TCONS_00065705 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00065705
Unique NameTCONS_00065705
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1630

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00065705 ID=TCONS_00065705|Name=TCONS_00065705|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1630bp
ATTGAAGGAGGGAAGCGTGACTCCAAAAGTAAAGGTCAACGAAATACAAG
CTCATAGAAACATTCCTAGAACATAGCACCTTACCGAAGATGGATTTTGA
TATTGTTGCATATCGCACACGAATTGGAAAATACCTTATCCGTATTGGAG
GTGATGGACTCTGGGTGAAAAGAATATGTCGGGTATGCGGAGTGCAGGAT
CCACCACGAAGTTTGTTTCCTGACGCTCCAGATATGACAGATTGGAAAGT
CAAGGTCACAAAATCCCTCGTACTCGAGTCAGGAGATCTCGTTCTTAAGA
GAAGAAAAAACAAGCAGATCAAGAAATGTGGAGCAAAAGACTGCAAAAAT
AAGCCAATCAACACACTGCCACTCGCATCACCACATAATTTGATTTTTAT
GAAGAAGGAGAAACGGTTGAAAAGAGATGAACGAAAAGCAACAGCAAAAG
AGGATAGTTATGTACTCTCCAACGTTCATTACCACGTGGACAGATCATGC
ACGGGTGATTCGACATCAATCTTCGTTTCAGATGATGTCGATGTTACTTT
AAGTGAAAAAGAATTCTAACTGACGTCAGTTTTGAACAAGTCAATTTTGA
cctcttttttagaaaaccaCATAACTTTACAAAATATTAGTTTCTGACAA
TGAGATTTTCAGGAGTGCCTTGATTTAAGTTGAAGTTTAGCCATACGAAA
TTTGAAGTCGATAACACAATAAGAGCGCtctacgtcaaaatttgaaactt
atggaatttttttttggggtAGAACACGCGAAATTAAAGTACATTTCAAA
CGTTGGTGTAAGAGTGACTTCTTCTCAGAATTAGCCACTTTATAACATTC
GTCGTTGATTTAGTTTCGCGAGTTAGCAATCTGACGCGTTTTttcgagtt
ttaatttcgcgaaaatgacaaaaattcgtGAAAGTTTAACGGATTAAAGC
AAACCCTAAATTGGAGTCGTCTATCGTGAATGTaatataggcgttatatg
ataatatgatatcgttacgggataatattagTTGTAAACTAACCTACACT
TTCCTTTATCCTACCCtacattttctttaatttagtcgtctagcatgcta
taCTTAGTAGATCCAGAAAGTTTTACgcgttttgatttttgaaattcgaT
TAAAGTATTTCTAGGGGGCATACTCAGTTGCATTTGCAGTTGCGTTGACT
TGTTGATTTTAATGCATGATACATGACTTTTGAGGAAGTCATCGTGGATC
CATGTGGATCCATACCTTATACAatagagtctctataactcgaaatctTA
GGGGGGGTCAATTTCTTTCGAGTTAAGGatacattcgagttatagacaCT
GATAATAGTGTTATTCTGACAGGACCAAAAGGATCGTTCGAAAGAAGGac
acattcgagttatagagattctagttaaagagactctaccgtaactatga
tttttttagattttacacTTTTAGGCGGCAAACCTCTTGTAAATAACCTT
ACTCaacgaaaaaaagaaagacatatTATGACATGGCtaccaaacttttt
ttattctatcatttttgtagattttataCTTTTAGGCGGCAAACCTTCTG
TAAATAACCTATACTCAACGAAAAAAGAAA
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_443:8630..26275-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00065705 ID=TCONS_00065705|Name=TCONS_00065705|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17646bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_443:8630..26275- (Clytia hemisphaerica)
