TCONS_00053698 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00053698
Unique NameTCONS_00053698
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length545

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00053698 ID=TCONS_00053698|Name=TCONS_00053698|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=545bp
GTGAACCTTTTCATCCACCCCTTGAGAGGGGCTTTGGTGGAGAAGTTTTT
TTAGTGGTGGCGACTGGTAGTAGTGTTGTAGTGTTAATGCCCTTTTGGTT
TTGAGTGTCTTTTTTGTATGTAATGTCATTATCACTGGCTGTTATATCGT
TGTCCGTTGCTTGTCCTTGAAGGTTTTCTTTGCCTTCCCTTTTAACATTG
CATTTTCAATTAACAGTTTGTCCATTTTTAACTTGCGTTCTCTATTTATT
ACATTCTGTCTGTGTCTTCGATTACGGTTTCTTTCCGTTTTTGCTCGCTA
CTTTTCATTTGATATATGCCTGGCATCATTTTCAGCCAATTCTTCTTCAA
ATCTAATGCGTCGTCTTTGTacgaaatttcaataatttttcacttaaaaa
aaaaaagtaacagATAAGTACATCAGAGAAAAATTAGTTCCTACCCCATC
TTTCCGAGAATGGTACATCGCATTGCGCATGGTCTTCATATTTACCAGCA
TTAATAATAATTAAATACATTTACAAAGGTTTTCAAGCAATAAAT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_233:1136655..1150224-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00053698 ID=TCONS_00053698|Name=TCONS_00053698|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13570bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_233:1136655..1150224- (Clytia hemisphaerica)
GTGAACCTTTTCATCCACCCCTTGAGAGGGGCTTTGGTGGAGAAGTTTTT
TTAGTGGTGGCGACTGGTAGTAGTGTTGTAGTGTTAATGCCCTTTTGGTT
TTGAGTGTCTTTTTTGTATGTAATGTCATTATCACTGGCTGTTATATCGT
TGTCCGTTGCTTGTCCTTGAAGGTTTTCTTTGCCTTCCCTTTTAACATTG
CATTTTCAATTAACAGTTTGTCCATTTTTAACTTGCGTTCTCTATTTATT
ACATTCTGCCTTCGATTACGGTTTCTTTCCGTTTTTGCTTGCTACTTTTC
ATCTAATATATGGCGCTGTTTTTTAATTGAAAATTCTGTCGGATGCACAA
TCGATACTTCTGACAGAGTTGAATAAAAATTAGTTATTAGTTAGGTTCAA
AGCTTATTATTATAAATAAGGACTAATGGGTTCTTTTTAATAGTGAACTT
TCCAAGAATCAAGCTCTTTACAGCTTTTTTCAGTGAAGTCAAATTCAAGT
CTGTCGGACGCACGCGATAGAAAATGGACTTCAAAATTTTTGAGGGCAAA
TCCTAATTCTATCGAAAGTACTAGGCCTACAAACTTGAACTTTNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAGACATCAAACAAATTAG
GTGTTAAGGAACGACTTTAGCTCGGAAATTGCTGCATTATCTTGATTTTA
AAAATTGACGTTGATGGTTACCAATTAAAAAACAGCGCCATATGCCTGGC
ATCATTTTCAGCCAATTCTACTTCAAATCAAATGCATCGTCTTTATACGA
AATTCCAATCATTTTTCACTTAAAAAAAAAAGTAACAGATAAGTACATCA
AAGAAAAATTAACAAAGGTAAAAAAATGTATTAACAAAATTTCACAAAAA
ACGACAAAAATGAACGGCAAATTTCATCTTTTGCCGTCCACAACCCCGAC
CGAAAGTGACTATACCAAGACACTTCCCTCGCAAAATAATCTAATTTTCG
CGGGACTTATTTTCGCGACTAACTTCGACTGTAATATTTCGCGATGATTT
AATTTCGCGAATTGGCGAATTTTTTCAGATTTTCACATTTTTCGTTAGTT
TGATTACGAGATTTTATGTGTAAAGTAGAGTCTCCATAACTCGAACGATC
ACGAGAAATGAAAATTTATTCAAATTGTAGAGACATACTAGTAATGAAGA
CTCATTTAAGAGAGTTTCTGAATTCGTTCAAAAAACTTAAATTTCGCGAA
