TCONS_00061533 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00061533
Unique Name	TCONS_00061533
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1841

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_359:111651..130935-

transcript sequence

>TCONS_00061533 ID=TCONS_00061533|Name=TCONS_00061533|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1841bp
TTTCCTAACGTGAAGTTATTACCTTTGGCACAGCCCGCGAATTAAAATAG
GCGTTTGAGCTCAGATAATTCATTCGAGCGGTGTTCCAGCTAGAAATGAG
TAAGTGCATAAGCTAGAACTCgaatatttctgaaaaaaattctgCAAGTC
GAGAAGAGAAGTGAAAGAAGGTTCCTTTTTCTGTTTTCCACAGTTTAAAT
CAAAATGACTTCATATGCAAGAGATGAGCCAAGACATACAGATGATGATG
AAGGAAAACTGTTTGTTGGTGGTTTGGCTTGGGAAAGTAACGACGCTTCC
ATTAAAGATTATTTTGGACAATGGGGTCCAGTTGAATCTGTAACTTTGAA
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AGAGATAGTAGACCAGGTCCCGGTGGTCGAGCTCCAAGGCATGAGCCTTA
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GAAGATGTTTGCCTTCTTAACTACTATATTATTTTTGGTCAACCCGGTAT
AGCCACTATCATCTAACCTTCTCCAACAAGCGTTTTGTATTGCATTTTCT
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tcgcACAAAAATGGGTACCTTCACAAGTATTTACTTTacgtaagaatttt
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ttgaataaCGATACatctcaaatttcttttaaattgttttg

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_359:111651..130935-

Legend: exon

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>TCONS_00061533 ID=TCONS_00061533|Name=TCONS_00061533|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=19285bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_359:111651..130935- (Clytia hemisphaerica)
TTTCCTAACGTGAAGTTATTACCTTTGGCACAGCCCGCGAATTAAAATAG
GCGTTTGAGCTCAGATAATTCATTCGAGCGGTGTTCCAGCTAGAAATGAG
TAAGTGCATAAGCTAGAACTCGAATATTTCTGAAAAAAATTCTGCAAGTC
GAGAAGAGAAGTGAAAGAAGGTTCCTTTTTCTGTTTTCCACAGTTTAAAT
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GGTTAGATATGTGATCGATGGATTACTTAACGATCCGGATAGGAGATAAA
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ATATCCATTATCGAGCTAGTATTTCAATCGAGTATATCAATTCGTCAATA
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TCAATTTGTTATCGAACGTAAATCAATTTGTTATCAATCGTAAATCGAGA
TTGATAAAAGATCGATGATATGATAGATCGATAAATAATTGATAACTACC
GTGAGAGGTCCTAAAGCCGACAGCCCAGCCTAAATCCGATGGGGTCTTTC
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TTCAAGGTGCTGACGGGACGCTCATTAGTAAGCGTCTATAGTGGCGAGAA
