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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00061208 ID=TCONS_00061208|Name=TCONS_00061208|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5535bp ATCCATCCCAAAAGTGTTTCTGATGCTTCAAGCAGAATGAATCTAAGGTC TATGTGAGGCGATATCAAAGattttcatagaaaaattaTGCGACTTTTAC CACTCTTATGTCTTATGGTCTTTATTCCATGTGTATTTTGCCGAACAAAA GACTGGCTTATCAATGACATCACTACCccttctgattggctgaaaaacga agatgGTAGCTATACATTGACCAATGGGCTAATCAGTAGAACCTTTTCTA CAAGCCCTGGGTTTACAACAATCGATTATTACTCTCATGAGAAATCAACG TCTTTATTACGAGCTTTAAGTCCTGAAGCTGTTCTCAAACTCGATGACGT CATGTATAATATTGGTCACGTGATAACAAAAATGTCACGTGGTTATTTGA ACCGAACAGAACTTTCCGAAACGATTGGACATGATCCTGCCAGTTTCCAG TATGCCGGCCACAGGACTCATCCGATCGAAGTTGATTTTCCTTACACTCC TTTGAGGGGTGCACCGCCCAATATCCATTGGCCACCCAAGGGCGTTAGAG TAGATGTGATTTTCAAAGCGCCCCAGTCCGCCCCTACCACACATCAAGGT ATTACTGTCACAATTCATTACCAAATATATGATGGTATACCAGCAATGTC CAAATGGGTATCCGTCCAAGCCGACCAAAAGGTCTGGGACCAAGTCACGT GTACTTTAGTTTCGATTGAGCTTTTAGCTGTCAATCAACCATTCTCAAAA ATTTCAACCTGGGATGGATACACGTTCAAACCTGATGGTGCTGATAATGC ATATGATTGGTTGTATATTGATCTTAATCGACCCTACGGTGGCTTAGTAA CCTGGCTCCAAGATCCAGCTCAAGCCCAAGTCGCTGGCTCTTTTCAGCCG TTACTTAACGTCTCTAATAGTGTGCCAGTACCAGTGGTAAGCGTTGGGAA AGACGGTTACACATCATTTAAAGTGAACGAACTTATACACTGCTCTGAAG ATCCTACACGAAAATCGCTATCTAAGAATCgacttttgaagcttttggcA CCTCATGTTCAAGAGAATCCGATTTTTTTTCACATGACTGACTCGAGAAG TGAACAGTTTCGCGCGACTGTTGACCAATTAGCTGAAGTGGGGTTTGAAA TGATTATCTATAGTTTTGGGAGTGGCCTTTATATGGAGGAGGAGAACGAA ACTTATTTGGATGGTGTTCGTAAAGATGTAGCGTACGCTAACAGTAAAGG AATGGAGGTTGGAGGTTACGATTTGATCGTTTTGGATCGTGGTGATTTAC CGAAAGAAATGCGTGCTACTGATGCTCAAGGTAACCCTGGAGGGAATGCA TGTTTAGCTTCTGAATGGTATGAAACAATATACGGGAAGTTGTTGAATTT CATGACTAAAACCAATATGACCATGGTAGAGACTGATGGCCCTTATGGAG GTGGTTCGTGTCATTCAACTACGCATGCGCACCACAAAGGATATGGTGAT TCTGTTTACAAGCAAAATATGCTTCAAGAAAAAATGTATAATGAGTTTCG AAGACGAAGTTTTTATATCAATTCGCCTGATTCTTACTACTATGGTGGTT CTAATCGTAATGgactAGGTTACAATGAGAATCAATATAGTCTACCTCGT TGGATGGACCTTGGTATCAGTCGGCAAACTGTTTTTGACCGTGTGTACTC AGTACCGCCAACCGCTGGCTGGATGTTTGTGCCACTCCAAGATTATCATG GCGGCGGAGAAGCAGCGGCTTTTGAACCGCTTCAACAACATCTAGCAGAA TTGAATTTCGCTTTTGCTCAGTATTTAGGTGCAGGTGTTGCAGCTTGTTA CCGTGGCAACCGTATCTATGATAGTGATGCTACGAAAGAGCTAGTTCAAC ATTGGGTATCGTTCTACAAGAAATATCGAGCATTAGTTACGAGTGATATA ATTCGAATTACGAGACCGGATATGCAGAATATCGATGCTTTTATGCATGT TAATTGGCAAAATGAAGACGATAAAGCCTTAGTAATGGTTTTTAATCCAA CCGCTGAAAAAAGGAACGTCACTCTGGGAGTTCCGGTGTATTATACCGGT ATACGGAACAAGGCTTTGGTGTCGGAACAGGAGGCCGGATATGTGCTGTA TGATATTGGTGTTGGTCCGCAgggaattgaaattgaaatagaAGTCGCAT