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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00063806 ID=TCONS_00063806|Name=TCONS_00063806|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2975bp CTCAATTGTAATATTGCCAGATGTTGCAGCTCTTCTCTTGCGACGTTGCG CAATATTTTGTGCACGTACATAAGTATCTGCAAGTCTGCGTTCCATTTGA GATTTGAAAGTGTCGGAAGTCACATCCTCTGTTTGATCCCTGACTATGAT GGTGAGCTCAACCAGGGTTTGATTGGTTGTTGGTGCAGTTGTGGGTGTTG GTGGCTGGGTGGTAATTACTGTTGAAGTGGGCGGTTGTAAAGATTGTGTG GCTAACAGTTCTgatgttttaaaagttttggtgGTGGGTGATTGGGAtac taaaataaaatgtgtTGTAAATGAAACATAAGAAGGTGCAATAAAAACTG GTGATGTGGTCAATAGTGGTTCTGTTGTGATCGTCATTACTGTAGTGCTT TGGAGTTGTGTCATTGGTGCCAAGTGTGCTGTGCTTAGAGTGTTAATTGT ACTTTGGTTTGTATGTGCAGTAGTTGCGAATGTTATTTCAGTGCTTGAAG CAGTGTTTGTCAAAAGTGTTCTTTCTGTCAATGCTGGAGTAACTGTGCTA ATCTGTAATGTGGAAATTATACCTTTTGTAAAGTCAATTGTAGTCAATGT ATTATAATATGTTGTTAATGATGATGTCAATATAATTTTTGTCACTGTTA ATTCTATTGATTGTAAGGTCGTGTAAATTTCTGTCATTGTCGTGATCGAT GAAAAATCAGTTGATGTTTTACCTTCACTGGCATATATTGATGTCTTGAG ACTTTGACCATGACAAATTGACGTAGTGACATATCTGGTGCAGTATGCAA TGTTTGTGGATGATGGAAAGATTTGAGGTGAAGACATTCTGCTGCCTTGT ATTGATGGTGAGATCTGTGAAGATGACATTGACTGAAGTGCAAGGGATGA TTTGGTTGTATTTGGTAATGTAGTGCTCTGTGGTTCCAGCACTTCTAAAA TTGTTGATATAGAAGCATTTAAAGGAGTCATCATCTCTGTCGTCTCTGGA GGTTGCAGGTCCAAAATTGATGATGCATTGATGCTGTTGGAAAGTGTGAA TTCCCCAATGGACGTTGTTGATGGAGAAATCTCTGGTAAATCAGTTGCAt taatttcacttttcaaagcGGTTGTGGTTACAGTAGGAGAAACTGCACTT GTCCCATTCATTATTTCATAACTTGGTAAAATGGTAGTTAAACTGCTTGA ATCCAGACTAGGTGAAACACTTTGGGTGTTATTCATAATTGAATCCAAGC TAGATGAGACACTTAGATAACTACTTATCGATTCAGAATTTAGTCTTATA GATGATCCTGGTGTTGGTAAGACTGAGTTCACTAAATTTGACGTGACAGT TGAATCATTAGTTATCAATGGTGAAATAGTTTGGGGTTGTATTGAAAAGG ATGAACTATCTGATAAAGATGTTAGTAAAGTTTGTGACATCTCCATTGAT ACTGATGATGTTGTGTTTATCTCATTGTTAACATTACGTCTTCTTCGCCT CTTTGCAATAGCCGAGGATGAGTATATAACTGATTGGTGATCTAACGATG TTGAAACTGAAACCGATTCAAAATCACCAGCGATAATGGAAGATAAACTA CTTGATTCCAAAGCTTCATTAGATGAACTTAGTATAGAAGATTCGTTTCC AAAAATTGATTCAGTTGACATAATTGATGAAGACAATGTATTTAGGACAG GGTTTTCTCTACTGATGGTTGATCCTATTGATATTGCTACTGGTGATATT GTTTGTATTGATGTCTCTATAGACAATGATTGTGAAATTGACGACGATGG ATTTATATCCGATGAATTGTTAAAAATAGAAGATTCATGTCCAACAAAAT AACTATTCGCAGATGATTGATCCTCTGAAATAAAGTTGGATGTTAGTTCT ATACTCATGGTTGTGCCATTAGTAATTGATTGAATATCTgcataatttgt tgaaaaactagactcaATGCTTGTTGGTAACATCGTCCCAGAACTCTCAA TAGAAGTTTGTATTTGTGAAAAAGTCATGTTTGAATTTATCAGTATTGAT TGGTTTCCTGTCACTGGAATACTAGAAGCTTCAATTACTGAGGTTGAATT CACAATCTGTATATTTGACGAATGTATATGAATTGAAGTGGAGAAAGTAG GAAAGTTATTAATAAGTGATGATGTGGGTGATAAACAAACTTCAGTAATA GCAGTAACAAAATATGAACAAGATGCTTGTAGAATTTCTGTGcttgatga aaaaaatcttgataaaaGTGAGCTTTGTACTGAATTTATGACTGTCTCTT GTGAAGTTAAACTTTTTGATGGTGAAATCCCAGATGTTGGTTGAACTGAT