TTTAGCCAGAGATAAGAGTTTGAAATTTTTTTGCGAGGGATTATCACAGG
AAAAAAAATTCAAATTCCTAGGTGGTGAAGAAATAACTTTACCATCTAGG
GATTGTTTGTCAAGGGAAATTTTAAAATGATGAACTGAATTTTTTTCCTA
TCTAGGAATTCTTTAAAATTACCGTCTCATTCTGACAATAAAGTATTACC
ATATAAAAATTTCTCTTGGATATTTTCATGGTAAAAATAACCATGTAAAT
TCTTAATTTTTGGATATGAATTTTCCCATCTAGGAAAAGTCTGAATTTAG
GATCGGAAATTGTTTTGCCAACTTCAACTAGAAAAAAAATTATCAGGTAG
AGAATACCTTAAATTTCCTAGTTGAATTTTCCATTTGTTGTAAATTGTTA
TCTCACTTCATCTACAGTATTTTTTTCTTTTATAACAGCAACAATGAGCC
TCAAAATCGTCAAAAGACTAGAACGATGCGGAGCCTGAAATTACTCAATT
ACACGCTATAAATAAGAACTGGATGAGAACAATTTAAGGCTCATGTGCCA
AAAAAAGAATAGCCAAGCCTCATCAACATTTTGCTGGTTCTTTTAAAAAA
GGTGTAAAGTCAACAAACGAAATGATTATGAAGAAATTTTCTATTACCGT
ATATCAGATGATTAGACCTCAACAAATTTGGAAATAGAGAGACATTCATC
CCGTAGTGCAATATATCTGTATTTAAATTTGGGCATCGAAAAAAAAAGTA
AAGGCTCAGCAGACTTGGTTCTTTTTTATTGTACTTATGCCATTAGAAAA
AGTTTTCAAACTCAAAAGAACGAGCGAACCAAAGAAAATAACACTTATGA
TATGACAATTGATATTAACAAGTTTTTATTTGTTATCTTTCTAGCAAACA
AGGGTCAACTAATTAAAAAGACAAAATCAATGCAAATTACCACATCGCTT
GTATCAGAATGTTAATAGGCAAGAGCCTCTCTTGAGATTAGAGATGCAAG
TGTTATTAATTCTTGCTGTTCTGACAAAGAGTACAACTTAAAGTCTCTCA
CACCATCTTCCTCGATCAATTTCAGCACACTTAGTCGAGCAAATTTCAAA
CAAACATCATTGCTCAAATCTTTTAAAGGCATCAATTCTTGTATTTTTCC
AAAATGTCCATCTTTTAACATGACATACTCTCCAACTTTCACACGATGCC
TTGAATTCGCAATGTAACATGCATTAAAACTTATGTATATTTCTTCTGTG
ATGCTATTTTCTCGTAAAAACTTATTGAAAGCATGACCAGCAATTTGAGT
GTTTGATTTTGCACCTCTGCCAATAAACACCACTAAATCGACATGTTCGT
CCTCGAAAAGATCTTTGTAACAGAGTTGCTTGAAGTTTGCGAGCTCCATT
GCACCTTGTAACCTGGAAGCAGTCTGAAATAATAATTATGAATTGTTTAT
AAATTAAAAAAAAATATCGTTGGAAAATAATAGTGAAATACCATTGAAAC
CTGTACATCTAGTTTTACCCTGTAGACCCTGTATTTGTTATTAGGGCCAA
AATTACCTCCAAACGATACACTTTTGCGACTTTTTACCTTGGACAAATAT
TAGATGTAATTTATAAGCGTTTGAGTGCAGTCAGGGGGTCAGAAAAAAGT
ACAAAAAAGGGTACGTACGTACCATGTGTGGGAGGAAATAAAATATGCTG
TTGTCTAGAGCATGGAACTATTTAGGGGGGAACTTGCAGTCAACTATATA
TATATTTAGCGAAAAAGGCGAAATTCACGAAAATTCGCGAAATATTATAA
TCCCCGTGATAATTTATCCCTTAAGGTAGTCCATGAAGGCATTATTATTG
TCTTCTTATAGGACCCTCTGGTATAGCCTGTTTTAGTAGGAATAATATGA
CGTTGCACACGAAGAGCATTTGCATTGTACCTGAACTGAAAAAGATTTGG
TGAGTTGTTGAAACCAGTCATGCTTCACTGTCTACCGAAATACTCCTCTA
AAATATCTTGACAAAACCTTTCAGTCAGAACAAATTCTAGACCACTTTTT
AAAAGATTTTTCACTGATTCTACGAGAGATTTCACATTTATACATAAATC
TTCAAAGGTCTGATTGATATGGTATGAACATCCTCTCCTTTTCTTTGTCG
GTTTTATCAGTTTTTGCCTCAACTTTGGCTTTCCAGTTATTGAAATAGGC
AAGAAAAACATTTTGCAGCCAATCGAACCTCCAATCAATATTTTCCTCTT
CAATGTTCCCTCTTCTTGACACCTAATATTGAAGCAGTCAAAAAAGCAAT
TCATATATCGACTCAAGTCCCCTGTAGTCCTATACTCAGGGTAATAGTGA
TAGATAACATTTGCCATTTTTGAGCTTAGAACTTGAGTTGCCAAACTAAC
AGTCATTGTAGAATAGGATGTCAAACTGATGCGAGCCAGAGTCAGCTTGA
GAAGTAACTTCAGATGCGATTCATGTCATCTTGAACAATGTGAACAATCT
