|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00064542 ID=TCONS_00064542|Name=TCONS_00064542|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=852bp
CTGGAATATCTTGTACACGTCACCAAGAACAACagaaaacaaacaacaaa
acacAAAGAAACAAACTGAAAAACAAAGTGATTAAGAAAATATGTCAGTT
GTCACAGCAAGCATGCGTAGTAACCATGTTGGAGGGCCACAAGGAAAAGG
AAGCCTTAGTTCGCCTACTATAGACTATGTTGCTAATAAAAAGCGAAAAG
AAGAAGGTTACCAGGGTCTACCGGCTAACGGCAAATCTGCCAACGATTCG
CTAGTGGACCACTCTACCTCTCCTTCGCATCAAAGTCATGATAAAGACAC
ACAAGGACTCAACAGTTGTTCTACGTCACAAAACCCTGTTACTACTAGCA
ACCAAGAAAGCGTCATAAATCATAATGGCCTACCAGCTATGAGTAATCCA
AACCATTATAATTCAATGGGGAATGGAGGGACTACGGCAGGCCAATACCC
GCCGACTAATGGTCCTGTCGACTCTACTGGGCCGCTTCCCAATGAGATTT
TCGAGCTCTTGAATGAGTTTTGGCGCCCAAACGAAATGGTTGCGCCTTCT
GATACTCATATGATGAATGGAAAGTTCACAAGAAGAAGTCCCGATGGATC
TTTGGATGATACCGTAGAAGAAGAAAAAGATGGTGAAGATGACATTACGT
CACTGGCAGACGCCGACATCGGAGTTGATCGTACTACGCAGAAACGTCGA
TATAGCCGACTGTCGGATGGTTATGAACGTTTAAAGTCAGTTTTACCAAC
CGTCAAAGATAAACGTCGTGTATCAAAAGCACGAATATTAGATGAAGCTA
TCAATTACATTCAAAGGTTGGAATCGATCACGAGTGTACTCAAACGAGAA
CA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_419:118387..135575+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00064542 ID=TCONS_00064542|Name=TCONS_00064542|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17189bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_419:118387..135575+ (Clytia hemisphaerica)
CTGGAATATCTTGTACACGTCACCAAGAACAACagaaaacaaacaacaaa
acacAAAGAAACAAACTGAAAAACAAAGTGATTAAGAAAATATGTCAGTT
GTCACAGCAAGCATGCGTAGTAACCATGTTGGAGGGCCACAAGGAAAAGG
AAGCCTTAGTTCGCCTACTATAGACTATGTTGCTAATAAAAAGCGAAAAG
AAGAAGGTTACCAGGGTCTACCGGCTAACGGCAAATCTGCCAACGATTCG
CTAGTGGACCACTCTACCTCTCCTTCGCATCAAAGTCATGATAAAGACAC
ACAAGGACTCAACAGTTGTTCTACGTCACAAAACCCTGTTACTACTAGCA
ACCAAGAAAGCGTCATAAATCATAATGGCCTACCAGCTATGAGTAATCCA
AACCATTATAATTCAATGGGGAATGGAGGGACTACGGCAGGCCAATACCC
GCCGACTAATGGTCCTGTCGACTCTACTGGGCCGCTTCCCAATGAGATTT
TCGAGCTCTTGAATGAGTTTTGGCGCCCAAACGAAATGGTTGCGCCTTCT
GATACTCATATGATGAATGGAAAGTTCACAAGAAGAAGTCCCGATGGATC
TTTGGATGATACCGTAGAAGAAGAAAAAGGTGAGtgtaaaacctttttta
aacattttatgGATACTTTCAGGAGCCCCCAgtggttttcgtgatggcgt
gattggcgtttttcaagttcgtgatttcgtgatttaaaattttaaaagtg
tgtgattgcgtgatcggaggaaccaacgtgatcaacgtgatcgtgataga
atggaaatttaactcgtgataacatgattttaaaacttttttgcgtgatt
gtgtggttgcgtgatttgaaaggtgacGGGGGCAGGGCTCTTCCATATAC
GACACCACATAGTGGTTAGTTATGATGGGGTCCTTTATGGATagaaaaat
tcttgacgcggtctggcgaaattccgtaatctaaacctctCAGATGTAGA
GTTAACTTTCCCGACCTTCATAACTTTCgcgtgtctgaaaaaaagaatta
tgtCACACGCCAGATAAAATAAAAGCTAGTAACACAAATATCATAAATTA
ATCCCAAAGGGCTTTGCACTATAAAAGGACTTGTACATTACTGATGATTT
