TCONS_00060891 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00060891
Unique Name	TCONS_00060891
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2535

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_349:685222..699196-

transcript sequence

>TCONS_00060891 ID=TCONS_00060891|Name=TCONS_00060891|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2535bp
agaatcttttttcaaaatgtgattTTATGTAAACAATGTCACGAAAAACT
TCGCTATCAACACGGCGTAAATTTAGTTCGAATGTCCGGAAACTATCTTC
TAGTTCGAGTAGTGTTGGTGTTGTTGTCGATGgcgtgagaaagaaaatct
caaATGCTCAGCTTTCTTTTCCAGGGCAAGAATACTTGGACGATCTTTAC
GAAGTCGCTCGATCACGTGATGACCCACTACTCTTGGAATCATTAGAGAA
CTTCTTATCAGCCACTGTAGATAATTTACTTAAAAAACAAGCCGATAATG
AAAGGTTGGATGCCGCCCTCAAACACGCAAAAGATCAGAATACAGAGATC
GCCGCACAGATCGAGGATGAGATGGAAGAACAGGTTGCCATTATGGAAGA
AAAGATACGTCAAGAAGAAGAACAAaagctgactcagcaaaaacaAGAAG
CGCATGCGCAATTACAAAAAGCCAACGATGAGTTGGGAGATATGGAACAC
AAAATTATAGCTttGGAAGAGAAATTGAACGAACAGAAGATCAAAGAAGC
ATCAATTCCCGAtcattttatcgataaaatacAACGTAAAGAACAGGAAA
ATCAACAGCTACAAGCCAAACTTTTAGAATTTCACACCCAGATGTCGCTC
ATGCGGACAGAAGTGGCCGCGCTGAAATCTGAATACGACGAACAGAGTTC
ACGTCTCCACAATGAGAGAGGAACAGTATTGAGTTGTGTGAGAGAACAAG
AAAATTTGACAAGACAACTTCAAATGTTACACGAAGCTAATAAGAGACTG
CATGATACGAATGATGACCTCAGATCTGCTCTTGATGTCAAGCGAAGTAA
CAGCTTTATGAACGAGAGTTCCATTTCACCGTTGAAGCGTTCACAAAGTT
TCGCTCATCAACAAAATCCACTTTTCAAACACGATCTACAAAGTTCATTC
AGAAGTGATCCTGGGTACGCTCGTCATCATTCCACTTTAAACAACACCGA
CTTTAACGACACTGATGACGATTCACGTCAATCATTCTCACGTGACGATG
ATGTCATTGATGACCTCATTGacaacgatgacgtcatcaatcaacAATCA
TTAATGGCGGAGTTAATGTCAGCTGAAGACCAAGCATTTGACCATCCACC
ACGCCGGCGAACAGGATCAGCCTTAAGCAACCTCAGTGGTAGCAACTTGA
GTAATATCAGTGAACGAGAACAGTTTGCACAGCAGTTGGAAATGTTGGCT
GAAACGAATCGAAGACTTGGTGAATCGAACGACGATTTGAGAAACGCTCT
TTCTcttttgacAGATCACGTGCGTTCTCAGTCCGTCTCTGAAAGGTCGG
AAGGTCCTTTAAGCCGCCGTGATGGGTCCGAAAGATCAGACATTTTGACG
TCACGAAGAGAGTCACCACCTGGTTGTTATTCAACGCCCTCAACGCCCCT
GAAAAGtGAATACACTGAGCGACCACGTCCAAACAGTACCAGTTCACCAA
GAAAAGTTATCTTAACAAAGAGTGGGTATCATTCGcaAAGTGACACATCG
ACTGCTGAAGACACAACAACAAACGTGGTTTCAAACGATGACCAAACACT
CGCTCAAACAAAGGAAACATCAAGCTTTTGTACCACTTGCGATGGTGATA
CAAAATCAGGCCTCACGAACTGCCCAACCTGTGGTGAGGGTGACGCGCCC
GAAGATACCGCCCATATTTTAGAAAACGTTTCATGGGATGAAACCCCGCC
CTTTTCTTTACGCCCAGATACGCCCATAAGTGGGCGCGATCGTAAAAACT
CCGTCCTGAGCAACCAAAGTAACCAAAGTCCGTCAACATCTAAAATACCA
