TCONS_00060882 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00060882
Unique Name	TCONS_00060882
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	5203

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_349:680658..704745-

transcript sequence

>TCONS_00060882 ID=TCONS_00060882|Name=TCONS_00060882|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5203bp
GAACCGAAAATACGATAACGACAATGTATAGCTATAACGGCGGTAACGAC
TTCATCAATATCACCGTATCCGTTCCTCGGTCAAACTCGTTTCACCGACA
ATCACCATCACAAACACAAGTCGTTCCCGACAACGAATATAACTCTGCCG
ACAATTCAGTCGACGAAGGAATCGTTCCTTCACCAACAAACCCACTCGAA
CGTGTCGAAACCGAAAGTTTTTACGATGATTTTTTCGGTTGCGTCAAAAA
AACACCTGACGGCGCTCGATACCAAGGTTACGGtgatttaaacaataaaa
ctcaaaaatatcaTATCTCAAGTACTGGGGagcttaaaaaactaaaagaa
aGAGCTCTCAAGAATCACCACAATCTTACCAGATCTGGCATCAAAGGACG
GCAATCTCCTCCTTGGAGGTTGATTATTGAGGAGGAAGATTTGATTACGT
CATCACCAGTGTTGCCAAAACCTCAAGCTTCTAAGAATGTCTCCAAGAAA
CGTGATCAGGATGGTTTTTGGAGAATGTTGAAACGTGTTGGATGGAAAGA
TGGGATTCTACCTGGGCAAGAATACTTGGACGATCTTTACGAAGTCGCTC
GATCACGTGATGACCCACTACTCTTGGAATCATTAGAGAACTTCTTATCA
GCCACTGTAGATAATTTACTTAAAAAACAAGCCGATAATGAAAGGTTGGA
TGCCGCCCTCAAACACGCAAAAGATCAGAATACAGAGATCGCCGCACAGA
TCGAGGATGAGATGGAAGAACAGGTTGCCATTATGGAAGAAAAGATACGT
CAAGAAGAAGAACAAaagctgactcagcaaaaacaAGAAGCGCATGCGCA
ATTACAAAAAGCCAACGATGAGTTGGGAGATATGGAACACAAAATTATAG
CTttGGAAGAGAAATTGAACGAACAGAAGATCAAAGAAGCATCAATTCCC
GAtcattttatcgataaaatacAACGTAAAGAACAGGAAAATCAACAGCT
ACAAGCCAAACTTTTAGAATTTCACACCCAGATGTCGCTCATGCGGACAG
AAGTGGCCGCGCTGAAATCTGAATACGACGAACAGAGTTCACGTCTCCAC
AATGAGAGAGGAACAGTATTGAGTTGTGTGAGAGAACAAGAAAATTTGAC
AAGACAACTTCAAATGTTACACGAAGCTAATAAGAGACTGCATGATACGA
ATGATGACCTCAGATCTGCTCTTGATGTCAAGCGAAGTAACAGCTTTATG
AACGAGAGTTCCATTTCACCGTTGAAGCGTTCACAAAGTTTCGCTCATCA
ACAAAATCCACTTTTCAAACACGATCTACAAAGTTCATTCAGAAGTGATC
CTGGGTACGCTCGTCATCATTCCACTTTAAACAACACCGACTTTAACGAC
ACTGATGACGATTCACGTCAATCATTCTCACGTGACGATGATGTCATTGA
TGACCTCATTGacaacgatgacgtcatcaatcaacAATCATTAATGGCGG
AGTTAATGTCAGCTGAAGACCAAGCATTTGACCATCCACCACGCCGGCGA
ACAGGATCAGCCTTAAGCAACCTCAGTGGTAGCAACTTGAGTAATATCAG
TGAACGAGAACAGTTTGCACAGCAGTTGGAAATGTTGGCTGAAACGAATC
GAAGACTTGGTGAATCGAACGACGATTTGAGAAACGCTCTTTCTcttttg
acAGATCACGTGCGTTCTCAGTCCGTCTCTGAAAGGTCGGAAGGTCCTTT
AAGCCGCCGTGATGGGTCCGAAAGATCAGACATTTTGACGTCACGAAGAG
AGTCACCACCTGGTTGTTATTCAACGCCCTCAACGCCCCTGAAAAGtGAA
TACACTGAGCGACCACGTCCAAACAGTACCAGTTCACCAAGAAAAGTTAT
CTTAACAAAGAGTGGGTATCATTCGcaAAGTGACACATCGACTGCTGAAG
ACACAACAACAAACGTGGTTTCAAACGATGACCAAACACTCGCTCAAACA
AAGGAAACATCAAGCTTTTGTACCACTTGCGATGGTGATACAAAATCAGG
CCTCACGAACTGCCCAACCTGTGGTGAGGGTGACGCGCCCGAAGATACCG
CCCATATTTTAGAAAACGTTTCATGGGATGAAACCCCGCCCTTTTCTTTA
CGCCCAGATACGCCCATAAGTGGGCGCGATCGTAAAAACTCCGTCCTGAG
CAACCAAAGTAACCAAAGTCCGTCAACATCTAAAATACCAACACCAAGAT
CTATGAACAGCCCACGATTCCGAAGTGGCACCTTAAAGTCATCGCCCAGA
ACCCCTTTAAGATCTGGCCGTAGTAGTTTACAGAACTCTCCTAGAGTCGA
AGACCCTTTGAAACCATTTGGAAGTGGTAGTTCAAAGTCATCGCCCAGAA
CACCTCTAAGATCTGGCCGCAGTAGTTTAAAGAACTCTCCCAGAATCGAA
GATCCTATAAGAGCTATACGTGAAAACAACCTCGAAAGTGGTTTGAGACC
ATTACTTCAAGAAGAAGACCTTATAGAACCGTCAGAAATTGCTTTAGACG
AAAGTTCTGCACCTGAAACCACCACGGATGATTTTTTCCGGAAACTTGAA
GATATCCCACCAAGTGTTTGCGAAACTTGTGATCAAACAATACAAGTCGA
TTTTACCGGTACCGAACAATGCCAATGCACGTTGAATGAGCGAGACAGGT
TATTAGATACTTTGCTTACTGATTCAGACTCGGATGATAGTTATACTGAA
CAAGAAACAAGTCATTTGGGAATTAGACATCGAGTCCAAAAACCACCTCT
