TCONS_00066678 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00066678
Unique Name	TCONS_00066678
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4833

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_458:31720..71302-

transcript sequence

>TCONS_00066678 ID=TCONS_00066678|Name=TCONS_00066678|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4833bp
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GAGAAATAATGTTATATTTAAACCAATTCTTTTCAGTTTTATCTTCTTGT
CGCTAACCGCAGACTAGCACCATGGAGGTGTAA

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transcript from alignment at scaffold_458:31720..71302-

Legend: exon

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>TCONS_00066678 ID=TCONS_00066678|Name=TCONS_00066678|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=39583bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_458:31720..71302- (Clytia hemisphaerica)
ATAACAGTGATCCTTACCTACTCCCTCTACGGCTTAATTAGCTCCTAGAT
AACAAGGTTGGAGGTGTATACGAAAAACAAAAATTTGTGGGAATACAGTA
GTAAAGTGTTTATACTGATGTTTTTATTGAGAGATACTGCGAGCTGCACT
GGAAAATAATATGGAAAAGACTTGTGATTTTTGCACTAGAATGTAATCTT
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ATTATCGTTCGATTGAGATCGTCTGGCTTTATTCTTGCAGCTTCCCAACA
TCCGAGCTCTCAAACATCACAAGCCGAATGAAATTACTTTCGATTTTACG
TAGAAATTATTCTATGAACAAGGAAACAATGAATCGACGATCGAACGCAA
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GAAAATTGCGGTAATATTCGATTGAGATTCGATTGCGTTCGACAATCGAA
TTTCAATCGGTCGATTGCGTTCGATTTGGTTCGACTGGTTCGATCGTCGA
TTTCTTTCGATTGAGATCGTCTGGCAAACAGTATGAAAACATTCCCTTTT
TATTCTTTCTAGAAAATGTTCCTCCAAATCTTTTGCATTTTGTAACATTT
TTTCTTTTTTTCTGAAGAATCTCCAAGCATCTTCTAGTCAATATTTCTAA
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ATGTCTTTAGAAATTCTAAACAGGGCAACTCGCAAAAAATTCTCAAAAAA
GTTTGAAATCTATAAAACCTTGAAATCGTAATAAATATCAAATTCTCTGC
ATATTATTATCCTTTAAAGCTGTTTTAAAGTCAAAGAGCAACCAACTTTA
GCGGATTTAAGGAATATCTTTTACTTTTAAGGCAACTTTTATTTGAAAGT
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TTTTCCTCAAATTTGCAAAAGTAAATGTCGTGAATTTCGCAATTTTTCAA
CCAATAACTACTATGACTTTGTATAATGCTGACATACATTGTCTAATTCC
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CTGAATAAGCTGTTTAAAAATCACTCTAACTACTCGTAAACGTAAACTAT
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GATGTTTTATTGTAACTGTTATTTAAATATTTAGAAATCAAATGTTATAA
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CTTTACATATGATGTAATGATCCATTGCAGATCCCTGACTGTAAACAAAC
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AACTGGCCTAAGATGTTTTATTGTAACTGTTATTTAAATATTTAGAAATC