CTTTTTACGTGATTACGGGGTTACTTTTAAGTCAAGGGGGTCAATGCTTA
GATTCGAACTGCAGAATGATTCGAATTAACAGCGtctcgaattatagaga
gttcTTTCGAAGTCCACCATTTTCGGATATTTTAAGATAGAACCTCTTGC
ACCTTCTAAACTACCACGGTTGTATCCGAAACGCTCGATGAGGTTTCCCA
GCAGATTACTAAGATTGAATTTCCCACGCACGTTAAAACACATTTTTTCT
ACGAAAAAAGAGTTAATCTTTTCCTGACAATCATTCCGCAGGCGATATTT
GGCGTAGGTTTAAAGGTGGGATTTTTTTCTTCACATTTTCTCACTTTTGA
TAGCGAAGAGGGCTTTTAATACCATCGTTAGAGTATTAAAGTGAATACAT
TATGAAGCAATACGACTGTAAAAATGTTTTGTATTTAAGTGTATTTTCAA
TGGCGCTGAAATGCTGCAAGAGTTGGTAATTGATGCAGACACAGGCCTTA
TTagaaaaaaatacctttttttgAGGAGCTTAAATTTTCGGTTCAGGTCG
CCCTAAAAAACAGGAAAATCTAGAGAGCCTCTTAATATAGGGCAACAATG
TAAAGAAGATCTTTGGAATCTAGACGGAAATCCAGCGGGGTACCTCATAA
ATATGCCTAAAATCCAAGAGGGGTATTAAAATTTTAGGCGAGAGTCCAAG
GatttgaattttcaataaatgatCTTCTCGTCAGGGGGGAGGGTACAATC
TCTTTTCTTAAATTGTCAAATGGAAATATTGTACGTACCACCTCTGTTTA
TTACCTCCCTGGAGACCACGCTTCCTCCCTCATCAGCATGGGGTAAAAGG
ACTAATTCTGGAATAGTCCCTTTCAGTTTAACCATATATAGCCTTAAACT
TAAGTCTGTAAAGCTCGTGTAACCGCCCTAATTTCTTATCTTATCgtttc
ttaggaaaatatacaaaaataccACCAATATGAGAACATTTAAGAACACT
TTCAGGCTTAAAACCTAAAGAGtttagaacatccgaaggcttcaaaactt
ttgcatgttcttatgaaaaatcatGTAGAATACATTAAGATTTGAATCAC
AGTATCTTCCCACTGATACCATAaagtataaaaaagaaaaggatttaaaa
gttcttttcatcacattttcttctttgttaGCTTTAGGAAGGGTATGTAT
GCCAATGAGTATATTTTTTGGTATAGTTAGACTATATACTTCACTGTATT
TAACTCGATCTTCAAGTGACCAAGAAATTTTTTCCAGGAAGTCGAAGATT
CTAATTAGGGGGAGTATTTCGTACCACTCTACAGTTTAGGGTACTAATGT
TTTACTGTAGTTGTTATTGCAGCTAAGtaaatttcgtattttttttGGTA
CTATGAggctgaaattgttcttatcatgttcttaattttaggGCAAGATT
ATTATATTTTAGGCTTTGTACTTGATTTTTACTTCTTCGTCCCTGAAATT
GCCACATCAATTTTAGGCTCAGTATTTTCCCTATTTTTTGACGATTTCGT
GCATCATTGTTCTAAAAAAAGAGTGTGCCTGCATCTTTCGTATAATTTCA
ACTTTGCAAAAAATCttcaagctttgaaaatttgtaatctGACTCGGTAT
AAAGAGGCttcttattttaaaatattaatTCCCATCTAAAAAGGTATTTT
AAAGGAATGTGTGAATGAGCGGTTAGGTTTGAAAATAATGTTTGAAGGGA
TTTGATAGGAATTTTCTGTGTCATATCATATTTCGCTACTTCGTTGGTTT
TTTCTTTAGCTTTTGGTCATAGAATTCAGGGtcttttcctttgttctttt
tggGTATATTTTACCGATAGCAGGACCAATAGGTCAATTTCTTTTGCCAC
AGGGTAGAATTGTGACAGTGTGCGAATGTCTAATGATAGTTGTACCATCC
TTAAGAAAGTCGAGCCTACGGAGTCCCTCTAAATTCTCTATAGAGTGTAa
tatttcttcaaaagtaaataataATCAAGAGAACTTTATCCCTTCACTca
aaaaaatgtcggggaaagCAAACAGATCCATAACACATTAAATTTTATCG
ACTAGTCATCATATAAAATCTGTTCtttaatgttttaaatttcataaaat
tccttCATATTAATAATTGATATGTTGGAACTACAAAcgcttttaaaaat
attgattaGATTTATTATAAGANCTCATATTCATAATTGATATGTTGGAA
CTACAAAcgcttttaaaaatattgattagatttattataagaataagatc
ccaagattttttttaattttcttgctAAAAAATGCCGGTAGGGCCAGTTA
AAACAAGACTTTAGGCATCAAGAAAGTTACTACTAAGCGCATTTTTGACA
CaattcataaaaatttatttcaagaaaacttTTCCGCAAAAACATCGAAA
TCCATTACTTTTAGCGGTGATCGGGGATATTTTCAGTGACTCGCTTGTTA
