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transcript sequence >TCONS_00061791 ID=TCONS_00061791|Name=TCONS_00061791|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2261bp
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AAAGATTACAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_360:168449..183602+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00061791 ID=TCONS_00061791|Name=TCONS_00061791|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15154bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_360:168449..183602+ (Clytia hemisphaerica)
GTTGACAAATCTGGTGGTGGAAAGACGGAAGAAAAATGTACATCTGTTTG
GTACGTCCCccttttttatctctttttcgCTTCGATCGTACTTTATTCGT
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TAAAATCTTATAATCTTGCGCGTGATTTCTGTGGGTTTATAAAGATTATA
GACTTTTGTTTGTGTGCGTGAcgtattgatgacgtcagcaaatttCTACA
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CTCACCTAGAATTTATTAGTTGTCTTTTAAGTCGCTGATAGTTAAACACG
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TCAGTTCTTGTTGACTTAATGTAGTATCTAGATTTTCCTTTtaacaattc
aaatttatcTTCGAAATGAAATCTTACTTTATTTCTTTTCCAGATTCAGA
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AAGAGAAGCGAACGGATTGTAGCGAAACAGTTGATAAACAAACAGTGCTG
AAAAATATCGAAGCCAAAGACAGTTTTCATTTTGATGACTTTTGGGAAGA
ATTAGCCTTACTTGATAACGAGGCTAGTGTAGATGATGACGTCAACAATA
ATAATTTCATCGATCAAGGTTTATATTCGATGTGTCTAGAGCCTAACGAT
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ACAATCTTCGGTAGATAGTGGAATCGTCGTTCGCACACCGAGTGAAAGTT
ATCAAGATCGATTAGCGCTTGTCAAGTCCCGAGTTAAACGATGCAAAACA
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GAAGGATATAGACTTGAATAAATTTCAAACGATCAAATTTAAAGACTTTG
AAGCAtacaaaaaagaacaacaagATAGTAAAATAGCTGCTGAGTCAGCG
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TTGAATGGGCGACCTCTATTTGAAGACTCGCTTGAAGAGAACTATGTGTT
ATCGTTTGATATTGACTCTACAGATACGAAAGGCGATACTTGTTTACATC
ACGCTTCCAGTATCGGCGACGTCGACACAGTTCGATATCTCTTGAAAGAG
GGCGGAAATGTGTGGcgtaaaaacaataacaaactaCTCCCTATGGAGCT
ATCTCATGATTTTAAAACAGCAAAACTTTTATCCCATGCAACTATCTTTT
ACACGGAACCAGAAAAACAGAGACATGGTTGTAATAATATTTCGTCGACC
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ATACTTCGTAGAttcttttttattaatttaagtTTGTTAGCCAGAGCTGT
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GTATTATAACGGTCTAATCCTCCTACTGGTCTATATAGACTAAAGGCTAT
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TTTTCCGGTTAAACTACCGGGTTAGACAAGAACTTTTTCTcccttgaaaa
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ttaataactttaaattttattaaattttgtatATATTGTAAAAATTTTCA
GTATAATGTCgtaaaattattttctattCTTGGGAATTACAATAAAGATT
ACAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00061791-exon-scaffold_360-1491911889:168449..168498 | TCONS_00061791-exon-scaffold_360-1491911889:168449..168498 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00061791-exon-scaffold_360-1510915933:168449..168498 | TCONS_00061791-exon-scaffold_360-1510915933:168449..168498 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00061791-exon-scaffold_360-1575043694:168449..168498 | TCONS_00061791-exon-scaffold_360-1575043694:168449..168498 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00061791-exon-scaffold_360-1491911889:181392..183602 | TCONS_00061791-exon-scaffold_360-1491911889:181392..183602 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00061791-exon-scaffold_360-1510915933:181392..183602 | TCONS_00061791-exon-scaffold_360-1510915933:181392..183602 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00061791-exon-scaffold_360-1575043694:181392..183602 | TCONS_00061791-exon-scaffold_360-1575043694:181392..183602 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_360 | supercontig | scaffold_360:168449..183602 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