AAATGTTATAAATGAAATTAAATCTTTATTTCATCATTAACTTCCTTAAT
TGATATCAAGACTTCCTAATTACAAACTTATCATGCTTTTCATTGATAAC
AAGCTCACTTCCTTTACATATGATGTAATGATCCATTGCAGATCCCTGAC
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AAAAGTTTCCAATATTATTAAGATGTTTAAATATAATGAATGATTTATTT
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GATGAGTTTCTCCAAAAAATAAGTCGAGTTTCATCTATTGATTTTTTAAA
ATGATATTCATTTCCATCCCATCAAAGGTATATCATCAATGTTTTTCTTT
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AAAATGCATCCTTAAGCTAGAGAAGAAATCGATTTTGTATAAACAGTTTT
TCATAATTCAACTGATCCTAGATATATGAAATACCGAGATCAAGCAATAG
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ATGTACATCAATGCTCTTTAATAACTATCATTCAGTTCACTGTTATGCTT
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AATCAAGGCTTGCATCCACAATCTTTAATAAATAATAATCACAGCAATAT
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GTCATAGCAGGTTAAGCCAGGTCAATACTTGGTAGAGTAACTATTACCAG
GAAACAGTTTAAGCTTTATCGAATTTGTATTTACTTTTTTTGCTCAATTT
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GCTTTAAAAATTTCATATCAAAGACTGAATGTCTTTTATTGAAAGCGATT
GTTTCTCTCAGACGTCTCATTTTATACACCAACATTCTTTTTAAAAACAT
TTTCAAACTTCTACAAACTGTTTTATGTGTGGGTGTTTTCCTTTTATTTT
TTATGATTATTCTAAATAATGAGGAAAAAGTTGAATTATTGATGAAATTC
ACAAAGTTTCTCTAATTTCTCAAAATTATGGTTAAACACTATAAAAACAC
TAAATTTCTAATAAATTAAGACAAGAAATAGGAGTTTAAAACACATTCTT
TAAAGTTCAACCTGGTTCAACAGTTTATAACTAAGCGGATTTTTCATCCA
CTCATTCGAAACCCTTTGTCTCACTTTATACTAAATCAAAAAATGAAAGT
CTTTATTAAACCCAAATCAACTTGGTGATTTGTCTGACAAAATGTTAGCT
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AAAACTTATACAAAGCAAGTCTTTTTCAGTTTCAATTTTTTGCAAATAAT
TAGCCTAAAACCAAACCAAAGAAAAAAACAGTTTATGAGTGCCTCTTTTG
TAGCCAATTTAATTATTGTTCGCTTATCTGGATGTTTAATTGCACAGGGG
AAAGTTTTTGAAGATAATAGGTTATTATATTCAGATCACACATCCTATCT
TTAGAGAAGAAAGGGCCATTAAATTCCATCATAAAAAAGGTTCCTCTGTT
AATCAAGATGTTAAAGTAAATTGCCAAAAGCCAAACGCCAAACGCCTTTA
TTGATCAAGAGAAGTAAATTGCTCAATAATATATTCTTTATAAAACAGAT
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GATGAGTTTCCAGATAATTGTCTAACTCTAAGTATTTTTAATTAATTAAA
GGCTAAATACTAAATTGGTTGGGGGTCAAACATTTTGGTGACACCCACCC
TTATGAAAAATGACTTGCATTACTCCAATGGTCATCTTCACCTTAACAAA
ATCTAGAAAAGCCAAAAAGTCAGAAAAATAATTCAAATTTCCCAAATCAT
GTAGTCAGGGAATTTGAAATCAGGAATATTAAAAGATGACATTTGGCACA
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ATAGTTTGAACCATAGGGGATGATTTTAATATAACATGGTGTTGACATCT
CCACGTATTAAACTGCTTTTTTTGATGTTGAAATTTGAGTACAATTAGTA
GCTTTTCAAGGTTACTGAGTAAAGGGTAAGAGGGTCTAACTTTCAAGTTT
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AAACTCGACTCTTAGTAAGGCCTAAAAGCCTGGAGCTGTATATTATGAAG