ATTGAAGGAGGGAAGCGTGACTCCAAAAGTAAAGGTCAACGAAATACAAG
GTATAAACTTCAAATAATGAATTATCTGATTTTATGTTGTAGCTAATATG
ATGTTCCAGCCTACCATATATTGAAAAACTTGTTGTAAGGGGCTTTTGCA
AAGTCTTTTCGTTATTTAATTCCGCAGAGAGGGGCAGCATTTAAGAGGGG
CTATTGCCACAACAGGGTTTTTCTTTGGAAATGGGTGGAAATTGAAATAT
CCATATCAATGCGATTTTTGACCAGGGTAGGACAATAAATTTCTAAGTGT
TGATTGAGGTAGAGACTTTGGCAGGGGATGGAATTAACAAGGGGTGGGTA
AAACTCATAAAATGAGGGAGGTCATTATTAAGTGAAATGGGGTGATTTTT
TCCAAAGCTTGAGGTAAGGGGTCTACAATTAAACATAAAAGAGTAAATGG
ACTACTTAGCAATTACTTTAATAACTATTTCCTGAATTTTCTTTTAGCTC
ATAGAAACATTCCTAGAACATAGCACCTTACCGAAGATGGATTTTGATAT
TGTTGCATATCGCACACGAATTGGAAAATACCTTATCCGTATTGGAGGTA
TTTTTTCTCCACCATTTTTGTTTTTACTTTTGACCATGAAGTGAACTTTT
AAGGGACCCTCTAATTATTATCGCAATATGTTTAGGTCATTATTCTTTAA
AATTGATAATTTCATTTTAATGTCGAATTTAGGTGATGGACTCTGGGTGA
AAAGAATATGTCGGGTATGCGGAGTGCAGGATCCACCACGAAGTTTGTTT
CCTGACGCTCCAGATATGACAGATTGGGTACGTACAGCCTCGATCTCAAG
GCTAATATCATCAAAATTTTTATTTGATAAGTTGTTTTTATTTTAACCCT
TTGAGGCCGAAGGGGGCCATGTGTGGGTCCTTAAACAAAAATCACCATAA
TTCAACCAAATTTTATGATATGATGCTAAAAATCTATGACGCGCCTTATG
TTGCAAAACTATATCATCTTGGCTTTCAATAAATTAGTTTTCGCTTCGAT
CAAAATGAAATTCTCGCTCAGTAATGGAATACTTTTTCGCTTAGATAAAA
GTCAATTTTCTCGCTTAGATAAACTCACTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAACTTCTTGT
AGAATTGTGGTATAAATACCATTTTGACAGGAGTGATTCTTCAATCTTAG
ATCATCATCACTGTGAAAAAATTTTTCAAAAATATTCAATCCATCAAAAG
ATATCAAACAAAGTTTATTATTGATTGATTGTCAAAAGGCTGTTTTATTG
CGATGTTTTTACTACTTTATACAACTTTATAGGGTCAACCAGTAATAAAA
TCTGTTCGATATCTTTTGATTGATTGAACATTTTTGAAAATTCTTTTTCA
CAGTGATGACGATCTAAGATTAAAGAATCACTCCTGTCAAAATGGTATTT
ATACCACAATTCTACAAGAAGTTGATTTTTTTCTTCTTCGTTTTTCATTT
TCATTTTCAATTTTTTTAAAAGTCTTTTTGTTTAATAATATTCCACTCAA
GAATATATTTTCAACGACCAAAAAATACTTCCCTTTCCCTGCGTTGCATT
GCACAAAAATTGACGTCAGTCGGTCTATACCATGTAATACAAATTTATGT
GACGCCATTTTGATGTACACAATACACCTATCCATACTTAACGACGCGGT
CAGCTTTTTAGGGGACTGGGTAGGAATTTAGGGGGACATTTTATTTCCGG
CGCACGGCATTTTCAAACTGCAACCTAAGCAAACCAAGCCAAAGCACTTT
TCCGCGCGAAAAGCATTTTTCCTGAATCTCTGCGGTGGAGCATAAATTTT
TTTTCGCATTCAAACAAGATCAACTAAAGTGANCTAAGCAAACCAAGCCA
AAGCACTTTTCCGCGCGAAAAGCATTTTTCCTATATCTCTGCGGTGGAGC
ATAATTTTTTTTTCGCATTCAAACAAGATCAACTAAAGTGATGTTACTTT
TTCGTTTCAATGCTCTTACATTTTTTCAAAGAGCACTCCTGCACCTTTGT
TTTCGATACCGTCAACGAAAGAAATCTGTACTGGTAAACTCGACCGAGTC
CCCTAAAAAGTTGGCTGCGCCGTTAAGTATGGATAGGTGTATTTGTACAA
