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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00061600 ID=TCONS_00061600|Name=TCONS_00061600|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=325bp GCGACGATCCAAGTGCAAGCTAGTGCTGATAATCCTTTCACATACGAAGA CAATTTGAAAGCTGTCGATGCATACTTTTGTAGGGGAAAATCTGGCAATT ATCGCCATCCAAATGGAGCCTGCGATCACTACATAGCCTGCGGTGTTGGA tgtaaaaatgctaaaaacagACGATCCTACAAACACCTTTGTACACAAAA CATCATGCCGTGCCCAGGTGGTCTTTTCTACGATGAGAAAGCTTATGGAG GATATGGAGCTTGTATTTATAAAGCTGAATCTAATTGTCTTCAATTCCAA GGAGAAGTTTGCTATGGATCCACTC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_36:926373..940495+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00061600 ID=TCONS_00061600|Name=TCONS_00061600|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14123bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_36:926373..940495+ (Clytia hemisphaerica) GCGACGATCCAAGTGCAAGCTAGTGCTGATAATCCTTTCACATACGAAGA
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TTGCTTAAAAGACTTAATAGTGGGAAGATTTCGTATATGATCTCCGAGGT
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AGGAGAATCCCTGGGTAGAAACTTACGAAGTCTGCGAATCAAtaccttga
ttagcttttttatttttttcatcaaggtgacggtcaaaggccagcttttg
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TTGAGAACAGCGAATATGGTCTAGGATAAGCGAAAATAAGGATGAGTcat
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atgacttaagtttaaaaattaaatcatcgtgccaaactctgtcaaaagct
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GCCCTGGCGGAAACCAGACTGGGAATTTGTGAAAAGATTATTGTTCTCGA
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ACCTcaattttgcccaaaaaataGGTTAGATTAAGAAAATTTGTGGCCTC
GTTATTCTAAATTTCGTATCCCTATTGCCGTAAAAGTGAAAAGGGGGTAT
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AACCGCCCTGGCTCGCAAGGCTgatgaattgttcttataaaataccAAAA
GTGACTTACTTGAAACCTTGACCCAGGAAATGATATTAAATACCCAGTAC
AGTAATTCTACAAATTGCTTTTTATACTGGCGAGTGATAGGAACAATTAA
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GttctaaatattttggccttaTTTTCTTATAGAGTCTGTACTTATGAAAG
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CTGAGTTAAGACCTCGTCCTCATTTTTCGGGATGTTATATCAAAGATGCA
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ATATGCCGCTGCTCGAGGTACCTTTTCTTCCATACACGGTGACCCAATTG
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AACATTCTACCCGGATGGCTAATTAAATATCcgtgaaaaatgaaaagtga
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TAAAAGGGGGAAGTTTTGGAGCGAGGGATGGACATCATCTCACAGCTCAA
CACAGCTTGTGAAAAAGAACAAAACGCAAACAGAAGAAGGAAGATTAATT
CACAAGCATCATGTTGGCAATCTATATTCTAGCCGTTGCTTTGGGTAAGT
GCTTTATCAAGCCTTAAACAGTATCTCAGTACTTTGATAGAGTTTCCAAA
GACACCCCCGTGTCACATACCTACTATGGAACCCACGTCCCtggaaactg
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CAGCCCTAAagcgaaaattgattttatacccatttgaaaaataattgaaa
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TCCCCATTGATGTTTCCCACTGTAAGAAAATTCtcaccggggctgcgaga
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AAGTGTTAGGTAGATGCTGATTTTAAATtctattttttacattttacatt
gGATTTTTTGagtgaaacaaaaatttgtttccAATCGAAAAAGCTACCTA
GATTCTTATGGATACGGTTGAATAATTGCCTTTTTGTATATCTAATTCCC
TCTCTATGTTATAGTGACGATCCAAGTGCAAGCCAGTGCTCATAATCCTT
TCACATACGAAGACAATTTGGAAGCTGGTAAGTAGGATTTTATTATGAAT
TGAGGGAAGACAATAACGTTTAAGTTGTAGTCTTGAAGAGAGCTGATAAA
GTGTCAAAGCTATGCAATTTGAGTGTATTTTTTGCTTTAATGGTGGGATA
AATTTTcgggaattaaatttcgtgGATGGCGCTACGTACTATATTTTGAC
GATCTTGTGCCTTTTTACACCAAATTGTGCATGTCGCTTCTTTGATAATA
GTTAAACATTCAAATACAAAGGAGTTACTTGAcattattttgagttttca
tCAAAactatttcgcggatgaggcttttccaaattttcattgggacttaa
tttcgcgaatgacaCCAAAATCAGCGTAAACAACTGATAAAACCATTCTC
CTTCTTTTTTTTGAGTTATTGAGAAATTCATCATcactttaattcttttt
tttacatttcagtCGATGCATAATTTTGTAGGGGAAAATCTGGCAATTAT
CGCCATCCTAATGGAGCCTGTGATCACTACATAGCCTGCGGTGTTGGAtg
taaaaatgctaaaaacagACGATCCTACAAACACCTTTGTACACAAAACA
TCATGCCGTGCCCAGGTGGTCTTTTCTACGATGAGAAAGCTTATGGAGGA
TATGGAGCTTGTATTTATAAAGCTGAATCTAATTGTCTTCAATTCCAAGG
AGAAGTTTGCTATGGATCCACTC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1491911889:926373..926436 | TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1491911889:926373..926436 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1510915933:926373..926436 | TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1510915933:926373..926436 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1575043694:926373..926436 | TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1575043694:926373..926436 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1491911889:927108..927175 | TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1491911889:927108..927175 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1510915933:927108..927175 | TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1510915933:927108..927175 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1575043694:927108..927175 | TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1575043694:927108..927175 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1491911889:940303..940495 | TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1491911889:940303..940495 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1510915933:940303..940495 | TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1510915933:940303..940495 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1575043694:940303..940495 | TCONS_00061600-exon-scaffold_36-1575043694:940303..940495 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_36 | supercontig | scaffold_36:926373..940495 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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