CTCTTCTGATAATCAGTACGACGACACAACAAACGACTTTACTACAGACC
CGACAGCGACACAAAATATGACAGAAGACATGTCGAAATCGTCGGCTTTT
GGATATCCGTATGACCGACAGAAACCGTCACCGGTGTCCAAACGATTAAG
GCTTCTTCATAACCTGGAAAGCGAGATGAGCATGCTTTCAACTTCTGAAA
TTTCCGAAGACGAGTTGGAGAACAGTGACAACGATTCCGTTGATGACGAA
GAACTCATCCGATTGGTCGATCAAGCAGCCAATGAGGAAACAGGATCAAT
CACAGATGAACCAATCACAGTCGAGGAAAAAATCTTGGATGTCGAAACCG
TACCACGTGGTCCAGGAGTTGGCGCAGATACATCCAGTGAATCGGGAGCG
AGTGTTGGAGATGTATCGAGTGAACCCGATGAGATGTTTAAACTTGTTTT
GGCGGGAAATGCGGCCGTTGGAAAATCAAGTTTCATTCTGAGACTTTGCA
AGAATAAATTTTATTCAGCTCTGAACGCAACGTTAGGCGTCGACTTCCAA
ATGAAACGCATGATTGTCGATAAAAAGAAAATCGCTTTACAATGCTGGGA
CACGGCTGGACAGGAGAGGTTTCGGAGTATTGCCAAAAGCTACTTCCGAC
GTGTAGATGGGGTCGTACTGTTGTATGACGTCACATGTGAGAATTCGTTC
CTGGATGTCAGAGAATGGATAGAATCGATTGAGAGCTCGTCTGATAACGT
ACCGGTCATCTTGTGTGGGAATAAAGTCGACTTGCGTCCTGATGCTGAGC
GAATTGGTATGCCAGTGATTAGCCGAGACCAGGGCCAACAGCTTGCCAAA
GACGTTGGTGCGTTATTCATTGAAACTTCAGCTAAAGAGGGAACCAATAT
TCATCGAGCTTGCAAGGATCTCATAAGGATGATGCAGCGTAATGAGAATC
CGAAACCTCACCCGAACGGAACAGTTCAACTCGATCCTGAATccgaaaaa
ccaaaaaaagctGGTTGTTGTGGCAAAAGTTGAAAAGTCTTTTGATGAAA
GTTTCCATCATTATGGATGCGATCAACAGATTGCGTAGAGAAAAAGGAGA
ATGATTCGCCGATCCCAGGGCCATTCCGATTTGATGACTGATTCGTATGG
TTCGAATGGATATGGTCAGGTCAACTTCGGTACTAGTCCAACGTTTACGA
AGAAAACGTCTGGAAATTCCCTATGACGAGAACTCGTCAACGTACACCCT
GGAATGCACGAGTGTGTCGCCCTGGAAGATTTGAGCTTTAAAGTTAAAAA
CCATCTCACTTAACTGACATTACCATCTTCGCCTAGCCCTGTCCATCCAC
AGACCAGGACGAAGATATTCGGTTACAATCAACTAAATGGACGCAAGACT
CAAGACTCAAGAATCAAAACACAAGACTCAAGATCCAAGACTCAAGATTC
AAGACACaatagattttaaatttaaagacAATTTTTAGAGTGGTAAAATC
TTAAGTATTTATATTAACAGCAGAAAATGAATGATTTTGGGGAATTTTAT
TTATGTTAAGTAATAAAACCCATTAAATTAGGATGTATTCCCAAAAGCTG
ACAGTATTAGGGTTTGGTTTAATTTGTCAGACATTTTACAGACATTTTAC
AGGTGTGATAGACCCTCGACATATCTATCAATACGTTAAGTTCCTTAAAA
AGCTTGCAGGGGGGAGGGGAATGATTTTGAGAGACTTCTAAAGTTACTAA
TGGATTTCTAAATAGAAAATCCTACAATATGGCCCAACTAATCTAGTTTT
CTAAACCTCTTCCAGTCAGCTAGTACAAAATTTTAAAGCAACGTTAAATG
GATGTTGAAACTACGCAGTGTCGTAGCTACCGGGGGGCTAGAGGGTGCTT
atcccccccccaataattctCTTAATGAAATGGAGTATTTTACCTTTAAA
TTTTGCCtttattcgaattattttagttttttgagtgTGTTCTTGGCCAA
TTTAGAGctctagatttcaaaatttcccccatcatgccaaaccatggttg
gccctcacgGTGTCACTGAACTTATGCCCCTTCCCCCAATATCAATATGC
CTCCTACGGCACTGCTACGTTGTAAGTCAGCTGGGTTTTGTGCATTCATT
ATCATACATCgagaaaatcttttcttttcttttcttattttgttttgttt
ttcatctatttttgttttcttcatgTAAATAGTTTATTTGTCATatcaag
atttgaaaaaattaaaaactattaTTGTACAAAGattcatatatttaaaa
atAGTTTCAGAATATAAACTATGAAAAATAACTAATTGTAATTTTTACGT
TTATGAGCTCATAGTACTATGATGagctacacttttttttaagtACAACG
AGG

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_349:680658..704745-

Legend: exon

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>TCONS_00060882 ID=TCONS_00060882|Name=TCONS_00060882|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=24088bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_349:680658..704745- (Clytia hemisphaerica)
GAACCGAAAATACGATAACGACAATGTATAGCTATAACGGCGGTAACGAC
TTCATCAATATCACCGTATCCGTTCCTCGGTCAAACTCGTTTCACCGACA
ATCACCATCACAAACACAAGTCGTTCCCGACAACGAATATAACTCTGCCG
ACAATTCAGTCGACGAAGGAATCGTTCCTTCACCAACAAACCCACTCGAA
CGTGTCGAAACCGAAAGTTTTTACGATGATTTTTTCGGTTGCGTCAAAAA
AACACCTGACGGCGCTCGATACCAAGGTTACGGTGATTTAAACAATAAAA
CTCAAAAATATCATATCTCAAGTACTGGGGAGCTTAAAAAACTAAAAGAA
AGAGCTCTCAAGAATCACCACAATCTTACCAGATCTGGCATCAAAGGACG