ACACCAAGATCTATGAACAGCCCACGATTCCGAAGTGGCACCTTAAAGTC
ATCGCCCAGAACCCCTTTAAGATCTGGCCGTAGTAGTTTACAGAACTCTC
CTAGAGTCGAAGACCCTTTGAAACCATTTGGAAGTGGTAGTTCAAAGTCA
TCGCCCAGAACACCTCTAAGATCTGGCCGCAGTAGTTTAAAGAACTCTCC
CAGAATCGAAGATCCTATAAGAGCTATACGTGAAAACAACCTCGAAAGTG
GTTTGAGACCATTACTTCAAGAAGAAGACCTTATAGAACCGTCAGAAATT
GCTTTAGACGAAAGTTCTGCACCTGAAACCACCACGGATGATTTTTTCCG
GAAACTTGAAGATATCCCACCAAGTGTTTGCGAAACTTGTGATCAAACAA
TACAAGTCGATTTTACCGGTACCGAACAATGCCAATGCACGTTGAATGAG
CGAGACAGGTTATTAGATACTTTGCTTACTGATTCAGACTCGGATGATAG
TTATACTGAACAAGAAACAAGTCATTTGGGAATTAGACATCGAGTCCAAA
AACCACCTCTCTCTTCTGATAATCAGTACGACGACACAACAAACGACTTT
ACTACAGACCCGACAGCGACACAAAATATGACAGAAGACATGTCGAAATC
GTCGGCTTTTGGATATCCGTATGACCGACAGAAAC

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_349:685222..699196-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00060891 ID=TCONS_00060891|Name=TCONS_00060891|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13975bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_349:685222..699196- (Clytia hemisphaerica)
AGAATCTTTTTTCAAAATGTGATTTTATGTAAACAATGTCACGAAAAACT
TCGCTATCAACACGGCGTAAATTTAGTTCGAATGTCCGGAAACTATCTTC
TAGTTCGAGTAGTGTTGGTGTTGTTGTCGATGGCGTGAGAAAGAAAATCT
CAAATGCTCAGCTTTCTTTTCCAGGGTACAAAAGACACTCACTTTATCAA
ACTCCTATTATTCGAATCTCTCTATAATTCGAGCTAATTCCCAGTACCCG
TCAAGGAGAAACCCTTTTAAAGTATTCACTGTAATTTGAATCTCTCTGTA
ATTCGAACAAATAAGATTTCCCATTCAATCTCGAAATAAAGAGAGCCTTA
TAAATGTTAAGTGATGACGACAACAAACTCTTTTTGAACATTACCACAGC
TTTATCTATCTCAGTGCTCTAGTGTAACCAGCAGAGACAATTTTTCTTTC
TGGTGTACATTAAAAACTCTAATCAACGTCCAGCTAATAAAAAACGGTCA
TCAAAAAGTTTTAAGGAGTCCTTAAATTTTAAACATGCGGTTTCTATTCC
ATCTCAATCAGGTTAAAAAAATTGCCAGATTACTGCACTATCCACGTAAA
ATATGGTGTATATGCTGAGTTTTATTCAATACTTAGATTTTTTCCCGTCT
CTTATACAGCTAAATAACGGTCCATAATCAAAAGTTTTTAAGGGTTCTTA
AAATTTTAAATACGCAGTACTATCTCAATCAGGTTTATATATGCTAGACA
TTCAAAACTCTAATCAAACTTTTTCTCCTTCTCTAATACAGGCAAGAATA
CTTGGACGATCTTTACGAAGTCGCTCGATCACGTGATGACCCACTACTCT
TGGAATCATTAGAGAACTTCTTATCAGCCACTGTAGATAATTTACTTAAA
AAACAAGCCGATAATGAAAGGTTGGATGCCGCCCTCAAACAGTAAGTCAA
CTTGAATTGGGCTTTTCCTTAAAAATTCTAATATGGGGTGTGTAGGATAT
AACATTTTTACATTTACCCCCTGGACTCGAATACGACATTCTGTAACTTT
TTTGCCCAATTTCCACCACAGTGCAAGAATGAGACCCGAAATACTAGCAA
CTAAAATTTTCTTTGAAATTGGATTTTTTTTTGTCGAAAATTCCAGAAAT
TTGTGCAAATATTCCCCGATTTCGTCCAAGCGAATTTCGCAATTCCTGGG
AAAAAAAGTAGATTTTGCTCTTCAACCAACCAAGAAACCCCCTCACAGCA