TTTGCACAACGACAtattattttcatgaaaaatatgaaattggtATTCAT
TTCTTGGGGGAAATACCAGTTTTATCCTAGCGTTATACTTATTGGTTCAT
TAAAATCTAAGTACAATACCCTTTTAACAAGAGAGATCCAATCAAAATGT
AACTTGTTTCTAAGTTATACATTTCTTGTTTTGGATGAGGATATTGTTTT
TCCGACAGCGGATATCTTCCATGGAGAACTAAATTAGACAGTATTGTTTT
GAAAGCTTGAAGGAAGCATGACGGGGTTTACGGCTCGGAGGTCTTACTTC
AATTTCTTACCGTAGTGAGCCAATTCTTAGTGTCGTCAAATGATTGATTA
TATCCGTTATCTGTAGTTATAAATTTTTGTTATCTCTGAAATTTGCCGAG
CCGAAATGCATGGATATTCAACACACTCAGAATTTTCGCCTTTTTTTACT
CGAAGAAATGAAACTGAAGCTATCTTTATTAAgcgaaagtttgaaaaatt
cagATATTTTTCTTAGTTCTTCTATAGTTTGTATTCTGATAGTAAATAGT
AGGTTTTCGCCAAATGTATCAGGCCTTTGAAAACTTAGACTAACACAATG
TCGTTTTGGAAATCTTCTTATCTAGCTGGAAGTATTTGAATGATATTTTT
GGAAGGGGATTGTCAAATTTCTCTGCTATCTACAAGCATCAAAGCTGTTG
AATTATTTAAAGGTGTGCCAGAAACGCTGAAATTATCGTACGCAGTGGAA
AAATACACTTAACATCCAGTGTGAATTCCCAGAAGTACATTGTTACTCAG
TGATGATGAGAGCTCACTGAATACAATATGCCTCTGAACTTTTGaactat
aaacaaaaaatagtaATTGGAGAACCCTGATCATAAAACGGTGATTTTCC
ATCCAAATAACTCATTTTATCCCAATTCGGTAAATTTTTCTCACCGGAta
actgagacaggggtgttaaattAATtgttagaaattgaaaattgctcCCA
AATCAAACGACGTCTAGACTTCGTAATGAACCTCTTGACTTCTTCAACTT
CACTCATTTTCAGGCAAGATTTTGAAATACTACTTTACCACTCCTGTATC
GATGATAAAGGGTAAGTAAGAGGGTACATCTAAAACACGAATTACTTAAT
AAAGAGAAGATATATAGCTGGTGGCTTTATTTTGTCAAAGTTTAAATTCC
AGTGTTCTTAAAGCTCACATACTTGTGTGAACCATAGCAGGTGCTCAAAA
AATAAAGTcgagagattttttttcttttactgtaCACAAGATCAGAGGGA
AGGCATATGCAATAGTCTTCTTTATCTTTTAAGACCTTAAGATCGGCGGA
AGTCAAATCTAAGTGTATCGGACAAGAAAAGGTATGCACCCTCTCTTGCC
ATAATTTGCTTTAAATACCCTTGAGTATTTCAATTTCTTGAGTCACATTT
TCAAGAGGCAACAGTCGAGACCGAATAGCATGGATGGTTATATGCCCATA
TAGATCGAGAAGTTAACAATGTTTTATAATTTCAACCTCAGATTATCATA
AGTATTAGAGACATGTGTTAAAATCAGTAACGAGCTTATGATCTTGCGTT
TTTCTCTCTCGTTTAGAAGAGTTTGACTTAAGAAGGCTTAAACAGATAGC
CTTCAACCTCATAAAATAAATCTCTCTGTGTCTTCTCTGACATTCTTTGA
GAAGTCGATCTTATAAGAAAATGCACGGTTTtattataagaatggtgttt
tttcatttcatcatgaatattcttaactttttggcgaaaatcatccaaaa
atattcttacggtattcttaggttaagatcgaaattggcaatctacaggt
taaaatgcattaaaaatggcatttcttAGATTTAgtttgctaaattccat
gatggtgatattcttaccatattcttaattttttggccattttcatcatg
gacattcttataaagtgtattcttataaaaaaagcgtgtagactGTTCCA
GTGACCAGTGCTTTCTTACTTTCTTCTTcgtaaagatatttttcttaata
tgggtgttgaataaaaaaacagttGAGTCTCTATAACTTGTATTACTCaa
aatgtctccttaattcgaacaagttttcttgaCCCTTCAATCAGTTaaca
ataaatttataaatcagtgtccataactcgaaatttccatcATTTGAACA
AATTTGAAATCGCCGAACGTTTGAgttatcatgaacatataaacgactgg
acgtctatcttttattgtctctttgaagcgagcttcgttgccgcctgtat
ttcaaaattggtatgaaaaatccgaaaatattccgtcataattttaaaag
attgatagagcttgaacattactcataataatatgtaatatattttatca
acattttcaagtctgaaatgcagaatttcaactgcgtgtatacttttgaa
tatcccttttgtcactccaataattttttttatgacttgaaaaaaatagc