GCAATCTCCTCCTTGGAGGTTGATTATTGAGGAGGAAGATTTGATTACGT
CATCACCAGTGTTGCCAAAACCTCAAGCTTCTAAGAATGTCTCCAAGAAA
CGTGATCAGGATGGTTTTTGGAGAATGTTGAAACGTGTTGGATGGAAAGA
TGGGATTCTACCTGGGTAAGGATCGAGTTTTAGGACTCCTAGATGGCACG
CGGCGTTGTTTCAACGTTCATATAACGTTATAGTAATAGTATGCATATGC
ATAGTATGTAAGTTTGATGGATCAGGATATCTTAATGAATTCTCGGTGAC
TCAATTCTTGCTAAACTAGAAACAAATCTTTAGTCTTATTCTAAAACACC
CGACTTCTTAGGAAACGGACAAAAGTGTTAAAAATAAGAACATTTTAAGA
ACATTTTTAGGCTAAAAACTCAAAAGATTAAGAACATCCGAAGACTTCAA
AAAAATTGGATGTTCTTATATAAAAAAACGTGTACCATTTTAGCTTGAAG
AACGCGCTTGACTTTGTTTAAATGATTATTGGTGATTCGATTCTTGCTAG
ACTAGAAACAAATCTTTAGTCTATCGCAACTAATCTTGAAACTTTGAAAC
GGCGAATCTTTCATTACTGACTCTCACGGCTCTCACGTGTGCATACACTT
TCGTTTTCAATTCTATGATGCATTTGTTCACTCAAGAGGCCCCATGTGTT
TCATGTTTGCTTATTAAAACAACTTTTCATTTATTCATCTGTGTAACAAT
ATGGATGGAAAAGTCACAAATCGTTACTATCAGATGATATCATTTTCCTG
TGAAAATCTCGCTTAAAACTTCTTTCAGAATGAGCAAATATTTAAAGTTT
TTATTGACGGTCTGTGTCATAATTATACAAATTAAAGTATTTTTTGAAAA
TTACCTTAAAGTCAAATTAAGGTATTTTCTAGTCGTTTTACACGTTTTTT
ATAAGAACAAACTATATAAGAACATAAGGCTTTGATGACCAAAATACTAA
GAACAAGTTAAGGACATTCTAAGGCTTTGTGAACTCAAAAACACTCTTTT
TCTTAGGAAAATGGCCAAGAATACTCACAAAATGGTCAAAATAAGAACAT
ACTAAAAATGTTTTTAGGCTTAGAACTCAAAAAGTTTGTTCTTATAAAAA
AACGGTTTTAAGAAACTACAGTACATCGCATGTATAGTAAATTCTTGAGG
TTTTTGTTGGTCACAGTATAAGCATTCTTTCACAATGGCAAAGAATCAAA
CCGCGTTTCGATTTCTGGAGCCAAAAGCAAAATCCTCATTTAAAATTTTT
GAGATACTTCTAAAACCCCCGTGGGAATATCCTCATTCACGAGGTTTTGT
TTTTATTCTCATCATCAAATCAGGGGGTTTATAAGCCAGATGTTTTCTGT
ATTCAAACACATAATCTTTGTATCATAATAGAGCCACCTGACTCTGGTTA
AAATTGTTTTTAATTTTTCATGTTTTTGTCTTTTTACTTTTTTAACGCAC
TTTTTTTATAAGAACAATGTTTGAATATATGTTTTTTTTCCCTCACAAGA
TTTGGCGCAAAGTTTTTCGTGTTTTTTAATGGAAATCCTGTACAGTGAAC
TCTCGCTATTTCGAGCTTCTTTTATTCGAATCTTTCTCTAATCCGAAATA
ATTCTCAGTCCCCGTCAAGGCTAAAACCACGTAAAATACTATTCGAATAT
TCTCTAATTCGAAGGCAATTTTTGTTCCCTTGAAGATCGAATTAGAGAGA
GTCAACTGTAAGTCTTAATTTCAAGGATAAATTTCGTCACAGTCGCTAAA
GGATATCACTTTTGAAGCGATTCTCAAAGAAATTTTGAAAATGCAACATT
TTTTATGATTTATGGAATGTTCTTACAGCCAGTACCTTACAAAAAAATCG
AAAAAAACTCTCCGATGAAGAGAAAAAAGGGGAGGCGGCACGCGACTAAA
ATCAAAAACCAAATTATGCGCATACATAGTTTAAGCTCGATAATCAAGGA
GTGTGGGTGACGTTTATTTTTCGGGTCTTTGAAATGGTCCTTCGTACAGT
ACACTTTTTTTAATATGAATAATAATGAGACTAAAAATTGCCAAAAATTA
GAACAATTTAGAACAATGCTGAGTCTGGAATTACTTAATTTCAAGCAATT
TAGAGGTCAAAGTAGTAAAAATTGGGTATAATTCTTAAGATACCTCAATT
TTGCCCTATAAACAGGATACACGTTTTTTTGCTTATAAGAACGTCAAAAA
TTTTCGAAGCCTTCGGATGTTCTTAGTTTTTTTTTATTTGAAGCCTAAAA
AATGTTCTTAAAATGTTCTTATTTTCAGCATTTTTTGAGCATTTTGATGT
AATTTCTCAAGAAAATGCATGTTTTTAAGTCTCCAAAGCCTTGGAATGTT
CTTAGAATGTTCTTAAATTTTTGGGCCTCGAAGCCTTATGTTCTTATATA
GTTTTTTCTTATAAAAAAAACGTGTAAGAACAATTTGAGGCTCAAAGTGC
CAAAAAAATAAGAACAGCCAATCCTCAGCAAAACTTTACTGGTTCTTACA
AAAAAAGTGTATTATTTTACTGGCAAATTCACTTTCACTTAAAATTCTGA
CAAAATAACTTCCCTTTCAAAAATTTTCAAAGTTATAAGTACAGTTAATA
ACAAGTTAAGAACAAGGTTAAGAACATTATAAAGCTTCATTAAATTATAA
ATTCTGAAAGACACAACTTTTTAGGAAATGGCACAAAAATACTGGCAAAA
TGGTGAAACATTTTAAACTCAAAAAGTTAAGAATATTTGAATTCTTCAAA
CATTTTGGATGTTCTTATAAAAAAATGTGTAGTCGAGCTATAAACAAGTT
CTGAATAATTGTTACTTAAAACTTTCAACTATCTTTTTGATAGATTTTTA
AATACATGCTGAGTCTAAGATAGCGGGTTTTAAGAAACACACTGTTTAAT
TAAGTCCCTTTATGTAAAAGTTTCGAAATCTTAAACTTTATTTCAAGGTG
ATTTTTAGAATATTGGGAAATGTTGTATCTAAAAAAAGGACTAGCTGTTC
TATTCAAAAAGAACTTTAAGTGTTAGATTAAAGTGTGATATGAGTTAAAA
