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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00064420 ID=TCONS_00064420|Name=TCONS_00064420|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4107bp AAATTTTTCAGCGATGTCATACCTTCGTTAGCTTGACTTGGCCcagatgg aaaaaaatatataatcatattccgcggaatacaaaatataaaaaaaacat cattattccgcggaatagctattccggccggaacagctattccggttccg gcattccgTCGTTCCGCCGTTCAGCGTTTTGTCTATACCCCAAGTTTTAA TATAGATCCACACAGATATCTGTGTATAGATCGCGGTTAACATTGTTTAT CGGTTCCGTTCGTTCCGTCACGATTGGGAAGATGCGAACAGGAATTCAAT ATGGCGCATCCACGTGTCTGCTCTAAAAAGTTGGGAATTTCACTGGACCA AATTGATTGCCATTAAATGCACCATTTCTTTTTTAAGTATTGTACATTTT TCCAGACTTtcgaaaaatctttcttttttggttTACAACATGTTAGTGAG CCCGAAATTTGGCACAACTCAAAATATTATGTATATACTTTATTGATAGT GATTGAGTGTTTTTGTCCAATCCAATTTTGCTAATTATTCTAaaacagtt acctagagacaagatgatttattaaatttttcttgagggaaagtaatgta tgtggagtaatttgttattcaatagaccgtCACGTTCTCATCCTAAACAC AATCACTATAGCAAATTTATAAAACACTGattgaatgaaattttctacAT AAATTTTTGGTGGTATTTGTGATTTTTCACGTTTTTGGTACCAAGTGGAT GAATAATGGTTAAGCTCTAAAATTGATTTGTGAATGACACCTTACGACCC ACTGCAtaatggcccgagaattctctttttattggaatttgcaTGATATG AAGTCgaactttttttgtaaaattgaatCTATGTTGCATAAATGACTGGA CAAGCTAAATCTATTAAATGAATGACTTTCCCAGTGCACCATTTATCtgt cttttgtatttttttacacagcgtcaaaatcttaaatatcATCCCCTACA CATACATAACTATTTATCAACTAACCGGTAGTGAAAATATGACTCATCGT GGGGGCAAACGTAACTTTGATGTACCAGAAGGTATGTTAATTGTTAATTT GGCAAGTTTTTATTCTTAAATAAAGCAGAATAAAGGCAACTAACTTCAGC ACTCAGAAAATATAAGGCTTCAACTTGATTCAAGTGATAGCAATATCAAC CTCTTAGCCTTCTTACCCAGCATCTTTGCAATAAGAGATAAAAATATAGC AATGAAAATCGCGTGATGAGATTTTGTAGGAAATGCAAAACCTATGCAAC TTTACCCAGAAAGCATCTTTTGAAGAGACATTTTTAAGCTCAATAGAGCA GTGTAAGgtagaaatttattttcattgactTTCAAAACTTAAGTTCTtta tagaaaatgttttaaaaaataacaCTGCAATTACTGAATTTCACCAATAT TTTTCCTAGTCTGAAAGTACCTAGATTGCAAAGATAGTTATGTCTTCATT ATTCTTCAATTATTTCTCATAGAAAGTGGCATTATTGTTAACATAATATA TGAAGACCAAATCAAATCTAGTGGGGATGCAGCCAGCTACGATATTCGAG AGCTTGGAAATTTGTCGGACTACCCAAAGGATGATAATGGAAAGAcaatt ggaattttcgtaagtCAACCATATATATCTTGTAATCTATAGTGAATCTA TAATATACATGTATGTTAAAGACAACGCTGTATACTGGCTAACGTACCTT TTACATATTTAGTTTATTCAGACAGACTTTGTATGTATTTATGTGTGCCT GAAGTCAAAAAAGAGACAGGCTATTGAGGTTAATAAAGCCTCTCAAAAAC AAAGTAATTCTGAGACTGTCTGAGAAATGAAAGTGATTAGCATTAGCCAG TACATTTTTAAATcctaaaaattaacattttaatgttgctgttatGATAA TTGGTGACTATGGGAAAATGTTGACCACAGGTCGCATAACATCAATTATC TATAATCAGTTTTCTCAATAGTGATTGACAATTGTATTTCAGGGCTATAA AAAAAGTAGAATGCTCACTGCTTTACTGCGCTTTATACAAGACACAGTAT ATTTTCTCTTCATTGgttatattttcatttattcTTAATATTTAGAAATT GCAAAATGCCCCAAAGAGCTTAGAAGATCTCGTGGAGGGAGAAAGAGTGT TTGCAATTTTCAAGCACGAGAAACATGTAAAGCACTATCCTGCcacaatt ttaaaaatcaaaggCAGAAAGAGTAAGTGTATCATTGTAATTATACCGTC AATTCAGACCTTTTTTAGACAAAAAAGTATTCATACCCTCTTTTATCATG AAAATGATTCTATGATGTGATGATACTTCAATCAAGTTATTTGTGTGTTT GTCACTTCAAATCTTAAATTTGATGCCTAATTTTCAAGCTTTTACATAAa gagaacaataaaagaaaaatatttgatttttagaGAGATTGAATGTATAT GTGCTTTGTGTGAAAATGGCTGGTTTTATGATTTCCGAGAAGATTGACCT TTCCTATTAAATTGTTGGGCTTGGAATATGGTATAATAATAGTAATGATG