ttgccaaagttgagagcctgtgtaataagaatatcgaaattagaatgcga
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNttagacacttttaagtcaaaatttagaaat
attagtcggagttttgacaagctaacgatgattttgcctctgttatcttt
gttatgatatagataaacgaattgagaagagtagaacaacagagactttt
gtcgaagttttgacgttgttagcaaggtattcccaagtgttatatcatca
aaatctattgtttcattttatgcttttaacgaggcggcaacgaagctagc
agccttttctacaaaaagacaaaggagatggatgtccagtcgtttatatg
ttcatggagttatggagactttattgtaccaattttggaaaaatgttgtC
CAAGTCTGCcccattgggctattccataaaatctttttttttttttaagt
tacctccctggattttttttccaatttttcaggacccccttggatttttt
tctcccatttcttTGGAGTGGTCCAAAGATTTTCGAActgattttactga
ccaccctggattttcaacctgattttactgaccaccctggattttatcAT
TCACAAAACCAGACCaacctgaatttttttattttccagaccaacctgga
cgtcacacctcctcaacatagggggtacagactatttctgaaATAGCCCA
ATTTCGACTACTGCGTGGTACATTTTCAACTGATAAATTGAACTTTTAAT
GTAAATCTTACTACCATTTTACGGGGCAAATTTCTATACTGATAAACTTT
TTTGTAAGCGAAGCGttcgaatgttcttaatgttctgaaaatgttcttgt
ttttaccattttgtaacattttgtaagtattattgttcattttcctgaga
aattgagtgttttaaagccttgaaatgttcttaaaacttgttcttaatat
tttgccaTCAAAACCTTAATGTTCTTGTATAggttattctcataaaaaat
gtgtatcccGAAAATGTGGGACAAATTTCTTAACTAATATCCTAAAGTAG
CAAAAAAACTTGAGGCTTGGAGTACTAAGCAATCCACTTTCTTTTTCCAT
CTTTTTGCATCTGTCTTCTTCACAGTGATGTGCCAAGAAATATTTTCACG
ATACAATCCTAAATATGTCTTCAAAAACCAACACAcgagaaaacaaaaga
acacTTTGAAGGGAAAGAATGTCTACTGAAGACGCACTAGAGGGAAgaaa
tctctctttctctttCGCGGGGCCTGACCGACAACCTTGTTTTATGGAGC
TCTTGATTTTTGAAGTAATGGtttaaattgatgtttttgaaTATGCCTGT
ATTTTTCAGTAATCGCCGAAGCCGATAGTTAGAAAAAACACCTGGAGATA
ATATGAGAGAGTCTACGATGTAGTTTATAGATGAGGGGAATGCTTGAACG
GTGTTTATAGTTTATAGATGAAGGAAAAGGCTTGAACGATGTATATTATT
GTCTCAGACGTATTCAGTATCGGAACGGTGTCAGGCTCCTCAGGTTTTGT
TTTGCGGTTTTAATGCTAGGTTTAGGCTCTATACATCGGTTTATTTTTAT
ATATGTAGAGTTAAGGCTCTAGACAGACTATGATGCACAATCTGCTTCTT
CTGACAACTTGCCACCTGTTGCGATTGTTTTAATGACTGTTTGTCTGAAG
TCTAAGTTCACATATACAGTAAATAATTGAATATATGAAAATTTGGAGAT
ATTCGAGATCCTCTTTCTTTTTGCTTAAGCAATTGTCGCTCATTGACCTG
GTATACACTGAAGGATGGAAAATCTCTTACTACacgttttctaaaaaaat
attagtTGGGAGTCTGTAAAAGGTCCCGTCGGAAAAAAGGGTGGTATGGA
ATCTGTGACTGTGTTTTATAATCTGTTGAAGGATGGAAGACCTCTTGCTC
TTAACGGTGGGGATAGTTTCTGAAAATCTCGCTGGAATGGTGTCCTTTCA
GATCTGTGAACTGTGGTGCAGTGGTGCAGGGGTGTCCTGATAAAACAATT
GTTTCCGTTTAGTGCATATTGCTAGGAGCAGAAAAACCTTTTGATTgttg
taaaaattattttgtttggcTGTTTGTTGGGATAATTGTTTACGTATTTA
TCTTATCTATTATCTAAAAATTCATTCTTTATTTATaatgttttaagaaa
aaaggaaagaaaaaaaaagacaaccTCAAATGTTTGTcttaaaattcttt
ttgttgATTGTCCCTTTCAATGGGGtcttcaaaagaaaatgttttcggAG
TGAAGATTGACTTGGAAATTCAAAAAGACTTCTTTATATCTTCATCAAAA
TAACATGACTTTTCGACAATGGATTCATTTCGATCTATTGAAACTCAAGA
GGTCtttcaaaccaaataaaattcttttggaaaattttcgtgACCAATGA