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AGATGTTTTGTTTCGAGAGCTCTTGCAATAGTTTATCGTTCAACTTGGAG
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ACCTTTACAGTGCAAAAAACCAGAAGTCTTTAACATTCTTCGTTCATTTG
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CAGATCGGTCCCGTAACAAATATTTTTTTGTGTTTGAAAGATGGTAGATC
AAGCTTTCTTTTGAAACCATTCGTTCTGTGGGGTCGTGCATTGTCTTCCA
GCAAATGTAAATCAAAGAATTAAATCCAAAATTTTTCGAAGAATCCGTCA
AATTTTTATGTTGCGAAAAGTAACAGCAGAGAGCTTGAGGTGAAGGCTTC
TTCGTAAAAGCGAAAGACATTTATCTATTTTTCGGATCCGGCATGCGGGA
ATAGAGTCAGGACCTGCAGGCGACCTGGTAGGGTTGGATACGGGTGTGGT
TTGGGTGTGGTTACGTATCAGATTGGCTAGGAATTTGGTTATTATCAGTT
AGGGTTAGGGTTGGAGCTCGAAAAAAGCACTCTTTTGTGATTTTCTCNNN
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GAAAAACTACGAACAAGAGACTGGAAAGTATGAAATAAGTCCAGATCTGT
CTTTCGTCTTTACGAAGAAGCCACGACCAGAGCTTGAGACCTTCCTCTTT
CATGCTGTGCAATCATCTTTTGTGTATCTATATCTGCTCCATTGTAAGGG
AAGTTTAATGGTATAGTGACCCCCGTCTCTATGGCTCGCACTACGGAAAA
ACACTCTCGGCCCAAACTTCCTGCACAGATTTTTTTGTAAAACACTTTCA
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TTTGAACAGGAATCTTCAAAAAAATGGAACTTCAAAATGGAATATCTGAA
AAACTACTAAAGGTTGAAAGATAAGTGACCCCTCATTTTTTTTCTGAGGA
TAAGGGCTTTCATTAAACTTGGTTTGACATTTTGAAAATGATTTTGAAAT
TTCGACTGACCCCCCTACATAAGAGTAGGGTGGTCAAAGGAAATTTCAAA
CTTACTTGCAGAATACCAAACCAAGTTTAATGGAAAGCCATAACCATCAG
AAGAAAAATGAGGGGTCATTTACCTTCCAATTCTTTAAAGCTCCAAAGAT
ATTCCATTTTGAAGTTCAATTTTTCAAGCATTTTTGTGCACGCATCGCCA
GCCATTTTGTACCTTCATTACGGCACCAAACTGCACCAAAAGCAAAAGTG
TTTTATGAAAAATTCCGCGCGGGAGGTTTGGTGCGAGTTTTATTTTCCGT
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TGCCACTGGAAACAGCTTGATTCTTACTTTTTTCACATTTGGAAAGAAAA
AACATTGTTCTTTCTAAAAAATTCACGTTTGATAAAAAAATTTGATTTTT
TCAATGAAAAAAACGCATTTTATAAGTACATAATTTGACTTCCTGAAAAA
TATACGTTGCTCCAACCAACAAACGTGGTACGTCTCAAAAGCTAAACTAT
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AGCGCTTTGGATTTTAAAACCCCCGGATAAAAAATTTTGCCGTGCCGCGA
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AGCTTGAATATTTTTTTCTCGAAAATCTATGTTTTGTTACTGCCGCACGC
GTAAGGCCCGACCTCCCTATCATAAGCTTAAAAAAATCTTGAGTATTTAT
CTTATCTTTATTTATCTTGAGTTTATTTGTGTTTACAGTTTGATTAAAGT
TCGATTACTTATCTCAGTTTGATTAAGTCCAGACGGTGTCAATCGAACAT
CTTCGAACAAAAATCGCAATAGAACCAAAAAAGTTGATTGTCGAACGTAA
TCGAATCTCAATCGAACGGCCAATTCCTGGGTACGATTGTGTTCGATTGC
GTTTGATTAAGGTTAGATTGGTTTGATTAATAGTTGACTATGTTCCATTG
GTTCAATTACAATTATGTTTGATGAGTTTGATTGCGATTAAATTAAATTG
GATCACTCTGCTAGAGCTTTTTAGCGTGGGTGGCTGAGCGCTTATCAAGT
