TCONS_00066636 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00066636
Unique Name	TCONS_00066636
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2522

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at scaffold_457:205839..215755+
coding sequence from alignment at scaffold_457:205839..215755+

transcript sequence

>TCONS_00066636 ID=TCONS_00066636|Name=TCONS_00066636|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2522bp
acagactaaaaactaaaaaaattcatCACAGAAAATAATGATCTAATTAC
ATATTAACGAAATGAAACCCATTGCTCTGTTCTTGGTTTTCTTGACTTGC
CATGATGTTTTATCATCTGTCAGTGATCAAACGTCAGAAGTTGGATTAGC
AGATATAGAAGGAGTTATTGCTGGGTATGGTGATTTCAATTCCGACCAAG
CAACAGATGTTTTTGTCATTTCAAAGGATTGGGCAACAGTTCATGTTTAT
CTTTGGAATGTGAGGAACCAAAAGTTTACAAAAGGAGATGCGACAGTAAA
GAGTGAGAATATAGTCAACATCGTTCCAGCAGACTTTAATGGTGATGGTG
ATATGGATTTATTGATCTCCACTGAATCATCAAAGAAAACAGTCATCTCT
CAAGTTTATTTTGGGAACCGCAAATCATTGACTAAATCTGATGACCTGAA
GATTGAGGCCAAAGATCAACCAACAGTCTTTGATATGAATGGTGACTACT
TACCAGACCTCTTTGGTACAGATTTGAATGGTAATCGAACTTATTGGGTG
TATGTACcaactgaaaacaaaaacaaCGCTCACTTTTCAACAGAGACTCA
AGAAACGGGTACTGACATAGCAATACCTAATTCTAATGGCTTTGTTGATG
CAACAGGTGATTTGCACCCAGATCTGGTCGTCAAATCAATAGCTGCTGAA
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GTTAGCTGGGACACTTTTAATGTTTgaagacaaaaatattgaaatggttG
GTCAAGTCAGTTTTGCTGATATAGacaATGATGAAACAATGGATTTGATC
GTACCAATTTGTTTGAAGAAAGACTGTGAACATTCCAAAATATATTCCCA
TTCACTTTCCATGCTCAATGGCAAATTTATTACCACATGGCAATTGCtgc
tttcaaatgaaaattcggATTGGAAGTTTGATCCAGAGACATTCACTAAA
GGAAAAATTCCATTCATGCTTAATTTTGgtgACTTTATCATGGATGGTAA
GATTGACGCTGTAGCCATCCTTCAGAAGAAAGATGATGGAACACCGTTTG
CTGTGCAACTCGTCAATCAaccttgttctccagcttctcACAAGTGCAAT
GGCGCTCGCTCATTTCGTATCGCTGAAATAaaaacgaaagGATACCCAAC
ATCAGTGAGTTTGATGGATGTTTATGAGAATGGTGCATTGGATTTTATGG
TTTCTTATGAAATCAAAACACAGAAGAAAACGATCAAAGGAATGCAGGTG
TTAAGGAATGATTATAACTCGGATGCTGCCTTCCTCAAAGTTGCTGtgTT
ATCTGGTGACAAAACTTCTGCAAAATACGGGTCGAATCTTGCTGGAGCAA
CAGTGATAATACAAACTACAGATACCGATGATAATGCTCTCGTCAGAAAA
GcGACACAATTATCGCAGACAGCTTATTTTTCATTGAGTTTACCATACGT
TGTTTTCGGCCTTGGTAGATCACCTAATTTCGTGGAGAAGATCACTGTCG
GCGTTTGTCAAAGTGATAACCCGAAGATCGATCGAGTTCGAACATGGGCC
TCGATCATTCCAAATTCACAAGTTATCGTCATACCAACTCCTAAGGATTC
GCCTTCCGATTGGGTGACAAGACTGTTAGTAACACCAAGCAAAATACTTC
TCCAAACAGCTGGTGTGTTGATTGGCACATGCCTCCTCATCGCTGGATTG
ATCTTGATACTCCATATCAAAGAAAAGAAAGAGGACGAGCGTGAAAAACG
AAAAGAAGCTcacaaatttcattttgatgCTCTGTAGTAATGGTATGAAT
CAAAAAAATGCTTAGGtatcttatttttcaatttcatcgcTGGTAAAATA
TTCTTTTAATAACCTTGCTCTGTCTTGTTGGAAAATGCACTTTAACATCA
AATGGAATCAAAATTATACGTCGATCAAAATtaacattcaaaacaaaatg
cagGCGTTGATTAAAACAGACTGGTGGACAAGAAATAATGATATATCAAT
AAGATGTAAAAAACATTTCCTAGTGTTAATTGCAATGATACAATGTTGGT
CGTGTGATTACATCAAGCAAGTTCATCACTGATTTAAAGATTCCCATGTG
AAAACCGAATGCTTGATTCACCAAAGACGTTTCAAATCAAAGCAACATTC
ATGAAAAGCACCATAGACATTACATCACGAAACCAATAGCTgtttggttg
taagtgacgtaaaatcagtctatacgtcactttcaaccaatcagctgttg
aaTAGATTTTGAAGAAATACTGTCCGATTTTTTCTTAATGTgatggagat
tttgtaaaattaaATCTGCACTGTAGTAGCACTATGAATcatattttctt
gaattttttaacAGGATATTGTGTTaagtatttcatttttttagttttcc
ctATCTTATTTGTATGCACCCACACATCTTGATAATTTCATATCTTTATT
TCTGGATTACAGCTTCAATGTA

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00066636-protein

>TCONS_00066636-protein ID=TCONS_00066636-protein|Name=TCONS_00066636-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=591bp