TATAAAAGTTCAATACGAGTAAATCCGTTGACTTGGCTTGACTTAAATGG
GTGTGATTTTATATGTTGATATATTTACTTTTTCATATTATCTGATGATT
TCGGTGATATAAAGCATATATTTCCACCCTCTATGCTAACGTTTATCTTT
TGTTTGCGCTTGGCATTGTGAATGAATACGATAAAAATCATCGGAAATTT
GGGACGGTAATTCTGGAGAGCTGGCCGAGATGAATTTTTCGATAACATTG
AATGGTTTCAGACCACCTGCACCTCCGAAATCGTTACCCTTTTAGATTAG
CTAAGACTTTTTTAGTCTAACAGTGTTTATTTTTGCCAGGCCGGTTAATT
CCAAGAAAGGTTTTTGCTAGTACGATAAGACCGCTGTTGAAGTTAATCAA
tatcaattaatttttttataaagtacTTTGGTGCACCTTATTTTCATGAA
AACTTCAGAATCGAGTTATTATTATACGAGCAGATCTTAGTTAATACGCA
AACTTCTTAAAAGATTATTATCGCATTTACTGAATCCTAGAGCAGAGCGC
AGTGTTGGTAGAATGGGTGAGATTAATCGCTTTATTTAAATGTTAAACCT
TAAGTATCGATTTTGCACCCTTTGTACTTTCTCTTTCACATGATTCCCAC
GGAAAATAATCTTAATTTTCGGCATCATTTACAGGAGTACAGGGGTTCAA
CAATCCCACTGTTTTATCACTCTCTTCAATGTCTCTGTGAATccctttct
ttttattcttcttctttcactactgtaaaaaaaggattttttttctgttt
gcGGTTTTCTAAATCTCATCCGCTTGGAGTGGTCATGTACTCTGCATGTG
TTTTCTCTCgaagaacaagaagaagaagataaaGACGATCCCTGAAGATG
AGAGgataaaagaatttttattatgcatgaaatcaaaatgaaaagaaaag
aaaaccacATAAAAAACACAGTATGAAATTATATACCAGGCCTTCTGTTA
TTGACATGCATTGGTTACTGTGTCGTGTTCTAAACTCGCCATCATACAGG
TTAGATTGCTGTTTCGGACACCCAGTGGCGTTGGATGAGTGACAGGTGGT
AGGGATATGAAGATAGTGCCCcttgcaccactttttgatttacTAATTGA
CGTCTTACAacaaaccccgggggggggggcactcaaggtaaatgaccaga
cgttcggcccttaagggtaggtttttcatagttcagctagtgcactgtaa
gggtaggaaattacaaaactgtactaaactgcactgtaagggtaggaaat
tgtgataaaaggccaattttttggtaaaattggcacaaaatcggacaatt
ttgaaggaaaaattccacatttacttggaaaattgcaaaaattttcgccc
ttacgggcgggaaattttgaaaaagtgcactgtaatggtatgatttttca
tgcaaattcactgcactgtaagggtccgattttagaaggcaaattttggg
ccgaacgaatggtcgttttcagatcgagtgcccccccgggcAACAAACCT
TTCGTTAGTGCTATCCGAATCATGAAAAAGTGACATAAGTAGGTCGTGTT
ATTCAGTTAGCCGGTTAGTCGATTGTTTCCCAGGGGTCCACAGCCAGCTG
ACTCAGAACTGAATGGACCATGGAAAGAGTTGGGGGGAGGGTTTGAACCA
GGAGCCTTTTGTGGCACTGACAGCGCAGATCACTCAGCCATCGCTTTTCA
TACATAATGGAAATAAAAGGGGGTTTCATTAGGTTTGTGTATTTGCTACA
TAATGTCTGTCATTTTTGTCTGTAAATTTCGAATTCTTTGATCAAAACTT
TTCATCGATTTGCTCTTTGGCAAAATTCCATAAAATGTCCTATTGAACTT
ACAATTCTAAATTTGTCAGTATTGGTGGGATTTATTACTTTATCACAGTG
TGGTTCAAAGTTTATGCGCACAGCTAACGTCAAAAGTAAATGGTAGGACA
CTCTATAGGGAAAATTTTTATGTTTCGAAAACATCTGCCTTTGTTGTTGT
GGAAAGAGGTCTGTTTGTCGTCCGTCCTCTTtatattctttttctttctt
ctttttaactctttcgactttctttttatgtttttatgtttttgttttta
tatttatatatcaCGAATCACGACCATCGTCATCGCTTTTTTGGTAGTGA
CGAACCGATAACTGTTGCTATGTTTTATTGGTGTCGGTGTCGATTTTACT
TTGTTTGGCAATGTTTACACCCTGGTGACCTAATGAGGATTTTTACAATC
AGTGACAATACAGGAGCTAAATATGATGATTTGGGGTCAAAAATACTGTA
TACTCCGAAAAGATTCTGATAACTCCGCGTATGGCACGTATTACTCTGAA
GACTAAGGCTGAGCTTAAAGAAAAAACGATGgcaccaaaaaacgtcaatc
ttaaacataaacattagaacGCAGACGTTTTGGCTTTCCAGGTCAATGAA