ATCGATTGCGTCATTTTGTTTGTATCGAGTATCGCCCTCTCAATCAGGTA
ATAACCTCGTTGAATAACTTAACATTCAAAAAATGCTCGTACTGTGTACA
GTGGTCAACTAATTGGATAACCCTTTGCTTGAGCAAGATCGTTCGCTTTC
AGCTCTTGTGGTGTCATTCCTCTCCGGAGGATGGTTGTTCTTCCTCCTCT
TTTTCTTGATCTCAGACTTCGCTGCCCTGTTGGCAACGTCGTGCAGGGAC
ATCACAAAAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNAGGGGGGTCAATTTCTTTCGAGTTAAGGATACATTCGAGTTAT
AGACACTGATAATAGTGTTATTCTGACGGGACCAAAAGGATCGTTCGAAA
GAAGGACACATTCGAGTTATAGAGATTCTAGTTAAAGAGACTCTACCGTA
ACTATGATTTTTTTAGATTTTACACTTTTAGGCGGCAAACCTCTTGTAAA
TAACCTTACTCAACGAAAAAAAAGAAAGACGTATTATGACATGGCTACCA
AACTTTTTTTATTCTATCATTTTTGTAGATTTTATACTTTTAGGCGGCAA
ACCTTCTGTAAATAACCTATACTCAACGAAAAAAGAAAGACATATTATGC
CAAGGCTACCCAACTACTTTTTATTCTATCATTTTTCTAGATTTTACACT
TTTATTACATAAACTTTTTGTAAGTAGAATGGTGAACGTGGAAAGAAAGG
CAAAATTAAAAGTCATTGCACCAAATTAATTTACCAAATAAAAAAAAATT
TAGGCTAACAATTCATAGGCCATTGCCCAACTTCTTTTATTCGCAAACGG
CAGGTCGCCCAGCAAAACAATTTCATTCAATCAGTAGAAAAGTAATATTC
TCTCCTTAATTCTTTTTTGTTAAATTTTGACCAAAGAGTGTAATACTATA
AGGCATTGAATACCCCTCCAACAAGACTAGAAAAAAAATTGTACAAGTCC
CTATTTAGTCACATCCCCGAATGAGCACAGAAGAGTACGAATTGGGTGTC
AAAATATCTTACGACATAGGAGTATTTTACAGTTGCGCGCAAAATGTTGG
ATCTAACTTGGATGGTGATATTTTACAGACAACCAAGTGTTTTNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAAACGAGGCCTGCTTTTATGCATCTCGA
GAAGAGTGTATTAAGAACGGAAGAAACAAACTTTCGCAAGCAGAAATTTT
TCCGAATTTTGGTCTTTTTCATGGAAGTAAGTGTCTTTGAGAATTCTTAA
CAGGGTAGTTCGTGAAACTAAGCTCGCAAAAAATTCTTTGAAAAATTAAA
GAACTGTAAAACTTCAAATTTAGTCCAAGAACAGCCGTCTTTATCAAATT
CATGGAACATTTGTAACTGTAAATTTTCATTTTTATTCAGCGATTCGCAA
AACTTTTTGCTCTCAAAATACATTCTTTTGGATTCACAAAAGTAGATGTC
TAAAACTTCGCAATCTTTTATCTTAAAACAAGTCTTGACCTGGCATTTGT
TTAAAACCGGTTGCACGACACAGTTCAGGCTCCATGCACGTCAGATTTGA
CCTGACGTACGTTTAAGGAACAGCTTTATAGAAACGGTTACACGTACGTC
AGACTCAGCAACAAGTCAGATTCGACCTGACGTGCGTTTAGCTACAGCTA
TATAGAAACGGTTACACGTACGTCAGGCTCCATGCACGTCAGATTCGACC
TGACGTGCGTTTAGCTACAGCTATATAGAAAGGGTTACACGTACGTCAGA
CTCAGCAACAAGTCAGATTCGACCTGACGTGCGTTTAGCGACAGCTATAT
AGAAACGGTTACACGTACGTCAGACTCAGCAACAAGTCAGATTCGACCTG
ACGTGCGTTTAGCGACAGCTATATAGAAACGGTTACACGTACGTCAGACT
CAGCAACAAGTCAGATTCGACCTGACGTGCGTTTAGCGACAGCTATATAG
AAACAGTTACACGTACGTCAGACTCAGCAACAAGTCAGATTCGACCTGAC
GTGCGTTTAGCTACAGCTATATAGAAACGGTTACACGTACGTCAGGCTCA
GCAACAAGTCAGATTCGACCTGACGTGCGTTTAGCTACAGCTTTATAGAA
ACGGTTACACGTACGTCAGACTCAGCAACAAGTCAGATTTGACCTGACGT
