TCONS_00066695 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00066695
Unique Name	TCONS_00066695
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2609

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_458:38287..71302-

transcript sequence

>TCONS_00066695 ID=TCONS_00066695|Name=TCONS_00066695|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2609bp
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ACAAAACGAAACGGAAAGTTACGGAAATGGACCATCATTGGGTAGAAGGG
AATTGTCCGGGAAAATGCACGAAGTGTAATAAAACCATTAAAAACAATTG
TTTAACTGGATTACACTGTGTGTGGTGTTCTGCACAGGTACACAACAGAT
GTGTCACCAATATGCCAGTCATGTGTTCGTTAGGACCACACAAAGTTCAT
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CCTAAAAGTGGCGGACGGCAGGGTGCAAGATTACTGAATAAATTCCGCTA
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ATTTGCGATGGCAAGAAACTTGAACTACCCAGTTTAGAGGGTATTGCAAT
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agaagaaaaggaaaaggaGGAAGAAGAGTAGTGGCTCTTCTGGTGATGAA
CCTGAATCACTCGGAAGTGTCAGCCAAGATATAAGTGACCGCAAACTAGA
AGTCGTTGGTTTGGAAAATAGTTTATATGTTGGTCAAATCATCGCTGGTG
TCAGACAACATGGTTTAAGATTAGCACAATGCTCGACTGTTGTTATTAAa
atCATGAAGACAATGCCAATGCAAATCGACGGTGAACCTTGGATGCAGGC
ACCTGCTCA

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_458:38287..71302-

Legend: exon

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>TCONS_00066695 ID=TCONS_00066695|Name=TCONS_00066695|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=33016bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_458:38287..71302- (Clytia hemisphaerica)
ATAACAGTGATCCTTACCTACTCCCTCTACGGCTTAATTAGCTCCTAGAT
AACAAGGTTGGAGGTGTATACGAAAAACAAAAATTTGTGGGAATACAGTA
GTAAAGTGTTTATACTGATGTTTTTATTGAGAGATACTGCGAGCTGCACT
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TGAAAGTATTGACATAAAAGAAGTAAAATTTTCCAGAATTGTTGACATTA
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ATTATCGTTCGATTGAGATCGTCTGGCTTTATTCTTGCAGCTTCCCAACA
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TAGAAATTATTCTATGAACAAGGAAACAATGAATCGACGATCGAACGCAA
TCGAACGCAATCGAACATCAATCGAACGCAATCGAATATCAATCGAATCT
GAAAATTGCGGTAATATTCGATTGAGATTCGATTGCGTTCGACAATCGAA
TTTCAATCGGTCGATTGCGTTCGATTTGGTTCGACTGGTTCGATCGTCGA
TTTCTTTCGATTGAGATCGTCTGGCAAACAGTATGAAAACATTCCCTTTT
TATTCTTTCTAGAAAATGTTCCTCCAAATCTTTTGCATTTTGTAACATTT
TTTCTTTTTTTCTGAAGAATCTCCAAGCATCTTCTAGTCAATATTTCTAA
CTTGAAACTCTTCTGAAAACTGTCAATGCAAATTAACAAATGAGGCTACT
GCTGAGAGTAAAGATGGTTTTGTGTGGTGCTAATACTTTAGGCGTACAAA
CTTTCGCGAGCAGAAACTTTCGTGAATTTTGGCCTTTTTCGCGAAAGTAA
ATGTCTTTAGAAATTCTAAACAGGGCAACTCGCAAAAAATTCTCAAAAAA
GTTTGAAATCTATAAAACCTTGAAATCGTAATAAATATCAAATTCTCTGC