ATCGTACGAAAGCGAATAAAATCTAAATCAATCGACCGTACTCGAACATA
ATCGAATACAATTGAACGTAATCAAAGCAATCGAACGGCAAATCCTGGGT
AATATTCGATTGCGATTCGATTATGTTTGACAATCGAATTGCAATTATTC
GATTGTGTTCAATTGCGTTCGATTGGTTCGGCATTCAATTCGTTCGATTG
ACACCGTCTGGTTAAGTTCGATCAGTGTTTTTGTAGCTCAAATGTTTCCA
GTTATTGCTAGCGCAACAGCTCTAGCCTAAACGATCCCCAATAATCATTA
GATTAGCAGATAAGAGTTGTTCATGCGCTCCAAAAATGATTTGTGAATGA
AAACCATATATAATATAATATCTCGAACATGACAGTTAAAGTCTGTCCAG
ATATAATTGGCAGTGGAAACAAGAATGCCTGTAACTTTTAATAGTCAAAT
ATAATTATGGAATTTTTTTTTGCTTGTTTCAGAGAATCAAAAGTGCTATA
TTTGAATATATTTTTGGTTGAAAAATTCGCGATTTTTATCGGTTAAATTT
GCGATTACAAAAATTAAGCTTTTTTTCTACTTATGCTATAACATTCATTT
TTACACCAGTGGTAGTTCAACCTTAGGTTAAGAAGTTTGTTAAATTTCAA
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TAGTGTTTTGGGAATTAGCAAAGTCCTTTAATGACTTAAAAATAACAAAG
GCAATATAAGCTCTTTTCAATAAAAACAATTATACTGTGATTTCACTTCG
TTTCGAAATAATCAATGATACCAATAACGCCAATGCAGCAACACTTAACA
CTTTCCAACTTTTAATTGCACTTTTCAAAAAAAAATAACATAACGCCCGT
TTTTAGTAATAAGTTGGAGATTTGATATTTCGCAGAAAAGTGCTACAAAG
GAGTATTTCGGGTCCCATATCTTCCGAAGGAGTTTTTTGTTCGCCTTGAA
ATTTAACAAACTTTTTAACCTAAGGTTGAACTACCACTGGTGTAAAAATG
AACGTTATAGCATAAGTAAAAGAAAAGCTTAATTTTTACAATCGCAAATT
TAACCGCTAAAAATCGCGAATTTTTCAACCAAAAATACATTCAAATATAG
CGCTTTTGATTCTATGAAACAAGCAAAAAAAAATTCCATAATTATATTTG
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CAGACTTTAGTCACGTCCAGACCCGATCAATCGAACTTGTCAAACCAATC
GAACAATCAAACCAATCGAACTCCATCGAACGATTAAAGTTCGATTAAAA
AAGTTAATCGAACTCTATGATTTTTGTGAGTGTTCGATTAAGTTCCATCA
ATGGGTTTTGGTTCGATCAGTTCGATAAACCAATTTAGTTCGACATGTTT
GTGCTGCTCTGCCACCGTTTAAAAGCTTCTTTTCAAAGCCAAATTCATAA
TGTAGATTGGGAAATTATTTCCGATAACGGATTACACACTTTTCCTGTAT
CCTTTTAGCGCCAGAGGCGGTTTGTTGGGGGCGTAGTATTCCGCCACTCG
GCCGCGCGCGAAATCGCAACAGAGGGGCTATGGACTTTATTCCGGATAGA
CAAATATCCGGTTACAATAAACGTCAAGCTGTTAATTCCGAGAACCGTCA
AATTGGCAATCGCGTGCCAGAGGACAAAGTTTTTACAAGCGAGGGAAGAT
ATCAGGATTTAATATCATCAAACTAATCGAACTTTTTACTGACCGAACTA
ATGGAAGTGCTATTGCTTCAAAAATTGGGAGTGTTCGATTAGGTTCGACT
AATTTTTTTAATCGAACTTTAGATGGAGTTTGATTAGTTTGATTGTTCGA
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TCACGTGCGTTTGGTTTGGGAACAAGAAACACAAACACGAACTACCCATG
TCTAAACTTTTCAATATATCTCCAAAACTAACAGATTTTTTGAAATTCTG
TAAAAAGGTCCAAGTTCCTGAATAGTTTTAACTATGTTCTGTGAAAAAAT
TATAACCATCAGTCAAATATCGTTCATCTATAAGATTGAAGACAAAAAGT
TGCGTACAAAAAATGCTTTTTCAAACACTTTTTTCCACCAAAAATCAATA
ACTTTTATAGACTTACCTTCCCCAAACATTGAAGAAGCCTCTACTAGTTA
