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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00054272 ID=TCONS_00054272|Name=TCONS_00054272|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9070bp CCTCATTTGAAATTAAATGGAAGGAAATTGCACGCTTCAAAACGATCCTT GTTGGATTTTtttaccttggaacaatagaatttccattCCTATTGGGAAT TCGATAAATTTTCTTCTCCACTGTAGAAAGAAGCTCCtcaggggctgtga gacagggaatGTAAAAATGGAAACGTGAAGAAAAGTCATTCCTCCGATGA AGTTTGAAAAGCACCTTGCTTATGGACATTTGACTTGCGAAATATCagtt aaatatttcataaagtTAGCGAAACATCCTCTAGCGGTTTGTCCTCAACT TTAAGGAACACAAAATTGTCTTTGGGTTTTGATGGGATATTACTCCTGGT CACTTGTCCCATATCGGCGTACGGATCACGGGAGTTTTTCCCGGCGTATT TATGTAACGAATGCTTCTTGTCCCCTCGGTCAGGTGCTGAGGAGCCGGTC GATGCGTACGCACTTTCGAGTTTTGAGAACCCCCCACTTGGTTTTGCATG CTCCGTTTTCTTTTTCTGTTCCTGTGGTTTGTCCGGTTTATAATGTGTCC CGGTACTGTCCGAAGTTAAACGACCCATCAAATAATCGGTCATATCTTCA TTATTGACGTTACTGTTAGGATCACCATtttctgtttgttgtttgttctC TTCGCTAGCTTTGTCACCAGACTCTTTTTCTCCTTCTTTTCCTGCTTTTG ATTCGTCAACAGGATTAGGTTTTGACACGTCTTCAACAGGGCTTGGATTG CTGTTCAATGAGTCAGTGGAGACCCCCTTCGAAGAGGGATCTTCTTTTGC TTTCTCAGAGTTCGATTCTGAATTCTCAGCTTTTGACGGATCTTTATCAG 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GTGTCTTCTTTAGGGTTTTCCTGCTTCGAAGCGTCTTCTTTGGGGTTTTC CTGCTTCGAAGCATCTTCGCTGGGGCTTTCCTGCTTCGAGGCGTCTTCTT TGGGGCTTTCCTGTTTCGAAGTGTCTTCTTTAGGGCTTTCCTGCTTCGAA GCATCTTCTTTATTCTCCTCCTTTGATCCTCCCTCTTTGGAAGAGTTCTC CTTATTCTCCTCCTGGGTGTTTCCTTGAGATTCAGGTGTCTTATCATCCA ACTTGGACCCACCATCGCTCTGTCCTTGCATCGCATTCTTCAAATTATCA TCTTCATATTCAGCGCATTCAATTTCCTGACGTTTGGAATCTTCACTCGG TGTTCCTATCATCACATATGGATCCTTAAGAGCCTTCGGGATTTGAACTT CCTTATGGCGCTTTTTACATTTGCTTTTGTCAATTTGACTTTTTCTTGAA GGATGCTTCattgattttcttttagaaGATAAAGAAGACCTTTTCTTACC ACCGATATCACTATAAAGGCGTTTCACTTCTTTGCCGACGTTTTTAGATA ATGAATCCTCGTCTTCTTCCACGGCAGGATGAACTTTCGATTTCTCAGTA GCAATGGCCTTCTCGAGGTTTTCAATGGTGTTTAACTCCTCTGCAACGCT TGGTGTAGCTTTGACTGCTTTTCCTTTCTCGTGAAACTTCTTCTTTTCTT TAGCTTTCAGTTTTGCTTCTTTTCCTTCCGATTTTGCTTTTGCCACGTAT GGATCACTGGTGTCATAAGGCCCGATATGAGATTGTGATGCCCGTGTAAA CTCGCTTATACCATTATGGAGCGATTCCAACTCTTTAGCCGTTGTCTCCG AGGCCCTAGCTTCACCAGCAGCAAGTTTCTCAACCGATTCTGATCCTTTA GCTGTCTTTTCATGTCGAGCTTCGTTTTGAGTCAACCCAACGGCTGTTCC 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GAGTAGGGGTCCTTACCGTTGATTTGATTACTGACTGTTTCTTTCGAATC TTTTGATTCCGGTGATTTTAGTTTCATCAACAGAGGGAAGATTCCTTGGA