TCONS_00058185 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00058185
Unique Name	TCONS_00058185
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3010

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_308:21043..33446+

transcript sequence

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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_308:21043..33446+

Legend: exon

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>TCONS_00058185 ID=TCONS_00058185|Name=TCONS_00058185|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12404bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_308:21043..33446+ (Clytia hemisphaerica)
ttcagtttctagCTCTGGCAATGTTCCATTTTATTTAAATCTTTGAAAGA
GTTACAAGAATTTCTGATTTCCACACTAAAGATTCATTATGGCGGACAAT
GGACTTTCTGCGACGGAGATTCTTTCGTTGGCATCAAAGATGGTAGGTGA
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gttc

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_036665	XLOC_036665	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_308	supercontig	scaffold_308:21043..33446 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.453345	0.188471	0.221651	0.0467613	0.0897036	0.174749	3.76453e-07	0	0	0	0.236884	0.180963	0	0	0.636889	0.263575	0	0	0	0	0.193685	0	0.364626	0	0	0.730129	0.536076	0.321577	0.0937867	0.292203

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00058185 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00058185 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00058185 (transcript) - C. hemisphaerica