AATTACAGTGACTTtccataagaacaatttcagaaCATTGTTCTCACCTG
ACAAGATTTCTGGCATAATTTCGCGATTAGATAGAATCGGTATTTTTACG
TTGATAGGCAAGTTATCTAGGACTTTGAGACTAATTTTGTTACGGGGTCT
CTACAGCCTGGGATTAGTATTGATTAGTTTAGATTGCAATCAATGATCAG
TTTTATCGATGTGACGGTTTTTTGTCCGAGTGAATAAAAAAGTTCACTTT
AAATTCTGAGCACGTGTCAGCAGAAGTTGCCATCGTCAGTTCACTTAATC
CTTAAGAAGAAGATTTCGATTTTAAATCTCTTTACTCCTGTGGCCTGCCT
CATTCTTTGTTATGTGTAGGTGAAGGAACGGACGAAAATAAATTCCAACA
AATGTCGAAATTCACATCCCTTTGTTCCTCTTTTGTACGCATGGGAAAAT
TTATGCttgttcatgtttttttttctttctctctctAAACGGAGATAGCT
TTTCACATGGGAGAATATTTTGTGATATTGGACTGATTTGTAAATacaga
ttgtgtttgttttggttgggttgttttttttatttgtaaatttgGTAATC
TGGTTGTTCATTATGTGTTAATGATATAATGAAGGGAATCAGTTCTTGTG
AAACTTCATTGGCAGCTTTTTGTTGGTACGGTGTTGGTACGGTGGAATCT
GTATAACTCGAAGACTCATGGGGGACACAAATTCGTTCGAATTATGGAAT
AGGGTTTGTTAAAGACAAGCTAATTTGTTGAGGAGgcatttgagttatag
aggttcacGTTAAAGAGTTTTCACTGTATTTTGTTCTGAAGGAATAAGTT
acttttttagcttttctcATCATGATCTTTATTTGTAAATTGGAGGAATA
CATGGGGTAAAACATAAACCCCTTCCGCTAGTGCTTCGcgtaatggattt
ttttgtGGGCGATTTTTTTGGTaccaattcttttgttttatttcgtAGTT
TGGGCTTTTTGTCACAATTTATTGCATGATAGCAAATGTTGCTAATTTTA
GTGATTGTAATGAGTGAAAAGATTTGATGAGATGTGATTGCATGATGGTG
GCATGACGATCCAGGTCTTCTTGcaatttctcaatttcttaaggTTTGTA
TGTATATTAACTATGAGATGTTTTTCTACGTCACcattttagtaattttt
caaaattttccaaaatttagaCAGATAAATTAGACAGATAAATTGAGAAA
TTACGTTGTCGCGTGAaaaatatgtattatatatttttgtcGTGAAAAAC
ACATCAGAAAGATCAAAGTGAGCCGCTTTTTTTAACTGTTACAAATAAGA
AGGGGGcgaaagagaaaaaaagtatGAATCAGAAAATTTGAGGGGTGAGA
AAAACTCCTTTTGTTCTACATGGCTTTATTGATTTTGTAagaacgctttt
ctttataagataaattcgaaacattttttttgaaacacctgATAGCTTAT
CTATATTTTATAAGATCGTTATTATACATTGTCAATGTCTTTTAGCATTT
CTATTgtcaattttaaatttgttaCAGCGTACAGAAATTCAAATTTAGCG
AtatattttgtgaaaaatgttAGAATGGTTCAAGACTACACCTTAACTTT
GTTAATTTGTTGGAAGGATAATACAGAGTGGGATTACTCTTCTTTTGTTA
GAAATTGAattatgaagatgaaaaatgaagaggaAGAGAAGATTTTTAGc
gtatttaaatttaaatttctatTCTCTTTCCTTGATGGATTAATAGAAAA
TCATGTTAGATTAGGGTTCTTTTTGCCAAATTAGCCAGTTTTAAGCCTAG
TTTGAAGCAATATAtgaaaaacatacaaaaagtgTTCATACTTTGAGATC
TTGGACTTTAAAagtagttcttataaaattaaaaaaaaaacaagagctGA
GAGCACTCCAATCCAGTGACCGTACACTGTTTCAATCTTCAGAATCTTTC
ACTGTTTCTCCTTACAtcatattctttttttcttttttttatcttcatca
cttttttatcttctttctCTTTTGTTGTGTGAAGTGTACAACAAAAGCAG
TTGATGAAGTTTTAATCAGTTCACACATTTAGGTCAGGTGTTAGGTCATT
AAAAATTCATTAAGTATATTTCTTACTACATCAACAGCCACCTTTTATAC
AGCTTATTcttcttttgctttttttgaaaaacttttccgTTTTGTTGTCG
TTGCACCTGAGCCTTTTTATCACCTCTCTATTATTCGTtgtcttcttcat
cttcttcttcatcttcaggttcaagagaaaaagtattcttttttcactca
ttttcatTCATGGATTTCTTGTTTTATATcgcttttgtctttttttttaa
acttctcAATTTGATCTTTGTTGTCCATTTCCCTTCTTCGACAAGGGATC
TCTCATAACCCCCAATCATTACCACAAAaactttttctattatttttttt