TAGCCTGAGCTGAGTTCTAAGCTCAAGATTGTCTTACACTCACCATTTTA
TGAGTATTTTGGTGCAATTTCCGAAAAAAAATGAGCGTTTCAAAGCCCGC
AAAGCCTTATAAATGTTCTTAACTTGGTCTTAATTTTTTGGCTTTGAAGC
CTTGTGTTCTTAGACAAAAGTGTATTTTACCTGCAAGCAATACTCTTCTT
TTCGTAGCGCAAAAGATCAGAATACAGAGATCGCCGCACAGATCGAGGAT
GAGATGGAAGAACAGGTTGCCATTATGGAAGAAAAGATACGTCAAGAAGA
AGAACAAAAGCTGACTCAGCAAAAACAAGAAGCGCATGCGCAATTACAAA
AAGCCAACGATGAGTTGGGAGATATGGAACACAAAATTATAGCTGTAAGT
TTTTTTGCTTTTATTAAGTTGACTCAATGAGTAAATGAGTCAATTTTGTA
AAAAAGTCTTATGAATAACTTCCTCGTCCATCTTTTGTTTCGAGATACCT
TATCGGCCAAAACTTAGTCGGCCCTAAGTGACTAAATTTTGGCTTGGTGA
CTAAAATTAGGGCCGACTAAAAATTTGGGCTGACTAAAATTTGGGCCGAC
TAAAAATTGGGCCGACTAAAAATTTAGCCAAAACTTATAGTTATTAGTCG
GCCCTTACTGACTAAATTTTGACGATGTGACTAAAATTAAGGCCGACTAA
GTTTTCCCCGATAATGTTTTAGTTGCACGAAATGTTTATAAAATTTTAGT
TTGATAGCTAGTTTCGGAATAAGAAGGTATTCGTTCGATAATCACAAAAC
ATTGATGATGTTATCGTCCGTTACAGTGATAGTAAAGGCGGGAAAATATG
GCGGTATGCCGTTATGGCGGTATATGGGAAAGAATCGGTGGGAGAGTTTC
GAAGAAAGACTGGCAACTCTACACCGACTGTAAACTCTTTTCGGCAAAAA
AAACCGTTTGCGAATTTTCTTCGGCTTTGCTTGGGCGTTTTTCTTAGATA
GTGATTCGTCTTAGACTATAACATAGTCTAATCAAAACATTGATTACAAT
AACATAAGTTTTACAGATTTTCAGCCGTTGCAGCATCGATCACGCTTTCA
ATCTGCAGGTCTTCGGCCGTTAACGTAGGTCTTCGGCCGCTGGAAAACCG
CGATTTAAAGTTTTGAAGGTCTTCGGCCGTTGATGGAAAAAAATTTTGCT
ACAACGCATTCTATAAAACTTACAAAATCCCTTAAACCTGAGAGAATTGA
GTCGCAAAAGCCTATTTCTCGTGTCATTGAAACTGAAAATATGTATTTGT
AAGTAAGCACTTGAATAGAGTTTTTGTTTTTTTGTTTTTGTAGTTGGAAG
AGAAATTGAACGAACAGAAGATCAAAGAAGCATCAATTCCCGATCATTTT
ATCGATAAAATACAACGTAAAGAACAGGTAAGATTGTATTTACTGTTAGA
CGGGGGTTTGGCTTTGCAATCTTCGAGTTCTTAATCACAACTTGTCGTAA
CCTCTATTTTTTGAATCTCTCTGTAATTTGAAGAAAATCTTTGGTCTCTT
GAAGATCGAATTAGAGAGAGATTCAACTGTATCAATCTCGAAACTTTTTT
TTTTGTTGATAGAAATAGCATGAGAAATAACTTAATATGGTTAAATAGCT
TTTTTACTTGGCCGGTAGTAATAAACTAACAAACTCGACCGTCTGTCCTA
TACTACTACATTGGGCTATTCCAGAAAAAAAATGCACCCCCTATATTGAT
GAGGTCTTTTTTTTAAAAGGCGACCCCCTGGGTTTTCTTCCCATTTTTCA
GGAGCCCCTTGGATTTTTTCTCCCATTGTCTTGGACCACCTTGGATTTTC
GACCTCGTTATACTGACCACCCTGGATTTTCAATCCGATTTTACTAACCA
CCCTGGATTTTTTCATTCAAAAAACCAACCCTCGATTTTTTATTTTCCAG
ACCACCCTGGACGTCCCACCTCCTCAACATAGGGGTACAGACTATTTCTG
GAATAGCCCATTTACAAGGTCGACTTACTTTCTTAATTCTATTTTCTATC
CCTATAGGAAAATCAACAGCTACAAGCCAAACTTTTAGAATTTCACACCC
AGATGTCGCTCATGCGGACAGAAGTGGCCGCGCTGAAATCTGAATACGAC
GAACAGAGTTCACGTCTCCACAATGAGAGAGGAACAGTATTGAGTTGTGT
GAGAGAACAAGAAAATTTGACAAGACAACTTCAAATGTTACACGAAGCTA