ACTAAGTTGTGAAGTACTTTTGGGCATTGTTTCAAGTGTTTTTTTATATT
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GTAAGCTCACTTTTGAACTGTTAGTGTTAAACTTTTTGGCTGCCATGCCC
TAATCTACTTTCCATTTGTAGGTAAATTTAAAGGGACATTAAAGTACTGA
CGAAATTTGTAAACAAACCGTATGCAGCGGGATACAAAATCAAAACAAAT
GTCACATGTCAAAATAAAAAAATAAAAACAAATAATGGCTGATTTTGATT
GTTTCAATTCTTTTACAAGTTTGTTTTGGACACGTGATTTTAATTGTTCA
ATGTTTACGTTTTACTACTTTCACTTTTATGTCCATTTAAAGTGATTCTC
TTCCCGAGACTAACATTTTGCCGATTCAGCATTATTATACTATTTTCAGT
TGCCTTATTCCTTGACATCAATTGATTTTTTTTGTTGACAAACCATGCTC
GCAGGTAACGGCTCCGTTCGCTCTGAAACGAAATCAAGCCGTTCTANAAA
TAATTCAAATTTCCCAAATCATGTAGTCAGGGAATTTGAAATCAGGAATA
TTAAAAGATGACATTTGGCACATTTTGATACGAAGGAATAAAGTTATAAC
TGAACAGATTAAAAATAGAAAGATAGTTTGAACCATAGGGGATGATTTTA
ATATAACATGGTGTTGACATCCCCCCCACGTATTAAACTGCTTTTTTTGA
TGTTGAAATTTGAGTACAATTAGTAGCTTTTCAAGGTTACTGAGTAAAGG
GTAAGAGGGTCTAACTTTCAAGTTTCAAAAATTTCAAGTTATGAAGTCAA
GTATTAAGTCAAGTGAAGTCACTTAAAGTCAAGCGTAAAACTCGACTCTT
AGTAAGGCCTAAAAGCCTGGAGCTGTATATTATGAAGACTAAGTTGTGAA
GTACTTTTGGGCATTGTTTCAAGTGTTTTTTTATATTCTAATATTATCCA
CTTTGGTTTCTAGACTCGAAGAGAAGATTAAAAGATGTACTGCAGGAATT
TCGAGAAGGTTATCATGAAGGTTACGACCCTGAACAGGTAAGCTCACTTT
TGAACTGTTAGNTTTGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTT
CGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTACCAGCTTTTCTCGAGAT
TGGCTCTTTAGTCTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGATGCATAACTATAAA
CCCTCGAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAAAATTTTTAGGCAA
ATTTGGGCCAAAAAACGGCTATAAAACGGGTTTTTTGGACTTTGTGAAAA
ATTGGATCATTAATTTTTTCTGATTTTTTGTATGATAGTAGGGTACCATC
ATAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTCGCAAAAAAATTTTGTTGGCT
TAAAAAACGCATGTTTAACTATAAGAATCAATATTAATAAGCATACACTA
ATGTTCTTAGTCAAATTACTACATTTTTTTATGAGATAGATGTTTTTTTT
CTCATGAGGGCTTACTTTTAAAGAATATATGTGTTTAGACATGAACCTTT
GGTTACTTGGCGTATGTTTGTAGAAAAACTGGCCAAATTCGATATTTTTT
TATAAACACATTATCAATTACTTAGGTATTAGCTTTTCTCGAGATTGCCT
GTTTCATTCTTTATTATTTTTTGCACAAAGATGCGTAACTATAAACCCTT
GAATGTGACTGAGCCCAATTTTCGAAAAAAAATGTTTTTGGGCAAATTTG
GGCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGGTTTTTTGGACTTTGAAAAATTGGAT
CATTAATTTTTTCTAATTTTTTTGAATGAAAATAGGTAAAAGATGGCTCA
AGCTGATTTTTGTAAAAAACGAATTTTTCAGCTCAAAAAACGCATCTTTA
TCTATAAGAATCACTATTAATAAGCATACATCAATGTTCTTAGCCAAATT
ACTCAATATTTTGATGAGATCGATGTTTTTTTTGCTCACGAAGTCTCGAA
TATGAAAGAATATTTATAGAGCATGAAATTTTGGTTTCTAAACGGTTTTT
TATAACAAACAAACGACTAATTTTAATAGATCGGCACTATTAGTGTTCTG
AATGATTGTTTAATTGTCACGCTCACGTAGATATCAATTATATATGTGTT
ATATGCATAACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATCACTTGTTTCAATTCAAA
AGAAAAGTGTTTCAAATTTTATCAGATCTATTATACAATTAAAAAGTCAT
TAAAAACTTTCGGTTATTTTAACCCTTAGTTGATTGTATTGAACCCTACC
AGTAAAACATCTCCCCTCCATCATTAAGTTGTTATTTTTCAGGATAAATG
GCTTTATGGTTCTGACCTAAGTCAAGACTCCCTTGAGAAGAACCCACAGA
TTTTTGTGAAGTCTGAAGATGTCGTGCTTTTTAAGCTCTTCCAAGCAAAA
AAAAGGGACTATCGCAAAAAATAATGCTGCTATTGTTTTCGAAAATCCGT
GAAGCTTCTTATTGGTCAAGCGCTGAAATTCTATTGTAATGTCACGTGAC
ATCGGCACAAATTTCAGCCGAAGCACGACTTCTAGCCCTTTGGGCTTTAT
AAATCTATGGAAGAATCCCTCTTTTAGGTTGTAATTCTTTTCTTCTTTTA
GCCTATGGGTTACGATGGATTCAAACTATTCATGTCAGTCTATTTGGGAC
AAAGTGTGAGCGAAGAATTGATGCAGACTTTATTTTGGACTTTCCATAAG
AAAGTTCCCAGAGGAGATGCAAAGTCACCAGATCTTCCCAACACAATATT
ACGAAAAATCTTAGTAGAAAATGGAAATGTTTCGCAAGAGAGCTTAGACC
AGCTGAATGGTAACTATATAGCTTAACTCCAGAAAAAAACATTGTTTTTT
CCCTAAAAATGTAAAGTTTTAAATTATGATAAAAATTCTAAAATTCTAAA
ATTTAAAAAACTTTAAAAGTCGTTTTAATTAATCATACGTGTAATGTTCA
TTCAAAACACATACACTAGCGGTTTCATATTATAGGATTTAAGTCTATTC
TCATTTGAGCACTCTTTTAGGAATAACTAGATTATGTTAATTTATAGGAT
GCATTGTAAAGGCTGCTTGAATTTACTCTCACTGTTTTTAATACACTTTA
TTTTTGCAAAAACTCTAATCACTTTTTTTCACTTAATTATGTAAGAAAGC
ACTCATCATATTTCTATTCCAGAAAGTTCATTGTCAAGGATCGCAAAAGG
TGCACGGCGAGCGACGGTTGTTGCCACAGCAACAGTTGTAGCAGGTATTA
AACAGAACGGTGAAACTACAGAACTCGAGAGTATCAAAGAAGACAAAGAA
AATTCTCGATTATCTTCTTCCCTTAATATAACATCCACTCGTACTAAATG
TTGTAATGACACACTTACACCAGGTTAGCTAATCATTCCATGCAACACTT
TGCATACTACTTTACGCTTGCATGTACATTCAACACGACAAAGTCATAGA
AGTCTAGTTTTCACTTACCGCACAGTCAATAAAACTACATATTGAGCTAT
TTTATTGGCTGATAACACGAATGAAATACACTTTTTTATAAGAACATCCA
AAATCTTTGAAGCCTTCGGATGTTCTTGACTTTTTGAGTTTTAAGCCAAA
AAATGTTTTTAACATATATGTTCTTATTTTCGTCATTTTATGGGCATTTT
TGCCTTTTTTCCTAAGAAATCGGGTGTTTTAGAGTCCACGAAGCCTTAAA
AAAATGTTCTTAACTTGTTAACCGTTGAAACCTTATGTTCTTTTATATAG
TTTGTTCTTATAAAAAACGTGTACTAGTATTATTCATTCAGACAATCCCT
ACCCATTCCTTTATAAACTGCTGTTTATACTTAAATTCCTAGGACCGCTG
CACTAACGCTTGTTACAGAAATTTGACATAACATAATTACGCAACGACAC
TGTCAAAAATCACTAACATCTTATTAATTAAGCATACATTAACCTAAAAC
TAATTATTAACATATACTTCAAGAGAAATTACAGCGGGGAGTTTCCATAA
CTCATATACGCGCGCTGAACGCAAAATTTGCGGTCGGTATTATATCTTAT
CGGTAGAAAATTCGTCGGCTATAAAAATTCGTCTGTAAATATTTTGTCCC
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CTTGTTGGAGTCAAGGAGACACTCGCAAGCTCGGTCGTTACTTGACTTTG
GGCAACATTTCTCAGAATAGCGTCAACTAACCGGTCATTATTGTATTAGT
GTAGTAGGCCCGTCGTCATGCTAAAAGAACCAATTGTATTGCTCAAAAAG
CCGTGTAGCCTACTTCGAGAAAGTTACCGGTTAACAACAGGTTTCGGGTA
TGGAGTATGGAGACTCAAGCCACTGTAATTTCAAATCGAATTTATTTTAT
TCAGATGACATACATACACAATATACGTTCTAACAATTTTTTTTTTCTTT
ATGAGGTTGTGTAAATGCCTCTTAGTCCCCGAAGATCCCATTTTTTGCTG