ATATTATTATCCTTTAAAGCTGTTTTAAAGTCAAAGAGCAACCAACTTTA
GCGGATTTAAGGAATATCTTTTACTTTTAAGGCAACTTTTATTTGAAAGT
TCTCATTTTTATCCTAGGATTCGCAAAAGTTTATGCTTGCGAAAATCATT
TTTTCCTCAAATTTGCAAAAGTAAATGTCGTGAATTTCGCAATTTTTCAA
CCAATAACTACTATGACTTTGTATAATGCTGACATACATTGTCTAATTCC
CTCATAGCAACTCAACTGTCTGGTCTTTAAATGTTTATAGGTAAGACCTT
CTGAATAAGCTGTTTAAAAATCACTCTAACTACTCGTAAACGTAAACTAT
CGTATATTGGTCTAATGTCAACATCCCCCTCCTAATCTCAACACCCTTAA
CTCTAGAGATAAGAACAAACGGAAGGTCAGAATCACTGATTGAAACTAAT
TTTTTTGCTTAGCCATCAGAGAGGAAAAATCTTTTTTCTATCAGACTTTT
GTCTGTCGAATACCCCTTTTAATAAAAACTAGAGATTCCAATCTGAATCT
AGCAGTACCTGGCAACACATGTTTGAGGAAATTATATAAATTCGAATGAG
ATTCTTTTTTTCAATTTTTGAATCAGTATAATTATCTTTGAGGCAATGAT
ACTTCAACCTTCGTTTTGATCATGAAACAAAAGAGTCTGACAGAGTAAAG
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GTGGTATTTTTATTTGGCTACTTGCAAGAAATTTGTTATCTAAAAAATAT
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AGGAAGTGATAAGCCACCCAGTGCTTGTTTCAATTTTGATGTAATTACAA
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GATGTTTTATTGTAACTGTTATTTAAATATTTAGAAATCAAATGTTATAA
ATGAAATTAAATCTTTATTTCATCATTAACTTCCTTAATTGATATCAAGA
CTTCCTAATTACAAACTTATCATGCTTTTCATTGATAACAAGCTCACTTC
CTTTACATATGATGTAATGATCCATTGCAGATCCCTGACTGTAAACAAAC
ATCTTTACTATTTTTGGAGTGTTTTGGATTGTTTCAATTTCATTTAGAGT
GTTTTTTCAATTTATATATTTTCAATTTTATTCTTCTATGCGGAAACATC
AGTATTCTCAAAAGTTCTGAGTAAGTAACTTTCCAGGGGCTTTCTTCTGT
TTGCTTTTTAGCTAAAATTTCAAGGTGAGAAGATTTTTGAAAAGTTTCCA
ATATTATTAAGATGTTTAAATATAATGAATGATTTATGNATCTTTTTTCT
ATCAGACTTTTGTCTGTCGAATACCCCTTTTAATAAAAACTAGAGATTCC
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ATTCGAATGAGATTCTTTTTTTCAATTTTTGAATCAGTATAATTATCTTT
GAGGCAATGATACTTCAACCTTCGTTTTGATCATGAAACAAAAGAGTCTG
ACAGAGTAAAGCAACAAAACAAAAGTTTTTGGTGTTAATCCTTAGTTGTA
ATGGTAGGCTAGTGGTATTTTTATTTGGCTACTTGCAAGAAATTTGTTAT
CTAAAAAATATAGATTTCCCAAAGTATTTCATTGCTATTTTTTTGTTTTG
TTTATTTGAAGAGGAAGTGATAAGCCACCCAGTGCTTGTTTCAATTTTGA
TGTAATTACAATGATTAATGTCTGTAATTAACAACTCAGGAGGTTGATCT
TTTTCATAGTAGAATAAAGAGCATTCAAAATCCATTTAAACCTGTTTTAC
AACTGGCCTAAGATGTTTTATTGTAACTGTTATTTAAATATTTAGAAATC
AAATGTTATAAATGAAATTAAATCTTTATTTCATCATTAACTTCCTTAAT
TGATATCAAGACTTCCTAATTACAAACTTATCATGCTTTTCATTGATAAC
AAGCTCACTTCCTTTACATATGATGTAATGATCCATTGCAGATCCCTGAC
TGTAAACAAACATCTTTACTATTTTTGGAGTGTTTTGGATTGTTTCAATT
TCATTTAGAGTGTCTTTTCAATTTATATATTTTCAATTTTATTCTTCTAT
GGGGAAACATCAGTATTCTCAAAAGTTCTGAGTAAGTAACTTTCCAGGGG
CTTTCATCTTTTTGCTTTTTAGCTAAAATTTCATGGTGAGAAGATTTTTG
AAAAGTTTCCAATATTATTAAGATGTTTAAATATAATGAATGATTTATTT
TTTTTAAACATTTTTTTCATGGAATAAACATTTTCTTTCTTTCTCATAAC
AAGTTTTTTTTTGCTCTGTGTAGCATAGATTAAGAGCTTTTCCCCCTGAT