GATTCCATAATATAACAAATCCCTTGTTCCTACCCCATCCCTCTGAGAAT
GGTACATCGCATTGCATGAATAGCTTCAGATTACATTTTCAACAGTAATT
AGGCTTGGGTCTGAAACTGGCAGTACCTATATTTTACATTCTGTCTGTGT
CTTCGATTACGGTTTCTTTCCGTTTTTGCTCGCTACTTTTCATTTGATAT
ATGCCTGGCATCATTTTCAGCCAAATCTTCATCAAATCTAATGCGTCGTC
TTTGTACGAAATTTCAATAATTTTTCACTTAAAAAAAAAAAGTAACAGAT
AAGTACATCAGAGAAAAATTAGTTCCTACCCCATCTTTCCGAGAATGGTA
CATCGCATTGCGCATGGTCTTCATATTTACCAGCATTAATAATAATTAAA
TACATTTACAAAGGTTTTCAAGCAATAAATTATGGGGAATGCTGGCCAGG
AGTCCATCCAATAGACCGGTCGATAGTATCGTCTAATCAAATGGAATGAA
CACCTGGTCGCATGAGCTGGTGTTGAATATCATTATGGGAGGTATCTTAA
GGTTATTAAAACTTTTTAAAATTTAACAATCAATAACAATCATAATATAA
ATAAATAATTAATGATATAAATAATGTATATGAAATAAACAATCATATGA
TGAGGGGAATCAGATATGAAATAAATAGACCTGCGTTCAGGAGAAAAATA
TTAATCGTTCTGTAGATGAAACTTGAATTGATCGAGACAATTCTTTGTGA
CATTTAAAAGAGAGCTCTATTGAAGGAACCTCCATCAGATACGGTTACAA
CAACTTTTAGTTTACAAGTCAGCTCTAATATGGAGACAGCTTTCCCAAAC
AGTAGCATCAACTGGGCTCCTGTTGTACCTACTGAAGCAAAATATGCAAA
GCTGAATTTTAGATCAGTTGAAATGCCACATAAAACACGAGATGATGTGT
TACTATGGTATCTACTTCCTTGAATGTAGAAGAGTTCAGGTCAGAATCCC
CCAAGGTCAACAAAACCAATCAATTCACATGTATGTTTGTCAAATACAAG
GTTATATTTCTTTGATAACATTTGAGATCCTTAGTCAACTCAGCTATTTC
TTCAACAACCTTGTGATTGAAACCCACTTCAGGACGAGTAGCATTTTATG
TGGTCATCAGGCAAGTACCATCCATAAAGTCGGACCTTCAATTCCAAAAA
ACCATTAACAATAATTTCAAATTCGGGAATAGAAAATTTTAAATTTTCAA
GGCTGCAAGTTATAAAAGACTTACCCCCAGTGCAGAGCACTTTCCAGTTT
GGAAGTTTCCATTTTGAACAGTGAGACACACAAACTCATTAAAACTTTCA
TATACAAAAGATTTTTGTTATACACTGTACTGCGTGAAACAAATCAAGCT
TTACTTCGGTATCTGGTCCAAAAATTTCCTTGTAAAGTTCTCCATCTTTG
CAACAATTGTCAATGATAATTTGATTTAAACCTGGGGCGTGCTCCTGTAA
ACTTTTAAGTAATCCTTTGAACTCGTTATGTTTTGAAGTGTCTGTCAAAG
TCCAATCAACAACTGCACCTGTTGCGTCCAAGATAATGAATAGCTTCAGA
TTACATTTTCAACAGTAATTAGGCTTGGGTCTGAAACTGGCAGTACCTAT
ATTTTACATTCTGTCTGTGTCTTCGATTACGGTTTCTTTCCGTTTTTGCT
CGCTACTTTTCATTTGATATATGCCTGGCATCATTTTCAGCCAATTCTTC
TTCAAATCTAATGCGTCGTCTTTGTACGAAATTTCAATAATTTTTCACTT
AAAAAAAAAAAGTAACAGATAAGTACATCAGAGAAAAATTAGTTCCTACC
CCATCTTTCCGAGAATGGTACATCGCATTGCGCATGGTCTTCATATTTAC
CAGCCTTAATAATAATTAAATACATTTACAAAGGTTTTCAAGCAATAAAT
TATGGGGAATGCTGGCCAGGAGTCCACCCAATAGACCGGTCGATAGTATC
GTCTAATCAAATGGAATGAACACCTGGTCGCATGAGCTGGTGTTGAATAT
CATTATGGGAGGTATCTTAAGGTTATTAAAACTTTTTAAAATTTAACAAT
CAATAACAATCATAATATAAATAAATAATTAATGATATAAATAATGTATA
TGAAATAAACAATCATATGATGAGGGGAATCAGATATGAAATAAATAGAC
CTGCGTTCAGGAGAAAAATATTAATCGTTCTGTAGATGAAACTTGAATTG
ATCGAGACAATTCTTTGTGACATTTAAAAGAGAGCTCTATTGAAGGAAGC
TCCATCAGATACGGTTACAACAACTTTTAGTTTACAAGTCAGCTCTAATA
TGGAGACAGCTTTACCAAACAGTAGCATCAACTGGGCGCCTGTTGTACCT
ACTGAAGCAAAATATGCTAAGCTGAATTTTAGATCAGTTGAAATGCCACA
TAAAACACAAGATGATGTGTTGCTATGGTATCTACTTCCTTGAATGTAGA