AAATACTCGGTTCAACTTGATCTCTACCAGCATTGGAAACTTCAGCCGGA TGTTGAGGAAGGTAGACACGTTTATGGGCCTTTTTCGTGATTATGTGTTT CTTAGAAGCAGGGTGGTGGTGATTCTTCTTGCTAATTGTGTGTCTTTTAA CAGACTTCCTCTTCTTGATGAAATGTCTTTTGACGTGTTTCGCTTTCTTC ACCACGGATCTTTTAGTAGTTTTCGTTCTCTTGTTCGTATGTGGTTTGGT AGGCTTAGCTCGTTTGCTACCCAAATCAGAGTAAGGATCACCATAGTGGG TCAGTGGTTTAGATTCCTTTACTTTTGATGGATTCACAAAGTTGCAATCA TCATCTCTCTTGGAAGCTTCATTTCCAATCATTTCATAAGGCTCACTGCA ACTTAAAAACCGTTTCGTGATTTCTGCTGATCGCCTGCTACGTTTATTGA TCTTGGCTTTCAGTGGAGTTTTAGTCGGGTCTTGGCTTCGTTTGGTCGCG ACAGTTGATGTGACGCTTTCTCCGACATCTAAATAAGGATCACGTCCCTG GTTTACACTTTTTTGGGGTGCTTTAAATTCATGCGTTTTAGAAGCATCAT TATTCTTGGAGCTTTCTTGTTTAGCTCGTTTGGTAGGGTTCGGTGAGGAG GCCCCTATCTCCAGGTAAGGATCCGAATTTTTCGCATTGGTTTTCACCTT GGATGCAATCGCTTGCTGCCCAAATACTGGTAGTGAGCCTTTGGAGGTCT CTTCCGATTGGGTAGAATTTGACTTTGGAGCAGAATTTGTCTGTTCTTCG CTAGCCTCGGGAAGTTTATGTCGTAGATTAGCATAAGGGTCGGAAGAAGG GTCTTGTGAGAGAGTTTGAGTTGAGTCGCCTTTTGAAAGTGTTTGACTTG AAACACCATTCATTTCATTCTTGATTTGTGCGTTCGATTTATTGAGAGCA CGAAGCAATTCTTCAGTCTTGGCAAGTGCTTGGTCAACTTCTCCTTCTTC GTCTTGTCCTTTCAAATTTGCTTGATTATCCTCTTTCTTCTTCTTGAGAA CTTTCTCGTTTCCCTCCTTCAATTTGTCACTCAATTCTTTTACTCTCTCC ATAATCTTTGCTCCTTTCTCTTCTTCACCCTCTCCTTTATCCTCCTCCTT CTCTTTATTTGATTCACTCGTTTCATCCTCGTTCGTCTTCTTCAGTGAAT CTCCTTCTTCATGATTCGCTTTTTTCAAAACACTATCAGCCAATGAAACA TCTTTTTCCAAACGTGGATCCATGTGTAAAGTTGCGTTGCTACCAGACAC TGGACCCGCCATGTTTTGAGTTACATTTGATACAGTTTTGTCAGTCACCG ATTTATCAACAACATTCGACTTGCTGTCACTGTCACCCTTCTCACCCCAG AACTTCGAGCTCTCTCCAACATCTGCGTAAGGATCACTAAATTGATGTTC AGATTTCGTAGACGCTATCTGATGTGTGTCAAACGATTCTTTAAGTTGCT TTTGCGCTTCAAGTGCAAGTGATGACTCTGGTTGAGTGTTGCCCTCAATG TTCGAATTCTCTGCATTCTTACCTAGCAAGTGAACTTGTTTCTGATTAGT TGCTCCCTCTTTTAGTTCTTCTTTACTCTCCTTAGAAGTTTCTTCGGAAA GTTCAAACTCCTTAGCTTTCATCATTTCTTTACCACTAATCTTCGATTGC ACATCGTGATCACCCTCTTCGCCATCAGATTTGGCAAACTCCTtcgattt ttctttcttctttttcgaaTCATCTTTATCTTCGTCATCTTTTGGCGGCT TCTGATCACCTGGTATTATTTTTGGAGGTAGAACTTTACCAATCGACTTA TAAGGATCTTTTGCGTACGATTTCACACCTTGTATGTTTTCCATAGACGT TGGCAATTTCGCTTTCTCTGCAATCTTCTTGAAATCAGTAACCTGGACTT GTTCTTTCTTTTCTGCGTCATCTCTCGAATAAACACTTGTTTCCTGGTTT CCATCAGCACCTGGACTGGTTTCTTCCAGCTTACGCTTACTTCCTTTGAC AGGCCGTGCGTTGATGCTTTTCAAGACAATGCTCTTTGAGACAgctttaa atttcgatttaagACCAGCTTTCGATACAATTCCACTCTTCAAAGAAGCT TTAATACCTGTTGGTGCTATTCTGGTCTTTGTTATCGAAGCTCTACTTTT CACAGTCGTAATTTTGTTCTTTCTACGGCTCAGCTTTGCCATTCTGCTTC