MKPIALFLVFLTCHDVLSSVSDQTSEVGLADIEGVIAGYGDFNSDQATDV
FVISKDWATVHVYLWNVRNQKFTKGDATVKSENIVNIVPADFNGDGDMDL
LISTESSKKTVISQVYFGNRKSLTKSDDLKIEAKDQPTVFDMNGDYLPDL
FGTDLNGNRTYWVYVPTENKNNAHFSTETQETGTDIAIPNSNGFVDATGD
LHPDLVVKSIAAEDKGVVFEIWKQNKKDMELAGTLLMFEDKNIEMVGQVS
FADIDNDETMDLIVPICLKKDCEHSKIYSHSLSMLNGKFITTWQLLLSNE
NSDWKFDPETFTKGKIPFMLNFGDFIMDGKIDAVAILQKKDDGTPFAVQL
VNQPCSPASHKCNGARSFRIAEIKTKGYPTSVSLMDVYENGALDFMVSYE
IKTQKKTIKGMQVLRNDYNSDAAFLKVAVLSGDKTSAKYGSNLAGATVII
QTTDTDDNALVRKATQLSQTAYFSLSLPYVVFGLGRSPNFVEKITVGVCQ
SDNPKIDRVRTWASIIPNSQVIVIPTPKDSPSDWVTRLLVTPSKILLQTA
GVLIGTCLLIAGLILILHIKEKKEDEREKRKEAHKFHFDAL

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_457:205839..215755+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

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>TCONS_00066636 ID=TCONS_00066636|Name=TCONS_00066636|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9917bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_457:205839..215755+ (Clytia hemisphaerica)
acagactaaaaactaaaaaaattcatCACAGAAAATAATGATCTAATTAC
ATATTAACGAAATGAAACCCATTGCTCTGTTCTTGGTTTTCTTGACTTGC
CATGATGTTTTATCATCTGTCAGTGATCAAACGTCAGAAGTTGGATTAGC
AGATATAGAAGGAGTTATTGCTGGGTATGGTGATTTCAATTCCGACCAAG
CAACAGATGTTTTTGTCATTTCAAAGGATTGTAAGTTGCCAAAAATACTT
CCAGTAACCTATCACTTGTGGTAAACCCCCTAAAATACCAACAATAATGC
AACAACTAAAACCTAACTTTGATTGTGTGAAAAAAGACTCGACAGTGGAG
TAGTTCGTACTTAACACTATGGCAAACACCCTTTTAACTTCTGAATTCCT
TTATTTTCAGGGGCAACAGTTCATGTTTATCTTTGGAATGTGAGGAACCA
AAAGTTTACAAAAGGAGATGCGACAGTAAAGAGGTAGTTTTATTATTCAT
TCTTTATCTTCATCAACTTCTCTGACTGACATTGCTGACTTAAACAATTA
GTTTTTGGCTGAACTCAAAAAATTTAGCGTTGTATTGGTATTGCTCCATG
TATAGAGGGAAAGTAACTAGTAAAACCTGTGAACAATGAAAAAATCGACT
TGATCTGAAGTAAATACTGTAAATCTATCTTCAATAAAGACACGCGggtt
aaaaattgaataagGGGTATTTTGTAAGGCACTTTCAGGTATTACATCCT
TGTGTATGACCAGGTATTATATCCTTGAAATGTATAAAGTAGACTATAAT
TATTGCTTTTTTTCTACATAGTGAGAATATAGTCAACATCGTTCCAGCAG
ACTTTAATGGTGATGGTGATATGGATTTATTGATCTCCACTGAATCATCA
AAGAAAACAGTCATCTCTCAAGTTTATTTTGGGAACCGCAAATCATTGAC
TAAATGTGAGtgaattattttatttcaaagaatAGATTGTGGATAAATGT
TTTCTGTTTTGACTAACATTTAATGGGGACAAATACATCTAAACCGCTGA
TGTATAAAATCTATATAAAGTGTACCATTAATTCTCACCCcatttcatct
gaaaaaaagcattttattcTTTGCAAATAGTGTATCAGTGGATTTCTGTT
TTAAACTTACATgagtttagaaaatattttattttgggTTTAGTATGAAT
AATGACCTTCTTGAACGTCTAAATCCATAGCTGATGACCTGAAGATTGAG
GCCAAAGATCAACCAACAGTCTTTGAGTAAGTTATTATTAGGCTGTTCAA
GTGTACTGTAGGGTTGCTAAACTTTCTTTTATTcctatgaaaaaatttct
gacgTATTTCTGCAACCCCCTGCTGTTTTTCCAGGCATaccagcaaaaat
aaatttttctgttGCGTAAAAATGCTTACACAACACCTAAATGCCTTGAG
ATAACCACCTAGCAAATTGAAGTAACTAGGATTTTTTTGTTGTAAAAATA
GCAACATGGATATTTTGcttaaaatgggaaaatttaGCAATCTTTACATT
ATGAACTTGTAATATTTTGACCCGAATCAAATCCCCTTCAATAACTAAGA
ACAAATGATTAACTTCGAGATTGTTACATTATATTCCTTATTAAAGAacc
caattcatgatatgcaccattgcaatgtcttccgttccacccaatagctg
attggttcaaaGTGACGTActgactgcttttacgtcacttccaaccaatg
agctattggttctgtgacgtaatgttagaagacattgcagtggtgcatat
cgtGAATACAGTCTTTATTTCGATATAAAACTTGACTGTATTGAGACATC
TTCAGCTCTTGCTTAGGAAAGGCAGAGtggctctatctagtgttttatgt
aAGATATCTGTAATGCTACCTCTTGAATACAAAGCTTTTGACTGATGTTC
GAATTGTTTTCAGTATGAATGGTGACTACTTACCAGACCTCTTTGGTACA
GATTTGAATGGTAATCGAACTTATTGGGTGTATGTACcaactgaaaacaa
aaacaagtaTGATTCTTACCTTTTTTGGTACAGTGTTTTCACATTTAAAG
ATAATTTGTCAACTCTggcttttttaaattattaacCTTTTCTATTAACT