ATAAGAGACTGCATGATACGAATGATGACCTCAGATCAGCACTCGATGTA
AGAAGGTTTAGATTCTTTTTCCAGGGAGTGATTTGTCAAAATTATACACC
ACTAGAAAACCGAGTACTAGATTGTTGTTATCGTCAAACGAATCTGTGGT
TATACCTTTTTAATCTGTCTCGATATACTTAGGCATACAAACATCTGCGA
GCAGAAACTTTCGTGATTTTTGTGAATTTTGACCTTTGTCGCGGAGATTT
GACAAGACAACTTCAAATGTTACACGAAGCTAATAAATAAGAGACTACAT
GATACGAATGATGACCTCAGATCTGCTCTTGATGTAAGAACACGTTTTTT
TTATAAGAACAAACTATATAGGAATATAAGGCTTGAATGATCAAATTGTT
AAGAACATTTTTAGGCTTTGCGGACTCAAAAAATTAAGATTCGATTCGAC
TAAGGTTTCAAAAATTTTGAATGTTCTTATAAAAGAATGTGTATATGTCA
TTCATATTATTTTGCTGAGGTTCCATCTGGACGTTGCAGTTTGTTCTAAA
AGCTACTGACTCTTGTCTAAATTGTACATCACTAGAAAATATAGCACTAG
GCTTTGAGAATCCTCAAATTCAAAAGAATTATCAAACTGTGATAGTACCT
ATCTTCGGTTTTTCCTAGGTCTGCTTTATTAACCTAAATCTACTAGCCCG
TTCCTTCATCCATTCATTCATTCATTCATTCATTTAATCATTTGTGTCAT
CACAAGCGATTTGAAGTACAAATAAAACGGAGCGTTCTTGAGACGTTCCT
GAACGTTCACGAACGTTCCATAGCGTTCCTAGAACGTTCCAGAACGTCCT
CGATCGTTCTTAAACGTTCAGGGACGTTTCTGAACGTTTCTGAACGTTCC
AGAACCTTCAGAGACGTTACAGAACGCTTGAGAACGTACTGGAACGCTCA
CGAACGATCTTTTGAGTCCAAAGGTTAATATTGACTCAATAAGAACGTTA
TGGAACGTATGAGAACGTTCGAGAACGTTATGGAACGTTCAGGAACGCTT
CCGAACGTTTTAAGACATCCTTAAACTTGTAAATAAAAGTGAATGACCAG
GAATGTTTAAGAACGTTCTCTAGCGTTCTTACAACGTTCCTAAAAGTTCA
AGAACGTTCCATATCGTTCGTCTTGCTGGAACGTTCCATTTCATTCGTAT
TTAAATTTGCTTGTGATGACACATTTATTCATTCATTCATTCATTCATTC
GTTCATTTATTCCTTCTTTGTATCTACAGGTCAAGCGAAGTAACAGCTTT
ATGAACGAGAGTTCCATTTCACCGTTGAAGCGTTCACAAAGTTTCGCTCA
TCAACAAAATCCACTTTTCAAACACGATCTACAAAGTTCATTCAGGTCAG
TGTAGACTGAAGTCATTTTTAATCCATACAATACATAATATATGGAAATT
TCTAGCGTCTAATGGTATTTTTGTCTCGATCCTCCGTCCGATATACAATA
CATAATATTGATGTTATACATAAAAATACAATAATCGTAACAGGGTAATA
TCAGTTTTTATCCCGCACCAGTAAGATTCTAGCGATTTCATTGGTCAACT
TCTACTGTTTTTTATTATTATCTGATTTTTCGCAATGTCTGAATTAGACG
TCTACCATACTATGTTTTGAGTGTTTTTTTTTCATATGGAAATTTTGTTT
CTGAAATTAGACGTTTAGCATGGTAAAGTAACGTCAGTGGTTATTTGCTT
CGATTAATTTGTAGATCAAAGTGTTTCCAGGATTTCCGTAGCCAATGAAA
TTCCTAACCTCGATTCTTAAAAAGCTTTTTTTTCAATTTATCATTACTTT
ATTTCCAGAAGTGATCCTGGGTACGCTCGTCATCATTCCACTTTAAACAA
CACCGACTTTAACGACACTGATGACGATTCACGTCAATCATTCTCACGTG
ACGATGATGTCATTGATGACCTCATTGACAACGATGACGTCATCAATCAA
CAATCATTAATGGCGGAGTTAATGTCAGCTGAAGACCAAGCAGTAAAGAT
CTTTGTTTTATTTTGCCGGATAAAAATTTCATCGAAAGCTATTGCTTCTA
TCAAAACACCTGGGATCAATGTTTTAAAAGAAGACATTTTTTTTAGGAGT
TTGGTTTGGTGGATGGCTATAAAAATTGATTTGGCGGAAATTTAGTTTAT