AAGTAAATGAGATAAGATAGATAAAACCTTAAAATCAATATATTTTTTAT
TTGAAAGTAATCTTTTCATGGAATAAAAAGATATAGTCAAATCTTGTAGG
GTCATTTTTCAAAAAAATTTTGCCAATATCAATTTTCGCATTTCGCCATT
TTACCCTACGCAAACGCACGTGTAGTGGAAGTATTTTGATTTGTGAAGCC
TCTTTTCATCACATAGAGCAAAATAAAATAGCAAAAGAACAAAGGAATTA
CCCCTAGCCACCATTTTGCAACCATGGGGGATCGCAATTTTACGGAAATG
GGAATCCTCATATCGGATAAAGCATCTTCTGAAAATTTCATTCTTCCCCA
TAAATGCGAAAATGAAAAACAAAGAAGCTTTTGATTTCTGATTGTCTTTT
TAATCTGCCATGAAGTGATATAAAATTCCTTATAGAAAGACACATTCTCT
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TAACAATTTCGTAAACTACGTCACAACTACCGTAAGTTGATCTAATATCA
ACATCCCTCGTCTAACTTTGATACCCTTCTTTAGAGACAGGAATAATAGG
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CTGACCGCTAAGCAAAGAAAAATAGCTTTGGCCTTTCTATCAATTTCAGC
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CCCACAACCACACTGAGCACTGACTTATTAGTTTTATGACTTGTTCTCAC
TCGTTTGGTTTCCGTAATAAAAAGAAAGACATTATTGTGAGCTTTGAACA
TGCTTATAATCGGTGTGCTTCCACTAACTGCATGAATTGAACTAATCAAA
CTTTACCAGAATTATTCGGTTCGATGACTGTTCCATTTGGTTCGGTAATC
GGACACCTATCGTTCGATTAAGTTTGATTGAGTTTGATTAGTTAGGTAAT
CGAACAGTTCAATTGACATTGCCTGGGAATGTTGTTTGAGGGTGCAGAAT
TTTTTCTTTAGCGTGAAATAAAGGCCTACGAATCAAGACCTATCTAGGAA
ATTAAAAATGACAAATTTTGGGATATATTGTGGAAAGGGGTCCGATCCCC
CTTCTTGCTGGCCATAATATAGAAAGGCAGGGCAGCGTCCGTTGGTGGCC
AAAAAGGGCACTTTTTCTTGTGTTTTTCTGCTAAAAAGGCTGTTTTTGCC
AAAATTTTAGAGATCTCAGGAGGGGCAGCCGTCCAATGACCATACGCTAA
AAGGGCATGAAAAATGGCCAATCCCTCCAACCTTTAAAAATGCGTATCCT
GAAGCGTTTTGGACAAAAATAGCTAACAAATATATGTGAAATATCTTTAG
AGAGAGAAAGCGAAATAATAAATTTCTTTCTTCTTTTTGCTGCATGTTTT
GAGTACTGTAATAAATAAAGGTGCTACAGTGTAGTATAATAAATCTTTCT
GAGATCGACAAATTTTTCTATTTATTATAGAAAACTGTTTGTTGGTGGTT
TGGCTTGGGAAAGTAACGACGGTTAGTTAATTCATTTTTTGTCACATTTT
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GGAGTAGAATATTGAATAGATTTTTTGTCATATATCTTCTGAGCCTATAA
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GGACCCAACAAAGCACAGGTTTATATTTATTCTAATTCTGTCCCGTTTTT
TGTTTCCTGAACACAATGTATACACCCTATTATAGTTAATTGATAAACTT
TGATGGGTGTAAATACCTGAGTATTTTCACAGATGGTGTTATACTGTAAA
TATGAGCAAAGTATTTCGTTTCACTCTCATAATAAAGTCAAATCATTATC
TGATTTTCTTTCAGGGGCTTTTGTTTTGTAAAATATTTTCACCAATCCAG
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AGGTATGATCATAGAATTCTCAAATCTCTCTCAATTGCTAAATTGTGATT
TAAATTGCTTGATAAATATTTGTCTTTTTTAAAAGGCCTTTAATGTTATT
GTATTTTTAATGGTTATTTGTATAAAGAAGTCTATATTTTTGTGATATTT
TTGTATTTTTGCACCACTCACCAGGACTAAAAAATAAACAACGGATTGAA