GCGTTTAGCGACAGCTATATAGAAACGGTTACACGTACGTCAGGCTCAGC
AACAAGTCAGATTCGACCTGACGTGCGTTTAGCGACAGCTATATAGAAAC
AGTTACACGCACGTCAGGCGCACTTGAGAATTCGTCGAATTAACCAAGAT
GATCAAGAATTTTACTAGACAATTTTAAAACTTTCCGCGACCGGACGTGC
TTCTAACAACGGCTATATAAAACGGATCTATGCACGTCAGGTTAAAAATA
ATCTGACGTGCGCGTAACAACACGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTGTTGAAAAGATATTCAGGGCA
TTATTTAGTTTTGAAAATATTGAAACATGAAAAAGAAAAATATTGAAAGG
CAAAAATAAATACTTAGAGGCCAAACGGACGCTCTCAGTAACAGCTTTGA
ACACAGAACCCCTGCTTTACAAGTCCCTTGCGCTATCCATTTGGACAACT
TGACATGTTCTATAAACTTTAATTTTTGGTAGAGATTCGCTTCATGATTT
GAAATGGCATGATTCGCGAAATTTCGCGTGTTTTGATAGAATTTAATTAT
TTTAATGTCAGAAATTTTCGCGTCCAGAAAATTTCGCGAATTTCGCGAAT
GACCCCTCAATTCGCGAAATTAAATGGTCGCGAAAAATATCTTTTGACTG
ATTCGCNCGCGAATGACCCCTCAATTCGCGAAATTAAATGGTCAGAATAA
AAACATACTTGTTTAAAATATTTTGCTCTCTCTTAGAGCATCTTCAGTTT
TTTTGAATAACAAAGACGTTTAATAATTATATTTAACGACGCTAGAACGG
CATTACAATGACTTCTTCAGTTTTTGACGTCACGGAACATCTGGTACACT
TCTTTCGCGTATCCGTGGCAGTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACGCAAAATACAT
TTTTAAAAATTTTCTTGGTCATTTTTTGCTTATTAGAACACAACAACAGG
CTTTTTAGCTTATTTTGCCAGTGTTTTTTCTGGCTGAATCCAATATCGCG
AAAATTAATTCCTACGAAATGAATTAATCTTGCTGATTCGCGAAATTAAA
TTCCATCAAAACACGCAAAAAGTAATTAGTTTGGTAATCGAAGATTAATT
TGTTTCGCATGAATAAATTTTCGTCAAAAGATATCAAACAAAGTTTATTA
TTGATTGATTGTCAAAAGGCTGTTTTATTGCGATGTTTTTACTACTTTAT
ACAACTTTATAGGGTCAACCAGTAATAAAATCTGTTCGATATCTTTTGAT
TGATTGAACATTTTTGAAAATTCTTTTTCACAGTGATGACGATCTAAGAT
TGAAGAATCACTCCTGTGAAAATGGTATTTATACCACAATTCTACAAGAC
GTTGATTTTTTCTTCTTCGTTTTTCATTTTCATTTTTCAATTTTTTTGAA
AGTCTTTTTGTTTAATAATATTCCACTCAAGAATATATTTTCAACGACCA
AAAAATACTTCCCTTTCCCTGCGTTGCATTGCACAAAAATTGACGTCAGT
CGGTCTATACCATGTAATACAAATTTATGTGACGTCATTTTGATGTACAC
AATACACCTATCCATACTTAACGACGCGGTCAGCTTTTTAGGGGACTGGG
TAGGAATTTAGGGGGACATTTTATTTCCGGCGCACGGCATTTTCAAACTG
CAACCTAAGCAAACCAAGCCAAAGCACTTTTCCGCGCGAAAAGCATTTTT
CCTGAATCTCTGCGGTGGAGCATAAATTTTTTTTCGCATTCAAACAAGAT
CAACTAAAGTGACGTTACTCTTTCGTTTCAATGGTCTTACATTTTTTCAA
AGAGCACTCCTGCACCTTTNGAATCTCTGCGGTGGAGCATAATTTTTTTT
TCGCATTCAAACAAGATCAACTAAAGTGACGTTACTTTTTCGTTTCAATG
CTCTTACATTTTTTCAAAGAGCACTCCTGCACCTTTGTTTTCGATACCGT
CAACGAAAGAAATCTGTACTAGTAAACTCGACCGAGTCCCCTAAAAAGTT
GGCCGCGCCGTTAAGTATGGATAGGTGTATTTGTACAAATCGATTGCGTC
ATTTTGTTTGTATCGAGTATCGCCCTCTCAATCGGGTAATAACCTCGTTG
AATAACTTAACATTCAAAAATGCTCGTACTGTGTACAGTGGTCAACTAAT
