TCONS_00064741 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00064741
Unique NameTCONS_00064741
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2982

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00064741 ID=TCONS_00064741|Name=TCONS_00064741|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2982bp
TTTCATTACAAATTATAATTCCTTGTTTCAGATTGGCATTGAAGGATTAT
TCACCGATTTTCAACTCGAAAATTCACTCGAAGGACCTGAAGTCACCGAT
TGTGTTCTGTCTTTCTGGAGTTCCTCAGAAAACAATCTTTTGACAGCATC
AACCGACTTTGAACTGAAATATACTTTAACGTACGAACCCCAACAAAGAC
CTTTCCCACAGGTCACTTTTGTACAATTCCTTTACGCTCAAACAAACCAA
CGTTGTGGAACAGAACCCGAATGTCCTGAACAACCACACACCACCATAGA
GCCTCCACTACCAGGAGAACTTACCACACCAGCTCCTGGTCCTCAATGCG
GTCCCCTTCTCTCCAATTTGAATCGAACATCCACAGGATTGACAGGAACT
GTCACCTTCCCTATCTCATCGAATGCTTCAACTTGGTATTTGAAGGTTGG
CATCGATGGTGCATTTAACAGTTTGACGATAGAAGGTACAACTGAAGGAC
CAGATTTCAATGAATGTCTGCTCTCCTTTTGGAGTGGAGACGATAACAGT
GTTCTAGTAACAGGAAAGGATTTGGTcttgaattttcaattgatGACGAA
TGAAGGTGCATCTATCACCCATTTCACTCTTTACTATGCACAAACAATGC
AGAATTGTGGAACCGAGCCTACTTGTGGGTTCGAAACAACCGCATCTCCT
CAAATAACAACTGAAGCTCCAGAACAAACGACTCAAGCTCCAGAACAAAC
AACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAG
CTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAG
CAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCAC
TCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTC
CAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAA
ACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACA
AGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAG
AACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACA
ACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGC
TCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAAC
AAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACC
CAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCC
AGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAA
CCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAA
GCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGA
ACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAA
CTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCT
CCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACA
AACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTC
AAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCA
GAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAAC
AACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAG
CTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAA
CAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAAC
CCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTC
CAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAA
ACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCA
AGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAG
AACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACC
ACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGC
TCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAAC
AAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACT
CAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCC
AGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAA
CAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAA
GCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGA
GCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCA
CTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCT
CCAGAACAAACAACTCANCTCCGCAACCCTAGTAAACTCCCCCCGCCCCC
GGATGAGAATCTAGGTTTTTGAGGaaacttctcaagaaaaacaTCCAAAC
TCAGGCAACTGCGAACTAGAAATTGGCATATTTACTCCCTGATTTGACAC
CTGTATCCCTGATGCCAGATAATGAAAACTACAGATTGCTTTCCTCTATT
ATCTATCAGAAAGTATCAATGTCTCCAGTAGTTAGAAATCAAGTTTCGTA
CACCTTTATACTTTTTTATGGGTCAAATgggcccaaaaatcaataaaaat
tgataaaaatccaCTAAAACGGACAATTTTAC
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00064741-protein

>TCONS_00064741-protein ID=TCONS_00064741-protein|Name=TCONS_00064741-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=906bp
FITNYNSLFQIGIEGLFTDFQLENSLEGPEVTDCVLSFWSSSENNLLTAS
TDFELKYTLTYEPQQRPFPQVTFVQFLYAQTNQRCGTEPECPEQPHTTIE
PPLPGELTTPAPGPQCGPLLSNLNRTSTGLTGTVTFPISSNASTWYLKVG
IDGAFNSLTIEGTTEGPDFNECLLSFWSGDDNSVLVTGKDLVLNFQLMTN
EGASITHFTLYYAQTMQNCGTEPTCGFETTASPQITTEAPEQTTQAPEQT
TQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTT
QAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQ
APEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQA
PEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAP
EQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPE
QTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQ
TTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQT
TQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTT
QAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQ
APEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQA
PEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAP
EQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPE
QTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTQAPEQTTXLRNPSKLPPPP
DENLGF
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_423:232675..236166+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00064741 ID=TCONS_00064741|Name=TCONS_00064741|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3492bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_423:232675..236166+ (Clytia hemisphaerica)