TGTTTGAAGGATTTTTCTTGGCCAAAAATTGTTATTGAATAATAAGCAAA
AAGCGCATATTTGACATTTAACATAAATTAAATTGGGTGGAAATTAAATT
TGGCGAATCAAATTAATGCTGACCGAATACAATATCTTTCAGTTTCTTTT
TTCGACCATCCTGCCATCCAGCTTGAACTTCCACCACGCAAATGGACGAT
TTTATTCGGAATTCTTATATTTTCAACACTAAACTCTTCTTTCCGTCGGA
GTTCCAGGAGAATAAAATGACTACGTTCTCTTCGATAGATAGCCTCTCAT
TGGAGACTGTTCCTCTAACGTTTCCAGACCATCTAAAAAGAGCGACAAAT
AACTATTAAAAAGCGACAAAAAGAACGACAAACTGTAACCCTAACCCTAA
CTAGCAAAGAACGACATATTTCGCCGTCCACAATCCCGACTGAAAGTGAC
TGTACTACCCAGATACACTCCTTTTTGTTTATCACGGGAATTAACTGCAT
GTGGTTTAAAAGAACAATAAATTACACATGTGTATAAGTCTCTATTTGGG
TGAACTGGAAACATGATGGACGATTTTATTCGAAATTTGAATGTTTTTCA
ACACTAAACTCTTCTTTTCTTTCCTTTCCTTATAGTTTGACCATCCACCA
CGCCGGCGAACAGGATCAGCCTTAAGCAACCTCAGTGGTAGCAACTTGAG
TAATATCAGTGAACGAGAACAGTTTGCACAGCAGTTGGAAATGTTGGCTG
AAACGAATCGAAGACTTGGTGAATCGAACGACGATTTGAGAAACGCTCTT
TCTGTAAGTTAAATCATAGAATTATAAAAGCCCGAAGAGCTAGATGTCAG
GTTTCGACTGAAAAGTTTGCCGTGGTTAATAAATTCTACCTAGGTCACGT
GAAATTACAATAGAATTTCAGCGCTTAACCAATCAGAAGCTTCGCGGGTT
TTCGAAAACAGTAGCAGCAATATTTTTTTGCGATATTCTATTTTTTTTTT
GCTTGAAAGAGCTTAGCACGGCATCTAGCCCAACAAATTCAGTAAGTCGA
ATACCTTACATATTTTTTCTATAAGGCTAACGTTTATAAGCATACTCAGT
TTTTTGGATCTAAACAATGGCTCTATTGTTTAAGGGCTCTATTGTTTAAG
GACAATAGAATGCTAAGCATAATGGTAGACGATTGCTTATTAAATAAAAA
AGATGTATTGTACGAAAATAAGAAGGTGTGTAATATACACTATTACTGTA
ATATACTATTCAACAGGGGGGGGGCGGTCGGTTGTAAAATCTCAGACATA
TATGAGTAGTAAAAGGATTTTTATGAATTTTTACATACCACCACCCAGAC
TCTTGGAAGAGGTATTTTACTACCCTGGTAGTAAAAGTTTTTGGGACAAT
TTGTCATAGAGACCACCTATTTTTTGGTTGCTTTTCGGACTGATTTTACA
AAAAAACTAAAAAATGATTATTTCTGTGACACATTTTTCACTAGTACAAA
AATTAATGTTTTGCCCTTAGAATTAAAGTCTTTTTTATACTGACAAAAAA
TTTTGAGAATTTTTTGTTTGCAGCAAACAACTTTCCAACAGAATTTTTTT
TTTAAATTATAAAAATTTTCAGATTTTTTCAGAAAAAAATTAAAATTAAA
AGAATTACAAAAATAGCCAAAATTTGCTAATTTTACCAGTTTTAACTACC
CAGGTAGTAAAATTTTTTCAACATTTAACACATAGATACCACCCATTTTA
GGAGTAAAATCTAAGGAGTAAAATCTTTTTTCGATTTTTCGTCACACCAC
CACCGTAGTAAACGTCATTATGTCTGAGATTTTACTACCCACCCCCCCCC
TTGTATTCAACTATATTATCCAATGTTTGCTTACAGTGTAGCCTGTGTAA
ACAATTTGTCATCTATTTTTTTCAGCTTTTGACAGATCACGTGCGTTCTC
AGTCCGTCTCTGAAAGGTCGGAAGGTCCTTTAAGCCGCCGTGATGGGTCC
GAAAGATCAGACATTTTGACGTCACGAAGAGAGTCACCACCTGGTTGTTA
TTCAACGCCCTCAACGCCCCTGAAAAGGTAATTTTCCGAAGCTCCTTTTC
AATGTAATATCAAAATGTGAACAAAATGAGTCAAACGGAGGAATTCTGTA
ATATAAAGGAGTGGTCCGAGGGCTGATGTCGTTCATAAAGTGTGTCTTGA
ATTTTATGTTCACTTCTATATAAGTATGTATAAATAAATCAATTAACCAA
