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transcript sequence >TCONS_00067365 ID=TCONS_00067365|Name=TCONS_00067365|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3346bp CAAAGACACATTGGAATTTGCCAGAGCCTGTTTCCATCTTCTTTGGACGA GAAAGTTTGATTGAATCTTTTCACTTGAAACTTCAGCAAAATCAAGCGGT TGCTTTGAGTGAAATGGGAGGTGTGGGGAAAACACAAACTGCTGCATAGT TCGTTCAAATGCACAAAGATGAATATTGGAAGATATTTTGGATTTCTGCT GTCAGCCTCAAGAAATCTTTGAGCGAGATTTTGTGTGCATTTGGTTGTAA ACAACTAATTCTTGATGAACCTTCGATGGAAACtctgattttcattttcc tctCTAAGATTTGTGAAGGTTCCAAAGGATCGCTGGTTGTATTGGATGAC GTCACTGAGGTCACAAAAGACGTCACCTCATTCATTCGaaatgtgaaaga aaaaatcagcTTATTGTTGACATCCCAATTGAAAGATTGGGAAGATTATG GTTTGATTCAAATTGCTGTTCCATGTTTCCAAGAACAAGAATCCATTGGC TTCTTACAGAATGAACTTTCTTCAGCCAGCCAACATGAAATCTCCATTTT AGCGAATCGTTTACAATCATTACCTTTAGCCCTTCACCAAGCCATTTGTT ACATCAAAAAACATAAAGTTCCTCTACACAAATACATCGAACAATTTGAA GCATGCAGAGTAAGCGTTTTGGGAATGAAAATCAATTCCTTTACTGAATA TGACAAAACATTGTTGACAGTTTGGGATTTGGCTTTTGCGAAGATTCGGG TCGAATCAAAGAATGCTCTTTTGATCTTGGGAATGATGGCTTTCATGGAC AAtcgaaaaatcaacaaaaagacTTTCAGTTATTTTGATAAAGTTGACGA ATTTGAATTAAATGAAATCATCAATCTGCTTTGTCAATACTCATTGGTCA ACGAACGGAACGAATGTTTAGAGATTCACAGTCTTGTGCAAAAAGTTATC CGATATCGTATTGAACAAAAACAATTTGTTGAGGGTGAATGTCCGTTGAC ACTGCTTGAAGTTGTTCTTTTGAAAATCGAGTCTTCTCTTGAAGATTTGG TTGCAAATGGTGACTACGAGGATTTATGGTACATTCATGTTTTTCGTTTG ATCATGAGTGGTGCACTAAAAACTATCAACTTTGATGTTAACCAGGTGTT AAATATCGCGACAGGCAGAATGGAGTTGGAAAACTTATACCTACTTGCTG AActtctttcaaaagatttgtTAGAACAATATAGGTTGTCTCGAGATGTG GAAACTTTTCACGGTTTATTGCTTGTTTATCGTCGTTTCATGGACGCGTC AATTCTAATAGGTTTATTTAATATGAATGAGATTATTGCTTTTGAAAAAG AGTTTTCCTCAGAGCTTGAAGAACATTGTGAAGAAGTTTACCAGTGGAAG CTACAGCAAGCTCAGGCATATAATATACATGGACAAATGTCGTTATACGA AGATATCGTTCGAAATTTATTCAATGAACTGGTCATAAAGAAAGGATTTG ATAATATTAAATTAATATTGGCAAGGCATCTCAATGTAAGGGATGTTGAA GTTTTGTTGAACTCCGTTGACACAAATAATGTCAGTGACATGAACTTTCT GGTGTATTATGATACAAAATGTTCTTTATACATCAAGAACGGTTGCTTTG ACTTGGCTGAACAAGTTATGAAGAATTGGAAAGAACATTTACACAGAAAA CAATTTTCTCGAATGTTGCACTTTAACTTCACAAAAAAGAATTGCTATTT ACTTTACAAGAAAGGAAATTACAACGAAGCATTGCTAGCTTGCGATGAAC TTAAACGTGATTTTTTTACTGATGCAGATATTTTAGCATTCGAAGCAttg attttgatcaaattaAGAAAGTTCAACGACGCAGAAATTTTACTTGATGC CTTTGACCAACACAACAAGATTATCATTGAAATCAGCTCATACCTGAAAT TTCGAAAGCATGACTTTGAAGCAGTAGAAAATCTTCTCGCCGAAAAGGAA GGTGAGCGCCAgtcaaaacttttgttttgggtAAAGGGATATGAGAAACT GCATGGACAATTcgaaaataataaatcaaatGAATTGGTTGAACGATGTT tgcaaatgaaaaaatttgtaaCTGATTTATTTCAAGTACATTTGGATTCG ATTCATCTTTGAAATGCAATTTCATCGAATTATGATTAGAATCGGATCTT TGGGAACTACTCCAATCTTTGTGCTTTGGCTAAACTGATAAGTTTTTTTA AGTGACTGTAATGTAATTTTTGCATTGACTTGGTCTGTAAAATCAGAAGT agtgtatttctttttaattatgaaaatatttgaggGGGTGGTTTCAGGGG GCACCTGATTCCGCCATTCGGTCATTTCGGGACGATTTTTCGCCAAGGTC