TatgaaataaattataaattatcatacagttgactctctctaattccaTC
TTCATTGGAGCAAATATTTTCTTCGaaatagagaaagattcgaattacag
agagtaatttaaaccactttcttgctgaggggaccaatattttaNttaga
gaaagattcgaattacagatagtaatttaaaccactttcttgctgagggg
accaatattttagttcgattaaagaaagatttaaataaaagaagttcgaa
ttagagtgcGTTGACTgtgaaatcaatgaaataaaattatCCTACCCTCT
TGTAATGAATCTTATCTTGCTTACCCTGGCTATCGTTGTCTTTTTTCAGC
GCTCACTTTTCAACAGAGACTCAAGAAACGGGTACTGACATAGCAATACC
TAATTCTAATGGCTTTGTTGATGCAACAGGTGATTTGCACCCAGGTAAGA
TCTCTTTGGTTATCCTTATCATTTTGTTTTCTTGTACCTGAGAATGGCTT
CCAAAGGCAACATAATATTGGGATATCATTACTTGACTAAGTGATATTGT
TGTGCAATAAAAACTAGTAAAGGTTATGGGTTCCTTTAAAGACTTACCAA
AATCTGAAGAATACTGAAACCCTGACCAAATATCGTGATGAAGACAATTA
AGCCCAATACTGAAGTACAAGCTTTTTGGAAGTCCCCGCCACTTAATTTA
TCCTTTTTTTGTTACATAGATCTGGTCGTCAAATCAATAGCNAAGAAGTC
CCCTCCACTTAATTTATCCCTTTTTTGTTACATAGATCTGGTCGTCAAAT
CAATAGCTGCTGAAGATAAAGGAGTTGTCTTCGAAATCTGGAaacaaaat
aaggtaaaattcATCAGAACCGCTAGAATacattttgaagtatttttttt
gtcttagttcatatatttttttagtACTGTTttataaaactgaaaataaa
aatgttttattctCTTGTGAGAGAAGTCATGTCCCTTGAAAGTCTGAAAT
AAggtcttttttacaaatttggcACATGAATAAAAAGGTAGGGAAATCCC
ACAATTCTTTGAtatgttttataagaataaaacacCTTCTAAATATctta
attttctaaattttagaaAGATATGGAGTTAGCTGGGACACTTTTAATGT
TTgaagacaaaaatattgaaatggttGGTCAAGTCAGTTTTGCTGATATA
GGTAATTTTCTGACGGTACTATATCTAAATTGTAGACACGTTCATATTGC
TGATGCTTTAGCAACACTAAGAGAAAGGGTCAACAAAATCTTGGTAATAC
AACAGGTCTGAATACGCGAAGTAGCGTTTTCATCACAACTTCTATTGCTC
CTCTATTTATaatgtattgttttattttactCTTTTGAAGTATTCCTTAT
TTCCTTTCTTGGATTAATGTTTAATTTGCGTAAGGGATGGCCTCTACAGG
TTCGAACGCTTTCTTCCATAACcgttgaaaaaatgaagttctttattttc
atttttaagacaATGATGAAACAATGGATTTGATCGTACCAATTTGTTTG
AAGAAAGACTGTGAACATTCCAAAATATATTCCCATTCACTTTCCATGCT
CAATGGCAAATTTATTACCACAGTaaatctaaaaatctttttactccatt
ttgaaaaaaatcataacaggTTTGAGTGAGAGCAGCCCGTGTCATTTGAA
TATGAAATATAAAGAAGTATGATCCAATCTTTCGGTAGTCGAAGTCATGA
TATTGTATTTCATCCAATATTTCTGATGCTTAAAATTCattctcattttt
aaatttctagTGGCAATTGCtgctttcaaatgaaaattcggATTGGAAGT
TTGATCCAGAGACATTCACTAAAGGAAAAATTCCATTCATGCTTAATTTT
GGTGAGTCAAATTGATCTGTTAAGATGATTTTTATAAATAGTTATATTTT
ACCTGAATTCAAACCTTTTAAATGCATATggatttagaaaataaaaccaa
aatagAAATTCGTTTTCTTTAATTTGAGAGAAATATTAGCCTAAAATTTA
AGCTAATCCCATTTAATGAGACTAGAATGCAAAATGGCAAAACAAATAtt
gtatttctttattttttatttcaggtgACTTTATCATGGATGGTAAGATT
GACGCTGTAGCCATCCTTCAGAAGAAAGATGATGGGttagtttttatttt
ggttCGCTAGAAATCGTGTTTAGCTTTGGCAAAGCAAATATCCTTTCCAC
TTTCGtctgttatttttttgttgcCTGAGAAAAGCTTTATATTATTGTTT
CCAATTATTTCACATTTTACCTTTTTATTCTTGTGACCATAAAATAACAC
TTTAAATTCATctcttttttaaaactttacgggttttcgggctccgaaca
ttcgattttttgacgtcacttttaactatcgaagctcctgcagtagcaaa
agaatcgaatttgcgtcaaaacacttgaaaggcttctatttttcgaaaat
cgtcaaagtggaactcatttcttagtgagttccaacGCTGCTCTTTAAAC
ATTTTAAGCTGACGAAGGGAtttaaattgttaaaaatgtacAAGTTTTAA
ATAATCTTTTGAATGTTGTTTTCCAGAACACCGTTTGCTGTGCAACTCGT
CAATCAaccttgttctccagcttctcACAAGTGCAATGGCGCTCGCTCAT
TTCGTATCGCTGAAATAGTATGTTCGTTACTTTTGATATCTTCTTTTGTT
GTCAGCAAACTACAATCTTTGACAGAATATAATGTCAAAGGCCTTAAAAG
AGTGTATTTTACCCCTTCCCCCAATATTGGGGGAAGGGGTTTTCTAGGGT
CAAAAActgtaaagaaaaaacaatctgTGACAAATATTTTGTCTAAGATT
GTAGGTTTTTCCCGATTTCCTTGATTAGTAAATTTCAGTGAGGTTGACCT
TTCAAAAATGACAAACCTCCTCTAACTACAGGGTTGAAAGATTTTTCTAA
AGTAGTCAATTTAATGAGAGCTTTCCATGTTTACATCAGAGTGCAACAAT
AAACAATAGTACTATTcagtaaaaagttaaaatatattttttttaaagtg
tatgttaatttggcggtcgatggattttgtaaattttagcAGTGATTTAA