GTTTCTCATTCTTGACGTTTTTCTTGTGATTCTTTTTAGAGAATGTGGAG CCTTTCAATGGTTCACTTGGTGCACTACCTATGTCCGAAAAAGGATCTCT TTTATGTCCGGTAGTTTTCTTCGGTCTACCAATTACCTTTTGTCGCTTTT GCTTCTTTGAGTGTTTGGGCATGCGGCTCCGTTTACTCTTCTTGTTTTTA CGAGACACCTTTCCTCTTTTCGAGACTTGCTTACGtgatgtttttctttc cctctttgCGCCTTTCTTTTGATTAACTTTGGTTGGTAGCCTGTGTCTCT TGTTCCCGATATCAGCGAAAGGGTCTTTCTTAATAGTGGCATGAATTTTA TTGatctttttcaaaggttttaGAGACTTGGTTTGAGCTTTATCAAGTTT ACTTGGTGATTTTGAATGGACTTCGCTTCCATAACCAATATCTGCGAAAG GGTCACCAGACTTTTTGTAACCTTTGCTTGTCTGTGTTCGCTTGGATGGC 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GATGTCTGAATAAGGATCTTTCAATCGATTCAATTGCAACATTgcttctt ttgtttctttcttcaaTTTATCCAAAGTGTTTTCGTATTCAAGGATCTTT GGTTTCAAACTTGATTCAGTCATCTCTGGTGATTGTTGTTGAGCTTCAGC TGTTGATGTGGATGTCATTGCTCTTGTTGCTGCGGACCCTTGGTTACCAG AGAGGATAGAAGTCAATTCTTTAGGCAAACTGACCACAATTCTCATTCTT TTTCCACGTTGTTCGATTCTAGATGGTGTTAAATGAATTTCTTTACCACG GTGGGGCGTTTCCAAGGTGCGCCGGCGGAGATCTGCATACGCTGCTTGAA GCTTGTTTTGGTCTTCCTTAGTCATTGGTTCGTCCTTAAAGATACGATCT GCGATAGTCACTGCAATAGCAGGGTTGTTGGTTATCGCAACAGCTCTGGA GTTTGATCGTTTACCATCTGGAGGCTTCAAATCAAtcgtgattggttctt tcagcTTGGCTAACGGTCCTTTGGGatttaaagtaattttgagTGGAACC CTGGGTAATTTACCGAACAGCTCCACAATAGTACTTGGTTGTTGTGTTTG ACCGACTTCGATTGATTCTC transcript from alignment at scaffold_242:1538557..1547626+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00054272 ID=TCONS_00054272|Name=TCONS_00054272|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9070bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_242:1538557..1547626+ (Clytia hemisphaerica) CCTCATTTGAAATTAAATGGAAGGAAATTGCACGCTTCAAAACGATCCTT
GTTGGATTTTtttaccttggaacaatagaatttccattCCTATTGGGAAT
TCGATAAATTTTCTTCTCCACTGTAGAAAGAAGCTCCtcaggggctgtga
gacagggaatGTAAAAATGGAAACGTGAAGAAAAGTCATTCCTCCGATGA
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aaatatttcataaagtTAGCGAAACATCCTCTAGCGGTTTGTCCTCAACT
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ttatctacttcactttcttttgcattttcttcttttactcCATCCTCCTT
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GTTTACACTTTTTTGGGGTGCTTTAAATTCATGCGTTTTAGAAGCATCAT
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CTCTTTATTTGATTCACTCGTTTCATCCTCGTTCGTCTTCTTCAGTGAAT
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GTTCAAACTCCTTAGCTTTCATCATTTCTTTACCACTAATCTTCGATTGC
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TCTGATCACCTGGTATTATTTTTGGAGGTAGAACTTTACCAATCGACTTA