TATATTTGAAAATCTTTTTCAAAAAGAATTTTCATTGAGCTTAAACCTCA
GATGAGTTTCTCCAAAAAATAAGTCGAGTTTCATCTATTGATTTTTTAAA
ATGATATTCATTTCCATCCCATCAAAGGTATATCATCAATGTTTTTCTTT
TTAAAGAGAACACAAACTATTAATTTATTCTCTTATTTGAAATTGTGCTA
ACAGTTTTCCAAAAAGTCAACCCATACAAAGTATTTAAACGCAATATGTT
AATCTGATCAATTAATATAAGCATTGTGTACACATTAATTCGTTGTAATC
AAAATGCATCCTTAAGCTAGAGAAGAAATCGATTTTGTATAAACAGTTTT
TCATAATTCAACTGATCCTAGATATATGAAATACCGAGATCAAGCAATAG
AACCTTGCTGTGTTTTGTCTTTTAGCTGTGTGAAAATACCTTCTCATTAA
ATGTACATCAATGCTCTTTAATAACTATCATTCAGTTCACTGTTATGCTT
TTTAAATAACAAGCAATACCAAAGCTTTAAAATAAGCTTTAGTTAATTAA
AATCAAGGCTTGCATCCACAATCTTTAATAAATAATAATCACAGCAATAT
TGGTCTAGCAACCAAATTTTGAAAAGTAAAAAAATATGAAATTTATAATT
GCAATTTAATCTCCTAGAATATGTTTTAAATATTTACATCTAGGTTATAA
GTATTTTACACCTTTTCTACCGTAATCGCGCTGTCAGACGCGTGTCACTT
TATTATTTAATTATCCCCCTAAACTTGATCCAATCCTTTCTTACACCTTT
TTCTATTGTCAATAGGTGCAAAAAAAGACTGGGACGGTTTTAGGGTGGTA
AAACGGACAAAAATAAGCCTGTGCAGCAATTGGCAGCTACGGTTGAAAAG
GTGTATTGTCAGGATGTATGACTCTTTCCTATCAGATTCAAAGAGAGACA
GTCATAGCAGGTTAAGCCAGGTCAATACTTGGTAGAGTAACTATTACCAG
GAAACAGTTTAAGCTTTATCGAATTTGTATTTACTTTTTTTGCTCAATTT
TTTAAATTGAAATTTCAAGAAACTGCCAGAAATACACTGTATTATAATTA
TAATTTTGAAAATTTAGTTTCTATGGATTTTGGTTTTTTAAATACCTTGT
ATTTGTCATGAGAAGAAATCAGTAGAACTTCTTTTAACAAAACATTTTTT
TGGAATATTTTTCCTTTCCATATTTTTTCTTTCTTTTAAATGTAAATTAA
ATCGATTTGATATCAAATGGTAAATTCCTTCTCTTTTTTTTTAAAAGTTG
ATTTTTAAAGAAAAGATGGCGTTTTTTATATAAATTTTAACCTCTTTCCT
TCTTTCTTCTTCAATTTTTGTCTTTATGAATAAAAAAATATTCTCTGAGA
TTGAGCTTTTATGGCATCTTTTTAAAGTAAGAAATTTTGACAATTAAAAA
TATCATCCCTTACAATTTTTGGCAATTTGCATATTTAAATTGAAGAAATT
TAAAAGTTTTATAAGAATGTCCACGTATGCTGTTACAGTTAAAAAAAATT
CAAATTTGCTTTTGCAAGGTTTCCTTAGGGAATATTAAAGATCTTCTGCA
AAGTATTTTTTGGTGTATCTGCTATTTAGTCCACAAAGTAAAATTGTTTG
TCTAGCTCATATAGTTAAGCTATTTGGTCAAGACAATATGATAAGATATC
CTATGGCTTTCATTTACCATGGAGTTTTCTGTATTTTTGGAAATCGGAAG
GCTTTAAAAATTTCATATCAAAGACTGAATGTCTTTTATTGAAAGCGATT
GTTTCTCTCAGACGTCTCATTTTATACACCAACATTCTTTTTAAAAACAT
TTTCAAACTTCTACAAACTGTTTTATGTGTGGGTGTTTTCCTTTTATTTT
TTATGATTATTCTAAATAATGAGGAAAAAGTTGAATTATTGATGAAATTC
ACAAAGTTTCTCTAATTTCTCAAAATTATGGTTAAACACTATAAAAACAC
TAAATTTCTAATAAATTAAGACAAGAAATAGGAGTTTAAAACACATTCTT
TAAAGTTCAACCTGGTTCAACAGTTTATAACTAAGCGGATTTTTCATCCA
CTCATTCGAAACCCTTTGTCTCACTTTATACTAAATCAAAAAATGAAAGT
CTTTATTAAACCCAAATCAACTTGGTGATTTGTCTGACAAAATGTTAGCT
CATTAAAATTCTCATTTAATATTTTAATAATCAGTGTCCAAGGAGTAGAC
AAAACTTATACAAAGCAAGTCTTTTTCAGTTTCAATTTTTTGCAAATAAT
TAGCCTAAAACCAAACCAAAGAAAAAAACAGTTTATGAGTGCCTCTTTTG
TAGCCAATTTAATTATTGTTCGCTTATCTGGATGTTTAATTGCACAGGGG
AAAGTTTTTGAAGATAATAGGTTATTATATTCAGATCACACATCCTATCT
TTAGAGAAGAAAGGGCCATTAAATTCCATCATAAAAAAGGTTCCTCTGTT