TTCTGCGGAGTACAAAACTGCTGAAtctgctgaaaatttcaaaagtttaa
tttccttttattttttagaaaacgaaagGATACCCAACATCAGTGAGTTT
GATGGATGTTTATGAGAATGGTGCATTGGATTTTATGGTTTCTTATGAAA
TCAAAACACAGAAGAAAACGATCAAAGGAATGCAGGTGTTAAGGAATGAT
TATAACTCGGATGCTGCCTTCCTCAAAGTTGCTGGTATATTATTCGCTGA
CTCatcactttttatttcaaaaactttcaaaagagCTGTTAAACTTTTAA
TCTTAACTACCTtgattggaactaattttcacgggaattaattttagcgt
tttttgcggtttttcgtcaaaatcgcgaaaatttgaaccTGCAAAAAATC
TTGAGAGttaaaatccgcgaaaattaattcccgcgaaacacaatttttcc
aattttatcaaaaaatttgaaaaatccctaggaaaatgaaagaaatttgt
ccaaaaaagggcaaaaccgcgaaaattccagaatgaaaaaaaccgcgaaa
ttaaaacccgcgaaatgcaatttttccgatattttttttcgaccgcgaaa
attagttcccgcgaaaattagttccaataaggtatcaaattgtgtttttc
agaTAACATTTCATTGTTCACTTAGTTTCGACGAGCAGTTTGTGACAACT
TTCCATCCAATTCTTCCAATCTATATTTATTTAactcttttttgtttttc
tttaaagtgTTATCTGGTGACAAAACTTCTGCAGtaagttgtttttcttt
tttttcaaaaaataaactaCAGTTGCCCTATAAAACATATCAGGCGTCTT
CAATACCTATAATGCCTTAATATTCTCGAttctaaagtttttttgaacaG
TTTTTTTATGTGTTTTTCTAGTGTTTTGTCACTACACTTTCTATAAGagc
aaaatatataagaacataaggcttcgaggctaAAATGATTTAAGAACATA
AAACATGCAATTTGTTAAGAAATCACACTAAAAGATGctcaaaatgctga
aaataagaagtaggcgaaaaaccaaaaaagttaagaacacctgAACGCTC
TCACGTTTTTTCAACCTTCTAATAAAACAACGTGTACGAAAAAATGTGAC
AAACTTTTTCCTTCTACTGTAGAAATACGGGTCGAATCTTGCTGGAGCAA
CAGTGATAATACAAACTACAGATACCGATGATAATGCTCTCGTCAGAAAA
GGTAAGTACCTCGTCGAccttttttacgccggcccttattggcgttattt
tttggctcgtggcgtaataagggccggtgtaaaaagagNTATCGGccttt
tttacgccggcccttattggcgttatttttgggctcgtggcgtaataagg
gccggtgtagaaagggccaaaattttgcaatttttacctaaaagtggcgt
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attttcaatggaattcaacagtttaatactgaaatatgacattttattgc
aaattttagTTAATACATACTGTTTTGAACCCTGAGTAGCGATTTTTAAA
AGTTAaggcgttatttacggccctaattggcgtaagcccaaaattaggct
gtggcggaataagggccggcgttaaattaaggccggcgtaaaaagggccg
ataaggtatatgaaTCTTTCAAGGACATTTAGATGTTTAGAGAGAAGAAT
ATTTTAAACTTCAAAGCAATCCGTTCAATAAGATCTATTCTTTGTTGTGC
GCTCCTCAGGTGTACTTCGAGAATAAAAATAATGCAATCTTGTGTAATAC
AATGAAGTGGATAATACAGTCGTTttcatgttgtcttctgaccagccacc
agaaccgttggaaaaccaacggatccggcgagactcgaactcTTAACCAT
GCCATTCGTCGGCATTTGCTCTATCATTGAGCTACGGGTCAATGTGGAAC
CCAAGAATTCCATTGCCACTCGGTAGAgctggaagtgaattcttgtGTAG
GTTTCACAGGGTTTCATGGCCTTTTTGCTTATGGAACTCAAAAATTTGTC
TGATGCTTGATTCACTCgtctaattaattttttttctttacagcGACACA
ATTATCGCAGACAGCTTATTTTTCATTGAGTTTACCATACGTTGTTTTCG
GCCTTGGTAGATCACCTAATTTCGTGGAGAAGATCACTGTCGGCGTTTGT
CAAAGTGATAACCCGAAGGTTAATAGTACTACCCAATAcatgtagttttt
ttttgtAGTTCGTATAATTTTTAATGGCTGTTGTCTTTCCCTCTTTTTCA
TTCAGTTTTATATTTTGCAGTTTTCTCCCAAACCTATTTCTTTTGCATCA
CTTTCATTaatatatatttcaaaattttgtcactttttgtTCCACAGATC
GATCGAGTTCGAACATGGGCCTCGATCATTCCAAATTCACAAGTTATCGT
CATACCAACTCCTAAGGATTCGCCTTCCGAGTATGTTATTACATTATTAC
TATGGTGAAAACTTAATTGCCTTTTTGCATTTCATCCAGCTAATCAGAAG
AACTTTTTGTTGTTGTCACTCTGTTTTAAAGTGAACAACCGTTGCAACTG
CAAGAATCCTCTTAAAATTGTAGGGAGCCAATCATTATGAACCGTATAAC
ATACAAAATCATTTTCccgtattttttaattttaactttaaatCTAGTTA
AAGATTCAGACTAAAACAGCTTTTCTCAAGACTTTCTTAGAAATGATAAC
CTGGTATAAACACCCATaataggcttttccagaaaaaaaactgaatatgG
GTGGAGGAGGAtatatcattttttagaaagttacctggacattgtgaatt
ttgaccacCCAGACAGCAGGtctgaccccccccccggacaagcatcagtt
gactcctggacattcaaaataacCCTCCAACTGaacaaaattacccccaa
acagagcaaccGATTTTTCACTATCCCCCTCTCCCTGGACATAATATCCT
CCACGCCCAACggcatgtacggacattttctggaaaagccaagCAATGTG