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TTGAATTTATACCTTTTTTTTATTATGTAGTCTTCGGTAATATCTGGTAA
TGTTCTTTAAGGACGGTTTTTCACTCGAAACTTAAGACGCGATTTACTCA
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CCTATTGGTGTGGTGAGTAAAAAAATCTACTCCCTATTTGACACTTAAAA
GTTTTTACGAATTATGTTTACGAAGTAGATTTTGATATTCATAAAGAGTT
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TGAGATAAAAATTAGTATGGTAGAATTGGAGATTTTGAATTTGCCACCAG
AAAAAAACCGTTCGAAAACTGGCCAATCAGAATTTTGTTGCATAAATTTT
TTAGGAGAACAATAGACATAATCGGCCAATCAGAAGCGTTTCTACAAAAA
ATTGTAGAATTTTTTTCTCCAAAACTACCCGTCTACTATCGAGTTCAGAA
AAAATCGTGAGTAGACGGGGCCCCATCTAGAGTTTAAACAACTCTTAGGA
CTTATTTGGATATTTTCTCCCTGTAAACAAACACTTTTTTACCTTTAAAA
AGCAAAATTGGTTGAGAACATTATAATTTACAATATTTTTTCAAAGCACA
AATCATAGACAAAATAATCATTTTGCGCTACTGTACCAATAAAAAAATGA
ATCATTGTTTTTTTAAACCACTTTTTAGAAACCAGAGCAGAGAACAAAAA
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AAATTCATTTTGATAAAAAGTTGCCAAAATAGTAAATTTTATTTTCAATA
ATCTGATTTTAAATGTACTTTGGGTGCTTTAGGTGAGTTAAACCGCTAAA
AATAAGGATTTTTTTTCTCAAAAATAAGGATTTTTTTCTCAAAAATATTA
TCTTTAAGGATTTTTGCTTTTAAAAGTGTTGCATACATCTGCACTTCAGA
TTGTGAAAGGGGTCTTTTGATAATATGAATCTTTCTTTAGATTTTGAATA
ACATAGAATATGCACTTGATCATCACACAAAGAAGAAAAGAGGTAAACCT
AATCTTTTGATACCTAATTTTTTCCTGAAACATTTTAGCTTTTCATTTTT
AATTATCATTGATTCACAATGATTATTAATGGGAGGGTTTTATGATTTTT
CACCTGTGTCTTCACTCAGTGAAAAAGTGAAAAAAGGGTTTTCTTGTCAT
TTAGAAAATTGGCAAGAAGTAATGATTTCAGATTCCTTACTTTTCTTTTA
ATGTTATAGGGTTCTGTTTCATCGAGTTTGCAAACGAGGGAATGGTTGAT
AGAATAGTCAAAGATAAATATCATTACGTAGCTGGTAAAAAGGTTAGTGT
TCTAGATGTTGTCTTCCGTGAATTTTTTTGTTGACTTCATTCTCCACAAT
ATTAATAGATAATAATATAATTAATTAAAATTCAATGAATATTAATTTAC
ATCTTGCCATGCTCGGGGAGGAAGGATTACTAGGGCAAAAAGGGGTACGG
AATGTGCCGCTGGTCAGGGTACCTTTTTGAGAAAATTTTGGAATTTCAGT
CCCATTCAGAGTCTTTTTTTCACAAATTTTGGCAAAATTTTCAAAAAAAT
AGGTCCCATGTAGTAACCATCCCCCGGTGCCACGCTTCCTAAGCTTGACA
GTTAAAGTCTCTGATGCTCTTAGCATAACATTGGTTTTGCTTAAAAGAAA
CCAGTTGTGGCCTGGTTCAGTGCTCTGTATAAATAAATAGGTCAAAGTTT
GGTCATGTAAGATTTAAAGTTGAGAATAGTAACACAAACTTTATTGACAC
ATTTTTGAATCACCCAGTAATTAAGTCAATCCTGCATGATCAGGTGAATC
TATTGACAATGAGGACTTGACTTTCAACTACTTCTATTTTTAGCTTGAAA
CAAAGAGGGCATTAACCAAACAGCAGCAACAAGAAATGGCTGCCCAGTCA
GGTATTTTACTGTTACTGATCTTATAGAGTTAGCTTATTTAACAAGATAA
TTTGTAACTTTCGACAATGTAAAAGACGACCCACTCTTATCTAAACTAAA
GCTATGATGTTTAGCTCGTCCTCTCTGCAACAGGGGCTAGTATGATTTTA
TTGTTTTCTTGCCATGTAAAACCTGTTGACACTATTGTTCTATCTTTGAA