TGGAAGCACGCAGCACGACTTGGTTCAAATTAAAGCCGACTACGTCATAA TGTTTTTTTACGAGTGCTGATGATAAACAACGATAACATTTAAACGAAAA TTAATACACgctgtctttttataagaatagtgtgcTTTGGCTGAGGgcga gcattattcttatttttctattgttctaaacaataggcctattgttctaa ctctgaaatatcaccctgatattcttatagaagttattcttataaaaaaa gtgtgtactaAAATCAGATAGATTTTCGTGGGTcaggattttgaaaaact aaatcACGCGAAAATTCATCCGAAGGCTGTACCGAAAATTACGAGGTCTT TTAGGGAATAACACCCGTAAATGGTCGGGATATTAGATCGCAAACTAAGA ATTAATACAAAggtaagatttttttgtttctcttttaaatatttcataaa aagtatcaaaaattatataacagaaattaaaatttatatattaaaaattg gaaaatattcTAGTACGTTTATATATTTTTACGATTCtcgtatgttttta ttgcatgGTTACTGTTTTCGACGAAGGTGAAATGAACGTCTTTTCGTGGT TTTATCGTCACGTGATTTTGAGGGCGGCTTTGGTTCATTTGTATCACTAT CCGGTTCGTCGTCTCGTTTTAAATATTTGTTACGTTTGCTTCCTAAACTT AGTCGAGGTAAACTTGGTAAAAATCTACTTGCAGCTGACAGTTTTGACTG TTTCTTATTTGTACTGGAGCATGCAGCTTCGGCTGctttggattgggctt catgatCTAAGCTATTGGTTTTATCAGCATCTGCAATTTTAATTGTAGAA GTTTTCTTTTGTAGACCCTGAAGCAAATTCTCGTGTTTCATGGTTTCTCG TTTCCTGGTGTCATTGTTTTGTTGGTAAATCGTAGTCTGGTCTGTGGGCT CCTTCTTTTTCCGACGTTTTGCAACCGTCTCAGATACGCCTTCAACAAAC ggagttttggactttgtactaCAGGCTGCTTTCTTTCGACCACTGCTGCT ACTTGATTCCTCGTCATCTAATCGATCAAGATTCAATGGTGGTACGAACG TTGGGCGGGGCCTTCGGACACATTCCGCAGGGTGGAAAATAGGAAATTCC CGAGGTGAAGCTGATGGTGGACGTGGGCTGTTTTCCGGGGATAAAGATTC TCCAAAATCAAGAGGTGGTATATCAACTCTTGGTATGTTTATTTGCATCG TATTAATTCCTGGTGATTTTACCGTGTGAGTAAGATCTTCATGATTAGCT TGCTGCTGGTTGGGATTACATTGTTGTGTCATCATCTTTGGACGATCTGT GCTCACCAAGCTGGTCCTATCTTCGGATAACCTTGGCAGACCTTCGTGTA GAGTTTCATCGTTGTTGGTTTCCCTTGTTGAGAAATCAGTTGTAAAGCGA TCTTGTTCGGCTTCAAGGGAACCATCCGAGGAAGTTGGTATGCTTTTTGA TTGACCTGTTTTATGCCGAGTTCGTGTAGTGCGTTCTTGGCTCGGAGGTT TTGGTGCGATTCCAAAAGTcgcttcattttttgttttttcttgatcTTCA GGGAGAGACCACGGTGAAGGGACGTTGGGTGTAAATTCTAAGTTTTGTGG GGCTAATTTACAGTCAATCAATTTCTTGCGTGAGTGGAGTTTAATGCAAT TAGATTTCAGAAACGCCCGAGTCTTTGGTGTAGGAAGTGAAAAAGATGTA AGGGTATTGAGTGACTCATCCATGCCTTTCGTACGGCTAATCTCGCCTGT CCGTGGTTCTCCCATTGTTGAAGATCTGACAGTGagttcaaatttgaaat aatgCAAACtggtttttcgtttttcttttttctttcctgTTGAACTTGAT TCCTGGACAGAagtattttcagttttcaatgaCATGTTTGACGATGTGGC TTTCAGCTGGTGATCTTCTCCCCTCTTTGTTGACTGTTTcgtctttttct ttctctttggTACAACTGAGAGGTGTTTCCCAGAGGCTGATATGTTTTGA TTACCATCAACAGTGCAAAGCTGGCTATCAGCTCTTGAATCTTCACTGTT TACATCCTTCTTTGGGACAACCTCTTGATTGACCGAATCAAAAACTAGAG GAGATGGTTTCGATAACTTTTTAGTTGGCTTTTTAGATTCAANGCCGAAT CAACAACTAGAGGAGATGGTTTCAATAACTTTTTAGTTGGCTTTTTAGAT TCAAAATGTCGATTCAAGGTCTCTTCGCTATTTTGGGTAATCAAGGCATT GATCCGTGAGGGTTTAATAGCTGACAAAGGGCGCTCTTTACCATCCAGTT