CCAAAGtttatttatgaaaaaaaagacATGGAAGACTTACACGAAAAATG
AACCAattgtttatcattttttatcattctattttcgtttatttttcagT
TGGGTGACAAGACTGTTAGTAACACCAAGCAAAATACTTCTCCAAACAGC
TGGTGTGTTGATTGGCACATGCCTCCTCATCGCTGGATTGATCTTGATAC
TCCATATCAAAGAAAAGGTATGTTTTGAAAGGAaccatattcatgatatg
cgccaCTGCAACTTTCCTGtttgttttggaaaattttaaaagttctcggA
AGACTTttcagtggtgcatatcatgaatagaagtAGACGTTTTTTATATG
TGAACAAGTATgcagaacattctaagaacattttgaggatTAACAGACCC
TAAAGCATGCAACTTCTTAGGAAATCATACTGATATACTTACGGAATGCT
ATAAATTTTTAGGCATCGTCTAGGCCTAAAATATTCGAAGGCGTCAAAGA
TTTTGACGTTCTATCTAAGTTGAAAAATTCTCCATATTTATTCTTCATAC
TTCCATGTTTAAATCAAGACTTTTGATACTATTTTGTCATCATCTTGGAc
agttttaatttattttttaacatgtAATTTACTAAAAATTCTAATGAAAC
CCTTAGAGGAATGTTCTACTACAGTGAATATTATATTATCTCATAACGTT
gtgttttcatttgttttcttaGAAAGAGGACGAGCGTGAAAAACGAAAAG
AAGCTcacaaatttcattttgatgCTCTGTAGTAATGGTATGAATCAAAA
AAATGCTTAGGtatcttatttttcaatttcatcgcTGGTAAAATATTCTT
TTAATAACCTTGCTCTGTCTTGTTGGAAAATGCACTTTAACATCAAATGG
AATCAAAATTATACGTCGATCAAAATtaacattcaaaacaaaatgcagGC
GTTGATTAAAACAGACTGGTGGACAAGAAATAATGATATATCAATAAGAT
GTAAAAAACATTTCCTAGTGTTAATTGCAATGATACAATGTTGGTCGTGT
GATTACATCAAGCAAGTTCATCACTGATTTAAAGATTCCCATGTGAAAAC
CGAATGCTTGATTCACCAAAGACGTTTCAAATCAAAGCAACATTCATGAA
AAGCACCATAGACATTACATCACGAAACCAATAGCTgtttggttgtaagt
gacgtaaaatcagtctatacgtcactttcaaccaatcagctgttgaaTAG
ATTTTGAAGAAATACTGTCCGATTTTTTCTTAATGTgatggagattttgt
aaaattaaATCTGCACTGTAGTAGCACTATGAATcatattttcttgaatt
ttttaacAGGATATTGTGTTaagtatttcatttttttagttttccctATC
TTATTTGTATGCACCCACACATCTTGATAATTTCATATCTTTATTTCTGG
ATTACAGCTTCAATGTA

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_457:205839..215755+

>TCONS_00066636 ID=TCONS_00066636|Name=TCONS_00066636|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=33744bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_457:205839..215755+ (Clytia hemisphaerica)
ATGAAACCCATTGCTCTGTTCTTGGTTTTCTTGACTTGCCATGATGTTTT
ATCATCTGTCAGTGATCAAACGTCAGAAGTTGGATTAGCAGATATAGAAG
GAGTTATTGCTGGGTATGGTGATTTCAATTCCGACCAAGCAACAGATGTT
TTTGTCATTTCAAAGGATTGGGCAACAGTTCATGTTTATCTTTGGAATGT
GAGGAACCAAAAGTTTACAAAAGGAGATGCGACAGTAAAGAGTGAGAATA
TAGTCAACATCGTTCCAGCAGACTTTAATGGTGATGGTGATATGGATTTA
TTGATCTCCACTGAATCATCAAAGAAAACAGTCATCTCTCAAGTTTATTT
TGGGAACCGCAAATCATTGACTAAATCTGATGACCTGAAGATTGAGGCCA
AAGATCAACCAACAGTCTTTGATATGAATGGTGACTACTTACCAGACCTC
TTTGGTACAGATTTGAATGGTAATCGAACTTATTGGGTGTATGTACcaac
tgaaaacaaaaacaaCGCTCACTTTTCAACAGAGACTCAAGAAACGGGTA
CTGACATAGCAATACCTAATTCTAATGGCTTTGTTGATGCAACAGGTGAT
TTGCACCCAGATCTGGTCGTCAAATCAATAGCTGCTGAAGATAAAGGAGT
TGTCTTCGAAATCTGGAaacaaaataagaaAGATATGGAGTTAGCTGGGA
CACTTTTAATGTTTgaagacaaaaatattgaaatggttGGTCAAGTCAGT
TTTGCTGATATAGacaATGATGAAACAATGGATTTGATCGTACCAATTTG
TTTGAAGAAAGACTGTGAACATTCCAAAATATATTCCCATTCACTTTCCA
TGCTCAATGGCAAATTTATTACCACATGGCAATTGCtgctttcaaatgaa
aattcggATTGGAAGTTTGATCCAGAGACATTCACTAAAGGAAAAATTCC
ATTCATGCTTAATTTTGgtgACTTTATCATGGATGGTAAGATTGACGCTG
TAGCCATCCTTCAGAAGAAAGATGATGGAACACCGTTTGCTGTGCAACTC
GTCAATCAaccttgttctccagcttctcACAAGTGCAATGGCGCTCGCTC
ATTTCGTATCGCTGAAATAaaaacgaaagGATACCCAACATCAGTGAGTT
TGATGGATGTTTATGAGAATGGTGCATTGGATTTTATGGTTTCTTATGAA
ATCAAAACACAGAAGAAAACGATCAAAGGAATGCAGGTGTTAAGGAATGA
TTATAACTCGGATGCTGCCTTCCTCAAAGTTGCTGtgTTATCTGGTGACA
AAACTTCTGCAAAATACGGGTCGAATCTTGCTGGAGCAACAGTGATAATA
CAAACTACAGATACCGATGATAATGCTCTCGTCAGAAAAGcGACACAATT