CATTTTTTCGGACCAAAACAGCTCAATTTCTCGTCTCCGAAAGTGGACCT AAATTCTGCACATCCGTCTAGATTTCTAATCGTCTTGAATTTTATTGTTA AATTAGAGGATTACATGTTAGTAGGGGGAAATTTGTAAAATCGCTCGATT TTTTTAGTCAAAGCACTTGTTATACATTTTTGGAAagctaaggggtaggg gaatcaaaataacttgggtgccaattttctttcggacactttggtgtgat tttcggacaaatacgacggtctcaNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNagcttgagaaaacggagacctgttgtatatt tttggaaagctctcaaaaaattaagattagtgatatattgcgagtatagg cgatttcagtacctaactcgagatattgagcttccgaaagcgcaaaaact ggacaaaacagctgttttggctgaaaaacagtgaaaaacactgtttttaa ggattaatatctcgaattatgtaaagaaatcacctatactcgcaatatat cactaatcttaattttctgagagctttccaaaaatatacaacaggtctcc gttttctcaagctaaaatttttattaatatttcactctatgatttttgcc tggaaccgtcgtatttgtccgaaaatcacaccaaagtgtccgaaaaaaaa ttggcacccaagttattttgattcccctaccccttggctttccaaaaatg tataacaagtgctttgactaaaaaattcgagcgacctcaaaaaaaacgaa caaatttccccctactatgttatgaaataaaattataGGTAGGCGAAATT TTTAGATTGCAACATTCTAAGGATATTTTGAAGAAAGTTGGTTGTTTGGG AGCAATTTTATTATTGATTTCTTTTAGattagaaataaaaattttg Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_469:541476..559620+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00067365 ID=TCONS_00067365|Name=TCONS_00067365|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=18145bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_469:541476..559620+ (Clytia hemisphaerica) CAAAGACACATTGGAACTTGCCAGAGCCTGTTTCCATCTTCTTTGGACGA
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AAGGGTAAAACTTGagctatgattttttttttgctatccatgccttatta
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00067365-exon-scaffold_469-1491911889:541476..541484 | TCONS_00067365-exon-scaffold_469-1491911889:541476..541484 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067365-exon-scaffold_469-1510915933:541476..541484 | TCONS_00067365-exon-scaffold_469-1510915933:541476..541484 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067365-exon-scaffold_469-1575043694:541476..541484 | TCONS_00067365-exon-scaffold_469-1575043694:541476..541484 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067365-exon-scaffold_469-1491911889:556284..559620 | TCONS_00067365-exon-scaffold_469-1491911889:556284..559620 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067365-exon-scaffold_469-1510915933:556284..559620 | TCONS_00067365-exon-scaffold_469-1510915933:556284..559620 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00067365-exon-scaffold_469-1575043694:556284..559620 | TCONS_00067365-exon-scaffold_469-1575043694:556284..559620 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_469 | supercontig | scaffold_469:541476..559620 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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