|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00055817 ID=TCONS_00055817|Name=TCONS_00055817|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=289bp
TGATAATTTTCTGCTTTTAGATTCAATATGCTATCTTTCGTAACCGAGGA
ATATAACATGTGTTTGATGACTCTATCGATCGATGCTTCATTATTTTCAC
TTGATTGCCTTAGATGGTCATCTCCAGAAGCAGGAACCAACATCTTGGCA
TTTCTTTATCGAATTGAtcatccaaagttttgaaacagaaaacaagaaag
gattacttcAGCTCTTGAACCagGttgataaattaaattttcaaaacaaa
gacaAGAGAAATTTACAATTATTTCTAAATACAAAGGTA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_260:26927..44688+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00055817 ID=TCONS_00055817|Name=TCONS_00055817|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17762bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_260:26927..44688+ (Clytia hemisphaerica)
TGATAATTTTCTGCTTTTAGATTCAATATGCTATCTTTCGTAACCGAGGA
ATATAACATGTGTTTGATGACTCTATCGATCGATGCTTCATTATTTTCGT
AAGTTGTCCAGTTTCTCTAATGCTcttcgtttttatttttacttctccct
tttcattttcatctggAACGAAACgcaagtcaaataaaaaataataatat
ggaTTTAGCTAATGTAGTCAGACATTTCAGAGACATTTTCTTACATCGCA
CTTTCTATCGTAGTTAGGACTCCCCACCATCGCTAGCTGCCGCTGAAGCG
CGTTAGTGACTAGTAACTTTGGATTGTTAAACACGATATATGCATACATC
TCTCTCTGATCCACTTGATCGGTTGGTTTGATGATAAATTTAAGATAAGA
AATTCCCGTAGAAATTCCCGTCCCATAGCGagtaatagcgagtttatgtt
tacaaaacaaagtcgatagttgatgtacgacACTATATCACCTTTGCTCA
CACTACTGGGTCAGAAACCGTTCGATTCGGACACACGAACGCTTTTCCAT
GCGTGACAAACGGGTTAACCGTTCGCGACGAATGCTTTTGCATTCGTCGT
GAACGCCCTaccaaaaagttttattgaaacCGTTCGCGACGAACGCTTTT
GCTTTTTAACCCGTTTGTGACAAACGGCTGAAAAAGAAAACCGTTCGTGA
AGAACGCTTACAAAAATTTGAGATATGAAACCGTACGCAAAGAATGCTTT
TCCGTTTGCCgcgaatgcttttaaagaatcaTTCATAAAACCGTTCGTTT
AACATACGCAACGAATGGATTTTAATGGGAAAcgatttctaagaaaattt
attttacatttACTTGGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTacccaaaaaatcggtat
cggaattgcaagtatttttttacggaatttcggaaattttggctaaatta
ttcggtatttcggaaatcgcaaaccccgtacgccccccatatattagaag
gctagaaatcttcgatgctgatagtaagaatgttcagaacagacttgagt
tctactaaaaagtcttatttcgtCGGGGgtgcctagaatttcttttgatt
tattacataaaagaaatcaaaagacattaacgaccaattaccgacaaatt
catctcctgtctttctttatacctctatggtttGATAAAGAATAGAGTAA
GAGACAGATGTGTATGCGAGATTTGTTCTCCAAAAACAAGACACGGTGAA
AAGTTATCAGTCCCCACCATTTTTGAAGGAGAGATCCTctttaaaattta
cgttttctagttttgaatgtttttattaattgtatatattcaaaaacatt
cgaacacGAAAATCATTGTATCATTACATTagaaaaacaatggaatgact
ATTACTAATGCTTTCGAGCGACTTTCTTTTCCAAAGCGTTCGTTATAAAC
GCATTCTAGAACTCGACACGTCACTAGCGTTTAGTTCGAAAACTTGCACG
TTTTTCTACTTCCTTCCCtttaatttcaagaaaatgttatacattgtaaa
aatgaaaatcaaagctTTTTTTAGAGCGTGGGAGATTTCTATCACGTAAC
AAGCAttggaatgtcttctttttcttttaaatgttgcaaaaaaAGGGGAG
AAAAATGTTGCCCAAGAATGGCGGCCTTCTTGATCTTGATAAAATGACAC