TAGATAACCCTTTGCTTGAGCAAGATCGTTCGCTTTCAGCTCTTGTGGTG
TCATTCCTCTCCGGAGGATGGTTGTTCTTCCTCCTCTTTTTCTTGATCTC
AGACTTCGCTGCCCTGTTGGCAACGTCGTGCAGGGACATCACAAAAACGT
CCCGCATCCCCTTTCAAGCTGATTTTTGTCATTTGAAGACTTTTATAACG
TTTAGTTTTTTGAAAGGGATAGAAATCGAGAAATTTTACTTCAAAGAAGA
TAATTTATTTCTGGCACCTCTGGTAGAATGATTACCTATTCATTTATTCT
TCTTTTTCTTCTATTCTTTAGAAAGTCAAGGTCACAAAATCCCTCGTACT
CGAGTCAGGAGATCTCGTTCTTAAGAGAAGAAAAAACAAGCAGATCAAGA
AATGTGGAGCAAAAGACTGCAAAAATAAGCCAATCAACACACTGCCACTC
GCATCACCACATAATTTGATTTTTATGAAGAAGGAGAAACGGTTGAAAAG
AGATGAACGAAAAGCAACAGCAAAAGAGGATAGTTATGTACTCTCCAACG
TTCATTACCACGTGGACAGATCATGCACGGGTGATTCGACATCAATCTTC
GTTTCAGATGATGTCGATGTTACTTTAAGTGAAAAAGAATTCTAACTGAC
GTCAGTTTTGAACAAGTCAATTTTGACCTCTTTTTTAGAAAACCACATAA
CTTTACAAAATATTAGTTTCTGACAATGAGATTTTCAGGAGTGCCTTGAT
TTAAGTTGAAGTTTAGCCATACGAAATTTGAAGTCGATAACACAATAAGA
GCGCTCTACGTCAAAATTTGAAACTTATGGAATTTTTTTTTGGGGTAGAA
CACGCGAAATTAAAGTACATTTCAAACGTTGGTGTAAGAGTGACTTCTTC
TCAGAATTAGCCACTTTATAACATGTCTCAAATTGAAACATAGCTGGTTA
TCTCTTTATAAAAGTCGTCGTTGATTTAGTTTCGCGAGTTAGCAATCTGA
CGCGTTTTTTCGAGTTTTAATTTCGCGAAAATGACAAAAATTCGTGAAAG
TTTAACGGATTAAAGCAAACCCTAAATTGGAGTCGTCTATCGTGAATGTA
ATATAGGCGTTATATGATAATATGATATCGTTACGGGATAATATTAGTTG
TAAACTAACCTACACTTTCCTTTATCCTACCCTACATTTTCTTTAATTTA
GTCGTCTAGCATGCTATACTTAGTAGATCCAGAAAGTTTTACGCGTTTTG
ATTTTTGAAATTCGATTAAAGTATTTCTAGGGGGCATACTCAGTTGCATT
TGCAGTTGCGTTGACTTGTTGATTTTAATGCATGATACATGACTTTTGAG
GAAGTCATCGTGGATCCATGTGGATCCATACCTTATACAATAGAGTCTCT
ATAACTCGAAATCTTAGGGGGGGTCAATTTCTTTCGAGTTAAGGATACAT
TCGAGTTATAGACACTGATAATAGTGTTATTCTGACAGGACCAAAAGGAT
CGTTCGAAAGAAGGACACATTCGAGTTATAGAGATTCTAGTTAAAGAGAC
TCTACCGTAACTATGATTTTTTTAGATTTTACACTTTTAGGCGGCAAACC
TCTTGTAAATAACCTTACTCAACGAAAAAAAGAAAGACATATTATGACAT
GGCTACCAAACTTTTTTTATTCTATCATTTTTGTAGATTTTATACTTTTA
GGCGGCAAACCTTCTGTAAATAACCTATACTCAACGAAAAAAGAAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_041165XLOC_041165Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1575043694:26226..26275TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1575043694:26226..26275Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1575043694:25679..25778TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1575043694:25679..25778Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1575043694:25449..25543TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1575043694:25449..25543Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1575043694:9452..10054TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1575043694:9452..10054Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1575043694:8630..9411TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1575043694:8630..9411Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1510915933:26226..26275TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1510915933:26226..26275Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1510915933:25679..25778TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1510915933:25679..25778Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1510915933:25449..25543TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1510915933:25449..25543Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1510915933:9452..10054TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1510915933:9452..10054Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1510915933:8630..9411TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1510915933:8630..9411Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1491911889:26226..26275TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1491911889:26226..26275Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1491911889:25679..25778TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1491911889:25679..25778Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1491911889:25449..25543TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1491911889:25449..25543Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1491911889:9452..10054TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1491911889:9452..10054Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1491911889:8630..9411TCONS_00065705-exon-scaffold_443-1491911889:8630..9411Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_443supercontigscaffold_443:8630..26275 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.124834	0.0515168	0.0282686	0.221251	0	0	0	0	1.76467	0.942151	0.888826	0.56872	0	2.60841	0.0708847	0.0456421	0.0986068	0	0.210355	0.0555448	0.220987	0	0.0286264	0.117872	0	0	0	0.109608	0.0554223	0.0846998
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00065705 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top