GAGTGCTCAATGGTTGCATGCATAACACAACCAGGGTGAAATCATACGAT
TTTTAAGAAAAAGTAGACAAGAATCAATTTAGTACTGTTCACTTTTATAT
AAATTATTTCAATAGTCATTTGGTCGTTTGGTCATTTGGTCAGTTTTTCA
TGTGAATACAACAAAATGACAACAAATTATTCCTTATCCGGATTTTAATG
TTGGATTTAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTTGTAGTGAATACACTGAGCGA
CCACGTCCAAACAGTACCAGTTCACCAAGAAAAGTTATCTTAACAAAGAG
TGGGTATCATTCGGTAAGATAAACAATTCTCTTGTATTTCTTTATTTCTT
GGAAATTTGTATTTCTTTTGTAGTTATATACTATTTATTGGGCCTTTCCT
ATTTATACTGATCATCTGAAAGGGAAAACATATTCGGGGAAATCTTTGTC
ACTTTTGTGAAGATATTTGTCAAAACTCCCTTAGACTGGAGTCGTTTATA
ATGCATGTAATACAGTAGTATAGCCGTTATATGATAATACGATTATTGTT
CCCTCCATTACTTTTTGGTTTATTTCTACTATGTCTGAATTAGTTGTCTA
GCTTGCTAGACTAGAACTCCCTTGAGTAGTTGAACAGTAAGGTTATTTGT
CGGCTAGGAAAACCTCGCCAATTGCTTAAAAATTTCATCATTTTACCCCG
ACTAATTCTTTCCTTTCAGGTAATTCTAAATTGTACACTTAGTTTATAAA
CGGCTTTTTGCGTTTTCGCACTCATGCTAAGCAAAGGTCAATTATTTCGC
TACACTTCAGTCAGACAGGTATTTTTATGAAAAGTTTTAGCAATAGAAAG
TTTATTAAAATGACAATGTTTTGAATATAAATTTAATACATTTTAATGCG
CCTGCACATACCTTAAGCGTTTATATACAGTTTGCATTTTTGAAAAGTCT
GCTTTTAAAGTTTTTGCGGAACGATACAGTAGCGCAATATTTGTGTAGGA
GAGCATATTTTTATGACACGGTAATTATCTTTTTCTATTATGAATAGATA
ATTACTGTGTCATAAAAATATGCTCTCCTACACAAATTTTGCGCCCCTCT
TGTCTACGCTACTGTGATAGTATTGTCTTTGAAACAGAGATTCATACCTT
AAACGTTTAGACACAGTTTGCATTTTTGAAAAGTCTGCTTTTAAAGTTTT
TAACATAATGACAGTATTGTCTTTGAAACAGAGGTATTATTTAGATTTTT
GTGACAAAAGTTAATCCGTCGAAGAAAGACATTTGTTGCAATATTTTTGT
CTTGCAGTCAGTGGTATTACTTGCATTCGTGGCTTTTCTTTTCTCTTGTT
CACCGCTCGCGTCGGAGCAAGAAGCTTTGGAGTTTTAAAAAAGCGCTGAT
AGGAATCATTGTGCATTACAGGGCGGACGGAACTGTATTTTATGTTTTAG
TGTTGTTTTTTGGTATTGGTAAAACTTGAGGTCTTCGTTTTACGTCTAGC
TCCTTTTGTTAACTTAAACGTGGAATATTATATTGACTTTATTGATCGAT
TGAATTTGGAAGTTTTGTAGAAATTAGCTTGGCTATCGTTTTAACTAATT
TTTGGTTAGTTTTTTGGACTACTAATTTCTACCGCTATCATGGTTGAAAA
TAAAGATAATGACGTAAGGCTTATTTTTCTTTTCGTGAGAAAATCTTTTA
AATCAATGTAGTTTTAGTACTCTGGAGAAGAGTGTAATAGGAAGAGATCA
TTTTCGACAGCCTTGTGTCATAGACCCGATGGGACCCCTGCAACGTTGGA
AGATTTGGCCAAAATTTCGTCCCCGGTTGGAAAACCGAGCCCAACTGGGA
AATTAACTTTGTTCTCTACCCCCACTGGGTTTTCGACCTAGAAGCAATAG
AATTCTACCCCCCATTGGGATTTATATATAAATTCTTAACTCCACAGCGG
GATGACGTTCCACCGGGGCTGTGAGACAGGGGTGTTTAATGGGTTTATGA
TATCAGGTAACGACGGCGATGGACTTTAAAGGACGTTGTGAACGTTAGAT
TAACGTTTAAACAATGTTGTGTGCCAGCTGGGGTACATTCACCAGGGCCT
TTTCTGGTGTATCCCTGATGAGGTTGTGTGGGTGGCGTGACCCATTATCA
ATGAGATAATGAGCCTAATAGTTAATGGCTTGTAAATAACGAGAAATTTT