GTTTAGCTAACTTCACATCTCATTTTAAATCAAAGCCCATTGTGAATATA
TTTCTACAAGAGCTCTCAACTTTGCCATTAAGACTTTAGCATCGAGAATG
GTAGAAAGTGTTCAAACAAGTTTTTAAAGTTTTTTAAGTGCAGGGTTTTA
AGATATGGTTCGAGGCAGGAGAAGAAGGAGACTTTCGAATTTGTAAGTTC
CACTAAGATGAAAGTTGAATTCTAAATTTATTCTTCTCTTCTAAGTGAAC
GTAAAAGTCAATGTATATCTGTGCTAAAACTTATAAGTGAACATAAAAAA
CACTTTTTCTTTGAAGGAGAGGACTGAGCTCTAGCTCGTTCCAAATTTTT
GTAGCATTGGACGGGAAAGTTTTACTTTCGACACAGCAGTGTGTACGACG
TTTCGACGGTTGTCTTTATCAAGTTTATTCTTCTCAAGACTACATGTTTT
GTTATATAAGAACATAAGACTTCGATGGCCGAAATGTTAAGAACAAGTTA
AGAACATTTTAAGGCTTTGTAGACTCGAAAGCACGCGATATTTAAGGAAA
TGGGTAAAAATGGTCGCAAAATGGAAAACATAAGAACATTTTTCGGCTTA
AAACCCAAAAAGTTAAAAACATTCGAAGGCTTCAAAAGTTTTGGATGTTC
TTATAAAAAAACGTGAGACATTCGAGTTATAGAGGTTCGAGTGAAAGAGA
CTATGCATACTGTATTGCATTTCACATTGGAGGATGTAGTGTGTATAGAG
CTTTAACATTAATTTCTGAATGCAAAATTATGATTTTATAAGTTTGCTTC
TTCACAATAGACCTTATCGGAGTTTTTGATTTTTCTAAAAAAGTGATGCA
TTGTGGGATTATTTCGAGAGTATTACAATAGAAATCTCTTGGGAATTCTT
CGAGGGAATTTTATTGTAATACACTCGAAACAATCCCACAATGCATCGCT
TTTTTAGAAAAATCAAAAACTCCGATAAGGTCTATTTTAATAAAATTCCA
TATTCTCATTTGCACAGTTGTTTCAAGTTATTTGTCTTATGAAGTACCTA
CATAACGTTTTCGTCCTTATTTCATCACGTAAATGAAACACTCTTAAGGC
TCTTCTTACACTACAAGAGTCTTTTGAATTCAAGAGTGATTTGATTTCTC
AGTTCACACAACGACTAAAAAAGTCTATCCCAACCTCGTCGCCGTACTTT
ATTTACGTTACTGATTGACGCCAGAGAATATAATATTATCTAGCGCTATC
TATCAGTAAGCATAAAAAAATGATGATACGATAGTAATACTGATAATACG
TAGGGAACGAGGTTGAGTCTATCCAACAACGTTCACGACGCCACGCTAGA
TGAACGTCAGTTTAACGTCATTAGATGAATGTTGATACGGCAGTGCCGTA
GGAAGCATTTCCATATTGGGGGGGGGGGCTGAAGTTTAGTGACGCCGGAG
GGCCAACCATGGTTTGGCCCGAGGGGGGGAATTTTGAAAATTTGACAACA
AAACTTTAATTGAAAATGGTCACATCACTAAAGATTTTCGTGTATGTATC
CCAAGCCTTAATCATAAAAATGTAAGTGTGCATCGGGCCTTAATTCTTCT
TTTATTCCAATATTTGTCATTCTTCAGTTTATGATATTAACACATTCTAC
CGAATCTCGTTTTTAAAGAAATTGATTTCTAATACGGTTGTGATATATAT
TTTTTCAAACCTTATCTCTTCATTGCTTATACATACTTGCTTGCGAAAAA
AAGATTGTTAGACTCAGAGAAGAATTATTTTTCGTTCGATATTCGATTTA
TTGATTTGCATCAAAGAAGATTTTCTTTTGTATTTATTCTTGGTGGTGAT
TTGACATCTAATAAACTGTACTATATCCAAGTCTAGTTCATGTACCTCAT
CCGATGTTTCGAAACTTGACAACCCTTAGTTCTGGATATGTTAATCAATA
CATTTGATATTCGAACTTACATTCTGGCGTTTCATTTTGGTTTATTCATA
AATTTGTAAAAGAACGATCAACTTGATTTTTAAATTGCATTTGGTCTCAA
GAATCTTTTTTCAAAATGTGATTTTATGTAAACAATGTCACGAAAAACTT
CGCTATCAACACGGCGTAAATTTAGTTCGAATGTCCGGAAACTATCTTCT
AGTTCGAGTAGTGTTGGTGTTGTTGTCGATGGCGTGAGAAAGAAAATCTC
AAATGCTCAGCTTTCTTTTCCAGGGTACAAAAGACACTCACTTTATCAAA
CTCCTATTATTCGAATCTCTCTATAATTCGAGCTAATTCCCAGTACCCGT
CAAGGAGAAACCCTTTTAAAGTATTCACTGTAATTTGAATCTCTCTGTAA
TTCGAACAAATAAGATTTCCCATTCAATCTCGAAATAAAGAGAGCCTTAT
AAATGTTAAGTGATGACGACAACAAACTCTTTTTGAACATTACCACAGCT
TTATCTATCTCAGTGCTCTAGTGTAACCAGCAGAGACAATTTTTCTTTCT
GGTGTACATTAAAAACTCTAATCAACGTCCAGCTAATAAAAAACGGTCAT
CAAAAAGTTTTAAGGAGTCCTTAAATTTTAAACATGCGGTTTCTATTCCA
TCTCAATCAGGTTAAAAAAATTGCCAGATTACTGCACTATCCACGTAAAA
TATGGTGTATATGCTGAGTTTTATTCAATACTTAGATTTTTTCCCGTCTC
TTATACAGCTAAATAACGGTCCATAATCAAAAGTTTTTAAGGGTTCTTAA
AATTTTAAATACGCAGTACTATCTCAATCAGGTTTATATATGCTAGACAT
TCAAAACTCTAATCAAACTTTTTCTCCTTCTCTAATACAGGCAAGAATAC
TTGGACGATCTTTACGAAGTCGCTCGATCACGTGATGACCCACTACTCTT
GGAATCATTAGAGAACTTCTTATCAGCCACTGTAGATAATTTACTTAAAA
AACAAGCCGATAATGAAAGGTTGGATGCCGCCCTCAAACAGTAAGTCAAC
TTGAATTGGGCTTTTCCTTAAAAATTCTAATATGGGGTGTGTAGGATATA
ACATTTTTACATTTACCCCCTGGACTCGAATACGACATTCTGTAACTTTT
TTGCCCAATTTCCACCACAGTGCAAGAATGAGACCCGAAATACTAGCAAC
