TCONS_00061630 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00061630
Unique NameTCONS_00061630
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length7900

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00061630 ID=TCONS_00061630|Name=TCONS_00061630|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7900bp
TAACATGTTCACCTTATTTTTAGTCCGTTTTAGGTTCACCCCACCCTCGT
AATACATTGTACATATCTATTAGTAGTCATAAACCGGTTTTAaactttta
gctttttttatatTAACAGATTCAAATACACGCGGACTAGGGCCCTTTTA
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TctgatgaaaagaaattttgacggCTTTTGATTTGACCCTATCTGTGCTT
TCTTTCTCCGCCTGGCtgtcaaatatttctttttcttgtcataggaaaac
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tgaaaagaaattttgacggCTTTTGATTTGACCCTATCTGTGCTTTCTTT
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acaaaaaaTTACTGTCGGTTGTAGTTAGAATGTGCTTTAAAATGGCGTTG
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taataataaaaagaaaaaatataccgTCAATGAATCGCGGATTGAATTAA
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GAAGACAGAAATGGTATCAATATTTAGAGGACCGTGACGTCGGGAATCGG
GAAGCTCTCAAAGCATTAACGGAACACATGCCGAAAGTCACATATATTTA
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GTTTTCAAACAGTCAAAGCGTATGCTGAATTTTGTGGCAAATTTCGGTCC
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ACAACAACAAAAACCATTTCCACCGCATGGCAGGCCGCAACATATGGCTC
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TTGAATAGCTTTTACCGCTTGGTTTTAACCCCATTGGCAAAAAATACTAA
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TTggatttcttttttactttcctattcaaaatgttgtttttttaagtttg
ttaaaaagcaaaataagATGTTAAGGATTTCAATAGATAAGAGAGATTGT
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ATAAAAACACATCATATTATTAACAAAAGTCTTATCGCGCTTTAGATTTC
ATTATTTgtcaagagaaaaaaattcgactttttttcttttaacctACTTT
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TTATCCTTTTGAAACCGTAAAATTTTCAGAGTGTTTGAATAAGCCCGGTC
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ATCTCAAGAACGTTCTTGTAATAAAACCTCAATGTTTTCACTCTGACTCA
AATACGAACTGTGAAATTCGTGCCGCCATACCTCACTCACATCTCAATCG
AATCTCTGGTTATCTCCGTCAtaatatacacgcttttttcatACGCGGTT
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tttctgTGGTAATTTATTATATAGTATGCTGTGTTTGTTAATATTATAAC
TTAGATATGTTTTTTGGATGCTGAAGCTTTATTTGTCTTCATATTTAAAA
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ttttttttctacacgagaattttttttatttaaagggGGGTTAAGGTTAG
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aagaaaatgttttcgggtaaattatgtcaaaataataTTCTATCTTTTTT
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AATGCTGAATGGAAGATTAGGAAGCAGGTTAAATTCAAATCTTCTCAAAA
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_36:1264257..1280995+

Legend: exon
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>TCONS_00061630 ID=TCONS_00061630|Name=TCONS_00061630|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16739bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_36:1264257..1280995+ (Clytia hemisphaerica)
TAACATGTTCACCTTATTTTTAGTCCGTTTTAGGTTCACCCCACCCTCGT
AATACATTGTACATATCTATTAGTAGTCATAAACCGGTTTTAaactttta