atttgcgtTTTTGCGGTGAAAACAAGATTATTACGCTGTTTTTGGTCCAT
CTGCACAGATCTCTAAAAAAACCAAGCTGTAAACCTTTGACTGTGTATTT
GCTGGTCTTTAGTAGGTTCATGGTACAAGATTTTGTTCTTTACTCTTTTT
TGGCTTCTTAACATACCGGGAAGCTTAGTTTTTTAGTTTGGCTTAGTTAC
AAAAGAGTGTGATAAGCTGCTGTCATCATTTTTTATCCCTATCTCATTGT
CACAGATTATTGGAAGCCCAAGTTTTAAACTTACGGGCGCAGtttttcaa
aagcaaaaatgcTAAGGGGTTTTTGAATGTGTTTCATCAAACCGGGATTA
AGCAATACTTTTTACTAGTTAATCCATTGGGTTTTTTAGCTTGATCGTTC
ATCGGGGCTCGAAATTTATCTTTCAATTAATTCATTGATCCagtattaaa
aaactttttttgtagTTCAGTGTCATGCTgcagaatttatttattattaa
aattcaggaaaaattaaaaaaaatccacGTTTTTGTTGGATTAATTGTTT
GGTATTGGTggaataattcaaaaaataaaacaaaatagatATAATATAAT
CTGACTGCagtaaaaaaatgaaagaattatcATTGACACCTGATTCGTTG
CTAGGTAAGTAAAATAACAACttatattttttgtacaatgtATACGATTT
CTAATGACCAACTGCGCTAAACTAAACTATAAGTTTAGAATATCACAGAT
TGGCCTCAATATCCAACCTGTCAGAGCATATATTACATAAAGCCTGGGAT
agacggggacgaggttggatGACTACCTAATGGAACAATTTTTCGACACa
gtacatttaaaaaaatgacgaCTGGCGGAAGatgaactttttttgaaaaa
caaaaagaaattaaaatgaagTAGTAGCGTAGTCACCAGacttgtaaatt
tttaatgtcTGATCAGAAATAACTTGATTATATTTGACCATCAAATTCCT
TCTTTGTGTTTTGTCAAACGATATTATGATACTGCAGGCGCGATAAGcag
cttttttacttttttacttcttttactatatttatttatttttactcCTG
TTGTTACACGAGATCAGATCAGTAGACATGGAGTATTTCATCTACTGTAT
TGTTCTTTTGATAAGTTTCGTTTTAACTTTCTTTCAATAACCATTTTCAG
GTGTAATATACTGACCTTGTACTGACTAACTCTTTTTCTAATCCTTTTCC
tgtatttcaaagaaaaagtaaaaaaaaaattataatttaaaaagttttag
atGGATTAATTTCAATCTACTTTTTGTTACTACTATGAANattatcattt
aaaaaagttttagatGGATTAATTTCAATCTACTTTTTGTTACTAATATG
AAGCACTAATCATCATTGAAATATTAGTCAATCTTAGTTGTTTTGACATG
TTGCAATTGATATCTTTTTTGGTGGTATTATGGATTTTGAATTAATGATA
CCTTTTGgtaaatgattttgttttacTTCTGTTTCTCTTTACTCTTCTTT
TAATTTGCAATTTTCACACCCAAGAAATAAAAAACACCGGCATTATTCTC
AACGTCACTTTTTCAGGTAAAGTGACTGATTTAAGCCATCATAGGCAACA
CAAGTGAATATcgtaaaaaatatattgtttttattgttttcctTTCCCCG
AAGCTTTTGATTGTTCAAGCGCCGAAATTCttttgtaatgtcacgtgacc
taggtcggatttcctacctaaccacggcacacttttcagagTTTCCACTG
TAAGAAAGTCTCCCAAGAGGTGTATTTAGTCAAAAATAGGCTCATGGCAT
GCGTGGATGGTAATGGTTGGTTTTTATGCCTTCCCAAGTACAacagaaag
taaaaaatatccGCACCATGCCCTCCCCCTGAAAGATACGAGAGTATATA
GAGGTATATATAAAAGCTTTTTTTGACTccgaaaaaattttaaaaaccct
GATGCTGCTCTTTCTATATTATATAAGCAATGGTGTTTTGGAAGGATGta
cttgattgaagaaaaacaaCTCAATAATAACATTTCAAAACTGAacgatt
tttttttatgttaacTGGACATTTTTTAGGCTGTTTAGagtactttttga
tttttttgatatcGGAATTTTTGTTATGTCTTACGTATGTGGATCGTGAT
ACAAAGGCTCAATTTACAAATCAACCCCATGAGTCCTTTAATTCCAGATT
TTTAAATTTCCCGATCTTTGATATAGAAAAAAACATCCTTTTGACAAGTA
TTAATATATTAAACGAAAGATGAAGAGAAAAATGCTTATATTAGATGCCT
TAGAAAAAAAGGTAGtcttatttcatttattttgatCGTATTTTTCCCAT
CTCTGCCAGAAAGTTCTAAAATACTACACGCACGGCCCTTTCCCAAAAGC
TGTACCAACGTCAACACAGTATATTGTCTTATTTGTGCATTCAGAAAGTT
