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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00067547 ID=TCONS_00067547|Name=TCONS_00067547|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1224bp
CTCCAACAGCAATGAGACTTTGGCTAGACATTGTGCTTGGTTGTCATAAG
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AACTattaaaattagaaataaaat Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00067547-protein >TCONS_00067547-protein ID=TCONS_00067547-protein|Name=TCONS_00067547-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=158bp
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ITTPKTILSSFEKLCANQPEWCRKRMLNNKLRMKHSSDQRSRRHLLTSQY
ILSHKRRTQSSSTVDRKTQRNINQKLQRLATMQRTYDYIRENNKIIKRLQ
KFVKKEFS Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_471:112557..127968+ Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00067547 ID=TCONS_00067547|Name=TCONS_00067547|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15412bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_471:112557..127968+ (Clytia hemisphaerica)
CTCCAACAGCAATGAGACTTTGGCTAGACATTGTGCTTGGTTGTCATAAG
TTTATGGTAAGAAACCTTATTCAGAAATATATGTATCTTTTATAGGCTAT
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taagtaaattttttttaaacaaaagatttgtaaatatTCATATCAAGAAG
TATGACGCAGAGAAAATATAAGGATTTAATTTTAGGTAAACTattaaaat
tagaaataaaat Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_471:112557..127968+ >TCONS_00067547 ID=TCONS_00067547|Name=TCONS_00067547|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=954bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_471:112557..127968+ (Clytia hemisphaerica)
ATGCAGAAACCAAGCGGCGAAACATCTTTATTGATATCGATTTTTGCAAT
GCTGGCGACACTGGACATTGTTGCATCTTTAGCGGGTCCTCTGCAACATG
GCAATGGACAGTCTGGCAAAACTGTCGTCATACAAACTACACAACCACGC
ATCACAACACCCAAAACGattttatcaaGTTTCGAAAAATTATGTGCAAA
TCAACCCGAATGGTGTCGAAAACGAATGTTAAACAACAAACTGAGAATGA
AGCATTCATCCGACCAACGATCCAGGAGACATTTGTTGACCAGTCAATAC
ATTTTATCACACAAACGAAGAACTCAATCATCCTCTACGGTGGACAGGAA
AACCCAACGCAATATCAACCAAAAATTACAAAGATTAGCAACGATGCAAA
GGACTTATGACTATATTAGGGAGAACAATAAAATCATAAAACGTCTTCAA
AAGTTCGTCAAGAAGGAATTCAGTTGAATGCAGAAACCAAGCGGCGAAAC
ATCTTTATTGATATCGATTTTTGCAATGCTGGCGACACTGGACATTGTTG
CATCTTTAGCGGGTCCTCTGCAACATGGCAATGGACAGTCTGGCAAAACT
GTCGTCATACAAACTACACAACCACGCATCACAACACCCAAAACGatttt
atcaaGTTTCGAAAAATTATGTGCAAATCAACCCGAATGGTGTCGAAAAC
GAATGTTAAACAACAAACTGAGAATGAAGCATTCATCCGACCAACGATCC
AGGAGACATTTGTTGACCAGTCAATACATTTTATCACACAAACGAAGAAC
TCAATCATCCTCTACGGTGGACAGGAAAACCCAACGCAATATCAACCAAA
AATTACAAAGATTAGCAACGATGCAAAGGACTTATGACTATATTAGGGAG
AACAATAAAATCATAAAACGTCTTCAAAAGTTCGTCAAGAAGGAATTCAG
TTGA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1491911889:112557..112612 | TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1491911889:112557..112612 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1510915933:112557..112612 | TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1510915933:112557..112612 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1575043694:112557..112612 | TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1575043694:112557..112612 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1491911889:126427..126633 | TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1491911889:126427..126633 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1510915933:126427..126633 | TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1510915933:126427..126633 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1575043694:126427..126633 | TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1575043694:126427..126633 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1491911889:127008..127968 | TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1491911889:127008..127968 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1510915933:127008..127968 | TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1510915933:127008..127968 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1575043694:127008..127968 | TCONS_00067547-exon-scaffold_471-1575043694:127008..127968 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_471 | supercontig | scaffold_471:112557..127968 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