TAAAATTTTCTTTGAAATTGGATTTTTTTTTGTCGAAAATTCCAGAAATT
TGTGCAAATATTCCCCGATTTCGTCCAAGCGAATTTCGCAATTCCTGGGA
AAAAAAGTAGATTTTGCTCTTCAACCAACCAAGAAACCCCCTCACAGCAT
AGCCTGAGCTGAGTTCTAAGCTCAAGATTGTCTTACACTCACCATTTTAT
GAGTATTTTGGTGCAATTTCCGAAAAAAAATGAGCGTTTCAAAGCCCGCA
AAGCCTTATAAATGTTCTTAACTTGGTCTTAATTTTTTGGCTTTGAAGCC
TTGTGTTCTTAGACAAAAGTGTATTTTACCTGCAAGCAATACTCTTCTTT
TCGTAGCGCAAAAGATCAGAATACAGAGATCGCCGCACAGATCGAGGATG
AGATGGAAGAACAGGTTGCCATTATGGAAGAAAAGATACGTCAAGAAGAA
GAACAAAAGCTGACTCAGCAAAAACAAGAAGCGCATGCGCAATTACAAAA
AGCCAACGATGAGTTGGGAGATATGGAACACAAAATTATAGCTGTAAGTT
TTTTTGCTTTTATTAAGTTGACTCAATGAGTAAATGAGTCAATTTTGTAA
AAAAGTCTTATGAATAACTTCCTCGTCCATCTTTTGTTTCGAGATACCTT
ATCGGCCAAAACTTAGTCGGCCCTAAGTGACTAAATTTTGGCTTGGTGAC
TAAAATTAGGGCCGACTAAAAATTTGGGCTGACTAAAATTTGGGCCGACT
AAAAATTGGGCCGACTAAAAATTTAGCCAAAACTTATAGTTATTAGTCGG
CCCTTACTGACTAAATTTTGACGATGTGACTAAAATTAAGGCCGACTAAG
TTTTCCCCGATAATGTTTTAGTTGCACGAAATGTTTATAAAATTTTAGTT
TGATAGCTAGTTTCGGAATAAGAAGGTATTCGTTCGATAATCACAAAACA
TTGATGATGTTATCGTCCGTTACAGTGATAGTAAAGGCGGGAAAATATGG
CGGTATGCCGTTATGGCGGTATATGGGAAAGAATCGGTGGGAGAGTTTCG
AAGAAAGACTGGCAACTCTACACCGACTGTAAACTCTTTTCGGCAAAAAA
AACCGTTTGCGAATTTTCTTCGGCTTTGCTTGGGCGTTTTTCTTAGATAG
TGATTCGTCTTAGACTATAACATAGTCTAATCAAAACATTGATTACAATA
ACATAAGTTTTACAGATTTTCAGCCGTTGCAGCATCGATCACGCTTTCAA
TCTGCAGGTCTTCGGCCGTTAACGTAGGTCTTCGGCCGCTGGAAAACCGC
GATTTAAAGTTTTGAAGGTCTTCGGCCGTTGATGGAAAAAAATTTTGCTA
CAACGCATTCTATAAAACTTACAAAATCCCTTAAACCTGAGAGAATTGAG
TCGCAAAAGCCTATTTCTCGTGTCATTGAAACTGAAAATATGTATTTGTA
AGTAAGCACTTGAATAGAGTTTTTGTTTTTTTGTTTTTGTAGTTGGAAGA
GAAATTGAACGAACAGAAGATCAAAGAAGCATCAATTCCCGATCATTTTA
TCGATAAAATACAACGTAAAGAACAGGTAAGATTGTATTTACTGTTAGAC
GGGGGTTTGGCTTTGCAATCTTCGAGTTCTTAATCACAACTTGTCGTAAC
CTCTATTTTTTGAATCTCTCTGTAATTTGAAGAAAATCTTTGGTCTCTTG
AAGATCGAATTAGAGAGAGATTCAACTGTATCAATCTCGAAACTTTTTTT
TTTGTTGATAGAAATAGCATGAGAAATAACTTAATATGGTTAAATAGCTT
TTTTACTTGGCCGGTAGTAATAAACTAACAAACTCGACCGTCTGTCCTAT
ACTACTACATTGGGCTATTCCAGAAAAAAAATGCACCCCCTATATTGATG
AGGTCTTTTTTTTAAAAGGCGACCCCCTGGGTTTTCTTCCCATTTTTCAG
GAGCCCCTTGGATTTTTTCTCCCATTGTCTTGGACCACCTTGGATTTTCG
ACCTCGTTATACTGACCACCCTGGATTTTCAATCCGATTTTACTAACCAC
CCTGGATTTTTTCATTCAAAAAACCAACCCTCGATTTTTTATTTTCCAGA
CCACCCTGGACGTCCCACCTCCTCAACATAGGGGTACAGACTATTTCTGG
AATAGCCCATTTACAAGGTCGACTTACTTTCTTAATTCTATTTTCTATCC
CTATAGGAAAATCAACAGCTACAAGCCAAACTTTTAGAATTTCACACCCA
GATGTCGCTCATGCGGACAGAAGTGGCCGCGCTGAAATCTGAATACGACG
AACAGAGTTCACGTCTCCACAATGAGAGAGGAACAGTATTGAGTTGTGTG
AGAGAACAAGAAAATTTGACAAGACAACTTCAAATGTTACACGAAGCTAA
TAAGAGACTGCATGATACGAATGATGACCTCAGATCAGCACTCGATGTAA
GAAGGTTTAGATTCTTTTTCCAGGGAGTGATTTGTCAAAATTATACACCA
CTAGAAAACCGAGTACTAGATTGTTGTTATCGTCAAACGAATCTGTGGTT
ATACCTTTTTAATCTGTCTCGATATACTTAGGCATACAAACATCTGCGAG
CAGAAACTTTCGTGATTTTTGTGAATTTTGACCTTTGTCGCGGAGATTTG
ACAAGACAACTTCAAATGTTACACGAAGCTAATAAATAAGAGACTACATG
ATACGAATGATGACCTCAGATCTGCTCTTGATGTAAGAACACGTTTTTTT
TATAAGAACAAACTATATAGGAATATAAGGCTTGAATGATCAAATTGTTA
AGAACATTTTTAGGCTTTGCGGACTCAAAAAATTAAGATTCGATTCGACT
AAGGTTTCAAAAATTTTGAATGTTCTTATAAAAGAATGTGTATATGTCAT
TCATATTATTTTGCTGAGGTTCCATCTGGACGTTGCAGTTTGTTCTAAAA
GCTACTGACTCTTGTCTAAATTGTACATCACTAGAAAATATAGCACTAGG
CTTTGAGAATCCTCAAATTCAAAAGAATTATCAAACTGTGATAGTACCTA
TCTTCGGTTTTTCCTAGGTCTGCTTTATTAACCTAAATCTACTAGCCCGT
TCCTTCATCCATTCATTCATTCATTCATTCATTTAATCATTTGTGTCATC