TTTCATTACAAATTATAATTCCTTGTTTCAGATTGGCATTGAAGGATTAT TCACCGATTTTCAACTCGAAAATTCACTCGAAGGACCTGAAGTCACCGAT TGTGTTCTGTCTTTCTGGAGTTCCTCAGAAAACAATCTTTTGACAGCATC AACCGACTTTGAACTGAAATATACTTTAACGTACGAACCCCAACAAAGAC CTTTCCCACAGGTCACTTTTGTACAATTCCTTTACGCTCAAACAAACCAA CGTTGTGGAACAGAACCCGAATGTCCTGAACAACCACACACCACCATAGA GCCTCCACTACCAGGAGAACTTACCACACCAGCTCCTGGTCCTCAATGCG GTCCCCTTCTCTCCAATTTGAATCGAACATCCACAGGATTGACAGGAACT GTCACCTTCCCTATCTCATCGAATGCTTCAACTTGGTATTTGAAGGTATA TATTAAACACTTTTTTGAAATGGTCGAACCTGGAAAACCTTTTGGTTTCA GTTGAAATTTCTAGTGTaataaaatttcgattttgaaatcgttatttttt gTTCAGCAAAGGATCATCATATTCATTGATAGGTTTTATTATATCCTGTC ATCTAATAAATTGATTTAAAGTTTCATCTCTGACAGTCTTTTCATAATGG AGCTTAACGCATTGAGTTTCAGACCGAAAAATGGAGgcgaatcttcaacc tttcatAGGCAAGCAAAAGTGGATCTTTAAAATTTGCGCCGTATTTTGGA AAGCAGATTAAACTTTCTTGTCGTATAAAAATGTTTCTGGCTCCGGCGTT AAATGTTACTTCCAATCTATCCTTTGTATGTAGGAAATAAGGATTCTATC TTTCGGCTATCTATAATCGACTTAAAGGGCCTACTATTCAAACAGGGTTA AAAAAGACTCCTTATTCGTTGACTTATCCGTTAATATATCCGTTAATTAA TATAGGTTGGCATCGATGGTGCATTTAACAGTTTGACGATAGAAGGTACA ACTGAAGGACCAGATTTCAATGAATGTCTGCTCTCCTTTTGGAGTGGAGA CGATAACAGTGTTCTAGTAACAGGAAAGGATTTGGTcttgaattttcaat tgatGACGAATGAAGGTGCATCTATCACCCATTTCACTCTTTACTATGCA CAAACAATGCAGAATTGTGGAACCGAGCCTACTTGTGGGTTCGAAACAAC CGCATCTCCTCAAATAACAACTGAAGCTCCAGAACAAACGACTCAAGCTC CAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAA ACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCA AGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAG AACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACA ACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGC TCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGC AAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACT CAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCC AGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAA CAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAA GCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGA ACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAA CTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCT CCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACA AACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCC AAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCA GAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAAC CACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAG CTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAA CAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAAC TCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTC CAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAA ACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCA AGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAG AACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACA ACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGC TCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAAC AAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACC CAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCC AGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAA CAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAA GCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGA ACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCA CTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCT CCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACA AACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTC AAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCA GAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAAC AACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCANCTCCGCAACCCTAGTAAACTCC CCCCGCCCCCGGATGAGAATCTAGGTTTTTGAGGaaacttctcaagaaaa acaTCCAAACTCAGGCAACTGCGAACTAGAAATTGGCATATTTACTCCCT GATTTGACACCTGTATCCCTGATGCCAGATAATGAAAACTACAGATTGCT TTCCTCTATTATCTATCAGAAAGTATCAATGTCTCCAGTAGTTAGAAATC AAGTTTCGTACACCTTTATACTTTTTTATGGGTCAAATgggcccaaaaat caataaaaattgataaaaatccaCTAAAACGGACAATTTTAC

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_423:232675..236166+

>TCONS_00064741 ID=TCONS_00064741|Name=TCONS_00064741|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=5442bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_423:232675..236166+ (Clytia hemisphaerica)
TTCATTACAAATTATAATTCCTTGTTTCAGATTGGCATTGAAGGATTATT
CACCGATTTTCAACTCGAAAATTCACTCGAAGGACCTGAAGTCACCGATT
GTGTTCTGTCTTTCTGGAGTTCCTCAGAAAACAATCTTTTGACAGCATCA
ACCGACTTTGAACTGAAATATACTTTAACGTACGAACCCCAACAAAGACC
TTTCCCACAGGTCACTTTTGTACAATTCCTTTACGCTCAAACAAACCAAC
GTTGTGGAACAGAACCCGAATGTCCTGAACAACCACACACCACCATAGAG
CCTCCACTACCAGGAGAACTTACCACACCAGCTCCTGGTCCTCAATGCGG
TCCCCTTCTCTCCAATTTGAATCGAACATCCACAGGATTGACAGGAACTG
TCACCTTCCCTATCTCATCGAATGCTTCAACTTGGTATTTGAAGGTTGGC
ATCGATGGTGCATTTAACAGTTTGACGATAGAAGGTACAACTGAAGGACC
AGATTTCAATGAATGTCTGCTCTCCTTTTGGAGTGGAGACGATAACAGTG
TTCTAGTAACAGGAAAGGATTTGGTcttgaattttcaattgatGACGAAT
GAAGGTGCATCTATCACCCATTTCACTCTTTACTATGCACAAACAATGCA
GAATTGTGGAACCGAGCCTACTTGTGGGTTCGAAACAACCGCATCTCCTC
AAATAACAACTGAAGCTCCAGAACAAACGACTCAAGCTCCAGAACAAACA
ACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGC
TCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGC
AAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACT
CAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCC
AGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAA
CAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAA
GCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGA
ACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAA
CTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCT
CCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACA
AACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCC
AAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCA
GAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAAC
CACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAG
CTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAA
CAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAAC
TCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTC
CAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAA
ACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCA
AGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAG
AACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACA
ACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGC
TCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAAC
AAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACC
CAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCC
AGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAA
CAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAA
GCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGA
ACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCA
CTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCT
CCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACA
AACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTC
AAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCA
GAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAAC
AACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAG
CTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAG
CAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCAC
TCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTC
CAGAACAAACAACTCANCTCCGCAACCCTAGTAAACTCCCCCCGCCCCCG
GATGAGAATCTAGGTTTTTGATTCATTACAAATTATAATTCCTTGTTTCA
GATTGGCATTGAAGGATTATTCACCGATTTTCAACTCGAAAATTCACTCG
AAGGACCTGAAGTCACCGATTGTGTTCTGTCTTTCTGGAGTTCCTCAGAA
AACAATCTTTTGACAGCATCAACCGACTTTGAACTGAAATATACTTTAAC
GTACGAACCCCAACAAAGACCTTTCCCACAGGTCACTTTTGTACAATTCC
TTTACGCTCAAACAAACCAACGTTGTGGAACAGAACCCGAATGTCCTGAA
CAACCACACACCACCATAGAGCCTCCACTACCAGGAGAACTTACCACACC
AGCTCCTGGTCCTCAATGCGGTCCCCTTCTCTCCAATTTGAATCGAACAT
CCACAGGATTGACAGGAACTGTCACCTTCCCTATCTCATCGAATGCTTCA
ACTTGGTATTTGAAGGTTGGCATCGATGGTGCATTTAACAGTTTGACGAT
AGAAGGTACAACTGAAGGACCAGATTTCAATGAATGTCTGCTCTCCTTTT
GGAGTGGAGACGATAACAGTGTTCTAGTAACAGGAAAGGATTTGGTcttg
aattttcaattgatGACGAATGAAGGTGCATCTATCACCCATTTCACTCT
TTACTATGCACAAACAATGCAGAATTGTGGAACCGAGCCTACTTGTGGGT
TCGAAACAACCGCATCTCCTCAAATAACAACTGAAGCTCCAGAACAAACG
ACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGC
TCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAAC
AAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACT
CAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCC
AGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAA
CAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAA
GCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGA
ACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAA
CTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCT
CCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCA
AACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTC
AAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCA
GAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAAC
AACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAG
CTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAA
CAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAAC
TCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTC
CAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAA
ACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCA
AGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAG
AACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACC
ACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGC
TCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAAC
AAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACT
CAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCC
AGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAA
CCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAA
GCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGA
ACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAA
CACAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCT
CCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACA
AACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCC
AAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCA
GAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAAC
AACCCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCAAG
CTCCAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTCCAGAA
CAAACCACTCAAGCTCCAGAGCAAACAACACAAGCTCCAGAACAAACCAC
TCAAGCTCCAGAACAAACCACTCAAGCTCCAGAACAAACAACCCAAGCTC
CAGAACAAACAACTCAAGCTCCAGAACAAACAACTCANCTCCGCAACCCT
AGTAAACTCCCCCCGCCCCCGGATGAGAATCTAGGTTTTTGA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040604XLOC_040604Clytia hemisphaericagene
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064741-proteinTCONS_00064741-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064741-exon-scaffold_423-1491911889:232675..233119TCONS_00064741-exon-scaffold_423-1491911889:232675..233119Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00064741-exon-scaffold_423-1510915933:232675..233119TCONS_00064741-exon-scaffold_423-1510915933:232675..233119Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00064741-exon-scaffold_423-1575043694:232675..233119TCONS_00064741-exon-scaffold_423-1575043694:232675..233119Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00064741-exon-scaffold_423-1491911889:233630..236166TCONS_00064741-exon-scaffold_423-1491911889:233630..236166Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00064741-exon-scaffold_423-1510915933:233630..236166TCONS_00064741-exon-scaffold_423-1510915933:233630..236166Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00064741-exon-scaffold_423-1575043694:233630..236166TCONS_00064741-exon-scaffold_423-1575043694:233630..236166Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_423supercontigscaffold_423:232675..236166 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.140734 0.199619 0.188318 0.127551 0.258801 0.122705 0.690845 0.816151 0.183281 0.360567 0.298127 0.374912 0.289302 0.229751 0.217946 0.226093 11.2468 13.0928 0.44881 0.341562 44.705 44.1843 62.1247 65.3758 67.2257 83.7069 0.0701724 0.14978 0.42601 0.332762
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00064741 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top