AATCAAGATGTTAAAGTAAATTGCCAAAAGCCAAACGCCAAACGCCTTTA
TTGATCAAGAGAAGTAAATTGCTCAATAATATATTCTTTATAAAACAGAT
TTCGTTCACTATCCTTTTTAAAAAGGCCAAAAATATGGGAGTTGATTCTA
GATGAGTTTCCAGATAATTGTCTAACTCTAAGTATTTTTAATTAATTAAA
GGCTAAATACTAAATTGGTTGGGGGTCAAACATTTTGGTGACACCCACCC
TTATGAAAAATGACTTGCATTACTCCAATGGTCATCTTCACCTTAACAAA
ATCTAGAAAAGCCAAAAAGTCAGAAAAATAATTCAAATTTCCCAAATCAT
GTAGTCAGGGAATTTGAAATCAGGAATATTAAAAGATGACATTTGGCACA
TTTTGATACGAAGGAATGAAGTTATAACTGAACAGATTAAAAATAGAAAG
ATAGTTTGAACCATAGGGGATGATTTTAATATAACATGGTGTTGACATCT
CCACGTATTAAACTGCTTTTTTTGATGTTGAAATTTGAGTACAATTAGTA
GCTTTTCAAGGTTACTGAGTAAAGGGTAAGAGGGTCTAACTTTCAAGTTT
CAAAAATTTCAAGTTATGAAGTCAAGTATTAAGTCAAGTGAAGTCACTTA
AAGTCAAGTTGTGAATAGGCTACGTCATATCTTCCTTCGTTTCGAGCGTA
AAACTCGACTCTTAGTAAGGCCTAAAAGCCTGGAGCTGTATATTATGAAG
ACTAAGTTGTGAAGTACTTTTGGGCATTGTTTCAAGTGTTTTTTTATATT
CTAATATTATCCACTTTGGTTTCTAGACTCGAAGAGAAGATTAAAAGATG
TACTGCAGGAATTTCGAGAAGGTTATCATGAAGGTTACGACCCTGAACAG
GTAAGCTCACTTTTGAACTGTTAGTGTTAAACTTTTTGGCTGCCATGCCC
TAATCTACTTTCCATTTGTAGGTAAATTTAAAGGGACATTAAAGTACTGA
CGAAATTTGTAAACAAACCGTATGCAGCGGGATACAAAATCAAAACAAAT
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GTTTCAATTCTTTTACAAGTTTGTTTTGGACACGTGATTTTAATTGTTCA
ATGTTTACGTTTTACTACTTTCACTTTTATGTCCATTTAAAGTGATTCTC
TTCCCGAGACTAACATTTTGCCGATTCAGCATTATTATACTATTTTCAGT
TGCCTTATTCCTTGACATCAATTGATTTTTTTTGTTGACAAACCATGCTC
GCAGGTAACGGCTCCGTTCGCTCTGAAACGAAATCAAGCCGTTCTANAAA
TAATTCAAATTTCCCAAATCATGTAGTCAGGGAATTTGAAATCAGGAATA
TTAAAAGATGACATTTGGCACATTTTGATACGAAGGAATAAAGTTATAAC
TGAACAGATTAAAAATAGAAAGATAGTTTGAACCATAGGGGATGATTTTA
ATATAACATGGTGTTGACATCCCCCCCACGTATTAAACTGCTTTTTTTGA
TGTTGAAATTTGAGTACAATTAGTAGCTTTTCAAGGTTACTGAGTAAAGG
GTAAGAGGGTCTAACTTTCAAGTTTCAAAAATTTCAAGTTATGAAGTCAA
GTATTAAGTCAAGTGAAGTCACTTAAAGTCAAGCGTAAAACTCGACTCTT
AGTAAGGCCTAAAAGCCTGGAGCTGTATATTATGAAGACTAAGTTGTGAA
GTACTTTTGGGCATTGTTTCAAGTGTTTTTTTATATTCTAATATTATCCA
CTTTGGTTTCTAGACTCGAAGAGAAGATTAAAAGATGTACTGCAGGAATT
TCGAGAAGGTTATCATGAAGGTTACGACCCTGAACAGGTAAGCTCACTTT
TGAACTGTTAGNTTTGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTT
CGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTACCAGCTTTTCTCGAGAT
TGGCTCTTTAGTCTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGATGCATAACTATAAA
CCCTCGAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAAAATTTTTAGGCAA
ATTTGGGCCAAAAAACGGCTATAAAACGGGTTTTTTGGACTTTGTGAAAA
ATTGGATCATTAATTTTTTCTGATTTTTTGTATGATAGTAGGGTACCATC
ATAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTCGCAAAAAAATTTTGTTGGCT
TAAAAAACGCATGTTTAACTATAAGAATCAATATTAATAAGCATACACTA
ATGTTCTTAGTCAAATTACTACATTTTTTTATGAGATAGATGTTTTTTTT