ACAAGCGATTTGAAGTACAAATAAAACGGAGCGTTCTTGAGACGTTCCTG
AACGTTCACGAACGTTCCATAGCGTTCCTAGAACGTTCCAGAACGTCCTC
GATCGTTCTTAAACGTTCAGGGACGTTTCTGAACGTTTCTGAACGTTCCA
GAACCTTCAGAGACGTTACAGAACGCTTGAGAACGTACTGGAACGCTCAC
GAACGATCTTTTGAGTCCAAAGGTTAATATTGACTCAATAAGAACGTTAT
GGAACGTATGAGAACGTTCGAGAACGTTATGGAACGTTCAGGAACGCTTC
CGAACGTTTTAAGACATCCTTAAACTTGTAAATAAAAGTGAATGACCAGG
AATGTTTAAGAACGTTCTCTAGCGTTCTTACAACGTTCCTAAAAGTTCAA
GAACGTTCCATATCGTTCGTCTTGCTGGAACGTTCCATTTCATTCGTATT
TAAATTTGCTTGTGATGACACATTTATTCATTCATTCATTCATTCATTCG
TTCATTTATTCCTTCTTTGTATCTACAGGTCAAGCGAAGTAACAGCTTTA
TGAACGAGAGTTCCATTTCACCGTTGAAGCGTTCACAAAGTTTCGCTCAT
CAACAAAATCCACTTTTCAAACACGATCTACAAAGTTCATTCAGGTCAGT
GTAGACTGAAGTCATTTTTAATCCATACAATACATAATATATGGAAATTT
CTAGCGTCTAATGGTATTTTTGTCTCGATCCTCCGTCCGATATACAATAC
ATAATATTGATGTTATACATAAAAATACAATAATCGTAACAGGGTAATAT
CAGTTTTTATCCCGCACCAGTAAGATTCTAGCGATTTCATTGGTCAACTT
CTACTGTTTTTTATTATTATCTGATTTTTCGCAATGTCTGAATTAGACGT
CTACCATACTATGTTTTGAGTGTTTTTTTTTCATATGGAAATTTTGTTTC
TGAAATTAGACGTTTAGCATGGTAAAGTAACGTCAGTGGTTATTTGCTTC
GATTAATTTGTAGATCAAAGTGTTTCCAGGATTTCCGTAGCCAATGAAAT
TCCTAACCTCGATTCTTAAAAAGCTTTTTTTTCAATTTATCATTACTTTA
TTTCCAGAAGTGATCCTGGGTACGCTCGTCATCATTCCACTTTAAACAAC
ACCGACTTTAACGACACTGATGACGATTCACGTCAATCATTCTCACGTGA
CGATGATGTCATTGATGACCTCATTGACAACGATGACGTCATCAATCAAC
AATCATTAATGGCGGAGTTAATGTCAGCTGAAGACCAAGCAGTAAAGATC
TTTGTTTTATTTTGCCGGATAAAAATTTCATCGAAAGCTATTGCTTCTAT
CAAAACACCTGGGATCAATGTTTTAAAAGAAGACATTTTTTTTAGGAGTT
TGGTTTGGTGGATGGCTATAAAAATTGATTTGGCGGAAATTTAGTTTATT
GTTTGAAGGATTTTTCTTGGCCAAAAATTGTTATTGAATAATAAGCAAAA
AGCGCATATTTGACATTTAACATAAATTAAATTGGGTGGAAATTAAATTT
GGCGAATCAAATTAATGCTGACCGAATACAATATCTTTCAGTTTCTTTTT
TCGACCATCCTGCCATCCAGCTTGAACTTCCACCACGCAAATGGACGATT
TTATTCGGAATTCTTATATTTTCAACACTAAACTCTTCTTTCCGTCGGAG
TTCCAGGAGAATAAAATGACTACGTTCTCTTCGATAGATAGCCTCTCATT
GGAGACTGTTCCTCTAACGTTTCCAGACCATCTAAAAAGAGCGACAAATA
ACTATTAAAAAGCGACAAAAAGAACGACAAACTGTAACCCTAACCCTAAC
TAGCAAAGAACGACATATTTCGCCGTCCACAATCCCGACTGAAAGTGACT
GTACTACCCAGATACACTCCTTTTTGTTTATCACGGGAATTAACTGCATG
TGGTTTAAAAGAACAATAAATTACACATGTGTATAAGTCTCTATTTGGGT
GAACTGGAAACATGATGGACGATTTTATTCGAAATTTGAATGTTTTTCAA
CACTAAACTCTTCTTTTCTTTCCTTTCCTTATAGTTTGACCATCCACCAC
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AATATCAGTGAACGAGAACAGTTTGCACAGCAGTTGGAAATGTTGGCTGA
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AAATTACAATAGAATTTCAGCGCTTAACCAATCAGAAGCTTCGCGGGTTT
TCGAAAACAGTAGCAGCAATATTTTTTTGCGATATTCTATTTTTTTTTTG
CTTGAAAGAGCTTAGCACGGCATCTAGCCCAACAAATTCAGTAAGTCGAA
TACCTTACATATTTTTTCTATAAGGCTAACGTTTATAAGCATACTCAGTT
TTTTGGATCTAAACAATGGCTCTATTGTTTAAGGGCTCTATTGTTTAAGG
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GATGTATTGTACGAAAATAAGAAGGTGTGTAATATACACTATTACTGTAA
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TGTATTCAACTATATTATCCAATGTTTGCTTACAGTGTAGCCTGTGTAAA
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TTTTATGTTCACTTCTATATAAGTATGTATAAATAAATCAATTAACCAAG
AGTGCTCAATGGTTGCATGCATAACACAACCAGGGTGAAATCATACGATT
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GTGAATACAACAAAATGACAACAAATTATTCCTTATCCGGATTTTAATGT
TGGATTTAACTTTTTCTTTCTTTTTTTTTGTAGTGAATACACTGAGCGAC
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GGGTATCATTCGGTAAGATAAACAATTCTCTTGTATTTCTTTATTTCTTG
GAAATTTGTATTTCTTTTGTAGTTATATACTATTTATTGGGCCTTTCCTA