TCAACTATTGAACTCTCTCCTAAATTCAATTGGCTTGATATTGGAAGGAT TTGTGAAGATTGTATTATATCACTTTCAATACTTTGGTCAACTCTACTTG AAGAGGGAATGATGAGAGTTTTTGATTCCATTAACACATCCATTGAATGA ATTGATTGCGACTCTAGCATACTTGATACAAAAATGTCTGACATAGAAAT GGAAGTTACTTGTTCTGACACAGAACTTGATGGTAAAGAAAAATTGttca ttgaatttgaaaatatatctACTAAAGAGCTTGAGTTTGATTGAATAAAA CTGCTAGCTGAGCTTTGTAATGAAAATGTTTCGATTTTCGAAGTTTGCGT GCTCTCTTTATTATTGAATTCACTTTCACTGAGAACCAAGCTTTGTGAAA GGGACAATGTTTTTGATAAAGAAGGCTCAATCATGGACATCAAACTGGCT GTTAAAGCCTCTGTTATGATAGAAGATGATGATATGTAGTCACTTGCTGT ATAGAGCTCTATGGAACCAGTTGATGATATTGTCTGAGATATTGATATAG AAGATTTGTTTGGTATGGTTGATGATGGATCAGAGAAAAATGATGATGCA TCTTGTGTTGGAAGGATTGTTGATC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_400:132334..135360- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00063806 ID=TCONS_00063806|Name=TCONS_00063806|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3027bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_400:132334..135360- (Clytia hemisphaerica) CTCAATTGTAATATTGCCAGATGTTGCAGCTCTTCTCTTGCGACGTTGCG
CAATATTTTGTGCACGTACATAAGTATCTGCAAGTCTGCGTTCCATTTGA
GATTTGAAAGTGTCGGAAGTCACATCCTCTGTTTGATCCCTGACTATGAT
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CTGTTAAAGCCTCTGTTATGATAGAAGATGATGATATGTAGTCACTTGCT
GTATAGAGCTCTATGGAACCAGTTGATGATATTGTCTGAGATATTGATAT
AGAAGATTTGTTTGGTATGGTTGATGATGGATCAGAGAAAAATGATGATG
CATCTTGTGTTGGAAGGATTGTTGATC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00063806-exon-scaffold_400-1575043694:134694..135360 | TCONS_00063806-exon-scaffold_400-1575043694:134694..135360 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00063806-exon-scaffold_400-1575043694:132334..134641 | TCONS_00063806-exon-scaffold_400-1575043694:132334..134641 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00063806-exon-scaffold_400-1510915933:134694..135360 | TCONS_00063806-exon-scaffold_400-1510915933:134694..135360 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00063806-exon-scaffold_400-1510915933:132334..134641 | TCONS_00063806-exon-scaffold_400-1510915933:132334..134641 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00063806-exon-scaffold_400-1491911889:134694..135360 | TCONS_00063806-exon-scaffold_400-1491911889:134694..135360 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00063806-exon-scaffold_400-1491911889:132334..134641 | TCONS_00063806-exon-scaffold_400-1491911889:132334..134641 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_400 | supercontig | scaffold_400:132334..135360 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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