TACAACTCGTTTTCCTTTTTATAAAAGTACATTTTTTAACATTATGATGC
GTTTTTTCGACAGCAACAACCAGACTACCGGCAAGAGCTGCTGCCCTCTC
GTATGCTGGTCTCCCTATAGCTACAGCCGGTGCTGCTTACGCACAACCAG
TCATCTACATTCACCCTGACTCGTTATCAACAAGCTATCCTCTACAGGCC
TTGGGCATAACAGCAGGTCTATCTGCGGGATACCCAGTAGCATCCACTGG
TTATACGACATCTTTGGAATCACTTTATTCACCTTATGGTGGGACGACTG
GAGCAAGGGATAGCAGAGATAGTAGAGATAGTAGACCAGGTATGTTTTGA
AACTTTTATACAAACATTTATTCAAAGTGTGAATAACTGGTTCCTTTATA
GGATACTTACCCTTTACGTTCTTGTTAGCGAGTTCGTGTATCAAAGGAAA
TTGAGGGCGACGGTGAGTGTATGTCAACACAAAACAAAGTCGCTAGTTGA
TGTACTGCTCTGTTTCACCTTTGCTCACCCAAACAAACGAGGTTATTTCG
GCGTTTTTACCGTCGTCGAGCAAAAAGTGGATGGCAATTTTGGTGAAATG
TCAATTTTGCTTTATACCGTCTCCTTTGAATTATCTCGGATACATAAACT
CGCTATCACTTGTTGAGCGATTCATTTATTAAAGTTTGTCTCAGTAAAAT
CTGCAGTGGAAACAAGAAATACGAAGTCTAATTGTAAATATCTTTACACA
ATTTAGTAAGAAAGTGATGTCAAGATTCATTGCTCTTTTCGTTTCAACTG
CAGATTGTTTTAGAGACATAATTTATATCTTCATGCATACACACTAAATT
CTTTCAATAAAGATTCTATGCAATTTTTATTTGATTATTTTTACTCTTTT
GTTTTTTAATTTTTGATTCATTTTCAGCTCCAGTTTTGCGGTGGATCAAC
CCTGCCCTTATCCCACGGTTCCCTTTACCCCCCAAACCCTTAAAATCACC
TTAAGTAAACATTATTGTCATTAAAGAAGTAATTATGATAACTATAATTA
CAAATTGAACAAACCTCAATAATATTTATTTATTTATAAAGGTGATTAAA
TCACTCGATTAAAAGTAAAATTTTATACCTTGTAAGAAGAGACGATGTAA
ATTTATTTTGATATACACACATTTCACACACACTTCATATTGCAAATATT
TTAGTTGATTTCAGGATAAAAAACACACTGTTTAGGTATACAAATTTCCA
AAATTTTTTAAAAAAATTGGGTTCTTTCAAATGTATTTGAAAAATTCTTA
TCGAGGCAATTCGCGAAAATCGAAAAGAAAATCTATGAAATTTTGAAATC
GTTAAAATACTTTTAATACTCGTGAAAAAATAACAATTTTCATAGTATTA
TTTATAACCCTTTTTAACACCTTTTTGAAGTTAGAGAACAGACGTATTTT
TTGTCATTTTATTAAGCCGATCTCCGTTGGAAAATGTCGCCTCGCGAAAG
TATGTATGCCTAAAGTAACTGTTTCCAGGAAGTTTCAAGCATGACTTGGA
GATATGACTTCGAGGTTTGTTAGAACAAGTTCTCCTTGGTTAGAGTTGAA
ATTATTTGATCGAATTCAAACCTTCGATATCAAAAGATAATATTATTATG
TTCTTTCAAGTATTCAAGTATTTTAAAGGATACTTAGTGCACTTTTTGTG
TTAGATATAAAAATGCACAATGATAATTATAACGTAGAGTAAATATGACA
GCTATTTAGTCATCAAGTAAAAGTTATGAGTTACTGTATGTATATGATTT
AAGTTATTTCTTAATGCTCAATACTATTTTATTAGGGTGTAGTACTTTTA
ATATAATTTTTTTGATGTTTAGATAATTTTGTGTTTATGTTGCACTCATG
AAAAGTAATTTTGAATCAATTTAACCTTTGGTTGCCCTTAATATATAATA
GTACATAAAATAAACTTTTAATCATCTATCAAACTGTATAAAAAAGCATG
GAATGGGGTTGGAGTCAAGCCCTTGGCTGCGTTCGCAAACATATGGAGGT
CATTCTACCCCTGGCAAATCAAAATCCAATAACCTGTAGTTGTTGGCATT
AACGAGGAAACCATTGGCTGGTAATACACTTGGTTGTAAATACATTTTAT
GGTATTGGAAATGGAATTGCTAAAACAAGAGTTTTTTAAAATGAAAATTA
AGAGACAATTGATTCCATTGAAAAAATTTGATTTACCTATTTTTTATACT