TTTATACTGATCATCTGAAAGGGAAAACATATTCGGGGAAATCTTTGTCA
CTTTTGTGAAGATATTTGTCAAAACTCCCTTAGACTGGAGTCGTTTATAA
TGCATGTAATACAGTAGTATAGCCGTTATATGATAATACGATTATTGTTC
CCTCCATTACTTTTTGGTTTATTTCTACTATGTCTGAATTAGTTGTCTAG
CTTGCTAGACTAGAACTCCCTTGAGTAGTTGAACAGTAAGGTTATTTGTC
GGCTAGGAAAACCTCGCCAATTGCTTAAAAATTTCATCATTTTACCCCGA
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GGCTTTTTGCGTTTTCGCACTCATGCTAAGCAAAGGTCAATTATTTCGCT
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TTACTGTGTCATAAAAATATGCTCTCCTACACAAATTTTGCGCCCCTCTT
GTCTACGCTACTGTGATAGTATTGTCTTTGAAACAGAGATTCATACCTTA
AACGTTTAGACACAGTTTGCATTTTTGAAAAGTCTGCTTTTAAAGTTTTT
AACATAATGACAGTATTGTCTTTGAAACAGAGGTATTATTTAGATTTTTG
TGACAAAAGTTAATCCGTCGAAGAAAGACATTTGTTGCAATATTTTTGTC
TTGCAGTCAGTGGTATTACTTGCATTCGTGGCTTTTCTTTTCTCTTGTTC
ACCGCTCGCGTCGGAGCAAGAAGCTTTGGAGTTTTAAAAAAGCGCTGATA
GGAATCATTGTGCATTACAGGGCGGACGGAACTGTATTTTATGTTTTAGT
GTTGTTTTTTGGTATTGGTAAAACTTGAGGTCTTCGTTTTACGTCTAGCT
CCTTTTGTTAACTTAAACGTGGAATATTATATTGACTTTATTGATCGATT
GAATTTGGAAGTTTTGTAGAAATTAGCTTGGCTATCGTTTTAACTAATTT
TTGGTTAGTTTTTTGGACTACTAATTTCTACCGCTATCATGGTTGAAAAT
AAAGATAATGACGTAAGGCTTATTTTTCTTTTCGTGAGAAAATCTTTTAA
ATCAATGTAGTTTTAGTACTCTGGAGAAGAGTGTAATAGGAAGAGATCAT
TTTCGACAGCCTTGTGTCATAGACCCGATGGGACCCCTGCAACGTTGGAA
GATTTGGCCAAAATTTCGTCCCCGGTTGGAAAACCGAGCCCAACTGGGAA
ATTAACTTTGTTCTCTACCCCCACTGGGTTTTCGACCTAGAAGCAATAGA
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ATGACGTTCCACCGGGGCTGTGAGACAGGGGTGTTTAATGGGTTTATGAT
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TTCTGGTGTATCCCTGATGAGGTTGTGTGGGTGGCGTGACCCATTATCAA
TGAGATAATGAGCCTAATAGTTAATGGCTTGTAAATAACGAGAAATTTTT
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GTTGAGTCTCAGTGCAATTATGAAGGAATGAAGGAATCCTTTTTTTCGAA
CATGTATGAAAGCTTGAAAACAAGTGGTATTTCTGTCACACACATGTGTA
GAGAAAGAGATCAATTTTAAAGAATAAAATATTTTAATAAAACAGCATTT
TAAAGCATATAGATCGAACTCATGTGAAATTTTTAACACCGGAATTAAAT
TTTTGTAGTCGAATATTGTTTTTTCGGCGGGTGTTTACAGTCGTCAATAT
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TCGCGAGTGGACCTTCTCACCCGGTTGTCGAGAAAAGAATGCAAATACAA
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AAATATTTTGGAATGTAACGGGTTAACTTACAAGATGAGAATTTTCTTGG
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TGAGAAAAAACCTACAAATTCAATGTAATATTTTGGTGTTTAGCAGGTGT
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CTAGGTAACAGGGGCTAAAAGAGCCTGGTTAAATCTCTTCAGCGATTTGA
TGTAACTATTTGATTATTTAATTGTTGTTAATATAATTTGTTTAATGTAC
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AACATTTTTAGCAAAGTGACACATCGACTGCTGAAGACACAACAACAAAC
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CTTTTGTACCACTTGCGATGGTGATACAAAATCAGGCCTCACGAACTGCC
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TGGCCGTAGTAGTTTACAGAACTCTCCTAGAGTCGAAGACCCTTTGAAAC
CATTTGGAAGTGGTAGTTCAAAGTCATCGCCCAGAACACCTCTAAGATCT
GGCCGCAGTAGTTTAAAGAACTCTCCCAGAATCGAAGATCCTATAAGAGC
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AAGACCTTATAGAACCGTCAGAAATTGCTTTAGACGAAAGTTCTGCACCT
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CTTACTGATTCAGACTCGGATGATAGTTATACTGAACAAGAAACAAGTCA
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CATAAGTTCCTTAATGAGTTTCGATGATGCTCTCTATTCAACTCGAACAA
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ACTCGAATTTCCTTAATTCGAACAAATTTGCATTTCCCATACGCATTCGA