CTCATGAGGGCTTACTTTTAAAGAATATATGTGTTTAGACATGAACCTTT
GGTTACTTGGCGTATGTTTGTAGAAAAACTGGCCAAATTCGATATTTTTT
TATAAACACATTATCAATTACTTAGGTATTAGCTTTTCTCGAGATTGCCT
GTTTCATTCTTTATTATTTTTTGCACAAAGATGCGTAACTATAAACCCTT
GAATGTGACTGAGCCCAATTTTCGAAAAAAAATGTTTTTGGGCAAATTTG
GGCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGGTTTTTTGGACTTTGAAAAATTGGAT
CATTAATTTTTTCTAATTTTTTTGAATGAAAATAGGTAAAAGATGGCTCA
AGCTGATTTTTGTAAAAAACGAATTTTTCAGCTCAAAAAACGCATCTTTA
TCTATAAGAATCACTATTAATAAGCATACATCAATGTTCTTAGCCAAATT
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TATGAAAGAATATTTATAGAGCATGAAATTTTGGTTTCTAAACGGTTTTT
TATAACAAACAAACGACTAATTTTAATAGATCGGCACTATTAGTGTTCTG
AATGATTGTTTAATTGTCACGCTCACGTAGATATCAATTATATATGTGTT
ATATGCATAACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATCACTTGTTTCAATTCAAA
AGAAAAGTGTTTCAAATTTTATCAGATCTATTATACAATTAAAAAGTCAT
TAAAAACTTTCGGTTATTTTAACCCTTAGTTGATTGTATTGAACCCTACC
AGTAAAACATCTCCCCTCCATCATTAAGTTGTTATTTTTCAGGATAAATG
GCTTTATGGTTCTGACCTAAGTCAAGACTCCCTTGAGAAGAACCCACAGA
TTTTTGTGAAGTCTGAAGATGTCGTGCTTTTTAAGCTCTTCCAAGCAAAA
AAAAGGGACTATCGCAAAAAATAATGCTGCTATTGTTTTCGAAAATCCGT
GAAGCTTCTTATTGGTCAAGCGCTGAAATTCTATTGTAATGTCACGTGAC
ATCGGCACAAATTTCAGCCGAAGCACGACTTCTAGCCCTTTGGGCTTTAT
AAATCTATGGAAGAATCCCTCTTTTAGGTTGTAATTCTTTTCTTCTTTTA
GCCTATGGGTTACGATGGATTCAAACTATTCATGTCAGTCTATTTGGGAC
AAAGTGTGAGCGAAGAATTGATGCAGACTTTATTTTGGACTTTCCATAAG
AAAGTTCCCAGAGGAGATGCAAAGTCACCAGATCTTCCCAACACAATATT
ACGAAAAATCTTAGTAGAAAATGGAAATGTTTCGCAAGAGAGCTTAGACC
AGCTGAATGGTAACTATATAGCTTAACTCCAGAAAAAAACATTGTTTTTT
CCCTAAAAATGTAAAGTTTTAAATTATGATAAAAATTCTAAAATTCTAAA
ATTTAAAAAACTTTAAAAGTCGTTTTAATTAATCATACGTGTAATGTTCA
TTCAAAACACATACACTAGCGGTTTCATATTATAGGATTTAAGTCTATTC
TCATTTGAGCACTCTTTTAGGAATAACTAGATTATGTTAATTTATAGGAT
GCATTGTAAAGGCTGCTTGAATTTACTCTCACTGTTTTTAATACACTTTA
TTTTTGCAAAAACTCTAATCACTTTTTTTCACTTAATTATGTAAGAAAGC
ACTCATCATATTTCTATTCCAGAAAGTTCATTGTCAAGGATCGCAAAAGG
TGCACGGCGAGCGACGGTTGTTGCCACAGCAACAGTTGTAGCAGGTATTA
AACAGAACGGTGAAACTACAGAACTCGAGAGTATCAAAGAAGACAAAGAA
AATTCTCGATTATCTTCTTCCCTTAATATAACATCCACTCGTACTAAATG
TTGTAATGACACACTTACACCAGGTTAGCTAATCATTCCATGCAACACTT
TGCATACTACTTTACGCTTGCATGTACATTCAACACGACAAAGTCATAGA
AGTCTAGTTTTCACTTACCGCACAGTCAATAAAACTACATATTGAGCTAT
TTTATTGGCTGATAACACGAATGAAATACACTTTTTTATAAGAACATCCA
AAATCTTTGAAGCCTTCGGATGTTCTTGACTTTTTGAGTTTTAAGCCAAA
AAATGTTTTTAACATATATGTTCTTATTTTCGTCATTTTATGGGCATTTT
TGCCTTTTTTCCTAAGAAATCGGGTGTTTTAGAGTCCACGAAGCCTTAAA
AAAATGTTCTTAACTTGTTAACCGTTGAAACCTTATGTTCTTTTATATAG
TTTGTTCTTATAAAAAACGTGTACTAGTATTATTCATTCAGACAATCCCT
ACCCATTCCTTTATAAACTGCTGTTTATACTTAAATTCCTAGGACCGCTG