gctttttttatatTAACAGATTCAAATACACGCGGACTAGGGCCCTTTTA
GGCCAATAAATTAGCAACACCAAGGCTAAAGGGCCGATAAGTTAGAAGTG
AGTATTTGTAGCATGCGTAACTTCGTAGTTTAAACATTAAGTTGATTTCT
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TGTGAGTCAGGTCTAAGCGCAAGTCTATTGTGTTCTGAATATAGCTCATA
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GTTTGCGCCAATAGAAGTAACGATCATGTTTAGTTTAATTCCCGCAAAGC
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AACCTCAAACTCGAAGTTACCTAACCCGGTATTCTTTTGGTCTACTGCAT
AGGAAGACGCGATTTTACACTTATCTGTACACTTTGACCAAATCTAAACA
CTGTCTTTAAAAGCCTTGATGCTGTCAATTTACATTGATACATTGCGTTT
TCTTTGTATCATCAAAGTTTGTTTTAGCCTAACTAAATGATCGTCTTTTA
AAGGCTCCTGGATGACGATTTAACATCACATGCATGGCAAACACTCTTCA
ACATCTTAAGCATACATCAACGGAGAGAAAAAACACTTGACATTTTCAAA
TACTGATATTATTGTCTGACTTGTTTTAACACTACCTACTAAACTCGAAC
GCGACAGGAAATCAAGGTAGAGAGGGTTTTTATAACACAAAAATGTGCGT
GAGTGTTGCTTTGATTTATATGCTTTGATGATGACTGTTGACTCAAAAAA
TctgatgaaaagaaattttgacggCTTTTGATTTGACCCTATCTGTGCTT
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GGTTTTTTGTAGGTTACTGATATCCTCAAACATTGATGATGCTCCTAGTA
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taaattcaaaaatttttttccaccaCAACCATACGTAGAgaaatatatta
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AACAGAAAAAAGGTGCATGTAAAAAGATAACCctgttgaaagaaaaattt
cctTCCCCCTCATTCTACCACTTTGCGCTTGTGATGTGATAATCAGCTGT
GGAAATCTCGCGCATGCGTGTAACAgctcaaaaacaacaaaagcacGTGT
GTTTTTAAAGCTCGACACATACTACAAATATTAGATGTCAACTCAGTATT
GGCTTGttattagggagataataatTTAAAGGGACAGATGGCGCAGAGGA
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GCAATAGTGTTTTTCTCATTCTTGTGATTATCTCCGTAATATCACGCTTG
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TGTCTTTTAGGATTATTAAATGTTGAatacttataaataaaaaaagagag
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GACAGTGGTGGAGGCGGTGGACCCACAATGAGCCGTTGCGTTACGAGATC
GATGTCTGCGAGTATAAACCAAGAACGAAAAACACATCCGAATTCAGCCG
CCGAGGAGAATAATAGTAATTTATGTTATACCAAACTCACCACAATTAAA
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CGGACTTGAGCGAAGAAGTTTTGATTGCGATTTTAGAGCATGTACCGGCT
ACTGGTCTAGTTTCTATGAGTAAAACTTCCTGGCTATTTCATCGCATCTG
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ctgaattttttggattttcttggTTTCATACCTTTATATTTTGTTCTCAC
ATTTCGTTTGGTTCTTGAATCACGTTTACATTACTATAGTTTGCAATTTA
GTACTGTACGTTCAATTTGAAGGGTGAATTGgggtaaattttaattttct
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CAGATCTGTGCTTCTAAAACTTGAACCGACAAATATCATAACATTTCTAA
CTTTAAAAATCTGAAGTGGGATGAACATTAGTCTCTTGGTTAAATGCAGG
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ttcaaGATCTTGGAGATTGTCTTTCCTATTTTGTAACTTGAACTTTTATT
ATGAATCTCAgctgaaaagttctttttttctcttctagTTCTAGagctat
attttttattttaagagtcttaaaaaatattttaaatgctCATGAAATTG
TAATTTGAAGAATATGGCCTTTTGGACAGCTGTAACTTTCCCCTTAGCTC
AATTCTTATTGTAACCATACCAGCATTTTTATTGTCTATGGCTTCCTAGA
TCTTTGGCATATCTGATTTAaaacttcttttcttttcacatAAAGCTCTT
GAACTTTATGACTAAATATTTTGCTATGGTATAAAGAGACATGTTTTTCC
AGTGAACGTAAgcttttcctttcaaaatatgtttaaagtttcatctttca
attttcttttccctTCTTATGTATATATTCACTATGAAAACATATATTTG
TCTATAAATCTCAAAAGGTTGAGCTTTACTTCACAACTAAACCCCCTGGT