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TCGAAATCTAAAAGTTTTAAAAGAACCATTCCTATTTCATTGCAAAGAAG
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AAAAACGTTAAAAATCGACCTATCAAATTAAACAGAAGCATAATTACATG
ATATATCAGTATTTTCGTTTCATTCATTAAAAATGATAATTAGCTGTCTA
AATGACCTTTTGTTATTTAAAGGAAGGTTTAATTTCAATGAAAGGAAGAA
AATTTGTCAAAAAAGGCCAGATAATCTGGTAAAATTCATAAAAATACATC
AAATATGGGTTTCGAGGTAGATCCAGCCTTACATAGACTTTATCCAGACT
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TATGTTACTGAAAAATGCTCTTAATCGTGTAAAGGCTATTGCAATTGCCA
AATTTAGAGTAAAAATTTGATAGGTCGATTTTTAACGTTTTCGAGCTCTT
TCTGAAAGTAACTTTTTTATTCAATTGAGTATAATTTTTGATCTAATGAA
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TTTGGCACCGTATTTGGCATATTTTCTTTTATCTTAACCGATAATCTCTT
AAGACTGAGATCGACGGTTTATAGACAGATAACTCTATTTCAAGTCTCAG
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AAGTTTTAAGCTTTGATCGAGGTTTTTTTGGAAATGATACCCACAAAAAC
GTCATTGCAGCGTATTCATGATATGCACCACTGCAATGACTTCACGAAAT
TATGCAACTTTTCTGTCTTTTTTCCCCACCCAATACGTCAATTTTTCTAC
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GGATTGACCATTTATGCTACCCGTACCAATGGCAATCACCAGTTTATCCT
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CCTTATAATTTAACAATCGTTTTCATCTTTCTTTTTAGATGAGCATGCTT
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_038221	XLOC_038221	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_349	supercontig	scaffold_349:680658..704745 -

Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00060882 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: RASEF (Ras and EF-hand domain-containing protein OS=Homo sapiens GN=RASEF PE=1 SV=1)

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            +K+VLAG+AAVGKSSF++RLCKN+F   ++ATLGVDFQMK +IVD ++  LQ WDTAGQERFRSIAKSYFR+ DGV+LLYDVTCE SFL++REW++ IE ++ + VP++L GNK D+R  A   G   +    G++LA   GALF ETSAK+G+NI  A   L R +++  +     + T      S+K P+   CC
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HSP 2 Score: 83.5741 bits (205), Expect = 6.473e-16
Identity = 75/269 (27.88%), Postives = 146/269 (54.28%), Query Frame = 3

Query:  534 RVGWKDGILPGQEYLDDLYEVARSRDDPLLLESLENFLSATVDNLLKKQADNERLDAALKHAKDQNTEIAAQIEDEMEEQVAIMEEKIRXXXXXXXXXXXXXAHAQLQKANDELGDMEHKIIALEEKLNEQKIKEASIPD--HFIDKIQRKEQENQQLQAKLLEFHTQMSLMRTEVAALKSEYDEQSSRLHNERGTVLSCVREQENLTRQLQMLHEANKRLHDTNDDLRSALD--VKRSNSFMNESSISP---LKRS--QSFAHQQNPL 1313
            R+G +   +P +E +  LY+   +  +P L++  E+ +   +  +  +  + E L  A+K A+D+     +++E+EM++++   E K R++E++K  +   +   Q +    E+GD++  I  L  KL EQ  + +   D      +I     ENQ+++  LLE  T ++ +++E+ ALKS+Y +QS     +   + +   ++ +L RQ+++L  AN++LHD+ND LRSAL+    + N  ++ ++ISP   + RS  +   H   PL
Sbjct:  134 RLGDEAKFIPREEQVSTLYQNI-NLVEPRLIQPYEHVIKNFIREIRLQSTEMENLAIAVKRAQDKAAMQLSELEEEMDQRIQAAEHKTRKDEKRKAEEALSDLRRQYET---EVGDLQVTIKKLR-KLEEQSKRVSQKEDVAALKKQIYDLSMENQKVKKDLLEAQTNIAFLQSELDALKSDYADQSLNTERDLEIIRAYTEDRNSLERQIEILQTANRKLHDSNDGLRSALENSYSKFNRSLHINNISPGNTISRSSPKFIGHSPQPL 397

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00060882 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00060882 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
RASEF	1.746e-56	53.30	Ras and EF-hand domain-containing protein OS=Homo ...	[more]

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TCONS_00060882 (transcript) - C. hemisphaerica