ATCGCAGACAGCTTATTTTTCATTGAGTTTACCATACGTTGTTTTCGGCC
TTGGTAGATCACCTAATTTCGTGGAGAAGATCACTGTCGGCGTTTGTCAA
AGTGATAACCCGAAGATCGATCGAGTTCGAACATGGGCCTCGATCATTCC
AAATTCACAAGTTATCGTCATACCAACTCCTAAGGATTCGCCTTCCGATT
GGGTGACAAGACTGTTAGTAACACCAAGCAAAATACTTCTCCAAACAGCT
GGTGTGTTGATTGGCACATGCCTCCTCATCGCTGGATTGATCTTGATACT
CCATATCAAAGAAAAGAAAGAGGACGAGCGTGAAAAACGAAAAGAAGCTc
acaaatttcattttgatgCTCTGTAGATGAAACCCATTGCTCTGTTCTTG
GTTTTCTTGACTTGCCATGATGTTTTATCATCTGTCAGTGATCAAACGTC
AGAAGTTGGATTAGCAGATATAGAAGGAGTTATTGCTGGGTATGGTGATT
TCAATTCCGACCAAGCAACAGATGTTTTTGTCATTTCAAAGGATTGGGCA
ACAGTTCATGTTTATCTTTGGAATGTGAGGAACCAAAAGTTTACAAAAGG
AGATGCGACAGTAAAGAGTGAGAATATAGTCAACATCGTTCCAGCAGACT
TTAATGGTGATGGTGATATGGATTTATTGATCTCCACTGAATCATCAAAG
AAAACAGTCATCTCTCAAGTTTATTTTGGGAACCGCAAATCATTGACTAA
ATCTGATGACCTGAAGATTGAGGCCAAAGATCAACCAACAGTCTTTGATA
TGAATGGTGACTACTTACCAGACCTCTTTGGTACAGATTTGAATGGTAAT
CGAACTTATTGGGTGTATGTACcaactgaaaacaaaaacaaCGCTCACTT
TTCAACAGAGACTCAAGAAACGGGTACTGACATAGCAATACCTAATTCTA
ATGGCTTTGTTGATGCAACAGGTGATTTGCACCCAGATCTGGTCGTCAAA
TCAATAGCTGCTGAAGATAAAGGAGTTGTCTTCGAAATCTGGAaacaaaa
taagaaAGATATGGAGTTAGCTGGGACACTTTTAATGTTTgaagacaaaa
atattgaaatggttGGTCAAGTCAGTTTTGCTGATATAGacaATGATGAA
ACAATGGATTTGATCGTACCAATTTGTTTGAAGAAAGACTGTGAACATTC
CAAAATATATTCCCATTCACTTTCCATGCTCAATGGCAAATTTATTACCA
CATGGCAATTGCtgctttcaaatgaaaattcggATTGGAAGTTTGATCCA
GAGACATTCACTAAAGGAAAAATTCCATTCATGCTTAATTTTGgtgACTT
TATCATGGATGGTAAGATTGACGCTGTAGCCATCCTTCAGAAGAAAGATG
ATGGAACACCGTTTGCTGTGCAACTCGTCAATCAaccttgttctccagct
tctcACAAGTGCAATGGCGCTCGCTCATTTCGTATCGCTGAAATAaaaac
gaaagGATACCCAACATCAGTGAGTTTGATGGATGTTTATGAGAATGGTG
CATTGGATTTTATGGTTTCTTATGAAATCAAAACACAGAAGAAAACGATC
AAAGGAATGCAGGTGTTAAGGAATGATTATAACTCGGATGCTGCCTTCCT
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AAGAAAGATGATGGAACACCGTTTGCTGTGCAACTCGTCAATCAaccttg
ttctccagcttctcACAAGTGCAATGGCGCTCGCTCATTTCGTATCGCTG
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GAGAATGGTGCATTGGATTTTATGGTTTCTTATGAAATCAAAACACAGAA
GAAAACGATCAAAGGAATGCAGGTGTTAAGGAATGATTATAACTCGGATG
CTGCCTTCCTCAAAGTTGCTGtgTTATCTGGTGACAAAACTTCTGCAAAA
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ATTTTTCATTGAGTTTACCATACGTTGTTTTCGGCCTTGGTAGATCACCT
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GATCGATCGAGTTCGAACATGGGCCTCGATCATTCCAAATTCACAAGTTA
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CACATGCCTCCTCATCGCTGGATTGATCTTGATACTCCATATCAAAGAAA
AGAAAGAGGACGAGCGTGAAAAACGAAAAGAAGCTcacaaatttcatttt
gatgCTCTGTAGATGAAACCCATTGCTCTGTTCTTGGTTTTCTTGACTTG
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CAGATATAGAAGGAGTTATTGCTGGGTATGGTGATTTCAATTCCGACCAA
GCAACAGATGTTTTTGTCATTTCAAAGGATTGGGCAACAGTTCATGTTTA
TCTTTGGAATGTGAGGAACCAAAAGTTTACAAAAGGAGATGCGACAGTAA
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GATATGGATTTATTGATCTCCACTGAATCATCAAAGAAAACAGTCATCTC
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TGGCGCTCGCTCATTTCGTATCGCTGAAATAaaaacgaaagGATACCCAA
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GGCGTTTGTCAAAGTGATAACCCGAAGATCGATCGAGTTCGAACATGGGC
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GAAAAGAAGCTcacaaatttcattttgatgCTCTGTAGATGAAACCCATT
GCTCTGTTCTTGGTTTTCTTGACTTGCCATGATGTTTTATCATCTGTCAG
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CTGGAaacaaaataagaaAGATATGGAGTTAGCTGGGACACTTTTAATGT