TGTCAGAAAACTTCAATAGAGCAAGGATGTAGTATGGATATTTTATGACA
TATAgtcttaaaaacaaatttctctATTTTTGAAGGTGTTTTTTATTTAC
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GGTCGTTTTTTATAAAGTAGATATGAAAATTATCTACTGAAAGATTATAA
TTCATCACAGGGTCTAGaataaaaaagttcttttcaCCCATTTTATAATA
TTATAATGTTGATGATTGTACAGTAGAGGGTAGTTTCAACAAAGTGGATG
NCTTTTTTTAGTCATGATATGAACCGATTGATTCAAagtacattttattt
tatttttgcttttacatTTAAATCTACTCTTTGTAATTATTTCAGGATTC
AGGCTTAATCTTGTGGGTTTTCGGGCTTTTCGGGAAACTTTTTCTAATCA
TTTTTCTTATCTTCTTCCTTAAAAGTATGAAAACATTGATTTTGATAGGG
tctaaatattttgaatatatgCTATATAATTTTGAACAGAAAGATGCTTT
TGCATGTTGCAAGAGCTCTCAAATTTCAGAACATTCTCCAAAATTTAAAG
TGCAATTTTCTATATTTagaccttttttatttttgatctttttaggtgta
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TCTAAAACTTGAACCGACAAATATCATAACATTTCTAACTTTAAAAATCT
GAAGTGGGATGAACATTAGTCTCTTGGTTAAATGCAGGAGAGTGATATCC
TGAATTTTAAGTGTCGTGTCTCaactttttgcttgtttttcaaGATCTTG
GAGATTGTCTTTCCTATTTTGTAACTTGAACTTTTATTATGAATCTCAgc
tgaaaagttcttttttttctcttcttgagctatattttttattttaagag
tcttaaaaaatattttaaatgctCATGAAATTGTAATTTGAAGAATATGG
CCTTTTGGACAGCTGTAACTTTCCCCTTAGCTCAATTCTTATTGTAACCA
TACCAGCATTTTTATTGTCTATGGCTTCCTAGATCTTTGGCATATCTGAT
TTAaaacttcttttcttttcacatAAAGCTCTTGAACTTTATGACTAAAT
ATTTTGCTATGGTATAAAGAGACATGTTTTTCCAGTGAACGTAAgctttt
cctttcaaaatatgtttaaagtttcatctttcaattttcttttccctTCT
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GTTGAGCTTTACTTCACAACTAAACCCCCTGGTTGTCAGAAAACTTCAAT
AGAGCAAGGATGTATGGATATTTTATGACATATAgtcttaaaaacaaatt
tctctatttttgaaggtgtttttttatttaccaATAAATTAGAACTAGTT
GTAGAAGCACTGACtaattcctctgaaaaaacttttgaaatttgttgaaa
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TGATCAAAGCATAGTTTTAGAGAAGAGCATGGGTCGTTTTTTATAAAGTA
GATATGAAAATTATCTACTGAAAGATTATAATTCATCACAGGGTCTAGta
taaaaaagttcttttcaCCCATTTTATAATATTATAATGTTGATGATTGT
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GATATTCCTATCTCATTTGCTTTAAATGGATGAGAAGGACAACTTAAGGT
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ttctttcctattTAGCTATTTTAGCAGTTCAGCCTATCGAATACTAAACT
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TTATTATATATCATTTTCATCTCCCATTTTGATATGATTTTCACTCAGGG
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TCATGTTGCCATATAATTTTCCTTCCTAATTTATTTAAACCCTACTTGTc
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GGCTCgttttttgatgatataccatcTATATTAAAATGAATAATGGCTTT
ATTTTGGTATTGATACTTTTGCCAGCTTTTGCAAAACAGTATAATATCAC
AATTTGTATGATCATTATAGTATCTCATTAATTTGATTGTtgtcataaaa
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TGGATTgactaaaatcttttaaatttgtttATAAAACTATCCATAGTTGT
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ATATTATAATCAAAATAATACAGATTAAAATGGTCTGGTCTGGTCAGAAT
GacgttttcaaaaagaattgTTATTTATTAATCTTTGTATGCAATCAGAT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
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Values : 
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00061630 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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