AGAGTTCAGGTCAGAATCCCCCAAGGTCAACAAAACCAATCAATTCACAT
GTATGTTTGTCAAATACAAGGTTATATTTCTTTGATAACATTTGAGATCC
TTAGTCAACTCAGCTATTTCTTCAACAACCTTGTGATTGAAACCCACTTC
AGGACGAGTAGCATTTTATGTGGTCATCAGGCAAGTACCATCCATAAAGT
CGGACCTTCAATTCCAAAAAACCATTAACAATAATTTCAAATTCGGGAAT
AGAAAATTTTAAATTTTCAAGGCTGCAAGTTATAAAAGACTTACCCCCAG
TGCAGAGCACTTTCCAGTTTGGAAGTTTCCATTTTGAACAGTGAGACACA
CAAACTCATTAAAACTTTCATATACAAAAGATTTTTGTTATACACTGTAC
TGCGTGAAACAAATCAAGCTTTACTTCGGTATCTGGTCCAAAAATTTCCT
TGTAAAGTTCTCCATCTTTGCAACAATTGTCAATGATAATTTGATTTAAA
CCTGGGGCGTGCTCCTGTAAACTTTTAAGTAATCCTTTGAACTCGTTATG
TTTTGAAGTGTCTGTCAAAGTCCAATCAACAACTGCACCTGTTGCGTCCA
AGATAATGAATAGCTTCAGATTACATTTTCAACAGTAATTAGGCTTGGGT
CTGAAACTGGCAGTACCTATATTTTACATTCTGTCTGTGTCTTCGATTAC
GGTTTCTTTCCGTTTTTGCTCGCTACTTTTCATTTGATATATGCCTGGCA
TCATTTTCAGCCAATTCTTCTTCAAATCTAATGCGTCGTCTTTGTACGAA
ATTTCAATAATTTTTCACTTAAAAAAAAAAAGTAACAGATAAGTACATCA
GAGAAAAATTAGTTCCTACCCCATCTTTCCGAGAATGGTACATCGCATTG
CGCATGGTCTTCATATTTACCAGCATTAATAATAATTAAATACATTTACA
AAGGTTTTCAAGCAATAAAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_033866XLOC_033866Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053698-exon-scaffold_233-1575043694:1149973..1150224TCONS_00053698-exon-scaffold_233-1575043694:1149973..1150224Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00053698-exon-scaffold_233-1575043694:1136655..1136947TCONS_00053698-exon-scaffold_233-1575043694:1136655..1136947Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00053698-exon-scaffold_233-1510915933:1149973..1150224TCONS_00053698-exon-scaffold_233-1510915933:1149973..1150224Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00053698-exon-scaffold_233-1510915933:1136655..1136947TCONS_00053698-exon-scaffold_233-1510915933:1136655..1136947Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00053698-exon-scaffold_233-1491911889:1149973..1150224TCONS_00053698-exon-scaffold_233-1491911889:1149973..1150224Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00053698-exon-scaffold_233-1491911889:1136655..1136947TCONS_00053698-exon-scaffold_233-1491911889:1136655..1136947Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_233supercontigscaffold_233:1136655..1150224 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0.478211	0.116964	0.996744	0.11252	0.407252	0.762529	0	0.330639	0.320926	0	0	0	0.0599566	0.0643427	0.0792649	0	0.112243	0	0	0	0	0	0.453463	0.303529	0.144783	0.154516	0.23439	0.119403
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00053698 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top