CCAAATAGACTTCTCTTAACATTTTCTGATCTCAGCGTGACAGCAGTTTT
CTcaacgaaaattgaaaatacttaAAAGGGGGTAAAGCTGGTAAAAACAC
TTGCCTTATATACTCTTTTGGTTTTAAAAGAGCAACAAAAGGTCGATAAA
TCATGGTGTGACAATtgaaagttttcaagttttcatTTTCGTGGATACTA
CACTATGAAAACACATTGAAATGTTGAGCtttagaaaaaacttttgttac
AGACAAGGTAGATAGATTATTGACAAATAGTTGTTGATATATACCAAACT
CTTTTTTCGCGGAAAAGACTATGCAAAGTACGCGCCAAGTTATGCGCTTT
TAAGTTTTTAGAGTACGGTACATGCTATGTTTTCAGGTGCAAACGCAAAT
TTTGTACAATAATAACGCATCcataatgtctttcaaatcaCACTTACTAT
TGCAACGAAAACCTTTGCTCTCTAGGGTGCGAATTATTTTTAATGGCTTA
AccaaaaacacaacaaaaatcgGACCAAAATTAGTTTTACAGTTAACATC
GTTGCTTCGAGGCAAGATTTACATTGACACTACTTGGAAACGTTTGACCT
GttcaaattttacttttaaatacCAATCCACTTTTCTATTTAGATGGTGA
AGATGACATTACGTCACTGGCAGACGCCGACATCGGAGTTGATCGTACTA
CGCAGAAACGTCGATATAGCCGACTGTCGGATGGTTATGAACGTTTAAAG
TCAGTTTTACCAACCGTCAAAGATAAACGTCGTGTATCAAAAGCACGAAT
ATTAGATGAAGCTATCAATTACATTCAAAGGTTGGAATCGATCACGAGTG
TACTCAAACGAGAACACGGTATGNTTAGATGAAGCTATCAATTACATTCA
AAGGTTGGAATCGATCACGAGTGTACTCAAACGAGAACA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1491911889:118387..119015 | TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1491911889:118387..119015 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1510915933:118387..119015 | TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1510915933:118387..119015 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1575043694:118387..119015 | TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1575043694:118387..119015 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1491911889:135280..135458 | TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1491911889:135280..135458 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1510915933:135280..135458 | TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1510915933:135280..135458 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1575043694:135280..135458 | TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1575043694:135280..135458 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1491911889:135532..135575 | TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1491911889:135532..135575 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1510915933:135532..135575 | TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1510915933:135532..135575 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1575043694:135532..135575 | TCONS_00064542-exon-scaffold_419-1575043694:135532..135575 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_419 | supercontig | scaffold_419:118387..135575 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