CACTAACGCTTGTTACAGAAATTTGACATAACATAATTACGCAACGACAC
TGTCAAAAATCACTAACATCTTATTAATTAAGCATACATTAACCTAAAAC
TAATTATTAACATATACTTCAAGAGAAATTACAGCGGGGAGTTTCCATAA
CTCATATACGCGCGCTGAACGCAAAATTTGCGGTCGGTATTATATCTTAT
CGGTAGAAAATTCGTCGGCTATAAAAATTCGTCTGTAAATATTTTGTCCC
CAAGAGATTTTCTCGTCTACCGATAGTGACATGATTGTTAAATTGTTGTA
CTTGTTGGAGTCAAGGAGACACTCGCAAGCTCGGTCGTTACTTGACTTTG
GGCAACATTTCTCAGAATAGCGTCAACTAACCGGTCATTATTGTATTAGT
GTAGTAGGCCCGTCGTCATGCTAAAAGAACCAATTGTATTGCTCAAAAAG
CCGTGTAGCCTACTTCGAGAAAGTTACCGGTTAACAACAGGTTTCGGGTA
TGGAGTATGGAGACTCAAGCCACTGTAATTTCAAATCGAATTTATTTTAT
TCAGATGACATACATACACAATATACGTTCTAACAATTTTTTTTTTCTTT
ATGAGGTTGTGTAAATGCCTCTTAGTCCCCGAAGATCCCATTTTTTGCTG
TTTTACTTTTTCGAGAAACTACATGACAATATTTGTCTTTCAATCCTTCT
TGTCAATGATTACATCTCCTTCTCACAGATCCGGTAGGATTTTTTCACCC
AGTTGGGATAGAAATAACGGACTGAAAGTCTAGTGAGAGCTACAATGTTC
TTCATGTGCACAGACTTGTTAAAAGCAAACTAACTTTTTTAAATGATCAA
TTAGGTCTATAAGATCACAAAAACGAGTGGTGAGAAAAATTTTGACCATT
TTGCTGGTCCCCATGTGACGTCATCACTTTTTCTGGGGCTTGAAAATGAA
AATGGAAGTGAAAATTTGAAGCTCATCAATATTTGAGAAGCTATAAAGAA
AAATAGCTCAAAAAATGACGTCATCGATGACGTCATCGGCAATTAAAAAA
TCGTCGAAATCGAAAATTTTTTGTTTCATTTGAAAGGTCCTCTTTTTTCC
CAATGCTTGAGAACAAAAAAAATTCAGTGGGGATGGTAAAAAAAGCATCA
CATTTTGTAGTGAGGATTGGTTTATTTGATTATTATCAGTGGAACAAAAA
TTGGAAGATATATTTGTGCTGGGAACGATATTTTGGACAATTTTTTAAGT
GGGAGGGCTCCCAGTTGGTCTGTGAGATTGGGGTGTATGATTTGAGGACT
TTTTGAAAATATCTGTAAAAATAAAATTGATTTGTATTATATTGATATTT
AGTCCTATTTATTTGTTTTAGGTGATATTCCAAGGAGAGCAATTTCAGAA
GCAGAGTTATCACGCATAGACAAAACTAATGATGAAATGCTAACACCTAT
AACAAAGAGACGATTATTTTTAGATACAATGACACATCTACCTATGATTG
AAATCAAAGAAATTGCTTGTTATTTATCACTACTAGAAGGTGGAGATGTC
AAAGATAAATTAGAATGTAAGTGAACGCTGCCCTTACAGAAGGAAGCAAT
TTCTAGAAATTCTAGAAATTCCATAAACTTCTTCTACCGGGTGTCCCAGA
AAAAAACTAATTCTGTAAACTGTTAAAGAATCGATCCTTTTGTATTGAAA
AGAGAAAGAATAAACTTAAAGATTCTACCCTGATTTTTCGCCTTTTTTCT
ATGATGATTTTTCAGTATTTAAACCATAACTTTTGATCTAGTTAATCAAA
TTTGACAAATGACCCCTCAAAATTTAAGTTTATCTTACTTTTTTCTTTTC
AATGCAAAAGGATTGATTCTTTCAAAGTTCAAAGAACTCAAGAAAATTCA
CTTCAAAGAGGGGGACTTTTTTCTGGGACACCCGCTACAAACTTTTAGAT
TTAAGACCTTTATTTTTAAATAACGTAAAACTACAGATTCCCCCGATACG
TTTTTTCTTGAAACGACTGAGGAATTTTCATGGCTTTTAATTAAGCAAGA
TTTAGGCGTATGAGTCAATAGTCCTGCCCACACGACCAATGCCATACTTA
AAGAATCTAACTACATACGTACTTTTCTCCACGTGGTACCAACAAGATAA
AGCAATATCTCNTTTCAGTATTTAAACCATAACTTTTGATCTAGTTAATC
AAATTTGACAAATGACCCCTCAAAATTTAAGTTTATCTTACTTTTTTCTT
TTCAATGCAAAAGGATTGATTCTTTCAAAGTTCAAAGAACTCGAGAAAAT
TCACTTCAAAGAGGGGGACTTTTTTCTGGGACACCCGGTACAAACTTTTA
GATTTAAGACCTTTACTTTTAAATAACGCAACTACAGATTCCCCGATACG
TTTTGTTCTTGAAACGACTGAGGAATTTTCATGGCTTTTAATTAAGCAAG
ATTTAGGCGTATGAGTCAATAGTCCTGCCCACACGACCAATGCCAAACTT