TAATACAATTTAATAATTGTTCAATTATTCTAAGCAATTTTGTCGTGTAC
AGTTGAGTCTCAGTGCAATTATGAAGGAATGAAGGAATCCTTTTTTTCGA
ACATGTATGAAAGCTTGAAAACAAGTGGTATTTCTGTCACACACATGTGT
AGAGAAAGAGATCAATTTTAAAGAATAAAATATTTTAATAAAACAGCATT
TTAAAGCATATAGATCGAACTCATGTGAAATTTTTAACACCGGAATTAAA
TTTTTGTAGTCGAATATTGTTTTTTCGGCGGGTGTTTACAGTCGTCAATA
TAAGCCTTAAACGAGTTATTATAAACCATACCGAGTTAGTAACTCGTTTT
AAGGATAATTAATTATTCGGAACAATCCGATATAACTCGACATGAGAACA
TTCGCGAGTGGACCTTCTCACCCGGTTGTCGAGAAAAGAATGCAAATACA
ATTCGACTTGAATTTGAATGAAATCGGTGCAAAGACATTTGTTCATGAGC
AAATTCACAGATCTTCAATGTTGATTCATATTAAAAAAAGACAGGTAAAA
TACTGAGATTGCTCTTTCAAATTTGAAGAAAAAATTACAGAAAATTCAAA
GAAATATTTTGGAATGTAACGGGTTAACTTACAAGATGAGAATTTTCTTG
GAAGCTTTGGTAGTCTGACAGGTAAAATAGTGAGATTGCTCTTTCAAATT
TTGAGAAAAAACCTACAAATTCAATGTAATATTTTGGTGTTTAGCAGGTG
TTAATGTATTTATAAAATGAGAGTTCTCATGGAAGCTTAGACAGTCTGAC
AGGTAAAATAGTGAGATCTCCTCTCAATGAAATCCTCAATGAAATATTTT
GCTAGGTAACAGGGGCTAAAAGAGCCTGGTTAAATCTCTTCAGCGATTTG
ATGTAACTATTTGATTATTTAATTGTTGTTAATATAATTTGTTTAATGTA
CAGAAAAGTTAGCAGAAAGGGAGTTTTGATTTTTCACTTAACCCAGGTCA
TACAAGTTTCTGTGACTTGCAAAATGACCTGAGTTTGAATCTCCAATCTT
GAAGAAAAAGAGAAAAATGTGACCTCCAAATTCTTGCATCAGAACAAAGC
CGACTATTACTTATTTCCACAAAAGCAGATTTTAAGTCTTACGTCTGAAT
AGAGCTTTAAAGAAGATTAAAAGTTTACTTTTAGAAGATATTTTAAACCT
TGTAAATAACATTTTATCTAACTAAACTTTTGTTATATAACAATGCAAGC
AAATCAACAAACAATTAAATCTAACTTCTTAAACCTTAAATTTAAATTTA
AAACATTTTTAGCAAAGTGACACATCGACTGCTGAAGACACAACAACAAA
CGTGGTTTCAAACGATGACCAAACACTCGCTCAAACAAAGGAAACATCAA
GCTTTTGTACCACTTGCGATGGTGATACAAAATCAGGCCTCACGAACTGC
CCAACCTGTGGTGAGGGTGACGCGCCCGAAGATACCGCCCATATTTTAGA
AAACGTTTCATGGGATGAAACCCCGCCCTTTTCTTTACGCCCAGATACGC
CCATAAGTGGGCGCGATCGTAAAAACTCCGTCCTGAGCAACCAAAGTAAC
CAAAGTCCGTCAACATCTAAAATACCAACACCAAGATCTATGAACAGCCC
ACGATTCCGAAGTGGCACCTTAAAGTCATCGCCCAGAACCCCTTTAAGAT
CTGGCCGTAGTAGTTTACAGAACTCTCCTAGAGTCGAAGACCCTTTGAAA
CCATTTGGAAGTGGTAGTTCAAAGTCATCGCCCAGAACACCTCTAAGATC
TGGCCGCAGTAGTTTAAAGAACTCTCCCAGAATCGAAGATCCTATAAGAG
CTATACGTGAAAACAACCTCGAAAGTGGTTTGAGACCATTACTTCAAGAA
GAAGACCTTATAGAACCGTCAGAAATTGCTTTAGACGAAAGTTCTGCACC
TGAAACCACCACGGATGATTTTTTCCGGAAACTTGAAGATATCCCACCAA
GTGTTTGCGAAACTTGTGATCAAACAATACAAGTCGATTTTACCGGTACC
GAACAATGCCAATGCACGTTGAATGAGCGAGACAGGTTATTAGATACTTT
GCTTACTGATTCAGACTCGGATGATAGTTATACTGAACAAGAAACAAGTC
ATTTGGGAATTAGACATCGAGTCCAAAAACCACCTCTCTCTTCTGATAAT
CAGGTACTAATTAAAATACGTCATTTTAAACATTAAACATTTTAAAGTTT