GGTGTTTTTCGATATCTCCAGGTAAGGGACTTTTGGTTGTCACTAGAGAC TGTTCGCTGTTTTTAACAGACACGTGATCCGATTGAGATATGTCGGTCAC TTCAAATGCTGAATCTTGTGAGGGTGAGATTTCAACTTTTAAAGGGTGTG TAGTGTTCGGATTGACCAATGAGCTCTCATCTTGCTCTGACATAATAGGT AATCCTAATCCGTGTATCCCGGCTTGACTTGCATTGTTTCGTCTAAAACG ACTCTCAAACACTGGAATCTTACTTCCAGTATTACAACCACTAAGCCATT TAAAAACTTTATCAGAAGAGCTGATACGCCCAGGTGATGTCAACTGGCTT TTGATAGGCATTGGAATACGACATGGTAACGAAAGAGTTTTTAATAGTTT AATGTCTTTTCTGACGTCTTCCGTAGTCTTAGAGCCACGGACTCTAATTT GCTTTGTATCGTCTTTATGTAGAGCAGCGTATTTGCCTCCGTATCCCGAA GACTTGACGTCCGATAGGCTCTTATTGATACTTTCATTTGGTGTAGTAGA TGAGACGGAGCTTGACTTGACGGGACCAAAACAACAGTGTGACTTCATTA AGAATTTGCTGCTGTGCGATAAGCTGTTCTCTCTGGGTACTCCCGACGCT GAGGTAGGCCTACTTGTTGATGAGTTTGGACGTACCTTAGATTGGAGACT TTGCGTTTTTTGTTTGTGCTTTGTCTTCTTTACTGGTTCCAGGCTAGTCT CCTCTACATCAGGATTAGTCTGGCAGTTGTCGTGCTGCTGAGAGTTTGAG CTAGTTGATTTACTTTTAGTAGCTTTCTTTTTggtttgaaaagctttttt cagATAAACCTTCTCTCCAATTTTGATTGGTATTGCCTTTTGACGTTTAC ATTCTTTATCTGTTCTCACCTTGGCTCCTTGTGAGTCATCCTTCTTAATA ACGATTGGTTCAATTCCCTCGATCCAATCCTCAAG Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00061208-protein >TCONS_00061208-protein ID=TCONS_00061208-protein|Name=TCONS_00061208-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=720bp
MRLLPLLCLMVFIPCVFCRTKDWLINDITTPSDWLKNEDGSYTLTNGLIS RTFSTSPGFTTIDYYSHEKSTSLLRALSPEAVLKLDDVMYNIGHVITKMS RGYLNRTELSETIGHDPASFQYAGHRTHPIEVDFPYTPLRGAPPNIHWPP KGVRVDVIFKAPQSAPTTHQGITVTIHYQIYDGIPAMSKWVSVQADQKVW DQVTCTLVSIELLAVNQPFSKISTWDGYTFKPDGADNAYDWLYIDLNRPY GGLVTWLQDPAQAQVAGSFQPLLNVSNSVPVPVVSVGKDGYTSFKVNELI HCSEDPTRKSLSKNRLLKLLAPHVQENPIFFHMTDSRSEQFRATVDQLAE VGFEMIIYSFGSGLYMEEENETYLDGVRKDVAYANSKGMEVGGYDLIVLD RGDLPKEMRATDAQGNPGGNACLASEWYETIYGKLLNFMTKTNMTMVETD GPYGGGSCHSTTHAHHKGYGDSVYKQNMLQEKMYNEFRRRSFYINSPDSY YYGGSNRNGLGYNENQYSLPRWMDLGISRQTVFDRVYSVPPTAGWMFVPL QDYHGGGEAAAFEPLQQHLAELNFAFAQYLGAGVAACYRGNRIYDSDATK ELVQHWVSFYKKYRALVTSDIIRITRPDMQNIDAFMHVNWQNEDDKALVM VFNPTAEKRNVTLGVPVYYTGIRNKALVSEQEAGYVLYDIGVGPQGIEIE IEVALEARSTTWFKLKPTTS Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_354:912117..922652- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00061208 ID=TCONS_00061208|Name=TCONS_00061208|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10536bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_354:912117..922652- (Clytia hemisphaerica) ATCCATCCCAAAAGTGTTTCTGATGCTTCAAGCAGAATGAATCTAAGGTC
TATGTGAGGCGATATCAAAGGTATGTTTTTTAGGTTTGGGTATGTTTAGC
GGCGAAAATATTTGGTAATGACTCCAAAAGCATTACATGTTAGCGTCAGA