TGCgttgtcttctttttcttcacagAGAGCGGAAATAAATGTTTTAACAT
CTTTATAGCGCATTTCATTTCATCGAGGATTTAATCGATACTTAAAAAGT
ATCGATTAAATCCTTGATGAAATGAAATGCGCTGTAAAGTGAATTTCTAT
AGAGGATTGTTTCTGTTTTCTTACCTTGTACCTcgacaaaaaagtaaaat
gtcaaggaaaaatcaaatgattctcATCAGTATCAAATAAACTTTCTTTA
CACCCTGTGTcagttagcctgggaatccatgctatgatttcttctttgat
gaactgatggcgaaatgtatagcatggtacgggctgagagtttgaatttc
tcagatcctgataacggttgaaaacatagccaatcaaattttgctattct
tttactggtcacactttcttagagaaagcgcaattttcgaaatttggttt
ttattttagtaagtgaggacagcgctaaattcgaatttcccactgtaaaa
aatgtgagtccaatattggacacacagctcgaacccgtcttgtgtacccg
tttgaagttaaaataaaatgaaatgatttcaattattattaaactttcTT
TACACCTCAGTGTCTCAGTGACTCTGATTGAAATCAAAGAATAATCAAAT
GATTTTAATTTCTATTAAACTTtccttacacccctgtctcagtgactccG
ATTGAATAAAACAATAATcgaatgattttaattattattaaactttcctt
acacccctgtctcagtgactccgtttaaagtcaaagaaaaatcatattat
ttttatcattaaaatttctttatacCCCTGTCTTGGTGACTCTCTTGGTA
AGTCAAACAAAGATAAAATGATTTTCACCTAAACTTTAAAAACAGTCAAT
GTGAGCAAAACCTatgttaaagattttgttttaattgaaaggtctgatga
tgctgatgtagtaaaaacaagtgggacaagattagaaaaaggatttgaaa
aattaaaaaatacattcaatAAAAAAGCATTCCTCAAACAAAGGGACTTT
TACTAatactttttcgaatgtttttttgtttataatataAAGTTTTCTAT
TTTATAATCTGTAAATTTGCTCAAAGTCAAAATcaactttgttatttttt
ttgtttacaaaaccaAAAGAATGCGAggtcacatctcgaaacaacttttg
atctttcacttgtttgcaggatattgttgcgtaaaaaagtagctttaatt
TATCTGGCTCAGCATGAAGACAGtgcctaaaataagctccttttattccc
gTATAATACCTTTAAGAACAGTTAAGAACGATAATCTTGAGAATTGTTAA
GAAGAGCCATTCAGCacacatttttaaaaacttacaACCGTTTGTGACGA
ACAGTTTTTAAACGATTGTTCGAAAGCATTTGCGGTAAACGGAAAAGCAT
TCTTCGCGTATGGTTTTAtatctttaaagtttttaaagcgTTCTTCACGA
Acggttttctttaaaaaccgttcgtcacaaacggtttcccgttcgtgacg
aacgctttcattaaaaaaaatcataagcatTCGTCGAACCGATGGAAAAG
CGTTCGTGTGTCCGAATCGAACGTTTTCTGACCCAGCAGtgtcacctaaa
cagacgacggtattttggtgtttttaccgtcgttgAGCAAAGTGGACGAT
GTGAGACGGTGAGACATATCattttgctttataccgtccccgcccctcga
tttatctcgaatacataaactcgctaatctTAGATCGGTGGGTATGATCT
CTCGAGATCAGTGGTCGAATTGAATGGAAGagaatcgaatcaatcgaatc
aatcgaattcaATCGAAGTAAATTGAAGTGATTGTTCAAATcgatcgaac
tcaatcgaattgCTCGATTGaacaatcgaaaccaatcgaagtgattgatc
gaatagatcgaatccaatcgaagacgatcgaagatttacatctttttccc
attttgattgaattcgattgattcgatcaatcacttcgattgagttcgat
cgattcgaacaatcacttcgatttaCTTCGATTGAATTTGATCGATTCGA
CTCCAAATCGAAAGCTcgtcaaaaactatatagaagacaattaaacgggt
atattcgatttctcagcctaactcgagaaaattgagatggtaattcctta
taaaatgaggcattttttcaaaaatgacgtcatagaacAGCTAgggacct
caataacttttcatattcaaatttttacttattaagattgatgtgatttg
aaatctacatcaaaaaacgcttcgaatggtatgtaaaactttgaaatttt
gcaacaacaatttttcacttttgcttgtgacgtcatcaattaataaatta
ttctcggacacgtccggtaaagatttttaaacacgccaagtaaatttttc