TCTAAACAAACTTATAAATGGCAAGAGAGGTTTCTTTCTTTCTTGTTTTT
TTTTTACAAAATCTGATTCCTCACAACGACGACAGAGTATGTAGAGATCG
CACTCCTAGAAGAAACCGAGTTCCCAAAACATACAAGACCTTTTTACAGC
TTCGATTCCTTAAACTAATCAAAAGAATTTAAACTCTCTTAACATAGACA
ACATAAGTTCCTTAATGAGTTTCGATGATGCTCTCTATTCAACTCGAACA
AGTTTTTAGGTCCCTTCTGTTAACAATGTCTTGTACTCTATGTACTCCAT
AACTCGAATTTCCTTAATTCGAACAAATTTGCATTTCCCATACGCATTCG
AGTTTTAGAGACTCAGCTGTATTAAAACTTAACATTAAAACACTCGCTTG
CAATGTACCGGGTGCGCCACAAAAAAGTTTCTCTCTTTAAAACTAATTTT
CTCGAAATCTAAAAGTTTTAAAAGAACCATTCCTATTTCATTGCAAAGAA
GAAAGATAAACTTAAATTTTGATGGGTCATTTATTAGATTCGATTCATTA
GATCAAAAGTTATGCTCAATTGAATAAAAAAGTTACTTTTGGAAAATGCT
CAAAAACGTTAAAAATCGACCTATCAAATTAAACAGAAGCATAATTACAT
GATATATCAGTATTTTCGTTTCATTCATTAAAAATGATAATTAGCTGTCT
AAATGACCTTTTGTTATTTAAAGGAAGGTTTAATTTCAATGAAAGGAAGA
AAATTTGTCAAAAAAGGCCAGATAATCTGGTAAAATTCATAAAAATACAT
CAAATATGGGTTTCGAGGTAGATCCAGCCTTACATAGACTTTATCCAGAC
TAGAACCAAAAATCTGAGGAAAATTTCAGTAAAACTAAATCAAATTGATT
TTGATGACGATTTTAAACCCTTTCGGCCCTTCAATTTCAAAATTTATGTG
TTATGTTACTGAAAAATGCTCTTAATCGTGTAAAGGCTATTGCAATTGCC
AAATTTAGAGTAAAAATTTGATAGGTCGATTTTTAACGTTTTCGAGCTCT
TTCTGAAAGTAACTTTTTTATTCAATTGAGTATAATTTTTGATCTAATGA
ATCGAATTTAATAAATGACCCATCAAAATTTAAGTTTTTCTTTCTTCTTT
CAACTGACATAGGTGTGGTTCTTTTAAAAATTTTAGATTTCGAGAAAATT
AGTTTCAAAGAGAGAAACTTTTTTGTGGCGCACCCGGTATTATAATCTAT
AACTCGAACAAATTCTGTTAACAATGCCTTATAAACTTTACTCCGTCGCT
CGAAATCTCCTTAATTCGAACTTCCTCGTACGTGTTCGAGTTATGGAGAC
TCCACTGTTTTAAAGCGTAATATTAAAACACTATCCTTATAGTGGACATT
TATAACAATTTATACTTTAAACGTTTTAAACATTCTTAAAACCTTTTCTT
TAACGACAACTTTAAGTACGACGACACAACAAACGACTTTACTACAGACC
CGACAGCGACACAAAATATGACAGAAGACATGTCGAAATCGTCGGCTTTT
GGATATCCGTATGACCGACAGAAAC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_038221	XLOC_038221	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_349	supercontig	scaffold_349:685222..699196 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.141074	0.094345	0.156499	0.0768359	5.09865	1.90341	3.98171	6.44451	2.15811	0.830402	0.831896	1.83289	4.3429	4.64173	2.28523	5.13571	3.049	2.73554	1.73412	1.8461	2.05612	1.51449	0	3.67526e-07	0.567995	4.03787	0	0	0	0.332153

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00060891 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00060891 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00060891 (transcript) - C. hemisphaerica