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TGGGGACGTTTATTCTACCCAACCTATGGACGATGTAAAGTTCCCATTCT
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CAGTACCGCCAACCGCTGGCTGGATGTTTGTGCCACTCCAAGATTATCAT
GGCGGCGGAGAAGCAGCGGCTTTTGAACCGCTTCAACAACATCTAGCAGA
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TAGTCGAGGTAAACTTGGTAAAAATCTACTTGCAGCTGACAGTTTTGACT
GTTTCTTATTTGTACTGGAGCATGCAGCTTCGGCTGCTTTGGATTGGGCT
TCATGATCTAAGCTATTGGTTTTATCAGCATCTGCAATTTTAATTGTAGA
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CGGAGTTTTGGACTTTGTACTACAGGCTGCTTTCTTTCGACCACTGCTGC
TACTTGATTCCTCGTCATCTAATCGATCAAGATTCAATGGTGGTACGAAC
GTTGGGCGGGGCCTTCGGACACATTCCGCAGGGTGGAAAATAGGAAATTC
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CTCCAAAATCAAGAGGTGGTATATCAACTCTTGGTATGTTTATTTGCATC
GTATTAATTCCTGGTGATTTTACCGTGTGAGTAAGATCTTCATGATTAGC
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AGAGTTTCATCGTTGTTGGTTTCCCTTGTTGAGAAATCAGTTGTAAAGCG
ATCTTGTTCGGCTTCAAGGGAACCATCCGAGGAAGTTGGTATGCTTTTTG
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TTAGATTTCAGAAACGCCCGAGTCTTTGGTGTAGGAAGTGAAAAAGATGT
AAGGGTATTGAGTGACTCATCCATGCCTTTCGTACGGCTAATCTCGCCTG
TCCGTGGTTCTCCCATTGTTGAAGATCTGACAGTGAGTTCAAATTTGAAA
TAATGCAAACTGGTTTTTCGTTTTTCTTTTTTCTTTCCTGTTGAACTTGA
TTCCTGGACAGAAGTATTTTCAGTTTTCAATGACATGTTTGACGATGTGG
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TTTCTCTTTGGTACAACTGAGAGGTGTTTCCCAGAGGCTGATATGTTTTG
ATTACCATCAACAGTGCAAAGCTGGCTATCAGCTCTTGAATCTTCACTGT
TTACATCCTTCTTTGGGACAACCTCTTGATTGACCGAATCAAAAACTAGA
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TTCAAAATGTCGATTCAAGGTCTCTTCGCTATTTTGGGTAATCAAGGCAT
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TGGTGTTTTTCGATATCTCCAGGTAAGGGACTTTTGGTTGTCACTAGAGA
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CTTCAAATGCTGAATCTTGTGAGGGTGAGATTTCAACTTTTAAAGGGTGT
GTAGTGTTCGGATTGACCAATGAGCTCTCATCTTGCTCTGACATAATAGG
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GACTCTCAAACACTGGAATCTTACTTCCAGTATTACAACCACTAAGCCAT
TTAAAAACTTTATCAGAAGAGCTGATACGCCCAGGTGATGTCAACTGGCT
TTTGATAGGCATTGGAATACGACATGGTAACGAAAGAGTTTTTAATAGTT
TAATGTCTTTTCTGACGTCTTCCGTAGTCTTAGAGCCACGGACTCTAATT
TGCTTTGTATCGTCTTTATGTAGAGCAGCGTATTTGCCTCCGTATCCCGA
AGACTTGACGTCCGATAGGCTCTTATTGATACTTTCATTTGGTGTAGTAG
ATGAGACGGAGCTTGACTTGACGGGACCAAAACAACAGTGTGACTTCATT
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GCTAGTTGATTTACTTTTAGTAGCTTTCTTTTTGGTTTGAAAAGCTTTTT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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