TTgaagacaaaaatattgaaatggttGGTCAAGTCAGTTTTGCTGATATA
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AAGTTTGATCCAGAGACATTCACTAAAGGAAAAATTCCATTCATGCTTAA
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AAGAAAACGATCAAAGGAATGCAGGTGTTAAGGAATGATTATAACTCGGA
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AATACGGGTCGAATCTTGCTGGAGCAACAGTGATAATACAAACTACAGAT
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GGCACATGCCTCCTCATCGCTGGATTGATCTTGATACTCCATATCAAAGA
AAAGAAAGAGGACGAGCGTGAAAAACGAAAAGAAGCTcacaaatttcatt
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TATCTTTGGAATGTGAGGAACCAAAAGTTTACAAAAGGAGATGCGACAGT
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GTGATATGGATTTATTGATCTCCACTGAATCATCAAAGAAAACAGTCATC
TCTCAAGTTTATTTTGGGAACCGCAAATCATTGACTAAATCTGATGACCT
GAAGATTGAGGCCAAAGATCAACCAACAGTCTTTGATATGAATGGTGACT
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GAAGATAAAGGAGTTGTCTTCGAAATCTGGAaacaaaataagaaAGATAT
GGAGTTAGCTGGGACACTTTTAATGTTTgaagacaaaaatattgaaatgg
ttGGTCAAGTCAGTTTTGCTGATATAGacaATGATGAAACAATGGATTTG
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AAAGGAAAAATTCCATTCATGCTTAATTTTGgtgACTTTATCATGGATGG
TAAGATTGACGCTGTAGCCATCCTTCAGAAGAAAGATGATGGAACACCGT
TTGCTGTGCAACTCGTCAATCAaccttgttctccagcttctcACAAGTGC
AATGGCGCTCGCTCATTTCGTATCGCTGAAATAaaaacgaaagGATACCC
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TGGTTTCTTATGAAATCAAAACACAGAAGAAAACGATCAAAGGAATGCAG
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gTTATCTGGTGACAAAACTTCTGCAAAATACGGGTCGAATCTTGCTGGAG
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CGTTGTTTTCGGCCTTGGTAGATCACCTAATTTCGTGGAGAAGATCACTG
TCGGCGTTTGTCAAAGTGATAACCCGAAGATCGATCGAGTTCGAACATGG
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AAGTTTACAAAAGGAGATGCGACAGTAAAGAGTGAGAATATAGTCAACAT
CGTTCCAGCAGACTTTAATGGTGATGGTGATATGGATTTATTGATCTCCA
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ATCTGGAaacaaaataagaaAGATATGGAGTTAGCTGGGACACTTTTAAT
GTTTgaagacaaaaatattgaaatggttGGTCAAGTCAGTTTTGCTGATA
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AATTTTGgtgACTTTATCATGGATGGTAAGATTGACGCTGTAGCCATCCT
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cttgttctccagcttctcACAAGTGCAATGGCGCTCGCTCATTTCGTATC
GCTGAAATAaaaacgaaagGATACCCAACATCAGTGAGTTTGATGGATGT
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AGAAGAAAACGATCAAAGGAATGCAGGTGTTAAGGAATGATTATAACTCG
GATGCTGCCTTCCTCAAAGTTGCTGtgTTATCTGGTGACAAAACTTCTGC
AAAATACGGGTCGAATCTTGCTGGAGCAACAGTGATAATACAAACTACAG
ATACCGATGATAATGCTCTCGTCAGAAAAGcGACACAATTATCGCAGACA
GCTTATTTTTCATTGAGTTTACCATACGTTGTTTTCGGCCTTGGTAGATC
ACCTAATTTCGTGGAGAAGATCACTGTCGGCGTTTGTCAAAGTGATAACC
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GAAAAGAAAGAGGACGAGCGTGAAAAACGAAAAGAAGCTcacaaatttca
ttttgatgCTCTGTAGATGAAACCCATTGCTCTGTTCTTGGTTTTCTTGA
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ATGGAGTTAGCTGGGACACTTTTAATGTTTgaagacaaaaatattgaaat
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GCAATGGCGCTCGCTCATTTCGTATCGCTGAAATAaaaacgaaagGATAC
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AGCAACAGTGATAATACAAACTACAGATACCGATGATAATGCTCTCGTCA
GAAAAGcGACACAATTATCGCAGACAGCTTATTTTTCATTGAGTTTACCA
TACGTTGTTTTCGGCCTTGGTAGATCACCTAATTTCGTGGAGAAGATCAC
TGTCGGCGTTTGTCAAAGTGATAACCCGAAGATCGATCGAGTTCGAACAT