TTTTACTTTTTCGAGAAACTACATGACAATATTTGTCTTTCAATCCTTCT
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CCTTGACGAACGGTCTTTGTATCGGTTCCTTATATAATAAGTATTAGTCT
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GAAGGCAGAAAAAGTGGTGAAAGACAAGAAAAATTCGGTGATAAGTTATG
ATGGTATACCCATGCAGATTACTCCGCTACCCGATACCAAACCTCTTATC
GCATTCATCAACCCTAAAAGTGGCGGACGGCAGGGTGCAAGGTACAAAGT
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CGGGGAAAACTTCGTCGCGGAAAAGTGACGAAATTTTGGACAAGTGACGA
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TTCCCCGACGAAGTTTACCCCGACGAAGTTTACCCCGATAAGGTATTCGA
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TGTCTTGGGCTCTTCCAGAAAATGTCCGTACATGGGGGTGGAGGATATAG
TATCCGAGGGGTTAACTTGCGCTGTTTTGGGGTAATTTTGATTGTCCATG
GGGTCAACTGATGCTTTTCCGGGGGTGCTATAACTGCTGTCCGGGGGTCA
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GCATTTCTTCAAGGTTTTTCACCCCTGCACGTTCGCTGCCGAGTACGAGT
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TATCTCACGTTTATCGCTTCGTAGTACACTCTGTGTGCATTTTCTGTTTG
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AAGCAACACTTCTCTCATCGTCTCCCCTCTCTCACCGGCACTCCCATCAC
AGCGGTTGGTTTGAAAAATCTCAAATGAGAAAAGACAATGACAACAGACC
CTCCACGGCAATTGAATTAGCCGTAGATACTGGGTCTGTGTACAGACAAT
CCAACGGAATGATACGGAAACATTTGCGTGGATTCATATTTTTTAATAAA
ACAATGTTGTTTTGCACACACTTTTCCCCTTTCTTTATACATTCACCTCA
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ATGGATCNGTGGTAGGGGTCTCAGTAGGACTATGACAAATGGTATGTGAA
CTCGAAATTGGGATGGATTGATTCGCAGTTTTGTCATTGTAAAATTTGTT
TCCTTCTTTTCTCAGATCGATTAACGAGTTTGAAACAAAGACCTCCGATG
GCCATTCTTCCTCTCGGTAAGAAAAGTTTTTCTAGCTTTATTTCCACATT
TTGAAGCCATTACCAACTAGCTTGATTGTATTCCATGAAATATGGAAGCT
GACTTATTTTTAAGTGTTATATAAGATTTACCGTCCTAGACGGCTTTCCA
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GGGTGGAGGATACGAAGGAGGCAGCTTGGACAAAGTTTTACAAAAAGTTC
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ACAATGTCAGACTAGATCTTGTGGATTACTTCAATCTGTCTTTACATATT
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TTTAGACTTAGTTGATTTCTGTAAGCGTAACGTAAAAAGTGTAATTTGAG
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NTAGGTATTAGCTTTTCTCGAGATTGGCTCTTTCATTCTTTATGATTTTT
TGCACAAAGATGCATAACTTTAAACCCTTAAATGTGACGGAGCGTGATTT
TCGAAAAAAATGTTTTTGGGCAAATTTGGGCCAAAAAACGGCTAAAAAAA
GGGTTTTTTGGACTTTGTGAAACACTGCATCATTGTTTTTTTCAGATTTT
TTACATGAAAGTAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTTGTAAAAAAAG
AATTTTTCAGCTAAAAAAACGCATATTTATTTATAAAAATCACTATTAAT
AAGCATACATCAATGTTCTTAGCCAAATTACTCAATTTTTTAATGAGAAA
GATGTTTTTTTTGCTCACAAAGTCTTGAATATGAAAGATTATTTCAAGAG
CATGAAATTTTGGTTTCTAAACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTATATTTGTTAAATGCATAACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATCACTTGT
TCTTTTCAGGTTTAAGAATAAACTTCGATATTTTCAAGCTGGTACGTCAG
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ACGCATCCCCTCTGATATGATTTGATATAACAAAATAAATTCTGGGGATG
CGCGCAGCCTAACCAACGCCATATTAACGTCTATAATTTTCATTTTCATT
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TAGATATAAGTGACCGCAAACTAGAAGTCGTTGGTTTGGAAAATAGTTTA
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GTCTAATGTCGACATCCCTCTTCTAATTTTGACATCCTTCTTTAGAGATG
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CATGGTTCACTGGTTCATGGTTCACTGGTTCATGGTTCTCTGGTTCACTG
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ACAGAACTAAGAAACCAAAGAACTATAGAACTATAGAACTAGAGAACTAT
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_041707	XLOC_041707	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
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Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00066678 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: DGKG (Diacylglycerol kinase gamma OS=Homo sapiens GN=DGKG PE=2 SV=3)

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Sbjct:    6 WVSLTPEEFDQLQKYSEYSSKKIKDALTEFNEGGSLKQYDPHEPISYDVFKLFMRAYLEVDLPQPLSTHLFLAFSQK-PR------------------------HETSDHPTEGA------------------------SNSEA--------NSADTNIQNADNATKADEACAPDT-------ESNMAEKQAPAEDQVAATPLEPPVPR----SSSSESPVVYLKDVVCYLSLLETGRPQDKLEFMFRLYDSDENGLLDQAEMDCIVNQMLHIAQYLEWDPTELRPILKEMLQGMDYDRDGFVSLQEWVHGGMTTIPLLVLLGMDDSGSKGDGRHAWTMKHFKKPTYCNFCHIMLMGV-RKQGLCCTYCKYTVHERCVSRNIPGCVKTYS--KAKRSGEVMQHAWVEGNSSVKCDRCHKSIKCYQSVTARHCVWCRMTFHRKC--ELSTLCDGGELRDHILLPTSICPIT----RDRPGEKSDGCVSAKGELVMQYKIIPTPGTHPLLVLVNPKSGGRQGERILRKFHYLLNPKQVFNLDNGGPTPGLNFFRDTPDFRVLACGGDGTVGWILDCIDK-ANFAKHPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGYEGGSLTKILKDIEQSPLVMLDRWHLEVIPREEVE-NGDQVPYSIMNNYFSIGVDASIAHRFHVMREKHPEKFNSRMKNKLWYFEFGTSETFAATCKKLHDHIELECDGVGVDLSNIFLEGIAILNIPSMYGGTNLWGENKKNRAVIRESRKGVTD-PKELKFCVQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCASVTIRTNKLLPMQVDGEPWMQPCCTIKITHKNQAPMMMGP 774

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00066678 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00066678 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
DGKG	0.000e+0	44.99	Diacylglycerol kinase gamma OS=Homo sapiens GN=DGK...	[more]

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TCONS_00066678 (transcript) - C. hemisphaerica