AAAGAATCTAACTACATACATACTTTTCTCCACGTGGTACCAACAAGATA
AAGCAATATCTCACGCAATCCAATATTTCCACTCAACTCCTTGTAAAAAC
CTGTATTATGAAGGAGAACTCGACATTTTTAACCCAAAATCCTCGGAGGT
CCAAGCAAAACACCAACTTTGCTTGTCATTCCAATAAACATTTTCTGAAT
AAGGAATTTTTACCCTTTTGTTTTTTAATATTAAAAGTTCTTCAAAAATC
TAATTCAAGGTAAATAATTGAAAAAGGGGGAGTGTATTGTTTATCCTTCT
CTTGGTCTTCAGTAATAAAGAATCCAAAAGTTCTAATAATGATTCTCTCT
AGTCTTAAATTTATGTTCTTTTGTCATTGGGTTTTACCAAGTTTTACGTG
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ACGGAGGAGCGAATATTTGGGGTGAACCGGAGAAGAAAAGGAAAAGGAGG
AAGAAGAGTAGTGGCTCTTCTGGTGATGAACCTGAATCACTCGGAAGTGT
CAGCCAAGGTTTGTTTCCGTATTTTTTATCACCGTTTTAAGGGTTCAATC
GTGGCATGCGTTTCATGTTTGCATTTACCGGTCTAAATACTCAGATTCAA
AATTTGCCAGTTTGGCAGAAGAAGGATGGGCTCTCCTCAATTTCAAACTT
TGTTTTGCTTTTATTTCCTTCTGAATCGCATTAATATTCTGTTCAAAACT
CATTATGGGGTTTCAAAGCGGCCAATACCGTTACTGGCTGTTTCTGGATA
ACGCCTACTTTGAAAACGAGAAATTTAAACCGTTCAAAGCTTCTAAATTA
TACTTTCCCCGAGGTAGGCATTCACGAAATTCATAAATTTTGTTCGCATT
CTATTTTAGATATAAGTGACCGCAAACTAGAAGTCGTTGGTTTGGAAAAT
AGTTTATATGTTGGTCAAATCATCGCTGGTGTCAGACAACATGGTTTAAG
ATTAGCACAATGCTCGACTGTTGTTATTAAGTATGTTTCTTTTTGTTGAA
GTAGACCCTTCCTGCTTTTGAAACTTACTCAAACATCTTTTTCCAAACAT
CTTTTCTTCTGAAATGAGAAAAATCAGAAAGTAGCCATGTTATTTAAACA
TTGTGTTACAGCCAACCATTTTATTGACAGCTTACCAATGCCTAGGCTGC
ACGCATCCCCTCTGATATGATTTGATATAACAAAATAAATTCTGGGGATG
CGCGCAGCCTAACCAACGCCATATTAACGTCTATAATTTTCATTTTCATT
TTTTAGAATCATGAAGACAATGCCAATGCAAATCGACGGTGAACCTTGGA
TGCAGGCACCTGCTCA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_041707	XLOC_041707	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_458	supercontig	scaffold_458:38287..71302 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.46371	0.00136779	0.0355156	0.31237	1.79408	3.47092	1.77621	2.30732	1.08086	1.97438	1.60819	1.38859	5.8598	2.48847	0.755901	0.397957	5.16706	4.93235	6.96922	3.76437	7.91254	11.3945	1.9065	4.389	2.70744	7.57774	1.87438	2.42179	0.00220781	0.33483

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00066695 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: DGKB (Diacylglycerol kinase beta OS=Homo sapiens GN=DGKB PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 672.929 bits (1735), Expect = 0.000e+0
Identity = 383/801 (47.82%), Postives = 509/801 (63.55%), Query Frame = 1