tgactctctaaactataaagatttcaaaataagtactcaatatttgtccc
tcgaattttcactgattcactttttttgatgtcatcagcTGCCTGTCTTT
TCTAACGCACCCAAACATGACCTAATTCGCTTCATTCAAAGCcgagaaaa
ttaaaattaaagtttGGCAATCATTACtatgaaaataattgaaaaaatta
gtttcccATACTAATCAAAAGTGATGGAGTcaatcaacaaaataaaataa
aaaaaccatTTCTATTATAACCATTTCTATTCCCAAGCTAATTAAGTGCG
AGTTTCTAATTACGTCCTAagcaattaaaaaatttcattttactttTACG
CTACCACTTAGGTGTTCTATTTATAGATGAAGATATCTTCGCANNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNTCATATAAAATTTCAAcgttatatttgaaatat
ttttcaagttattcaagaaatactatatttttgagttcactaaatgtcac
actatttttgaacatGATCCATGCAAGTGATGTCAAATGACTTTGGAcat
tcggtgaaatggtggcagaATTGCCATTCTTTTTTTTGTCAGATAGACCC
TTAGAGGGCTtactgtattttaagaaataaaatatttctagaaataaaat
atttctaatttgtaatttaagaaatattttatttcttaaaatacgaaaat
gagaaatatccTTATAACTTATCAATGGATGATCCGAATGACATAACACT
CCACTGATGTAAGGCACAGGTATTGACAGTTTAGGacacaaaaaattgac
ttcatatgctgacgtcagcaaattctgctaaaacattacttaaattacga
aaatgagaaatataatGAACCCGAATGGTATCTGCacgaaattttgctca
caaacttgtattggaaggaggagggcttctgcaaaatttcatctcgtttt
gctgacgttagcactttttataagaatatttcttaaatttgtaatttgag
aaataaaatatttctcaaaatactaatttaagaaatatgctcgtaacttt
tgattggaagatggcagcattttcaaattttgcagtcttgtaccacatca
tactccggagtctcggtccaaatttggaatcaatccgatgacgtcataga
tttttatggcaaaatcataattttcaacttatgcagccaaacgtgtaagc
ttggccaaaagctagaaatggccataaattctgaactacgaATAGCNGGA
ATAGCCAGTCacccaaattttgctcacaaactcgtattggtaggaggagg
gcttctgcaaattttcatctcgttttgctgacgttagcactttttataag
aatatttcttaaattcgtaatttgagaaataaaatatttctcaaaatact
aatttaagaaatatacTCGTAACTTTTGACTGGAAGATGgcagcattttc
aaattttgcagtcttgtactacatcatactccggagtctcggtccaaatt
tggaatcaatccgatgaggtcatcgatttctatggcaaaatcatcatttt
cgacttatgcagccaaacgtgtaagcttgactaaaagctagaaatggcca
taaattctgaactacgaATAGCCAATCTCCCAAATTGGATGGAAAACTTC
ACGAAAGAGAAATTGCTATCAAACAAACAACATGGGTTCATGGGCAAGCG
ATCGACAGTGACACAACTACTTCACTACTTAGAGAAATGTGTGGACTCGA
TATCCAATGATGAAGTTGTTGACGTAATCTATTTCGACTTCACAAAGGCC
TTTGACACCGTTCCACATCGCAGATTACTAGGAAAACTCGAAGCGTATGG
TACCAGAGGAGGGGTACTCGATTGGATGGTCAATGGAAAGTTATCCAAGA
AATGCCAGGTACAAAGTGGTGTATCACAAGGAAGTGTCTTAGGTCCACTC
CTTTTCgttatttacatcaatgatctaGCTGAAGTCACAAACTTAGAAAT
GTTCCTCTTTGCCAATGACACAAATAAGCTGGTTGTAGAAATAAATAACG
TTGAAGATGCGATTAGACTTCAGCACGATATCGAGGCAATGGAAAAGTGA
TCTGATGACTGGTTGTTGAAATTCCATCCTAACAAGTGCCACGTGTTGAC
ACTAGGGAAATTCTGGAACATTCAACATGCACAACATCACGAGATCGCTG
GCTCTGTCCTAGAACATGTCGATCAAGAGTGGATCTTGAAGTGATTATTA
TTGTTAGCGAATTGAATTTCGAAGAGCACATCTACACCAAGATCAAGAAG
GCTAACTCGATCGTAGGATTGATTAACAGAAGCTTCGACTACCTTTCTCC
CGAGATGCTCCGCACACTTTTCATTACATTTGAGAGATCTTACCTTGAGT
ACGCGCAAGCAGTTTGGTCTCAACGGCTGATAAAACACTCTGATGCAATT
GAAAGTGTCCAACGTAGGGCCACAAGACTTGTCGATGGTTATAGAAACCA
TTCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAGAATTCTCAAGATGTCCTTTCAT
TGCTTCAAAATTTGCCTTATTGTAGTTATAGTTTTCATTAATGCATTCTG
TTTCAAGGTAACATTCGAACGTAAATGATAGTATGTTTAGTAACGGAACT
GATCGAATACTTTAGGTGTTGAGTGATTTTTTTAGCCTATGAGAAGCGCT
TAATAACTATTAATAACTACTTTGTGGTatataataaagctttacaggtt
tgcagaccaccgtgaagacacatgggcctctataaccgctcgtacttttt
gcaatgatctttttgaaatagagtttttttcgcgggctccctggactttc
cattttgtgttgtctcCCTTGATTTAAGTattcattttttcggcttcctt
acaccattcttagATTATtcgtctttcatttttggtcaaatcctctgtca
ctcggTAAGGGAAGCTTTTTTCTTTCGTTATTGCTTGCatcatttttagc
ttttttggctgcataagtcgaaaatgataaatattatatataaatatttt
atttctcaaattacgaatttaagaaatattcttataaaaagtgctaacgt
cagcaaaacgagatgaaatttttcagaagccctcctcctactaatacaag
tttgtgagcaaaattttggcgactggctattcctagttcagaatttatgg
ccgttctagcttttggccaagcttacacgtttgactgcataagtcgaaaa
tgatgattttgccatagaaatcgatgacgtcatcggattgatttcaaatt
tggaccgagactccggagtatgatgtagTACAAGACtgcgaaatttgaat
ttgctgtcatcttccaatcaaaagtcacgagcatatttcttaaattagta
ttttgagaaatattttatttctcaaattacgaatttaagaaatattctta
taaaaagtgctaacgtcaNgaaatcgatgacgtcattggattgatttcaa
atttggaccgagactccggagtatgatgtggtacaagactgcaaaatttg
aaaatgctgccatcttccaatcaaaaggNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNtatttctcattttcgta
ttttaagaaataaaatatttcttaaattacaaattagaaatattttattt
ctagaaatattttatttcttaaaatacagtaagccccttagagcagttga
cggtcgATTTCGTTTAATGAAATTCAATGGTTCAATTACAAAAAtccagg
gtgtctacgggaccttgaaaaccttgaaaattccgaaaaaaaattcgtaG
ACACCCTGAAATCGGTTCTAAGGGTTCAGTTAACATCGCCtggctattta
taaatcatgcttcatcgcagaggtttttgtacggaaatttttttatcaaa
cagacaaccATACAGGAGTACTGTTAAGTCgggcaacttgcatcagtgga
gggaaacttgcatagccatcaaatgactgaccaatcaaagcagcaaaatt
ttaaacaaatgaactatgcagctgcgctcacagctctactttaccatttt
tgttttgatttaactttgtattttaatgaccaaccaggtcattcatttga
ggactatgcatgttagcctccaggCCGActctaaaaaaattttcatttca
ggtccaccgggtgacgaaaaaaaaagttatgtggGCGgccgggaaaattt
tttttttggtccttttcatgatttctaataaaaaaattaggaagaaaaaa
atcgtctCTCTGGCTGTTAGTGTTACCCCACATTctgtctttatattttt
tctctctttcactGAAAGAAATGTGTTGCTATTAATTACAAAAAGCTGTA
CTTTGTGATTTTTTCTCAGAATCAACTAATTTTTCATTCtaataaattga
ttttaatatgcataacactatttatttgatctttaacgTCCAGAAAGCAT
gctaaataaacaaactttttgaagagtgTTATATAGGAACGATGTAACAG
TTTGAATGAGTCATGAGTAAAGGTTTTTAAGAAGAAAGTTTGATCTGTTA
TCTATTTGGCtcttatgagaaaaaaaatgcgACCGGGTgacaacgaaaaa
aaatttcacccggccggtggaccggaaaagaaaaaatttttagggTCGGC
CCCACTGATGCAAGTATCAGGGTATATGACAACCTCTTCCCCCAAGGCAA
GGGGATTTTGTTcacttttcagattttcataGGGGATCATTGAGGGTTTC
CAGAGTTTCCATGTTTCAAAGAGAGAGATATTCTCAAACCAGGCAATAtg
ttgtcaataaaactttacCTGTCACTTACCTACCTATTGTACCTATTTGT
TGTGGCTTCTGCTTAAACAGCTCATCCAACTATTAAGTCTAATGCTTTGA