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TGGCAATTTCGCTTTCTCTGCAATCTTCTTGAAATCAGTAACCTGGACTT
GTTCTTTCTTTTCTGCGTCATCTCTCGAATAAACACTTGTTTCCTGGTTT
CCATCAGCACCTGGACTGGTTTCTTCCAGCTTACGCTTACTTCCTTTGAC
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GTTTCTCATTCTTGACGTTTTTCTTGTGATTCTTTTTAGAGAATGTGGAG
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GCTTCTTTGAGTGTTTGGGCATGCGGCTCCGTTTACTCTTCTTGTTTTTA
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TGTTCCCGATATCAGCGAAAGGGTCTTTCTTAATAGTGGCATGAATTTTA
TTGatctttttcaaaggttttaGAGACTTGGTTTGAGCTTTATCAAGTTT
ACTTGGTGATTTTGAATGGACTTCGCTTCCATAACCAATATCTGCGAAAG
GGTCACCAGACTTTTTGTAACCTTTGCTTGTCTGTGTTCGCTTGGATGGC
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AGCACTATCAATATTCGGCATGTTAGCTAGAAATCTGAAAGGTTTCATTT
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TCGAATCGACTGTGGACATTGAAGGGGTATGGGTATGAGAGATTAATGAC
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ACCTGTTTTGTTAGAGACAGCCCTGATCGATCTTTTCAATCCAGCAGATC
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TGTTGATGTGGATGTCATTGCTCTTGTTGCTGCGGACCCTTGGTTACCAG
AGAGGATAGAAGTCAATTCTTTAGGCAAACTGACCACAATTCTCATTCTT
TTTCCACGTTGTTCGATTCTAGATGGTGTTAAATGAATTTCTTTACCACG
GTGGGGCGTTTCCAAGGTGCGCCGGCGGAGATCTGCATACGCTGCTTGAA
GCTTGTTTTGGTCTTCCTTAGTCATTGGTTCGTCCTTAAAGATACGATCT
GCGATAGTCACTGCAATAGCAGGGTTGTTGGTTATCGCAACAGCTCTGGA
GTTTGATCGTTTACCATCTGGAGGCTTCAAATCAAtcgtgattggttctt
tcagcTTGGCTAACGGTCCTTTGGGatttaaagtaattttgagTGGAACC
CTGGGTAATTTACCGAACAGCTCCACAATAGTACTTGGTTGTTGTGTTTG
ACCGACTTCGATTGATTCTC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00054272-exon-scaffold_242-1491911889:1538557..1547626 | TCONS_00054272-exon-scaffold_242-1491911889:1538557..1547626 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00054272-exon-scaffold_242-1510915933:1538557..1547626 | TCONS_00054272-exon-scaffold_242-1510915933:1538557..1547626 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00054272-exon-scaffold_242-1575043694:1538557..1547626 | TCONS_00054272-exon-scaffold_242-1575043694:1538557..1547626 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_242 | supercontig | scaffold_242:1538557..1547626 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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