ATAAAACTTCtaataataacaaaaatacAAGCAAGAATAATCATTTTTAG AGAGAAAGATTCCcgagaagaagaaaaacaataaGCAGGACACAAAACTC ATTCAAGGTGAGACACCAGAAAATATGGAAGATTTCACTTGACTTAATGT ACATAACTTTTTAGGTGAAGTCAGAATGAAAATCATTTCAGTTTCTAATG CCtggaattaaattttaaaataaagttCTACATAACATATTTTTTGTCAG TGAAGTTGCCAGGTGTGTAGATGACATACtttcatatttattttaatCAT TCCAGAGACTCTCTCTGCTCCTACCACACCAGGTAATTCATTTCAGTTCT AATTCAGAACTTTTTAAGTGCTCCTCTAACCTTTTCTTTAACTTGTAggt tttattcaatttttacaataaaaagtCATACAGATGAATTCTTGACGAAA TGTTTGAATATTCTGTAACTTCTTTTTGATAGAGCAAACAAAAACAAGga acaaaaataatgaaatgatgTACACAAACTCACTACCAGGTGCCTCATCT TCATCACCACTTAGAAAACGTAAGAGCTTTATTTGTTCTTTGTCTTTATA TAATACAATTCATTATTATATTGTAATAATTTGAAAGTAGTTATAAGCAA AGTCTTGATAGGTTCTTTTCACATCAACTTCCACCAGAGCAACAAAACAA CTTGAGAAGAAAGAAGGCAGCAGAGAAACGACAACAAGAAGAAGACGAGA TTGAGAAGGAGATCCAACTCAGGATGTCTGATGAAAACAAAGGTAAATGT TATAATGGGAATTGAATTTAAATCCAAGGAACTTTTCTGTAGTAAGTTAC TATACTAATATATAttccttttattttattttatttttaaggtCTTGATG GAATGTTTCAATCAAAAAGTCATTTACAGGTGTTGCAAGGTATGTACAAG GTGATCTTGATCCTGGAGTGAAATGAGGAATAATGTCAACCCCAGGATGA AACTCTTTTCGACCGGCGTCAAAATTAGGCAAAATCTGACATATTTGAAC AAAGTAGCATTTCTTCCAAGAATGATTGGGAAAAATTGCTAGGTAGGAAA TTTAAATGCTAGGGTGAAAAGTtcaattttgatctgttctgcaAAATGCC CTGCGACGCCAGTTTTGGTCCATCATACATAGGCTAGGGCTGTGAAATTA TGCAGCGATATGATAAAGCTGCGGAATTTTGCAGCGTTGCGGAGCTATGG ACAACGGCGCTAAAAAATGCGAAATTTCGCAACGTTGCGGATCTATGCAA TTTCCCGAATAACTGAATGTAactgaacacaatcgaataattgcgtttga caatacaccttatcggaaattccacaaaaacaattgcgctaaaatggatc cgttgaaattgggaggtaaacataaatggtAGCAAGAGTAGCGCCAAAAG TTCCTGCGTAAAACAAGAACTCATTTGCTTATATCTGGCTTTTTTAtatg ttcctaa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_414:66255..70361- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00064420 ID=TCONS_00064420|Name=TCONS_00064420|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4107bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_414:66255..70361- (Clytia hemisphaerica) AAATTTTTCAGCGATGTCATACCTTCGTTAGCTTGACTTGGCCCAGATGG
AAAAAAATATATAATCATATTCCGCGGAATACAAAATATAAAAAAAACAT
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CAATACACCTTATCGGAAATTCCACAAAAACAATTGCGCTAAAATGGATC
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TTCCTGCGTAAAACAAGAACTCATTTGCTTATATCTGGCTTTTTTATATG
TTCCTAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00064420-exon-scaffold_414-1575043694:66255..70361 | TCONS_00064420-exon-scaffold_414-1575043694:66255..70361 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00064420-exon-scaffold_414-1510915933:66255..70361 | TCONS_00064420-exon-scaffold_414-1510915933:66255..70361 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00064420-exon-scaffold_414-1491911889:66255..70361 | TCONS_00064420-exon-scaffold_414-1491911889:66255..70361 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_414 | supercontig | scaffold_414:66255..70361 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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