CATTTCCTTGAGGCTACTGGAGTCAATGCAATTTCTCTCCAATCTCTGAC
TTTTATGGCAGAAAATACCTCCTTTTCTTTCGTCAAAGTGAAAATTCGGC
CTTCAATGACGTTCCAGGTGTAAATTATTTGGTAACACTGTCTCCATCCT
CCGAGGATTTTGCAAGAATATTGCTTTAGCAATTTTAAAGCCATTAAGTT
TGGGAGCCACCAGAAATAAGCCATGGAGCAAAGAAGATTGAGTATGCATC
GCCCTttaaaagtgtgcaaaattgaaaattgttcaGAAAATGGATACCTT
TTAAATGCAGATGAAGAAGGAAATTATGTACAGCttaacaattttcaatt
ttgctcCCCCCCCCGCTCTAAACCAATCCTAAACCAGATTAAAACCTAAA
CCAAGTTATTTTGCAGACTCACAATTAAATAGGAGAAACTGCTTAATTCA
TATAAAAATCTCTTATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNatttaaaaaaaaaatcctttttcagACTTGATT
GCCTTAGATGGTCATCTCCAGAAGCAGGAACCAACATCTTGGCATTTCTT
TATCGAATTGAtcatccaaagttttgaaacagaaaacaagaaaggattac
ttcAGCTCTTGAACCaggtttgaaatgaaatttttttgttatcACGTTTT
TTAGAACTGTTTAGAAGAACATttgctttttgagttttaaaaatgctctt
aaaatgctcttattttcaccattttgtgagtatttttgtccatattccta
agaaattgggtgttttataGATATTTACTCAGCCATTACATTCATTCAAT
TATGTTTTAGTTCTTTGTCTATTTAAGACTTTATTTTCTACTTTAGGttg
ataaattaaattttcaaaacaaagacaAGAGAAATTTACAATTATTTCTA
AATACAAAGGTA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1491911889:26927..27024 | TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1491911889:26927..27024 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1510915933:26927..27024 | TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1510915933:26927..27024 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1575043694:26927..27024 | TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1575043694:26927..27024 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1491911889:44269..44393 | TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1491911889:44269..44393 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1510915933:44269..44393 | TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1510915933:44269..44393 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1575043694:44269..44393 | TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1575043694:44269..44393 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1491911889:44623..44688 | TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1491911889:44623..44688 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1510915933:44623..44688 | TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1510915933:44623..44688 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1575043694:44623..44688 | TCONS_00055817-exon-scaffold_260-1575043694:44623..44688 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_260 | supercontig | scaffold_260:26927..44688 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
