TCONS_00064541 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00064541
Unique NameTCONS_00064541
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length3496

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00064541 ID=TCONS_00064541|Name=TCONS_00064541|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3496bp
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Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00064541-protein

>TCONS_00064541-protein ID=TCONS_00064541-protein|Name=TCONS_00064541-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=498bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_419:100120..145991+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
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>TCONS_00064541 ID=TCONS_00064541|Name=TCONS_00064541|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=45872bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_419:100120..145991+ (Clytia hemisphaerica)
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Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_419:100120..145991+

>TCONS_00064541 ID=TCONS_00064541|Name=TCONS_00064541|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=5988bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_419:100120..145991+ (Clytia hemisphaerica)
ATGTCAGTTGTCACAGCAAGCATGCGTAGTAACCATGTTGGAGGGCCACA
AGGAAAAGGAAGCCTTAGTTCGCCTACTATAGACTATGTTGCTAATAAAA
AGCGAAAAGAAGAAGGTTACCAGGGTCTACCGGCTAACGGCAAATCTGCC
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CACTATGGGGTCAACAGGTGGGGGCGTGGCTGACCAATCATCACATATGG
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
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Position
The following features are aligned
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Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR011598bHLH_dom
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
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GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0046983 protein dimerization activity
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00064541 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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