TTTAACTCTAAATATATTTTGCCTCTAAAGTGAATTTTCTTATTATTTAT
AAAAATGACAATTTACTTTCAGCTGATTTTTTCAATTACTTTTTCTTTTT
CATGGCTTTGTAAAATCTCATTTTGCTTTTGATACTTAAATGAGGCCCCC
CAGCGGTAACTCTCATCACGATATCACGCAATTTTTTGTCTTCAATCACG
ATCACGCAAATCATTGAAAAAGTCTAAATCACGGCTCAAAAATCTTTCAA
ATCACGATCTCATCGCGCAAAGAAAAAAATCCAAATCACGTTATCACGCT
GCAGAAAAGTCCCTATTACGTCATCATAAAAACCGCTTGGGAGGCCTCTT
TAAAGTTTTGAAAGCGTTCATCGAGCCTTTTTATCTCATCTTTGCCTGAA
GAATTTTTTGGATAATATTATTGTACATATTTCTATTAGTTTTGTATTAC
GATTTCATTTTTGTTTTGTTCAGTTCTGTTCTGTTATCAAGAGAGGCTGT
TTCAAAAATGAGACAAAAGAGTTTTTAAACATGCTTAAGATATGTATTAA
CCAAAATTTATCAATCAGCTAGATAAAAATTTCTTTCCTTATAACTATTA
CCTTAAGTGGATATTTTTTCCTGAGCAGATGTTTTCGCGAGAAAAAAATC
AAAAATGATTTAATTTTCGTGGGACTTATTTTCGCAAATCGGCCCCTTTT
TTAGCTATTTTCTCTTCCATTTTCCTAGAGGTATTAGCAAAAATAACTAG
GGTTTTCGTCAAAGGTTCTGGTTTCAAATTTTTCGCGAGCTTTAAGTATC
TCGAATTTTCGGAAAAACTTAATCATAAAATCCTCGCGTAAATTAATCCA
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TTTTTTAAATTTCTTTATTAAATCAGTTTCGCGTTTTTGGAACAGCTTCA
CATAGGCCCTTTATGCTGTATGATAGTGTTTTTGAAAAGTAGTTGTGTAT
ATTTTGTAATTGCGAAAACTATTATATTATGTTTGATATACACCTGCAAA
AGAAATTTTTTTTAAACTACAATAATTTTTCTTTCCGATGTGCTGTCCCA
TCAAATATCCATACATGGGATGGAAGAACCTTTTCAAGGCAAAACAAGAT
TCTTATAAATGTGTGGATACCCCCTGGAAATTTTAGAATTAGCCTTTTAC
TCCTTGGAAAAATTTGAAAATACTCCTTTATACTCCCTGTAAATATACTC
CCGATTACCCTTTGGAAATGTTCGTCCACCCTCTGTATGGATATAAAATT
GTCAGCCAATTGCCAGTGTTCAGTGTATCAAAGTCAGATATGTTAGATCA
TTAGAAATAATCAAGGGATTTAGTGAAGCACTTCCATAATGGATTTTACA
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CGAAACTCTATGGGAGACACAAATTCGTTCGAGTTAAGGAAATTTCGAGT
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GTTCGAGTTATAGAGGTTCGAGTTAAAGAGAATCCACTGTAGTAATTTAA
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ATCTCGTCGCATTTTACATATAATGTAAAGCTTTTCAAATTGCAAATGGT
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CTGGGCAGGAGGGTAGCTTTTTGTGATCAAGACTAAGAAGAGCTTTTTAT
TTGCTATCTTTGAAAGTATAATCAATTGAATGACCGTTGAAAAGACTTGT
GTGCTTTAAATATTTGAATAAGTAAAGCTTTGAAGGAGGCTTTTCAATTT
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GTGGTCTTTTTAAAGAAATTTCTGTCATTCCAAACTCAAATCAACTTTCT
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GTTTGCTTTTTGGGGTCACTCGCATATCGAGGTCTCCCACAATAAATGAC
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GTTTGCCTTCTTAACTACTATATTATTTTTGGTCAACCCGGTATAGCCAC
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TTCGGCATTGTTTACAAAAGAAACATTTTTAACCATATAGGGTACACACA