Query:  334 WDRLHPDEFTKLQEYTKYSKRRLKDVLQEFR-EGYHEGYDPE-------QPMGYDGFKLFMSVYLGQSVSEELMQTLFWTFHKKVPRGDAKSPDLPNTILRKILVENGNVSQESLDQLNGDIPRRAISEAELSRIDKTNDEMLTPITKRRLFLDTMTHLPMIEIKEIACYLSLLEGGDVKDKLEFVFRVYDSDNNDYLDGEELESIVSQMLRVAEYLGWDTTALKPILTDMLADMDYDSDGQISLEEWVKGGMNNIPFLVLMGMEIKVDEEGKHQWAMKHFKTQAFCNICHGVLAGFGRKQGLQCIFCRFTCHERCVQRSPNSCISTYTQNKTKRKVTEMDHHWVEGNCPGXXXXXXXXXX-XXXXXGLHCVWCSAQVHNRCVTNMPVMCSLGPHKVHILPPICITPA-----------------SXXXXXXXXXXXXNSVI-----------SYDGIPMQITPLPDTKPLIAFINPKSGGRQGARLLNKFRYLLNPRQVFNLAEGGPFPGLKFFAQVPDFRVLCCGGDGTAGWILATIDRLTSLKQRPPMAILPLGTGNDLARCLXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXMMDRWQIDCDNFEKTSIEGDIMPQNIMNNYFSIGVDAAIALKFHLQREKNPEKFNSRFKNKLRYFQAGTSEQLAATCTKLSNFLEIICDGKKLEL--PSLEGIAILNIPSIYGGANIWGEPEXXXXXXX-----XXXXXXXDEPESLGSVSQDISDRKLEVVGLENSLYVGQIIAGVRQHGLRLAQCSTVVIKIMKTMPMQIDGEPWMQAP 2604
            W  L P EF++LQ+Y +YS ++LKDVL+EF   G    Y+PE       Q + ++GFKLFM  +L   + ++    LF +F  K P         P  +   + +  G ++           P R  S A     +                        +I +K+I CYLSLLE G  +DKLEF+FR+YD+D N +LD  ELE+I+SQM+ VAEYL WD T L PIL +M+ ++DYD DG +SLEEW++GGM  IP LVL+G+E  V ++G+H W +KHF   A+CN+C  +L G G KQGL C FC++T HERCV R+P SCI TY   K+KR    M H+WVEGNCP KC KC+KT+K    LTGLHCVWC   +HN+C +++   C  GP K HILPP  I P                  S  K EK    + N VI           + DG  +Q+TP+P T PL+ F+NPKSGG+QG R+  KF+YLLNPRQV++L+  GP PGL FF  VPDFRVL CGGDGT GW+L  I++  ++ + PP+AILPLGTGNDLARCL WGGGYEG +L K+L+ +  S+ +M+DRW+ +    +K   +GD +P +I+NNYFSIGVDA+IA +FH+ REK+PEKFNSR KNK  YF+ GTSE  +ATC KL   +EI CDG +++L   SLEGIAILNIPS++GG+N+WGE +K+R  R+         ++  + + L   SQD+SD+ LEVVGLE ++ +GQI  G++  G RLAQCS VVI+  K++PMQIDGEPWMQ P
Sbjct:    7 WAHLSPSEFSQLQKYAEYSTKKLKDVLEEFHGNGVLAKYNPEGKQDILNQTIDFEGFKLFMKTFLEAELPDDFTAHLFMSFSNKFPHSSPMVKSKPALLSGGLRMNKGAIT-----------PPRTTSPANTCSPE------------------------VIHLKDIVCYLSLLERGRPEDKLEFMFRLYDTDGNGFLDSSELENIISQMMHVAEYLEWDVTELNPILHEMMEEIDYDHDGTVSLEEWIQGGMTTIPLLVLLGLENNVKDDGQHVWRLKHFNKPAYCNLCLNMLIGVG-KQGLCCSFCKYTVHERCVARAPPSCIKTYV--KSKRNTDVMHHYWVEGNCPTKCDKCHKTVKCYQGLTGLHCVWCQITLHNKCASHLKPECDCGPLKDHILPPTTICPVVLQTLPTSGVSVPEERQSTVKKEKSGSQQPNKVIDKNKMQRANSVTVDGQGLQVTPVPGTHPLLVFVNPKSGGKQGERIYRKFQYLLNPRQVYSLSGNGPMPGLNFFRDVPDFRVLACGGDGTVGWVLDCIEK-ANVGKHPPVAILPLGTGNDLARCLRWGGGYEGENLMKILKDIENSTEIMLDRWKFEVIPNDKDE-KGDPVPYSIINNYFSIGVDASIAHRFHIMREKHPEKFNSRMKNKFWYFEFGTSETFSATCKKLHESVEIECDGVQIDLINISLEGIAILNIPSMHGGSNLWGESKKRRSHRRIEKKGSDKRTTVTDAKELKFASQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSCVVIRTSKSLPMQIDGEPWMQTP 767

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00066695 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00066695 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
DGKB	0.000e+0	47.82	Diacylglycerol kinase beta OS=Homo sapiens GN=DGKB...	[more]

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TCONS_00066695 (transcript) - C. hemisphaerica