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aaaacaaCGCTCACTTTTCAACAGAGACTCAAGAAACGGGTACTGACATA
GCAATACCTAATTCTAATGGCTTTGTTGATGCAACAGGTGATTTGCACCC
AGATCTGGTCGTCAAATCAATAGCTGCTGAAGATAAAGGAGTTGTCTTCG
AAATCTGGAaacaaaataagaaAGATATGGAGTTAGCTGGGACACTTTTA
ATGTTTgaagacaaaaatattgaaatggttGGTCAAGTCAGTTTTGCTGA
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GGCAAATTTATTACCACATGGCAATTGCtgctttcaaatgaaaattcggA
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TCGCTGAAATAaaaacgaaagGATACCCAACATCAGTGAGTTTGATGGAT
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GCAAAATACGGGTCGAATCTTGCTGGAGCAACAGTGATAATACAAACTAC
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cattttgatgCTCTGTAGATGAAACCCATTGCTCTGTTCTTGGTTTTCTT
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CATCTCTCAAGTTTATTTTGGGAACCGCAAATCATTGACTAAATCTGATG
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00066636-protein	TCONS_00066636-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
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Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00066636 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: TIP (T-cell immunomodulatory protein OS=Homo sapiens GN=ITFG1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 263.848 bits (673), Expect = 1.010e-76
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Query:  116 SVSDQTSEVGLADIEGVIAGYGDFNSDQATDVFVISKDWATVHVYLWNVRNQKFTKGDATVKSEN----IVNIVPADFNGDGDMDLLIS---TESSKKTVISQVYFGNRKSLTKSDD--LKIEAKDQPTVFDMNGDYLPDLFGTD---------LNGNRTYWVYVPTENKNNAHFSTETQETGTDIAIPNSNGFVDATGDLHPDLVVKSIAAEDKGVVFEIWKQNKKDMELAGTLLMFEDKNIEMVGQVSFADIDNDETMDLIVPICLKKDCEHSKIYSHSLSMLNGKFITTWQLLL---SNENSDWKFDP----ETFTKGKIPFMLNFGDFIMDGKIDAVAILQKKDDGTPFAVQLVNQPCSPASHKCNGARS-----FRIAEIKTKGYPTSVSLMDVYENGALDFMVSYEIKTQKKTIKGMQVLRNDYNSDAAFLKVAVLSG------DKTSAKYGSNLAGATVIIQTTDTDDNALVRKATQLSQTAYFSLSLPYVVFGLGRSPNFVEKITVGVCQSDNPKIDRVRTWASIIPNSQVIVIPTPKDSPSDWVTRLLVTPSKILLQTAGVXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAHKFHFDAL 1834
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Sbjct:   33 ALHNVTAELFGAEAWGTLAAFGDLNSDKQTDLFVL-RERNDLIVFLAD-QNAPYFKPKVKVSFKNHSALITSVVPGDYDGDSQMDVLLTYLPKNYAKSELGAVIFWGQNQTLDPNNMTILNRTFQDEPLIMDFNGDLIPDIFGITNESNQPQILLGGNLSWHPALTTTSK---------------MRIPHSHAFIDLTEDFTADLFLTTLNATTSTFQFEIWE--NLDGNFSVSTILEKPQNMMVVGQSAFADFDGDGHMDHLLPGCEDKNCQKSTIY------LVRSGMKQWVPVLQDFSNKGTLWGFVPFVDEQQPTEIPIPITLHIGDYNMDGYPDALVILKNTSGSNQQAFLLENVPCNNAS--CEEARRMFKVYWELTDLNQIKDAMVATFFDIYEDGILDIVVLS--KGYTKNDFAIHTLKNNFEADAYFVKVIVLSGLCSNDCPRKITPFGVNQPGPYIMYTTVDANGYLKNGSAGQLSQSAHLALQLPYNVLGLGRSANFLDHLYVGIPRPSGEKSIRKQEWTAIIPNSQLIVIPYPHNVPRSWSAKLYLTPSNIVLLTAIALIGVCVFILAIIGILHWQEKKADDREKRQEAHRFHFDAM 612

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00066636 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00066636 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
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Match Name	E-value	Identity	Description
TIP	1.010e-76	33.83	T-cell immunomodulatory protein OS=Homo sapiens GN...	[more]

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TCONS_00066636 (transcript) - C. hemisphaerica

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