694:112558..112612 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1491911889:129158..129264 | TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1491911889:129158..129264 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1510915933:129158..129264 | TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1510915933:129158..129264 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1575043694:129158..129264 | TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1575043694:129158..129264 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1491911889:132684..133139 | TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1491911889:132684..133139 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1510915933:132684..133139 | TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1510915933:132684..133139 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1575043694:132684..133139 | TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1575043694:132684..133139 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_471 | supercontig | scaffold_471:112558..133139 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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