GGGTTTATTGGGTAACCTTCAACTTCAGATGTATATTTATTTTTTCGCAC
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AGTCTTCTTAGTTTCTTTCTATTTCAAATTTTGTTTTTATTATGTTTTCT
TTTTTGGGATTCTTGAACTCTTGACTATAGCCTTTCATCAATCTCGTTAA
CTAGCTTTGAGTTTCTTAGATTCTTAGCCTTGGTACGTGTAAAGTCTCAG
ATACGTTTAAAACTAGCGGCCTTACGTAAAAAAAAAGTTTATCAAGGGTA
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TTTCATATTTTTTGTTGCATTCTTTTTAAATTCACAAAAAAACTTTGAAT
AACGATACATCTCAAATTTCTTTTAAATTGTTTTG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_038605	XLOC_038605	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_359	supercontig	scaffold_359:111651..130935 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
21.3361	20.4356	53.4384	54.9793	8.13815	6.03492	34.856	32.8269	24.6067	26.0534	14.3435	15.6054	5.37074	7.12903	9.36311	13.0932	16.381	16.1856	5.58224	4.12337	13.0858	11.5739	11.5726	11.0224	19.7316	20.4472	9.50644	5.14084	6.76638	6.04439

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00061533 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: HNRPD (Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0 OS=Homo sapiens GN=HNRNPD PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 136.732 bits (343), Expect = 3.013e-35
Identity = 77/190 (40.53%), Postives = 115/190 (60.53%), Query Frame = 1

Query:  214 YARDEPRHTD-----DDEGKLFVGGLAWESNDASIKDYFGQWGPVESVTLKRNKEDPT--KHRGFCFVKYFHQSSADACLSKKDSHILDGSKIDPKSACPIGVKPEQRTKKIFVGGLQTETTDDALRDYFSQFGEILNNIEYALDHHTKKKRGFCFIEFANEGMVDRIVKDKYHYVAGKKLETKRALTKQ 762
            ++   PRH++      +E K+F+GGL+W++    +KDYF ++G V   TLK    DP   + RGF FV +    S D  + +K+ H L+G  IDPK A    +K ++  KKIFVGGL  +T ++ +R+YF  FGE+  +IE  +D+ T K+RGFCFI F  E  V +I++ KYH V   K E K A++K+
Sbjct:   79 HSNSSPRHSEAATAQREEWKMFIGGLSWDTTKKDLKDYFSKFGEVVDCTLKL---DPITGRSRGFGFVLFKESESVDKVMDQKE-HKLNGKVIDPKRA--KAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEV-ESIELPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKE 261

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00061533 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00061533 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
HNRPD	3.013e-35	40.53	Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0 OS=Homo...	[more]

You are here

TCONS_00061533 (transcript) - C. hemisphaerica